# Janet Thornton

Dame Janet Maureen Thornton (Regne Unit, 23 de maig de 1949) és una científica sènior i directora emèrita a l'Institut Europeu de Bioinformàtica (EBI), el qual forma part del Laboratori Europeu de Biologia Molecular (EMBL). És una de les eminències mundials dins del camp de la bioinformàtica estructural, que utilitza mètodes computacionals per entendre l'estructura i la funció de les proteïnes. Va ser directora de l'EBI des de l'octubre de 2001 fins al juny de 2015, i va tenir un paper clau en el projecte ELIXIR (European life-sciences Infrastructure for biological Information).

## Educació

Després de graduar-se en física a la Universitat de Nottingham, va fer un màster de biofísica al King's College de Londres i un PhD de biofísica al National Institute for Medical Research de Londres, al 1973.

## Carrera i recerca

Un cop finalitzat el seu PhD, Thornton va treballar en biofísica molecular amb David Chilton Phillips a la Universitat d'Oxford. Al 1978, va tornar al National Institute for Medical Research, i posteriorment va aconseguir una beca al Birkbeck College, part de la Universitat de Londres. El 1990 va ser nomenada professora i directora de la unitat especialitzada en estructures biomoleculars al departament de bioquímica i biologia molecular de la University College de Londres, i posteriorment també fou nomenada presidenta del departament de cristal·lografia al Birkbeck College.
Thornton va ser directora de l'Institut Europeu de Bioinformàtica del 2001 fins al 2015, al Wellcome Genome Campus de Hinxton, a prop de Cambridge. Va ser organitzadora de Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) i European Conference on Computational Biology (ECCB), conferència conjunta a Glasgow l'any 2004.
El treball de Thornton és altament interdisciplinari, incloent camps com la biologia estructural, la bioinformàtica, la bioquímica i la quimioinformàtica, entre d'altres. Va ser una de les pioneres en la investigació de la validació estructural macromolecular per a la cristal·lografia de proteïnes, desenvolupant l'àmpliament utilitzat software ProCheck. Juntament amb Christine Orengo va introduir la base de dades d'estructures proteiques CATH. El seu grup va desenvolupar una robusta classificació d'enzims anomenada EC-BLAST que calcula la similitud entre enzims basant-se en reaccions químiques mitjançant la captura dels canvis d'enllaç i els centres de reacció, o la similitud estructural entre ells.
Entre 2008 i 2012 va coordinar la fase preparatòria de ELIXIR, i posteriorment ha seguit formant part del projecte com una de les delegades científiques d'EMBL. Les seves investigacions han estat finançades pel Medical Research Council, el Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), el Wellcome Trust i la Unió Europea.
Thornton també ha supervisat alguns PhD i investigadors postdoctorals incloent Sarah Teichmann i David Tudor Jones.

## Premis i distincions

Thornton va ser elegida membre de la Royal Society el 1999. També va fer-se membre de l'Organització Europea de Biologia Molecular (EMBO) el 2000, col·laboradora estrangera de l'Acadèmia Nacional de Ciències dels Estats Units el 2003, i membre de l'Acadèmia de Ciències Mèdiques (FMedSci) al 2014. Thornton és membre supernumerària del Churchill College de Cambridge. Va ser elegida becària de la Royal Society of Chemistry (FRSC) el 2017.
A més, va ser nomenada Comandant de l'Ordre de l'Imperi Britànic (CBE) al 2000 i Dama Comandant de l'Ordre de l'Imperi Britànic (DBE) a la Birthday Honours List de 2012 pels seus serveis en el camp de la bioinformàtica. La revista The Times va nomenar Thornton núm. 86 de la seva llista "Eureka 100" de científics britànics al 2010. També va ser guardonada amb el premi Suffrage Science l'any 2011.

