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# Ajouter au RMQS des protocoles pour suivre la biodiversité: Une première estimation des besoins

Camille Imbert

► To cite this version:

Camille Imbert. Ajouter au RMQS des protocoles pour suivre la biodiversité: Une première estimation des besoins. Rendez-vous RMQS 2022, INRAE InfoSol, Feb 2022, En visio-conférence, France. hal-04181506

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Submitted on 16 Aug 2023

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# Ajouter au RMQS des protocoles pour suivre la biodiversité : Une première estimation des besoins

## Rendez-vous RMQS

4 février 2022

Camille Imbert
US InfoSol INRAE
camille.imbert@inrae.fr
<figure><img src="image_3.png" /></figure>

Estimer les besoins financiers, humains et logistiques de la partie terrain

Former les équipes aux protocoles Biodiversité
# Calendrier RMQS de 2021

## Printemps-Eté 2020

- Choix des sites (Méthodologie et tirages des sites)
- Plan d'échantillonnage

<figure><img src="image_4.png" /></figure>

## Sept-Oct 2020

- Tests des protocoles à l'INRAE d'Orléans

- Rédaction de la 1ère version du manuel RMQS-Biodiversité

<figure><img src="image_5.png" /></figure>

## Nov 2020-Automne 2021

- Echantillonnage des sites

<figure><img src="image_6.png" /></figure>

## Hiver 21-Printemps 22

- Analyse des enquêtes terrain

<figure><img src="image_7.png" /></figure>

## Mai 2022

- Remise d'une proposition du RMQS-Biodiversité à l'OFB

<figure><img src="image_8.png" /></figure>
# Calendrier RMQS de 2021

Printemps-Eté 2020

- Choix des sites (Méthodologie et tirages des sites)
- Plan d'échantillonnage

Sept-Oct 2020

- Tests des protocoles à l'INRAE d'Orléans

Nov 2020-Automne 2021

- Echantillonnage des sites

Hiver 21-Printemps 22

- Analyse des enquêtes terrain

Mai 2022

- Remise d'une proposition du RMQS-Biodiversité à l'OFB

<figure><img src="image_9.png" /></figure>

<figure><img src="image_10.png" /></figure>

- Rédaction de la 1ère version du manuel RMQS-Biodiversité

<figure><img src="image_11.png" /></figure>

<figure><img src="image_12.png" /></figure>

<figure><img src="image_13.png" /></figure>

<figure><img src="image_14.png" /></figure>
## Printemps-Eté 2020

- Choix des sites (Méthodologie et tirages des sites)
- Plan d'échantillonnage

<figure><img src="image_15.png" /></figure>

## Sept-Oct 2020

- Tests des protocoles à l'INRAE d'Orléans

- Rédaction de la 1ère version du manuel RMQS-Biodiversité

<figure><img src="image_16.png" /></figure>

## Nov 2020-Mars 2022

### Echantillonnage des sites

<figure><img src="image_17.png" /></figure>

## Mars 22- Mai 22

### Analyse des enquêtes terrain

<figure><img src="image_18.png" /></figure>

## Mai 2022

- Remise d'une proposition du RMQS-Biodiversité à l'OFB

<figure><img src="image_19.png" /></figure>
## 5 protocoles pour suivre la biodiversité

<figure><img src="image_20.png" /></figure>

<figure><img src="image_21.png" /></figure>

<figure><img src="image_22.png" /></figure>

Echantillon
composite de
surface 0-25cm ou
0-30 cm

<figure><img src="image_23.png" /></figure>

* Bactéries, Champignons,
* Protistes
* Nématodes
* Banque de graines
* Activités enzymatiques
* Dégradation de la matière
organique

<figure><img src="image_24.png" /></figure>

<figure><img src="image_25.png" /></figure>

<figure><img src="image_26.png" /></figure>
# 5 protocoles pour suivre la biodiversité

## 6 Pots Barber

<figure><img src="image_27.png" /></figure>

<figure><img src="image_28.png" /></figure>

Macrofaune et mésofaune de surface

<figure><img src="image_29.png" /></figure>
# 5 protocoles pour suivre la biodiversité

3 carottes diam. 5 cm

<figure><img src="image_30.png" /></figure>

<figure><img src="image_31.png" /></figure>

<figure><img src="image_32.png" /></figure>

<figure><img src="image_33.png" /><figcaption>Mésofaune endogée</figcaption></figure>

<figure><img src="image_34.png" /></figure>

<figure><img src="image_35.png" /></figure>
# 5 protocoles pour suivre la biodiversité

3 colonnes ø 16 cm

Porosité du sol

<figure><img src="image_36.png" /></figure>

<figure><img src="image_37.png" /></figure>

<figure><img src="image_38.png" /></figure>

<figure><img src="image_39.png" /></figure>
# 5 protocoles pour suivre la biodiversité

## 6 test-bêche + moutarde

<figure><img src="image_40.png" /></figure>

<figure><img src="image_41.png" /></figure>

<figure><img src="image_42.png" /></figure>

<figure><img src="image_43.png" /><figcaption>Macrofaune endogée</figcaption></figure>

