# Le système d'exploitation GNU-Linux/La base de données MySQL

* Qu'est-ce qu'un système d'exploitation ?
* Unix et Linux
* Partitionnement du disque
* Installation
** Installer Debian via le réseau
* Utilisateur Unix, l'interface console
** Le login
** Variables d'environnement
** Commandes de base
** L'aide en ligne man
** L'éditeur de texte vi
** Les shells
** La complétion
** Les jokers
** Les répertoires importants
** Redirection des entrées/sorties
** Invoquer un programme en tâche de fond
** Propriétaires et droits d'accès
** Processus
** Locale
* Administration du système
** Configuration du réseau
** Les utilisateurs et groupes
** Le processus d'initialisation
** Les systèmes de fichiers
** Le système virtuel /proc
** Les périphériques /dev
** L'ordonnanceur de travaux cron
** Le backup : tar et gzip
** ghost avec partimage
** sauvegarde de fichiers avec rsync
** Les fichiers journaux syslog
** Installation de nouveaux logiciels
** Le noyau Linux et les modules
** Autres commandes utiles
** Installation RAID1 logiciel + LVM + XFS
** Scripts de surveillance
** Réseaux sans fil
* Administration des services réseaux
** L'outil d'administration Webmin
** telnet
** cURL
** wget
** Le serveur de noms BIND
** Le serveur de configuration réseau DHCP
** Le serveur de shell distant SSH
** Le partage de fichiers Samba
** Le partage de fichiers NFS
** Le serveur d'impression CUPS
** Le serveur de fichiers FTP
** Le serveur Web Apache
** Le serveur Web Nginx
** La base de données MySQL
** La base de données Memcached
** La base de données Redis
** Le serveur de mails Postfix
** Les annuaires LDAP
** La supervision Nagios
* Sécurisation d'un serveur Linux
** Installation d'un service en mode chroot
** Protection avec iptables
* Erreurs connues
* Médiagraphie
* Auteurs
* Qu'est-ce qu'un système d'exploitation ?
* Unix et Linux
* Partitionnement du disque
* Installation
** Installer Debian via le réseau
* Utilisateur Unix, l'interface console
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** Variables d'environnement
** Commandes de base
** L'aide en ligne man
** L'éditeur de texte vi
** Les shells
** La complétion
** Les jokers
** Les répertoires importants
** Redirection des entrées/sorties
** Invoquer un programme en tâche de fond
** Propriétaires et droits d'accès
** Processus
** Locale
* Administration du système
** Configuration du réseau
** Les utilisateurs et groupes
** Le processus d'initialisation
** Les systèmes de fichiers
** Le système virtuel /proc
** Les périphériques /dev
** L'ordonnanceur de travaux cron
** Le backup : tar et gzip
** ghost avec partimage
** sauvegarde de fichiers avec rsync
** Les fichiers journaux syslog
** Installation de nouveaux logiciels
** Le noyau Linux et les modules
** Autres commandes utiles
** Installation RAID1 logiciel + LVM + XFS
** Scripts de surveillance
** Réseaux sans fil
* Administration des services réseaux
** L'outil d'administration Webmin
** telnet
** cURL
** wget
** Le serveur de noms BIND
** Le serveur de configuration réseau DHCP
** Le serveur de shell distant SSH
** Le partage de fichiers Samba
** Le partage de fichiers NFS
** Le serveur d'impression CUPS
** Le serveur de fichiers FTP
** Le serveur Web Apache
** Le serveur Web Nginx
** La base de données MySQL
** La base de données Memcached
** La base de données Redis
** Le serveur de mails Postfix
** Les annuaires LDAP
** La supervision Nagios
* Sécurisation d'un serveur Linux
** Installation d'un service en mode chroot
** Protection avec iptables
* Erreurs connues
* Médiagraphie
* Auteurs
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## Introduction

MySQL est un serveur de bases de données relationnelles SQL (Open Source), fonctionnant sur le port 3306 en mode TCP.
Prérequis : Apache.

