# Hydrolase

Les hydrolases constituent une classe d'enzymes qui catalysent les réactions d'hydrolyse de molécules suivant la réaction générale :
On y trouve par exemple
* les estérases, qui hydrolysent les esters (R-CO-O~R'),
* les peptidases, qui hydrolysent les liaisons peptidiques (AA1-CO~NH-AA2),
* les glycosidases, qui hydrolysent les oligo- ou polysaccharides (sucre1-O~sucre2),
* les phosphatases, qui hydrolysent les produits phosphorés (exemple : ATP + H$_2$O ⇌ ADP + P).
Ces enzymes ne nécessitent pas en général de coenzymes. Elles sont activables par des cations.
On rencontre des hydrolases dans les lysosomes des cellules. Les hydrolases lysosomales, particulièrement acides, présentent un pH d'environ 5 lorsqu'elles sont activées. Elles sont enfermées de façon étanche au sein du lysosome dont la libération brutale du contenu pourrait lyser la cellule.
Elles sont classées dans le groupe EC 3 dans la nomenclature EC, et sont réparties en 13 sous-groupes, en fonction du type de liaison qui sera coupée.

## Classification EC
### Groupe EC3.1 (estérases)

Elles agissent sur les liaisons ester de type R-CO-O-R'.

#### EC 3.1.1 : Hydrolases spécifiques des esters carboxyliques

* EC 3.1.1.1 : carboxylestérase
* EC 3.1.1.2 : arylestérase
* EC 3.1.1.3 : triacylglycérol-lipase
* EC 3.1.1.4 : phospholipase A2
* EC 3.1.1.5 : lysophospholipase
* EC 3.1.1.6 : acétylestérase
* EC 3.1.1.7 : acétylcholinestérase
* EC 3.1.1.8 : cholinestérase
* EC 3.1.1.9 : supprimée
* EC 3.1.1.10 : tropinestérase
* EC 3.1.1.11 : pectinestérase
* EC 3.1.1.12 : supprimée
* EC 3.1.1.13 : stérol-estérase
* EC 3.1.1.14 : chlorophyllase
* EC 3.1.1.15 : L-arabinonolactonase
* EC 3.1.1.16 : supprimée (mélange de EC 5.3.3.4 et de EC 3.1.1.24)
* EC 3.1.1.17 : gluconolactonase
* EC 3.1.1.18 : supprimée (incluse dans EC 3.1.1.17)
* EC 3.1.1.19 : uronolactonase
* EC 3.1.1.20 : tannase
* EC 3.1.1.21 : rétinyl-palmitate-estérase
* EC 3.1.1.22 : hydroxybutyrate-dimère-hydrolase
* EC 3.1.1.23 : acylglycérol-lipase
* EC 3.1.1.24 : 3-oxoadipate-énol-lactonase
* EC 3.1.1.25 : 1,4-lactonase
* EC 3.1.1.26 : galactolipase
* EC 3.1.1.27 : 4-pyridoxolactonase
* EC 3.1.1.28 : acylcarnitine-hydrolase
* EC 3.1.1.29 : aminoacyl-tRNA-hydrolase
* EC 3.1.1.30 : D-arabinonolactonase
* EC 3.1.1.31 : 6-phosphogluconolactonase
* EC 3.1.1.32 : phospholipase A1
* EC 3.1.1.33 : 6-acétylglucose-déacétylase
* EC 3.1.1.34 : lipoprotéine lipase
* EC 3.1.1.35 : dihydrocoumarin-hydrolase
* EC 3.1.1.36 : limonine-D-cyclolactonase
* EC 3.1.1.37 : stéroïde-lactonase
* EC 3.1.1.38 : triacétate-lactonase
* EC 3.1.1.39 : actinomycine-lactonase
* EC 3.1.1.40 : orsellinate-depside-hydrolase
* EC 3.1.1.41 : céphalosporine C-déacétylase
* EC 3.1.1.42 : chlorogénate-hydrolase
* EC 3.1.1.43 : α-aminoacide-estérase
* EC 3.1.1.44 : 4-méthyloxaloacétate-estérase
* EC 3.1.1.45 : carboxyméthylènebutènolidase
* EC 3.1.1.46 : désoxylimonate A-cyclolactonase
* EC 3.1.1.47 : 1-alkyl-2-acétylglycérophosphocholine-estérase
* EC 3.1.1.48 : fusarinine C-ornithinestérase
* EC 3.1.1.49 : sinapine-estérase
* EC 3.1.1.50 : cutinase
* EC 3.1.1.51 : phorbol-diester-hydrolase
* EC 3.1.1.52 : phosphatidylinositol-déacylase
* EC 3.1.1.53 : sialate O-acétylestérase
* EC 3.1.1.54 : acétoxybutynylbithiophène-déacétylase
* EC 3.1.1.55 : acétylsalicylate-déacétylase
* EC 3.1.1.56 : méthylumbelliférylacétate-déacétylase
* EC 3.1.1.57 : 2-pyrone-4,6-dicarboxylate-lactonase
* EC 3.1.1.58 : N-acétylgalactosaminoglycane-déacétylase
* EC 3.1.1.59 : hormone juvénile-estérase
* EC 3.1.1.60 : bis(2-éthylhexyl)phtalate-estérase
* EC 3.1.1.61 : protéine-glutamate-méthylestérase
* EC 3.1.1.62 : transférée vers EC 3.5.1.47
* EC 3.1.1.63 : 11-cis-rétinyl-palmitate-hydrolase
* EC 3.1.1.64 : all-trans-rétinyl-palmitate-hydrolase
* EC 3.1.1.65 : L-rhamnono-1,4-lactonase
* EC 3.1.1.66 : 5-(3,4-diacétoxybut-1-ynyl)-2,2'-bithiophène-déacétylase
* EC 3.1.1.67 : acide gras-éthylester-synthase
* EC 3.1.1.68 : xylono-1,4-lactonase
* EC 3.1.1.69 : transférée vers EC 3.5.1.89
* EC 3.1.1.70 : cétraxate-benzylestérase
* EC 3.1.1.71 : acétylalkylglycérol-acétylhydrolase
* EC 3.1.1.72 : acétylxylane-estérase
* EC 3.1.1.73 : féruloyl-estérase
* EC 3.1.1.74 : cutinase
* EC 3.1.1.75 : poly(3-hydroxybutyrate)-dépolymérase
* EC 3.1.1.76 : poly(3-hydroxyoctanoate)-dépolymérase
* EC 3.1.1.77 : acyloxyacyl-hydrolase
* EC 3.1.1.78 : polyneuridine-aldéhyde-estérase
* EC 3.1.1.79 : hormone-sensitive-lipase
* EC 3.1.1.80 : acétylajmaline-estérase
* EC 3.1.1.81 : quorum-quenching N-acyl-homoserine lactonase
* EC 3.1.1.82 : phéophorbidase
* EC 3.1.1.83 : monoterpène ε-lactone-hydrolase

#### EC 3.1.2 : Hydrolases spécifiques des thioesters

* EC 3.1.2.1 : acétyl-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.2 : palmitoyl-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.3 : succinyl-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.4 : 3-hydroxyisobutyryl-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.5 : hydroxyméthylglutaryl-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.6 : hydroxyacylglutathion-hydrolase
* EC 3.1.2.7 : glutathion-thiolestérase
* EC 3.1.2.8 : supprimée (incluse dans EC 3.1.2.6)
* EC 3.1.2.9 : supprimée
* EC 3.1.2.10 : formyl-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.11 : acétoacétyl-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.12 : S-formylglutathion-hydrolase
* EC 3.1.2.13 : S-succinylglutathion-hydrolase
* EC 3.1.2.14 : oléoyl-(acylprotéine de transport)-hydrolase
* EC 3.1.2.15 : ubiquitine-thiolestérase
* EC 3.1.2.16 : citrate-lyase-déacétylase
* EC 3.1.2.17 : (S)-méthylmalonyl-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.18 : ADP-dependent short-chain-acyl-CoA hydrolase
* EC 3.1.2.19 : ADP-dependent medium-chain-acyl-CoA hydrolase
* EC 3.1.2.20 : acyl-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.21 : dodécanoyl-(acylprotéine de transport)-hydrolase
* EC 3.1.2.22 : palmitoyl(protéine)-hydrolase
* EC 3.1.2.23 : 4-hydroxybenzoyl-CoA-thioestérase
* EC 3.1.2.24 : transférée vers EC 3.13.1.3
* EC 3.1.2.25 : phénylacétyl-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.26 : acide biliaire-CoA-hydrolase
* EC 3.1.2.27 : choloyl-CoA-hydrolase

#### EC 3.1.3 : Hydrolases spécifiques des liaisons monoester-phosphoriques

* EC 3.1.3.1 : phosphatase alcaline
* EC 3.1.3.2 : phosphatase acide
* EC 3.1.3.3 : phosphosérine-phosphatase
* EC 3.1.3.4 : phosphatidate-phosphatase
* EC 3.1.3.5 : 5'-nucléotidase
* EC 3.1.3.6 : 3'-nucléotidase
* EC 3.1.3.7 : 3'(2'),5'-bisphosphate-nucléotidase
* EC 3.1.3.8 : 3-phytase
* EC 3.1.3.9 : glucose-6-phosphatase
* EC 3.1.3.10 : glucose-1-phosphatase
* EC 3.1.3.11 : fructose-bisphosphatase
* EC 3.1.3.12 : tréhalose-phosphatase
* EC 3.1.3.13 : bisphosphoglycérate-phosphatase
* EC 3.1.3.14 : méthylphosphothioglycérate-phosphatase
* EC 3.1.3.15 : histidinol-phosphatase
* EC 3.1.3.16 : phosphoprotéine-phosphatase
* EC 3.1.3.17 : phosphorylase-phosphatase
* EC 3.1.3.18 : phosphoglycolate phosphatase
* EC 3.1.3.19 : glycérol-2-phosphatase
* EC 3.1.3.20 : phosphoglycérate-phosphatase
* EC 3.1.3.21 : glycérol-1-phosphatase
* EC 3.1.3.22 : mannitol-1-phosphatase
* EC 3.1.3.23 : sucre-phosphatase
* EC 3.1.3.24 : sucrose-phosphate-phosphatase
* EC 3.1.3.25 : inositol-phosphate phosphatase
* EC 3.1.3.26 : 4-phytase
* EC 3.1.3.27 : phosphatidylglycérophosphatase
* EC 3.1.3.28 : ADP-phosphoglycérate-phosphatase
* EC 3.1.3.29 : N-acylneuraminate-9-phosphatase
* EC 3.1.3.30 : supprimée (incluse dans EC 3.1.3.31)
* EC 3.1.3.31 : nucléotidase
* EC 3.1.3.32 : polynucléotide 3'-phosphatase
* EC 3.1.3.33 : polynucléotide 5'-phosphatase
* EC 3.1.3.34 : désoxynucléotide 3'-phosphatase
* EC 3.1.3.35 : thymidylate-5'-phosphatase
* EC 3.1.3.36 : phosphoinositide-5-phosphatase
* EC 3.1.3.37 : sédoheptulose-bisphosphatase
* EC 3.1.3.38 : 3-phosphoglycérate-phosphatase
* EC 3.1.3.39 : streptomycine-6-phosphatase
* EC 3.1.3.40 : guanidinodésoxy-scyllo-inositol-4-phosphatase
* EC 3.1.3.41 : 4-nitrophénylphosphatase
* EC 3.1.3.42 : (glycogène-synthase-D)-phosphatase
* EC 3.1.3.43 : (pyruvate-déshydrogénase-(acétylransférase))-phosphatase
* EC 3.1.3.44 : acétyl-CoA-carboxylase-phosphatase
* EC 3.1.3.45 : 3-désoxy-manno-octulosonate-8-phosphatase
* EC 3.1.3.46 : fructose-2,6-disphosphate 2-phosphatase
* EC 3.1.3.47 : hydroxyméthylglutaryl-CoA-réductase (NADPH)-phosphatase
* EC 3.1.3.48 : protéine-tyrosine-phosphatase
* EC 3.1.3.49 : pyruvate-kinase-phosphatase
* EC 3.1.3.50 : sorbitol-6-phosphatase
* EC 3.1.3.51 : dolichyl-phosphatase
* EC 3.1.3.52 : 3-méthyl-2-oxobutanoate-déshydrogénase (lipoamide)-phosphatase
* EC 3.1.3.53 : myosine-chaîne légère-phosphatase
* EC 3.1.3.54 : fructose-2,6-disphosphate 6-phosphatase
* EC 3.1.3.55 : caldesmone-phosphatase
* EC 3.1.3.56 : inositol-polyphosphate 5-phosphatase
* EC 3.1.3.57 : inositol-1,4-disphosphate 1-phosphatase
* EC 3.1.3.58 : sucre terminal-phosphatase
* EC 3.1.3.59 : alkylacétylglycérophosphatase
* EC 3.1.3.60 : phosphoénolpyruvate-phosphatase
* EC 3.1.3.61 : supprimée
* EC 3.1.3.62 : multiple inositol-polyphosphate phosphatase
* EC 3.1.3.63 : 2-carboxy-D-arabinitol-1-phosphatase
* EC 3.1.3.64 : phosphatidylinositol-3-phosphatase
* EC 3.1.3.65 : transférée vers EC 3.1.3.64
* EC 3.1.3.66 : phosphatidylinositol-3,4-disphosphate 4-phosphatase
* EC 3.1.3.67 : phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase
* EC 3.1.3.68 : 2-désoxyglucose-6-phosphatase
* EC 3.1.3.69 : glucosylglycérol 3-phosphatase
* EC 3.1.3.70 : mannosyl-3-phosphoglycérate-phosphatase
* EC 3.1.3.71 : 2-phosphosulfolactate-phosphatase
* EC 3.1.3.72 : 5-phytase
* EC 3.1.3.73 : α-ribazole-phosphatase
* EC 3.1.3.74 : pyridoxal-phosphatase
* EC 3.1.3.75 : phosphoéthanolamine/phosphocholine-phosphatase
* EC 3.1.3.76 : lipide-phosphate-phosphatase
* EC 3.1.3.77 : aciréductone-synthase
* EC 3.1.3.78 : phosphatidylinositol-4,5-disphosphate 4-phosphatase
* EC 3.1.3.79 : mannosylfructose-phosphate phosphatase
* EC 3.1.3.98 : transférée vers EC 3.6.1.68 en 2016

