# Flavivirus patogeni per l'uomo

I Flavivirus patogeni per l'uomo sono 32 specie, secondo E.A. Gould e T. Solomon Dipartimento di Scienze Neurologiche dell'Università di Liverpool (Lancet 2008).

## Virologia

I flavivirus utilizzano diverse strategie genomiche di replicazione all'interno dell'ospite, anche perché utilizzano diversi insetti vettori e diversi ospiti mammiferi.
Oltre alla codifica delle proteine virali, il genoma virale contiene segnali speciali in strutture del proprio RNA che regolano l'amplificazione delle componenti virali e partecipano all'attivazione o all'elusione delle risposte antivirali. In questa ottica assumono un ruolo prevalente, per le funzioni specifiche per l'adattamento all'ospite, le strutture dell'RNA presenti nella regione non tradotta (3 UTR) del genoma dei flavivirus.
In particolare il virus Dengue si adatta alle zanzare o alle cellule umane selezionando diverse varianti virali. La specializzazione all'ospite (host) delle strutture di RNA presenti nella regione 3'UTR è associata a guadagni della "salute virale". Infatti, la replicazione degli elementi del RNA virale comporta esigenze contrastanti nei diversi tipi cellulari in cui si esplica.
I flavivirus appartengono a 4 gruppi con specifiche strategie genomiche. Essi sono:
* Flavivirus trasmessi dalle zanzare (Mosquito-borne flaviviruses)
* Flavivirus insetto specifico (Insect-specific flaviviruses)
* Flavivirus trasmessi dalle zecche (Tick borne flaviviruses)
* Flavivirus con vettore sconosciuto (No-known-vector flaviviruses)
Ognuno di questi gruppi possiede una regione genomica del tipo SLA (stem-loop A) in cui differisce la sequenza di basi nucleotidiche e la struttura tridimenzionale.

### Vettori

I vettori tradizionali sono:
* zanzare
* zecche (nei climi più freddi)
I virus trasmessi dalle zanzare hanno tassi di evoluzione più elevati.

### Ospiti

I flavivirus di solito hanno ospiti animali ad alto tasso riproduttivo, ciò perché così trovano sempre ospiti immunologicamente naive. Gli ospiti naturali dei flavivirus difficilmente subiscono infezioni rapidamente mortali perché così altrimenti si avrebbe una rapida estinzione della diffusione del virus. L'uomo non subendo generalmente grandi viremie nel proprio organismo (sangue) diventa per il virus un ospite terminale o "vicolo cieco"; fanno eccezione la Dengue e la febbre gialla dove l'uomo e i primati sono ospiti naturali della malattia.

## Clinica

Tradizionalmente, i flavivirus determinano tre le sindromi cliniche note:
* febbre-artralgia-rash,
* febbre emorragica virale,
* malattie neurologiche,
anche se per alcuni flavivirus questo il modello di malattia si sta modificando. L'animale ospite sviluppa dopo l'infezione un'immunità permanente. La malattia da flavivirus è generalmente lieve, di solito sono sindromi febbrili ciò perché è conveniente per il virus non portare a morte l'ospite infetto in modo da avere un'alta percentuale di serbatoi virali per il mantenimento della nicchia ecologica occupata.