<figure><img src="image_44.png" /></figure>

<figure><img src="image_45.png" /></figure>
# Plan d'échantillonnage

<figure><img src="image_46.png" /></figure>

- 4 zones d'échantillonnage de 24mx4m, sont situées à 2m et de chaque côté de la surface RMQS

- Les placettes sont regroupées par 4 soit une par campagne

- Choix au hasard d'une placette parmi celle de la campagne

* Pot Barber x 6

* Colonne Porosité du sol x 3

* Carotte Mésofaune x 3

* Test-bêche et Moutarde x 6

<figure><img src="image_47.png" /></figure>
<figure><img src="image_48.png" /></figure>

<figure><img src="image_49.png" /></figure>

OFB
OFFICE FRANÇAIS
DE LA BIODIVERSITÉ

Financement de l'échantillonnage de 30 sites par l'OFB

Grande diversité des sites RMQS

Test sur 26 sites :

- Correspondant aux différentes durées d'échantillonnage potentielle de la biodiversité (rapide, moyenne, longue, très longue)

- 2 sites par équipe, d'usages du sol différents si possible, pour les former

<figure><img src="image_50.png" /></figure>

Test sur 4 sites avec un expert écologue pour estimer la durée avec des opérateurs maîtrisant les protocoles
<figure><img src="image_51.png" /></figure>

<figure><img src="image_52.png" /></figure>

<figure><img src="image_53.png" /></figure>

4. Estimations des coûts

<figure><img src="image_54.png" /></figure>

3. Opinions des équipes

<figure><img src="image_55.png" /></figure>

2. Durées de chaque protocole

1. Choix des sites
<figure><img src="image_56.png" /></figure>

1. Attribuer une classe de durée d'échantillonnage à chaque site RMQS : rapide, moyenne, longue, très longue

Variables prises en compte :

- Occupation du sol

- Besoins particuliers pour accéder au site

- Profondeur du sol

- Teneur en argile

- Densité apparente

- Difficultés spécifiques aux sites forestiers

- Teneur en éléments grossiers

<figure><img src="image_57.png" /></figure>

Méthode SIRIS

2. Etablir des lots de 26 sites avec :

- 2 sites par équipe

- 2 usages du sol par équipe si possible

- répartis de manière équitable autant que possible entre les différentes classes de durée d'échantillonnage

3. 4 sites avec les écologues faisant partie du groupe de travail RMQS-Biodiversité
<figure><img src="image_58.png" /></figure>

Quelles sont les difficultés rencontrées ? Comment améliorer les protocoles ?

RMQS-Biodiversité : Echantillonnage Jour J

ID Site :

Date :

H arrivée/H fin :

Agents :

<table><thead><tr><th>Etapes</th><th></th><th>Relevé des pots Barber</th><th>Implantation du dispositif</th><th>Carottes mésofaune</th><th>Test-bêche+ Moutarde</th><th>Colonne Porosité</th></tr></thead><tbody><tr><td colspan="2">Heure début-Heure fin</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">La mise en place du protocole est-elle simple ? Oui/non</td><td>D</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>A</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Cette étape est-elle trop longue ? Oui/non</td><td>D</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>A</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Le matériel est-il adapté ? Oui/non</td><td>D</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>A</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Le déroulement des étapes est-il clair ? Oui/non</td><td>D</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>A</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Faut-il augmenter le nombre d'agents ? Oui/non</td><td>D</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>A</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td rowspan="2">Autres</td><td>D</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>A</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>
<figure><img src="image_59.png" /></figure>

Noter les durées de chaque protocole sur le terrain

RMQS-Biodiversité : Echantillonnage Jour J

ID Site :

Date :

H arrivée/H fin :

Agents :

<table><thead><tr><th>Etapes</th><th>Relevé des pots Barber</th><th>Implantation du dispositif</th><th>Carottes mésofaune</th><th>Test-bêche+ Moutarde</th><th>Colonne Porosité</th></tr></thead><tbody><tr><td>Heure début-Heure fin</td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

Durée du protocole

X

Nombre de personnes

X

100 eur

=

Coût du protocole (partie terrain)

<figure><img src="image_60.png" /></figure>

Quartile 75% de la durée du protocole sur les 30 sites échantillonnés

<figure><img src="image_61.png" /></figure>

Configuration actuelle : 2 personnes à J-7 3 personnes à J

<figure><img src="image_62.png" /></figure>

Coût d'une heure pour une personne
<figure><img src="image_63.png" /></figure>

27,5 sites échantillonnés sur 30

<figure><img src="image_64.png" /><figcaption>Seine et Marne</figcaption></figure>

<figure><img src="image_65.png" /><figcaption>Eure</figcaption></figure>

<figure><img src="image_66.png" /><figcaption>Somme</figcaption></figure>

<figure><img src="image_67.png" /><figcaption>Gers</figcaption></figure>

<figure><img src="image_68.png" /><figcaption>Corrèze</figcaption></figure>

<figure><img src="image_69.png" /><figcaption>Pas-de-Calais</figcaption></figure>

