# Liste bayerischer Klöster und Stifte

Die Liste bayerischer Klöster und Stifte enthält bestehende und ehemalige Klöster und Stifte im heutigen Bundesland Bayern. In Bayern sind über 500 Klöster bekannt.

## Liste

| Ort | Kloster | Bistum | Orden | ♂/♀ | Gründung | Schließung | Bemerkung |
| A |||||||||
| Abenberg | Kloster Marienburg | Bistum Eichstätt | SSM (CBMV) | ♀ | 1142 1920 | 1806* | 1806 geschlossen, 1920 wieder besiedelt als Mutterhaus der Kongregation der Schwestern von der Schmerzhaften Mutter |
| Abensberg | Kloster Abensberg | Bistum Regensburg | OCarm | ♂ | 1389 | 1802 | Aufgelöst Brüder sind nach Säkularisation in den Karmel nach Straubing übersiedelt |
| Aldersbach | Kloster Aldersbach | Bistum Passau | OCist | ♂ | 1120 | 1803 | Aufgelöst Seit 1146 Zisterzienser, davor Augustiner-Chorherren |
| Allmannshofen | Kloster Holzen | Bistum Augsburg | OSB | ♀ | 1150 | 1802 | Aufgelöst |
| Altenmarkt an der Alz | Kloster Baumburg | Erzbistum München und Freising | CanReg | ♂ | 1107 | 1803 | Aufgelöst |
| Altmannstein | Kloster Schamhaupten | Bistum Regensburg | CanReg | ♂ | 1137 | 1606 | Aufgelöst nach einigen Jahrzehnten des Leerstandes Heute ist nur noch die ehem. Klosterkirche erhalten, diese dient als Pfarrkirche |
| Altomünster | Kloster Altomünster | Erzbistum München und Freising | OSsS (OSB) | ♂/♀ | 970 | 1803 | Aufgelöst Ursprünglich Benediktinerkloster, ab 1488 Doppelkloster des Erlöserordens, später nur Schwesternkloster |
| Altötting | Kloster St. Joseph | Bistum Passau | CJ | ♀ | 1720 | | War während von 1809-23 Filiale des Instituts der Englischen Fräulein von Burghausen |
| Altötting | Bruder-Konrad-Kloster | Bistum Passau | OFMCap (OFMRef) | ♂ | 1654 | | Hier lebte der hl. Bruder Konrad Im Zuge der Säkularisation 1803 wurden die Franziskaner vertrieben, es wurde Aussterbekloster für vertriebene Kapuziner aus ganz Bayern an. Unter König Ludwig I. konnte es als Kapuzinerkloster weiterbestehen. 1961 von Kloster St. Anna in Bruder-Konrad-Kloster umbenannt. |
| Altötting | Kloster St. Magdalena | Bistum Passau | OSPPE (SJ) (CSsR) (OFMCap) | ♂ | 1591 1841 | 1771* | Ursprünglich als Jesuitenkloster erbaut, die zur Wallfahrtsseelsorge nach Altötting gerufen wurden. Mit der Auflösung des Jesuitenordens 1771 wurde auch das Kloster aufgelöst. 1841-1873 Redemptoristenkloster Ab 1874 Kapuzinerkloster Seit 2022 leben polnische Paulinermönche in St. Magdalena |
| Altötting | Provinzhaus Hl. Kreuz | Bistum Passau | CSSC | ♀ | 1915 | | Das Kloster der Menzinger Schwestern beinhaltet auch die Herz Jesu Anbetungskirche |
| Altötting | Kollegiatstift Altötting | Bistum Passau | | ♂ | 1228 1930 | 1803* | Ursprünglich als Benediktinerkloster gegründet (876-907) 1930 wurde das Kollegiatstift als Ehrenkanonikatsstift St. Rupertus wiederbelebt. Seither besetzen überwiegend pensionierte Priester der Diözese Passau das Stiftskapitel. |
| Amberg | Kloster St. Augustinus | Bistum Regensburg | OVM | ♀ | 1692 | 1804 | Aufgelöst |
| Amberg | Franziskanerkloster Amberg | Bistum Regensburg | OFMRef | ♂ | 1452 | 1802 | Aufgelöst |
| Amberg | Franziskanerkloster Maria Hilf | Bistum Regensburg | OFM | ♂ | 1832 | | Ursprünglich Filiale des Stadtklosters, wurde 1802 ebenfalls aufgelöst. 1832 zur Betreuung der Wallfahrt wieder errichtet, seit 2007 polnische Franziskaner aus Krakau |
| Amberg | Paulanerkloster Amberg | Bistum Regensburg | OMinim | ♂ | 1652 | 1803 | Aufgelöst Ehem. Klosterkirche ist heute evangelische Pfarrkirche |
| Amorbach | Kloster Amorbach | Bistum Würzburg | OSB | ♂ | 734 | 1803 | Aufgelöst Ehem. Klosterkirche ist heute evangelische Pfarrkirche |
| Andechs | Kloster Andechs | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 1455 | | Zwischenzeitlich von 1803-50 aufgehoben, als Priorat der Abtei St. Bonifaz München wieder errichtet. |
| Ansbach | Kloster und Kollegiatstift St. Gumbertus | Erzbistum Bamberg | OSB | ♂ | 748 | 1563 | Aufgelöst Ab 1012 Kollegialstift |
| Aschaffenburg | Kloster St. Maria | Bistum Würzburg | CJ | ♀ | 1747 | 2013 | Aufgelöst |
| Aschaffenburg | Kollegiatstift Aschaffenburg | Bistum Würzburg | | ♂ | 974 | 1588 | Aufgelöst |
| Auerbach in der Oberpfalz | Kloster Michelfeld | Erzbistum Bamberg | OSB | ♂ | 1119 | 1803 | Aufgelöst Zwischenzeitlich von 1556-1669 bereits aufgelöst |
| Auerbach in der Oberpfalz | Provinzhaus der Auerbacher Schulschwestern | Erzbistum Bamberg | deND | ♀ | 1945 | | Deutsche Niederlassung der böhmischen Schulschwestern von Unserer Lieben Frau |
| Aufhausen | Kloster Aufhausen | Bistum Regensburg | CO (OSB) | ♂ | 1692 2012 | 1978* | Benediktinerkloster 1978 aufgehoben seit 2012: Kongregation des Oratoriums des hl. Philipp Neri |
| Augsburg | Kloster Hl. Kreuz | Bistum Augsburg | OP (CanReg) | ♂ | 1143 1936 | 1802* | Augustinerchorherrenstift in der Säkularisation aufgelöst, 1936 durch die Dominikaner wieder besiedelt. |
| Augsburg | Franziskanerinnenkloster Maria Stern | Bistum Augsburg | OSF | ♀ | 1258 1828 | 1803* | Zwischenzeitlich von 1803-28 aufgehoben |
| Augsburg | Kloster St. Georg | Bistum Augsburg | CanReg | ♂ | 1153 | 1802 | Aufgelöst |
| Augsburg | Kloster St. Martin | Bistum Augsburg | OSF | ♀ | 1263 | 1533 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Augsburg | Kollegiatstift St. Moritz | Bistum Augsburg | | ♂ | 1019 | 1803 | Aufgelöst |
| Augsburg | Kollegiatstift St. Peter am Perlach | Bistum Augsburg | | ♂ | 1067 | 1803 | Aufgelöst |
| Augsburg | Kloster St. Sebastian | Bistum Augsburg | OFMCap | ♂ | 1601 | 2008 | Aufgelöst Zwischenzeitlich von 1809-43 bereits aufgehoben. |
| Augsburg | Kloster St. Stephan | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 989 1853 | 1803* | ab 13. Jh. ein Kanonissenstift, ab dem 15. Jh. bis 1803 ein säkulares Damenstift, seit der Wiedergründung 1835 Benediktinerabtei |
| Augsburg | Kloster St. Ulrich und Afra | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 1006 | 1802 | Aufgelöst Von 1577 bis 1802 Reichsabtei |
| Augsburg | Benediktinerinnenkloster Augsburg | Bistum Augsburg | OSB | ♀ | 1262 | 1537 | Aufgelöst |
| Augsburg | Dominikanerinnenkloster St. Ursula | Bistum Augsburg | OP | ♀ | 1355 | | Zwischenzeitlich von 1803-28 aufgehoben |
| Augsburg | Franziskanerkloster Augsburg | Bistum Augsburg | OFM | ♂ | 1211 | 1807 | Aufgelöst Zwischenzeitlich von 1526-1614 aufgehoben |
| Augsburg | Kloster Herz Jesu | Bistum Augsburg | CJ | ♀ | 1662 | 1803 | Aufgelöst |
| Augsburg | Karmelitenkloster Augsburg | Bistum Augsburg | OCarm | ♂ | 1275 | 1803 | Aufgelöst Zwischenzeitlich von 1534-1637 aufgehoben |
| Augsburg | Kloster bei der Horbruck | Bistum Augsburg | OFMConv | ♀ | 1406 | 1533 | Aufgelöst, Kloster der Terziarinnen der Minoriten |
| Augsburg | Terziarinnenkloster St. Martin | Bistum Augsburg | OFMConv | ♀ | 1263 | 1533 | Aufgelöst |
| Auhausen | Kloster Auhausen | Bistum Eichstätt | OSB | ♂ | 959 | 1534 | vom Markgrafen in der Reformation aufgelöst |
| Aura an der Saale | Kloster Aura | Bistum Würzburg | OSB | ♂ | 1108 | 1564 | Aufgelöst |
| Aurachtal | Kloster Münchaurach | Erzbistum Bamberg | OSB | ♂ | 1139 | 1532 | Aufgelöst |
| B |||||||||
| Babenhausen | Kloster Klosterbeuren | Bistum Augsburg | OFM | ♀ | 1273 | 1803 | Aufgelöst |
| Bad Brückenau | Kloster Volkersberg | Bistum Würzburg | OFM | ♂ | 1658 | 1966 | Aufgelöst Heute eine Jugendbegegnungsstätte der Diözese Würzburg |
| Bad Grönenbach | Kollegiatstift St. Philipp und Jakob | Bistum Augsburg | | ♂ | 1479 | 1804 | Aufgelöst |
| Bad Kissingen | Kloster Hausen | Bistum Würzburg | OPraem | ♀ | 1161 | 1581 | Aufgelöst |
| Bad Königshofen im Grabfeld | Kloster St. Johanniszelle unter Wildberg | Bistum Würzburg | OCist | ♀ | 1209 | 1555 | Aufgelöst |
| Bad Königshofen im Grabfeld | Kloster Königshofen | Bistum Würzburg | OFMCap | ♂ | 1647 | 1973 | Aufgelöst Bis auf die Klosterkirche abgerissen |
| Bad Neustadt an der Saale | Kloster Neustadt an der Saale | Bistum Würzburg | OCarm | ♂ | 1352 | 1803 | Aufgelöst |
| Bad Reichenhall | Kloster St. Zeno | Erzbistum München und Freising | CanReg (OSB) | ♂ | 803 1136 | 1803 | Aufgelöst Als Benediktinerkloster gegründet, später Kanonikerstift und ab 1136 Augustiner-Chorherren |
| Bad Staffelstein | Kloster Vierzehnheiligen | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1839 | | Von 1744–1803 Zisterzienser |
