# Choanoflagellata

El filo propuesto Choanoflagellata engloba a las denominadas proto-esponjas y a los coanoflagelados, si bien algunos investigadores denominan a todo este grupo como "coanoflagelados", los coanoflagelados verdaderos se ubican en la clase Choanoflagellatea, como grupo vivo hermano de Benthozoa.
La clase Varisarca fue propuesta por Cavalier Smith para englobar a los organismos espongiformes que no entran dentro de Porifera ni Choanoflagellatea, dentro de ese grupo están las denominadas proto-esponjas, organismos con fase de coanocito que a diferencia de los coanoflagelados verdaderos, tienen como células encargadas de la diferenciación celular a los arqueocitos, quienes forman a los coanocitos a partir de estas células, además de formar amebocitos móviles a partir de los arqueocitos para la sujeción bentónica.
La clase Choanoflagellatea por otro lado emplea los coanocitos como punto de la diferenciación celular y la fase de arqueocito se perdió, aunque pueden formar amebocitos si el coanoflagelado esta en una situación de confinamiento.

## Diferencias entre Varisarca, Choanoflagellatea y Porifera

Este es un cuadro donde se denotan las diferencias entre las proto-esponjas, esponjas y coanoflagelados. Los tres grupos forman el grupo ancestral esponjoso o el grupo coano-esponja al contrario que el grupo acolchado o frondoso Petalonamae.
| Características presentes | Varisarca | Choanoflagellatea | Porifera |
| Diferenciación celular | Arqueocitos | Coanocitos | Arqueocitos |
| Formación de gametos | Los arqueocitos forman los óvulos y los coanocitos, estos últimos a su vez posiblemente formen los espermatozoides. | El coanocito forma tanto los espermatozoides como los óvulos. | Los arqueocitos forman óvulos, mientras que los coanocitos forman espermatozoides. |
| Estructura tisular | Colonial con mesohilo | Colonial con mesohilo (perdido en Acanthoecida) | Semi-tisular con mesohilo |
| Capas germinales | Monoblástico | Monoblástico (exc. Acanthoecida) | Monoblástico (posiblemente diploblastico en algunos grupos) |
| Etapa de alimentación | Todas las etapas | Todas las etapas | Adulta sésil |
| Ubicación del coanodermo | Variable (Externo y/o interno) | Externo | Interno (formando canales) |
| Neuroides (células secretoras) | Presentes | Los coanocitos ocupan su lugar | Presentes |

## Relaciones filogenéticas

Cavalier Smith al principio presentó a los varisarcos como una forma transicional entre los coanoflagelados y las esponjas, no obstante el consenso de los orígenes animales a través de protistas parecidos a células madre señala que el ancestro común entre los dos grupos tenía como diferenciador celular a los arqueocitos, implicando que los coanoflagelados verdaderos también descienden de las pre-esponjas en lugar de que fuesen solo un grupo hermano o predecesor de estos.
Debido a ello los coanoflagelados perdieron la fase de arqueocito y las integrinas que poseían los varisarcos, ahora los coanoflagelados recurren directamente la diferenciación por la forma de coanocito. Tanto los coanoflagelados modernos como las esponjas poseen neuroides, pero en los coanoflagelados estos son muy similares a los coanocitos y los propios coanocitos poseen la maquinaria molecular para formarlos, ausente en las esponjas y pre-esponjas que utilizan los arqueocitos para formarlos.
Las pre-esponjas Otavia y Eocyathispongia están más relacionadas con las esponjas que a los coanoflagelados debido a la presencia de coanodermo interno inferido pero ausencia de ostia definida. El fósil Funisia en cambio posee una constitución tubular, con mesohilo sin pinacodermos, pero con una forma similar a Cladospongia elegans, posee el coanodermo externo en lugar de interno, y se reproducía sexualmente, presentaría arqueocitos al igual que Eocyathispongia, dentro del mesohilo.