Domäne__Biologie_
Domäne__Biologie_

=== Ursprung der Eukaryoten ===
Der Drei-Domänen-Stammbaum nach Woese und die Eozyten-Hypothese (Zwei-Domänen-Stammbaum) nach Cox ''et al.'', 2008.
Die Eukaryoten sind vermutlich aus den Archaeen (nämlich dem Umfeld der Asgardarchaeota) hervorgegangen. Außer der Ausbildung eines abgegrenzten Zellkerns (möglicherweise unter Mithilfe von Viren) haben diese in einer Symbiogenese Bakterien (aus dem Umfeld der Rickettsiales, Alphaproteobacteria) aufgenommen. Dadurch wurden diese Bakterien zu Organellen  – Mitochondrien, Hydrogenosomen, Mitosomen – insgesamt auch genannt MROs (); siehe auch Eozyten-Hypothese. In diesen Szenario wären die Archaeen paraphyletisch. Um dies zu vermeiden, müssten die Eukaryoten im Sinn der Kladistik den Archaeen zugeordnet werden. Allerdings stößt bei einer solchen Entstehung mittels Symbiogenese die kladistische Methodik ohnehin an ihre Grenzen.