OpenLLM-France/wikimedia huggingface dataset:
# Biologie en BCPST2 (France)/Leçons
## I – Des molécules du vivant à la cellule : organisation fonctionnelle

Voir le cours de première année.

## II - L’organisme : un système en interaction avec son environnement
### II-A L’organisme vivant : un système physico-chimique en interaction avec son environnement (10 heures)

Voir le cours de première année.

### II-D Ontogenèse et reproduction (24h)

Voir le cours de première année.

### II-E Organisation fonctionnelle des organismes (12h)

II-E-1 Nutrition des Angiospermes en liaison avec le milieu
II-E-2 Développement des Angiospermes

### II-F Diversité morpho-fonctionnelle des organismes

II-F-1 Organismes pluricellulaires
II-F-2 Organismes unicellulaires

## IV – La biodiversité et sa dynamique
### IV-A Génomique structurale et fonctionnelle (8 h)

Voir le cours de première année.

### IV-B Réplication de l’information génétique et mitose (5 h)

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### IV-C La diversification des génomes (7 h)

Voir le cours de première année.
# Cytométrie en flux/Le phénotypage

Le phénotypage est le fait d’utiliser un cytomètre en flux et des anticorps fluorescents pour déterminer la présence ou non de protéines particulières sur ou dans une cellule. Les questions posées sont généralement :
* La protéine d'intérêt est-elle présente dans les cellules de mon échantillon ?
* Y a-t-il des différences dans l’expression de cette protéine selon les échantillons ?

## Marquages membranaires

On observe une molécule fluorescente en surface de la cellule. Le plus souvent, on utilise un anticorps fluorescent, et on compare l'intensité du marquage avec un contrôle négatif, généralement l'isotype contrôle de l'anticorps utilisé.

## Marquages intracellulaires

On observe la présence d'une molécule dans la cellule, et non à sa surface. Pour ce faire, on a fixé et perméabilisé les cellules avant d'ajouter l'anticorps dirigé contre la protéine d'intérêt.
| Le réglage et la compensation | Le tri cellulaire |
# D

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* « D » sur le Wiktionnaire
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# Cytométrie en flux/La fluorescence

La fluorescence est un phénomène chimique, mettant en jeu des transitions électroniques entre deux niveaux d'énergie superficiels, et déclenchée par autre chose que la simple chaleur, ce qui la différencie de l'incandescence.

## Principe

De nombreuses molécules sont capables d'absorber des photons, et d'augmenter leur énergie d'agitation: la lumière est alors convertie en chaleur. Les molécules fluorescentes - on parle de fluorophores ou de fluorochromes- ont la propriété d'absorber de l'énergie lumineuse et de la restituer, généralement avec une énergie plus basse (une longueur d'onde plus grande).
Ces molécules fluorescentes sont de taille et de nature chimiques diverses ; certaines sont suffisamment petites pour être conjuguées à d’autre molécules (comme dans le cas des anticorps couplés à un fluorochrome); d'autres ne sont fluorescentes que dans certains états de chélation (comme les marqueurs fluorescents vitaux, qui ne sont fluorescents que complexés à l'ADN).
Chaque fluorochrome est caractérisé par :
* sa longueur d'onde d'excitation : la lumière à lui fournir pour que la molécule "fluoresce",
* sa longueur d'onde d'émission : la lumière émise quand la molécule est fluorescente,
* ses conditions de fluorescence: certaines molécules ne sont fluorescentes qu’à certaines conditions.
En pratique courante, pour minimiser les plages de longueurs d'ondes à considérer, les lumières d'excitation sont produites par des lasers, fournissant une lumière monochromatique.

## Le transfert d'énergie

Il est possible d'associer deux fluorochromes entre eux, pour obtenir un transfert energétique entre les deux.
Ainsi, une molécule fluorescente A absorbe un photon d'énergie λ1. Elle émet un photon λ2. Une molécule B absorbe un photon d'énergie λ2, et émet un photon λ3. Si on couple ces deux molécules et qu'on fournit des photons λ1 à la molécule A+B, la lumière émise sera composée de photons d'énergie λ3. Ainsi, en excitant A, on a permis à B d'émettre sa fluorescence spécifique. C’est le principe de base qui permet l'extension des gammes de molécules fluorescentes : ainsi, il existe un fluorochrome, la phycoérythrine, qui peut être couplé à divers types de molécules fluorescentes (cyanines, Texas Red, par exemple), et ainsi, avec la même source de lumière, on pourra différencier diverses lumières émises.
# Cytométrie en flux/Le tri cellulaire

Le tri cellulaire est une des premières applications de la cytométrie en flux. Basiquement, on sépare les cellules selon les informations données par le phénotype.

