# Bathyarchaeia

Die Bathyarchaeen sind eine Klade von Archaeen. Nach ursprünglichem Vorschlag galt diese Gruppe taxonomisch als Kandidatenphylum „Bathyarchaeota“, in neueren Taxonomien fungiert sie aber als Kandidatenklasse Bathyarchaeia. Diese Gruppe ist per Vorschlag ein nachträglich hinzugekommener Teil des „TACK-Superphylums“, so dass sein Anfangsbuchstabe ‚B‘ nicht in das zugehörige Akronym (‚TACK‘) einging.
Obwohl es bisher nicht möglich war, Vertreter dieser Gruppe zu kultivieren, haben Metagenomanalysen ergeben, dass es sich um weit verbreitete Organismen handelt, die in nährstoffarmen Sedimenten des Meeresbodens reichlich vorkommen. Genetische Analysen haben ergeben, dass zumindest einige Linien der „Bathyarchaeota“ einen Stoffwechselweg der Homoacetogenese gehen, was bis dato ausschließlich bei Bakterien beobachtet wurde.

## Beschreibung

Die Bathyarchaeen sind anaerob und scheinen eine Schlüsselrolle im globalen Kohlenstoffkreislauf in terrestrischen und marinen anoxischen Sedimenten zu spielen. Einige Bathyarchaeen sind in der Lage, den archaealen Wood-Ljungdahl-Weg zu gehen, was auf eine Fähigkeit zur CO$_2$-Fixierung durch Acetogenese hindeutet (zuvor nur bei Bakterien bekannt). Von Bedeutung ist, dass einige Vertreter Methanbildner sein könnten, d. h. sie sind anscheinend in der Lage, Methan aus Methanol, Methylsulfiden (Dimethylsulfid etc.) und methylierten Amine zu produzieren.

