# Copa da UEFA de 2008–09

A Copa da UEFA de 2008–09 foi a 38ª edição do segundo principal torneio europeu de clubes de futebol. O Shakhtar Donetsk conquistou seu primeiro título da competição após vencer o Werder Bremen por 2–1 na final realizada no Estádio Şükrü Saraçoğlu, em Istambul.

## Qualificação

122 equipes participaram nesta edição, das 53 associações da UEFA. Cada associação pode beneficiar de um certo número de equipas para a Copa da UEFA com base no seu Coeficiente das Ligas Nacionais. Através de competições domésticas (campeonatos nacionais e taças e taças da liga, em certos países) uma associação pode beneficiar até quatro equipes. Abaixo está a qualificação para a temporada 2008–09:

### 1ª pré-eliminatória(74 equipas)

* 33 vencedores de Taças associações 21-53
* 32 segundo classificados de associações 19-37, 39-50 e 53
* 6 terceiro classificados de associações 16-21
* 3 vencedores do prémio Fair Play

### 2ª pré-eliminatória(64 equipas)

* 37 vencedores da 1ª eliminatória de qualificação
* 6 vencedores da taça de associações 15-20
* 7 terceiro classificados de associações 9-15
* 3 segundo classificados de associações 16-18
* 11 entradas a partir de Copa Intertoto da UEFA de 2008

### 1ª eliminatória(80 equipas)

* 32 2ª eliminatória de qualificação
* 14 vencedores da taça de associações 1-14
* 2 terceiro classificados de associações 7-8
* 5 quarto classificados de associações 4-8
* 7 quinto classificados de associações de 1-3, 5-8
* 2 sexto classificados de associações 1-2
* 2 vencedores da Taça da Liga de associações 3-4
* 16 entradas a partir de 3ª eliminatória da Liga dos Campeões

### Fase de Grupos(40 equipas)

* 40 vencedores da primeira fase

### Fases finais(32 equipas)

* 24 top-três acabadoras da Fase de Grupos
* 8 entradas a partir de Fase de Grupos da Liga dos Campeões

## Calendário

O calendário da prova:
| Data | Evento | Data | Evento |
| 1 de Julho 2008 | Sorteio da 1ª pré-eliminatória | 17 de Dezembro 2008 | Fase de Grupos, 5ª ronda |
| 17 de Julho 2008 | 1ª pré-eliminatória, 1ª mão | 18 de Dezembro 2008 | Fase de Grupos, 5ª ronda |
| 31 de Julho 2008 | 1ª pré-eliminatória, 2ª mão | 19 de Dezembro 2008 | Sorteio dos Dezasseis e oitavos de final |
| 1 de Agosto 2008 | Sorteio da 2ª pré-eliminatória | 18 de Fevereiro 2009 | Dezasseis-avos de final, 1ª mão |
| 14 de Agosto 2008 | 2ª pré-eliminatória, 1ª mão | 19 de Fevereiro 2009 | Dezasseis-avos de final, 1ª mão |
| 28 de Agosto 2008 | 2ª pré-eliminatória, 2ª mão | 26 de Fevereiro 2009 | Dezasseis-avos de final, 2ª mão |
| 29 de Agosto 2008 | Sorteio da 1ª eliminatória | 12 de Março 2009 | Oitavos de final, 1ª mão |
| 18 de Setembro 2008 | 1ª eliminatória, 1ª mão | 18 de Março 2009 | Oitavos de final, 2ª mão |
| 2 de Outubro 2008 | 1ª eliminatória, 2ª mão | 19 de Março 2009 | Oitavos de final, 2ª mão |
| 7 de Outubro 2008 | Sorteio da Fase de Grupos | 20 de Março 2009 | Sorteio das fases restantes |
| 23 de Outubro 2008 | Fase de Grupos, 1ª ronda | 9 de Abril 2009 | Quartos de final, 1ª mão |
| 6 de Novembro 2008 | Fase de Grupos, 2ª ronda | 16 de Abril 2009 | Quartos de final, 2ª mão |
| 27 de Novembro 2008 | Fase de Grupos, 3ª ronda | 30 de Abril 2009 | Meias-finais, 1ª mão |
| 3 de Dezembro 2008 | Fase de Grupos, 4ª ronda | 7 de Maio 2009 | Meias-finais, 2ª mão |
| 4 de dezembro 2008 | Fase de Grupos, 4ª ronda | 20 de maio 2009 | Final em Istambul, Turquia |