## Moteurs de stockage

Par défaut, MySQL utilise le moteur de stockage MyISAM.
Toutefois, MySQL propose d'autres moteurs de stockage :
* InnoDB : support des transactions (compatible ACID), des clés étrangères et de l'intégrité référentielle
* MERGE ou MRG_MYISAM : permet de fusionner plusieurs tables de structures identiques
* BDB : Berkeley DB est un format de stockage très répandu (utilisé par exemple par OpenLDAP) et supporte les transactions (compatible ACID)
* HEAP ou MEMORY : ces tables sont stockées en mémoire vive (RAM), elles sont très rapides mais ne survivent pas à un redémarrage de MySQL
* CSV : les données sont stockées dans des fichiers au format CSV (Comma Separated Values)
* ARCHIVE : stocke des informations en utilisant le minimum de place disque (perte de la notion d'index)
* BLACKHOLE : les données sont tout simplement envoyées vers /dev/null et donc perdues. Moteur utilisé pour faire des tests

## Types de données

Chaque information stockée dans une table est définie par un type décrivant la nature de l'information enregistrée.

### Les nombres

* TINYINT
* SMALLINT
* MEDIUMINT
* INT
* BIGINT
* FLOAT
* DOUBLE
* DECIMAL

### Les chaînes de caractères

* CHAR
* VARCHAR
* BINARY
* VARBINARY
* BLOB
* TEXT
* ENUM
* SET

### Les dates et heures

* DATE
* TIME
* DATETIME
* TIMESTAMP
* YEAR

## Installation

Pour installer mysql sous Debian, on tape la commande suivante :

## Fichier de configuration

Le fichier de configuration est /etc/mysql/my.cnf.
Dans ce fichier de configuration on trouve plusieurs sections :
Chaque fois que l'on modifie ce fichier, il faut relancer mysql :
Les bases de données sont stockées dans le répertoire /var/lib/mysql/. Il faut donc sauvegarder ce répertoire.
Pour se connecter à Mysql à partir du shell, on utilise le client Mysql :

## Commandes SQL d'importation / exportation
### LOAD DATA INFILE

La commande SQL LOAD DATA INFILE permet d'importer des données dans une table SQL à partir d'un fichier texte.
Par exemple, nous avons la table suivante :
Nous voulons insérer le fichier suivant :
Pour importer le fichier dans la table contact, nous tapons la commande suivante :
Vérification :
Pour connaître l'ensemble des options disponibles de la commande LOAD DATA INFILE, voir la documentation Mysql : Doc Mysql / LOAD DATA INFILE

### SELECT INTO OUTFILE

La commande SQL SELECT INTO OUTFILE permet d'exporter des données de la base de données dans un fichier texte.
Dans le cas présent, les champs "prenom" et "nom" ont été sélectionnés à partir de la table "contacts" afin de pouvoir être exportés dans le fichier "result.txt" situé dans le répertoire "/tmp"
Attention, il faut penser à préciser les clauses "FIELDS" et "LINES" destinées à traiter correctement les délimitations des champs et des lignes lors de l'export !
Remarque : C'est l'utilisateur mysql qui crée ce fichier, il doit donc avoir les droits nécessaires :

## Les fichiers de données

Les fichiers contenant les données sont stockés dans /var/lib/mysql/.
/var/lib/mysql/ est donc le répertoire important à sauvegarder.
Chaque base de données dispose de son propre répertoire /var/lib/mysql/<nomdelabase>/.
Le fichier db.opt contient la configuration de la base de données (encodage des caractères ...).
Le fichier <nomdetable>.FRM décrit la structure de la table.
Dans le cas du format MyISAM, chaque table est enregistrée dans deux fichiers :
* <nomdetable>.MYD : contient les données
* <nomdetable>.MYI : contient les index
Dans le cas du format Innodb, toutes les tables sont stockées dans un ou plusieurs seuls fichiers : ibdata1, ibdata2 ...

