# Variación genética humana

La variación genética humana es la diferencia genética presente en y entre las poblaciones. Puede haber múltiples variantes de cualquier gen en la población humana (alelos), una situación llamada polimorfismo.
No hay dos humanos genéticamente idénticos. Incluso los gemelos monocigóticos (que se desarrollan a partir de un cigoto) tienen diferencias genéticas poco frecuentes debido a las mutaciones que ocurren durante el desarrollo y la variación del número de copias del gen. Las diferencias entre los individuos, incluso los individuos estrechamente relacionados, son la clave de técnicas como la huella genética. A partir de 2017, hay un total de 324 millones de variantes conocidas de genomas humanos secuenciados. A partir de 2015, la diferencia típica entre los genomas de dos individuos se estimó en 20 millones de pares de bases (o 0.6% del total de 3200 millones de pares de bases).
Los alelos ocurren en diferentes frecuencias en diferentes poblaciones humanas. Las poblaciones que son más remotas geográficamente y ancestralmente tienden a diferir más. Las diferencias entre las poblaciones representan una pequeña proporción de la variación genética humana general. Las poblaciones también difieren en la cantidad de variación entre sus miembros. La mayor divergencia entre las poblaciones se encuentra en el África subsahariana, en consonancia con el reciente origen africano de las poblaciones no africanas. Las poblaciones también varían en la proporción y el lugar de los genes introgresados que recibieron por mezcla arcaica tanto dentro como fuera de África.
El estudio de la variación genética humana tiene importancia evolutiva y aplicaciones médicas. Puede ayudar a los científicos a comprender las antiguas migraciones de la población humana, así como la forma en que los grupos humanos están biológicamente relacionados entre sí. Para la medicina, el estudio de la variación genética humana puede ser importante porque algunas variantes de cualquier gen en la población humana (alelos) causantes de enfermedades, ocurren con mayor frecuencia en personas de regiones geográficas específicas. Nuevos hallazgos muestran que cada humano tiene en promedio 60 nuevas mutaciones en comparación con sus padres.

## Causas de variación

Las causas de las diferencias entre los individuos incluyen una variedad independiente, el intercambio de genes (cruce y recombinación) durante la reproducción (a través de la meiosis) y varios eventos mutacionales.
Existen al menos tres razones por las cuales existe variación genética entre poblaciones. La selección natural puede conferir una ventaja adaptativa a las personas en un entorno específico si un alelo proporciona una ventaja competitiva. Es probable que los alelos bajo selección ocurran solo en aquellas regiones geográficas donde confieren una ventaja. Un segundo proceso importante es la deriva genética, que es el efecto de cambios aleatorios en el conjunto de genes, en condiciones en las que la mayoría de las mutaciones son neutrales (es decir, no parecen tener ningún efecto selectivo positivo o negativo en el organismo). Finalmente, las poblaciones migrantes pequeñas tienen diferencias estadísticas, llamadas el efecto fundador, de las poblaciones generales donde se originaron; cuando estos migrantes se establecen en nuevas áreas, su población descendiente generalmente difiere de su población de origen: predominan los diferentes genes y es menos genéticamente diversa.
En humanos, la causa principal es deriva genética. Los efectos fundadores seriales y el pequeño tamaño de la población anterior (que aumenta la probabilidad de deriva genética) pueden haber tenido una influencia importante en las diferencias neutrales entre las poblaciones. La segunda causa principal de variación genética se debe al alto grado de neutralidad de la mayoría de las mutaciones. Parece que un número pequeño pero significativo de genes se ha sometido a una selección natural reciente, y estas presiones selectivas a veces son específicas de una región.