## Eliminatórias de qualificação
### 1ª Pré-eliminatória

O sorteio da 1ª pré-eliminatória foi realizado no dia 1 de julho de 2008.
Os jogos de ida foram aconteceram no dia 17 de julho de 2008, e os jogos de volta no dia 31 de julho.
| Equipe 1 | Total | Equipe 2 | 1.º jogo | 2.º jogo |
| Região Sul-Mediterrânica |||||
| Cherno More | 9-0 | Sant Julià | 4-0 | 5-0 |
| Pelister | 0-1 | APOEL | 0-0 | 0-1 |
| Vaduz | 1-5 | Zrinjski Mostar | 1-2 | 0-3 |
| Široki Brijeg | 3-1 | Partizani | 0-0 | 3-1 |
| Ironi Kiryat Shmona | 4-1 | Mogren | 1-1 | 3-0 |
| Koper | 1-2 | Vllaznia Shkodër | 1-2 | 0-0 |
| Zeta | 1-2 | Interblock Ljubljana | 1-1 | 0-1 |
| Hapoel Tel Aviv | 5-0 | Juvenes/Dogana | 3-0 | 2-0 |
| Hajduk Split | 7-0 | Birkirkara | 4-0 | 3-0 |
| Omonia | 4-1 | Milano | 2-0 | 2-1 |
| Marsaxlokk | 0-8 | Slaven Belupo | 0-4 | 0-4 |
| Região Centro-Leste |||||
| Red Bull Salzburg | 10-0 | Banants Yerevan | 7-0 | 3-0 |
| Győri | 3-1 | Zestaponi | 1-1 | 2-1 |
| Ararat Yerevan | 1-4 | Bellinzona | 0-1 | 1-3 |
| Dacia Chisinau | 2-4 | Borac Cacak | 1-1 | 1-3 |
| Tobol | 1-2 | Austria Wien | 1-0 | 0-2 |
| Hertha BSC | 8-1 | Nistru Otaci | 8-1 | 0-0 |
| Khazar Lankaran | 1-5 | Lech Poznan | 0-1 | 1-4 |
| Legia Warsaw | 4-1 | Gomel | 0-0 | 4-1 |
| Spartak Trnava | 2-3 | WIT Georgia | 2-2 | 0-1 |
| Partyzan Minsk | 2-3 | MŠK Žilina | 2-2 | 0-1 |
| Shakhter Karagandy | 1-2 | Debrecen | 1-1 | 0-1 |
| Vojvodina | 2-1 | Olimpik Baku | 1-0 | 1-1 |
| Região Norte |||||
| FH Hafnarfjarðar | 8-3 | Grevenmacher | 3-2 | 5-1 |
| Vėtra | 1-2 | Viking | 1-0 | 0-2 |
| Racing | 1-10 | Kalmar | 0-3 | 1-7 |
| Honka | 4-2 | Akranes | 3-0 | 1-2 |
| Glentoran | 1-3 | Liepājas Metalurgs | 1-1 | 0-2 |
| Brøndby | 3-0 | B36 Tórshavn | 1-0 | 2-0 |
| TVMK | 0-8 | Nordsjælland | 0-3 | 0-5 |
| EB/Streymur | 0-4 | Manchester City | 0-2 | 0-2 |
| Olimps | 0-3 | St Patrick's Athletic | 0-1 | 0-2 |
| Djurgården | 2-2 (g.f.) | Flora Tallinn | 0-0 | 2-2 |
| Sūduva | 2-0 | The New Saints | 1-0 | 1-0 |
| Cliftonville | 0-11 | Copenhagen | 0-4 | 0-7 |
| Cork City | 2-6 | Haka | 2-2 | 0-4 |
| Bangor City Football Club | 1-10 | Midtjylland | 1-6 | 0-4 |
Legenda:
* g.f. - equipa apurou-se pela Regra do gol fora de casa

