# T-box

T-box verwijst naar een groep transcriptiefactoren die betrokken zijn bij de ontwikkeling van embryonale ledematen en het hart. Elk T-box-eiwit heeft een relatief groot DNA-bindingsdomein, dat over het algemeen ongeveer een derde van het gehele eiwit omvat, dat zowel noodzakelijk als voldoende is voor sequentiespecifieke DNA-binding. Alle leden van de T-box- genfamilie binden aan de "T-box", een DNA-consensussequentie van TCACACCT.

## T-boxgenen

T-boxgenen zijn vooral belangrijk voor de ontwikkeling van embryo's, gevonden in oöcyten van zebravis door Bruce et al 2003 en klauwkikker door Xanthos et al 2001. Ze worden ook tot expressie gebracht in latere stadia, waaronder volwassen muizen en konijnen bestudeerd door Szabo et al 2000.
Mutaties die het eerste werden gevonden, veroorzaakten korte staarten bij muizen, en daarom werd het gecodeerde eiwit brachyury genoemd, Grieks voor "korte staart". Bij muizen heet dit gen Tbxt, en bij mensen heet het TBXT. Brachyury is gevonden in alle Bilateria die zijn gescreend en is ook aanwezig in de neteldieren.
Het muizen-Tbxt-gen werd gekloond en bleek een embryonale kerntranscriptiefactor van 436 aminozuren te zijn. Het eiwit brachyury bindt aan de T-box via een regio van de N-terminus.

## Eiwitactiviteit

De gecodeerde eiwitten van TBX5 en TBX4 spelen een rol bij de ontwikkeling van ledematen en spelen een belangrijke rol bij de initiatie van ledemaatknoppen. Bij kippen specificeert TBX4 bijvoorbeeld de status van de achterpoot, terwijl TBX5 de status van de voorpoot specificeert. De activering van deze eiwitten door Hox-genen initieert signaalcascades die de Wnt-signaalroute en FGF-signalen in ledemaatknoppen inschakelenn. Uiteindelijk leiden TBX4 en TBX5 tot de ontwikkeling van de apicale ectodermale rand (AER) en de zone van polariserende activiteit (ZPA) signaalcentra in de zich ontwikkelende ledemaatknop, die de oriëntatiegroei van de zich ontwikkelende ledemaat specificeren. Samen spelen TBX5 en TBX4 een rol bij het patroon van de zachte weefsels (spieren en pezen) van het bewegingsapparaat.

## Defecten

Bij mensen en sommige andere dieren zijn defecten in de TBX5-genexpressie verantwoordelijk voor het syndroom van Holt-Oram, dat wordt gekenmerkt door ten minste één abnormaal polsbot. Andere armbotten worden bijna altijd aangetast, hoewel de ernst sterk kan variëren, van volledige afwezigheid van een bot tot slechts een vermindering van de botlengte. Vijfenzeventig procent van de getroffen personen heeft ook aangeboren afwijkingen, meestal is er geen scheiding tussen de linker- en rechterhartkamer.
TBX3 wordt geassocieerd met het ulnair-mammair syndroom bij mensen met onder andere afwijkingen van de vijfde vinger, maar is ook verantwoordelijk voor de aanwezigheid of afwezigheid van de wildkleur bij paarden, en heeft geen schadelijke effecten, of deze nu tot uiting komt of niet.