## Systematik

Die alten/veralteten Bezeichnungen wie MCG-6 weisen auf die frühere Zuordnung zum Phylum Crenarchaeota hin. Wo nicht anders angegeben, folgt die Systematik der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), sowie der Genome Taxonomy Database (GTDB) und der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI), die Metagenomik ist nicht komplett wiedergegeben:
Superphylum „TACK“
* Phylum Thermoproteota Garrity & Holt 2021
** (Phylum) „Candidatus Bathyarchaeota“ Meng et al. 2014
    Synonyme Terrestrical Miscellaneous Crenarchaeotal group, Miscellaneous Crenarchaeotal group, MCG, auch I.3 (veraltet)
*** Klasse „Candidatus Bathyarchaeia“ McGonigle et al. 2019 bzw. Loh et al. 2021 oder Khomyakova et al. 2023
    Synonyme Miscellaneous Crenarchaeotal group 6, MCG-6 (veraltet)
*** Ordnung „Candidatus Baizomonadales“ Hou et al. 2023$^{(P)}$
**** Familie „Candidatus Baizostellaceae“ Hou et al. 2023
***** Gattung „[Baizosediminiarchaeum]“ (formal ergänzt)
****** Spezies „Ca. Baizosediminiarchaeum ligniniphilus“ Yu et al. 2023
**** ohne nähere Zuordnung
****      * Stamm UWMA_0236$^{(P)}$ alias UWMA-0236
****      * Stamm B29_G1$^{(P)}$
*** Ordnung „Candidatus Bathyarchaeales“ Khomyakova et al. 2023
**** Familie „Candidatus Bathyarchaeaceae“ Khomyakova et al. 2023
***** Gattung „Candidatus Bathyarchaeum“ Khomyakova et al. 2023
****** Spezies „Ca. Bathyarchaeum tardum“ Khomyakova et al. 2023
******* Referenzstamm M17CTs alias M17C oder INSDC:CP122380
***** Gattung BA1$^{(G)}$
****** Spezies BA1 sp001399805$^{(G)}$
    Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon BA1$^{(N)}$
***** Gattung BA2$^{(G)}$
****** Spezies BA2 sp001399795$^{(G)}$
    Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon BA2$^{(N)}$
**** Familie „Bathycorpusculaceae“ Loh & Brune 2023
    Synonym UBA233$^{(G)}$ – Gattung Termiticorpusculum syn. mit Bathycorpusculum
***** Gattung „Bathycorpusculum“ Loh & Brune 2023
    Synonym PALSA-86 (NCBI, offenbar verschrieben für PALSA-986; siehe enthaltene Spezies)
    Synonym „[Hafrusarcha]“ (formal ergänzt nach Pallen et al. 2022, NCBI)
    Synonym „Ca. Termiticorpusculum“ Loh et al. 2021
    Synonym „Ca. Termitimicrobium“ Loh et al. 2021$^{(N,G)}$
****** Spezies „Ca. Bathycorpusculum acetigenerans“ Loh & Brune 2023
    Synonym „Ca. Hafrusarcha ugapana“ Pallen et al. 2022$^{(N)}$
    Synonym PALSA-986 sp009781675$^{(N)}$
    Synonym Termiticorpusculum sp009781675$^{(G)}$
******* Referenzstamm Emb289P1_bin127 alias Emb289P1bin127$^{(N,G)}$
****** Spezies „Bathycorpusculum acidaminoxidans“ [„Ca. Bathycorpusculum acidaminoxidans“ Loh & Brune 2023]
    Synonym „Ca. Hafrusarcha ecaria“ Pallen et al. 2022$^{(N)}$
    Synonym PALSA-986 sp009787585$^{(N)}$
    Synonym Termiticorpusculum sp009787585
******* Referenzstamm Co191P4_bin18$^{(N)}$, Co191P4_bin18TS$^{(L)}$, Co191P3bin4$^{(G)}$
****** Spezies „Ca. Bathycorpusculum fermentans“ Loh & Brune 2023
    Synonym „Ca. Hafrusarcha emabaria“ Pallen et al. 2022$^{(N)}$
    PALSA-986 sp009787175$^{(N)}$
    Synonym Termiticorpusculum sp009787175$^{(G)}$
******* Referenzstamm Nc150P4bin1$^{(G)}$
****** Spezies „Ca. Bathycorpusculum grumuli“ Loh & Brune 2023
    Synonym „Ca. Hafrusarcha otegia“ Pallen et al. 2022$^{(N)}$
    PALSA-986 sp009776805$^{(N)}$
    Termiticorpusculum sp009776805$^{(G)}$
******* Referenzstamm Th196P4_bin19 alias Th196P4bin19$^{(N,G)}$
****** Spezies „Ca. Bathycorpusculum hydrogenotrophicum“ Loh & Brune 2023
    Synonym „Ca. Hafrusarcha upamia“ Pallen et al. 2022$^{(N)}$
    PALSA-986 sp009783705$^{(N)}$
    Termiticorpusculum sp009783705$^{(G)}$
******* Referenzstamm Lab288P3_bin169 alias Lab288P3bin169$^{(N,G)}$
****** Spezies „Ca. Bathycorpusculum soli“ Loh & Brune 2023
    Synonym PALSA-986 sp009783705$^{(N)}$
    Synonym Termiticorpusculum sp009783705$^{(G)}$
******* Referenzstamm Pmx449_bin19$^{(N)}$, Lab288P3bin169$^{(G)}$
****** Spezies „Ca. Bathycorpusculum termitum“ Loh & Brune 2023
******* Referenzstamm Cus372_bin2$^{(N)}$
****** Spezies „Ca. Bathycorpusculum terrae“ Loh & Brune 2023
    Synonym „Ca. Hafrusarcha icagaria“ Pallen et al. 2022
    Synonym PALSA-986 sp009779045$^{(N)}$
    Synonym Termiticorpusculum sp009779045$^{(G)}$
******* Referenzstamm Lab288P3_bin115$^{(N)}$, Lab288P4bin25$^{(G)}$
***** Gattung SG8-32-3 (früher miscellaneous Crenarchaeota group-1, MCG-1)
****** Spezies SG8-32-3 sp001273335$^{(G)}$
    Synonym miscellaneous Crenarchaeota group-1 archaeon SG8-32-3$^{(N)}$