### 2ª Pré-eliminatória

O sorteio da 2ª Pré-eliminatória foi a 1 de Agosto de 2008 em Nyon, Suíça, onde entraram 16 equipas por apuramento directo, 37 vencedores da eliminatória anterior, e os 11 finalistas da Copa Intertoto.
Os jogos da primeira mão foram a 14 de Agosto, e os da segunda mão a 28 de Agosto.
| Equipe 1 | Total | Equipe 2 | 1.º jogo | 2.º jogo |
| Região Sul-Mediterrânica |||||
| Široki Brijeg | 1-6 | Besiktas | 1-2 | 0-4 |
| Braga | 3-0 | Zrinjski Mostar | 1-0 | 2-0 |
| Borac Cacak | 2-1 | Lokomotiv Sofia | 1-0 | 1-1 |
| Vojvodina | 0-3 | Hapoel Tel Aviv | 0-0 | 0-3 |
| Aris Thessaloniki | 1-2 | Slaven Belupo | 1-0 | 0-2 |
| Litex Lovech | 2-1 | Ironi Kiryat Shmona | 0-0 | 2-1 |
| Deportivo La Coruña | 2-0 | Hajduk Split | 0-0 | 2-0 |
| APOEL | 5-5 (g.f.) | Red Star Belgrade | 2-2 | 3-3 (a.p.) |
| Vllaznia Shkodër | 0-9 | Napoli | 0-3 | 0-5 |
| Maccabi Netanya | 1-3 | Cherno More | 1-1 | 0-2 |
| AEK Atenas | 2-3 | Omonia | 0-1 | 2-2 |
| Região Centro-Leste |||||
| Liepājas Metalurgs | 1-5 | Vaslui | 0-2 | 1-3 |
| Zürich | 2-2 (g.p.) | Sturm Graz | 1-1 | 1-1 |
| Stuttgart | 6-2 | Győri | 2-1 | 4-1 |
| Lech Poznan | 6-0 | Grasshopper | 6-0 | 0-0 |
| Slovan Liberec | 2-4 | MŠK Žilina | 1-2 | 1-2 |
| WIT Georgia | 0-2 | Austria Wien | (c) | 0-2 |
| Young Boys | 7-3 | Debrecen | 4-1 | 3-2 |
| Legia Warsaw | 1-4 | FC Moscou | 1-2 | 0-2 |
| Dnipro Dnipropetrovsk | 4-4 (g.f.) | Bellinzona | 3-2 | 1-2 |
| Interblock Ljubljana | 0-3 | Hertha BSC | 0-2 | 0-1 |
| Sūduva | 2-4 | Red Bull Salzburg | 1-4 | 1-0 |
| Região Norte |||||
| Djurgården | 2-6 | Rosenborg | 2-1 | 0-5 |
| Queen of the South | 2-4 | Nordsjælland | 1-2 | 1-2 |
| Gent | 2-5 | Kalmar | 2-1 | 0-4 |
| Manchester City | 1-1 (g.p.) | Midtjylland | 0-1 | 1-0 |
| Honka | 2-1 | Viking | 0-0 | 2-1 |
| Haka | 0-6 | Brøndby | 0-4 | 0-2 |
| Stabæk | 2-3 | Rennes | 2-1 | 0-2 |
| Copenhagen | 7-3 | Lillestrøm | 3-1 | 4-2 |
| Elfsborg | 3-4 | St. Patrick’s Athletic | 2-2 | 1-2 |
| FH | 2-5 | Aston Villa | 1-4 | 1-1 |
Legenda:
* a.p. - equipe avançou após a prorrogação

