# Coloration (microscopie)

La coloration de tissu biologique est souvent nécessaire pour la mise en évidence et l'identification de cellules ou de la structure tissulaire. Certaines colorations sont compatibles avec la vie cellulaire, d'autres nécessitent la fixation des tissus, et parfois la création de coupes histologiques.

## Colorations en microscopie photonique

Pour permettre l'observation des organites en microscopie optique, des substances colorantes sont utilisées.

### Colorations topographiques

Un colorant consiste souvent en une solution aqueuse contenant un composé portant des groupements chimiques chargés électriquement (fonctions anioniques ou cationiques) et qui peut colorer une ou plusieurs substances de manière stable.
Constitué d'un groupement chromophore (couleur) et d'un groupement auxochrome (groupement ionisé): fixation permanente sur des groupements acides ou basiques des constituants cellulaires (à un pH donné).
Caractéristiques :
* non spécifique d'un type de molécule ;
* donne une vue d'ensemble du tissu : renseigne sur la répartition, l'architecture et la structure des cellules ;
* résulte de l'action conjuguée d'un colorant acide (éosine) et d'un colorant basique (hémalun, bleu de méthylène).
Les substances acides (chargées -) de la cellule sont colorées par un colorant basique (chargé +), les substances basiques (chargées +) de la cellule par un colorant acide (chargé -).
Cette coloration colore un type de charge. On peut voir la morphologie de la cellule (forme), la position du noyau et sa forme. Ainsi, on peut déterminer le nombre de types cellulaires dans le tissu et la structure de ce tissu (cellules collées ou non).

### Colorations histochimiques

Réactions rédox agissant sur des macromolécules, renseignent sur la constitution chimique de la cellule. Exemples :
* Acide periodique-Schiff (PAS)
* Feulgen-Rosenbeck (ADN – Quantitatif)
* Brachet (ADN et/ou ARN)
* Perl's (met en évidence le fer)
* Par précipitation de sel d'argent (visualisation de la mélanine, amines biogènes, neurofibrilles, etc.).

## Types de tissu révélés par coloration
### Colorants acides

Les colorants acides ont une bonne affinité avec les substances alcalines, ils mettent en évidence des tissus basiques donc acidophiles.
* éosine (rouge)
* acide picrique (jaune)
* vert rapide
* orange G
* fuchsine acide (rouge)
* érythrosine [rouge]

### Colorants basiques

Ils mettent en évidence des tissus acides, dits basophiles.
* hématoxyline (bleu foncé)
* safranine (orange)
* carmin (rouge)
* bleu de méthylène
* thionine (bleu)
* fuchsine basique (rouge)
* vert d'iode (vert)
De nombreuses colorations utilisent deux colorants : carmino-vert ou carmin vert d'iode (technique de double coloration en rose et vert), éosine-bleu de méthylène …

### Colorations argentiques

Certains tissus fixent l'argent. On parle de structures argentaffines ou de structures argyrophiles.
* coloration de Golgi
* Coloration de Dieterle
* Trichrome de Gomori

### Coloration aux sels de Chrome

On met ainsi en évidence les tissus chromaffines, comme la médullo-surrénale.

## Différentes méthodes de coloration

Plusieurs méthodes de coloration ont été mises au point pour révéler certaines structures. En voici quelques-unes répertoriées dans un tableau :
| Coloration | Composants | Cytoplasme | Collagène | Élastine | ADN | Autres | pH |
| Hématoxyline et éosine | Hématoxyline et éosine | rouge/rose | rouge/rose | rouge | bleu/noir | | ? |
| van Gieson | Hématoxyline, fuchsine acide et acide picrique | jaune | rouge | - (parfois rose) | noir | | ? |
| Goldner | Hématoxyline, fuchsine acide, Light Green SF | rouge | vert | - | noir | | ? |
| Elastica | Résorcine, fuchsine | | | brun-violet | | | |
| Azan | Azocarmine, bleu aniline | rouge | bleu | - (parfois rose) | rouge | | |
| Ladewig | Orange G, bleu de méthylène, fuchsine acide, hématoxyline | rouge (érythrocyte orange) | bleu | | noir | | |
| Sudan III | Colorant soluble dans les lipides | | | | | Lipides en orange | |
| PAS | Hématoxyline, acide periodique, réactif de Schiff | | | | bleu | Polysaccharides : violet-rouge | |
| Nissl | Thionine (ou toluidine ou violet de crésyl) | bleu (avec le RE) | | | bleu | | |
| Coloration de May-Grünwald Giemsa | Éosine, bleu de méthylène et azur de methylène | rouge chez les GR, bleu chez les lymphocytes | | | bleu | | |

### Colorations utilisées en microbiologie

Même s'il ne s'agit pas directement de colorations histologiques, ces méthodes visent à distinguer entre plusieurs types cellulaires. Elles utilisent aussi les mêmes types de colorants :
* la coloration de Gram, pour déterminer des types de cellules procaryotes ;
* la coloration de Ziehl-Neelsen révèle les mycobactéries.

## Colorations au microscope électronique

Pour permettre l'observation des organites en microscopie électronique, des métaux lourds comme le plomb, l'uranium ou le tungstène sont utilisés. Les régions à colorer deviennent sombres car peu d'électrons parviennent à traverser ces métaux.