#### EC 3.1.4 : Hydrolases spécifiques des liaisons diester-phosphoriques

* EC 3.1.4.1 : phosphodiestérase I
* EC 3.1.4.2 : glycérophosphocholine-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.3 : phospholipase C
* EC 3.1.4.4 : phospholipase D
* EC 3.1.4.5 : transférée vers EC 3.1.21.1
* EC 3.1.4.6 : transférée vers EC 3.1.22.1
* EC 3.1.4.7 : transférée vers EC 3.1.31.1
* EC 3.1.4.8 : transférée vers EC 3.1.27.3
* EC 3.1.4.9 : transférée vers EC 3.1.30.2
* EC 3.1.4.10 : transférée vers EC 4.6.1.13
* EC 3.1.4.11 : phosphoinositide-phospholipase C
* EC 3.1.4.12 : sphingomyéline-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.13 : sérine-éthanolaminephosphate-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.14 : acylprotéine de transport-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.15 : adénylyl-(glutamate—ammonium-ligase)-hydrolase
* EC 3.1.4.16 : 2',3'-nucléotide cyclique 2'-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.17 : 3',5'-nucléotide cyclique phosphodiestérase
* EC 3.1.4.18 : transférée vers EC 3.1.16.1
* EC 3.1.4.19 : transférée vers EC 3.1.13.3
* EC 3.1.4.20 : transférée vers EC 3.1.13.1
* EC 3.1.4.21 : transférée vers EC 3.1.30.1
* EC 3.1.4.22 : transférée vers EC 3.1.27.5
* EC 3.1.4.23 : transférée vers EC 3.1.27.1
* EC 3.1.4.24 : supprimée
* EC 3.1.4.25 : transférée vers EC 3.1.11.1
* EC 3.1.4.26 : supprimée
* EC 3.1.4.27 : transférée vers EC 3.1.11.2
* EC 3.1.4.28 : transférée vers EC 3.1.11.3
* EC 3.1.4.29 : supprimée
* EC 3.1.4.30 : transférée vers EC 3.1.21.2
* EC 3.1.4.31 : transférée vers EC 3.1.11.4
* EC 3.1.4.32 : supprimée
* EC 3.1.4.33 : supprimée
* EC 3.1.4.34 : supprimée
* EC 3.1.4.35 : 3',5'-GMPc-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.36 : transférée vers EC 3.1.4.43
* EC 3.1.4.37 : 2',3'-nucléotide cyclique 3'-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.38 : glycérophosphocholine-cholinephosphodiestérase
* EC 3.1.4.39 : alkylglycérophosphoéthanolamine-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.40 : CMP-N-acylneuraminate-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.41 : sphingomyéline-phosphodiestérase D
* EC 3.1.4.42 : glycérol-1,2-phosphate cyclique 2-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.43 : glycérophosphoinositol-inositolphosphodiestérase
* EC 3.1.4.44 : glycérophosphoinositol-glycérophosphodiestérase
* EC 3.1.4.45 : N-acétylglucosamine-1-phosphodiester α-N-acétylglucosaminidase
* EC 3.1.4.46 : glycérophosphodiester-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.47 : transférée vers EC 4.6.1.14
* EC 3.1.4.48 : dolichylphosphate-glucose-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.49 : dolichylphosphate-mannose-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.50 : glycosylphosphatidylinositol-phospholipase D
* EC 3.1.4.51 : glucose-1-phospho-D-mannosylglycoprotéine-phosphodiestérase
* EC 3.1.4.52 : GMPc-phosphodiestérase spécifique
* EC 3.1.4.53 : 3',5'-AMPc-phosphodiestérase

#### EC 3.1.5 : Hydrolases spécifiques des liaisons monoester-triphosphoriques

* EC 3.1.5.1 : désoxyguanosine-triphosphatase

#### EC 3.1.6 : Hydrolases spécifiques des liaisons ester-sulfuriques

* EC 3.1.6.1 : arylsulfatase
* EC 3.1.6.2 : stéryl-sulfatase
* EC 3.1.6.3 : glycosulfatase
* EC 3.1.6.4 : N-acétylgalactosamine-6-sulfatase
* EC 3.1.6.5 : supprimée
* EC 3.1.6.6 : choline-sulfatase
* EC 3.1.6.7 : cellulose-polysulfatase
* EC 3.1.6.8 : cérébroside-sulfatase
* EC 3.1.6.9 : chondro-4-sulfatase
* EC 3.1.6.10 : chondro-6-sulfatase
* EC 3.1.6.11 : disulfoglucosamine-6-sulfatase
* EC 3.1.6.12 : N-acétylgalactosamine-4-sulfatase
* EC 3.1.6.13 : iduronate-2-sulfatase
* EC 3.1.6.14 : N-acétylglucosamine-6-sulfatase
* EC 3.1.6.15 : N-sulfoglucosamine-3-sulfatase
* EC 3.1.6.16 : monométhyl-sulfatase
* EC 3.1.6.17 : D-lactate-2-sulfatase
* EC 3.1.6.18 : glucuronate-2-sulfatase

#### EC 3.1.7 : Hydrolases spécifiques des liaisons monoester-diphosphoriques

* EC 3.1.7.1 : prényl-diphosphatase
* EC 3.1.7.2 : guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase
* EC 3.1.7.3 : monoterpényl-diphosphatase
* EC 3.1.7.4 : sclaréol-cyclase
* EC 3.1.7.5 : géranylgéranyl-diphosphate-diphosphatase

#### EC 3.1.8 : Hydrolases spécifiques des liaisons triester-phosphoriques

* EC 3.1.8.1 : aryldialkylphosphatase
* EC 3.1.8.2 : diisopropyl-fluorophosphatase

#### EC 3.1.11 : Exodésoxyribonucléases productrices de 5'-phosphomonoesters

* EC 3.1.11.1 : exodésoxyribonucléase I
* EC 3.1.11.2 : exodésoxyribonucléase III
* EC 3.1.11.3 : exodésoxyribonucléase (induite pas le phage λ)
* EC 3.1.11.4 : exodésoxyribonucléase (induite pas le phage SP3)
* EC 3.1.11.5 : exodésoxyribonucléase V
* EC 3.1.11.6 : exodésoxyribonucléase VII

#### EC 3.1.13 : Exoribonucléases productrices de 5'-phosphomonoesters

* EC 3.1.13.1 : exoribonucléase II
* EC 3.1.13.2 : exoribonucléase H
* EC 3.1.13.3 : oligonucléotidase
* EC 3.1.13.4 : poly(A)-ribonucléase spécifique
* EC 3.1.13.5 : ribonucléase D

#### EC 3.1.14 : Exoribonucléases productrices de 3'-phosphomonoesters

* EC 3.1.14.1 : ribonucléase de levure

#### EC 3.1.15 : Exonucléases actives à la fois sur l'ARN et sur l'ADN et produisant des 5'-phosphomonoesters

* EC 3.1.15.1 : exonucléase de venin

#### EC 3.1.16 : Exonucléases actives à la fois dur l'ARN et sur l'ADN et produisant des 3'-phosphomonoesters

* EC 3.1.16.1 : exonucléase de la rate

#### EC 3.1.21 : Endodésoxyribonucléases productrices de 5'-phosphomonoesters

* EC 3.1.21.1 : désoxyribonucléase I
* EC 3.1.21.2 : désoxyribonucléase IV (induite pas le phage T4)
* EC 3.1.21.3 : désoxyribonucléase à site spécifique de type I
* EC 3.1.21.4 : désoxyribonucléase à site spécifique de type II
* EC 3.1.21.5 : désoxyribonucléase à site spécifique de type III
* EC 3.1.21.6 : endodésoxyribonucléase à préférence CC
* EC 3.1.21.7 : désoxyribonucléase V

#### EC 3.1.22 : Endodésoxyribonucléases productrices de 3'-phosphomonoesters

* EC 3.1.22.1 : désoxyribonucléase II
* EC 3.1.22.2 : désoxyribonucléase K1 (Aspergillus)
* EC 3.1.22.3 : supprimée (maintenant EC 3.1.21.7)
* EC 3.1.22.4 : endodésoxyribonucléase spécifique de jonction
* EC 3.1.22.5 : désoxyribonucléase X

#### EC 3.1.23 & EC 3.1.24

Endodésoxyribonucléases spécifiques incluses aujourd'hui dans EC 3.1.21.3, EC 3.1.21.4 et EC 3.1.21.5.

#### EC 3.1.25 : Endodésoxyribonucléases spécifiques des bases abîmées

* EC 3.1.25.1 : endodésoxyribonucléase à dimère pyrimidine

#### EC 3.1.26 : Endoribonucléases productrices de 5'-phosphomonoesters

* EC 3.1.26.1 : ribonucléase de Physarum polycephalum
* EC 3.1.26.2 : ribonucléase alpha
* EC 3.1.26.3 : ribonucléase III
* EC 3.1.26.4 : ribonucléase H de thymus de veau
* EC 3.1.26.5 : ribonucléase P
* EC 3.1.26.6 : ribonucléase IV
* EC 3.1.26.7 : ribonucléase P4
* EC 3.1.26.8 : ribonucléase M5
* EC 3.1.26.9 : ribonucléase poly-U-spécifique
* EC 3.1.26.10 : ribonucléase IX
* EC 3.1.26.11 : tRNase Z
* EC 3.1.26.12 : ribonucléase E
* EC 3.1.26.13 : ribonucléase H rétrovirale

#### EC 3.1.27 : Endoribonucléases productrices de 3'-phosphomonoesters

* EC 3.1.27.1 : ribonucléase T$_2$
* EC 3.1.27.2 : ribonucléase de Bacillus subtilis
* EC 3.1.27.3 : ribonucléase T$_1$
* EC 3.1.27.4 : ribonucléase U$_2$
* EC 3.1.27.5 : ribonucléase pancréatique
* EC 3.1.27.6 : ribonucléase de Enterobacter
* EC 3.1.27.7 : ribonucléase F
* EC 3.1.27.8 : ribonucléase V
* EC 3.1.27.9 : endonucléase à intron ARN de transfert
* EC 3.1.27.10 : endonucléase à ARN ribosomique

#### EC 3.1.30 : Endoribonucléases actives à la fois sur l'ARN et sur l'ADN et productrices de 5'-phosphomonoesters

* EC 3.1.30.1 : nucléase S$_1$ de Aspergillus
* EC 3.1.30.2 : nucléase de Serratia marcescens

#### EC 3.1.31 : Endoribonucléases actives à la fois sur l'ARN et sur l'ADN et productrices de 3'-phosphomonoesters

* EC 3.1.31.1 : nucléase micrococcale

### Groupe EC3.2 (glycosylases)
#### EC 3.2.1 : Glycosidases (enzymes agissant autant sur les liaisons O-glycosidiques que sur les liaisons S-glycosidiques)