## 1ª Eliminatória

O sorteio da 1ª Eliminatória do torneio foi realizado no dia 29 de agosto de 2008.
Para esta fase entram as 32 equipas apuradas directamente para a eliminatória, as vencedoras da 2ª Pré-eliminatória, e também os vencidos da 3ª eliminatória da Liga dos Campeões.
Os jogos da primeira mão foram, na sua maioria, a 18 de Setembro, e os da segunda mão a 2 de Outubro.
| Equipe 1 | Total | Equipe 2 | 1.º jogo | 2.º jogo |
| Grupo 1 |||||
| Milan | 4 - 1 | Zürich | 3-1 | 1-0 |
| Politehnica Timisoara | 1 - 3 | Partizan | 1-2 | 0-1 |
| Hertha Berlim | 2 - 0 | St. Patrick’s Athletic | 2-0 | 0-0 |
| Baník Ostrava | 1 - 2 | Spartak Moscovo | 0-1 | 1-1 |
| Besiktas | 2 - 4 | Metalist Kharkiv | 1-2 | 1-4 |
| Grupo 2 |||||
| Portsmouth | 4 - 2 | Vitória de Guimarães | 2-0 | 2-2 (a.p.) |
| Kayserispor | 1 - 2 | Paris Saint-Germain | 1-2 | 0-0 |
| Sevilla | 4 - 0 | Red Bull Salzburg | 2-0 | 2-0 |
| Wolfsburg | 2 - 1 | Rapid Bucuresti | 1-0 | 1-1 |
| Sampdoria | 7 - 1 | Kaunas | 5-0 | 2-1 |
| Grupo 3 |||||
| Marítimo | 1 - 3 | Valencia | 0-1 | 1-2 |
| Dinamo Zagreb | 3 - 3 (g.f.) | Sparta Praha | 0-0 | 3-3 |
| Omonia | 2 - 4 | Manchester City | 1-2 | 1-2 |
| Young Boys | 2 - 4 | Club Brugge | 2-2 | 0-2 |
| Nancy | 3 - 0 | Motherwell | 1-0 | 2-0 |
| Grupo 4 |||||
| Everton | 3 - 4 | Standard Liège | 2-2 | 1-2 |
| Napoli | 3 - 4 | Benfica | 3-2 | 0-2 |
| Bellinzona | 4 - 6 | Galatasaray | 3-4 | 1-2 |
| NEC Nijmegen | 1 - 0 | Dinamo Bucharest | 1-0 | 0-0 |
| Racing Santander | 2 - 0 | Honka | 1-0 | 1-0 |
| Equipe 1 | Total | Equipe 2 | 1.º jogo | 2.º jogo |
| Grupo 5 |||||
| APOEL | 2 - 5 | Schalke | 1-4 | 1-1 |
| Litex Lovech | 2 - 4 | Aston Villa | 1-3 | 1-1 |
| Austria Wien | 4 - 5 | Lech Poznan | 2-1 | 2-4 (a.p.) |
| Vitória de Setúbal | 3 - 6 | Heerenveen | 1-1 | 2-5 |
| Brann | 2 - 2 (2-3)(g.p.) | Deportivo La Coruña | 2-0 | 0-2 (a.p.) |
| Grupo 6 |||||
| Slavia Praga | 1 - 1 (g.f.) | Vaslui | 0-0 | 1-1 |
| Slaven Belupo | 1 - 3 | CSKA Moscou | 1-2 | 0-1 |
| Brøndby | 3 - 5 | Rosenborg | 1-2 | 2-3 |
| Cherno More | 3 - 4 | Stuttgart | 1-2 | 2-2 |
| Rennes | 2 - 2 (g.f.) | FC Twente | 2-1 | 0-1 |
| Grupo 7 |||||
| Borac Cacak | 1 - 6 | Ajax | 1-4 | 0-2 |
| Tottenham | 3 - 2 | Wisla Kraków | 2-1 | 1-1 |
| FC Moscou | 2 - 3 | Copenhagen | 1-2 | 1-1 |
| MŠK Žilina | 2 - 1 | Levski Sofia | 1-1 | 1-0 |
| Borussia Dortmund | 2 - 2 (3-4)(g.p.) | Udinese | 0-2 | 2-0 (a.p.) |
| Grupo 8 |||||
| Braga | 6 - 0 | Artmedia Petržalka | 4-0 | 2-0 |
| Feyenoord | 2 - 2 (g.f.) | Kalmar | 0-1 | 2-1 |
| Hamburgo | 2 - 0 | Unirea Urziceni | 0-0 | 2-0 |
| Hapoel Tel Aviv | 2 - 4 | Saint-Étienne | 1-2 | 1-2 |
| Nordsjælland | 0 - 7 | Olympiacos | 0-2 | 0-5 |
Legenda:
* a.p. - equipa apurou-se após prolongamento)