## Referències

* 1 2 «Thornton, Dame Janet - Who's Who». A & C Blanc, an imprint of Bloomsbury Publishing plc.. United Kingdom: Anon, 2015. DOI: 10.1093/ww/9780199540884.013.U37638.
* ↑ «Professor Dame Janet Thornton: Director, European Bioinformatics Institute». Arxivat de l'original el 9 de juny de 2013.
* 1 2 «Great British bioscience pioneers – Professor Dame Janet Thornton». Arxivat de l'original el 9 de febrer de 2015.
* ↑ Zagorski, N. «Profile of Janet M. Thornton». Proceedings of the National Academy of Sciences, 102, 35, 2005, pàg. 12296–12298. Bibcode: 2005PNAS..10212296Z. DOI: 10.1073/pnas.0505819102. PMC: 1194944. PMID: 16118281.
* ↑ Dean, Caroline; Osborn, Mary; Oshlack, Alicia; Thornton, Janet «Women in Science». Genome Biology, 13, 3, 2012, pàg. 148–201. DOI: 10.1186/gb4005. PMC: 3439960. PMID: 22405408.
* ↑ «Thornton Research Group Page». Arxivat de l'original el 18 d'abril de 2011.
* 1 2 Crosswell, L. C.; Thornton, J. M. «ELIXIR: A distributed infrastructure for European biological data». Trends in Biotechnology, 30, 5, 2012, pàg. 241–242. DOI: 10.1016/j.tibtech.2012.02.002. PMID: 22417641.
* ↑ Thornton, Janet (1975). The conformation of dinucleotides Arxivat 2018-06-10 a Wayback Machine. (PhD thesis). King's College London.
* ↑ Thornton, J. M.; Bayley, P. M. «Conformational energy calculations for dinucleotide molecules. A systematic study of dinucleotide conformation, with application to diadenosine pyrophosphate». Biopolymers, 15, 5, 1976, pàg. 955–975. DOI: 10.1002/bip.1976.360150511. PMID: 177120.
* ↑ Perkins, W. J.; Piper, E. A.; Thornton, J. «Computer techniques for conformational studies of biological molecules». Computers in Biology and Medicine, 6, 1, 1976, pàg. 23–31. DOI: 10.1016/0010-4825(76)90034-2. PMID: 1253578.
* ↑ «Janet Thornton steps down». European Bioinformatics Institute. Arxivat de l'original el 3 de juliol de 2015.
* ↑ «ISMB/ECCB 2004».
* ↑ Laskowski, R. A.; MacArthur, M. W.; Moss, D. S.; Thornton, J. M. «PROCHECK: A program to check the stereochemical quality of protein structures». Journal of Applied Crystallography, 26, 2, 1993, pàg. 283–291. DOI: 10.1107/S0021889892009944.
* ↑ Pearl, F. M.; Bennett, C. F.; Bray, J. E.; Harrison, A. P.; Martin, N; Shepherd, A; Sillitoe, I; Thornton, J; Orengo, C. A. «The CATH database: An extended protein family resource for structural and functional genomics». Nucleic Acids Research, 31, 1, 2003, pàg. 452–5. DOI: 10.1093/nar/gkg062. PMC: 165509. PMID: 12520050.
* ↑ Orengo, C. A.; Michie, A. D.; Jones, S.; Jones, D. T.; Swindells, M. B.; Thornton, J. M. «CATH – a hierarchic classification of protein domain structures». Structure, 5, 8, 1997, pàg. 1093–1109. DOI: 10.1016/S0969-2126(97)00260-8. PMID: 9309224.
* 1 2 Marx, V. «The Author Fitxer: Janet Thornton». Nature Methods, 11, 2, 2014, pàg. 115. DOI: 10.1038/nmeth.2831. PMID: 24645189.
* ↑ Sibanda, B. L.; Blundell, T. L.; Thornton, J. M. «Conformation of beta-hairpins in protein structures. A systematic classification with applications to modelling by homology, electron density fitting and protein engineering». Journal of Molecular Biology, 206, 4, 1989, pàg. 759–77. DOI: 10.1016/0022-2836(89)90583-4. PMID: 2500530.
* ↑ Thornton, J. M.; Singh, J; Campbell, S; Blundell, T. L. «Protein-protein recognition via side-chain interactions». Biochemical Society Transactions, 16, 6, 1988, pàg. 927–30. DOI: 10.1042/bst0160927. PMID: 3224756.