* EC 3.2.1.1 : α-amylase
* EC 3.2.1.2 : β-amylase
* EC 3.2.1.3 : glucane 1,4-α-glucosidase
* EC 3.2.1.4 : cellulase
* EC 3.2.1.5 : supprimée
* EC 3.2.1.6 : endo-1,3(4)-β-glucanase
* EC 3.2.1.7 : inulinase
* EC 3.2.1.8 : endo-1,4-β-xylanase
* EC 3.2.1.9 : supprimée
* EC 3.2.1.10 : oligo-1,6-glucosidase
* EC 3.2.1.11 : dextranase
* EC 3.2.1.12 : supprimée (incluse dans EC 3.2.1.54)
* EC 3.2.1.13 : supprimée (incluse dans EC 3.2.1.54)
* EC 3.2.1.14 : chitinase
* EC 3.2.1.15 : polygalacturonase
* EC 3.2.1.16 : supprimée
* EC 3.2.1.17 : lysozyme
* EC 3.2.1.18 : exo-α-sialidase
* EC 3.2.1.19 : supprimée
* EC 3.2.1.20 : α-glucosidase
* EC 3.2.1.21 : β-glucosidase
* EC 3.2.1.22 : α-galactosidase
* EC 3.2.1.23 : β-galactosidase
* EC 3.2.1.24 : α-mannosidase
* EC 3.2.1.25 : β-mannosidase
* EC 3.2.1.26 : β-fructofuranosidase
* EC 3.2.1.27 : supprimée
* EC 3.2.1.28 : α,α-tréhalase
* EC 3.2.1.29 : supprimée (incluse dans EC 3.2.1.52)
* EC 3.2.1.30 : supprimée (incluse dans EC 3.2.1.52)
* EC 3.2.1.31 : β-glucuronidase
* EC 3.2.1.32 : xylane endo-1,3-β-xylosidase
* EC 3.2.1.33 : amylo-1,6-glucosidase
* EC 3.2.1.34 : supprimée (incluse dans EC 3.2.1.35)
* EC 3.2.1.35 : hyaluronoglucosaminidase
* EC 3.2.1.36 : hyaluronoglucuronidase
* EC 3.2.1.37 : xylane 1,4-β-xylosidase
* EC 3.2.1.38 : β-D-fucosidase
* EC 3.2.1.39 : glucane endo-1,3-β-D-glucosidase
* EC 3.2.1.40 : α-L-rhamnosidase
* EC 3.2.1.41 : pullulanase
* EC 3.2.1.42 : GDP-glucosidase
* EC 3.2.1.43 : β-L-rhamnosidase
* EC 3.2.1.44 : fucoidanase
* EC 3.2.1.45 : glucosylcéramidase
* EC 3.2.1.46 : galactosylcéramidase
* EC 3.2.1.47 : galactosylgalactosylglucosylcéramidase
* EC 3.2.1.48 : sucrose α-glucosidase
* EC 3.2.1.49 : α-N-acétylgalactosaminidase
* EC 3.2.1.50 : α-N-acétylglucosaminidase
* EC 3.2.1.51 : α-L-fucosidase
* EC 3.2.1.52 : β-L-N-acétylhexosaminidase
* EC 3.2.1.53 : β-N-acétylgalactosaminidase
* EC 3.2.1.54 : cyclomaltodextrinase
* EC 3.2.1.55 : α-N-arabinofuranosidase
* EC 3.2.1.56 : glucuronosyl-disulfoglucosamine glucuronidase
* EC 3.2.1.57 : isopullulanase
* EC 3.2.1.58 : glucane 1,3-β-glucosidase
* EC 3.2.1.59 : glucane endo-1,3-α-glucosidase
* EC 3.2.1.60 : glucane 1,4-α-maltotétraohydrolase
* EC 3.2.1.61 : mycodextranase
* EC 3.2.1.62 : glycosylcéramidase
* EC 3.2.1.63 : 1,2-α-L-fucosidase
* EC 3.2.1.64 : 2,6-β-fructane 6-lévanbiohydrolase
* EC 3.2.1.65 : lévanase
* EC 3.2.1.66 : quercitrinase
* EC 3.2.1.67 : galacturane 1,4-α-galacturonidase
* EC 3.2.1.68 : isoamylase
* EC 3.2.1.69 : supprimée (incluse dans EC 3.2.1.41)
* EC 3.2.1.70 : glucane 1,6-α-glucosidase
* EC 3.2.1.71 : glucane endo-1,2-β-glucosidase
* EC 3.2.1.72 : xylane 1,3-β-xylosidase
* EC 3.2.1.73 : lichéninase
* EC 3.2.1.74 : glucane 1,4-β-glucosidase
* EC 3.2.1.75 : glucane endo-1,6-β-glucosidase
* EC 3.2.1.76 : L-iduronidase
* EC 3.2.1.77 : mannane 1,2-(1,3)-α-mannosidase
* EC 3.2.1.78 : mannane endo-1,4-β-mannosidase
* EC 3.2.1.79 : supprimée (incluse dans EC 3.2.1.55)
* EC 3.2.1.80 : fructane β-fructosidase
* EC 3.2.1.81 : β-agarase
* EC 3.2.1.82 : exo-poly-α-galacturonosidase
* EC 3.2.1.83 : κ-carragéenase
* EC 3.2.1.84 : glucane 1,3-α-glucosidase
* EC 3.2.1.85 : 6-phospho-β-galactosidase
* EC 3.2.1.86 : 6-phospho-β-glucosidase
* EC 3.2.1.87 : polysaccharide encapsulé endo-1,3-α-galactosidase
* EC 3.2.1.88 : β-L-arabinosidase
* EC 3.2.1.89 : arabinogalactane endo-1,4-β-galactosidase
* EC 3.2.1.90 : supprimée (insuffisamment caractérisée)
* EC 3.2.1.91 : cellulose 1,4-β-cellobiosidase
* EC 3.2.1.92 : peptidoglycane β-N-acétylmuramidase
* EC 3.2.1.93 : α,α-phosphotréhalase
* EC 3.2.1.94 : glucane 1,6-α-isomaltosidase
* EC 3.2.1.95 : dextrane 1,6-α-isomaltotriosidase
* EC 3.2.1.96 : mannosyl-glycoprotéine endo-β-N-acétylglucosaminidase
* EC 3.2.1.97 : glycopeptide α-N-acétylgalactosaminidase
* EC 3.2.1.98 : glucane 1,4-α-maltohexaosidase
* EC 3.2.1.99 : arabinane endo-1,5-α-L-arabinosidase
* EC 3.2.1.100 : mannane 1,4-mannobiosidase
* EC 3.2.1.101 : mannane endo-1,6-α-mannosidase
* EC 3.2.1.102 : substance du groupe sanguin endo-1,4-β-galactosidase
* EC 3.2.1.103 : kératane-sulfate endo-1,4-β-galactosidase
* EC 3.2.1.104 : stéryl-β-glucosidase
* EC 3.2.1.105 : strictosidine β-glucosidase
* EC 3.2.1.106 : mannosyl-oligosaccharide glucosidase
* EC 3.2.1.107 : protéine-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase
* EC 3.2.1.108 : lactase
* EC 3.2.1.109 : endogalactosaminidase
* EC 3.2.1.110 : supprimée (identique à EC 3.2.1.97)
* EC 3.2.1.111 : 1,3-α-L-fucosidase
* EC 3.2.1.112 : 2-désoxyglucosidase
* EC 3.2.1.113 : mannosyl-oligosaccharide 1,2-α-mannosidase
* EC 3.2.1.114 : mannosyl-oligosaccharide 1,3-1,6-α-mannosidase
* EC 3.2.1.115 : dextrane ramifié exo-1,2-α-glucosidase
* EC 3.2.1.116 : glucane 1,4-α-maltotriohydrolase
* EC 3.2.1.117 : amygdaline β-glucosidase
* EC 3.2.1.118 : prunasine β-glucosidase
* EC 3.2.1.119 : vicianine β-glucosidase
* EC 3.2.1.120 : oligoxyloglucane β-glycosidase
* EC 3.2.1.121 : polymannuronate-hydrolase
* EC 3.2.1.122 : maltose-6'-phosphate glucosidase
* EC 3.2.1.123 : endoglycosylcéramidase
* EC 3.2.1.124 : 3-désoxy-2-octulosonidase
* EC 3.2.1.125 : raucaffricine β-glucosidase
* EC 3.2.1.126 : coniférine β-glucosidase
* EC 3.2.1.127 : 1,6-α-L-fucosidase
* EC 3.2.1.128 : glycyrrhizinate β-glucuronidase
* EC 3.2.1.129 : endo-α-sialidase
* EC 3.2.1.130 : glycoprotéine endo-α-1,2-mannosidase
* EC 3.2.1.131 : xylane α-1,2-glucuronosidase
* EC 3.2.1.132 : chitosanase
* EC 3.2.1.133 : glucane 1,4-α-maltohydrolase
* EC 3.2.1.134 : difructose-anhydride synthase
* EC 3.2.1.135 : néopullulanase
* EC 3.2.1.136 : glucuronoarabinoxylane endo-1,4-β-xylanase
* EC 3.2.1.137 : mannane exo-1,2-1,6-α-mannosidase
* EC 3.2.1.138 : reportée à 4.2.2.15
* EC 3.2.1.139 : α-glucuronidase
* EC 3.2.1.140 : lacto-N-biosidase
* EC 3.2.1.141 : 4-α-D-((1→4)-α-D-glucano)tréhalose tréhalohydrolase
* EC 3.2.1.142 : dextrinase limite
* EC 3.2.1.143 : poly(ADP-ribose) glycohydrolase
* EC 3.2.1.144 : 3-désoxyoctulosonase
* EC 3.2.1.145 : galactane 1,3-β-galactosidase
* EC 3.2.1.146 : β-galactofuranosidase
* EC 3.2.1.147 : thioglucosidase
* EC 3.2.1.148 : reportée à EC 4.4.1.21
* EC 3.2.1.149 : β-primevèrosidase
* EC 3.2.1.150 : oligoxyloglucan reducing-end-specific cellobiohydrolase
* EC 3.2.1.151 : xyloglucane endo-β-1,4-glucanase spécifique
* EC 3.2.1.152 : mannosylglycoprotéine endo-β-mannosidase
* EC 3.2.1.153 : fructane β-(2,1)-fructosidase
* EC 3.2.1.154 : fructane β-(2,6)-fructosidase
* EC 3.2.1.155 : xyloglucane exo-β-1,4-glucanase spécifique
* EC 3.2.1.156 : oligosaccharide reducing-end xylanase
* EC 3.2.1.157 : ι-carragéenase
* EC 3.2.1.158 : α-agarase
* EC 3.2.1.159 : α-néoagaro-oligosaccharide hydrolase
* EC 3.2.1.160 : vide
* EC 3.2.1.161 : β-apiosyl-β-glucosidase
* EC 3.2.1.162 : λ-carragéenase
* EC 3.2.1.163 : 1,6-α-D-mannosidase
* EC 3.2.1.164 : galactane endo-1,6-β-galactosidase
* EC 3.2.1.165 : exo-1,4-β-D-glucosaminidase

#### EC 3.2.2 : Hydrolases spécifiques des liaisons N-glycosidiques

* EC 3.2.2.1 : purine-nucléosidase
* EC 3.2.2.2 : inosine-nucléosidase
* EC 3.2.2.3 : uridine-nucléosidase
* EC 3.2.2.4 : AMP-nucléosidase
* EC 3.2.2.5 : NAD$^+$-nucléosidase
* EC 3.2.2.6 : NAD(P)$^+$-nucléosidase
* EC 3.2.2.7 : adénosine-nucléosidase
* EC 3.2.2.8 : ribosylpyrimidine-nucléosidase
* EC 3.2.2.9 : adénosylhomocystéine-nucléosidase
* EC 3.2.2.10 : pyrimidine-5'-nucléotide-nucléosidase
* EC 3.2.2.11 : β-aspartyl-N-acétylglucosaminidase
* EC 3.2.2.12 : inosinate-nucléosidase
* EC 3.2.2.13 : 1-méthyladénosine-nucléosidase
* EC 3.2.2.14 : NMN-nucléosidase
* EC 3.2.2.15 : ADN-désoxyinosine-glycosylase
* EC 3.2.2.16 : méthylthioadénosine-nucléosidase
* EC 3.2.2.17 : désoxyribodipyrimidine-endonucléosidase
* EC 3.2.2.18 : supprimée (incluse dans EC 3.5.1.52)
* EC 3.2.2.19 : ADP-ribosylarginine-hydrolase
* EC 3.2.2.20 : ADN-3-méthyladénine-glycosylase I
* EC 3.2.2.21 : ADN-3-méthyladénine-glycosylase II
* EC 3.2.2.22 : ARN ribosomique N-glycosylase
* EC 3.2.2.23 : ADN-formamidopyrimidine-glycosylase
* EC 3.2.2.24 : ADP-ribosyl-(diazote réductase)-hydrolase
* EC 3.2.2.25 : N-méthyl-nucléosidase
* EC 3.2.2.26 : futalosine-hydrolase
* EC 3.2.2.27 : uracil-ADN-glycosylase
* EC 3.2.2.28 : uracil-ADN double brin glycosylase
* EC 3.2.2.29 : thymine-ADN-glycosylase

#### EC 3.2.3 : Hydrolases spécifiques des liaisons S-glycosidiques

Groupe vide : la seule enzyme (EC 3.2.3.1) a été déplacée vers EC 3.2.1.147.