## Fase de grupos

O sorteio para a fase de grupos realizou-se na sede da UEFA em Nyon, Suíça, a 7 de Outubro de 2008. As 40 equipas no sorteio foram divididas em cinco potes com base em seus coeficientes da UEFA. As oito equipes com o maior coeficiente da UEFA foram atribuídos ao Pote 1, as oito seguintes para Pote 2, e assim por diante. Uma equipa de cada pote foi sorteada para cada grupo, com a restrição de que nenhuma equipa poderia defrontar outra do mesmo país.
Legenda:
* Classificados para os Dezasseis-avos de Final
* Eliminados

## Fase Final

Todas as rondas na fase final são a duas mãos, com excepção para a final. No caso do resultado agregado ser idêntico em golos para as duas equipas após o tempo normal do segundo jogo, a equipe vencedora será aquela que mais marcar fora; se mesmo assim for idêntico joga-se tempo extra. (A regra de golos fora também se aplica se no final do tempo extra.) Se não houver golos marcados no tempo extra, o empate é decidido através de grandes penalidades.

## Eliminatórias

| Dezasseis-avos finais | Dezasseis-avos finais | Dezasseis-avos finais | Dezasseis-avos finais | Oitavos-finais | Oitavos-finais | Oitavos-finais | Oitavos-finais | Quartos-finais | Quartos-finais | Quartos-finais | Quartos-finais | Semi-finais | Semi-finais | Semi-finais | Semi-finais | Final | Final |
| Paris Saint-Germain | 2 | 3 | 5 |
| Wolfsburg | 0 | 1 | 1 | Paris Saint-Germain | 0 | 1 | 1 |
| Braga | 3 | 1 | 4 | Braga | 0 | 0 | 0 |
| Standard Liège | 0 | 1 | 1 | | | | | Paris Saint-Germain | 0 | 0 | 0 |
| Dínamo de Kiev (g.f.) | 1 | 2 | 3 | | | | | Dínamo de Kiev | 0 | 3 | 3 |
| Valencia | 1 | 2 | 3 | Dínamo de Kiev (g.f.) | 1 | 2 | 3 | | | | |
| Sampdoria | 0 | 0 | 0 | Metalist Kharkiv | 0 | 3 | 3 | | | | |
| Metalist Kharkiv | 1 | 2 | 3 | | | | | | | | | Dínamo de Kiev | 1 | 1 | 2 |
| Aston Villa | 1 | 0 | 1 | | | | | | | | | Shakhtar Donetsk | 1 | 2 | 3 |
| CSKA Moscou | 1 | 2 | 3 | CSKA Moscou | 1 | 0 | 1 | | | | | | | | |
| Shakhtar Donetsk | 2 | 1 | 3 | Shakhtar Donetsk | 0 | 2 | 2 | | | | | | | | |
| Tottenham Hotspur | 0 | 1 | 1 | | | | | Shakhtar Donetsk | 2 | 2 | 4 | | | | |
| Marseille (g.p.) | 0 | 1 | 1(7) | | | | | Marseille | 0 | 1 | 1 | | | | |
| Twente | 1 | 0 | 1(6) | Marseille | 2 | 2 | 4 | | | | | | | | |
| Fiorentina | 0 | 1 | 1 | Ajax | 2 | 1 | 3 | | | | | | | | |
| Ajax | 1 | 1 | 2 | | | | | | | | | | | | | Shakhtar Donetsk | 2 |
| Werder Bremen (g.f.) | 1 | 2 | 3 | | | | | | | | | | | | | Werder Bremen | 1 |
| Milan | 1 | 2 | 3 | Werder Bremen | 1 | 2 | 3 | | | | | | | | |
| Olympiacos | 1 | 1 | 2 | Saint-Étienne | 0 | 2 | 2 | | | | | | | | |
| Saint-Étienne | 2 | 3 | 5 | | | | | Werder Bremen | 3 | 3 | 6 | | | | |
| Lech Poznań | 2 | 1 | 3 | | | | | Udinese | 1 | 3 | 4 | | | | |
| Udinese | 2 | 2 | 4 | Udinese | 2 | 0 | 2 | | | | | | | | |
| Zenit | 2 | 2 | 4 | Zenit | 0 | 1 | 1 | | | | | | | | |
| Stuttgart | 1 | 1 | 2 | | | | | | | | | Werder Bremen | 0 | 3 | 3 |
| NEC Nijmegen | 0 | 0 | 0 | | | | | | | | | Hamburgo | 1 | 2 | 3 |
| Hamburgo | 3 | 1 | 4 | Hamburgo | 1 | 3 | 4 | | | | | | | | |
| Bordeaux | 0 | 3 | 3 | Galatasaray | 1 | 2 | 3 | | | | |
| Galatasaray | 0 | 4 | 4 | | | | | Hamburgo | 3 | 2 | 5 |
| Copenhagen | 2 | 1 | 3 | | | | | Manchester City | 1 | 3 | 4 |
| Manchester City | 2 | 2 | 4 | Manchester City (g.p.) | 2 | 0 | 2(4) | | | | |
| AaB Aalborg | 3 | 3 | 6 | AaB Aalborg | 0 | 2 | 2(3) |
| Deportivo La Coruña | 0 | 1 | 1 | | | | |