## T-box-genen

De T-box-genen die aanwezig zijn in het menselijk genoom zijn:
* TBXT
* TBR1
* TBR2
* TBX1
* TBX2
* TBX3
* TBX4
* TBX5
* TBX6
* TBX7
* TBX10
* TBX15
* TBX18
* TBX19
* TBX20
* TBX21
* TBX22
* TBX23
Dit artikel of een eerdere versie ervan is een (gedeeltelijke) vertaling van het artikel T-box op de Engelstalige Wikipedia, dat onder de licentie Creative Commons Naamsvermelding/Gelijk delen valt. Zie de bewerkingsgeschiedenis aldaar.
* ↑ https://www.rcsb.org/structure/1h6f
* ↑ Wilson V, Conlon FL (2002). The T-box family. Genome Biology 3 (6): REVIEWS3008. PMID 12093383. PMC 139375. DOI: 10.1186/gb-2002-3-6-reviews3008.
* ↑ (en) Müller, CW, Herrmann, BG (23 October 1997). Crystallographic structure of the T domain-DNA complex of the Brachyury transcription factor. Nature 389 (6653): 884–8. PMID 9349824. DOI: 10.1038/39929.
* ↑ Naiche, L.A., Harrelson, Zachary, Kelly, Robert G., Papaioannou, Virginia E. (1 december 2005). T-Box Genes in Vertebrate Development. Annual Review of Genetics 39 (1): 219–239 (Annual Reviews). ISSN: 0066-4197. PMID 16285859. DOI: 10.1146/annurev.genet.39.073003.105925.
* ↑ Entrez Gene: T.
* ↑ Edwards YH, Putt W, Lekoape KM, Stott D, Fox M, Hopkinson DA, Sowden J (March 1996). The human homolog T of the mouse T(Brachyury) gene; gene structure, cDNA sequence, and assignment to chromosome 6q27. Genome Research 6 (3): 226–33. PMID 8963900. DOI: 10.1101/gr.6.3.226.
* ↑ Scholz CB, Technau U (January 2003). The ancestral role of Brachyury: expression of NemBra1 in the basal cnidarian Nematostella vectensis (Anthozoa). Development Genes and Evolution 212 (12): 563–70. PMID 12536320. DOI: 10.1007/s00427-002-0272-x.
* ↑ Herrmann BG, Labeit S, Poustka A, King TR, Lehrach H (February 1990). Cloning of the T gene required in mesoderm formation in the mouse. Nature 343 (6259): 617–22. PMID 2154694. DOI: 10.1038/343617a0.
* 1 2 3 Tickle C (October 2015). How the embryo makes a limb: determination, polarity and identity. Journal of Anatomy 227 (4): 418–30. PMID 26249743. PMC 4580101. DOI: 10.1111/joa.12361.
* ↑ Rodriguez-Esteban C, Tsukui T, Yonei S, Magallon J, Tamura K, Izpisua Belmonte JC (April 1999). The T-box genes Tbx4 and Tbx5 regulate limb outgrowth and identity. Nature 398 (6730): 814–8. PMID 10235264. DOI: 10.1038/19769.
* ↑ Hasson P, DeLaurier A, Bennett M, Grigorieva E, Naiche LA, Papaioannou VE, Mohun TJ, Logan MP (January 2010). Tbx4 and tbx5 acting in connective tissue are required for limb muscle and tendon patterning. Developmental Cell 18 (1): 148–56. PMID 20152185. PMC 3034643. DOI: 10.1016/j.devcel.2009.11.013.
* ↑ syndroom van Holt-Oram Otphanet
* ↑ Holt–Oram syndrome. Genetics Home Reference. U.S. National Library of Medicine (June 2014). Geraadpleegd op 18 april 2018.
* ↑ McDermott DA, Fong JC, Basson CT. Holt–Oram Syndrome. 2004 Jul 20 [Updated 2015 Oct 8]. In Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA, et al., editors. GeneReviews® [Internet]. Seattle (WA): University of Washington, Seattle; 1993-2018. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1111/
* ↑ Bossert, T, Walther, T, Gummert, J (October 2002). Cardiac malformations associated with the Holt–Oram syndrome—report on a family and review of the literature.. The Thoracic and Cardiovascular Surgeon 50 (5): 312–4. PMID 12375192. DOI: 10.1055/s-2002-34573.
* ↑ syndroom van Holt-Oram Otphanet
* ↑ Imsland F, McGowan K, Rubin CJ, Henegar C, Sundström E, Berglund J, Schwochow D, Gustafson U, Imsland P, Lindblad-Toh K, Lindgren G, Mikko S, Millon L, Wade C, Schubert M, Orlando L, Penedo MC, Barsh GS, Andersson L (February 2016). Regulatory mutations in TBX3 disrupt asymmetric hair pigmentation that underlies Dun camouflage color in horses. Nature Genetics 48 (2): 152–8. PMID 26691985. PMC 4731265. DOI: 10.1038/ng.3475. (December 21, 2015). A horse of a different color: Genetics of camouflage and the dun pattern. Persbericht.
* ↑ Anne-Marie Pulichino, Bruno Lamolet, Thierry Brue, Alain Enjalbert, Michel David, Georges Malpuech et Jacques Drouin, Tpit, un nouveau membre de la famille des gènes à boîte T, est impliqué dans la déficience isolée en ACTH, Med Sci, Paris, vol. 17, no 11, novembre 2001, p. 1203-1207 (DOI 10.1051/medsci/200117111203)