| Bad Tölz | Franziskanerkloster Tölz | Erzbistum München und Freising | OFMRef | ♂ | 1330 | 2008 | Aufgelöst Zwischenzeitlich von 1802–1828 aufgehoben |
| Bad Windsheim | Kloster Windsheim | Erzbistum Bamberg | OESA | ♂ | 1291 | 1525 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Bad Wörishofen | Kloster Wörishofen | Bistum Augsburg | OP | ♀ | 1243 | | Zwischenzeitlich von 1802-42 aufgehoben Beherbergt das Kneipp-Museum |
| Bamberg | Kollegiatstift St. Gangolf | Erzbistum Bamberg | | ♂ | 1057 | 1806 | Aufgelöst |
| Bamberg | Kollegiatstift St. Jakob | Erzbistum Bamberg | | ♂ | 1109 | 1803 | Aufgelöst |
| Bamberg | Kollegiatstift St. Stephan | Erzbistum Bamberg | | ♂ | 1007 | 1803 | Aufgelöst Heute evangelische Pfarrkirche |
| Bamberg | Antoniterkloster Bamberg | Erzbistum Bamberg | CRSAnt | ♂ | 1454 | 1548 | Aufgelöst |
| Bamberg | Dominikanerkloster Bamberg | Erzbistum Bamberg | OP | ♂ | 1310 | 1806 | Aufgelöst Ehem. Klosterkirche ist heute Aula der Universität |
| Bamberg | Franziskanerkloster Bamberg | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1223 | 1806 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Bamberg | Kapuzinerkloster Bamberg | Erzbistum Bamberg | OFMCap | ♂ | 1636 | 1804 | Aufgelöst und später abgerissen |
| Bamberg | Karmelitenkloster St. Theodor | Erzbistum Bamberg | OCarm | ♂ | 1589 | | ursprünglich Zisterzienserinnen (1003-1545) zwischenzeitlich von 1802–1902 aufgehoben |
| Bamberg | Klarissenkloster Bamberg | Erzbistum Bamberg | OSCI | ♀ | 1341 | 1803 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Bamberg | Dominikanerinnenkloster Hl. Grab | Erzbistum Bamberg | OP | ♀ | 1365 | | Zwischenzeitlich von 1803–1926 aufgehoben |
| Bamberg | Kloster Mariä Himmelfahrt | Erzbistum Bamberg | CJ | ♀ | 1716 | | |
| Bamberg | Kloster Michelsberg | Erzbistum Bamberg | OSB | ♂ | 1015 | 1803 | Aufgelöst Birgt heute ein Altenheim und Teile der Bamberger Stadtverwaltung In der Kirche ist das Grab des Hl. Bischofs Otto |
| Bastheim | Kloster Wechterswinkel | Bistum Würzburg | OCist | ♀ | 1140 | 1574 | Aufgelöst |
| Bayreuth | Kloster St. Jobst | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1506 | 1529 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Bechhofen an der Heide | Kloster Königshofen | Bistum Eichstätt | CBMV | ♀ | 1422 | 1495 | Aufgelöst Chorfrauen übersiedelten nach Kloster Marienburg |
| Benediktbeuern | Kloster Benediktbeuern | Bistum Augsburg | SDB (OSB) | ♂ | 8. Jh. 1930 | 1803* | Benediktinerabtei 1803 säkularisiert, seit 1930 Salesianerkloster Beherbergt die Philosophisch-Theologische Hochschule Benediktbeuern |
| Berching | Propstei Berching | Bistum Eichstätt | OESSH | ♂ | 1158 | 1312 | Aufgelöst |
| Berching | Kloster Berching | Bistum Eichstätt | OFMCap OFM | ♂/♀ | 1721 | 1806 | Aufgelöst Bis 1738 als Hospitium Berching der Kapuziner, danach Koster der Franziskaner/innen |
| Berching | Kloster Plankstetten | Bistum Eichstätt | OSB | ♂ | 1129 | | Zwischenzeitlich von 1806–1904 aufgehoben |
| Berchtesgaden | Chorherrenstift Berchtesgaden | Erzbistum München und Freising | CanReg | ♂ | 1102 | 1803 | Aufgelöst Ab 1559 als Fürstpropstei ein eigenständiges Territorium |
| Berchtesgaden | Franziskanerkloster Berchtesgaden | Erzbistum München und Freising | OFMRef (CBMV) | ♂ (♀) | 1400 1695 | 1564* | Von 1400-1564 Augustiner Chorfrauenstift Ab 1695 Franziskanerkloster, seit 1987 von polnischen Brüdern bewohnt. Zwischenzeitlich von 1822-59 aufgehoben |
| Berg | Kloster Aufkirchen | Erzbistum München und Freising | OCD OESA | ♀ (♂) | 1686 1896 | 1803* | Von 1689-1803 Augustinerkloster, seit 1896 Karmelitinnenkloster |
| Berg bei Neumarkt in der Oberpfalz | Kloster Gnadenberg | Bistum Eichstätt | OCsS | ♀ | 1422 | 1563 | Aufgelöst und verfallen |
| Berg im Gau | Kloster Berg im Donaugau | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 772 | 885 | Aufgelöst |
| Bernried | Kloster Bernried | Bistum Augsburg | OSB (CanReg) | ♀ (♂) | 1121 1949 | 1803* | Von 1121-1803 Augustiner-Chorherrenstift Seit 1949 Kloster der Missionsbenediktinerinnen |
| Biberbach | Kloster Salmannshofen | Bistum Augsburg | TOR | ♀ | 1281 | 1401 | Aufgelöst |
| Biburg | Kloster Biburg | Bistum Regensburg | OSB SJ | ♂ | 1125 1589 | 1555 1809 | Aufgelöst Von 1125-1555 Benediktiner-, von 1589-1809 Jesuitenkloster |
| Bischofsheim in der Rhön | Kloster Bischofsheim | Bistum Würzburg | OFM | ♂ | 1646 | 1692 | Aufgelöst |
| Bischofsheim in der Rhön | Kloster Kreuzberg | Bistum Würzburg | OFM | ♂ | 1692 | | Zur Betrung der Wallfahrt am Kreuzberg, dem bedeutendsten Wallfahrtsort Frankens gegründet. |
| Bogen | Kloster Oberalteich | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 1080 | 1803 | Aufgelöst |
| Breitenbrunn | Kloster Bedernau | Bistum Augsburg | OFESW | ♂ | 1250 | 1263 | Aufgelöst |
| Brennberg | Kloster Frauenzell | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 1351 1590 | 1522 1803 | Aufgelöst |
| Burghausen | Kloster Heilig Schutzengel | Erzbistum München und Freising | CJ | ♀ | 1683 | 2018 | Zwischenzeitlich von 1816-26 aufgehoben |
| Burghausen | Kloster Raitenhaslach | Erzbistum München und Freising | OCist | ♂ | 1143 | 1803 | Aufgelöst |
| Burghausen | Kapuzinerkloster St. Anna | Erzbistum München und Freising | OFMCap | ♂ | 1618 | 1994 | Aufgelöst Hier lebte als Novize der Hl. Bruder Konrad Ab 1892 beherbergte es auch das Studienseminar St. Konrad |
| Burglengenfeld | Kloster Burglengenfeld | Bistum Regensburg | OFMCap | ♂ | 1706 | 1802 | Aufgelöst |
| Burkardroth | Kloster Frauenroth | Bistum Würzburg | OCist | ♀ | 1231 | 1574 | Aufgelöst |
| Buxheim (Schwaben) | Kloster Buxheim | Bistum Augsburg | SDB (CanReg) (OCart) | ♂ | 1100 1926 | 1802* | Von 1402-1802 Kartäuserkloster, ab 1548 Reichskartause Seit 1926 Niederlassung der Salesianer Don Boscos |
| C |||||||||
| Cham | Franziskanerkloster Cham | Bistum Regensburg | OFMRef | ♂ | 1631 | 1802 | Aufgelöst |
| Cham | Redemptoristenkloster Cham | Bistum Regensburg | CSsR | ♂ | 1900 | | |
| Cham | Kloster Chammünster | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 739 | 925 | Im Zuge der Ungarnkriege zerstört und aufgelöst |
| Cham | Kloster Maria Hilf | Bistum Regensburg | CSsR | ♂ | 1900 | | |
| Chiemsee | Kloster Frauenchiemsee | Erzbistum München und Freising | OSB | ♀ | 782 | | Auch Abtei Frauenwörth genannt 1803 aufgelöst, jedoch unter Fortbestand des Konvents, 1836 durch König Ludwig I. von Bayern wiedererricht |
| Chiemsee | Kloster Herrenchiemsee | Erzbistum München und Freising | CanReg | ♂ | 629 | 1803 | Aufgelöst Die Klosterkirche diente von 1216 bis 1807 als Kathedrale des Bistums Chiemsee |
| Coburg | Kloster St. Peter und Paul | Erzbistum Bamberg | OSB | ♂ | 1074 | 1524 | Aufgelöst |
| Coburg | Franziskanerkloster Coburg | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1250 | 1525 | Aufgelöst |
| D |||||||||
| Deggendorf | Kapuzinerkloster Deggendorf | Bistum Regensburg | OFMCap | ♂ | 1627 | 1802 | Aufgelöst |
| Dettelbach | Franziskanerkloster Dettelbach | Bistum Würzburg | OFM | ♂ | 1617 | 2017 | Aufgelöst Die Patres betreuten neben den Pfarreien v. a. die Wallfahrt nach Maria im Sand |
| Dießen am Ammersee | Kloster St. Alban | Bistum Augsburg | OSB | ♀ | 1923 | | |
| Dießen am Ammersee | Kloster Dießen | Bistum Augsburg | CanReg | ♂ | 1114 | 1803 | Aufgelöst Im 10. Jahrhundert bereits als Frauenkloster existent |
| Dietfurt an der Altmühl | Kloster Dietfurt | Bistum Eichstätt | OFMRef | ♂ | 1660 | | Zwischenzeitlich von 1802-27 aufgehoben |
| Dietramszell | Kloster Dietramszell | Erzbistum München und Freising | OVM (CanReg) | ♀ (♂) | 1098 1831 | 1803* | Von 1098-1803 Augustiner-Chorherrenstift, seit 1831 Kloster der Salesianerinnen |
| Dillingen an der Donau | Kollegiatstift St. Peter | Bistum Augsburg | | ♂ | 1498 | 1803 | Aufgelöst Ehem. Stiftskirche heute Konkathedrale der Diözese |
| Dillingen an der Donau | Franziskanerinnenkloster Dillingen | Bistum Augsburg | OSF | ♀ | 1241 | | Mutterhaus der Dillinger Franziskanerinnen |
| Dingolfing | Franziskanerkloster Dingolfing | Bistum Regensburg | OFMConv (OFMRef) | ♂ | 1642 1975 | 1802* | Seit 1975 Minoriten |
| Dinkelsbühl | Kapuzinerkloster Dinkelsbühl | Bistum Augsburg | OFMCap | ♂ | 1622 | 1803 | Aufgelöst |