### Groupe EC3.3 (éther-hydrolases)
#### EC 3.3.1 : Hydrolases spécifiques des liaisons thioéther et des trialkylsulfoniums

* EC 3.3.1.1 : adénosylhomocystéinase
* EC 3.3.1.2 : adénosylméthionine-hydrolase
* EC 3.3.1.3 : déplacée vers EC 3.2.1.148

#### EC 3.3.2 : Autres éther-hydrolases

* EC 3.3.2.1 : isochorismatase
* EC 3.3.2.2 : alkénylglycérophosphocholine-hydrolase
* EC 3.3.2.3 : transférée vers EC 3.3.2.9 et EC 3.3.2.10
* EC 3.3.2.4 : trans-époxysuccinate-hydrolase
* EC 3.3.2.5 : alkénylglycérophosphoéthanolamine-hydrolase
* EC 3.3.2.6 : leukotriène-A$_4$ hydrolase
* EC 3.3.2.7 : hépoxyline-époxyde-hydrolase
* EC 3.3.2.8 : limonène-1,2-époxyde-hydrolase
* EC 3.3.2.9 : époxyde-hydrolase microsomale
* EC 3.3.2.10 : époxyde-hydrolase soluble
* EC 3.3.2.11 : cholestérol-5,6-oxyde-hydrolase

### Groupe EC3.4 (peptidases)

Les sous-groupes EC3.4.1 à EC3.4.4 ont été supprimés et les enzymes autrefois répertoriées dans ces groupes réparties dans les groupes nouvellement créés (EC3.4.11 à EC3.4.24). La liste qui suit donne la correspondance entre l'ancienne numérotation et la nouvelle.
* EC 3.4.1.1 → EC 3.4.11.1
* EC 3.4.1.2 → EC 3.4.11.2
* EC 3.4.1.3 → EC 3.4.11.4
* EC 3.4.1.4 → EC 3.4.11.5
* EC 3.4.2.1 → EC 3.4.17.1
* EC 3.4.2.2 → EC 3.4.17.2
* EC 3.4.2.3 → EC 3.4.17.4
* EC 3.4.3.1 → EC 3.4.13.18
* EC 3.4.3.2 → EC 3.4.13.18
* EC 3.4.3.3 → EC 3.4.13.3
* EC 3.4.3.4 → EC 3.4.13.5
* EC 3.4.3.5 → EC 3.4.13.6
* EC 3.4.3.6 → EC 3.4.13.8
* EC 3.4.3.7 → EC 3.4.13.9
* EC 3.4.4.1 → EC 3.4.23.1
* EC 3.4.4.2 → EC 3.4.23.2
* EC 3.4.4.3 → EC 3.4.23.4
* EC 3.4.4.4 → EC 3.4.21.4
* EC 3.4.4.5 → EC 3.4.21.1
* EC 3.4.4.6 → EC 3.4.21.1
* EC 3.4.4.7 → EC 3.4.21.36 et EC 3.4.21.37
* EC 3.4.4.8 → EC 3.4.21.9
* EC 3.4.4.9 → EC 3.4.14.1
* EC 3.4.4.10 → EC 3.4.22.2
* EC 3.4.4.11 → EC 3.4.22.6
* EC 3.4.4.12 → EC 3.4.22.3
* EC 3.4.4.13 → EC 3.4.21.5
* EC 3.4.4.14 → EC 3.4.21.7
* EC 3.4.4.15 → EC 3.4.23.15
* EC 3.4.4.16 → EC 3.4.21.62 à EC 3.4.21.67
* EC 3.4.4.17 → EC 3.4.23.20 à EC 3.4.23.30
* EC 3.4.4.18 → EC 3.4.22.10
* EC 3.4.4.19 → EC 3.4.24.3
* EC 3.4.4.20 → EC 3.4.22.8
* EC 3.4.4.21 → EC 3.4.21.34
* EC 3.4.4.22 → EC 3.4.23.3
* EC 3.4.4.23 → EC 3.4.23.5
* EC 3.4.4.24 → EC 3.4.22.32 et EC 3.4.22.33
* EC 3.4.4.25 : supprimée

#### EC 3.4.11 : Aminopeptidases

* EC 3.4.11.1 : leucyl-aminopeptidase
* EC 3.4.11.2 : alanyl-aminopeptidase membranaire
* EC 3.4.11.3 : cystinyl-aminopeptidase
* EC 3.4.11.4 : tripeptide-aminopeptidase
* EC 3.4.11.5 : prolyl-aminopeptidase
* EC 3.4.11.6 : arginyl-aminopeptidase
* EC 3.4.11.7 : glutamyl-aminopeptidase
* EC 3.4.11.8 → EC 3.4.19.3
* EC 3.4.11.9 : Xaa-Pro-aminopeptidase (Xaa = acide aminé protéinogène, Pro = proline)
* EC 3.4.11.10 : leucyl-aminopeptidase bactérienne
* EC 3.4.11.11 : supprimée
* EC 3.4.11.12 : supprimée
* EC 3.4.11.13 : aminopeptidase clostridiale
* EC 3.4.11.14 : alanyl-aminopeptidase cytosolique
* EC 3.4.11.15 : lysyl-aminopeptidase
* EC 3.4.11.16 : Xaa-Trp-aminopeptidase (Xaa = acide aminé protéinogène, Trp = tryptophane)
* EC 3.4.11.17 : tryptophanyl-aminopeptidase
* EC 3.4.11.18 : méthionyl-aminopeptidase
* EC 3.4.11.19 : aminopeptidase D-stéréospécifique
* EC 3.4.11.20 : aminopeptidase Ey
* EC 3.4.11.21 : aspartyl-aminopeptidase
* EC 3.4.11.22 : aminopeptidase I
* EC 3.4.11.23 : aminopeptidase pepB
* EC 3.4.11.24 : aminopeptidase S

#### EC 3.4.12

Sous-groupe aujourd'hui disparu. La liste suivante donne la correspondance entre les anciens numéros et les nouveaux.
* EC 3.4.12.1 → EC 3.4.16.1
* EC 3.4.12.2 → EC 3.4.17.1
* EC 3.4.12.3 → EC 3.4.17.2
* EC 3.4.12.4 → EC 3.4.16.2
* EC 3.4.12.5 → EC 3.4.19.10
* EC 3.4.12.6 → EC 3.4.17.8
* EC 3.4.12.7 → EC 3.4.17.3
* EC 3.4.12.8 → EC 3.4.17.4
* EC 3.4.12.9 : supprimée
* EC 3.4.12.10 → EC 3.4.19.9
* EC 3.4.12.11 → EC 3.4.17.6
* EC 3.4.12.12 → EC 3.4.16.1
* EC 3.4.12.13 : supprimée

#### EC 3.4.13 : Dipeptidases

* EC 3.4.13.1 → EC 3.4.13.18
* EC 3.4.13.2 → EC 3.4.13.18
* EC 3.4.13.3 : Xaa-His-dipeptidase
* EC 3.4.13.4 : Xaa-Arg-dipeptidase
* EC 3.4.13.5 : Xaa-méthyl-His-dipeptidase
* EC 3.4.13.6 → EC 3.4.11.2
* EC 3.4.13.7 : Glu-Glu-dipeptidase
* EC 3.4.13.8 → EC 3.4.17.21
* EC 3.4.13.9 : Xaa-Pro-dipeptidase
* EC 3.4.13.10 → EC 3.4.19.5
* EC 3.4.13.11 : supprimée (incluse dans EC 3.4.13.18)
* EC 3.4.13.12 : Met-Xaa-dipeptidase
* EC 3.4.13.13 : supprimée (incluse dans EC 3.4.13.3)
* EC 3.4.13.14 : supprimée
* EC 3.4.13.15 : supprimée (incluse dans EC 3.4.13.18)
* EC 3.4.13.16 : supprimée
* EC 3.4.13.17 : dipeptidase non stéréospécifique
* EC 3.4.13.18 : dipeptidase cytosolique non spécifique
* EC 3.4.13.19 : dipeptidase membranaire
* EC 3.4.13.20 : β-Ala-His-dipeptidase
* EC 3.4.13.21 : dipeptidase E
* EC 3.4.13.22 : D-Ala-D-Ala dipeptidase

#### EC 3.4.14 : Dipeptidyl-peptidases et tripeptidyl-peptidases

* EC 3.4.14.1 : dipeptidyl-peptidase I
* EC 3.4.14.2 : dipeptidyl-peptidase II
* EC 3.4.14.3 → EC 3.4.19.1
* EC 3.4.14.4 : dipeptidyl-peptidase III
* EC 3.4.14.5 : dipeptidyl-peptidase IV
* EC 3.4.14.6 : dipeptidyl-dipeptidase
* EC 3.4.14.7 : supprimée
* EC 3.4.14.8 → EC 3.4.14.9 et EC 3.4.14.10
* EC 3.4.14.9 : tripeptidyl-peptidase I
* EC 3.4.14.10 : tripeptidyl-peptidase II
* EC 3.4.14.11 : Xaa-Pro-dipeptidyl-peptidase
* EC 3.4.14.12 : prolyltripeptidyl-aminopeptidase
* EC 3.4.14.12 : γ-D-glutamyl-L-lysine dipeptidyl-peptidase.

#### EC 3.4.15 : Peptidyl-dipeptidases

* EC 3.4.15.1 : peptidyl-dipeptidase A
* EC 3.4.15.2 → EC 3.4.19.2
* EC 3.4.15.3 : supprimée (incluse dans EC 3.4.15.5)
* EC 3.4.15.4 : peptidyl-dipeptidase B
* EC 3.4.15.5 : peptidyl-dipeptidase Dcp
* EC 3.4.15.6 : cyanophycinase

#### EC 3.4.16 : Carboxypeptidases de type sérine

* EC 3.4.16.1 : supprimée (incluse dans EC 3.4.16.5 et EC 3.4.16.6)
* EC 3.4.16.2 : Pro-Xaa-carboxypeptidase lysosomale
* EC 3.4.16.3 : supprimée (incluse dans EC 3.4.16.5)
* EC 3.4.16.4 : D-Ala-D-Ala carboxypeptidase de type sérine
* EC 3.4.16.5 : carboxypeptidase C
* EC 3.4.16.6 : carboxypeptidase D

#### EC 3.4.17 : Métallocarboxypeptidases

* EC 3.4.17.1 : carboxypeptidase A
* EC 3.4.17.2 : carboxypeptidase B
* EC 3.4.17.3 : lysine-carboxypeptidase
* EC 3.4.17.4 : Gly-Xaa-carboxypeptidase
* EC 3.4.17.5 : supprimée
* EC 3.4.17.6 : alanine-carboxypeptidase
* EC 3.4.17.7 → EC 3.4.19.10
* EC 3.4.17.8 : muramoylpentapeptide-carboxypeptidase
* EC 3.4.17.9 : supprimée (incluse dans EC 3.4.17.4)
* EC 3.4.17.10 : carboxypeptidase E
* EC 3.4.17.11 : glutamate-carboxypeptidase
* EC 3.4.17.12 : carboxypeptidase M
* EC 3.4.17.13 : muramoyltétrapeptide-carboxypeptidase
* EC 3.4.17.14 : zinc-D-Ala-D-Ala-carboxypeptidase
* EC 3.4.17.15 : carboxypeptidase A2
* EC 3.4.17.16 : Pro-Xaa-carboxypeptidase membranaire
* EC 3.4.17.17 : tubulinyl-Tyr-carboxypeptidase
* EC 3.4.17.18 : carboxypeptidase T
* EC 3.4.17.19 : carboxypeptidase Taq
* EC 3.4.17.20 : carboxypeptidase U
* EC 3.4.17.21 : glutamate-carboxypeptidase II
* EC 3.4.17.22 : métallocarboxypeptidase D
* EC 3.4.17.23 : angiotensine-enzyme de conversion 2

