# Liste d'espèces dont le génome est séquencé

La liste ci-dessous, non exhaustive, présente des espèces dont le génome a été complètement séquencé à la date du 12 février 2016.

## Projets de séquençage global, voire de tout le vivant

Après que le séquençage ait été fait pour l'Homme (en 30 ans environ), plusieurs projets visent à séquencer le génome d'un grand nombre d'espèces de quelques groupes taxonomiques, et même de tout le vivant :
* le projet Genoma 10K veut séquencer 10 000 génomes de vertébrés (environ pour chaque genre) ;
* le projet I5K souhaite déchiffrer le génome de 5000 arthropodes ;
* le projet B10K voudrait déchiffrer les génomes de chacune des environ 10 500 espèces d'oiseaux ;
* le projet Earth BioGenome, préparé dès 2015 et initié en 2017, entend séquencer l'ensemble des espèces connues de la planète.

## Eubacteria
### Epsilonproteobacteria

* Campylobacter jejuni. Souche NCTC11168. Génome publié dans EMBL :
** Identifiant (ID): CJ11168
** Numéro d'accès (accession number): AL111168
* Helicobacter hepaticus. Souche ATCC51449. Publié dans GenBank, numéro d'accès: AE017125. Voir aussi www.THE-MWG.com.
* Helicobacter pylori
* Thimicrospira denitrificans
* Wollinella succinogenes

### Deltaproteobacteria

* Anaeromyxobacter dehalogenans
* Bdellovibrio bacteriovorus
* Desulfotalea psychrophila
* Desulfovibrio desulfuricans
* Desulfuvibrio vulgaris
* Desulfuromonas acetoxidans
* Geobacter metallireducen
* Geobacter sulfurreducens
* Pelobacter carbinolicus

### Alphaproteobacteria

* Agrobacterium tumefaciens
* Anaplasma marginale
* Bartonella henselae
* Bradyrhizobium japonicum
* Brucella melitensis
* Brucella suis
* Caulobacter crescentus
* Erlichia canis
* Erlicha ruminantium
* Gluconobacter oxydans
* Jannaschia
* Magnetococcus
* Magnetospirillum magnetotacticum
* Mesorhizobium loti
* Nitrobacter hamburgensis
* Nitrobacter windogradskyi
* Novosphingobium aromaticivorans
* Bartonella quintana
* Paracoccus denitrificans
* Rhodobacter sphaeroides
* Rhodospirillum rubrum
* Rickettsia akari
* Rickettsia conorii
* Rickettsia prowazekii
* Rickettsia sibirica
* Rickettsia typhi
* Silicibacter pomeroyi
* Sinorhizobium meliloti
* Sphingopyxis alaskensis
* Wolbachia pipientis
* Zymomonas mobilis

### Betaproteobacteria

* Azoarcus
* Bordetella bronchiseptica
* Bordetella parapertussis
* Bordetella pertussis
* Burkholderia cenocepacia
* Burkholderia cepacia
* Burkholderia mallei
* Burkholderia pseudomallei
* Burkholderia vietnamiensis
* Burkholderia xenovarans
* Chromobacterium violaceum
* Cupriavidus metallidurans
* Cupriavidus necator
* Dechloromonas aromatica
* Methylobacillus flagellatus
* Neisseria gonorrhoeae
* Neisseria meningitidis
* Nitrosomonas europaea
* Nitrospira multiformis
* Polaromonas
* Ralstonia solanacearum
* Rhodoferax ferrireducens
* Rubrivivax gelatinosus
* Thiobacillus denitrificans

## Eukaryota
### Plantes

Quelques éléments de la Liste d'espèces de plantes dont le génome est séquencé :
* L'arabette des dames : Arabidopsis thaliana, une plante modèle (premier séquençage complet du règne végétal, terminé en 2000)
* Le riz asiatique : Oryza sativa
* Le blé tendre : Triticum aestivum
* Le maïs : Zea mays
* Le peuplier de l'Ouest : Populus trichocarpa
* La tomate Solanum lycopersicum
* La pomme de terre : Solanum tuberosum
* La vigne: Vitis vinifera
* Le sorgho commun : Sorghum bicolor
* La banane: Musa acuminata
* Le lin : Linum usitatissimum
* Le pêcher : Prunus persica
* Le rosier : voir génome de la rose
* Le papayer: Carica papaya
* Le tournesol: Helianthus annuus

### Champignon

* Armillaria mellea
* Glarea lozoyensis
* Heterobasidion irregulare
* Magnaporthe grisea
* Saccharomyces cerevisiae

