### Opinion

# COVID-19 au Sénégal: réflexion d´un microbiologiste

COVID-19 au Sénégal: réflexion d´un microbiologiste

COVID-19 in Senegal: reflection from a microbiologist

Assane Dieng1,&, Jean Baptiste Niokhor Diouf2, Serigne Mbaye Lo Ndiaye1

1Laboratoire de Bactériologie Virologie du Centre Hospitalier Universitaire le Dantec, Dakar, Sénégal, 2Service de Pédiatrie de l´Hôpital Roi Baudouin, Dakar, Sénégal

&Auteur correspondant Assane Dieng, Laboratoire de Bactériologie Virologie du Centre Hospitalier Universitaire le Dantec, Dakar, Sénégal

Les maladies respiratoires particulièrement le COVID-19 constituent un problème majeur de santé publique dans le monde. Depuis mars 2020, le Sénégal a enregistré 299 cas de COVID-19 dont 183 guéris et seulement deux cas sévères. Aussi environ 20000 personnes en contact étroit avec les malades ont été testés négatifs. Ces résultats sur l´absence de cas sévère, le taux élevé de guérison et la négativité des tests chez les personnes en contact étroit avec les malades pourraient s´expliquer par un portage de coronavirus non viable ou à charge virale très faible (non détectable). En effet, certains facteurs tels que le climat, les prédispositions génétiques pourraient jouer un rôle très important sur la viabilité de SARS CoV-2. Les autres virus respiratoires tels qu´Influenza virus, VRS, rhinovirus, entérovirus, métapneumovirus, para influenza virus causant les mêmes symptômes que le SARS CoV-2, leur détection devrait être faite ensemble pour l´imputabilité de la maladie à un tel virus respiratoire. En conclusion, au Sénégal, le nombre de personnes supposées malades de COVID-19 est très faible et le taux de guérison très élevé. Ainsi, les efforts déployés contre le COVID-19 devraient être réorientés vers la prise en charge des autres pathologies prioritaires des sénégalais.

English abstract

Respiratory diseases, especially COVID 19 are a major global public-health problem. Since March 2020, 299 cases of COVID19 have been reported in Senegal, including 183 cured and only two severe cases. Moreover, approximately 20.000 people who had close contact with infected individuals were tested negative. The absence of severe cases, the high rate of healing and the presence of people who had close contact with infected individuals who were tested negative could be explained by a short coronavirus viability or a very low viral load (non-detectable). Indeed, some factors such as climate, genetic predisposition could play a very important role in SARS CoV-2 viability. Other respiratory viruses such as influenza virus, respiratory syncytial virus (RSV), rhinovirus, enteroviruses, metapneumovirus, para-influenza virus causing the same symptoms as SARS CoV-2, should be detected to establish that the disease has been caused by this respiratory virus. In conclusion, in Senegal, the number of people who have suspected COVID 19 is very low and the healing rate is very high. Thus, efforts to control the COVID-19 should be redirected toward the management of other priority diseases in Senegal.

Key words: SARS CoV-2, COVID-19, respiratory virus

Depuis toujours et dans tous les pays du monde, les maladies infectieuses ont constitué l´une des premières causes de morbidité et de mortalité [1,2]. Aujourd´hui, grâce à la vaccination et les progrès de la médecine moderne, la mortalité de certaines maladies comme la variole, le tétanos, la poliomyélite, la fièvre jaune, la rougeole et la coqueluche a fortement diminué [3]. Cependant, certaines maladies respiratoires continuent de constituer un problème majeur de santé publique surtout dans les pays à ressources très limitées particulièrement en Afrique chez les enfants de moins de 5 ans, les personnes âgées ou vivant avec une maladie chronique [4,5]. En effet, les statistiques annuelles prouvent que ces infections respiratoires sont la cause de 1,9 millions de décès dans le monde dont 70% en Afrique et que les virus tels que ceux grippaux (influenza A, B, C) constituaient les principaux agents responsables [4-6]. L´incidence élevée du paludisme, de l´infection à VIH, des hépatites, des maladies rénales a fait que le fardeau des infections respiratoires en Afrique soit longtemps négligé [7]. En outre, il est établi que les virus respiratoires ne sont pas des virus pathogènes spécifiques et que bon nombre de personnes sont des porteurs asymptomatiques [8].Une étude réalisée au Sénégal avait montré que 42,1% des enfants de moins de 5 ans étaient porteurs asymptomatiques de tels virus [8].

Dans la prise en charge du COVID-19 au Sénégal, la stratégie de lutte pour endiguer l´épidémie consiste à détecter le matériel génétique du virus chez les personnes symptomatiques et asymptomatiques suspectes confinées. La charge virale de SARS CoV-2 n´est pas déterminée systématiquement. Dès lors plusieurs interrogations peuvent être posées. Les personnes déclarées malades de COVID-19 le sont-elles réellement? La recherche d´autres virus respiratoires tels qu´influenza virus ou virus respiratoire syncitial, adénovirus, rhinovirus etc. ne se révélerait-elle pas positive? Existe-t-il des arguments scientifiques plausibles démontrant l´imputabilité de ces maladies respiratoires au SARS CoV-2 uniquement et pas aux autres virus respiratoires? Au Sénégal depuis la confirmation du premier cas de COVID-19 à la date du 02 mars jusqu´au 14 avril 2020, un total de 299 patients ont été testés positifs avec seulement deux présentant une symptomatologie sévère. Parmi les 299 patients, il y´avait 183 qui étaient déclarés guéris dont un enfant de moins de deux ans et sur environ 20000 personnes qui étaient en contact étroit avec ces patients malades, les résultats d´analyse étaient négatifs. Ces résultats sur l´absence de cas sévère, le taux élevé de guérison et la négativité des tests chez les personnes de contact étroit avec les malades pourraient s´expliquer par un portage de coronavirus non viable ou à charge virale très faible (non détectable). En effet certains facteurs tels que le climat, les prédispositions génétiques pourraient jouer un rôle très important sur la viabilité de SARS CoV-2.

Pour le climat, au Sénégal l´apparition de l´épidémie a coïncidé avec la période de chaleur qui a une influence sur la viabilité des virus respiratoires [9]. Pour les facteurs de prédispositions génétiques, la négativité des tests chez les personnes contactes pourrait s´expliquer par la présence de facteurs génétiques prédisposants. Pour les malades présentant les symptômes respiratoires attribués à SARS CoV-2, les autres virus respiratoires tels qu´influenza virus, VRS, rhinovirus, entérovirus, métapneumovirus, para influenza virus et les coronavirus humains peuvent être responsables [8]. Ainsi la détection de SARS CoV-2 devrait être associée à la détection de ces virus respiratoires étant donné la ressemblance des signes cliniques que causent ces virus. Ainsi aucun argument solide n´est en faveur de l´imputabilité de ces maladies respiratoires au SARS CoV-2 d´autant qu´une étude antérieure réalisée à Dakar avait montré un portage des coronavirus humains de même que d´autres virus respiratoires chez les enfants de moins de 5 ans [8].

En conclusion, au Sénégal, le nombre de personnes supposées malades de COVID-19 est très faible. Ainsi, les efforts déployés contre le COVID-19 devraient être réorientés vers la prise en charge des autres pathologies prioritaires des sénégalais. Il y va de l´efficience dans la mise en œuvre des politiques de santé publique.

Les auteurs ne déclarent aucun conflit d'intérêts.

Tous les auteurs ont lu et approuvé la version finale du manuscrit.

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