#### EC 3.4.18 : Carboxypeptidases de type cystéine

* EC 3.4.18.1 : cathepsine X

#### EC 3.4.19 : Oméga-peptidases (enzymes coupant au niveau du dernier acide aminé d'une chaîne peptidique)

* EC 3.4.19.1 : acylaminoacyl-peptidase
* EC 3.4.19.2 : peptidyl-glycinamidase
* EC 3.4.19.3 : pyroglutamyl-peptidase I
* EC 3.4.19.4 : supprimée
* EC 3.4.19.5 : β-aspartyl-peptidase
* EC 3.4.19.6 : pyroglutamyl-peptidase II
* EC 3.4.19.7 : N-formylméthionyl-peptidase
* EC 3.4.19.8 → EC 3.4.17.21
* EC 3.4.19.9 : γ-glutamyl-hydrolase
* EC 3.4.19.10 → EC 3.5.1.28
* EC 3.4.19.11 : γ-D-glutamyl-méso-diaminopimélate-peptidase I
* EC 3.4.19.12 : ubiquitinyl-hydrolase 1

#### EC 3.4.21 : Sérine-endopeptidases

* EC 3.4.21.1 : chymotrypsine
* EC 3.4.21.2 : chymotrypsine C
* EC 3.4.21.3 : métridine
* EC 3.4.21.4 : trypsine
* EC 3.4.21.5 : thrombine
* EC 3.4.21.6 : facteur de coagulation Xa
* EC 3.4.21.7 : plasmine
* EC 3.4.21.8 → EC 3.4.21.34 et EC 3.4.21.35
* EC 3.4.21.9 : entéropeptidase
* EC 3.4.21.10 : acrosine
* EC 3.4.21.11 → EC 3.4.21.36 et EC 3.4.21.37
* EC 3.4.21.12 : endopeptidase α-lytique
* EC 3.4.21.13 → EC 3.4.16.1
* EC 3.4.21.14 → EC 3.4.21.62 à EC 3.4.21.65, et EC 3.4.21.67
* EC 3.4.21.15 → EC 3.4.21.63
* EC 3.4.21.16 : supprimée
* EC 3.4.21.17 : supprimée
* EC 3.4.21.18 : supprimée
* EC 3.4.21.19 : glutamyl-endopeptidase
* EC 3.4.21.20 : cathepsine G
* EC 3.4.21.21 : facteur de coagulation VIIa
* EC 3.4.21.22 : facteur de coagulation IXa
* EC 3.4.21.23 : supprimée
* EC 3.4.21.24 : supprimée
* EC 3.4.21.25 : cucumisine
* EC 3.4.21.26 : prolyl-oligopeptidase
* EC 3.4.21.27 : facteur de coagulation XIa
* EC 3.4.21.28 : supprimée (incluse dans EC 3.4.21.74)
* EC 3.4.21.29 : supprimée (incluse dans EC 3.4.21.74)
* EC 3.4.21.30 : supprimée (incluse dans EC 3.4.21.74)
* EC 3.4.21.31 → EC 3.4.21.68 et EC 3.4.21.73
* EC 3.4.21.32 : brachyurine
* EC 3.4.21.33 : supprimée
* EC 3.4.21.34 : kallikréine plasmatique
* EC 3.4.21.35 : kallikréine tissulaire
* EC 3.4.21.36 : élastase pancréatique
* EC 3.4.21.37 : élastase leucocytaire
* EC 3.4.21.38 : facteur de coagulation XIIa
* EC 3.4.21.39 : chymase
* EC 3.4.21.40 : supprimée
* EC 3.4.21.41 : sous-composant C du complément
* EC 3.4.21.42 : sous-composant C du complément
* EC 3.4.21.43 : classical-complement-pathway C3/C5 convertase
* EC 3.4.21.44 : supprimée (incluse dans EC 3.4.21.43)
* EC 3.4.21.45 : facteur I du complément
* EC 3.4.21.46 : facteur D du complément
* EC 3.4.21.47 : alternative-complement-pathway C3/C5 convertase
* EC 3.4.21.48 : cérévisine
* EC 3.4.21.49 : hypodermine C
* EC 3.4.21.50 : lysyl-endopeptidase
* EC 3.4.21.51 : supprimée
* EC 3.4.21.52 : supprimée
* EC 3.4.21.53 : endopeptidase La
* EC 3.4.21.54 : γ-rénine
* EC 3.4.21.55 : vénombine AB
* EC 3.4.21.56 : supprimée
* EC 3.4.21.57 : leucyl-endopeptidase
* EC 3.4.21.58 : supprimée
* EC 3.4.21.59 : tryptase
* EC 3.4.21.60 : scutélarine
* EC 3.4.21.61 : kexine
* EC 3.4.21.62 : subtilisine
* EC 3.4.21.63 : oryzine
* EC 3.4.21.64 : peptidase K
* EC 3.4.21.65 : thermomycoline
* EC 3.4.21.66 : thermitase
* EC 3.4.21.67 : endopeptidase So
* EC 3.4.21.68 : activateur du t-plasminogène
* EC 3.4.21.69 : protéine C (activée)
* EC 3.4.21.70 : endopeptidase E pancréatique
* EC 3.4.21.71 : élastase II pancréatique
* EC 3.4.21.72 : sérine-endopeptidase IgA-spécifique
* EC 3.4.21.73 : activateur du u-plasminogène
* EC 3.4.21.74 : vénombine A
* EC 3.4.21.75 : furine
* EC 3.4.21.76 : myéloblastine
* EC 3.4.21.77 : séménogélase
* EC 3.4.21.78 : granzyme A
* EC 3.4.21.79 : granzyme B
* EC 3.4.21.80 : streptogrisine A
* EC 3.4.21.81 : streptogrisine B
* EC 3.4.21.82 : glutamyl-endopeptidase II
* EC 3.4.21.83 : oligopeptidase B
* EC 3.4.21.84 : limulus clotting factor
* EC 3.4.21.85 : limulus clotting factor
* EC 3.4.21.86 : limulus clotting enzyme
* EC 3.4.21.87 → EC 3.4.23.49
* EC 3.4.21.88 : répresseur LexA
* EC 3.4.21.89 : peptidase I signal
* EC 3.4.21.90 : togavirine
* EC 3.4.21.91 : flavivirine
* EC 3.4.21.92 : endopeptidase Clp
* EC 3.4.21.93 : proprotéine-convertase 1
* EC 3.4.21.94 : proprotéine-convertase 2
* EC 3.4.21.95 : activateur du facteur V de venin de serpent
* EC 3.4.21.96 : lactocépine
* EC 3.4.21.97 : assembline
* EC 3.4.21.98 : hépacivirine
* EC 3.4.21.99 : spermosine
* EC 3.4.21.100 : sédolisine
* EC 3.4.21.101 : xanthomonalisine
* EC 3.4.21.102 : peptidase agissant sur le C-terminal
* EC 3.4.21.103 : physarolisine
* EC 3.4.21.104 : mannan-binding lectin-associated serine protease-2
* EC 3.4.21.105 : rhomboïde-protéase
* EC 3.4.21.106 : hepsine
* EC 3.4.21.107 : peptidase Do
* EC 3.4.21.108 : HtrA2 peptidase
* EC 3.4.21.109 : matriptase
* EC 3.4.21.110 : C5a peptidase
* EC 3.4.21.111 : aqualysine 1
* EC 3.4.21.112 : site-1 protéase
* EC 3.4.21.113 : pestivirus NS3 polyprotéine peptidase
* EC 3.4.21.114 : artérivirus chevalin sérine-peptidase
* EC 3.4.21.115 : peptidase du birnavirus Vp4 de la nécrose pancréatique infectieuse
* EC 3.4.21.116 : SpoIVB peptidase
* EC 3.4.21.117 : enzyme chymotryptique du stratum corneum
* EC 3.4.21.118 : kallikréine 8
* EC 3.4.21.119 : kallikréine 13
* EC 3.4.21.120 : oviductine

#### EC 3.4.22 : Cystéine-endopeptidases

* EC 3.4.22.1 : cathepsine B
* EC 3.4.22.2 : papaïne
* EC 3.4.22.3 : ficaïne
* EC 3.4.22.4 → EC 3.4.22.32 et EC 3.4.22.33
* EC 3.4.22.5 → EC 3.4.22.33
* EC 3.4.22.6 : chymopapaïne
* EC 3.4.22.7 : asclépaïne
* EC 3.4.22.8 : clostripaïne
* EC 3.4.22.9 → EC 3.4.21.48
* EC 3.4.22.10 : streptopaïne
* EC 3.4.22.11 → EC 3.4.24.56
* EC 3.4.22.12 → EC 3.4.19.9
* EC 3.4.22.13 : supprimée
* EC 3.4.22.14 : actinidaïne
* EC 3.4.22.15 : cathepsine L
* EC 3.4.22.16 : cathepsine H
* EC 3.4.22.17 → EC 3.4.22.52 et EC 3.4.22.53
* EC 3.4.22.18 : supprimée (incluse dans EC 3.4.21.26)
* EC 3.4.22.19 : supprimée (incluse dans EC 3.4.24.15)
* EC 3.4.22.20 : supprimée
* EC 3.4.22.21 : supprimée (incluse dans EC 3.4.99.46)
* EC 3.4.22.22 → EC 3.4.24.37
* EC 3.4.22.23 : supprimée (incluse dans EC 3.4.21.61)
* EC 3.4.22.24 : cathepsine T
* EC 3.4.22.25 : glycyl-endopeptidase
* EC 3.4.22.26 : cancer procoagulant
* EC 3.4.22.27 : cathepsine S
* EC 3.4.22.28 : picornaïne 3C
* EC 3.4.22.29 : picornaïne 2A
* EC 3.4.22.30 : caricaïne
* EC 3.4.22.31 : ananaïne
* EC 3.4.22.32 : bromélaïne (de la tige d'ananas)
* EC 3.4.22.33 : bromélaïne (du fruit)
* EC 3.4.22.34 : légumaïne
* EC 3.4.22.35 : histolysaïne
* EC 3.4.22.36 : caspase 1
* EC 3.4.22.37 : gingipaïne R
* EC 3.4.22.38 : cathepsine K
* EC 3.4.22.39 : adénaïne
* EC 3.4.22.40 : bléomycine-hydrolase
* EC 3.4.22.41 : cathepsine F
* EC 3.4.22.42 : cathepsine O
* EC 3.4.22.43 : cathepsine V
* EC 3.4.22.44 : nuclear-inclusion-a endopeptidase
* EC 3.4.22.45 : helper-component proteinase
* EC 3.4.22.46 : L-peptidase
* EC 3.4.22.47 : gingipaïne K
* EC 3.4.22.48 : staphopaïne
* EC 3.4.22.49 : séparase
* EC 3.4.22.50 : V-cath endopeptidase
* EC 3.4.22.51 : cruzipaïne
* EC 3.4.22.52 : calpaïne-1
* EC 3.4.22.53 : calpaïne-2
* EC 3.4.22.54 : calpaïne-3
* EC 3.4.22.55 : caspase 2
* EC 3.4.22.56 : caspase 3
* EC 3.4.22.57 : caspase 4
* EC 3.4.22.58 : caspase 5
* EC 3.4.22.59 : caspase 6
* EC 3.4.22.60 : caspase 7
* EC 3.4.22.61 : caspase 8
* EC 3.4.22.62 : caspase 9
* EC 3.4.22.63 : caspase 10
* EC 3.4.22.64 : caspase 11
* EC 3.4.22.65 : peptidase 1 (de mite)
* EC 3.4.22.66 : calicivirine
* EC 3.4.22.67 : zingipaïne
* EC 3.4.22.68 : Ulp1 peptidase
* EC 3.4.22.69 : protéinase principale du coronavirus SARS
* EC 3.4.22.70 : sortase A
* EC 3.4.22.71 : sortase B