## Principe de fonctionnement

Chaque gouttelette est analysée. Selon les valeurs prises par chaque paramètre, on pourra décider de séparer cet évènement des autres. La séparation est obtenue par électrisation de la goutte, puis déflexion par des champs électriques ou magnétiques. Selon les appareils, on pourra trier une, deux ou quatre populations.

## Logiciel

Il est impossible de trier sans signifier à la machine quels sont les évènements à séparer. On fait donc l'analyse de quelques évènements, puis on choisit une combinaison de fenêtres de sélection pour désigner les populations à trier.

## En pratique

Chaque trieur est limité par différents facteurs. Les principaux sont les mêmes que pour les cytomètres d'analyse:
* Le nombre de lasers;
* Le nombre de PMT;
* Le débit maximum toléré pour trier;
* Le nombre de populations triables en simultané.
| Le phénotypage | Sommaire |
# Cytométrie en flux/Prérequis conseillés

Les notions de fluorescence, de transfert d'énergie et de dynamique des fluides seront abordées rapidement. Il peut être utile de lire les articles correspondants sur Wikipédia : fluorescence, transfert d'énergie et dynamique des fluides. Quelques notions d'optique seront également utiles.
# Cytométrie en flux/Présentation de la leçon

La cytométrie en flux est un outil particulièrement puissant pour la biologie cellulaire. En effet, cette technique permet de déterminer énormément de caractéristiques d'une suspension de cellules : son état d'activation, de maturation, de prolifération, ou de mort. Elle permet également de séparer des informations concernant des cellules différentes, présentes dans la même suspension ; elle permet même de trier ces cellules, de les séparer physiquement, pour pouvoir obtenir des populations pures à partir d'un mélange. La cytométrie en flux est devenue un outil indispensable pour certains domaines de la médecine (comme l'hématologie) ou de la recherche (comme l'immunologie).
Ce cours propose d'exposer les concepts de bases et de déjouer les plus gros pièges de la cytométrie.
# Deuxième degré du secondaire (Belgique)/Cours

Cours de mathématiques
# Deuxième degré du secondaire (Belgique)/Présentation de la structure

Le second degré du secondaire, dont les élèves sont majoritairement âgés de 14 à 16 ans, comprend les 3ème et 4ème années de l'enseignement secondaire en Belgique.
# Dessin en perspective/Prérequis conseillés

* Connaissances de base en géométrie dans l'espace et dans le plan.
* Sens de l'observation dans le monde réel tridimensionnel.
# Dessin en perspective/Présentation de la leçon

Il existe différentes façons de représenter un sujet par la perspective en dessin. Les différentes techniques sont plus ou moins simplistes. Les plus simples suffisent dans certains cas, d'autres sont indispensables dans des images plus complexes.
# Deuxième degré du secondaire (Belgique)

L'école secondaire en Belgique
Le second degré du secondaire, dont les élèves sont majoritairement âgés de 14 à 16 ans, comprend les 3ème et 4ème années de l'enseignement secondaire en Belgique.
Cours de mathématiques
# Development as freedom

* Auteur : Amartya Sen
* Année : 2013
* Titre : Development as freedom
* Nature : Essai
* ISBN : Development as Freedom
* Mots clés : Développement, économie, capabilities approach
Development as freedom est un essai de l'économiste et prix Nobel d'économie Amartya Sen. Il développe l'idée que les libertés sont à la fois le but et le moyen du développement, dans une capability approach.

## Résumé

L'auteur commence par définir les libertés, puis s'intéresse aux interrelations entre elles et la manière dont on peut se servir de cette approche pour atteindre des buts de développement.

### Introduction: Development as Freedom

Les cinq libertés sont les libertés politiques, les services économiques, les opportunités sociales, les garanties de transparence et la sécurité protective.

### 12 Individual Freedom as a Social Commitment
## Commentaires
## Citations

   « Expansion of freedom is viewed, in this approach, both as the primary end and as the principal means of development. »
   « Development consists of the removal of various types of unfreedoms that leave people with little choice and little opportunity of exercising their reasonned agency. »
# Diabète

| Chap. 1 : | Généralités |
| Chap. 2 : | Diabète de type 1 |
| Chap. 3 : | Diabète de type 2 |
| Chap. 4 : | Hémoglobine glyquée |
| Chap. 5 : | Alimentation du diabétique de type 2 |
| Chap. 6 : | Évaluation de l’insulinosensibilité |
| Annexe : | Tableau des Index glycémiques |

## Présentation [Modifier]

Cette leçon porte sur le diabète. Il y a plusieurs formes de diabète mais la plus courante est le diabète de type 2 (diabète sucré insulinorésistant). La majorité des patients atteints du diabète de type 2 sont en sur-poids. Le meilleurs traitement est de faire un régime et de pratiquer des activités physiques.