### Insectes

Coleoptera
* Agrilus planipennis, agrile du frêne (2014)
* Dendroctonus ponderosae, dendroctone du pin ponderosa (2013)
* Tribolium castaneum, tribolium rouge de la farine (2008)
Diptera
Culicidae
* Aedes aegypti, moustique (2007)
* Anopheles albimanus, moustique (2014)
* Anopheles arabiensis, moustique (2014)
* Anopheles atroparvus, moustique (2013)
* Anopheles christyi, moustique (2014)
* Anopheles culicifacies, moustique (2014)
* Anopheles darlingi, moustique (2013)
* Anopheles dirus, moustique (2014)
* Anopheles epiroticus, moustique (2013)
* Anopheles farauti, moustique (2014)
* Anopheles funestus, moustique (2006)
* Anopheles gambiae, moustique (2002)
* Anopheles maculatus, moustique (2013)
* Anopheles melas, moustique (2014)
* Anopheles merus, moustique (2014)
* Anopheles minimus, moustique (2014)
* Anopheles nili, moustique (2011)
* Anopheles quadriannulatus, moustique (2014)
* Anopheles sinensis, moustique (2014)
* Anopheles stephensi, moustique (2014)
* Culex quinquefasciatus, moustique (2010)
Psychodidae
* Clogmia albipunctata, moucheron (2013)
Drosophilidae
* Drosophila ananassae, drosophile (2007)
* Drosophila biarmipes, drosophile (2011)
* Drosophila bipectinata, drosophile (2011)
* Drosophila erecta, drosophile (2007)
* Drosophila elegans, drosophile (2011)
* Drosophila eugracilis, drosophile (2011)
* Drosophila ficusphila, drosophile (2011)
* Drosophila grimshawi, drosophile (2007)
* Drosophila kikkawai, drosophile (2011)
* Drosophila melanogaster, drosophile (2000)
* Drosophila mojavensis, drosophile (2007)
* Drosophila persimilis, drosophile (2007)
* Drosophila pseudoobscura, drosophile (2005)
* Drosophila rhopaloa, drosophile (2011)
* Drosophila santomea, drosophile
* Drosophila sechellia, drosophile (2007)
* Drosophila simulans, drosophile (2007)
* Drosophila takahashi, drosophile (2011)
* Drosophila virilis, drosophile (2007)
* Drosophila willistoni, drosophile (2007)
* Drosophila yakuba, drosophile (2007)
Syrphidae
* Episyrphus balteatus, syrphe (2011)
Phoridae
* Megaselia abdita, mouche phoride (2013)
Hemiptera
* Acyrthosiphon pisum, puceron du pois (2010)
Hymenoptera
Formicidae
* Acromyrmex echinatior fourmis (2011)
* Atta cephalotes, fourmis (2011)
* Atta colombica, fourmis (2012)
* Camponotus floridanus, fourmis (2010)
* Cardiocondyla obscurior, fourmis (2012)
* Cyphomyrmex costatus, fourmis (2011)
* Formica selysi, fourmis (2012)
* Harpegnathos saltator, fourmis (2010)
* Lasius flavus, fourmis (2019)
* Lasius niger, fourmis (2019)
* Linepithema humile, fourmis (2011)
* Monomorium pharaonis, fourmis
* Myrmecia crosslandi, fourmis
* Myrmecia pilosula, fourmis
* Mystrium rogeri, fourmis
* Odontomachus hastatus, fourmis
* Paraponera clavata, fourmis
* Paratrachymyrmex cornetzi, fourmis (2015)
* Pogonomyrmex barbatus, fourmis (2011)
* Pogonomyrmex colei, fourmis (2015)
* Pseudomyrmex gracilis, fourmis
* Solenopsis invicta, fourmis (2011)$^,$
* Tetramorium caespitum, fourmis (2015)
* Trachymyrmex septentrionalis, fourmis
* Vollenhovia emeryi, fourmis (2015)
* Vollenhovia nipponica, fourmis (2015)
Apidae
* Apis mellifera, abeille domestique (2006)
Pteromalidae
* Nasonia giraulti, guêpe parasitoïde (2010)
* Nasonia longicornis, guêpe parasitoïde (2010)
* Nasonia vitripennis, guêpe parasitoïde (2010)
Lepidoptera
Bombycidae
* Bombyx mori, ver à soie (2004)
Nymphalidae
* Danaus plexippus, monarque (2011)
* Heliconius melpomene, héliconie (2012)
Plutellidae
* Plutella xylostella, Teigne des crucifères (2013)
Phthiraptera
Pediculidae
Pediculus humanus, pou (2010)

### Autres Invertébrés

* L'oursin Arbacia punctulata
* Le ver nématode Caenorhabditis elegans

### Vertébrés
#### Poissons

* Le poisson médaka : Oryzias latipes
* Le poisson fugu Takifugu rubipres
* Le poisson zèbre : Danio rerio
* Le poisson tétraodon Tetraodon nigroviridis
* La morue de l'atlantique : Gadus morhua
* Le killi turquoise : Nothobranchius furzeri

#### Batraciens

* Le crapaud xénope : Xenopus laevis

#### Oiseaux

* Le coq bankiva ou sauvage : Gallus gallus
* Le poulet domestique : Gallus gallus domesticus
* La dinde : Meleagris
* La perruche ondulée : Melopsittacus undulatus
* Le diamant mandarin : Taeniopygia guttata
* Le pigeon biset : Columba livia

#### Mammifères

* L'humain : Homo sapiens ; voir Projet génome humain abouti en 2003
* La souris grise : Mus musculus
* Le rat surmulot : Rattus norvegicus
* Le chimpanzé : Pan troglodytes
* Le macaque rhésus : Macaca mulatta
* Le chat domestique : Felis silvestris catus
* L'ornithorynque : Ornithorhynchus anatinus
* Le taureau : Bos Taurus
* Le cheval : Equus Caballus
* Le gorille : Gorilla gorilla
* Le chameau de Bactriane : Camelus bactrianus