#### EC 3.4.23 : Aspartate-endopeptidases

* EC 3.4.23.1 : pepsine A
* EC 3.4.23.2 : pepsine B
* EC 3.4.23.3 : gastricsine
* EC 3.4.23.4 : chymosine
* EC 3.4.23.5 : cathepsine D
* EC 3.4.23.6 → EC 3.4.23.18 à EC 3.4.23.28, et EC 3.4.23.30
* EC 3.4.23.7 → EC 3.4.24.20
* EC 3.4.23.8 → EC 3.4.24.25
* EC 3.4.23.9 → EC 3.4.24.21
* EC 3.4.23.10 → EC 3.4.24.22
* EC 3.4.23.11 : supprimée
* EC 3.4.23.12 : népenthésine
* EC 3.4.23.13 : supprimée
* EC 3.4.23.14 : supprimée
* EC 3.4.23.15 : rénine
* EC 3.4.23.16 : rétropepsine de HIV-1
* EC 3.4.23.17 : enzyme de conversion de la pro-opiomélanocortine
* EC 3.4.23.18 : aspergillopepsine I
* EC 3.4.23.19 : aspergillopepsine II
* EC 3.4.23.20 : pénicillopepsine
* EC 3.4.23.21 : rhizopuspepsine
* EC 3.4.23.22 : endothiapepsine
* EC 3.4.23.23 : mucorpepsine
* EC 3.4.23.24 : candidapepsine
* EC 3.4.23.25 : saccharopepsine
* EC 3.4.23.26 : rhodotorulapepsine
* EC 3.4.23.27 → EC 3.4.21.103
* EC 3.4.23.28 : acrocylindropepsine
* EC 3.4.23.29 : polyporopepsine
* EC 3.4.23.30 : pycnoporopepsine
* EC 3.4.23.31 : scytalidopepsine A
* EC 3.4.23.32 : scytalidopepsine B
* EC 3.4.23.33 → EC 3.4.21.101
* EC 3.4.23.34 : cathepsine E
* EC 3.4.23.35 : barrierpepsine
* EC 3.4.23.36 : peptidase II signal
* EC 3.4.23.37 → EC 3.4.21.100
* EC 3.4.23.38 : plasmepsine I
* EC 3.4.23.39 : plasmepsine II
* EC 3.4.23.40 : phytepsine
* EC 3.4.23.41 : yapsine 1
* EC 3.4.23.42 : thermopsine
* EC 3.4.23.43 : prépiline-peptidase
* EC 3.4.23.44 : endopeptidase de nodavirus
* EC 3.4.23.45 : mémapsine 1
* EC 3.4.23.46 : mémapsine 2
* EC 3.4.23.47 : rétropepsine de HIV-2
* EC 3.4.23.48 : activateur Pla du plasminogène
* EC 3.4.23.49 : omptine
* EC 3.4.23.50 : endopeptidase du rétrovirus humain endogène K
* EC 3.4.23.51 : HycI peptidase

#### EC 3.4.24 : Métalloendopeptidases

* EC 3.4.24.1 : atrolysine A
* EC 3.4.24.2 : supprimée
* EC 3.4.24.3 : collagénase microbienne
* EC 3.4.24.4 → EC 3.4.24.25 à EC 3.4.24.32, EC 3.4.24.39 et EC 3.4.24.40
* EC 3.4.24.5 → EC 3.4.22.17 et EC 3.4.25.1
* EC 3.4.24.6 : leucolysine
* EC 3.4.24.7 : collagénase interstitielle
* EC 3.4.24.8 : supprimée (incluse dans EC 3.4.24.3)
* EC 3.4.24.9 : supprimée
* EC 3.4.24.10 : supprimée
* EC 3.4.24.11 : néprilysine
* EC 3.4.24.12 : envélysine
* EC 3.4.24.13 : métalloendopeptidase IgA-spécifique
* EC 3.4.24.14 : procollagène N-endopeptidase
* EC 3.4.24.15 : thimet oligopeptidase
* EC 3.4.24.16 : neurolysine
* EC 3.4.24.17 : stromélysine 1
* EC 3.4.24.18 : méprine A
* EC 3.4.24.19 : procollagène C-endopeptidase
* EC 3.4.24.20 : peptidyl-Lys métalloendopeptidase
* EC 3.4.24.21 : astacine
* EC 3.4.24.22 : stromélysine 2
* EC 3.4.24.23 : matrilysine
* EC 3.4.24.24 : gélatinase A
* EC 3.4.24.25 : vibriolysine
* EC 3.4.24.26 : pseudolysine
* EC 3.4.24.27 : thermolysine
* EC 3.4.24.28 : bacillolysine
* EC 3.4.24.29 : auréolysine
* EC 3.4.24.30 : coccolysine
* EC 3.4.24.31 : mycolysine
* EC 3.4.24.32 : métalloendopeptidase β-lytique
* EC 3.4.24.33 : peptidyl-Asp-métalloendopeptidase
* EC 3.4.24.34 : collagénase neutrophile
* EC 3.4.24.35 : gélatinase B
* EC 3.4.24.36 : leishmanolysine
* EC 3.4.24.37 : saccharolysine
* EC 3.4.24.38 : gamétolysine
* EC 3.4.24.39 : deutérolysine
* EC 3.4.24.40 : serralysine
* EC 3.4.24.41 : atrolysine B
* EC 3.4.24.42 : atrolysine C
* EC 3.4.24.43 : atroxase
* EC 3.4.24.44 : atrolysine E
* EC 3.4.24.45 : atrolysine F
* EC 3.4.24.46 : adamalysine
* EC 3.4.24.47 : horrilysine
* EC 3.4.24.48 : ruberlysine
* EC 3.4.24.49 : bothropasine
* EC 3.4.24.50 : bothrolysine
* EC 3.4.24.51 : ophiolysine
* EC 3.4.24.52 : trimérélysine I
* EC 3.4.24.53 : trimérélysine II
* EC 3.4.24.54 : mucrolysine
* EC 3.4.24.55 : pitrilysine
* EC 3.4.24.56 : insulysine
* EC 3.4.24.57 : O-sialoglycoprotéine-endopeptidase
* EC 3.4.24.58 : russellysine
* EC 3.4.24.59 : peptidase mitochondriale intermédiaire
* EC 3.4.24.60 : dactylysine
* EC 3.4.24.61 : nardilysine
* EC 3.4.24.62 : magnolysine
* EC 3.4.24.63 : méprine B
* EC 3.4.24.64 : peptidase à action mitochonfriale
* EC 3.4.24.65 : élastase de macrophage
* EC 3.4.24.66 : choriolysine L
* EC 3.4.24.67 : choriolysine H
* EC 3.4.24.68 : tentoxilysine
* EC 3.4.24.69 : bontoxilysine
* EC 3.4.24.70 : oligopeptidase A
* EC 3.4.24.71 : endothelin-converting enzyme
* EC 3.4.24.72 : fibrolase
* EC 3.4.24.73 : jararhagine
* EC 3.4.24.74 : fragilysine
* EC 3.4.24.75 : lysostaphine
* EC 3.4.24.76 : flavastacine
* EC 3.4.24.77 : snapalysine
* EC 3.4.24.78 : gpr endopeptidase
* EC 3.4.24.79 : pappalysine-1
* EC 3.4.24.80 : membrane-type matrix metalloproteinase-1
* EC 3.4.24.81 : ADAM10 endopeptidase
* EC 3.4.24.82 : ADAMTS-4 endopeptidase
* EC 3.4.24.83 : endopeptidase du facteur létal de l'anthrax
* EC 3.4.24.84 : Ste24 endopeptidase
* EC 3.4.24.85 : S2P endopeptidase
* EC 3.4.24.86 : ADAM 17 endopeptidase
* EC 3.4.24.87 : ADAMTS13 endopeptidase
* EC 3.4.24.88 : desampylase
* EC 3.4.24.89 : Pro-Pro endopeptidase.

#### EC 3.4.25 : Thréonine-endopeptidases

* EC 3.4.25.1 : complexe protéasome-endopeptidase
* EC 3.4.25.2 : HslU—HslV peptidase

#### EC 3.4.99 : Endopeptidases dont le mécanisme d'action est inconnu

Dans ce sous-groupe sont placées les enzymes dont on ne connaît pas encore le mécanisme d'action. Dès que celui-ci est connu, l'enzyme est reclassée. La liste ci-après donne la nouvelle nomenclature donnée aux enzymes en attente. Actuellement, cette liste ne contient aucune enzyme en attente.
* EC 3.4.99.1 → EC 3.4.23.28
* EC 3.4.99.2 : supprimée
* EC 3.4.99.3 : supprimée
* EC 3.4.99.4 → EC 3.4.23.12
* EC 3.4.99.5 → EC 3.4.24.3
* EC 3.4.99.6 → EC 3.4.24.21
* EC 3.4.99.7 : supprimée
* EC 3.4.99.8 : supprimée
* EC 3.4.99.9 : supprimée
* EC 3.4.99.10 → EC 3.4.24.56
* EC 3.4.99.11 : supprimée
* EC 3.4.99.12 : supprimée
* EC 3.4.99.13 → EC 3.4.24.32
* EC 3.4.99.14 : supprimée
* EC 3.4.99.15 : supprimée
* EC 3.4.99.16 : supprimée
* EC 3.4.99.17 : supprimée
* EC 3.4.99.18 : supprimée
* EC 3.4.99.19 → EC 3.4.23.15
* EC 3.4.99.20 : supprimée
* EC 3.4.99.21 : supprimée
* EC 3.4.99.22 → EC 3.4.24.29
* EC 3.4.99.23 : supprimée
* EC 3.4.99.24 : supprimée
* EC 3.4.99.25 : supprimée (incluse dans EC 3.4.23.21)
* EC 3.4.99.26 → EC 3.4.24.73 et EC 3.4.21.68
* EC 3.4.99.27 : supprimée
* EC 3.4.99.28 → EC 3.4.21.60
* EC 3.4.99.29 : supprimée
* EC 3.4.99.30 : supprimée (incluse dans EC 3.4.24.20)
* EC 3.4.99.31 : supprimée (incluse dans EC 3.4.24.15)
* EC 3.4.99.32 → EC 3.4.24.20
* EC 3.4.99.33 : supprimée
* EC 3.4.99.34 : supprimée
* EC 3.4.99.35 → EC 3.4.23.36
* EC 3.4.99.36 → EC 3.4.21.89
* EC 3.4.99.37 : supprimée
* EC 3.4.99.38 → EC 3.4.23.17
* EC 3.4.99.39 : supprimée
* EC 3.4.99.40 : supprimée
* EC 3.4.99.41 → EC 3.4.24.64
* EC 3.4.99.42 : supprimée
* EC 3.4.99.43 → EC 3.4.23.42
* EC 3.4.99.44 → EC 3.4.24.55
* EC 3.4.99.45 → EC 3.4.24.56
* EC 3.4.99.46 → EC 3.4.25.1

### Groupe EC3.5 (enzymes agissant sur les liaisons carbone-azote)
#### EC 3.5.1 : Enzymes spécifiques des amides linéaires (liaison C-N linéaire)