## Les fichiers journaux

Les fichiers journaux sont contenus dans le répertoire /var/log/mysql/.
Il y a 3 fichiers importants :
* mysql.log : contient les authentifications des utilisateurs et les requêtes SQL
* mysql.err : contient les erreurs. Sous Debian, ce fichier n'existe pas ou est vide car les erreurs Mysql sont envoyées à syslog (Debian improvement).
* mysql-slow.log : contient les requêtes lentes
Pour activer les fichiers log, il faut décommenter les deux lignes dans /etc/mysql/my.cnf :
Puis relancer mysql :

## Les documentations
### Package Debian mysql-doc-5.0

Debian propose un package contenant les documentations Mysql. Il faut pour y accéder installer le package mysql-doc-5.0 :
La documentation sur mysql est accessible dans le répertoire /usr/share/doc/mysql-doc-5.0.
Dans ce répertoire, on trouve des pages HTML qui contiennent toute la documentation de mysql.

### Documentations en ligne

Sur le site de mysql
- Toutes les documentations
- Le manuel de référence en français

### Listes de diffusion

Toutes les listes de diffusion

### IRC

Canal #mysql sur Freenode

## Modifications des privilèges

Il y a quatre techniques pour modifier les privilèges :
* modifier directement les tables user et db de la base de données mysql (ne pas oublier de faire un FLUSH PRIVILEGES; après)
* utiliser les instructions SQL GRANT et REVOKE
Exemple : enlever tous les droits à l'utilisateur alex sur la base de données dbalex :
Exemple : donner tous les droits à l'utilisateur alex sur la base de données dbalex :
on peut également spécifier les droits à donner :
* utiliser la commande shell mysql_setpermission (cf ci-dessous)
* utiliser un outil graphique de type PhpMyAdmin

## Les commandes d'administration

Utile : pour ne pas avoir à spécifier le mot de passe du root chaque fois que l'on invoque une commande mysql*, il suffit de créer un fichier .my.cnf dans son répertoire de travail et qui contient le mot de passe à utiliser. Attention aux droits d'accès à ce fichier !

### mysql

La commande mysql est le client Mysql en ligne de commande. Il permet de se connecter à Mysql et de saisir des commandes SQL.
Voici les options les plus courantes :
Options de base (communes à la plupart des commandes mysql) :
* -h (--host=) : définit l'hôte hébergeant la base de données
* -D (--database=) : définit la base sur laquelle l'utilisateur va se connecter.
* -u (--user=) : précise le nom d'utilisateur Mysql sous lequel l'utilisateur se connecte.
* -P (--port=) : détermine le port à utiliser pour la connexion
* -p (--password=) : demande la saisie du mot de passe (obligatoire si l'utilisateur a été défini pour se connecter avec un mot de passe)
Exemple :
Dans cet exemple la requête demande de se connecter par mot de passe à la base dbalex en tant que paul.
Autres options intéressantes :
* -H (--html) : permet de produire des sorties en HTML
* -X (--xml) : permet de produire des sorties en XML
Pour aller plus loin :
Donne la liste et un bref descriptif de toutes les options à utiliser avec la commande mysql

### mysqldump

mysqldump peut sauvegarder des bases de données MySQL. Son fonctionnement est particulièrement intéressant car elle génère les commandes SQL permettant de re-créer la base de données sur un autre serveur, ou d'exporter les données vers du CSV et du XML.

#### Backup

Pour exporter la base de donnée « myBase », on utilise la commande suivante :
Ceci fera l'export dans un fichier « myBase_backup.sql ».
Exemple de dump d'une base :
Pour dumper toutes les bases :
Pour dumper certains enregistrements de certaines tables :

##### Sans les données

Pour ne récupérer que le schéma :

##### Aux formats Oracle, PostgreSQL, Microsoft SQL Server...

L'option --compatible permet de spécifier à mysqldump le format à utiliser pour être compatible avec les bases de données existantes. Exemple :
Cette option peut prendre les valeurs suivantes : ansi, mysql323, mysql40, postgresql, oracle, mssql, db2, maxdb, no_key_options, no_table_options, or no_field_options

##### Tâche planifiée

Pour définir le backup automatique d'une base tous les soirs à minuit, sous Linux :
Le fichier décompresser est au format SQL et peut donc être exécuter pour recréer les bases, tables, et insérer les enregistrements.