## Objectifs [Modifier]

comprendre la maladie, les analyses et les traitements.

## Niveau et prérequis conseillés [Modifier]

Leçon de niveau 16.
avoir des notions de biologie.

## Référents [Modifier]

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* docteur Knock
# Environnement virtuel pour la validation du processus de conception
## Introduction

Pour résoudre les problèmes difficiles dans la procédure de chirurgie mini-invasive (CMI) de la colonne vertébrale. Dans les études antérieures, on a recherché au niveau de l’organisation autour des chirurgiens praticiens pour améliorer le processus de conception d’un ancillaire innovant destiné à une opération chirurgicale percutanée.
Ensuite, il y a aussi des recherches pour concevoir les outils chirurgicaux innovants pour la procédure de CMI de la colonne vertébrale. Dans le processus de conception, il faut faire des tests afin de valider les choix de conception de l'ensemble. Pour réaliser validation, on doit créer des outils prototypes ainsi que mannequin, colonne vertébrale… Cette méthode est également très chère et prend plus de temps ainsi que le changement difficile de chaque validation.
En outre, la création d'un modèle pratique avec les comportements biomécaniques comme corps humain n’est pas entièrement réalisable. Par conséquent, on a pensé à l’application de la technologie réalité virtuelle en médecine. Grâce à l’assistance du logiciel 3D, on peut créer un modèle de la salle d’opération virtuelle. Les comportements biomécaniques du corps humains lorsque l'intervention des instruments chirurgicaux peuvent être simulées grâce à la technologie haptique. Cette méthode est évaluée à moindre coût et plus vite parce qu’on n’a pas besoin de fabriquer prototypes. La création d’un environnement chirurgical virtuel permet aussi aux chirurgiens d'effectuer manœuvres opératoires avec un sentiment haptique comme dans l'environnement chirurgical réel. En plus, il a également contribué à la formation des étudiants en médecine.

## Environnement technique

* CATIA (avec Haption: IFC Core ), Solidworks, MeshLab, Scan 3D.
* Bras Haptique, souris 3D connexion, polariseur.
# Entiers et décimaux/Rappel des acquis
## Nommer les nombres entiers

De nos jours, on sait nommer tous les nombres entiers. Les Hommes ont réussi graduellement à savoir nommer tous les nombres. On a pris les dix premiers mots et en les superposant différemment en rajoutant juste quelque nouveaux termes, on a réussi à nommer tous les nombres. Quand on compte, on dit : zéro, un, deux, trois, quatre, cinq, six, sept, huit, neuf. En comptant, on a obtenu les nominations des dix premiers nombres.
En continuant, on dit : dix, onze, douze, treize, quatorze, quinze, seize, dix-sept, dix-huit, dix-neuf. On remarque ici que ces dix nombres dérivent des dix premiers et du nouveau terme « dix ». Jusqu'à seize, on prend le radical du nombre de la première dizaine, et on rajoute le suffixe -ze en déformant un peu le radical pour une meilleure sonorité. Ensuite, on dit dix suivi du nombre de la première dizaine.
Si on rajoute vingt à tout cela, on a maintenant, à partir de zéro, les désignations des vingt et un premiers nombres. Remarquons que « vingt » est un terme nouveau.
Continuons à compter : vingt et un, vingt-deux, vingt-trois, vingt-quatre, vingt-cinq, vingt-six, vingt-sept, vingt-huit, vingt-neuf, trente.
| Sommaire | Nombres entiers naturels |
# Enzyme

| Chap. 1 : | Présentation |
| Chap. 2 : | Rôle biologique |
| Chap. 3 : | Caractéristiques |
| Chap. 4 : | Cofacteurs |
| Chap. 5 : | Activité enzymatique |
| Chap. 6 : | Classification |
| Chap. 7 : | Utilisations |
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## Présentation

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## Objectifs

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## Niveau et prérequis conseillés

Leçon de niveau 13. Les prérequis pour cette leçon n'ont pas encore été précisés. Pour le faire, cliquez ici.