## Medidas de variación

La variación genética entre humanos ocurre en muchas escalas, desde alteraciones graves en el cariotipo humano hasta cambios en un solo nucleótido. Se detectan anomalías cromosómicas en 1 de 160 nacimientos humanos vivos. Además de los trastornos de los cromosomas sexuales, la mayoría de los casos de aneuploidía provocan la muerte del feto en desarrollo (aborto espontáneo); los cromosomas autosómicos adicionales más comunes entre los nacidos vivos son 21, 18 y 13.
La diversidad de nucleótidos es la proporción promedio de nucleótidos que difieren entre dos individuos. A partir de 2004, la diversidad de nucleótidos humanos se estimó en 0.1% a 0.4% de pares de bases. En 2015, el Proyecto 1000 Genomas, que secuenciaba a mil individuos de 26 poblaciones humanas, encontró que:
   "...un genoma [individual] típico difiere del genoma humano de referencia en 4.1 millones a 5.0 millones de sitios ... que afectan a 20 millones de bases de secuencia"
La última cifra corresponde al 0,6% del número total de pares de bases. Casi todos (>99.9%) de estos sitios son pequeñas diferencias, ya sea polimorfismos de un solo nucleótido o breves inserciones o deleciones (indeles) en la secuencia genética, pero las variaciones estructurales representan un mayor número de pares de bases que los SNP y los indeles.
A partir de 2017, la Single Nucleotide Polymorphism Database (DbSNP), que enumera SNP y otras variantes, enumeró 324 millones de variantes encontradas en genomas humanos secuenciados.

### Polimorfismos de un solo nucleótido

Un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP del inglés Single Nucleotide Polymorphism) es una diferencia en un solo nucleótido entre los miembros de una especie que ocurre en al menos el 1% de la población. Las 2.504 personas caracterizadas por el "Proyecto 1000 Genomas" tenían 84.7 millones de SNP entre ellos. Los SNP son el tipo más común de variación de secuencia, estimado en 1998 para representar el 90% de todas las variantes de secuencia. Otras variaciones de secuencia son intercambios, eliminaciones e inserciones de base única. Los SNP ocurren en promedio cada 100 a 300 bases y, por lo tanto, son la principal fuente de heterogeneidad.
Un SNP funcional, o no sinónimo, es aquel que afecta algún factor, como el empalme de genes o el ARN mensajero, y por lo tanto causa una diferencia fenotípica entre los miembros de la especie. Alrededor del 3% al 5% de los SNP humanos son funcionales (ver Proyecto Internacional HapMap). Los SNP neutros o sinónimos siguen siendo útiles como marcadores genéticos en los estudios de asociación de todo el genoma, debido a su gran número y la herencia estable a lo largo de las generaciones.
Un SNP de codificación es uno que ocurre dentro de un gen. Hay 105 SNP de referencia humana que resultan en codones de parada prematuros en 103 genes. Esto corresponde al 0,5% de los SNP de codificación. Ocurren debido a la duplicación segmentaria en el genoma. Estos SNP resultan en la pérdida de proteínas, sin embargo, todos estos alelos SNP son comunes y no se purifican en la selección negativa.

### Variación estructural

La variación estructural es la variación en la estructura del cromosoma de un organismo. Las variaciones estructurales, como la variación y las deleciones del número de copias, las inversiones, las inserciones y las duplicaciones, representan mucha más variación genética humana que la diversidad de un solo nucleótido. Esto se concluyó en 2007 del análisis de las secuencias completas diploides de los genomas de dos humanos: Craig Venter y James D. Watson. Esto se sumó a las dos secuencias haploides, que eran amalgamas de secuencias de muchos individuos, publicadas por Human Genome Project y Celera Genomics, respectivamente.
De acuerdo con el Proyecto 1000 Genomas, un humano típico tiene entre 2,100 y 2,500 variaciones estructurales, que incluyen aproximadamente 1,000 deleciones grandes, 160 variantes de número de copias, 915 inserciones Alu, 128 inserciones L1, 51 inserciones SVA, 4 NUMT sy 10 inversiones.

#### Variación de número de copia

Una variación del número de copias (CNV, del inglés copy-number variation) es una diferencia en el genoma debido a la eliminación o duplicación de grandes regiones de ADN en algunos cromosomas. Se estima que el 0,4% de los genomas de humanos no relacionados difieren con respecto al número de copias. Cuando se incluye la variación del número de copias, la variación genética de humano a humano se estima en al menos 0.5% (99.5% de similitud). Las variaciones del número de copias se heredan, pero también pueden surgir durante el desarrollo.
Se construyó un mapa visual con las regiones con alta variación genómica del conjunto de referencia humano-moderno en relación con un Neandertal de 50k.

### Epigenética

La variación epigenética es la variación en las etiquetas químicas que se adhieren al ADN y afectan la forma en que se leen los genes. Las etiquetas, "llamadas marcas epigenéticas, actúan como interruptores que controlan cómo se pueden leer los genes". En algunos alelos, el estado epigenético del ADN y el fenotipo asociado pueden heredarse de generación en generación.