| Dinkelsbühl | Karmelitenkloster Dinkelsbühl | Bistum Augsburg | OCarm | ♂ | 1290 | 1803 | Aufgelöst und abgerissen, heute Kirche St. Paul |
| Dombühl | Kloster Sulz | Erzbistum Bamberg | OPraem | ♀ | 1200 | 1556 | Aufgelöst |
| Donauwörth | Kloster Hl. Kreuz | Bistum Augsburg | MSC (OSB) | ♂ | 1040 1935 | 1803* | Von 1040-1803 Benediktinerabtei, seit 1935 Kloster der Herz-Jesu-Missionare |
| Donauwörth | Kapuzinerkloster Donauwörth | Bistum Augsburg | OFMCap | ♂ | 1630 | 1802 | Aufgelöst |
| Dorfen | Kloster Tegernbach | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 8. Jh. | 935 | Aufgelöst |
| E |||||||||
| Ebersberg | Kloster Ebersberg | Erzbistum München und Freising | SJ OSB CanReg | ♂ | 964 | 1773 | Aufgelöst Von 964 bis 1013 Augustiner-Chorherrenstift Von 1013 bis 1595 Benediktinerkloster Von 1595 bis 1773 Kloster der Jesuiten |
| Ebrach | Kloster Ebrach | Kloster Ebrach | OCist | ♂ | 1127 | 1803 | Aufgelöst Beherbergt heute die Justizvollzugsanstalt |
| Echenbrunn | Kloster Echenbrunn | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 1122 | 1556 | Aufgelöst |
| Ederheim | Kloster Christgarten | Bistum Augsburg | OCart | ♂ | 1358 | 1649 | Aufgelöst und größtenteils abgerissen. Ehem. Klosterkirche ist heute evangelische Pfarrkirche |
| Eggenfelden | Kloster Eggenfelden | Bistum Regensburg | OFMRef | ♂ | 1649 | 2013 | Aufgelöst Zwischenzeitlich von 1802 bis 1841 aufgehoben |
| Eichstätt | Kloster Hl. Geist | Bistum Eichstätt | CanReg | ♂ | 1216 | 1592 | Aufgelöst |
| Eichstätt | Kollegiatstift St. Willibald | Bistum Eichstätt | | ♂ | 1276 | 1806 | Aufgelöst War am Eichstätter Dom ansässig |
| Eichstätt | Kloster Herz Jesu | Bistum Eichstätt | CBMV | ♀ | 1711 | 1809 | Aufgelöst |
| Eichstätt | Dominikanerkloster Eichstätt | Bistum Eichstätt | OP | ♂ | 1275 | 1806 | Aufgelöst |
| Eichstätt | Schottenkloster Eichstätt | Bistum Eichstätt | CP (OSB) (OFMCap) | ♂ | 1166 1623 2012 | 1483* 2009* | Ursprünglich Kloster von schottischen Benediktinern, von 1623-1806 und 1826–2009 Kapuzinerkloster Seit 2012 Niederlassung der Passionisten |
| Eichstätt | Kollegiatstift U. l. Frau | Bistum Eichstätt | | ♂ | 1318 | 1806 | Aufgelöst |
| Eichstätt | Kloster Marienstein | Bistum Eichstätt | CBMV | ♀ | 1460 | 1832 | Aufgelöst |
| Eichstätt | Kloster Rebdorf | Bistum Eichstätt | MSC (CanReg) | ♂ | 1156 1958 | 1806* | Von 1154-1809 Augustiner-Chorherrenstift Seit 1958 Kloster der Herz-Jesu-Missionare |
| Eichstätt | Kloster St. Walburg | Bistum Eichstätt | OSB | ♀ | 879 | | Grabstätte der Hl. Walburga |
| Eichstätt | Salesianum Rosental | Bistum Eichstätt | SDB | ♂ | 1934 | | Süddeutsches Haupthaus der Kongregation der Oblaten des hl. Franz von Sales |
| Elchingen | Kloster Elchingen | Bistum Augsburg | OSB OMI | ♂ | 1120 1921 | 1802 2009 | Aufgelöst Von 1485 bis 1802 Reichsabtei |
| Ellingen | Franziskanerkloster Ellingen | Bistum Eichstätt | OFM | ♂ | 1736 | 1809 | Aufgelöst |
| Elsenfeld | Kloster Himmelthal | Bistum Würzburg | OCist | ♀/♂ | 1232 1595 | 1568 1773 | Aufgelöst Von 1232 bis 1568 Zisterzienserinnenabtei, von 1595 bis 1773 Kloster der Jesuiten |
| Engelthal | Kloster Engelthal | Bistum Eichstätt | OP | ♀ | 1240 | 1552 | Aufgelöst |
| Ensdorf | Kloster Ensdorf | Bistum Regensburg | SDB (OSB) | ♂ | 1121 1920 | 1802* | Ursprünglich Benediktinerkloster, zwischenzeitlich von 1556 bis 1669 aufgehoben Seit 1920 Salesianerkloster |
| Erding | Kloster Erding | Erzbistum München und Freising | OFMCap | ♂ | 1692 | 1802 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Eresing | Erzabtei St. Ottilien | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 1887 | | Die Erzabtei ist das Stammkloster der Ottilianer Kongregation |
| Erlangen | Kloster Frauenaurach | Erzbistum Bamberg | OP | ♀ | 1267 | 1549 | Aufgelöst Heute evangelische Pfarrkirche |
| Erlangen | Karmelitinnenkloster Erlangen-Büchenbach | Erzbistum Bamberg | OCarm | ♀ | 1969 | | |
| Erlangen | Karmelitenkloster Erlangen-Bruck | Erzbistum Bamberg | OCarm | ♂ | 1967 | | Betreuung der Pfarrei Hl. Kreuz in Erlangen-Bruck |
| Essing | Kollegiatstift Neuessing | Bistum Regensburg | | ♂ | 1367 | 1610 | Aufgelöst Später Niederlassung von Jesuiten und Maltesern |
| Ettal | Kloster Ettal | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 1330 | | Zwischenzeitlich von 1803–1900 aufgehoben Klosterkirche ist seit 1920 Basilica minor |
| Eurasburg | Kloster Beuerberg | Erzbistum München und Freising | CanReg OVM | ♂/♀ | 1121 1858 | 1803 2014 | Aufgelöst Ursprünglich Augustiner-Chorherrenstift Von 1858 bis 2014 Kloster der Salesianerinnen |
| F |||||||||
| Feuchtwangen | Kloster Unserer Lieben Frau | Bistum Augsburg | OSB CanReg | ♂ | 817 | 1540 | Aufgelöst Ursprünglich Benediktinerkloster, ab 1197 Chorherrenstift |
| Flintsbach am Inn | Kloster St. Peter am Madron | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 1130 | 1296 | Aufgelöst |
| Forchheim | Franziskanerkloster Forchheim | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1649 | 1830 | Aufgelöst |
| Forchheim | Kollegiatstift Forchheim | Erzbistum Bamberg | | ♂ | 1354 | 1803 | Aufgelöst |
| Freising | Kollegiatstift St. Andrä | Erzbistum München und Freising | | ♂ | 1062 | 1802 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Freising | Kollegiatstift St. Johannes | Erzbistum München und Freising | | ♂ | 1319 | 1803 | Aufgelöst |
| Freising | Kollegiatstift St. Paul | Erzbistum München und Freising | | ♂ | 1251 | 1802 | Aufgelöst |
| Freising | Kollegiatstift St. Veit | Erzbistum München und Freising | (OSB) | ♂ | 833 | 1802 | Aufgelöst Ursprünglich Benediktinerkloster, seit 1020 Kollegialstift |
| Freising | Domkloster Freising | Erzbistum München und Freising | | ♂ | 816 | 883 | Aufgelöst |
| Freising | Franziskanerkloster Freising | Erzbistum München und Freising | OFMRef | ♂ | 1610 | 1803 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Freising | Kloster der Franziskaner-Terziarinnen | Erzbistum München und Freising | TOR | ♀ | 1484 | 1551 | Aufgelöst |
| Freising | Kloster Neustift | Erzbistum München und Freising | OPraem | ♂ | 1142 | 1803 | Aufgelöst |
| Freising | Kloster Weihenstephan | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂/♀ | 830 | 1803 | Aufgelöst Bis 1020 Kollegialstift, danach Benediktiner/innen |
| Fremdingen | Kloster St. Maria Porten | Bistum Augsburg | TOR | ♀ | 1591 | 1807 | Aufgelöst |
| Frensdorf | Kloster Schlüsselau | Erzbistum Bamberg | OCist | ♀ | 1280 | 1553 | Aufgelöst 1949 versuchten Karmelitinnen das Kloster wieder zu besiedeln, diese zogen nach Erlangen-Büchenbach weiter |
| Freystadt | Kloster Freystadt | Bistum Eichstätt | OFMRef | ♂ | 1452 | | Zwischenzeitlich von 1556-1710 und 1803-36 aufgehoben |
| Fürstenfeldbruck | Kloster Fürstenfeld | Erzbistum München und Freising | OCist | ♂ | 1263 | 1803 | Aufgelöst |
| Fürstenzell | Kloster Fürstenzell | Bistum Passau | OCist SM | ♂ | 1274 1930 | 1803 2009 | Aufgelöst Von Ursprünglich Zisterzienserabtei, von 1930–2009 Niederlassung der Maristen |
| Füssen | Franziskanerkloster Füssen | Bistum Augsburg | OFM | ♂ | 1628 | | Während der Säkularisation das bayerische Aussterbekloster der Franziskaner |
| Füssen | Kloster St. Mang | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 9. Jh. | 1803 | Aufgelöst |
| G |||||||||
| Gangkofen | Kloster Seemannshausen | Bistum Regensburg | OESA | ♂ | 1255 | 1802 | Aufgelöst |
| Gars am Inn | Kloster Gars | Erzbistum München und Freising | CSsR (OSB) (CanReg) | ♂ | 768 1858 | 1803* | Ursprünglich von 768-1122 Benediktinerkloster, von 1122-1803 Augustiner-Chorherrenstift Seit 1858 Kloster der Redemptoristen |
| Gars am Inn | Kloster Au am Inn | Erzbistum München und Freising | OSF (CanReg) | ♀ (♂) | 1122 1853 | 1803* | Ursprünglich Augustiner-Chorherrenstift, seit 1853 Kloster der Dillinger Franziskanerinnen |
| Geisenfeld | Kloster Geisenfeld | Bistum Regensburg | OSB | ♀ | 1037 | 1803 | Aufgelöst |
| Gemünden am Main | Kloster Schönau | Bistum Würzburg | OFMConv (OCist) | ♂ (♀) | 1189 1699 | 1564* | Von 1189 bis 1564 Zisterzienserinnenkloster Ab 1699 Minoritenkloster, zwischenzeitlich von 1803-43 aufgehoben |
| Gessertshausen | Kloster Oberschönenfeld | Bistum Augsburg | OCist | ♀ | 1211 | | Zwischenzeitlich von 1803-36 aufgehoben |