## Référents

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# Enzyme, phénotype et génotype

| Chap. 1 : | Présentation (12) |
| Chap. 2 : | Substrat et produit (12) |
| Chap. 3 : | Synthèse et hydrolyse enzymatiques (12) |
| Chap. 4 : | Spécificité de l'enzyme et conformation spatiale (12) |
| Chap. 5 : | La spécificité enzymatique (12) |
| Chap. 6 : | Les atouts de l'activité enzymatique (12) |
| Chap. 7 : | Modèle d'enzyme (12) |
| Chap. 8 : | Cascade enzymatique (12) |
| Chap. 9 : | Rappels de données biochimiques (12) |
| Chap. 10 : | Rappels de données génétiques (12) |
| Chap. 11 : | Du génotype au phénotype (12) |
| Chap. 12 : | Génotype, phénotype et évolution (12) |
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## Présentation [Modifier]

La matière vivante contient des molécules organiques qu'elle est capable de fabriquer. La biochimie étudie les molécules organiques aussi bien dans leur composition, leur formation que dans leurs interactions. Les enzymes, molécules organiques de nature protidique, interviennent dans les réactions biochimiques en les provoquant et les contrôlant : les enzymes sont indispensables à la Vie. Il y a un lien entre génotype et molécules organiques : c’est ce lien molécules organiques - gènes qui sera étudié au travers de l'étude des enzymes.

## Objectifs [Modifier]

* découvrir les modalités d'action des enzymes,
* découvrir le lien entre le code génétique et les enzymes qui s'exprime dans le phénotype des individus.
Tout en restant à un niveau d'initiation donnant plus une compréhension de la Vie qu'une connaissance précise sur tous ses mécanismes. C'est une synthèse de différents cours sur le vivant.

## Niveau et prérequis conseillés [Modifier]

Leçon de niveau 12.
* des notions de base de Chimie,
* des connaissances biologiques (biochimiques, physiologiques et génétiques) qui ont été rencontrées au cours d'études et qui peuvent être replacées dans l'organisation et le fonctionnement du Vivant.
Dans la mesure du possible, des liens sont fournis dans la leçon pour retrouver ou découvrir des connaissances précises.

## Référents

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# Enzyme, phénotype et génotype/La spécificité enzymatique
## Spécificité de substrats

Puisque les sites d'activations des substrats correspondent à des pôles d'activation donnés sur le ou les substrats, chaque enzyme montre une spécificité de substrats.

## Spécificité de réaction biochimique

Les substrats activés vont se retrouver dans une position donnée l'un par rapport à l'autre, ce qui va permettre à l'enzyme de traiter les substrats sur des sites particuliers (pour les associer ou les libérer) : ainsi, la liaison établie ou rompue sera une liaison bien précise par rapport à la structures des substrats. L'enzyme présente une spécificité correspondant à une réaction biochimique donnée.
    Deux enzymes peuvent intervenir sur une même liaison mais l'une, la synthétase, la met en place et l'autre, l'hydrolase, la défait. Ce sont des enzymes qui peuvent montrer des sites d'activation identiques, capables de fixer par les mêmes pôles d'activations deux corps qu’ils soient assemblés ou libres mais qui montreront des différences d'action

## Spécificité de produit

Si l'enzyme montre à la fois une spécificité de substrat et une spécificité de réaction biochimique, le produit obtenu sera toujours le même. Ainsi, une enzyme montrera une spécificité par rapport au(x) produit(s) obtenu(s).
    C'est d'ailleurs cette spécificité du produit, regroupant les spécificités de substrat et de réaction biochimique, qui est utilisée pour l'attribution des noms à certaines enzymes.
| Spécificité de l'enzyme et conformation spatiale | Les atouts de l'activité enzymatique |
# Dérivation/Présentation de la leçon

Cette leçon, destinée à des élèves se destinant à une carrière scientifique, apporte de solides bases à l'étude de la dérivation.
# Désignation des câbles et conducteurs

| Chap. 1 : | Définition (11) |
| Chap. 2 : | Constitution générale (11) |
| Chap. 3 : | Couleurs des conducteurs (11) |
| Chap. 4 : | Désignation suivant les normes (11) |

## Présentation [Modifier]

Les conducteurs et câbles représentent les éléments actifs des liaisons électriques, puisqu’ils conduisent le courant électrique. Il en existe une très grande variété pour satisfaire à toutes les utilisations de l'énergie électrique.