### Variabilidad genética

La variabilidad genética es una medida de la tendencia de los genotipos individuales en una población a variar (volverse diferente) entre sí. La variabilidad es diferente de la diversidad genética, que es la cantidad de variación observada en una población particular. La variabilidad de un rasgo es cuánto tiende a variar ese rasgo en respuesta a las influencias ambientales y genéticas.

### Clinas

En biología, una clina (también cline) es un continuo de especies, poblaciones, razas, variedades o formas de organismos que exhiben diferencias fenotípicas y/o genéticas graduales en un área geográfica, típicamente como resultado de la heterogeneidad ambiental. En el estudio científico de la variación genética humana, un gen cline puede definirse rigurosamente y someterse a métricas cuantitativas.

### Haplogrupos

En el estudio de la evolución molecular, un haplogrupo es un grupo de haplotipos similares que comparten un ancestro común con una mutación de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP). Los haplogrupos pertenecen a profundos orígenes ancestrales que datan de miles de años.
Los haplogrupos humanos más comúnmente estudiados son los haplogrupos de cromosoma Y (ADN-Y) y los haplogrupos de ADN mitocondrial (ADNmt), que pueden usarse para definir poblaciones genéticas. El ADN-Y se transmite únicamente a lo largo de la línea patrilineal, de padre a hijo, mientras que el ADNmt se transmite por la línea matrilineal, de madre a hija o hijo. El ADN-Y y el ADNmt pueden cambiar por mutación fortuita en cada generación.

### Número variable de repeticiones en tándem

Una repetición en tándem de número variable (VNTR) es la variación de la longitud de una repetición en tándem. Una repetición en tándem es la repetición adyacente de una secuencia corta de nucleótidos. Las repeticiones en tándem existen en muchos cromosomas, y su longitud varía entre los individuos. Cada variante actúa como un alelo heredado, por lo que se utilizan para la identificación personal o parental. Su análisis es útil en investigación de genética y biología, análisis forense y huellas de ADN.
Las repeticiones en tándem cortas (aproximadamente 5 pares de bases) se llaman microsatélites, mientras que las más largas se llaman minisatélites.

## Historia y distribución geográfica
### Origen africano reciente de los humanos modernos

El paradigma del origen africano de los humanos modernos supone la dispersión de poblaciones no africanas de humanos anatómicamente modernos después de hace 70,000 años. La dispersión dentro de África ocurrió significativamente antes, hace al menos 130,000 años. La teoría de "fuera de África" se origina en el siglo XIX, como una sugerencia tentativa en Origen del hombre de Charles Darwin, pero se mantuvo especulativa hasta la década de 1980, cuando fue respaldada por el estudio del ADN mitocondrial actual, combinado con evidencia de antropología física de especímenes arcaicos.
Según un estudio de 2000 de la variación de la secuencia del cromosoma Y, los cromosomas Y humanos rastrean ascendencia a África, y los descendientes del linaje derivado abandonaron África y finalmente fueron reemplazados por cromosomas Y humanos arcaicos en Eurasia. El estudio también muestra que una minoría de las poblaciones contemporáneas en África Oriental y los Joisán son los descendientes de los patrilinajes más ancestrales de humanos anatómicamente modernos que abandonaron África hace 35,000 a 89,000 años. Otra evidencia que respalda la teoría es que las variaciones en las mediciones del cráneo disminuyen con la distancia desde África al mismo ritmo que la disminución de la diversidad genética. La diversidad genética humana disminuye en las poblaciones nativas con distancia migratoria de África, y se cree que esto se debe a cuellos de botella durante la migración humana, que son eventos que reducen temporalmente el tamaño de la población.
Un estudio de agrupamiento genético de 2009, que genotipificó 1327 marcadores polimórficos en varias poblaciones africanas, identificó seis grupos ancestrales. La agrupación correspondía estrechamente con el origen étnico, la cultura y el idioma. Un estudio de secuenciación del genoma completo de 2018 de las poblaciones del mundo observó grupos similares entre las poblaciones de África. En K = 9, distintos componentes ancestrales definieron las poblaciones de habla afroasiática que habitan el norte de África y el noreste de África; las poblaciones de habla nilo-sahariana en el noreste de África y África oriental; las poblaciones de Ari en el noreste de África; las poblaciones que hablan Níger-Congo en África occidental central, África occidental, África oriental y África meridional; las poblaciones pigmeas en África Central; y las poblaciones khoisan en el sur de África.