<figure><img src="image_70.png" /><figcaption>Jura</figcaption></figure>

<figure><img src="image_71.png" /><figcaption>Côtes-d'Armor</figcaption></figure>
<figure><img src="image_72.png" /></figure>

27,5 sites échantillonnés sur 30

<figure><img src="image_73.png" /><figcaption>Var</figcaption></figure>

<figure><img src="image_74.png" /><figcaption>Lorrèze</figcaption></figure>

<figure><img src="image_75.png" /><figcaption>Corse du Sud</figcaption></figure>

<figure><img src="image_76.png" /><figcaption>Aisne</figcaption></figure>

<figure><img src="image_77.png" /><figcaption>Haute-Corse</figcaption></figure>

<figure><img src="image_78.png" /><figcaption>Savoie</figcaption></figure>

<figure><img src="image_79.png" /><figcaption>Loire-Atlantique</figcaption></figure>

<figure><img src="image_80.png" /><figcaption>Aube</figcaption></figure>
27,5 sites échantillonnés sur 30

<figure><img src="image_81.png" /></figure>

<figure><img src="image_82.png" /><figcaption>Côte d'Or</figcaption></figure>

<figure><img src="image_83.png" /><figcaption>Nord</figcaption></figure>

<figure><img src="image_84.png" /><figcaption>Hautes-Pyrénées</figcaption></figure>

<figure><img src="image_85.png" /><figcaption>Vendée</figcaption></figure>

<figure><img src="image_86.png" /><figcaption>Nièvre</figcaption></figure>

<figure><img src="image_87.png" /><figcaption>Calvados</figcaption></figure>

<figure><img src="image_88.png" /><figcaption>Loiret</figcaption></figure>
27,5 sites échantillonnés sur 30

<figure><img src="image_89.png" /></figure>

<figure><img src="image_90.png" /><figcaption>Loiret</figcaption></figure>

<figure><img src="image_91.png" /><figcaption>Vaucluse</figcaption></figure>

<figure><img src="image_92.png" /><figcaption>Pyrénées-Orientales</figcaption></figure>

<figure><img src="image_93.png" /><figcaption>Pyrénées-Orientales</figcaption></figure>
<figure><img src="image_94.png" /></figure>

Durées : Jour J-7

1) Implantation du site

Quartile 25% : 1h04

Médiane : 1h25

Quartile 75% : 1h52

<figure><img src="image_95.png" /></figure>

2) Pose des pots Barber

Quartile 25% : 29 min

Médiane : 33 min

Quartile 75% : 36 min

<figure><img src="image_96.png" /></figure>

Durée total Protocoles J-7

Quartile 25% : 1h35

Médiane : 2h08

Quartile 75% : 2h46
<figure><img src="image_97.png" /></figure>

1) Relevé des pots Barber
Quartile 25% : 7 min
Médiane : 9 min
Quartile 75% : 12 min

<figure><img src="image_98.png" /></figure>

2) Carottes Mésofaune
Quartile 25% : 19 min
Médiane : 23 min
Quartile 75% : 29 min

<figure><img src="image_99.png" /></figure>

Durées : Jour J

<figure><img src="image_100.png" /></figure>

3) Extraction des mottes du test-bêche + Moutarde

<figure><img src="image_101.png" /></figure>

5) Tri des mottes du test-bêche

<figure><img src="image_102.png" /></figure>

4) Colonnes Porosité
Quartile 25% : 1h10
Médiane : 1h41
Quartile 75% : 2h10

<figure><img src="image_103.png" /></figure>

Quartile 25% : 4h29
Médiane : 5h22
Quartile 75% : 6h25

Durée total Protocoles J
Quartile 25% : 6h15 Médiane : 6h59 Quartile 75% : 7h49
<figure><img src="image_104.png" /></figure>

# Coûts de chaque protocole pour un site

Quartile 75% de la durée du protocole sur les 30 sites échantillonnés

<figure><img src="image_105.png" /></figure>

Configuration actuelle :

2 personnes à J-7
3 personnes à J

<figure><img src="image_106.png" /></figure>

100 eur

<figure><img src="image_107.png" /></figure>

Coût du protocole (partie terrain)

<figure><img src="image_108.png" /></figure>

Pots Barber
Coût = Journée J-7 + Pose Barber
Coût = 552+60 = 611 eur

<figure><img src="image_109.png" /></figure>

Carottes Mésofaune
Coût = 143 eur

<figure><img src="image_110.png" /></figure>

Colonnes Porosité
Coût = 650 eur

<figure><img src="image_111.png" /></figure>

Test-bêche et Moutarde
Coût = 1925 eur

$$ 
\begin{aligned}
\text{Coût total} &= \text{Coût Journée J-7} + \text{Journée J} \\
\text{Coût total} &= 552+2343 = 2895 \text{ eur}
\end{aligned}
$$
<figure><img src="image_112.png" /></figure>

## Coûts de chaque protocole

Quelle durée prendre pour estimer le coût ?

Combien de personnes pour chaque protocole ?

Même coût pour tous les sites ?

Coût du quartage du composite de surface ?

Durée et coût de la préparation du matériel et des envois ?
<figure><img src="image_113.png" /></figure>