* ↑ Blundell, T. L.; Sibanda, B. L.; Sternberg, M. J.; Thornton, J. M. «Knowledge-based prediction of protein structures and the design of novel molecules». Nature, 326, 6111, 1987, pàg. 347–52. Bibcode: 1987Natur.326..347B. DOI: 10.1038/326347a0. PMID: 3550471.
* ↑ Blundell, T; Barlow, D; Borkakoti, N; Thornton, J «Solvent-induced distortions and the curvature of alpha-helices». Nature, 306, 5940, 1983, pàg. 281–3. Bibcode: 1983Natur.306..281B. DOI: 10.1038/306281a0. PMID: 6646210.
* ↑ Reeves, G. A.; Eilbeck, K.; Magrane, M.; O'Donovan, C.; Montecchi-Palazzi, L.; Harris, M. A.; Orchard, S.; Jimenez, R. C.; Prlic, A. «The Protein Feature Ontology: A tool for the unification of protein feature annotations». Bioinformatics, 24, 23, 2008, pàg. 2767–2772. DOI: 10.1093/bioinformatics/btn528. PMC: 2912506. PMID: 18936051.
* ↑ Rahman, S. A.; Cuesta, S. M.; Furnham, N.; Holliday, G. L.; Thornton, J. M. «EC-BLAST: A tool to automatically search and compare enzyme reactions». Nature Methods, 11, 2, 2014, pàg. 171–4. DOI: 10.1038/nmeth.2803. PMC: 4122987. PMID: 24412978.
* 1 2 Rahman, Syed Asad; Cuesta, Sergio Martinez; Furnham, Nicholas; Holliday, Gemma L.; Thornton, Janet M. «EC-BLAST: a tool to automatically search and compare enzyme reactions» (en anglès). Nature Methods, 11, 2, 01-02-2014, pàg. 171–174. DOI: 10.1038/nmeth.2803. ISSN: 1548-7091. PMC: 4122987. PMID: 24412978.
* ↑ Rahman, Syed Asad; Torrance, Gilliean; Baldacci, Lorenzo; Martínez Cuesta, Sergio; Fenninger, Franz; Gopal, Nimish; Choudhary, Saket; May, John W.; Holliday, Gemma L. «Reaction Decoder Tool (RDT): extracting features from chemical reactions». Bioinformatics, 32, 13, 01-07-2016, pàg. 2065–2066. DOI: 10.1093/bioinformatics/btw096. ISSN: 1367-4811. PMC: 4920114. PMID: 27153692.
* ↑ «ELIXIR's leadership: Governance in ELIXIR's construction phase». Arxivat de l'original el 14 d'octubre de 2013.
* ↑ «UK Government Grants awarded to Janet Thornton». Research Councils UK. Arxivat de l'original el 10 de març de 2015.
* ↑ Anon. «Publications EMBL-EBI PhD Theses», 2014. Arxivat de l'original el 4 de març de 2014.
* ↑ Jones, D. T.; Taylor, W. R.; Thornton, J. M. «A new approach to protein fold recognition». Nature, 358, 6381, 1992, pàg. 86–89. Bibcode: 1992Natur.358...86J. DOI: 10.1038/358086a0. ISSN: 0028-0836. PMID: 1614539.
* ↑ «Why Prof. Thornton was awarded the FRS». Londres: Royal Society. Arxivat de l'original el 12 de novembre de 2007.
* ↑ «The EMBO Pocket Directory». European Molecular Biology Organization. Arxivat de l'original el 16 de març de 2015.
* ↑ «Professor Dame Janet Thornton DBE FRS FMedSci». Academy of Medical Sciences. Arxivat de l'original el 10 de març de 2015.
* ↑ «Professor Dame Janet Thornton PhD, CBE, FRS, DBE, Churchill College, Cambridge». Arxivat de l'original el 10 de març de 2015.
* ↑ «Our Honorary Fellows». Royal Society of Chemistry. [Consulta: 27 febrer 2018].
* ↑ «http://royalsociety.org/DServe/dserve.exe?dsqIni=Dserve.ini&dsqApp=Archive&dsqDb=Catalog&dsqCmd=show.tcl&dsqSearch=%28RefNo%3D%3D%27EC%2F1999%2F34%27%29 EC/1999/34: Thornton, Janet M». Londres: The Royal Society. Arxivat de l'original el 2014-02-18. [Consulta: 2 desembre 2020].
* ↑ "No. 60173". The London Gazette (Supplement). 16 de juny de 2012. p. 6.
* ↑ «Eureka 100: the people that matter». Londres: The Times.
* ↑ «Honour and heirloom for Sarah Teichmann», 09-03-2012.

## Enllaços externs

* Publicacions de Janet Thornton a Europe PubMed Central
* Publicacions de Janet Thornton a PubMed
* Publicacions de Janet Thornton indexades per Google Scholar
* Publicacions de Janet Thornton indexades per la base de dades bibliogràfica Scopus