# Sequência biológica

Uma sequência biológica é a descrição da sequência de elementos (ou monômeros) que constituem uma macromolécula biológica, ácido nucleico ou proteína. Essas macromoléculas são de fato polímeros lineares, consistindo de nucleotídeos para os primeiros ou de aminoácidos para os segundos. A sequência é geralmente representada sob a forma de uma cadeia de caracteres que é armazenada em uma arquivo de computador em formato texto.
No caso do ADN, isto corresponde à sequência de bases, tal como pode ser obtido na saída de um sequenciador de DNA. Isso corresponde à informação genética bruta. No caso de proteínas, isto corresponde à sequência de aminoácidos que pode ser obtida por sequenciação química ou por tradução da sequência do gene correspondente no DNA.

## Sequências nucleotídicas
### Sequências genéticas

No caso de uma sequência de ADN, o "texto" é um consistindo apenas de 4 letras correspondentes aos quatro nucleotídeos formando a sequência de um dos filamentos de DNA: A para adenina, G para guanina, T para timina, C para citosina. Tem-se que ter cuidado se a direção da leitura puder ser 3' para 5' ou inversa.
Exemplo de uma sequência biológica de DNA para o gene Antennapedia CG1028-RH de Drosophila melanogaster:

### Sequências de ARN

No caso de uma sequência de ARN, a letra U é utilizada para designar a uracila substituindo a timina para estas moléculas.

## Sequências de proteínas (péptidos)

Esta sequência corresponde ao que é chamado de estrutura primária da proteína em bioquímica. Chamamos tradução, a etapa de síntese de proteínas a partir de uma sequência nucleotídica, este passo pode ser facilmente previsto por software de computador para a identificação de genes até agora desconhecidos. O código genético dá uma letra do alfabeto para cada um dos 20 aminoácidos existentes, em correspondência com os diferentes códons. Como um códon é formado por três bases, a sequência da proteína é três vezes menor que a sequência nucleica correspondente.
Aqui está um exemplo em proteína do gene Antennapedia de Drosophila:

## Outras sequências
### Sequência glicídica

Sequência glicídica ou glucídica ou ainda, sequência de carboidratos, são moléculas compostas tendo como monômeros carboidratos como constituinte. Diferentemente dos componentes dos ácidos nucléicos, os carboidratos podem se unir de maneiras múltiplas e não-lineares, porque cada bloco de construção tem cerca de quatro grupos funcionais para a ligação, podendo até formar cadeias ramificadas. Assim sendo, o número de possíveis polissacarídeos é enorme. Como os carboidratos assumem uma grande variedade de configurações, muitas proteínas de ligação a carboidratos estão sendo consideradas alvos de novos medicamentos.
Deve-se observar que o DNA não codifica para carboidratos, que assim como os lipídios são sintetizados, decompostos e metabolizados com a ajuda das enzimas.
Sequências de carboidratos tem processos de sequenciamento específicas para sua natureza, como por exemplo a espectrometria de massa de armadilha de íon quadrupolo ou a espectrometria de massa de múltiplos estágios (MSn, de multiple-stage mass spectrometry).
A diversidade de estruturas de oligossacarídeos pode conferir a especificidade inerente a muitas interações moleculares e celulares. Cientistas de numerosas disciplinas enfrentam o desafio de determinar sua sequência e decifrar sua função. Um exemplo é o bikunin, o proteoglicano mais simples, com uma única cadeia de glicosaminoglicanos, que é um inibidor da protease de serina usado no tratamento da pancreatite aguda e inibidor de tripsina urinário.

## Processamento por computador
### Análise de sequências

Sequências como estas podem ser usadas como entrada (copiado/colado com todas as anotações) para fazer análise de sequência como no programa BLAST. Outros programas permitem que se pesquise estruturas palindrômicas. Bluejay é um programa escrito em Java permitindo transformar dados de sequência de ADN em XML.

### Anotações genômicas

Ensembl é um software usado para anotar sequências genômicas.

## Tipos de seqüências biológicas particulares

* Sequência repetitiva
* Repetição terminal longa
* Promotor
* Microssatélite