### Genética de poblaciones

Debido a la ascendencia común de todos los humanos, solo un pequeño número de variantes tienen grandes diferencias de frecuencia entre las poblaciones. Sin embargo, algunas variantes raras en la población humana del mundo son mucho más frecuentes en al menos una población (más del 5%).
Se supone comúnmente que los primeros humanos abandonaron África y, por lo tanto, deben haber atravesado un cuello de botella en la población antes de su divergencia entre África y Eurasia hace unos 100,000 años (aproximadamente 3,000 generaciones). La rápida expansión de una población previamente pequeña tiene dos efectos importantes en la distribución de la variación genética. Primero, el llamado efecto fundador ocurre cuando las poblaciones fundadoras solo traen un subconjunto de la variación genética de su población ancestral. En segundo lugar, a medida que los fundadores se separan más geográficamente, la probabilidad de que dos individuos de diferentes poblaciones fundadoras se apareen se hace más pequeña. El efecto de este apareamiento selectivo es reducir el flujo de genes entre grupos geográficos y aumentar la distancia genética entre grupos.
La expansión de los humanos desde África afectó la distribución de la variación genética de otras dos formas. Primero, las poblaciones más pequeñas (fundadoras) experimentan una mayor deriva genética debido a las mayores fluctuaciones en los polimorfismos neutros. En segundo lugar, los nuevos polimorfismos que surgieron en un grupo tenían menos probabilidades de transmitirse a otros grupos debido a que el flujo de genes estaba restringido.
Las poblaciones en África tienden a tener menores cantidades de desequilibrio de enlace que las poblaciones fuera de África, en parte debido al mayor tamaño de las poblaciones humanas en África a lo largo de la historia humana y en parte debido a que el número de humanos modernos que abandonaron África para colonizar el resto del mundo parece haber sido relativamente bajo. En contraste, las poblaciones que han experimentado reducciones de tamaño dramáticas o expansiones rápidas en el pasado y las poblaciones formadas por la mezcla de grupos ancestrales previamente separados pueden tener niveles inusualmente altos de desequilibrio de ligamiento.

### Distribución de la variación

La distribución de variantes genéticas dentro y entre las poblaciones humanas es imposible de describir de manera sucinta debido a la dificultad de definir una "población", la naturaleza clinal de la variación y la heterogeneidad en todo el genoma. Sin embargo, en general, existe un promedio de 85% de variación genética dentro de las poblaciones locales, ~7% es entre poblaciones locales dentro del mismo continente, y ~8% de variación ocurre entre grupos grandes que viven en diferentes continentes. La teoría del origen africano para los humanos predeciría que en África existe mucha más diversidad que en otros lugares y que la diversidad debería disminuir cuanto más lejos de África se muestrea una población.

#### Variación fenotípica

El África subsahariana tiene la mayor diversidad genética humana y lo mismo se ha demostrado que es válido para la variación fenotípica en la forma del cráneo. El fenotipo está conectado al genotipo a través de la expresión génica. La diversidad genética disminuye suavemente con la distancia migratoria desde esa región, que muchos científicos creen que es el origen de los humanos modernos, y esa disminución se refleja en una disminución en la variación fenotípica. Las mediciones del cráneo son un ejemplo de un atributo físico cuya variación dentro de la población disminuye con la distancia desde África.
La distribución de muchos rasgos físicos se asemeja a la distribución de la variación genética dentro y entre las poblaciones humanas (Asociación Americana de Antropólogos Físicos, 1996). Por ejemplo, ~90% de la variación en las formas de la cabeza humana ocurre dentro de los grupos continentales, y ~10% separa los grupos, con una mayor variabilidad de la forma de la cabeza entre individuos con antepasados africanos recientes.
Una excepción prominente a la distribución común de las características físicas dentro y entre los grupos es el color de la piel. Aproximadamente el 10% de la variación en el color de la piel ocurre dentro de los grupos, y ~90% ocurre entre los grupos. Esta distribución del color de la piel y su patrón geográfico, con personas cuyos antepasados vivieron predominantemente cerca del ecuador que tienen una piel más oscura que aquellos con antepasados que vivieron predominantemente en latitudes más altas, indican que este atributo ha estado bajo una fuerte presión selectiva. La piel más oscura parece estar fuertemente seleccionada en regiones ecuatoriales para prevenir las quemaduras solares, el cáncer de piel, la fotólisis del folato y el daño a las glándulas sudoríparas.
Comprender cómo la diversidad genética en la población humana impacta varios niveles de expresión génica es un área activa de investigación. Si bien los estudios anteriores se centraron en la relación entre la variación del ADN y la expresión del ARN, los esfuerzos más recientes caracterizan el control genético de varios aspectos de la expresión génica, incluidos los estados de cromatina, traducción, y los niveles de proteína. Un estudio publicado en 2007 encontró que el 25% de los genes mostraron diferentes niveles de expresión génica entre poblaciones de ascendencia europea y asiática. Se pensaba que la causa principal de esta diferencia en la expresión génica eran los SNP en las regiones reguladoras de genes del ADN. Otro estudio publicado en 2007 encontró que aproximadamente el 83% de los genes se expresaron en diferentes niveles entre individuos y aproximadamente el 17% entre poblaciones de ascendencia europea y africana.