| Gößweinstein | Kloster Gößweinstein | Erzbistum Bamberg | OFM (OFMCap) | ♂ | 1723 | | Ursprünglich Kapuzinerkloster, seit 2006 von polnischen Franziskanern bewohnt |
| Gotteszell | Kloster Gotteszell | Bistum Regensburg | OCist | ♂ | 1285 | 1803 | Aufgelöst |
| Bad Griesbach im Rottal | Kloster St. Salvator | Bistum Passau | OPraem | ♂ | 1289 | 1803 | Aufgelöst |
| Griesstätt | Kloster Altenhohenau | Erzbistum München und Freising | OP | ♀ | 1235 | 2013 | Aufgelöst |
| Großheubach | Kloster Engelberg über dem Main | Bistum Würzburg | OSJ (OFMCap, OFM) | ♂ | 1630 1828 | 1803* | Ursprünglich Kapuzinerkloster bis 1803 1828-Mai 2024 Franziskanerkloster, seit Oktober 2024 Kloster der Oblaten des Hl. Joseph |
| Günzburg | Kloster Herz Jesu | Bistum Augsburg | CJ OFMRef | ♀ | 1433 1825 | 1782* | Bis 1782 Kloster der Terziarinnen der Franziskaner-Reformaten, seit 1825 Englische Fräulein |
| Günzburg | Kapuzinerkloster Günzburg | Bistum Augsburg | OFMCap | ♂ | 1616 | 1806 | Aufgelöst |
| Günzburg | Kloster Ss. Trinitatis | Bistum Augsburg | SP | ♂ | 1750 | 1807 | Aufgelöst |
| H |||||||||
| Habach | Kollegiatstift St. Ulrich | Bistum Augsburg | | ♂ | 11. Jh. | 1802 | Aufgelöst |
| Hammelburg | Kloster Altstadt | Bistum Würzburg | OFM | ♂ | 1649 | 2014 | Aufgelöst Jetzt beherbergt es die Bayerische Musikakademie |
| Heidenheim (Mfr) | Kloster Heidenheim | Bistum Eichstätt | OSB | ♂/♀ | 752 | 1537 | Gegründet von den hll. Wunibald und Walburga Ursprünglich Doppelkloster für Benediktiner/innen Ab 790 ein Stift für Säkularkanoniker |
| Heilsbronn | Kloster Heilsbronn | Bistum Eichstätt | OCist | ♂ | 1132 | 1578 | Aufgelöst Münster war Grablege der Fränkischen Hohenzollern |
| Herrieden | Kloster Herrieden | Bistum Eichstätt | TOR | ♀ | 1463 | 16. Jh. | Aufgelöst |
| Herrieden | Kollegiatstift Herrieden | Bistum Eichstätt | | ♂ | 797 | 1806 | Aufgelöst Ursprünglich Benediktinerkloster, ab 888 Kanonikerstift |
| Hilpoltstein | Kollegiatstift St. Johannes | Bistum Eichstätt | | ♂ | 1372 | 1534 | Aufgelöst |
| Himmelkron | Kloster Himmelkron | Erzbistum Bamberg | OCist | ♀ | 1279 | 1569 | Aufgelöst |
| Höchstadt an der Aisch | Kloster Höchstadt | Erzbistum Bamberg | OFMCap | ♂ | 1703 | 1810 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Hof | Franziskanerkloster Hof | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1292 | 1542 | Aufgelöst |
| Hof | Klarissenkloster Hof | Erzbistum Bamberg | OSCI | ♀ | 1287 | 1574 | Aufgelöst |
| Hohenwart | Kloster Hohenwart | Bistum Augsburg | OSB | ♀ | 1074 | 1803 | Aufgelöst |
| Holzheim | Kloster Fultenbach | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 739 | 1803 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Hösbach | Kloster Schmerlenbach | Bistum Würzburg | SAC (OSB) | ♂ (♀) | 1218 | | Benediktinerinnenkloster 1982 aufgelöst, seitdem Niederlassung der Pallottiner |
| I |||||||||
| Ilmmünster | Kloster Ilmmünster | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 762 | 1803 | Ursprünglich Benediktinerkloster, ab 1060 Kollegialstift |
| Ingolstadt | Kloster St. Georg | Bistum Eichstätt | OSU | ♀ | 1750 | 1810 | Aufgelöst, Klosterkirche heute Teil des Amtsgerichtes |
| Ingolstadt | Kloster Mariä Himmelfahrt | Bistum Eichstätt | OFMCap (OFMRef) | ♂ | 1275 | | Franziskanerkloster im 19. Jh. zwischenzeitlich aufgehoben, 2005 aufgelöst Seit 2006 Kapuzinerkloster |
| Ingolstadt | Kloster Gnadenthal | Bistum Eichstätt | OSF | ♀ | 1276 | | Mutterhaus der Franziskaner-Tertiarinnen vom hl. Johannes |
| Ingolstadt | Kloster ob der Schutter | Bistum Eichstätt | OESA | ♂ | 1606 | 1802 | Aufgelöst |
| Iphofen | Kloster Birklingen | Erzbistum Bamberg | CanReg | ♂ | 1459 | 1546 | Aufgelöst |
| Irsee | Kloster Irsee | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 1180 | 1802 | Aufgelöst Ab 1502 Reichsabtei |
| Isen | Kloster St. Zeno | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 8. Jh. | 1802 | Aufgelöst Bis Anfang 12. Jh. Benediktinerkloster, dann Kollegiatstift |
| K |||||||||
| Kaisheim | Kloster Kaisheim | Bistum Augsburg | OCist | ♂ | 1133 | 1802 | Aufgelöst Ab 1363 Reichsabtei Heute JVA und Museum |
| Karlstadt | Kloster Karlstadt | Bistum Würzburg | OFMCap | ♂ | 1647 | 1976 | Aufgelöst Zwischenzeitlich von 1804-08 aufgehoben, Konvent übersiedelte 1966 in das Gemeindezentrum Hl. Familie |
| Kastl | Kloster Kastl | Bistum Eichstätt | OSB SJ | ♂ | 1098 1636 | 1556 1808 | Aufgelöst Ursprünglich Benediktinerkloster, später Niederlassung der Jesuiten und ab 1782 der Malteser |
| Kaufbeuren | Kloster Kaufbeuren | Bistum Augsburg | OFM | ♀ | 1261 | | Zwischenzeitlich von 1803-31 aufgehoben Die heilige Maria Crescentia Höss war hier Oberin |
| Kelheim | Franziskanerkloster Kelheim | Bistum Regensburg | OFMRef | ♂ | 1461 | 1802 | Aufgelöst |
| Kelheim | Kloster Trauntal | Bistum Regensburg | TOR | ♀ | 1450 | 1802 | Aufgelöst |
| Kelheim | Kloster Weltenburg | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 700 | | Zwischenzeitlich von 1803-42 aufgelöst, von Metten aus wieder besiedelt, seit 1913 Abtei Gilt als ältestes Kloster Bayerns |
| Kemnath | Kloster Kemnath | Bistum Regensburg | OFMRef | ♂ | 1658 | 1802 | Aufgelöst |
| Kempten (Allgäu) | Kloster Heiligkreuz | Bistum Augsburg | OFM | ♂ | 1715 | 1805 | Aufgelöst |
| Kempten (Allgäu) | Fürststift St. Lorenz | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 752 | 1803 | Aufgelöst Ab 1062 Reichssfürstenstift |
| Kempten (Allgäu) | Stiftsgymnasium Kempten | Bistum Augsburg | SP | ♂ | 1752 | 1803 | Aufgelöst |
| Kempten (Allgäu) | Franziskanerkloster St. Bernhardin | Bistum Augsburg | OFM | ♂ | 1458 | 1805 | Aufgelöst |
| Kempten (Allgäu) | Franziskanerinnenkloster St. Anna | Bistum Augsburg | OSF | ♀ | 1502 | 1805 | Aufgelöst |
| Kempten (Allgäu) | Kloster St. Anton | Bistum Augsburg | OFMCap | ♂ | 1912 | 2001 | Aufgelöst Von 2003-15 lebte die Ordensgemeinschaft von den Heiligsten Herzen Jesu und Mariens hier |
| Kitzingen | Benediktinerinnenkloster Kitzingen | Bistum Würzburg | OSB | ♀ | 745 | 1568 | Aufgelöst Doppeltürmige Abteikirche später zerstört |
| Kitzingen | Ursulinenkloster Kitzingen | Bistum Würzburg | OSU | ♀ | 1660 | 1804 | Aufgelöst Auf den Grundmauern des ehem. Benediktinerinnenkloster erbaut Ehem. Klosterkirche ist heute evang. Stadtkirche |
| Kitzingen | Kapuzinerkloster Kitzingen | Bistum Würzburg | OFMCap | ♂ | 1630 | 1828 | Aufgelöst Heute Altenheim |
| Klosterlechfeld | Kloster Lechfeld | Bistum Augsburg | OFM | ♂ | 1624 | 1993 | Zwischenzeitlich von 1803-30 aufgelöst |
| Kochel am See | Klösterl Walchensee | Bistum Augsburg | OSH | ♂ | 1688 | 1725 | Aufgelöst Heute Jugendhaus der Diözese |
| Konnersreuth | Kloster Fockenfeld | Bistum Regensburg | OSFS | ♂ | 1951 | | Patres betreiben auch eine Spätberufenenschule |
| Konnersreuth | Theresianum Konnersreuth | Bistum Regensburg | OCarm | ♀ | 1963 | | Errichtung des Anbetungskloster war Wunsch von Therese Neumann |
| Königsberg in Bayern | Augustinerkloster Königsberg | Bistum Würzburg | OESA | ♂ | 1363 | 1528 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Königsberg in Bayern | Kloster der Augustinerterziarinnen | Bistum Würzburg | OESA | ♀ | 1320 | 1524 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Kösching | Kloster Bettbrunn | Bistum Regensburg | OESA | ♂ | 1650 | 1803 | Aufgelöst |
| Kronach | Kloster Kronach | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1649 | 1829 | Aufgelöst |
| Kühbach | Kloster Kühbach | Bistum Augsburg | OSB | ♀ | 1011 | 1803 | Aufgelöst |
| L |||||||||
| Landsberg am Lech | Kloster Landsberg | Bistum Augsburg | OP (OSU) | ♀ | 1719 1845 | 1809* | Ursprünglich Ursulinenkloster Seit 1845 Dominikanerinnen, seit 1985 an neuem Standort |
| Landsberg am Lech | Kloster Sandau | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 8. Jh. | 10. Jh. | Aufgelöst und bis auf die Kirche zerstört |
| Landshut | Kloster St. Joseph | Erzbistum München-Freising | OSU | ♀ | 1668 | 2016 | Zwischenzeitlich von 1803-27 aufgehoben |
| Landshut | Kollegialstift St. Martin | Erzbistum München-Freising | | ♂ | 1598 | 1803 | Aufgelöst Siedelte von St. Kastulus in Moosburg hierher um |
| Landshut | Kloster St. Peter & Paul | Erzbistum München-Freising | OFMRef | ♂ | 1280 | 1802 | Aufgelöst |
| Landshut | Dominikanerkloster Landshut | Erzbistum München-Freising | OP | ♂ | 1271 | 1802 | Aufgelöst |
