# Taxinomie du genre Pinus

La taxinomie du genre Pinus se base sur des caractéristiques morphologiques et anatomiques variées telles que le nombre d'aiguilles par fascicule ou encore les caractéristiques des cônes et des graines, ainsi que sur des analyses ADN. De très nombreuses classifications ont été proposées depuis Linné et elles sont encore en cours de discussion actuellement. Par conséquent la classification présentée ici est indicative et susceptible de changer. Cependant, un certain nombre de regroupements sont généralement reconnus.

## Généralités

Le genre des pins est le plus large des conifères, avec environ 115 espèces. Il se distingue par ses aiguilles qui sont fasciculées, c'est-à-dire en groupe de 2, 3, ou 5 aiguilles entourées à leur base d'une gaine. Les pins sont également caractérisés par un dimorphisme branchial : des branches longues portent des feuilles stériles en forme d'écaille; des branches très courtes au bout desquelles on trouve les fascicules d'aiguilles.
La forme de leurs cônes femelles (l'équivalent des fruits des angiospermes, que l'on appelle familièrement "pommes de pin") est aussi caractéristique. Ils se développent en trois étés, et on peut distinguer sur le cône mature la partie qui était déjà visible lors du premier été (l'ombilic) et celle qui était déjà visible le second été (l'écusson).
La pertinence d'un genre Pinus séparé des autres genres de Pinacées n'est actuellement plus discutée, tant à cause de leurs caractéristiques morphologiques et anatomiques uniques que sur base d'analyses de séquence ADN.

## Méthodes de classification
### Critères morphologiques
#### Nombre d'aiguilles

Le premier critère de classification a été le nombre d'aiguilles par fascicule. Il est la plupart du temps un des premiers termes de la suite de Fibonacci, c'est-à-dire 2, 3 ou 5 (rarement 1 ou 8). Ce nombre est souvent assez constant au sein d'une espèce, des variations pouvant malgré tout être trouvées chez certaines espèces (dont certains Pins mexicains). Quoiqu'il ne s'agisse pas d'un critère permettant d'identifier la position taxinomique de l'espèce, elle permet de donner quelques indications. Ainsi, tous les pins de la sous-section Strobus ont cinq aiguilles.

#### Caractéristique du bois

Les pins ont été classés selon les caractéristiques anatomiques de leur bois, notamment par Van der Burgh en 1974.

## Historique

Les premières classifications utilisaient comme critère le nombre d'aiguilles par fascicule, mais cela s'est avéré insuffisant, particulièrement après la découverte de nombreux pins mexicains dont le nombre d'aiguilles est variable au sein d'une même espèce.
Engelmann, en 1880, fut le premier à proposer une séparation du genre en deux sous-genres, qu'il appela Pinaster et Strobus. Koehne, en 1893, observa les faisceaux vasculaires des aiguilles de pins et conclut qu'on pouvait diviser les pins en deux groupes: ceux qui n'en ont qu'un par aiguille et ceux qui en ont deux. Il nomma les premiers "Haploxylon" et les seconds "Dyploxylon". Cette division fut ensuite abondamment reprise, renommée plus tard respectivement Strobus et Pinus.
Cette division en deux sous-genres est encore utilisée aujourd'hui. Cependant, d'autres classifications virent aussi le jour. En 1969, Little et Critchfield créèrent le sous-genre Ducampopinus qui ne comportait qu'une seule espèce, Pinus krempfii, dont la forme des feuilles, plates, étaient très particulières. Cette classification reste la plus citée aujourd'hui, particulièrement parmi les forestiers. En, 2003, Frankis proposa une classification en trois sous-genres, où Ducampopinus ne comprenait plus seulement Pinus krempfii mais une quinzaine d'espèces.
Les analyses cladistiques, en particulier celles utilisant l'ADN, ont largement confirmé la pertinence évolutive de la séparation entre Strobus et Pinus. Pinus krempfii semble bien faire partie du sous-genre Strobus comme l'intégralité du sous-genre Ducampopinus, qui semble être paraphylétique en son sein.

