# Introdução ao Jornalismo Científico/Metodologia e Filosofia da Ciência/Atividade/Thalef Sousa Santos
## Nome da atividade

Esta seção apresenta a tarefa principal do Módulo 1 do curso de "Introdução ao Jornalismo Científico". A realização da tarefa é indispensável para o reconhecimento de participação no curso. Seu trabalho estará acessível, publicado no ambiente wiki, e será anexado ao certificado de realização do curso, quando finalizar todas as atividades. Tome cuidado de estar logado na Wikiversidade. Se não estiver logado, não será possível verificar o trabalho.

## Descrição da atividade

Atuar no jornalismo científico é às vezes comparado ao de ser um tradutor, no jargão da área da comunicação um 'tradutor intersemiótico', que passa a linguagem de um campo para o de outro campo. Nesta atividade, vamos observar e analisar como isso foi feito em uma das principais publicações acadêmicas brasileiras, a Pesquisa FAPESP.
Você deverá selecionar um artigo na revista Pesquisa FAPESP. Estão acessíveis na página principal da publicação. Escolha um artigo sobre um tema de pesquisa - ou seja, que seja baseado em uma ou mais de uma publicação científica - e leia-o com cuidado. Responda às perguntas que seguem.
As respostas deverão ser publicadas nesta página individual. Apenas altere os campos indicados.

## Nome de usuário(a)

Thalef Sousa Santos

## Link para a matéria selecionada

Nesta seção, você deverá colocar os links da matéria selecionada. Esteja logado.
* Título de matéria: “Proteína de bactéria que vive entre o solo e pilhas de bagaço de cana pode aumentar produtividade do etanol de segunda geração”
* Autoria de matéria: Marcos Pivetta
* Link de matéria: https://revistapesquisa.fapesp.br/proteina-de-bacteria-que-vive-entre-o-solo-e-pilhas-de-bagaco-de-cana-pode-aumentar-produtividade-do-etanol-de-segunda-geracao/

## Resumo da matéria

Para esta etapa, resuma a matéria em até 300 caracteres. Esteja logado.
Pesquisadores do LNBR (CNPEM) descobriram a enzima CelOCE, produzida pela bactéria UBP4 em solos ricos em bagaço de cana. A enzima acelera a quebra da celulose em glicose, aumentando em 21% a eficiência do coquetel enzimático para etanol de segunda geração. O estudo foi publicado na Nature e está em fase de patente.

## Análise da matéria

Para esta etapa, identifique e analise com base na matéria: o objeto e a metodologia (observação, hipótese, experimentação, análise e publicação) da pesquisa. Esteja logado.
Objeto de pesquisa
O objeto da pesquisa é a enzima CelOCE, identificada em solos de usinas de cana-de-açúcar, e sua capacidade de acelerar a degradação da celulose em glicose. O estudo busca entender o papel dessa enzima no processo de produção de etanol de segunda geração o e seu potencial para aumentar a eficiência da hidrólise da biomassa.
Metodologia
1. Observação: Os pesquisadores analisaram solos onde resíduos de biomassa da cana são estocados há mais de 20 anos, partindo da hipótese de que esses ambientes poderiam conter microrganismos especializados na degradação da celulose.
2. Hipótese: A equipe formulou a hipótese de que nesses ambientes haveria bactérias produtoras de enzimas altamente eficientes na desconstrução da celulose.
3. Experimentação:
- Coletaram amostras do solo e extraíram DNA para identificar possÃ­veis microrganismos envolvidos.
- Descobriram a bactéria UBP4 e identificaram o gene responsável pela produção da CelOCE.
- Clonaram esse gene e o inseriram no fungo Trichoderma reesei usando a técnica CRISPR-Cas9, permitindo sua produção em laboratório.
- Testaram a eficiência da CelOCE em comparação com outras enzimas, como as LPMO, e observaram que a nova enzima dobrava a eficiência dessas no coquetel enzimático.
4. Análise: A estrutura cristalográfica da CelOCE foi determinada com auxílio do acelerador Sirius, revelando um arranjo molecular incomum e um sítio ativo compacto, o que explica sua elevada eficiência.
5. Publicação: Os resultados foram publicados na revista Nature, validando a descoberta no meio científico. Além disso, o LNBR iniciou negociações para o licenciamento da enzima para uso industrial.