| Landshut | Kapuzinerkloster Landshut | Erzbistum München-Freising | OFMCap | ♂ | 1610 | 1802 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Landshut | Kloster Maria Loreto | Erzbistum München-Freising | OCarm OFM | ♀ ♂ | 1627 1835 | 1802 2002 | Aufgelöst Ursprünglich Kloster der Karmelitinnen, später der Franziskaner-Minoriten |
| Landshut | Kloster Seligenthal | Erzbistum München-Freising | OCist | ♀ | 1232 | | Zwischenzeitlich von 1803-36 aufgehoben |
| Langenzenn | Kloster Langenzenn | Erzbistum Bamberg | CanReg | ♂ | 1409 | 1533 | Aufgelöst ehem. Klosterkirche jetzt evang. Pfarrkirche |
| Langquaid | Kloster Paring | Bistum Regensburg | CRV (OSB) | ♂ | 1139 1598 1974 | 1551* 1803* | Von 1139-1551 Augustiner Chorherrenstift Von 1598-1803 Benediktinerkloster Seit 1974 wieder Chorherren |
| Laufen (Salzach) | Kollegialstift Laufen | Erzbistum München-Freising | | ♂ | 1621 | 1809 | Aufgelöst |
| Lauingen (Donau) | Kloster St. Agnes | Bistum Augsburg | OCist | ♀ | 1270 | 1812 | Aufgelöst |
| Lauingen (Donau) | Augustinerkloster Lauingen | Bistum Augsburg | OESA | ♂ | 1292 | 1802 | Aufgelöst, von 1540-1656 aufgehoben |
| Lichtenfels | Kloster Langheim | Erzbistum Bamberg | OCist | ♂ | 1132 | 1803 | Aufgelöst |
| Lindau (Bodensee) | Franziskanerkloster Lindau | Bistum Augsburg | OFMConv | ♂ | 1224 | 1528 | Aufgelöst |
| Lindau (Bodensee) | Kanonissenstift Lindau | Bistum Augsburg | | ♀ | 822 | 1802 | Aufgelöst |
| Lindau (Bodensee) | Terziarinnenkloster Lindau | Bistum Augsburg | TOR | ♀ | 1238 | 1528 | Aufgelöst |
| M |||||||||
| Maihingen | Kloster Maihingen | Bistum Augsburg | OCsS OFMConv | ♀/♂ | 1437 1607 | 1803 | Aufgelöst Ursprünglich Brigittenkloster, ab 1607 Minoriten |
| Mallersdorf-Pfaffenberg | Kloster Mallersdorf | Bistum Regensburg | OSF (OSB) | ♂ (♀) | 1107 1869 | 1803* | Ursprünglich Benediktinerkloster Seit 1869 Mutterhaus der Mallersdorfer Schulschwestern (OSF) |
| Marktsteft | Kloster Michelfeld | Bistum Würzburg | OPraem | ♀ | 1245 | 1305 | Aufgelöst |
| Markt Indersdorf | Kloster Indersdorf | Erzbistum München und Freising | OVM (CanReg) | ♀ (♂) | 1126 1856 | 1803* | Ursprünglich Augustiner-Chorherrenstift Später Salesianerinnen und Heute Kloster der Barmherzigen Schwestern |
| Marktleugast | Kloster Marienweiher | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1646 | | Zwischenzeitlich von 1802-28 aufgehoben |
| Medlingen | Kloster Obermedlingen | Bistum Augsburg | MIC (OP, OMI, OPraem) | ♂ (♀) | 1251 1923 | 1804* | Ursprünglich Dominikanerinnenkloster, später Dominikaner, Hünfelder Oblaten und Prämonstranser Aktuell Kloster der Marianer |
| Memmingen | Kloster Hl. Geist | Bistum Augsburg | OSS | ♂ | 1210 | 1802 | Aufgelöst |
| Memmingen | Kloster St. Elisabeth | Bistum Augsburg | OESA | ♀ | 1252 | 1551 | Aufgelöst |
| Memmingen | Kloster St. Johannes Baptis | Bistum Augsburg | OESA | ♂ | 1240 | 1803 | Aufgelöst |
| Memmingen | Antoniterkloster Memmingen | Bistum Augsburg | CRSAnt | ♂ | 1214 | 1561 | Aufgelöst |
| Memmingen | Schottenkloster Memmingen | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 1167 | 1498 | Aufgelöst |
| Metten | Kloster Metten | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 766 | | Zwischenzeitlich von 1803-30 aufgehoben |
| Miltenberg | Franziskanerkloster Miltenberg | Bistum Würzburg | OFM | ♂ | 1630 | 1983 | Aufgelöst Zwischenzeitlich von 1803-36 aufgehoben |
| Mindelheim | Kloster Hl. Kreuz | Bistum Augsburg | TOR | ♀ | 1456 | 2018 | Aufgelöst |
| Mindelheim | Augustinerkloster Mindelheim | Bistum Augsburg | OESA | ♂ | 1263 | 1526 | Aufgelöst |
| Mindelheim | Kloster Herz Jesu | Bistum Augsburg | CJ | ♀ | 1701 | | |
| Mittenwald/Krün | Kloster Scharnitz | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 763 | 772 | Aufgelöst und nach Schlehdorf übersiedelt |
| Mödingen | Kloster Mödingen | Bistum Augsburg | OSF (OP) | ♀ | 1246 1843 | 1802* | Ursprünglich Dominikanerinnenkloster Seit 1843 Kloster der Dillinger Franziskanerinnen |
| Mönchsdeggingen | Kloster Mönchsdeggingen | Bistum Augsburg | OSB CMM | ♂ | 1138 1950 | 1802 2009 | Ursprünglich Benediktiner(innen)kloster Von 1950–2009 Kloster der Marianhiller Missionare |
| Mönchsroth | Kloster Mönchsroth | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 1130 | 1558 | Aufgelöst, Ehem. Klosterkirche heute Evang. Friedhofskirche |
| Moosburg an der Isar | Kollegiatstift St. Kastulus | Erzbistum München und Freising | | ♂ | 895 | 1598 | Aufgelöst Nach Landshut transferiert |
| Mühldorf am Inn | Kollegiatstift St. Nikolaus | Erzbistum München und Freising | | ♂ | 1610 | 1803 | Aufgelöst |
| München | Franziskanerkloster St. Antonius | Erzbistum München und Freising | OFMRef | ♂ | 1210 | 1802 | Aufgelöst |
| München | Abtei St. Bonifaz | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 1835 | | |
| München | Kloster St. Elisabeth | Erzbistum München und Freising | OSM | ♀ | 1715 | | Zwischenzeitlich von 1802-69 aufgehoben |
| München | Kloster St. Jakob am Anger | Erzbistum München und Freising | SSND (OFMRef) (OSCI) | ♀ (♂) | 1221 1843 | 1804* | Ursprünglich Franziskanerkloster, ab 1284 Klarissen Seit 1843 Kloster der Armen Schulschwestern |
| München | Kloster St. Kajetan | Erzbistum München und Freising | OP (CRth) | ♂ | 1662 1935 | 1801* | Ursprünglich Theatinerkloster, heute Dominikaner |
| München | Kloster St. Maximilian | Erzbistum München und Freising | OH | ♂ | 1750 | 1809 | Aufgelöst und abgerissen |
| München | Kloster St. Philipp Neri | Erzbistum München und Freising | CO | ♂ | 1707 | 1775 | Aufgelöst |
| München | Augustinerkloster München | Erzbistum München und Freising | OESA | ♂ | 1294 | 1803 | Aufgelöst |
| München | Franziskanerkloster St. Anna im Lehel | Erzbistum München und Freising | OFM | ♂ | 1727 | | Zwischenzeitlich von 1807-27 aufgehoben |
| München | Elisabethinerinnenkloster München | Erzbistum München und Freising | OSE | ♀ | 1754 | 1809 | Aufgelöst |
| München | Kloster der Englischen Fräulein | Erzbistum München und Freising | CJ | ♀ | 1627 | | Zwischenzeitlich von 1807-90 aufgehoben Heute in Pasing und Nymphenburg angesiedelt |
| München | Kapuzinerkloster St. Anton | Erzbistum München und Freising | OFMCap | ♂ | 1600 | | Zwischenzeitlich von 1802-45 aufgehoben |
| München | Karmelitenkloster St. Nikolaus | Erzbistum München und Freising | OCD | ♂ | 1629 | 1802 | Aufgelöst |
| München | Karmelitinnenkloster Hl. Dreifaltigkeit | Erzbistum München und Freising | OCD | ♀ | 1711 | 1802 | Aufgelöst |
| München | Kloster auf dem Lilienberg | Erzbistum München und Freising | OSB | ♀ | 1693 | 1802 | Aufgelöst |
| München | Paulanerkloster München | Erzbistum München und Freising | OMinim | ♂ | 1623 | 1799 | Aufgelöst und abgerissen |
| München | Püttrichkloster St. Christophorus | Erzbistum München und Freising | TOR | ♀ | 1284 | 1802 | Aufgelöst und abgerissen |
| München | Ridlerkloster St. Johannes | Erzbistum München und Freising | TOR | ♀ | 1295 | 1785 | Aufgelöst und abgerissen |
| München | Kollegialstift Unserer lieben Frau | Erzbistum München und Freising | | ♂ | 1493 | 1803 | Aufgelöst Ehem. Stiftskirche heute Kathedrale der Erzdiözese (Liebfrauendom) |
| München | Kloster der Barmherzigen Schwestern vom Hl. Vinzenz von Paul | Erzbistum München und Freising | FdC | ♀ | 1832 | | Mutterhaus der Schwestern |
| Münchsmünster | Kloster Münchsmünster | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 772 | 1556 | Aufgelöst |
| Münchsteinach | Kloster Münchsteinach | Bistum Würzburg | OSB | ♂ | 1140 | 1528 | Aufgelöst |
| Münnerstadt | Kloster Bildhausen | Bistum Würzburg | OCist | ♂ | 1158 | 1803 | Aufgelöst |
| Münnerstadt | Kloster Münnerstadt | Bistum Würzburg | OSA | ♂ | 1279 | | Während der Bauernkriege zwischenzeitlich verwaist |
| N |||||||||
| Neuburg an der Donau | Kloster Bergen | Bistum Eichstätt | OSB | ♀ | 976 | 1552 | Aufgelöst |
| Neuburg an der Donau | Benediktinerinnenkloster Neuburg | Bistum Augsburg | OSB | ♀ | 1007 | 1542 | Aufgelöst |
| Neuburg an der Donau | Kollegiatstift St. Peter | Bistum Augsburg | | ♂ | 1681 | 1803 | Aufgelöst |
| Neuburg an der Donau | Kloster St. Wolfgang | Bistum Augsburg | OH | ♂ | 1623 | 1980 | Aufgelöst |
| Neuburg an der Donau | Kloster St. Maria | Bistum Augsburg | OSU | ♀ | 1700 | 1813 | Aufgelöst |