## Classification

La classification des pins n'étant pas arrêtée, cette liste, et en particulier la division en sous-section, ne peut être qu'indicative. Elle se base principalement sur l'ouvrage d'Aljos Farjon, "Drawings and description of the genus Pines", sorti en 2005.
* Sous-genre Strobus
** Section Parrya
*** Sous-section Nelsoniae
**** Pinus nelsonii
*** Sous-section Balfourianae
**** Pinus aristata
**** Pinus balfouriana
**** Pinus longaeva
*** Sous-section Rzedowskii
**** Pinus pinceana
**** Pinus maximartinezii
**** Pinus rzedowskii
*** Sous-section Cembroides
**** Pinus cembroides
**** Pinus culminicola
**** Pinus edulis
**** Pinus johannis
**** Pinus monophylla
**** Pinus orizabensis
**** Pinus quadrifolia
**** Pinus remota
** Section Strobus
*** Sous-section Gerardianae
**** Pinus bungeana
**** Pinus gerardiana
**** Pinus squamata
*** Sous-section Krempfianae
**** Pinus krempfii
*** Sous-section Strobus
**** Pinus albicaulis
**** Pinus amamiana
**** Pinus armandii
**** Pinus ayacahuite
**** Pinus bhutanica
**** Pinus cembra
**** Pinus dalatensis
**** Pinus fenzeliana
**** Pinus flexilis
**** Pinus koraiensis
**** Pinus lambertiana
**** Pinus monticola
**** Pinus morrisonicola
**** Pinus parviflora
**** Pinus peuce
**** Pinus pumila
**** Pinus sibirica
**** Pinus strobiformis
**** Pinus strobus
**** Pinus wallichiana
* Sous-genre Pinus
** Section Trifolius
*** Sous-section Australes
**** Pinus apulcensis
**** Pinus attenuata
**** Pinus caribaea
**** Pinus cooperi
**** Pinus cubensis
**** Pinus echinata
**** Pinus elliottii
**** Pinus glabra
**** Pinus greggii
**** Pinus herrerae
**** Pinus jaliscana
**** Pinus lawsonii
**** Pinus leiophylla
**** Pinus lumholtzii
**** Pinus luzmariae
**** Pinus muricata
**** Pinus occidentalis
**** Pinus oocarpa
**** Pinus palustris
**** Pinus patula
**** Pinus praetermissa
**** Pinus pringlei
**** Pinus pungens
**** Pinus radiata
**** Pinus rigida
**** Pinus sabiniana
**** Pinus taeda
**** Pinus tecunumanii
**** Pinus teocote
*** Sous-section Ponderosae
**** Pinus arizonica
**** Pinus coulteri
**** Pinus devoniana
**** Pinus douglasiana
**** Pinus durangensis
**** Pinus engelmannii
**** Pinus jeffreyi
**** Pinus hartwegii
**** Pinus maximinoi
**** Pinus montezumae
**** Pinus ponderosa
**** Pinus pseudostrobus
**** Pinus serotina
**** Pinus torreyana
*** Sous-section Contortae
**** Pinus banksiana
**** Pinus clausa
**** Pinus contorta
**** Pinus virginiana
** Section Pinus
*** Sous-section Pinaster
**** Pinus brutia
**** Pinus canariensis
**** Pinus halepensis
**** Pinus heldreichii
**** Pinus merkusii
**** Pinus latteri
**** Pinus pinea
**** Pinus pinaster
**** Pinus roxburghii
*** Sous-section Pinus
**** Pinus densata
**** Pinus densiflora
**** Pinus fragilissima
**** Pinus henryi
**** Pinus hwangshanensis
**** Pinus kesiya
**** Pinus luchuensis
**** Pinus massoniana
**** Pinus mugo
**** Pinus nigra
**** Pinus resinosa
**** Pinus sylvestris
**** Pinus tabuliformis
**** Pinus taiwanensis
**** Pinus thunbergii
**** Pinus tropicalis
**** Pinus uncinata
**** Pinus yunnanensis

## Classification phylogénétique

| Jin et al. 2021 | Stull et al. 2021$^,$ |
| Pinus sous-genre Strobus section Parrya sous-section Nelsonii P. nelsonii sous-section Balfouriana P. aristata P. balfouriana P. longaeva sous-section Cembroides P. pinceana P. maximartinezii P. rzedowskii P. quadrifolia P. monophylla P. culminicola P. discolor P. remota P. edulis P. cembroides section Quinquefoliae sous-section Gerardiana P. bungeana P. squamata P. gerardiana sous-section Krempfii P. krempfii sous-section Strobus P. peuce P. lambertiana P. strobus P. chiapensis P. monticola P. flexilis P. strobiformis P. ayacahuite P. albicaulis P. koraiensis P. sibirica P. cembra P. parviflora P. wallichiana P. armandii P. dabeshanensis P. fenzeliana P. mastersiana P. bhutanica P. morrisonicola P. wangii P. kwangtungensis P. dalatensis sous-genre Pinus section Pinus sous-section Pinaster P. heldreichii P. pinaster P. halepensis P. brutia P. pinea P. canariensis P. roxburghii sous-section Pinus P. latteri P. merkusii P. resinosa P. nigra P. densiflora P. sylvestris P. mugo P. uncinata P. massoniana P. thunbergii P. luchuensis P. kesiya P. yunnanensis P. densata P. henryi P. tabuliformis P. hwangshanensis P. taiwanensis section Trifoliae sous-section Sabiniana P. jeffreyi P. coulteri P. torreyana P. sabiniana sous-section Ponderosae P. washoensis P. ponderosa P. hartwegii P. engelmannii P. durangensis P. arizonica P. devoniana P. montezumae P. pseudostrobus P. douglasiana P. maximinoi sous-section Attenuata P. radiata P. attenuata P. muricata sous-section Contorta P. contorta P. banksiana P. virginiana P. clausa sous-section Australes P. pungens P. serotina P. rigida P. glabra P. taeda P. echinata P. elliottii P. palustris P. caribaea P. oocarpa P. tecunumanii P. greggii P. patula P. teocote P. lawsonii P. herrerae P. pringlei P. leiophylla P. lumholtzii P. praetermissa P. jaliscana P. luzmariae P. georginae | Pinus Modèle:Clade |