* EC 3.5.1.1 : asparaginase
* EC 3.5.1.2 : glutaminase
* EC 3.5.1.3 : ω-amidase
* EC 3.5.1.4 : amidase
* EC 3.5.1.5 : uréase
* EC 3.5.1.6 : β-uréidopropionase
* EC 3.5.1.7 : ureidosuccinase
* EC 3.5.1.8 : formylaspartate-déformylase
* EC 3.5.1.9 : arylformamidase
* EC 3.5.1.10 : formyltétrahydrofolate-déformylase
* EC 3.5.1.11 : pénicilline-amidase
* EC 3.5.1.12 : biotinidase
* EC 3.5.1.13 : aryl-acylamidase
* EC 3.5.1.14 : aminoacylase
* EC 3.5.1.15 : aspartoacylase
* EC 3.5.1.16 : acétylornithine-déacétylase
* EC 3.5.1.17 : acyl-lysine-déacylase
* EC 3.5.1.18 : succinyl-diaminopimélate-désuccinylase
* EC 3.5.1.19 : nicotinamidase
* EC 3.5.1.20 : citrullinase
* EC 3.5.1.21 : N-acétyl-β-alanine-déacétylase
* EC 3.5.1.22 : pantothénase
* EC 3.5.1.23 : céramidase
* EC 3.5.1.24 : choloylglycine-hydrolase
* EC 3.5.1.25 : N-acétylglucosamine-6-phosphate-déacétylase
* EC 3.5.1.26 : N4-(β-N-acétylglucosaminyl)-L-asparaginase
* EC 3.5.1.27 : N-formylméthionylaminoacyl-ARNt-déformylase
* EC 3.5.1.28 : N-acétylmuramoyl-L-alanine-amidase
* EC 3.5.1.29 : 2-(acétamidométhylène)succinate-hydrolase
* EC 3.5.1.30 : 5-aminopentanamidase
* EC 3.5.1.31 : formylméthionine-déformylase
* EC 3.5.1.32 : hippurate-hydrolase
* EC 3.5.1.33 : N-acétylglucosamine-déacétylase
* EC 3.5.1.34 : supprimée (transférée vers EC 3.4.13.5)
* EC 3.5.1.35 : D-glutaminase
* EC 3.5.1.36 : N-méthyl-2-oxoglutaramate-hydrolase
* EC 3.5.1.37 : supprimée (transférée vers EC 3.5.1.26)
* EC 3.5.1.38 : glutamine-asparaginase
* EC 3.5.1.39 : alkylamidase
* EC 3.5.1.40 : acylagmatine-amidase
* EC 3.5.1.41 : chitine-déacétylase
* EC 3.5.1.42 : nicotinamide-nucléotide-amidase
* EC 3.5.1.43 : peptidyl-glutaminase
* EC 3.5.1.44 : protéine-glutamine-glutaminase
* EC 3.5.1.45 : transférée vers EC 6.3.4.6
* EC 3.5.1.46 : 6-aminohexanoate-dimère-hydrolase
* EC 3.5.1.47 : N-acétyldiaminopimélate-déacétylase
* EC 3.5.1.48 : acétylspermidine-déacétylase
* EC 3.5.1.49 : formamidase
* EC 3.5.1.50 : pentanamidase
* EC 3.5.1.51 : 4-acétamidobutyryl-CoA-déacétylase
* EC 3.5.1.52 : peptide-N4-(N-acétyl-β-glucosaminyl)asparagine-amidase
* EC 3.5.1.53 : N-carbamoylputrescine-amidase
* EC 3.5.1.54 : allophanate-hydrolase
* EC 3.5.1.55 : acide gras à longue chaîne-glutamate-déacylase
* EC 3.5.1.56 : N,N-diméthylformamidase
* EC 3.5.1.57 : tryptophanamidase
* EC 3.5.1.58 : N-benzyloxycarbonylglycine-hydrolase
* EC 3.5.1.59 : N-carbamoylsarcosine-amidase
* EC 3.5.1.60 : N-acyléthanolamine à longue chaîne-déacylase
* EC 3.5.1.61 : mimosinase
* EC 3.5.1.62 : acétylputrescine-déacétylase
* EC 3.5.1.63 : 4-acétamidobutyrate-déacétylase
* EC 3.5.1.64 : Nα-benzyloxycarbonylleucine-hydrolase
* EC 3.5.1.65 : théanine-hydrolase
* EC 3.5.1.66 : 2-(hydroxyméthyl)-3-(acétamidométhylène)succinate-hydrolase
* EC 3.5.1.67 : 4-méthylèneglutaminase
* EC 3.5.1.68 : N-formylglutamate-déformylase
* EC 3.5.1.69 : glycosphingolipide-déacylase
* EC 3.5.1.70 : aculéacine A-déacylase
* EC 3.5.1.71 : N-féruloylglycine-déacylase
* EC 3.5.1.72 : D-benzoylarginine-4-nitroanilide-amidase
* EC 3.5.1.73 : carnitinamidase
* EC 3.5.1.74 : chénodésoxycholoyltaurine-hydrolase
* EC 3.5.1.75 : uréthanase
* EC 3.5.1.76 : arylalkyl-acylamidase
* EC 3.5.1.77 : N-carbamoyl-D-aminoacide-hydrolase
* EC 3.5.1.78 : glutathionylspermidine-amidase
* EC 3.5.1.79 : phthalyl-amidase
* EC 3.5.1.80 : supprimée (transférée vers EC 3.5.1.25)
* EC 3.5.1.81 : N-acyl-D-aminoacide-déacylase
* EC 3.5.1.82 : N-acyl-D-glutamate-déacylase
* EC 3.5.1.83 : N-acyl-D-aspartate-déacylase
* EC 3.5.1.84 : biuret-amidohydrolase
* EC 3.5.1.85 : (S)-N-acétyl-1-phényléthylamine-hydrolase
* EC 3.5.1.86 : mandélamide-amidase
* EC 3.5.1.87 : N-carbamoyl-L-aminoacide-hydrolase
* EC 3.5.1.88 : peptide-déformylase
* EC 3.5.1.89 : N-acétylglucosaminylphosphatidylinositol-déacétylase
* EC 3.5.1.90 : adénosylcobinamide-hydrolase
* EC 3.5.1.91 : formamide N-substituée-déformylase
* EC 3.5.1.92 : pantéthéine-hydrolase
* EC 3.5.1.93 : acide glutaryl-7-aminocéphalosporanique-acylase
* EC 3.5.1.94 : γ-glutamyl-γ-aminobutyrate-hydrolase
* EC 3.5.1.95 : N-malonylurée-hydrolase
* EC 3.5.1.96 : succinylglutamate-désuccinylase
* EC 3.5.1.97 : acyl-homosérine-lactone-acylase
* EC 3.5.1.98 : histone-déacétylase
* EC 3.5.1.99 : amide d'acide gras-hydrolase
* EC 3.5.1.100 : (R)-amidase
* EC 3.5.1.101 : L-prolinamide-hydrolase

#### EC 3.5.2 : Enzymes spécifiques des amides cycliques (liaison C-N cyclique)

* EC 3.5.2.1 : barbiturase
* EC 3.5.2.2 : dihydropyrimidinase
* EC 3.5.2.3 : dihydroorotase
* EC 3.5.2.4 : carboxyméthylhydantoïnase
* EC 3.5.2.5 : allantoïnase
* EC 3.5.2.6 : β-lactamase
* EC 3.5.2.7 : imidazolonepropionase
* EC 3.5.2.8 : supprimée (incluse dans EC 3.5.2.6)
* EC 3.5.2.9 : 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysante)
* EC 3.5.2.10 : créatininase
* EC 3.5.2.11 : L-lysine-lactamase
* EC 3.5.2.12 : 6-aminohexanoate-dimère cyclique-hydrolase
* EC 3.5.2.13 : 2,5-dioxopipérazine-hydrolase
* EC 3.5.2.14 : N-méthylhydantoïnase (ATP-hydrolysante)
* EC 3.5.2.15 : acide cyanurique-amidohydrolase
* EC 3.5.2.16 : maléimide-hydrolase
* EC 3.5.2.17 : hydroxyisourate-hydrolase
* EC 3.5.2.18 : énamidase

#### EC 3.5.3 : Déiminases (enzymes spécifiques des amidines linéaires) (liaison C=N linéaire)

* EC 3.5.3.1 : arginase
* EC 3.5.3.2 : guanidinoacétase
* EC 3.5.3.3 : créatinase
* EC 3.5.3.4 : allantoïcase
* EC 3.5.3.5 : formiminoaspartate-déiminase
* EC 3.5.3.6 : arginine-déiminase
* EC 3.5.3.7 : guanidinobutyrase
* EC 3.5.3.8 : formimidoylglutamase
* EC 3.5.3.9 : allantoate-déiminase
* EC 3.5.3.10 : D-arginase
* EC 3.5.3.11 : agmatinase
* EC 3.5.3.12 : agmatine-déiminase
* EC 3.5.3.13 : formiminoglutamate-déiminase
* EC 3.5.3.14 : amidinoaspartase
* EC 3.5.3.15 : protéine-arginine-déiminase
* EC 3.5.3.16 : méthylguanidinase
* EC 3.5.3.17 : guanidinopropionase
* EC 3.5.3.18 : diméthylargininase
* EC 3.5.3.19 : uréidoglycolate-hydrolase
* EC 3.5.3.20 : diguanidinobutanase
* EC 3.5.3.21 : méthylènediurée-désaminase
* EC 3.5.3.22 : proclavaminate-amidinohydrolase
* EC 3.5.3.23 : N-succinylarginine-dihydrolase

#### EC 3.5.4 : Enzymes spécifiques des amidines cycliques (liaison C=N cyclique)

* EC 3.5.4.1 : cytosine-désaminase
* EC 3.5.4.2 : adénine-désaminase
* EC 3.5.4.3 : guanine-désaminase
* EC 3.5.4.4 : adénosine désaminase
* EC 3.5.4.5 : cytidine-désaminase
* EC 3.5.4.6 : AMP-désaminase
* EC 3.5.4.7 : ADP-désaminase
* EC 3.5.4.8 : aminoimidazolase
* EC 3.5.4.9 : méthényltétrahydrofolate-cyclohydrolase
* EC 3.5.4.10 : IMP-cyclohydrolase
* EC 3.5.4.11 : ptérine-désaminase
* EC 3.5.4.12 : dCMP-désaminase
* EC 3.5.4.13 : dCTP-désaminase
* EC 3.5.4.14 : désoxycytidine-désaminase
* EC 3.5.4.15 : guanosine-désaminase
* EC 3.5.4.16 : GTP-cyclohydrolase I
* EC 3.5.4.17 : adénosine-phosphate-désaminase
* EC 3.5.4.18 : ATP-désaminase
* EC 3.5.4.19 : phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase
* EC 3.5.4.20 : pyrithiamine-désaminase
* EC 3.5.4.21 : créatinine-désaminase
* EC 3.5.4.22 : 1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate-désaminase
* EC 3.5.4.23 : blasticidine S-désaminase
* EC 3.5.4.24 : sépiaptérine-désaminase
* EC 3.5.4.25 : GTP-cyclohydrolase II
* EC 3.5.4.26 : diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine-désaminase
* EC 3.5.4.27 : méthényltétrahydrométhanoptérine-cyclohydrolase
* EC 3.5.4.28 : S-adénosylhomocystéine-désaminase
* EC 3.5.4.29 : GTP-cyclohydrolase IIa
* EC 3.5.4.30 : dCTP-désaminase (formatrice de dUMP)

#### EC 3.5.5 : Nitrilases (enzymes spécifiques des nitriles) (liaison C≡N)

* EC 3.5.5.1 : nitrilase
* EC 3.5.5.2 : ricinine-nitrilase
* EC 3.5.5.3 : transférée vers EC 4.3.99.1
* EC 3.5.5.4 : cyanoalanine-nitrilase
* EC 3.5.5.5 : arylacétonitrilase
* EC 3.5.5.6 : bromoxynil-nitrilase
* EC 3.5.5.7 : nitrilase aliphatique
* EC 3.5.5.8 : thiocyanate-hydrolase

#### EC 3.5.99 : Autres enzymes

* EC 3.5.99.1 : riboflavinase
* EC 3.5.99.2 : thiaminase
* EC 3.5.99.3 : hydroxydéchloroatrazine-éthylaminohydrolase
* EC 3.5.99.4 : N-isopropylammélide-isopropylaminohydrolase
* EC 3.5.99.5 : 2-aminomuconate-désaminase
* EC 3.5.99.6 : glucosamine-6-phosphate-désaminase
* EC 3.5.99.7 : 1-aminocyclopropane-1-carboxylate-désaminase

### Groupe EC3.6 (enzymes spécifiques des anhydrides d'acides)
#### EC 3.6.1 : Polyphosphatases (enzymes spécifiques des anhydrides contenant du phosphore)