### Dezasseis-avos de Final
#### Sorteio

O sorteio realizou-se a 19 de Dezembro de 2008, em Nyon, na Suíça, e os jogos estão agendados para 18 de Fevereiro a primeira mão, e dia 26 de Fevereiro a segunda mão.
Nesta fase da competição jogarão as 24 equipas apuradas da fase de grupos bem como as 8 equipas que ficaram no terceiro lugar de cada um de grupos da fase de grupos da Liga dos Campeões. Decorrerá da seguinte forma:
* As oito primeiro classificadas de cada grupo jogaram contra as oito terceiro classificadas;
* As oito segundo classificadas de cada grupo jogaram contra as oito terceiro classificadas de cada grupo da fase de grupos da Liga dos Campeões.
| Grupo | Vencedor do Grupo | Segundo-lugar do grupo | Terceiro-lugar do grupo | Terceiro lugar na Liga dos Campeões (fase de grupos) |
| A | Manchester City | Twente | Paris Saint-Germain | Bordeaux |
| B | Metalist Kharkiv | Galatasaray | Olympiacos | Werder Bremen |
| C | Standard Liège | Stuttgart | Sampdoria | Shaktar Donetsk |
| D | Udinese | Tottenham Hotspur | NEC Nijmegen | Marseille |
| E | Wolfsburg | Milan | Braga | AaB Aalborg |
| F | Hamburgo | Ajax | Aston Villa | Fiorentina |
| G | Saint-Étienne | Valencia | Copenhagen | Dínamo de Kiev |
| H | CSKA Moscou | Deportivo La Coruña | Lech Poznań | Zenit |

#### Jogos

Os jogos realizaram-se a 18 e 19 de Fevereiro de 2009 para a primeira mão, e 26 de Fevereiro, para a segunda mão.
| Equipe 1 | Total | Equipe 2 | 1.º jogo | 2.º jogo |
| Paris Saint-Germain | 5 - 1 | Wolfsburg | 2 – 0 | 3 - 1 |
| Copenhagen | 3 - 4 | Manchester City | 2 - 2 | 1 - 2 |
| NEC Nijmegen | 0 - 4 | Hamburgo | 0 – 3 | 0 - 1 |
| Sampdoria | 0 - 3 | Metalist Kharkiv | 0 – 1 | 0 - 2 |
| Braga | 4 - 1 | Standard Liège | 3 – 0 | 1 - 1 |
| Aston Villa | 1 - 3 | CSKA Moscou | 1 – 1 | 0 - 2 |
| Lech Poznań | 3 - 4 | Udinese | 2 - 2 | 1 - 2 |
| Olympiacos | 2 - 5 | Saint-Étienne | 1 – 3 | 1 - 2 |
| Fiorentina | 1 - 2 | Ajax | 0 - 1 | 1 - 1 |
| AaB Aalborg | 6 - 1 | Deportivo La Coruña | 3 – 0 | 3 - 1 |
| Werder Bremen | 3 - 3 (g.f.) | Milan | 1 – 1 | 2 - 2 |
| Bordeaux | 3 - 4 | Galatasaray | 0 – 0 | 3 - 4 |
| Dínamo de Kiev | 3 - 3 (g.f.) | Valencia | 1 – 1 | 2 - 2 |
| Zenit | 4 - 2 | Stuttgart | 2 – 1 | 2 - 1 |
| Olympique de Marseille | 1 - 1 (7-6 g.p.) | Twente | 0 - 1 | 1 - 0 |
| Shakhtar Donetsk | 3 - 1 | Tottenham | 2 - 0 | 1 - 1 |