##### Índice de fijación de Wright como medida de variación

El genetista de poblaciones Sewall Wright desarrolló el índice de fijación (a menudo abreviado como F$_{ST}$) como una forma de medir las diferencias genéticas entre las poblaciones. Esta estadística a menudo se usa en taxonomía para comparar las diferencias entre dos poblaciones dadas midiendo las diferencias genéticas entre poblaciones para genes individuales, o para muchos genes simultáneamente. A menudo se afirma que el índice de fijación para los humanos es de aproximadamente 0,15. Esto se traduce en un estimado del 85% de la variación medida en la población humana en general se encuentra en individuos de la misma población, y aproximadamente el 15% de la variación ocurre entre poblaciones. Estas estimaciones implican que dos individuos de diferentes poblaciones tienen casi la misma probabilidad de ser más similares entre sí que cualquiera de los miembros de su propio grupo.
   "La historia evolutiva compartida de los seres humanos vivos ha resultado en una alta relación entre todas las personas vivas, como lo indica, por ejemplo, el índice de fijación muy bajo (F$_{ST}$) entre las poblaciones humanas vivas".
Richard Lewontin, quien afirmó estas proporciones, concluyó que ni la "raza" ni la "subespecie" eran formas apropiadas o útiles para describir las poblaciones humanas.
El propio Wright creía que los valores> 0,25 representan una gran variación genética y que una F$_{ST}$ de 0,15-0,25 representaba una gran variación. Sin embargo, alrededor del 5% de la variación humana ocurre entre poblaciones dentro de continentes, por lo tanto, en algunos estudios se han encontrado valores de F$_{ST}$ entre grupos continentales de humanos (o razas) tan bajos como 0.1 (o posiblemente más bajos), lo que sugiere niveles más moderados de variación genética. Se ha expresado que el F$_{ST}$ no debe usarse como un marcador del estado de subespecies, ya que la estadística se usa para medir el grado de diferenciación entre poblaciones.
Se ha criticado la aplicación de F$_{ST}$ a poblaciones humanas, encontrando que la cifra del 85% es engañosa porque implica que todas las poblaciones humanas contienen en promedio el 85% de toda la diversidad genética. Argumentan que el modelo estadístico subyacente asume incorrectamente historias de variación iguales e independientes para cada gran población humana. Un enfoque más realista es comprender que algunos grupos humanos son parentales de otros grupos y que estos grupos representan grupos parafiléticos para sus grupos de ascendencia. Por ejemplo, según la reciente teoría del origen africano, la población humana en África es parafilética para todos los demás grupos humanos porque representa el grupo ancestral del que derivan todas las poblaciones no africanas, pero más que eso, los grupos no africanos solo derivan de una pequeña muestra no representativa de esta población africana. Esto significa que todos los grupos no africanos están más estrechamente relacionados entre sí y con algunos grupos africanos (probablemente africanos del este) que con otros, y además que la migración fuera de África representó un cuello de botella genético, con gran parte de la diversidad que existía en África no siendo sacado de África por los grupos emigrados. Bajo este escenario, las poblaciones humanas no tienen cantidades iguales de variabilidad local, sino cantidades de diversidad disminuidas cuanto más lejos de África vive una población. Se ha encontrado que en lugar del 85% de la diversidad genética humana existente en todas las poblaciones humanas, alrededor del 100% de la diversidad humana existe en una sola población africana, mientras que solo alrededor del 70% de la diversidad genética humana existe en una población derivada de Nueva Guinea. Se ha argumentado que esto todavía produce una población humana global que es genéticamente homogénea en comparación con otras poblaciones de mamíferos.