| Neuburg an der Donau | Karmelitinnenkloster Neuburg | Bistum Augsburg | OCD | ♀ | 1661 | 1802 | Aufgelöst und abgerissen |
| Neuburg an der Donau | Franziskanerkloster Neuburg | Bistum Augsburg | OFM | ♂ | 1656 | 1803 | Aufgelöst |
| Neuburg an der Donau | Kloster St. Elisabeth | Bistum Augsburg | OSE | ♀ | 1840 | | |
| Neuburg an der Kammel | Kanonissenstift Edelstetten | Bistum Augsburg | | ♀ | 1126 | 1804 | Aufgelöst |
| Neuhaus am Inn | Kloster Vornbach | Bistum Passau | OSB | ♂ | 1094 | 1803 | Aufgelöst |
| Neunkirchen am Brand | Kloster Neunkirchen am Brand | Erzbistum Bamberg | CanReg | ♂ | 1313 | 1555 | Aufgelöst Ländereien diente fortan dem Priesterseminar Bamberg |
| Neukirchen beim Heiligen Blut | Kloster Neukirchen beim Heiligen Blut | Bistum Regensburg | OFMRef | ♂ | 1656 | | Patres betreuen v. a. die Wallfahrt |
| Neumarkt in der Oberpfalz | Kloster Hl. Geist | Bistum Eichstätt | OSS | ♂ | 1239 | 1527 | Aufgelöst |
| Neumarkt in der Oberpfalz | Kapuzinerkloster Neumarkt | Bistum Eichstätt | OFMCap | ♂ | 1627 | 1802 | Aufgelöst Ehem. Klosterkirche ist heute evang. Pfarrkirche |
| Neumarkt in der Oberpfalz | Karmelitenkloster Neumarkt | Bistum Eichstätt | OCarm | ♂ | 1677 | 2001 | Aufgelöst Zwischenzeitlich bereit von 1807–1907 aufgehoben |
| Neumarkt in der Oberpfalz | Kloster St. Josef | Bistum Eichstätt | ODS | ♀ | 1920 | | Provinzialmutterhaus der Niederbronner Schwestern |
| Neumarkt-Sankt Veit | Kloster St. Veit | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 1171 | 1802 | Aufgelöst |
| Neunburg vorm Wald | Kloster Neunburg vorm Wald | Bistum Regensburg | SSND OFMRef | ♀ (♂) | 1722 1833 | 1802* | Ursprünglich Franziskanerkloster 1833 wurde hier der Orden der Armen Schulschwestern gegründet. |
| Neustadt an der Aisch | Kloster Birkenfeld | Erzbistum Bamberg | OCist | ♀ | 1275 | 1536 | Aufgelöst |
| Neustadt an der Aisch | Franziskanerkloster Riedfeld | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1458 | 1528 | Aufgelöst |
| Neustadt am Kulm | Kloster Neustadt am Kulm | Bistum Regensburg | OCarm | ♂ | 1413 | 1531 | Aufgelöst |
| Neustadt am Main | Dominikanerinnenkloster Neustadt ursprünglich Benediktinerabtei | Bistum Würzburg | OP (OSB) | ♀ (♂) | 742 1909 | 1803* | Ursprünglich Benediktinerkloster Seit 1909 Kloster der Missionsdominikanerinnen |
| Neustadt am Main | Franziskanerinnenkloster Neustadt | Bistum Würzburg | OSF | ♀ | 1855 | 1959 | Aufgelöst |
| Niederalteich | Kloster Niederaltaich | Bistum Passau | OSB | ♂ | 741 | | Zwischenzeitlich von 1803–1918 aufgehoben |
| Niederschönenfeld | Kloster Niederschönenfeld | Bistum Augsburg | OCist | ♀ | 1241 | 1803 | Aufgelöst |
| Niederviehbach | Kloster Niederviehbach | Bistum Regensburg | OP (OESA) | ♀ | 1296 1847 | 1803* | Ursprünglich Kloster der Augustiner-Eremitinnen Seit 1847 Kloster der Dominikanerinnen |
| Nördlingen | Herrgottskloster Nördlingen | Bistum Augsburg | OCarm | ♂ | 1401 | 1564 | Aufgelöst |
| Nördlingen | Antoniterkloster Nördlingen | Bistum Augsburg | CRSAnt | ♂ | 1396 | 1520 | Aufgelöst |
| Nördlingen | Franziskanerkloster Nördlingen | Bistum Augsburg | OFM | ♂ | 1279 | 1536 | Aufgelöst |
| Nördlingen | Franziskanerinnenkloster Nördlingen | Bistum Augsburg | TOR | ♀ | 1243 | 1536 | Aufgelöst |
| Nördlingen | Kloster Zimmern | Bistum Augsburg | OCist | ♀ | 1233 | 1558 | Aufgelöst |
| Nürnberg | Augustinerkloster Nürnberg | Erzbistum Bamberg | OESA | ♂ | 1265 | 1524 | Aufgelöst |
| Nürnberg | Dominikanerkloster Nürnberg | Erzbistum Bamberg | OP | ♂ | 1248 | 1543 | Aufgelöst |
| Nürnberg | Kloster Himmelthron | Erzbistum Bamberg | OCist | ♀ | 1340 | 1525 | Aufgelöst |
| Nürnberg | Kloster St. Magdalena | Erzbistum Bamberg | OSCI | ♀ | 1224 | 1279 | Aufgelöst, nach St. Klara übersiedelt |
| Nürnberg | Franziskanerkloster Nürnberg | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1224 | 1525 | Aufgelöst |
| Nürnberg | Karmelitenkloster Nürnberg | Erzbistum Bamberg | OCarm | ♂ | 1287 | 1525 | Aufgelöst |
| Nürnberg | Klarissenkloster St. Klara | Erzbistum Bamberg | OSCI | ♀ | 1279 | 1596 | Aufgelöst |
| Nürnberg | Schottenkloster St. Ägidien | Erzbistum Bamberg | OSB | ♂ | 1150 | 1525 | Aufgelöst |
| Nürnberg | Terziarinnenspital Nürnberg | Erzbistum Bamberg | TOR | ♀ | 1412 | 1525 | Aufgelöst |
| Nürnberg | Kloster Pillenreuth | Bistum Eichstätt | CBMV | ♀ | 1345 | 1552 | Aufgelöst |
| O |||||||||
| Oberaudorf | Kloster Reisach | Erzbistum München und Freising | OCD | ♀ | 1731 | | Von 1802-36 lediglich Aussterbekloster |
| Oberschleißheim | Kloster Mittenheim Schleißheim | Erzbistum München und Freising | OFMRef | ♂ | 1702 | 1802 | Aufgelöst |
| Oberstaufen | Kollegialstift St. Peter und Paul | Bistum Augsburg | | ♂ | 1328 | 1806 | Aufgelöst |
| Ochsenfurt | Kapuzinerkloster Ochsenfurt | Bistum Würzburg | OFMCap | ♂ | 1646 | 1803 | Aufgelöst |
| Ochsenfurt | Kloster Tückelhausen | Bistum Würzburg | OCart | ♂ | 1349 | 1803 | Aufgehoben Ursprünglich Prämonstratenserkloster |
| Odelzhausen | Kloster Taxa | Erzbistum München und Freising | OAD | ♂ | 1654 | 1802 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Osterhofen | Kloster Osterhofen | Bistum Passau | CJ (OPraem) | ♀ (♂) | 1138 1858 | 1783* | Ursprünglich Kollegialstift und Prämonstratenserkloster Heute Kloster der Englischen Fräulein |
| Otting | Kloster Otting | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 749 | 1803 | Aufgelöst |
| Ottobeuren | Kloster Ottobeuren | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 764 | | Zwischenzeitlich von 1802-35 aufgehoben Ab 1624 Reichsabtei |
| P |||||||||
| Pappenheim | Kloster Pappenheim | Bistum Eichstätt | OESA | ♂ | 1372 | 1545 | Aufgelöst |
| Passau | Stift St. Nikola | Bistum Passau | OT CanReg | ♀ (♂) | 1070 1975 | 1803* | Ursprünglich Augustinerchorherrenstift, heute Mutterhaus der Deutschordensschwestern |
| Passau | Kollegiatstift St. Salvator | Bistum Passau | | ♂ | 1490 | 1803 | Aufgelöst |
| Passau | Franziskanerkloster Passau | Bistum Passau | OFM | ♂ | 1564 | 1803 | Aufgelöst |
| Passau | Kloster Maria Hilf | Bistum Passau | OSPPE (OFMCap) | ♂ | 1631 | | Ursprünglich Kapuzinerkloster, von 1803–1890 aufgehoben Seit 2002 polnische Pauliner zur Wallfahrtsseelsorge |
| Passau | Kloster Niedernburg | Bistum Passau | OSB CJ | ♀ | 1500 1836 | 1803 2017 | Aufgelöst Ursprünglich Benediktinerinnenabtei, später Kloster der Englischen Fräulein |
| Pfreimd | Franziskanerkloster Pfreimd | Bistum Regensburg | OFMRef | ♂ | 1596 | 1995 | Aufgelöst Zwischenzeitlich von 1802-70 aufgehoben |
| Pfreimd | Kollegiatstift Pfreimd | Bistum Regensburg | | ♂ | 1118 | 1216 | Aufgelöst |
| Planegg | Kloster Maria Eich | Erzbistum München und Freising | OSA | ♂ | 1953 | | |
| Pielenhofen | Kloster Pielenhofen | Bistum Regensburg | OCist | ♀ | 1240 | 1559 | Aufgelöst |
| Polling | Kloster Polling | Bistum Augsburg | OSB CanReg | ♂ | 750 | 1830 | Ursprünglich Benediktinerkloster, ab 1010 Augustinerchorherrenstift |
| Prichsenstadt | Kloster Ilmbach | Bistum Würzburg | OCart | ♂ | 1453 | 1803 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Pyrbaum | Kloster Seligenporten | Bistum Eichstätt | OCist OVM | ♀/♂ | 1242 1692 1930 | 1556 1803 1967 | Aufgelöst Ursprünglich Zisterzienserinnenkloster, vom 1692-1803 Kloster der Salesianerinnen 1930-67 Tochterkloster der Zisterzienser von Meherau |
| R |||||||||
| Regensburg | Kloster Prüfening | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 1109 | 1803 | Aufgelöst |
| Regensburg | Kloster Prüll | Bistum Regensburg | OCart OSB | ♂ | 997 | 1803 | Aufgelöst Auch als Karthaus Prüll bekannt Ursprünglich Benediktinerstift, ab 1484 Kartäuserkloster |
| Regensburg | Kloster St. Emmeram | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 739 | 1803 | Aufgelöst Ab 1731 Fürstabtei Ruhestätte des heiligen Wolfgang |
| Regensburg | Kollegiatstift St. Johann | Bistum Regensburg | | ♂ | 1271 | 1810 | Aufgelöst |
| Regensburg | Kloster St. Magdalena | Bistum Regensburg | OSMM OSCI | ♀ | 1228 | 1809 | Aufgelöst und zerstört Ursprünglich Kloster der Magdalenerinnen, ab 1286 Klarissen |
| Regensburg | Kloster St. Peter | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 1070 | 1552 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Regensburg | Augustinerkloster Regensburg | Bistum Regensburg | OESA | ♂ | 1255 | 1810 | Aufgelöst |