****** Spezies miscellaneous Crenarchaeota group-1 archaeon SG8-32-1$^{(N)}$
***** Gattung AD8-1 (früher miscellaneous Crenarchaeota group-6, MCG-6)
****** Spezies AD8-1 sp001273385$^{(G)}$
    Synonym miscellaneous Crenarchaeota group-6 archaeon AD8-1$^{(N)}$
*** Ordnung „Candidatus Hecatellales“ Adam et al. 2022
**** Familie „Candidatus Hecatellaceae“ Adam et al. 2022
***** Gattung „Candidatus Hecatella“ Adam et al. 2022
****** Spezies „Ca. Hecatella orcuttiae“ Adam et al. 2022
******* Referenzstamm JdFR-11$^{(N,G)}$
***** Gattung EX4484-218$^{(G)}$
****** Spezies EX4484-218 sp002254975$^{(G)}$
    Synonym Ca. Hecatellales archaeon ex4484_218$^{(N)}$
    Synonym Ca. Candidatus Bathyarchaeota archaeon ex4484_218$^{(N)}$
***** Gattung B25$^{(G)}$
****** Spezies B25 sp003662515$^{(G)}$
    Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon B25$^{(N)}$
*** Ordnung Ca. Houtuarculales$^{(P)}$
    Synonym 40CM-2-53-6 [ord]$^{(G)}$
**** Familie Candidatus Paludivitaceae
    Synonym BC38-41$^{(P)}$
    Synonym FEN-987$^{(G)}$
***** Klade BC38$^{(P)}$
****** Spezies [Bathyarchaea sp. MBMAG202] (formal ergänzt)
******* Referenzstamm MBMAG202$^{(P)}$
****** Spezies [Bathyarchaea sp. MBMAG504] (formal ergänzt)
******* Referenzstamm MBMAG504$^{(P)}$
***** Klade BC39$^{(P)}$
***** Gattung FEN-987$^{(G)}$
    Synonym BC40$^{(P)}$
****** Spezies FEN-987 sp003152955$^{(G)}$
******* Referenzstamm FEN-987$^{(G)}$ alias fen_987$^{(P)}$ oder fen_987
***** Klade BC41$^{(P)}$
**** ohne Familienzuordnung
***** Klade BC42$^{(P)}$
***** Klade BC47$^{(P)}$
*** Ordnung Wuzhiqiibiales$^{(P)}$
    Synonym TCS64$^{(G)}$
**** Familie B23$^{(G)}$
***** Gattung B23$^{(G)}$
****** Spezies B23 sp001593875$^{(G)}$
    Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon B23$^{(N)}$
**** Familie PIYN01$^{(G)}$
**** Familie TCS64$^{(G)}$
***** Gattung UBA8941$^{(G)}$
    Synonym BC27$^{(P)}$
****** Spezies UBA8941 sp8941u$^{(G)}$
******* Referenzstamm UBA8941$^{(G,P)}$
****** Spezies UBA8941 sp001774245$^{(G)}$
    Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon RBG_13_52_12
******* Referenzstamm RBG_13_52_12 [archaeon]$^{(G,P)}$
**** ohne Familienzuordnung
***** Klade BC24$^{(P)}$
****** Spezies Ca. Bathyarchaeota archaeon TCS64
******* Referenzstamm TCS64 [archaeon]$^{(P)}$
***** Klade BC25$^{(P)}$
****** Spezies Ca. Bathyarchaeota archaeon RBG_13_60_20
******* Referenzstamm RBG_13_60_20 [archaeon]$^{(P)}$
****** Spezies Ca, Bathyarchaeota archaeon RBG_16_57_9
******* Referenzstamm RBG_16_57_9 [archaeon]$^{(P)}$
***** Klade BC29$^{(P)}$
****** ohne nähere Zuordnung
******* Stamm bin91 (nicht Hel238.bin91)$^{(P)}$
******* Stamm Hel238.bin100$^{(P)}$
*** Ordnung Zhuquarculales$^{(P)}$
***      * ohne nähere Zuordnung
***      ** Stamm B42_G17$^{(P)}$
***      ** Stamm B13_G2$^{(P)}$
*** Ordnung B24$^{(G)}$
**** Familie B24$^{(G)}$
***** Gattung B24$^{(G)}$
****** Spezies B24 sp001593865$^{(G)}$
    Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon B24$^{(N)}$
******* Referenzstamm B24, Stamm B27_G17$^{(G)}$
****** Spezies B24 sp021161255$^{(G)}$
******* Referenzstamm AUK243$^{(G)}$
*** Ordnung EX4484-135$^{(G)}$
**** Familie EX4484-135$^{(G)}$
***** Gattung EX4484-135$^{(G)}$
****** Spezies EX4484-135 sp002255025$^{(G)}$
    Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon ex4484_135$^{(N)}$
******* Referenzstamm ex4484_135$^{(G)}$
****** Spezies EX4484-135 sp011040545$^{(G)}$
******* Referenzstamm HyVt-157$^{(G)}$
*** Ordnung JAPDIZ01$^{(G)}$
*** Familie JAPDIZ01$^{(G)}$
**** Gattung JAPDIZ01$^{(G)}$
***** Spezies JAPDIZ01 sp029259355$^{(G)}$
****** Referenzstamm S4B2_HD70$^{(G)}$
*** Ordnung RBG-16-48-13$^{(G)}$
**** Familie GCA-020345945$^{(G)}$
***** Gattung GCA-020345945$^{(G)}$
****** Spezies GCA-020345945 sp020345945$^{(G)}$
******* Referenzstamm bin22$^{(G,P)}$
**** Familie GCA-020355125$^{(G)}$
***** Gattung GCA-020355125$^{(G)}$
****** Spezies GCA-020355125 sp020355125$^{(G)}$
******* Referenzstamm bin796$^{(G,P)}$
**** Familie RBG-16-48-13$^{(G)}$
***** Gattung RBG-16-48-13$^{(G)}$
****** Spezies RBG-16-48-13 sp001775995$^{(G)}$
    Synonym Ca. Bathyarchaeota archaeon RBG_16_48_13$^{(N)}$
******* Referenzstamm RBG_16_48_13$^{(G,N)}$
Mitglieder der Bathyarchaeen ohne nähere Zuordnung:
         * Klade: miscellaneous Crenarchaeota group-15 (MCG-15)
         ** Spezies: miscellaneous Crenarchaeota group-15 archaeon DG-45$^{(N)}$
    (G) – Genome Taxonomy Database (GTDB)
    (L) – List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)
    (N) – Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI)
    (P) – Pavia et al. (2024)