### Mezcla arcaica

Existe la hipótesis de que los humanos anatómicamente modernos se cruzaron con los neandertales durante el Paleolítico Medio. En mayo de 2010, el Proyecto del Genoma de Neandertal presentó evidencia genética de que el mestizaje probablemente tuvo lugar y que un pequeño pero significativa parte de la mezcla neandertal está presente en el ADN de los euroasiáticos y oceánicos modernos, y casi ausente en las poblaciones de África subsahariana.
Se cree que entre el 4% y el 6% del genoma de los melanesios (representado por Papúa Nueva Guinea y los isleños de Bougainville) deriva de homínidos de Denisova, una especie previamente desconocida que comparte un origen común con los neandertales. Posiblemente se introdujo durante la migración temprana de los antepasados de los melanesios al sudeste asiático. Esta historia de interacción sugiere que los denisovanos alguna vez se extendieron ampliamente por el este de Asia.
Por lo tanto, los melanesios emergen como la población más arcaica mezclada, con una mezcla relacionada con Denisovan/Neanderthal de ~ 8%.
En un estudio publicado en 2013, se estudió datos de secuencia completa del genoma y encontró tasas más altas de introgresión en asiáticos en comparación con los europeos. Se probó la hipótesis de que los genomas africanos contemporáneos tienen firmas de flujo genético con ancestros humanos arcaicos y encontró evidencia de mezcla arcaica en genomas africanos, lo que sugiere que cantidades modestas de flujo genético se extendieron a lo largo del tiempo y el espacio durante la evolución de los humanos anatómicamente modernos.

## Categorización de la población mundial

Los nuevos datos sobre la variación genética humana han reavivado el debate sobre una posible base biológica para la categorización de los humanos en razas. La mayor parte de la controversia gira en torno a la cuestión de cómo interpretar los datos genéticos y si las conclusiones basadas en ellos son sólidas. Algunos investigadores argumentan que la raza autoidentificada puede usarse como un indicador de ascendencia geográfica para ciertos riesgos de salud y medicamentos.
Aunque las diferencias genéticas entre los grupos humanos son relativamente pequeñas, estas diferencias en ciertos genes como duffy, ABCC11, SLC24A5, llamados marcadores informativos de ascendencia (AIM), sin embargo, pueden usarse para ubicar de manera confiable a muchos individuos dentro de agrupaciones geográficas amplias. Por ejemplo, los análisis informáticos de cientos de loci polimórficos muestreados en poblaciones distribuidas globalmente han revelado la existencia de agrupaciones genéticas que se asocian aproximadamente con grupos que históricamente han ocupado grandes regiones continentales y subcontinentales.
Algunos comentaristas han argumentado que estos patrones de variación proporcionan una justificación biológica para el uso de categorías raciales tradicionales. Argumentan que los agrupamientos continentales se corresponden aproximadamente con la división de los seres humanos en africanos subsaharianos; europeos, asiáticos occidentales, asiáticos centrales, asiáticos meridionales y africanos del norte; asiáticos del este, sudeste asiático, polinesios y nativos americanos; y otros habitantes de Oceanía (melanesios, micronesios y aborígenes australianos). Otros observadores no están de acuerdo, diciendo que los mismos datos socavan las nociones tradicionales de grupos raciales. Señalan, por ejemplo, que las poblaciones principales consideradas razas o subgrupos dentro de las razas no forman necesariamente sus propios grupos.
Además, debido a que la variación genética humana es clinal, muchos individuos se afilian a dos o más grupos continentales. Por lo tanto, la "ascendencia biogeográfica" de base genética asignada a una persona determinada generalmente se distribuirá ampliamente y estará acompañada de incertidumbres considerables.
En muchas partes del mundo, los grupos se han mezclado de tal manera que muchos individuos tienen antepasados relativamente recientes de regiones muy separadas. Aunque los análisis genéticos de un gran número de loci pueden producir estimaciones del porcentaje de los antepasados de una persona que provienen de varias poblaciones continentales, estas estimaciones pueden asumir un carácter distintivo falso de las poblaciones parentales, ya que Los grupos humanos han intercambiado parejas de escalas locales a continentales a lo largo de la historia. Incluso con un gran número de marcadores, la información para estimar las proporciones de mezcla de individuos o grupos es limitada y las estimaciones suelen tener amplios intervalos de confianza.