| Regensburg | Dominikanerinnenkloster Hl. Kreuz | Bistum Regensburg | OP | ♀ | 1233 | | |
| Regensburg | Franziskanerkloster St. Salvator | Bistum Regensburg | OFMConv | ♂ | 1221 | 1799 | Aufgelöst |
| Regensburg | Kapuzinerkloster Regensburg | Bistum Regensburg | OFMCap OSCI | ♂/♀ | 1613 | 1974 | Aufgelöst Ursprünglich Kapuzinerkloster, ab 1810 Klarissen |
| Regensburg | Karmelitenkloster St. Josef | Bistum Regensburg | OCD | ♂ | 1635 | | Zwischenzeitlich von 1812-36 aufgehoben |
| Regensburg | Karmelitenkloster St. Oswald | Bistum Regensburg | OCarm | ♂ | 1290 | 1367 | Aufgelöst Ehem. Klosterkirche heute evang. Pfarrkirche |
| Regensburg | Kloster Mittelmünster | Bistum Regensburg | OSB SJ | ♀/♂ | 972 | 1773 | Aufgelöst Ursprünglich Benediktinerinnenstift Ab 1558 Jesuitenkolleg und Priesterseminar |
| Regensburg | Kanonissenstift Niedermünster | Bistum Regensburg | | ♀ | 778 | 1810 | Aufgelöst Ab 1216 Reichsabtei |
| Regensburg | Kanonissenstift Obermünster | Bistum Regensburg | | ♀ | 866 | 1803 | Aufgelöst |
| Regensburg | Schottenkloster St. Jakob | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 1100 | 1803 | Aufgelöst |
| Regensburg | Kloster St. Kassian Stadtamhof | Bistum Regensburg | OFMRef | ♂ | 1650 | 1809 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Regensburg | Stift St. Mang Stadtamhof | Bistum Regensburg | CanReg | ♂ | 1138 | 1803 | Aufgelöst |
| Regensburg | Stift Unserer Lieben Frau zur Alten Kapelle | Bistum Regensburg | | ♂ | 875 | 1802 | Aufgelöst |
| Reichenbach am Regen | Kloster Reichenbach | Bistum Regensburg | OH (OSB) | ♂ | 1118 1890 | 1803* | Ursprünglich Benediktinerstift Heute Kloster der Barmherzigen Brüder |
| Reichertsheim | Kloster Ramsau bei Haag | Erzbistum München und Freising | OESA | ♂ | 1412 | 1802 | Aufgelöst |
| Riedbach | Kloster Kreuztal Marburghausen | Bistum Würzburg | OCist | ♀ | 1237 | 1582 | Aufgelöst |
| Rieneck | Kloster Einsiedel | Bistum Würzburg | OPraem | ♂ | 1292 | 1530 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Rimpar | Kloster Maidbronn | Bistum Würzburg | OCist | ♀ | 1232 | 1581 | Aufgehoben |
| Rinchnach | Kloster Rinchnach | Bistum Passau | OSB | ♂ | 1011 | 1803 | Aufgehoben |
| Roding | Kloster St. Dominikus Strahlfeld | Bistum Regensburg | OP | ♀ | 1917 | | Mutterhaus der Missionsdominikanerinnen vom hl. Herzen Jesu |
| Rodach bei Coburg | Kloster Georgenberg | Erzbistum Bamberg | OPraem | ♂ | 1120 | 1540 | Aufgelöst |
| Rödental | Kloster Mönchröden | Bistum Würzburg | OSB | ♂ | 1149 | 1538 | Aufgelöst |
| Rödelmaier | Karmelitinnenkloster Regina Pacis | Bistum Würzburg | OCD | ♀ | 1928 | | |
| Roggenburg | Kloster Roggenburg | Bistum Augsburg | OPraem | ♂ | 1130 | | Zwischenzeitlich von 1802–1924 aufgehoben Von 1482-1802 Reichsabtei |
| Rohr in Niederbayern | Kloster Rohr | Bistum Regensburg | OSB (CanReg) | ♂ | 1133 1946 | 1803* | Ursprünglich Augustinerchorherrenstift Seit 1946 aus Böhmen besiedelte Benediktinerabtei Offiziell: Abtei zum heiligen Wenzel zu Braunau |
| Rosenheim | Kloster Rosenheim | Erzbistum München und Freising | OFMCap | ♂ | 1606 | 2017 | Zwischenzeitlich von 1803-54 aufgehoben |
| Rothenburg ob der Tauber | Franziskanerkloster Rothenburg | Erzbistum Bamberg | OFMConv | ♂ | 1281 | 1584 | Aufgelöst |
| Rothenburg ob der Tauber | Terziarenkloster Rothenburg | Erzbistum Bamberg | TOR | ♀ | 1400 | 1541 | Aufgelöst |
| Röthlein | Kloster Heidenfeld | Bistum Würzburg | CSR CanReg | ♀ (♂) | 1071 1901 | 1803* | Ursprünglich Augustinerchorherrenstift Seit 1901 Kloster der Kongregation der Schwestern des Erlösers |
| Rott am Inn | Kloster Rott | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 1081 | 1803 | Aufgelöst |
| Rottenbuch | Kloster Rottenbuch | Erzbistum München und Freising | CanReg | ♂ | 1073 | 1803 | Aufgelöst |
| Rotthalmünster | Kloster Asbach | Bistum Passau | OSB | ♂ | 1091 | 1803 | Aufgelöst |
| Rötz | Kloster Rötz | Bistum Regensburg | OESA | ♂ | 1297 | 1803 | Aufgelöst |
| S |||||||||
| Sachsenkam | Franziskanerinnenkloster Reutberg | Erzbistum München und Freising | TOR | ♀ | 1618 | | Zwischenzeitlich von 1803–1835 aufgehoben |
| Schäftlarn | Kloster Schäftlarn | Erzbistum München und Freising | OSB (OPraem) | ♂ | 762 1140 1866 | 10. Jh. 1803 | Ursprünglich als Benediktinerkloster gegründet, von 1140-1803 Prämonstranserkloster, seit 1866 wieder Benediktinerabtei |
| Scheinfeld | Kloster Schwarzenberg | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1702 | | |
| Scheyern | Kloster Scheyern | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 1077 | | Ursprünglich in Fischbachau gegründet; seit 1119 in Scheyern Zwischenzeitlich von 1803–1838 aufgehoben |
| Schillingsfürst | Kloster Schillingsfürst | Erzbistum Bamberg | OFM | ♂ | 1687 | 1822 | Aufgelöst |
| Schlehdorf | Kloster Schlehdorf | Erzbistum München und Freising | OP (CanReg) | ♀ (♂) | 763 1904 | 1803* | Ursprünglich Benediktiner, später Augustiner-Chorherrenstift Seit 1904 Missions-Dominikanerinnen von Qonce |
| Schliersee | Kloster Schliersee | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 770 | 1495 | Ursprünglich Benediktiner, später Kanonikerstift Aufgelöst |
| Schollbrunn | Kloster Grünau | Bistum Würzburg | OCart | ♂ | 1328 | 1803 | Aufgelöst; heute Ruine |
| Schongau | Kloster Schongau | Bistum Augsburg | OCD | ♂ | 1719 | 1802 | Aufgelöst |
| Schönthal | Kloster Schönthal | Bistum Regensburg | OESA | ♂ | 1250 | 1802 | Aufgelöst |
| Schrobenhausen | Kloster Schrobenhausen | Bistum Augsburg | OFMRef | ♂ | 1664 | 1802 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Schwandorf | Kloster Schwandorf | Bistum Regensburg | OFMCap | ♂ | 1685 | 1802 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Schwanfeld | Kloster Heiligenthal | Bistum Würzburg | OCist | ♀ | 1234 | 1579 | Aufgelöst |
| Schwarzach am Main | Abtei Münsterschwarzach | Bistum Würzburg | OSB | ♂ | 877 | | Zwischenzeitlich von 1803–1913 aufgehoben Heute Missionsbenediktiner |
| Schwarzach am Main | Frauenkloster Münsterschwarzach | Bistum Würzburg | OSB | ♀ | 750 | 877 | Aufgehoben, wurde von Benediktinern übernommen |
| Schwarzhofen | Kloster Schwarzhofen | Bistum Regensburg | OP | ♀ | 1240 | 1802 | Aufgelöst |
| Schweinfurt | Benediktinerkloster Schweinfurt | Bistum Würzburg | OSB | ♂ | 1003 | 1437 | Aufgelöst |
| Schweinfurt | Karmelitenkloster Schweinfurt | Bistum Würzburg | OCarm | ♂ | 1366 | 1542 | Aufgelöst |
| Seeon-Seebruck | Kloster Seeon | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 994 | 1803 | Aufgelöst |
| Siegsdorf | Kloster Maria Eck | Erzbistum München und Freising | OFMConv | ♂ | 1891 | | Ursprünglich Priorat des Klosters Seeon (OSB) |
| Solnhofen | Kloster Solnhofen | Bistum Eichstätt | OSB | ♂ | 794 | 1534 | Aufgelöst |
| Sonnefeld | Kloster Sonnefeld | Erzbistum Bamberg | OCist | ♀ | 1260 | 1524 | Aufgelöst; Klosterkirche heute Ev.-Luth. Pfarrkirche |
| Spalt | Kollegiatstift St. Emmeram | Bistum Eichstätt | | ♂ | 792 | 1619 | Mit St. Nikolaus vereinigt, 1806 aufgelöst |
| Spalt | Kollegiatstift St. Nikolaus | Bistum Eichstätt | | ♂ | 1295 | 1806 | Aufgelöst |
| Spalt | Kloster Heiligenblut Spalt | Bistum Eichstätt | OFMRec | ♂ | 1703 | 1803 | Aufgelöst |
| Sparneck | Kloster Sparneck | Erzbistum Bamberg | OCarm | ♂ | 1477 | 1550 | Aufgelöst |
| Speinshart | Kloster Speinshart | Bistum Regensburg | OPraem | ♂ | 1145 | | Zwischenzeitlich von 1564-1661 und 1803–1921 aufgehoben |
| St. Oswald-Riedlhütte | Kloster St. Oswald | Bistum Passau | OSPPE CanReg OSB | ♂ | 1396 1431 1567 | 1427 1563 1803 | Aufgelöst Ursprünglich Paulinerkloster, später Chorherrenstift und Benediktinerkloster |
| St. Wolfgang | Kollegialstift St. Wolfgang | Erzbistum München und Freising | | ♂ | 1724 | 1803 | Aufgelöst |
| Bad Staffelstein | Kloster Banz | Erzbistum Bamberg | OSB | ♂ | 1070 | 1802 | Aufgelöst, heute Tagungsstätte der Hanss-Seidel-Stiftung |
| Steinach | Kloster Pfaffenmünster | Bistum Regensburg | OSB | ♂ | 1157 | 1803 | Aufgelöst, ab 1300 Kollegialstift |
| Steingaden | Kloster Steingaden | Bistum Augsburg | OPraem | ♂ | 1147 | 1803 | Aufgelöst |
| Straubing | Kloster Azlburg | Bistum Regensburg | OSE | ♀ | 1748 | 1807 | Aufgelöst |
| Straubing | Franziskanerkloster Straubing | Bistum Regensburg | OFMRef OCD | ♂ | 1702 | 187 | Aufgelöst, von 1802–1817 Aussterbekloster der Unbeschuhten Karmeliten |