#### Restauration

Pour importer une base de données sauvegardée via mysqldump, on utilise la commande cliente mysql et une redirection en entrée :
En cas de gros volume, il est plus rapide de copier les .bin des bases, au lieu d'utiliser mysqldump.

##### Préparation

Pour réinjecter le dump dans d'autres bases, il vaut mieux nettoyer la base de destination.

##### Vers une base distante

En utilisant mysqldump et ssh, on peut dupliquer une base de données sur une machine distante :

### mysqlimport

Attention : le nom du fichier (sans extension) doit être le même que la table.

### mysqladmin

La commande mysqladmin permet de passer des commandes à Mysql.
OPTIONS :
Commandes :
* create : créé une base de données
* drop : supprimé une base de données
* flush-privileges : rechargé les tables de droits
* flush-hosts : met à jour les informations concernant les hôtes
* flush-logs : met à jour les informations concernant les journaux
* flush-status : efface les variables status
* flush-tables : met à jour les informations concernant les tables
* flush-threads : met à jour les informations concernant les threads
* password : change le mot de passe
* old-password : change le mot de passe en utilisant l'ancien algorithme de chiffrement
* ping : teste si mysql fonctionne
* reload : recharge la configuration
* refresh : vide les caches
* shutdown : arrête mysql
* status : connaitre des informations sur l'état du serveur
* extended-status : connaitre des informations détaillées sur l'état du serveur
* proc ou processlist : connaitre les utilisateurs connectés
* debug : Passe Mysql en mode debug
* kill : Permet d'arrêter des threads. On indique le numéro de connexion à terminer obtenu avec proc ou processlist
* start-slave : Démarre la réplication sur le serveur de réplication esclave
* stop-slave : Arrête la réplication sur le serveur de réplication esclave
* variables : Affiche les variables internes Mysql
* version : Affiche le numéro de version de Mysql
Utile : j'ai perdu le mot de passe du compte root mysql, comment le changer :
1. On arrête Mysql :
2. On relance le daemon mysqld avec l'option --skip-grant-tables
3. Depuis une autre fenêtre, on se connecte à Mysql
4. On met à jour la table user :
5. On arrête proprement le daemon mysqld :
6. On relance Mysql :

### mysqlcheck

La commande mysqlcheck permet de vérifier l'intégrité d'une base de données. On indique la (les) base(s) de données à vérifier (et optionnellement les tables à vérifier), et la commande donne l'état : OK ou corrompue.
Options courantes :
* -r ou --repair : permet de corriger presque tout, sauf les problèmes de doublons pour les clés uniques.
* -a ou --analyse : permet d'analyser les tables indiquées.
* -o ou --optimize : permet d'optimiser les tables indiquées.
Exemple : vérifier l'intégrité de toutes les tables de la base de données testdb :
Vérifier uniquement la table client :
Vérifier les tables user et db de la base de données mysql :
Remarque : mysqlcheck ne fonctionne qu'en utilisant des instructions SQL (CHECK TABLE, REPAIR TABLE, ANALYZE TABLE, et OPTIMIZE TABLE), il a donc besoin que le serveur Mysql soit en train de fonctionner.