## Objectifs

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## Niveau et prérequis conseillés [Modifier]

Leçon de niveau 11.
aucun

## Référents [Modifier]

Ces personnes sont prêtes à vous aider concernant cette leçon :
* Crochet.david
# Désignation des câbles et conducteurs/Prérequis conseillés

aucun
# Désignation des câbles et conducteurs/Désignation suivant les normes

Il existe 2 normalisations pour désigner un câble ou un conducteur, l'une de niveau européen, c’est la CENELEC, et l'une au niveau français, c’est l'UTE.
| Désignation HAR CENELEC | | | | Désignation NF-UTE |
| Signification du symbole | Symbole | Définition | Symbole | Signification du symbole |
| Série harmonisée | H | Type de la série | U | Câble faisant l’objet d'une norme UTE |
| Série nationale reconnue | A | Type de la série | U | Câble faisant l’objet d'une norme UTE |
| Série nationale autre | FR-N | Type de la série | U | Câble faisant l’objet d'une norme UTE |
| 300/300 V | 03 | Tension Nominale | 250 | 250 V |
| 300/500 V | 05 | Tension Nominale | 500 | 500 V |
| 450/750 V | 07 | Tension Nominale | 1000 | 1 000 V |
| 0,6/1 kV | 1 | Tension Nominale |
La désignation peut-être complétée par l'indication éventuelle d'un conducteur vert/jaune dans le câble Forme du
| Couleurs des conducteurs | Sommaire |
# Désignation des câbles et conducteurs/Définition
## Conducteur isolé

Un conducteur isolé est un ensemble formé d'une âme conductrice et de son enveloppe isolante.
L'enveloppe isolante est souvent recouverte d'une coloration soit monochrome, soit bi-colore en fonction des demandes des clients ou normalisation

## Câble unipolaire

Un câble unipolaire est un conducteur isolé comportant en plus une ou plusieurs gaines de protection.
Le câble unipolaire est souvent utilisé à partir d'une section. En effet, lorsque la section est relativement importante, il devient plus difficile de cintrer un ensemble de conducteur. De même, le refroidissement d'un câble unipolaire est meilleur.
La différence avec un conducteur est aussi une protection accrue contre les agressions externes au câble ( écrasement, chocs, produits chimique …)

## Câble multipolaire

Un câble multipolaire est un ensemble de conducteurs électriquement distincts mais comportant une protection commune
| Sommaire | Constitution générale |
# Désignation des câbles et conducteurs/Couleurs des conducteurs

Les conducteurs sont repérés par des couleurs :
* Conducteur de protection Double coloration Vert/jaune
* Conducteur de neutre Bleu clair
Attention : Le repérage des conducteurs ne doit être considéré que comme une présomption et il est toujours nécessaire de vérifier la polarité des conducteurs avant toute intervention
* N’importe quelle couleur peut-être utilisée pour les conducteurs de phases à l'exception du vert et du jaune
* Les conducteurs de phase sont repérés par la couleur noire ou brune et éventuellement bleu clair dans les câbles multiconducteurs, et ceci uniquement dans le cas où le câble, où la canalisation ne comporterait pas de conducteur de neutre. Par contre, le conducteur vert/jaune d'un câble assurant une liaison ne comportant pas de conducteur de protection doit être abandonnée.
Dans le cas où le neutre serait également utilisé comme conducteur de protection (mise au neutre des masses), il doit être repéré comme un conducteur de protection
| Constitution générale | Désignation suivant les normes |
# Développement durable/Quiz/QCM Développement durable
## Vers le développement durable

| QCM Croissance démographique | QCM BNB |
# Développement durable : contrainte ou opportunité pour l'entreprise ?

| Chap. 1 : | Pourquoi les nouvelles exigences écologiques sont-elles une contrainte pour l'entreprise ? (11) |
| Chap. 2 : | Quel est l'impact des exigences éthiques ou sociétales sur l'entreprise ? (11) |
| Chap. 3 : | Quelles opportunités de développement durable offre-t-il à l'entreprise ? (11) |

## Présentation

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## Objectifs

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## Niveau et prérequis conseillés

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## Référents [Modifier]

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* Aumars
# Développement d’un organisme animal/Contrôle du développement embryonnaire

Toutes les cellules de l'embryon sont génétiquement identiques. Durant la différenciation, elles n'expriment qu'une partie de leur information génétique et perdent la capacité d'exprimer le reste.

## Réseaux de gènes contrôlant le développement embryonnaire
### Gènes homéotiques et mise en place des axes de polarité

| Développement embryonnaire et acquisition du plan d’organisation | Développement post-embryonnaire |
# Développement durable/Quiz/QCM Inégalités
## Inégalités de développement dans le monde

| Sommaire | QCM Croissance démographique |