### Oitavas-de-final

O sorteio para os oitavos finais teve lugar a 19 de Dezembro de 2008, imediatamente após o sorteio para os Dezasseis-avos de Final. Cada jogo na dos dezasseis-avos foi numerado e as equipas foram sorteadas para os oitavos-finais. Os jogos da primeira mão realizaram-se a 12 de março, e os da segunda mão a 18 e 19 de Março.
| Equipe 1 | Total | Equipe 2 | 1.º jogo | 2.º jogo |
| Werder Bremen | 3 - 2 | Saint-Étienne | 1-0 | 2-2 |
| CSKA Moscou | 1 - 2 | Shakhtar Donetsk | 1-0 | 0-2 |
| Udinese | 2 - 1 | Zenit | 2-0 | 0-1 |
| Paris Saint-Germain | 1 - 0 | Braga | 0-0 | 1-0 |
| Dínamo de Kiev | 3 - 3 (g.f.) | Metalist Kharkiv | 1-0 | 2-3 |
| Manchester City | 2 - 2 (4-3g.p.) | AaB Aalborg | 2-0 | 0-2 |
| Olympique de Marseille | 4 - 3 (a.p.) | Ajax | 2-1 | 2-2 |
| Hamburgo | 4 - 3 | Galatasaray | 1-1 | 3-2 |

### Quartas-de-final

O sorteio para as quartas-de-final da competição teve lugar em Nyon, Suíça, no dia 20 de março de 2009. Não houve cabeças de série, o que significa que foi um sorteio inteiramente aleatório.
Os jogos da primeira mão foram no dia 9 de abril, e os da segunda estão previstos para 16 de abril.
| Equipe 1 | Total | Equipe 2 | 1.º jogo | 2.º jogo |
| Hamburgo | 4 - 3 | Manchester City | 3-1 | 1-2 |
| Paris Saint-Germain | 0 - 3 | Dínamo de Kiev | 0-0 | 0-3 |
| Shakhtar Donetsk | 4 - 1 | Olympique de Marseille | 2-0 | 2-1 |
| Werder Bremen | 6 - 4 | Udinese | 3-1 | 3-3 |

### Semifinais

Os jogos de ida foram no dia 30 de abril, e os de volta no dia 7 de maio.
| Equipe 1 | Total | Equipe 2 | 1.º jogo | 2.º jogo |
| Werder Bremen | 3 - 3 (g.f.) | Hamburgo | 0-1 | 3-2 |
| Dínamo de Kiev | 2 - 3 | Shakhtar Donetsk | 1-1 | 1-2 |

### Final

A final da Copa da UEFA de 2008–09 foi realizada no dia 20 de maio de 2009, no Estádio Şükrü Saraçoğlu, em Istanbul. Esta foi a primeira vez que a final da competição aconteceu na Turquia.
| 20 de maio de 2009 | Shakhtar Donetsk | 2 - 1 (a.p.) | Werder Bremen | Estádio Şükrü Saraçoğlu, Istambul |
| 20:45 | Luiz Adriano 25' Jadson 97' | Relatório | Naldo 35' | Público: 37,357 Árbitro: Luis Medina Cantalejo |

## Artilheiros

| # | Jogador | Equipa | Golos |
| 1 | Vágner Love | CSKA Moscou | 11 |
| 2 | Ivica Olić | Hamburgo | 9 |
| 3 | Fabio Quagliarella | Udinese | 8 |
| 4 | Diego | Werder Bremen | 6 |
| 4 | Luís Aguiar | Braga | 6 |
| 4 | Mario Gómez | Stuttgart | 6 |
| 4 | Péguy Luyindula | Paris Saint-Germain | 6 |
| 8 | Claudio Pizarro | Werder Bremen | 5 |
| 8 | Milan Baroš | Galatasaray | 5 |
| 8 | Diogo | Olympiacos | 5 |
| 8 | Ilan | Saint-Étienne | 5 |
| 8 | Albert Meyong | Braga | 5 |
| 8 | Mladen Petrić | Hamburgo | 5 |
| 8 | Hernán Rengifo | Lech Poznań | 5 |
| 8 | Luis Suárez | Ajax | 5 |