# LIPH4SAS Research Infrastruture. Livestock phenotyping for sustainable agroecological systems

Jean-Pierre Bidanel, Stéphane Ingrand, Mouna Loucif

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Jean-Pierre Bidanel, Stéphane Ingrand, Mouna Loucif. LIPH4SAS Research Infrastruture. Livestock phenotyping for sustainable agroecological systems. Le numérique au service de la santé, du bien-être animal et des 3R, IR EMERG'IN & LIPH4SAS, May 2024, Tours, France. hal-05288654

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Submitted on 29 Sep 2025

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Distributed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License
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Research Infrastructure

*Livestock phenotyping for sustainable agroecological systems*

Jean-Pierre Bidanel, Stéphane Ingrand, Mouna Loucif

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RÉPUBLIQUE
FRANÇAISE

Liberté
Egalité
Fraternité

INRAO
> LIPH4SAS
Présentation

LIPH4SAS est une infrastructure de recherche (IR) créée en 2021 Sa mise en place a bénéficié:

* de l'existence de 3 projets euro-péens d'infrastructures (INFRAIA)

* De la montée en puissance

* de la PF PIXANIM

* du CATI SICPA

LIPH4SAS est une IR INRAE pilotée par les départements GA et PHASE

<figure><img src="image_4.png" /><figcaption>HERBIPÔLE
Bovins - Ovins</figcaption></figure>

<figure><img src="image_5.png" /><figcaption>UEP
Bovins</figcaption></figure>

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SmartCow

<figure><img src="image_8.png" /><figcaption>3P
Porcins</figcaption></figure>

<figure><img src="image_9.png" /><figcaption>GENESI
Porcins</figcaption></figure>

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PIGWEB

<figure><img src="image_11.png" /><figcaption>NUMEA
Poissons</figcaption></figure>

<figure><img src="image_12.png" /><figcaption>PEIMA
Poissons</figcaption></figure>

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AQUA
EXCEL 3.0

<figure><img src="image_14.png" /><figcaption>PAO
Multi-espèces</figcaption></figure>

<figure><img src="image_15.png" /><figcaption>P3R
Ovins, Caprins</figcaption></figure>

<figure><img src="image_16.png" /><figcaption>PIXANIM
Imagerie
Multi-espèces</figcaption></figure>

Données

<figure><img src="image_17.png" /><figcaption>CATI - SICPA
Données - SI</figcaption></figure>
> LIPH4SAS
Présentation

LIPH4SAS est inscrite dès 2021 sur la Feuille de Route Nationale des infrastructures de recherche

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> LIPH4SAS

Objectifs

LIPH4SAS est une infrastructure de recherche dédiée au phénotypage des animaux d'élevage.

Elle met en œuvre des expérimentations, collecte des phénotypes et met à disposition des échantillons biologiques, des animaux et des données pour les communautés scientifiques en lien avec l'élevage,

Les programmes de recherche visent à
une transition vers des systèmes
d'élevage plus durables, basés sur les
principes de l'agroécologie.

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> LIPH4SAS

Une infrastructure de recherche distribuée

LIPH4SAS est une IR distribuée, constituée de 10 entités INRAE réparties sur le territoire national.

Avec une diversité de conditions environnementales, de systèmes d'élevage et de ressources génétiques

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LIPH4SAS

Conditions environnementales et systèmes d'élevage

CONTRASTÉS

Des conditions d'élevage variées et finement caractérisées, permettant d'étudier les interactions génotype x milieu ou les réponses des animaux à des variations environnementales.

Causses du Larzac

Plaines du centre

P3R

La Fage

HERBIPÔLE

UEP

Moyenne montagne

Bocage normand

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LIPH4SAS

Infrastructure de Recherche distribuée

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3P

Elevage conventionnel

GENESI

Elevage bio
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# LIPH4SAS

## Diversité des ressources génétiques

### DIVERSITÉ DES RESSOURCES GÉNÉTIQUES

- Diversité de races bovines

- Truies (LW, MS) et porcs en croissance de différentes races

- Lignées originales sélectionnées (CMJR, Rés. Mammites, comp. Micr....)

- Lignées isogéniques de truites

- Animaux à génomes édités

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> LIPH4SAS

Les caractéristiques des 10 entités

* Quatre unités expérimentales dédiées aux ruminants (HERBIPÔLE - UEP - PAO - P3R);

* Trois unités expérimentales porcines (3P - GENESI - PAO);

* Une unité expérimentale (PEIMA) et une installation expérimentale (IE NUMEA) pour la pisciculture;

* Une plateforme d'exploration fonctionnelle dédiée aux animaux de taille moyenne à grande (PIXANIM);

* Une réseau d'informaticiens en charge de la gestion des données et du développement d'outils de phénotypage (SICPA).

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Six entités sont intégrées dans des infrastructures européennes (INFRA-IA : AQUAEXCEL - PiGWeb - SmartCow);
> LIPH4SAS

Quelques chiffres

280
AGENTS

2000 ha
SURFACE AGRICOLE

4500
OVINS CAPRINS

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2000
BOVINS

7000
PORCINS

>50.000
TRUITES

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# LIPH4SAS

## Services de phénotypage

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# LIPH4SAS

## Offres de phénotypage – Emission de GES

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UEP

Sniffer

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PROJET

PAC Chambers
(Petits ruminants)

Ensemble
d'équipements

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3P

Halle bioclimatique
MEGEVE à l'échelle du
système

## PHÉNOTYPE DE CARACTÈRES CLÉS
### EMISSION DE GES

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HERBIPÔLE - UEP - P3R

Greenfeed
(Bovins - Ovins)

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HERBIPÔLE - 3P

Chambres respiratoires
= gold standard à
l'échelle individuelle
(Bovins - Porcs - Petits
ruminants)

SAS

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# Services de phénotypage – efficience de l'utilisation des ressources alimentaires

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* Bovins

* Porcs

* Petits ruminants

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* AUGES BIOCONTROL

* DAC

* DAE

* DAF

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## Mesures de l'ingestion

## PHÉNOTYPE DE CARACTÈRES CLÉS
ALIMENTATION

## Mesures de la digestibilité

* SPIR
Atelier de digestibilité

* Analyse chimique

* Ateliers de digestibilité (UEP - Herbipôle)

## Caractérisation de la valeur des aliments

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## Services de phénotypage – Comportement et bien-être animal

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LIPH4SAS – Liens avec autres IR / Structures

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# LIPH4SAS – Projets associés

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TEF
agrifood

ESFRI
PHENO-LIVE

SOUMIS

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EU-L-PHE
DXEUROPEAN NETWORK ON LIVESTOCK PHENOMICS

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PROGRAMME
DE RECHERCHE
AGROÉCOLOGIE
ET NUMÉRIQUE

anr®

INRAO

Inria

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PROGRAMME
DE RECHERCHE

AGROÉCOLOGIE
ET NUMÉRIQUE

COBREEDING

HOLOBIONTS

PATASEL

AGRODIV

BREIF

WAIT4

Digi4
Live

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INRAO
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Merci pour votre attention