| Straubing | Kapuzinerkloster Straubing | Bistum Regensburg | OFMCap | ♂ | 1614 | 1802 | Aufgelöst und angebrochen |
| Straubing | Karmelitenkloster Straubing | Bistum Regensburg | OCarm | ♂ | 1368 | | |
| Straubing | Kollegialstift St. Jakob | Bistum Regensburg | | ♂ | 1581 | 1803 | Aufgelöst |
| Straubing | Ursulinenkloster Straubing | Bistum Regensburg | OSU | ♀ | 1691 | | Zwischenzeitlich von 1809-27 aufgehoben |
| Sulzbach-Rosenberg | Salesianerinnenkloster Sulzbach | Bistum Regensburg | OVM | ♀ | 1753 | 1809 | Aufgelöst |
| T |||||||||
| Tegernsee | Kloster Tegernsee | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 746 | 1803 | Aufgelöst War einst die bedeutendste Abtei Oberbayerns |
| Teisendorf | Kloster Höglwörth | Erzbistum München und Freising | CanReg | ♂ | 1125 | 1817 | Aufgelöst |
| Theres | Kloster Theres | Bistum Würzburg | OSB | ♂ | 1043 | 1803 | Aufgelöst |
| Thierhaupten | Kloster Thierhaupten | Bistum Augsburg | OSB | ♂ | 800 | 1803 | Aufgelöst |
| Thyrnau | Kloster Thyrnau | Bistum Passau | OCist | ♀ | 1902 | | Ursprünglich von 1698-1802 Kapuzinerkloster |
| Tittmoning | Kloster Allerheiligen | Erzbistum München und Freising | OESA | ♂ | 1682 | 1806 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Tittmoning | Kollegiatstift Tittmoning | Erzbistum München und Freising | | ♂ | 1633 | 1810 | Aufgelöst |
| Traunstein | Kapuzinerkloster Traunstein | Erzbistum München und Freising | OFMCap | ♂ | 1685 | 1805 | Aufgelöst |
| Triefenstein | Kloster Triefenstein | Bistum Würzburg | CanReg | ♂ | 1102 | 1803 | Aufgelöst heute Hauptsitz der ordensähnlichen evang. Christusträger-Bruderschaft |
| Tuntenhausen | Kloster Beyharting | Erzbistum München und Freising | CanReg | ♂ | 1130 | 1803 | Aufgelöst |
| Türkheim | Kloster Türkheim | Bistum Augsburg | OFMCap | ♂ | 1685 | 1972 | Aufgelöst |
| U |||||||||
| Ursberg | Kloster Ursberg | Bistum Augsburg | CSJ (OPraem) | ♀ (♂) | 1125 1897 | 1803* | Ursprünglich Prämonstratenserstift; ab 1378 Reichsabtei Seit 1897 Kloster der St. Josefskongregarion |
| V |||||||||
| Vilsbiburg | Magdalenerinnenkloster Seyboldsdorf | Bistum Regensburg | OSMM | ♀ | 1951 | 2004 | Aufgelöst |
| Vilshofen an der Donau | Benediktinerabtei Schweiklberg | Bistum Passau | OSB | ♂ | 1904 | | Kloster der Missionsbenediktiner von St. Ottilien |
| Vilshofen an der Donau | Kapuzinerkloster Vilshofen | Bistum Passau | OFMCap | ♂ | 1642 | 1802 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Vilshofen an der Donau | Kollegiatstift Vilshofen | Bistum Passau | | ♂ | 1376 | 1803 | Aufgelöst |
| Volkach | Kloster Pons Mariae Astheim | Bistum Würzburg | OCart | ♂ | 1409 | 1803 | Aufgelöst, heute Klostermuseum |
| Volkach | Kloster St. Maria | Bistum Würzburg | OSF | ♀ | 1856 | | |
| Volkach | Kloster Vogelsburg | Bistum Würzburg | OCarm | ♂ | 1282 | 1545 | Aufgelöst |
| W |||||||||
| Walderbach | Kloster Walderbach | Bistum Regensburg | CanReg OCist | ♂ | 1130 1669 | 1556 1803 | Aufgelöst Ursprünglich Augustinerchorherrenstift, später Zisterzienserkloster |
| Waldsassen | Kloster Waldsassen | Bistum Regensburg | OCist | ♀ (♂) | 1133 | | Ursprünglich Zisterzienserkloster, seit 1863 Frauenkloster Zwischenzeitlich von 1571-1661 und 1803-63 aufgehoben |
| Wallerstein | Kloster Wallerstein | Bistum Augsburg | SP CJ | ♂/♀ | 1761 1859 | 1803 2008 | Aufgelöst Ursprünglich Piaristenkloster, später Englische Fräulein |
| Wang | Klostergut Wittibsmühle | Erzbistum München und Freising | SSSF | ♀ | 1917 | 2012 | Aufgelöst |
| Wasserburg am Inn | Kloster Attel | Erzbistum München und Freising | OSB | ♂ | 1137 | 1803 | Aufgelöst |
| Wasserburg am Inn | Kloster Wasserburg | Erzbistum München und Freising | OFMCap | ♂ | 1624 | 1806 | Aufgelöst und abgebrochen |
| Weißenburg in Bayern | Kloster Weißenburg | Bistum Eichstätt | OCarm | ♂ | 1325 | 1526 | Aufgelöst |
| Weißenburg in Bayern | Kloster Wülzburg | Bistum Eichstätt | OSB | ♂ | 1060 | 1537 | Aufgelöst |
| Weißenhorn | Kloster Weißenhorn | Bistum Augsburg | OFMCap | ♂ | 1667 | 1806 | Aufgelöst |
| Weißenohe | Kloster Weißenohe | Erzbistum Bamberg | OSB | ♂ | 1109 | 1803 | Aufgelöst Zwischenzeitlich von 1554-1661 aufgehoben |
| Welden | Kloster Welden | Bistum Augsburg | OCD (TOR) | ♀ | 1571 1931 | 1782* | Ursprünglich Kloster der Terziarinnen, heute Unbeschuhte Karmelitinnen |
| Wertingen | Kloster Weihenberg | Bistum Augsburg | CBMV | ♀ | 1145 | 1448 | Aufgelöst |
| Wessobrunn | Kloster Wessobrunn | Bistum Augsburg | OSB | ♂/♀ | 817 | 2012 | Aufgelöst Ursprünglich Benediktinerkloster von 817-1803 Von 1913–2012 Missions-Benediktinerinnen von Tutzing |
| Wettenhausen | Kloster Wettenhausen | Bistum Augsburg | OP (CanReg) | ♀ (♂) | 1130 1864 | 1803* | Ursprünglich Chorherrenstift, ab 1566 Reichsstift Seit 1864 Dominikanerinnen |
| Weyarn | Kloster Weyarn | Erzbistum München und Freising | CanReg | ♂ | 1133 | 1803 | Aufgelöst |
| Wiesent | Kloster Heilsberg | Bistum Regensburg | | ♂ | 1796 | 1799 | Aufgelöst |
| Windberg | Kloster Windberg | Bistum Regensburg | OPraem | ♂ | 1142 | | Zwischenzeitlich von 1803–1921 aufgehoben |
| Wolnzach | Kloster Wolnzach | Bistum Regensburg | OFMCap | ♂ | 1726 | 1802 | Aufgelöst |
| Würzburg | Kloster Himmelspforten | Bistum Würzburg | OCD (OCist) | ♀ | 1231 1844 | 1804* | Ursprünglich Zisterzienserinnenkloster Seit 1844 Unbeschuhte Karmelitinnen Ein Teil des Klosters ist heute Tagungshaus der Diözese Würzburg |
| Würzburg | Damenstift St. Anna | Bistum Würzburg | | ♀ | 1714 | 1803 | Aufgelöst |
| Würzburg | Kloster St. Alfons | Bistum Würzburg | CSsR | ♂ | 1953 | | |
| Würzburg | Karmelitenkloster St. Barbara | Bistum Würzburg | OCarm | ♀ | 1252 | 1805 | Aufgelöst und abgebrochen (heute Rathaus) |
| Würzburg | Stift St. Burkard | Bistum Würzburg | OSB | ♂ | 983 | 1803 | Aufgelöst Ursprünglich Benediktinerkloster, ab 1470 Kollegiatstift |
| Würzburg | Kloster St. Stephan | Bistum Würzburg | OSB | ♂ | 1057 | 1803 | Aufgelöst Abteikirche ist heute Ev.-Luth. Stadtkirche |
| Würzburg | Agnetenkloster Würzburg | Bistum Würzburg | OSCI | ♀ | 1250 | 1560 | Aufgelöst |
| Würzburg | Antoniterkloster Würzburg | Bistum Würzburg | CRSAnt | ♂ | 1434 | 1545 | Aufgelöst |
| Würzburg | Augustinerinnenkloster Würzburg | Bistum Würzburg | OESA | ♀ | 1460 | 1572 | Aufgelöst |
| Würzburg | Augustinerkloster Würzburg | Bistum Würzburg | OSA | ♂ | 1262 | | Augustiner sind seit 1824 im ehemaligen Dominikanerkloster |
| Würzburg | Provinzialat der Claretiner | Bistum Würzburg | CMF | ♂ | 1989 | | |
| Würzburg | Kloster Engelgarten | Bistum Würzburg | OCart | ♂ | 1352 | 1803 | Aufgelöst |
| Würzburg | Franziskanerkloster Würzburg | Bistum Würzburg | OFMConv | ♂ | 1221 | | Ältestes Franziskanerkloster nördlich der Alpen |
| Würzburg | Kapuzinerkloster Würzburg | Bistum Würzburg | OFMCap | ♂ | 1615 | 2014 | Aufgelöst Kapuzinerkloster in der Stadt 1615-1803 Kloster am Würzburger Käppele 1749–2014 |
| Würzburg | Karmelitenkloster St. Maria Magdalena | Bistum Würzburg | OCD | ♂ | 1627 | | Ursprünglich Kloster der Magdalenerinnen (1227-1564) |
| Würzburg | Kloster Mariä Verkündigung | Bistum Würzburg | OSU | ♀ | 1712 | | Zwischenzeitlich von 1804-08 aufgehoben |
| Würzburg | Kollegiatstift Haug | Bistum Würzburg | | ♂ | 1002 | 1803 | Aufgelöst |
| Würzburg | Kollegiatstift Neumünster | Bistum Würzburg | | ♂ | 1057 | 1803 | Aufgelöst |
| Würzburg | Kloster Oberzell | Bistum Würzburg | OSF (OPraem) | ♀ (♂) | 1128 1901 | 1803* | Ursprünglich Prämonstratenserkloster Seit 1901 Mutterhaus der Oberzeller Franziskanerinnen |
| Würzburg | Schottenkloster Würzburg | Bistum Würzburg | OSB | ♂ | 1139 | 1803 | Aufgelöst, heute Salesianerkloster auf dem Areal |
| Würzburg | Kloster Don Bosco | Bistum Würzburg | SDB | ♂ | 1951 | | Auf dem Areal des ehemaligen Schottenklosters |
| Würzburg | Kloster Unterzell | Bistum Würzburg | OPraem | ♀ | 1230 | 1803 | Zwischenzeitlich von 1562-1642 aufgehoben |
| Würzburg | Kloster Wilberghaus | Bistum Würzburg | TOR | ♀ | 1366 | 1579 | Aufgelöst |
| Z |||||||||
| Zapfendorf | Abtei Maria Frieden Kirchschletten | Erzbistum Bamberg | OSB | ♀ | 1953 | | Wurde durch die Aufnahme Geflüchteter bekannt (Kirchenasyl) |
| Ziertheim | Stift Reistingen | Bistum Augsburg | | ♀ | 1250 | 1450 | Aufgelöst |