### Agrupación genética

Los datos genéticos se pueden utilizar para inferir la estructura de la población y asignar individuos a grupos que a menudo se corresponden con su ascendencia geográfica autoidentificada. Se ha argumentado que:
   "...el análisis de muchos loci ahora produce estimaciones razonablemente precisas de similitud genética entre individuos, en lugar de poblaciones. La agrupación de individuos se correlaciona con el origen geográfico o la ascendencia".
Sin embargo, la identificación por origen geográfico puede romperse rápidamente cuando se considera la ascendencia histórica compartida entre individuos en el tiempo.
En 2009 se publicó un análisis de los datos de SNP autosómicos del Proyecto Internacional HapMap (Fase II) y del Panel de Diversidad del Genoma Humano del CEPH. El estudio de 53 poblaciones tomadas de los datos de HapMap y CEPH (1138 individuos no relacionados) sugirió que la selección natural puede dar forma al genoma humano mucho más lentamente de lo que se pensaba anteriormente, con factores como la migración dentro y entre continentes que influyen más fuertemente en la distribución de variaciones genéticas. Un estudio similar publicado en 2010 encontró una fuerte evidencia de selección en todo el genoma debido a cambios en la ecorregión, la dieta y la subsistencia, particularmente en relación con las ecorregiones polares, con la búsqueda de alimento y con una dieta rica en raíces y tubérculos. En un estudio de 2016, el análisis de componentes principales de datos de todo el genoma fue capaz de recuperar objetivos previamente conocidos para la selección positiva (sin una definición previa de poblaciones), así como una serie de nuevos genes candidatos.

### Antropología Forense

Los antropólogos forenses pueden determinar aspectos de la ascendencia geográfica (es decir, asiáticos, africanos o europeos) de restos óseos con un alto grado de precisión mediante el análisis de las medidas esqueléticas. Según algunos estudios, los métodos de prueba individuales, como las mediciones de la mitad del rostro y los rasgos del fémur, pueden identificar la ascendencia geográfica y, por extensión, la categoría racial a la que se habría asignado a un individuo durante su vida, con más del 80% de precisión y en combinación puede ser incluso más precisa. Sin embargo, los esqueletos de personas que tienen ascendencia reciente en diferentes regiones geográficas pueden exhibir características de más de un grupo ancestral y, por lo tanto, no pueden identificarse como pertenecientes a un solo grupo ancestral.

### Flujo y mezcla de genes

El flujo de genes entre dos poblaciones reduce la distancia genética promedio entre las poblaciones, solo las poblaciones humanas totalmente aisladas no experimentan flujo de genes y la mayoría de las poblaciones tienen un flujo de genes continuo con otras poblaciones vecinas que crean la distribución clinal observada para la variación genética de la polilla. Cuando el flujo de genes tiene lugar entre poblaciones genéticas bien diferenciadas, el resultado se denomina "mezcla genética".
El mapeo de mezclas es una técnica que se utiliza para estudiar cómo las variantes genéticas causan diferencias en las tasas de enfermedad entre la población. Las poblaciones de mezclas recientes que rastrean su ascendencia a múltiples continentes son muy adecuadas para identificar genes de rasgos y enfermedades que difieren en la prevalencia entre las poblaciones parentales. Las poblaciones afroamericanas han sido el centro de numerosos estudios de mapeo genético y de mezclas de poblaciones, incluidos estudios de rasgos genéticos complejos como el recuento de glóbulos blancos, el índice de masa corporal, el cáncer de próstata y la enfermedad renal.
Se llevó a cabo un análisis de la variación fenotípica y genética, incluido el color de la piel y el estado socioeconómico, en la población de Cabo Verde, que tiene una historia bien documentada de contacto entre europeos y africanos. Los estudios mostraron que el patrón de mezcla en esta población ha sido sesgado por el sexo y hay interacciones significativas entre el estatus socioeconómico y el color de la piel independientemente del color y la ascendencia de la piel. Otro estudio muestra un mayor riesgo de complicaciones de la enfermedad de injerto contra huésped después del trasplante debido a variantes genéticas en el antígeno leucocitario humano (HLA) y las proteínas no HLA.