### myisamchk

La commande myisamchk permet la restauration d'une table ou plusieurs tables endommagées à la suite de crash répétés du démon mysqld.
Attention : myisamchk intervient directement sur les fichiers, il se passe de mysqld contrairement à mysqlcheck !
Quelques précautions d'usage: : Si vous utilisez myisamchk pour réparer ou optimiser les tables, vous devez toujours vous assurer que mysqld n'utilise pas cette table (ce qui s'applique aussi si vous utilisez --skip-external-locking ). Si vous n'éteignez pas le serveur mysqld , vous devez au moins utiliser mysqladmin flush-tables avant de lancer myisamchk.
Attention : Vos tables peuvent être corrompues si le serveur mysqld et myisamchk travaillent dans une même table simultanément.
Vérifier la cohérence d'une table:
On indique à myisamchk les tables à vérifier en désignant les fichiers index MYI :
On peut également spécifier toutes les tables comme ceci :
Voire carrément vérifier toutes les tables de toutes les bases :
La commande affiche un rapport d'analyse, et si tout est OK, ne signale pas d'erreur :
Cette commande trouvera 99.99% de toutes les erreurs. Elle ne peut toutefois détecter les erreurs qui impliquent uniquement le fichier de données (ce qui est très inhabituel).
Si vous voulez uniquement vérifier une table sans que la commande produise un affichage, il faut utiliser l'option -s (ou --silent).

### mysql_setpermission

La commande mysql_setpermission permet de définir les permissions des utilisateurs Mysql de manière intéractive.
Ecrit en Perl, ce script a besoin des modules DBI et DBD::mysql pour fonctionner.
* 1 : Permet de modifier le mot de passe d'un utilisateur éxistant
* 2 : Permet d'ajouter/modifier le droit SELECT d'un utilisateur sur une table en créant un utilisateur et une table :
L'utilisateur user aura le droit SELECT sur la base de donnée dbuser
* 3 : Même fonction que la sélection 2, sauf que l'on donne le droit SELECT sur une table existante.
* 4 : Même fonction que la sélection 2, pour les droits SELECT,INSERT,UPDATE,DELETE.
* 5 : Même fonction que la sélection 2, pour les droits SELECT,INSERT,UPDATE,DELETE,CREATE,DROP,INDEX,LOCK TABLES,CREATE TEMPORARY TABLES
* 6 : Même fonction que la sélection 2, pour tous les droits.
* 7 : Met les droits par défaut (N) pour un utilisateur existant.
* 0 : sortir du programme
Les différentes options de mysql_setpermission :
* --help (ou -h) : permet d'afficher l'aide
* --host (ou -h) : se connecte au serveur Mysql donné
* --password (ou -p) : pour qu'il demande le mot de passe à la connexion
* --port (ou -P) : donne le numéro de port si différent de celui par défaut
* --user (ou -u) : se connecte au serveur avec le nom de compte donné

### mysqlhotcopy

La commande mysqlhotcopy permet de copier une base de données à chaud, c'est à dire sans arrêter le serveur Mysql.
Pour cela, la commande bloque les tables afin qu'il n'y ai pas de modification des tables durant la copie.
Les tables sont ensuite débloquées.
Exemple d'utilisation :
Vérification :

## Autres programmes utiles
### MySQL Workbench

Anciennement nommé MySQL Administrator, MySQL Workbench est aujourd'hui maintenu par Oracle.
| Accueil de MySQL Workbench | Accueil de MySQL Administrator |
| Configuration de MySQL Workbench | Configuration de MySQL Administrator |

### MySQL Query Browser

MySQL Query Browser n'est plus développé depuis 2012.

### MySQL Control Center

mysqlcc est l'ancien logiciel d'administration de MySQL, il s'est arrêté en 2013, et donc n'est pas 100 % compatible avec la version 5 de MySQL. Il est désormais remplacé par MySQL Workbench.

### MySQL Navigator

MySQL Navigator n'est plus développé depuis 2013.

## Références

* ↑ http://stackoverflow.com/questions/6645818/how-to-automate-database-backup-using-phpmyadmin
* ↑ https://dev.mysql.com/doc/refman/8.0/en/mysqldump.html
* ↑ http://sqlbrowser.www2.pl/?act=download
* ↑ http://sourceforge.net/projects/mysqlcc/?source=navbar
* ↑ http://sourceforge.net/projects/mysqlnavigator/?source=typ_redirect