## Sinossi

Flavivirus patogeni :
| Specie | Anno primo isolamento | Località primo isolamento | Fonte isolamento | Distribuzione geografica | Specie vettore | Specie ospite | Manifestazione clinica nell'uomo | Note |
| Alkhurma virus | 1995 | Arabia del Sud | Uomo | Penisola Arabica | Ornithodorus savignyi? | Uomo, Pecora, Cammello | Febbre emorragica | |
| Apoi virus | 1954 | Giappone | Roditori | Giappone | Sconosciuto | Roditori? | Encefaliti | |
| Bagaza virus | 1966 | Repubblica Centro africana | Culex spp | Africa | Culex spp | Sconosciuto | Febbre | |
| Banzi virus | 1956 | SudAfrica | Uomo | Africa | Culex spp | Sconosciuto | Febbre | |
| Bussuquara virus | 1956 | Brasile | Alouatta belzebul | Brasile | Culex spp | Sconosciuto | Febbre | |
| Dakar bat virus | 1962 | Senegal | Pipistrello | Africa | Sconosciuto | Pipistrelli? | Febbre | |
| Dengue 1 virus | 1944 | Hawai | Uomo | Tropici, subtropici | Aedes aegypti | Uomo | Febbre, rash, vasculopatie | 390 milioni di casi/anno nel mondo, disponibili due vaccini |
| Dengue 2 virus | 1944 | Nuova Guinea | Uomo | Tropici, subtropici | Aedes aegypti | Uomo | Febbre, rash, vasculopatie | |
| Dengue 3 virus | 1957 | Filippine | Uomo | Tropici, subtropici | Aedes aegypti | Uomo | Febbre, rash, vasculopatie | |
| Dengue 4 virus | 1956 | Filippine | Uomo | Tropici, subtropici | Aedes aegypti | Uomo | Febbre, rash, vasculopatie | |
| Ilheus virus | 1957 | Brasile | Aedes e Psorophora | America Sud e Centrale America | Culex spp? | Uccelli | Febbre | |
| Japanese encephalitis virus | 1935 | Giappone | Uomo | Asia | Culex trita-eniorhynchus | Uccelli | Encefaliti | In espansione, epidemiologicamente la più importante malgrado i vaccini |
| Koutango virus | 1969 | Senegal | Tatera kempi | Senegal | Sconosciuto | Roditori? | Febbre, rash | |
| Kyasanur Forest disease | 1957 | India | Presbytis entellus | India | Haemaphysalis spinigera | Scimmie | Febbre emorragica | Epidemie circoscritte, vettore zecca |
| Langat virus | 1956 | Malesia | Ixodes Granulatus | Malesia, Thailandia, Siberia | Ixodes granulatus | Sconosciuto | Encefaliti | |
| Louping ill virus | 1929 | Scozia | Ovini | UK, Irlanda | Ixodes spp | Pecore, pernici, lepri | Encefaliti | |
| Modoc virus | 1958 | USA | Peromyscus | USA | Sconosciuto | Peromyscus maniculatus | Encefaliti | |
| Murray Valley encephalitis | 1951 | Australia | Uomo | Australia, Nuova Guinea | Culex annulirostris | Uccelli | Encefaliti | |
| Ntaya virus | 1943 | Uganda | Zanzare | Africa | Zanzare | Sconosciuto | Febbre | |
| Omsk haemorrhagic fever virus | 1947 | Russia | Uomo | Ovest Siberia | Dermacentor pictus | Topi muschiati, roditori? | Febbre emorragica | Epidemie circoscritte, vettore zecca; trasmessa anche con carcasse infette |
| Powassan virus | 1948 | Russia, USA, Canada | Ixodes spp, Dermacentor spp, Haemaphysalis spp | Russia, USA, Canada | Ixodes spp | Piccoli mammiferi | Encefaliti | |
| Rio Bravo virus | 1954 | USA | Tadarida brasiliensis mexicana | USA, Mexico | Sconosciuto | Tadarida brasiliensis mexicana | Febbre | |
| Rocio virus | 1975 | Brasile | Uomo | Brasile | Culex spp? | Uccelli | Encefaliti | |
| St Louis encephalitis virus | 1933 | USA | Uomo | Sud e America Centrale | Culex spp | Uccelli | Encefaliti | |
| Sepik virus | 1966 | Nuova Guinea | Mansonia septempunctata | Nuova Guinea | Zanzare | Sconosciuto | Febbre | |
| Spondweni virus | 1955 | Sud Africa | Mansonia uniformis | Africa | Aedes circumluteolus | Sconosciuto | Febbre | |
| Tick-borne encephalitis virus | 1937 | Russia | Uomo | Europa, Asia | Ixodes spp | Roditori? | Encefaliti | Epidemie circoscritte, vettore zecca; trasmessa anche con il latte. Prima: Russian spring–summer encephalitis |
| Usutu virus | 1956 | Sud Africa | Culex spp | Africa | Zanzare | Uccelli | Febbre, rash | |
| Wesselsbron virus | 1955 | Sud Africa, Madagascar e Thailand | Ovini | Africa, Asia | Aedes spp | Sconosciuto | Sconosciuto | |
| West Nile virus | 1937 | Uganda | Uomo | Worldwide | Zanzare, zecche | Uccelli | Encefaliti | In espansione |
| Yellow fever | 1927 | Ghana | Uomo | Sub-Sahara Africa, Sud America | Aedes spp/ Haemagogus spp | Scimmie | Pantropica | 200.000 casi/anno con 30.000 morti nel mondo. |
| Zika virus | 1947 | Uganda | Macaca mulatta | Africa, Asia | Aedes spp | Scimmie? | Febbre, rash | dal 2007 Micronesia, dal 2015 Sud-America |