* EC 3.6.1.1 : diphosphatase inorganique
* EC 3.6.1.2 : trimétaphosphatase
* EC 3.6.1.3 : adénosinetriphosphatase
* EC 3.6.1.4 : supprimée (incluse dans EC 3.6.1.3)
* EC 3.6.1.5 : apyrase
* EC 3.6.1.6 : nucléoside-diphosphatase
* EC 3.6.1.7 : acylphosphatase
* EC 3.6.1.8 : ATP-diphosphatase
* EC 3.6.1.9 : nucléotide-diphosphatase
* EC 3.6.1.10 : endopolyphosphatase
* EC 3.6.1.11 : exopolyphosphatase
* EC 3.6.1.12 : dCTP-diphosphatase
* EC 3.6.1.13 : ADP-ribose-diphosphatase
* EC 3.6.1.14 : adénosine-tétraphosphatase
* EC 3.6.1.15 : nucléoside-triphosphatase
* EC 3.6.1.16 : CDP-glycérol-diphosphatase
* EC 3.6.1.17 : bis(5'-nucléosyl)-tétraphosphatase (asymétrique)
* EC 3.6.1.18 : FAD-diphosphatase
* EC 3.6.1.19 : nucléoside-triphosphate-diphosphatase
* EC 3.6.1.20 : 5'-acylphosphoadénosine-hydrolase
* EC 3.6.1.21 : ADP-ose-diphosphatase
* EC 3.6.1.22 : NAD$^+$-diphosphatase
* EC 3.6.1.23 : dUTP-diphosphatase
* EC 3.6.1.24 : nucléoside-phosphoacylhydrolase
* EC 3.6.1.25 : triphosphatase
* EC 3.6.1.26 : CDP-diacylglycérol-diphosphatase
* EC 3.6.1.27 : undécaprényl-diphosphatase
* EC 3.6.1.28 : thiamine-triphosphatase
* EC 3.6.1.29 : bis(5'-adénosyl)-triphosphatase
* EC 3.6.1.30 : m$^7$G(5')pppN-diphosphatase
* EC 3.6.1.31 : phosphoribosyl-ATP-diphosphatase
* EC 3.6.1.32 : transférée vers EC 3.6.4.1
* EC 3.6.1.33 : transférée vers EC 3.6.4.2
* EC 3.6.1.34 : transférée vers EC 3.6.3.14
* EC 3.6.1.35 : transférée vers EC 3.6.3.6
* EC 3.6.1.36 : transférée vers EC 3.6.3.10
* EC 3.6.1.37 : transférée vers EC 3.6.3.9
* EC 3.6.1.38 : transférée vers EC 3.6.3.8
* EC 3.6.1.39 : thymidine-triphosphatase
* EC 3.6.1.40 : guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate-diphosphatase
* EC 3.6.1.41 : bis(5'-nucléosyl)-tétraphosphatase (symétrique)
* EC 3.6.1.42 : guanosine-diphosphatase
* EC 3.6.1.43 : dolichyldiphosphatase
* EC 3.6.1.44 : oligosaccharide-diphosphodolichol-diphosphatase
* EC 3.6.1.45 : UDP-ose-diphosphatase
* EC 3.6.1.46 : transférée vers EC 3.6.5.1
* EC 3.6.1.47 : transférée vers EC 3.6.5.2
* EC 3.6.1.48 : transférée vers EC 3.6.5.3
* EC 3.6.1.49 : transférée vers EC 3.6.5.4
* EC 3.6.1.50 : transférée vers EC 3.6.5.5
* EC 3.6.1.51 : transférée vers EC 3.6.5.6
* EC 3.6.1.52 : diphosphoinositol-polyphosphate-diphosphatase
* EC 3.6.1.53 : ADP-ribose/CDP-alcool Mn$^{2+}$-dépendante-diphosphatase
* EC 3.6.1.68 : geranyl diphosphate phosphohydrolase

#### EC 3.6.2 : Sulfatases (enzymes spécifiques des anhydrides contenant un groupe sulfonyle)

* EC 3.6.2.1 : adénylylsulfatase
* EC 3.6.2.2 : phosphoadénylylsulfatase

#### EC 3.6.3 : Anhydrases agissant lors de mouvements transmembranaires

* EC 3.6.3.1 : ATPase-Mg$^{2+}$
* EC 3.6.3.2 : ATPase-Mg$^{2+}$ (import)
* EC 3.6.3.3 : ATPase-Cd$^{2+}$ (export)
* EC 3.6.3.4 : ATPase-Cu$^{2+}$ (export)
* EC 3.6.3.5 : ATPase-Zn$^{2+}$ (export)
* EC 3.6.3.6 : ATPase-H$^+$ (export)
* EC 3.6.3.7 : ATPase-Na$^+$ (export)
* EC 3.6.3.8 : ATPase-Ca$^{2+}$ (transport)
* EC 3.6.3.9 : ATPase-Na$^+$/K$^+$ (échange)
* EC 3.6.3.10 : ATPase-H$^+$/K$^+$ (échange)
* EC 3.6.3.11 : ATPase-Cl$^−$ (transport)
* EC 3.6.3.12 : ATPase-K$^+$ (transport)
* EC 3.6.3.13 : supprimée (identique à EC 3.6.3.1)
* EC 3.6.3.14 : H$^+$-transporting two-sector ATPase
* EC 3.6.3.15 : Na$^+$-transporting two-sector ATPase
* EC 3.6.3.16 : ATPase-arsenite (transport)
* EC 3.6.3.17 : ATPase-monosaccharide (transport)
* EC 3.6.3.18 : ATPase-oligosaccharide (transport)
* EC 3.6.3.19 : ATPase-maltose (transport)
* EC 3.6.3.20 : ATPase-glycérol-3-phosphate (transport)
* EC 3.6.3.21 : ATPase-aminoacide polaire (transport)
* EC 3.6.3.22 : ATPase-aminoacide non polaire (transport)
* EC 3.6.3.23 : ATPase-oligopeptide (transport)
* EC 3.6.3.24 : ATPase-nickel (transport)
* EC 3.6.3.25 : ATPase-sulfate (transport)
* EC 3.6.3.26 : ATPase-nitrate (transport)
* EC 3.6.3.27 : ATPase-phosphate (transport)
* EC 3.6.3.28 : ATPase-phosphonate (transport)
* EC 3.6.3.29 : ATPase-molybdate (transport)
* EC 3.6.3.30 : ATPase-Fe$^{3+}$ (transport)
* EC 3.6.3.31 : ATPase-polyamine (transport)
* EC 3.6.3.32 : ATPase-amine quaternaire (transport)
* EC 3.6.3.33 : ATPase-vitamine B12 (transport)
* EC 3.6.3.34 : ATPase-chélate fer (transport)
* EC 3.6.3.35 : ATPase-manganèse (transport)
* EC 3.6.3.36 : ATPase-taurine (transport)
* EC 3.6.3.37 : ATPase-guanine (transport)
* EC 3.6.3.38 : ATPase-polysaccharide encapsulé (transport)
* EC 3.6.3.39 : ATPase-lipopolysaccharide (transport)
* EC 3.6.3.40 : ATPase-acide téichoïque (transport)
* EC 3.6.3.41 : ATPase-hème (transport)
* EC 3.6.3.42 : ATPase-β-glucane (transport)
* EC 3.6.3.43 : ATPase-peptide (transport)
* EC 3.6.3.44 : ATPase-xénobiotique (transport)
* EC 3.6.3.45 : incluse dans EC 3.6.3.44
* EC 3.6.3.46 : ATPase-cadmium (transport)
* EC 3.6.3.47 : ATPase-acyl-CoA (transport)
* EC 3.6.3.48 : ATPase-facteur α (transport)
* EC 3.6.3.49 : channel-conductance-controlling ATPase
* EC 3.6.3.50 : ATPase-protéine de sécrétion
* EC 3.6.3.51 : ATPase-protéine mitochondriale (transport)
* EC 3.6.3.52 : ATPase-protéine de chloroplaste (transport)
* EC 3.6.3.53 : ATPase-Ag$^+$ (export)

#### EC 3.6.4 : Anhydrases impliquées dans les mouvements cellulaires et subcellulaires

* EC 3.6.4.1 : myosine-ATPase
* EC 3.6.4.2 : dynéine-ATPase
* EC 3.6.4.3 : microtubule-severing ATPase
* EC 3.6.4.4 : plus-end-directed kinesin ATPase
* EC 3.6.4.5 : minus-end-directed kinesin ATPase
* EC 3.6.4.6 : vesicle-fusing ATPase
* EC 3.6.4.7 : peroxisome-assembly ATPase
* EC 3.6.4.8 : protéasome-ATPase
* EC 3.6.4.9 : chapéronine-ATPase
* EC 3.6.4.10 : non-chaperonin molecular chaperone ATPase
* EC 3.6.4.11 : nucléoplasmine-ATPase
* EC 3.6.4.12 : ADN-hélicase
* EC 3.6.4.13 : ARN-hélicase

#### EC 3.6.5 : Enzymes agissant sur le GTP, et impliquées dans les mouvements cellulaires et subcellulaires

* EC 3.6.5.1 : protéine G hétérotrimérique-GTPase
* EC 3.6.5.2 : petite GTPase monomérique
* EC 3.6.5.3 : protein-synthesizing GTPase
* EC 3.6.5.4 : signal-recognition-particle GTPase
* EC 3.6.5.5 : dynamine-GTPase
* EC 3.6.5.6 : tubuline-GTPase

### Groupe EC3.7 (enzymes agissant sur les liaisons carbone-carbone)
#### EC3.7.1 : Enzymes actives sur les corps cétoniques

* EC 3.7.1.1 : oxaloacétase
* EC 3.7.1.2 : fumarylacétoacétase
* EC 3.7.1.3 : cynuréninase
* EC 3.7.1.4 : phlorétine-hydrolase
* EC 3.7.1.5 : acylpyruvate-hydrolase
* EC 3.7.1.6 : acétylpyruvate-hydrolase
* EC 3.7.1.7 : β-dicétone-hydrolase
* EC 3.7.1.8 : 2,6-dioxo-6-phénylhexa-3-énoate-hydrolase
* EC 3.7.1.9 : 2-hydroxymuconate-semialdéhyde-hydrolase
* EC 3.7.1.10 : cyclohexane-1,3-dione-hydrolase
* EC 3.7.1.11 : cyclohexane-1,2-dione-hydrolase

### Groupe EC3.8 (enzymes agissant sur les liaisons carbone-halogène)
#### EC3.8.1 : Déhalogénases (enzymes spécifiques des liaisons carbone-halogène)

* EC 3.8.1.1 : alkylhalidase
* EC 3.8.1.2 : (S)-2-haloacide-déhalogénase
* EC 3.8.1.3 : haloacétate-déhalogénase
* EC 3.8.1.4 : transférée vers EC 1.97.1.10
* EC 3.8.1.5 : haloalcane-déhalogénase
* EC 3.8.1.6 : 4-chlorobenzoate-déhalogénase
* EC 3.8.1.7 : 4-chlorobenzoyl-CoA-déhalogénase
* EC 3.8.1.8 : atrazine-chlorohydrolase
* EC 3.8.1.9 : (R)-2-haloacide-déhalogénase
* EC 3.8.1.10 : 2-haloacide-déhalogénase (avec inversion de configuration)
* EC 3.8.1.11 : 2-haloacide-déhalogénase (avec conservation de configuration)

### Groupe EC3.9 (enzymes agissant sur les liaisons N-P)

Ce groupe ne contient actuellement qu'une seule enzyme, la phosphoamidase, qui hydrolyse la N-phosphocréatine en créatine.
* EC 3.9.1.1 : phosphoamidase

### Groupe EC3.10 : Sulfohydrolases (enzymes agissant sur les liaisons N-S)

* EC 3.10.1.1 : N-sulfoglucosamine-sulfohydrolase
* EC 3.10.1.2 : cyclamate-sulfohydrolase

### Groupe EC3.11 (enzymes agissant sur les liaisons C-P)

* EC 3.11.1.1 : phosphonoacétaldehyde-hydrolase
* EC 3.11.1.2 : phosphonoacétate-hydrolase
* EC 3.11.1.3 : phosphonopyruvate-hydrolase

### Groupe EC3.12 (enzymes agissant sur les liaisons S-S)

Ce groupe ne contient qu'une seule enzyme, la trithionate-hydrolase, qui hydrolyse le trithionate en thiosulfate et sulfate.
* EC 3.12.1.1 : trithionate-hydrolase

### Groupe EC3.13 (enzymes agissant sur les liaisons C-S)

* EC 3.13.1.1 : UDP-sulfoquinovose-synthase
* EC 3.13.1.2 : supprimée (peut-être remplacée par EC 4.4.1.21)
* EC 3.13.1.3 : 2'-hydroxybiphényl-2-sulfinate-désulfinase

## Exemples d'hydrolases (par ordre alphabétique) avec leur type d'action

* aminopeptidase ou aminoacyl-peptidase hydrolase (peptidase)
* carboxypeptidase A ou peptidyl-L aminoacide hydrolase (peptidase)
* cholestérol estérase (estérase)
* chymotrypsine (protéase)
* désoxyribonucléases (estérase)
* β-glucosidase ou β-D-glucoside glucohydrolase (osidase)
* lipases ou glycérol-ester hydrolases (estérase)→ ex: lipases pancréatiques
* lysozyme (osidase)
* maltase (osidase)
* phosphatase alcaline (par exemple d'Escherichia coli) (estérase)
* phospholipase A1 (estérase)
* phospholipase A2 (estérase)
NB : Certaines phospholipases A contenues dans certains venins de serpents peuvent provoquer une hémolyse importante.
* phospholipase C (estérase)
* phospholipase D (estérase)
* ribonucléases (estérase)
* trypsine (peptidase)