## Salud

Las diferencias en la frecuencia de los alelos contribuyen a diferencias de grupo en la incidencia de algunas enfermedades monogénicas y pueden contribuir a diferencias en la incidencia de algunas enfermedades comunes. Para las enfermedades monogénicas, la frecuencia de los alelos causales generalmente se correlaciona mejor con la ascendencia, ya sea familiar (por ejemplo, síndrome de Ellis-van Creveld entre los amish de Pensilvania) o étnica, enfermedad de Tay-Sachs entre las poblaciones judías asquenazíes) o geográfica (hemoglobinopatías entre personas con antepasados que vivieron en regiones palúdicas). En la medida en que la ascendencia se corresponda con grupos o subgrupos raciales o étnicos, la incidencia de enfermedades monogénicas puede diferir entre los grupos categorizados por raza o etnia, y los profesionales de la salud suelen tener en cuenta estos patrones al realizar diagnósticos.
Incluso con enfermedades comunes que involucran numerosas variantes genéticas y factores ambientales, los investigadores señalan evidencia que sugiere la participación de alelos distribuidos diferencialmente con efectos pequeños a moderados. Los ejemplos citados con frecuencia incluyen hipertensión, diabetes, obesidad y cáncer de próstata. Sin embargo, en ninguno de estos casos se ha demostrado que la variación alélica en un gen de susceptibilidad explica una fracción significativa de la diferencia en la prevalencia de la enfermedad entre los grupos, y el papel de los factores genéticos en la generación de estas diferencias sigue siendo incierto.
Algunas otras variaciones, por otro lado, son beneficiosas para los humanos, ya que previenen ciertas enfermedades y aumentan la posibilidad de adaptarse al medio ambiente. Por ejemplo, mutación en el gen CCR5 que protege contra el SIDA. El gen CCR5 está ausente en la superficie de la célula debido a una mutación. Sin el gen CCR5 en la superficie, no hay nada a lo que los virus del VIH se adhieran y se unan. Por lo tanto, la mutación en el gen CCR5 disminuye la posibilidad de que una persona corra el riesgo de padecer SIDA. La mutación en CCR5 también es bastante popular en ciertas áreas, con más del 14% de la población portadora de la mutación en Europa y alrededor del 6-10% en Asia y África del Norte.
Aparte de las mutaciones, muchos genes que pueden haber ayudado a los humanos en la antigüedad afectan a los humanos en la actualidad. Por ejemplo, se sospecha que los genes que permiten a los humanos procesar los alimentos de manera más eficiente son los que hacen que las personas sean susceptibles a la obesidad y la diabetes en la actualidad.
Neil Risch de la Universidad de Stanford ha propuesto que la raza/grupo étnico autoidentificado podría ser un medio válido de categorización en los EE. UU. para consideraciones de salud pública y políticas. Un artículo de 2002 del grupo de Noah Rosenberg hace una afirmación similar:
   La estructura de las poblaciones humanas es relevante en varios contextos epidemiológicos. Como resultado de la variación en la frecuencia de factores de riesgo tanto genéticos como no genéticos, las tasas de enfermedad y de fenotipos como la respuesta adversa al fármaco varían entre las poblaciones. Además, la información sobre la población de origen de un paciente podría proporcionar a los profesionales de la salud información sobre el riesgo cuando se desconocen las causas directas de la enfermedad.
Sin embargo, en 2018 Noah Rosenberg publicó un estudio que argumentaba en contra de las ideas genéticamente esencialistas de las disparidades de salud entre las poblaciones, afirmando que las variantes ambientales son una causa más probable Interpretación de puntajes poligénicos, adaptación poligénica y diferencias fenotípicas humanas

## Proyectos de genoma

Los proyectos del genoma humano son esfuerzos científicos que determinan o estudian la estructura del genoma humano. El Proyecto Genoma Humano fue un proyecto genómico histórico.