## Análise da pesquisa

Para esta etapa, acesse a(s) pesquisa(s) de origem, de base para o artigo na Pesquisa FAPESP, identifique e analise a seção metodológica. Em especial, explique em que medida o processo de pesquisa foi bem documentado no artigo que você selecionou. Esteja logado.
O processo de pesquisa do artigo A metagenomic ‘dark matter’ enzyme catalyses oxidative cellulose cleavage foi bem documentado no texto analisado, pois apresenta, de forma estruturada e acessível, os principais elementos metodológicos do estudo.
A reportagem descreve claramente a observação inicial, mencionando a escolha de solos de usinas de cana-de-açúcar como locais propícios para encontrar microrganismos degradadores de celulose. Explica também a coleta de amostras, a extração e análise do DNA para identificar a bactéria UBP4, e a clonagem do gene da enzima no fungo Trichoderma reesei por meio da tecnologia CRISPR-Cas9. Além disso, a caracterização estrutural da enzima usando o acelerador de partículas Sirius é destacada, o que demonstra o rigor experimental do estudo.
A validação dos resultados também é mencionada, enfatizando a eficiência da CelOCE na quebra da celulose e seu impacto na produção de etanol de segunda geração. A reportagem reforça a credibilidade do trabalho ao citar sua publicação na Nature, as colaborações internacionais e os comentários de especialistas externos.

## Metáfora científica

Para esta etapa, reveja o conteúdo da aula sobre "A metáfora científica". No artigo da Pesquisa FAPESP selecionado, identifique quais foram as metáforas científicas ou cientificamente inspiradas utilizadas e justifique esse uso a partir das indicações da aula. Analise em que medida contribuem ou dificultam o entendimento da ciência. Esteja logado.
No texto da reportagem identificam-se algumas metáforas que facilitam a compreensão de conceitos científicos.
A palavra “desconstruir” é utilizada para descrever o processo de degradação da celulose em glicose.
A enzima é descrita como um agente que “acelera” a quebra da celulose, sugerindo que ela atua como um catalisador que torna o processo mais rápido e eficiente.
Outro termo utilizado para descrever a enzima foi “biocatalizador”, que combina “bio” (vida) e “catalisador” (substância que aumenta a velocidade de uma reação química).
Essas metáforas da linguagem comum e cientificamente inspiradas, tornam o conteúdo mais acessível ao público não especializado. A reportagem também contextualiza os termos referentes, o suficiente para que se torne claro o significado da expressão.

## Filosofia da ciência

Para esta etapa, reveja o conteúdo da aula sobre "Ciência e Filosofia". Discorra sobre em que medida o artigo da Pesquisa FAPESP que você selecionou coloca questões filosóficas e apresente exemplos extraídos do texto. Esteja logado.
A reportagem aborda implicitamente alguns conceitos da filosofia da ciência. Podemos identificar, por exemplo:
1. Falseabilidade e Corroboração:
Os pesquisadores propuseram que a enzima poderia aumentar a eficiência na produção de etanol de segunda geração. Para corroborar essa hipótese, realizaram experimentos que demonstraram um aumento de 21% na eficiência do coquetel enzimático comercial. Ou seja, testaram e validaram a hipótese.
2. Ciência Normal e Ciência Extraordinária:
A descoberta da CelOCE pode ser vista como parte da ciência normal, onde os pesquisadores trabalham dentro do paradigma de busca por enzimas que auxiliem na degradação da celulose. Entretanto, a identificação de uma enzima com eficiência significativamente maior pode levar a uma mudança de paradigma nas técnicas de produção de etanol.
3. Construção Social do Conhecimento Científico:
A reportagem menciona a colaboração entre diversas instituições, como o CNPEM, USP, Universidade Aix Marseille e a Universidade Técnica da Dinamarca. Essa cooperação internacional exemplifica a construção social do conhecimento científico, onde descobertas são resultado de esforços coletivos.
4. Ética na Pesquisa Científica:
A utilização da ferramenta de edição genética CRISPR-Cas9 para introduzir o gene da bactéria no fungo Trichoderma reesei levanta questões éticas sobre a manipulação genética. Essa atividade implica uma reflexão sobre os limites éticos da intervenção humana nos processos biológicos.

## Próximos passos

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