# قائمة الجينومات العتيقة المتسلسلة

تحتوي هذه القائمة من الجينومات العتيقة المتسلسلةlist of sequenced archaeal genomes) على كل العتائق المعروفة التي لديها تسلسلات جينومية كاملة متاحة للعامة و التي تم تجميعها وشرحها وإيداعها في قواعد بيانات عامة. كانت ميثانوكوكوس جاناشي(Methanococcus jannaschii) أول كائنات عتيقة تم تسلسل جينومها في عام 1996.
يوجد حاليًا في هذه القائمة 39 جينومًا تنتمي إلى أنواع العتائق المصدرية(Crenarchaeota)، و105 تنتمي إلى العتائق العريضة( (Euryarchaeota، وجينوم واحد ينتمي إلى العتائق الشابة(Korarchaeota) وإلى الصغروية(Nanoarchaeota)، و3 تنتمي إلى العتائق العجيبة(Thaumarchaeota )وجينوم واحد ينتمي إلى العتائق غير المصنفة، بإجمالي 150 جينومًا من عتيقا.

## العتائق المصدرية
### حمضيات

| صِنف | السلاسل | أزواج القاعدة | الجينات | مرجع | معرف بنك الجينات | سنة النشر |
| أسيديلوبس ساكاروفورانس | 345-15 | 1,496,000 | 1,547 | | CP001742 | 2010 |

### Desulforococcales

| نوع (تصنيف) | السلسلة | أزواج القاعدة | الجينات | معرف الجينبنك | سنة النشر |
| Aeropyrum pernix | K1 | 1,669,695 | 2,694 | NC_000854 (NCBI Reference Sequence) | 1999 |
| Desulfurococcus kamchatkensis | 1221n | 1,365,000 | 1,521 | CP001140 | 2009 |
| Hyperthermus butylicus | DSM 5456 | 1,667,000 | 1,669 | CP000493 | 2007 |
| Ignicoccus hospitalis | KIN4/I, DSM 18386 | 1,297,000 | 1,496 | CP000816 | 2008 |
| Ignisphaera aggregans | AQ1.S1, DSM 17230 | 1,875,000 | 2,042 | CP002098 | 2010 |
| Pyrolobus fumarii | 1A, DSM 11204 | 1,843,000 | 2,038 | CP002838 | 2011 |
| Staphylothermus hellenicus | P8, DSM 12710 | 1,580,000 | 1,716 | CP002051 | 2011 |
| Staphylothermus marinus | F1, DSM 3639 | 1,570,000 | 1,659 | CP000575 | 2011 |
| Thermosphaera aggregans | M11TL, DSM 11486 | 1,316,000 | 1,457 | CP001939 | 2010 |

### Sulfolobales

| نوع (تصنيف) | السلالة | زوج القواعد | الجينات | الإحالة | معرف الجينبنك | سنة النشر |
| Acidianus hospitalisاسيديانوس هوسبيطالية | W1 | 2,137,000 | 2,424 | | CP002535 | 2011 |
| Metallosphaera cuprina | Ar-4 | 1,840,000 | 2,077 | | CP002656 | 2011 |
| Metallosphaera sedula | DSM 5348 | 2,191,000 | 2,347 | | CP000682 | 2008 |
| Sulfolobus acidocaldarius | DSM 639 | 2,225,959 | 2,223 | | CP000077 | 2005 |
| Sulfolobus islandicus | HVE10/4 | 2,655,000 | | | CP002426 | 2011 |
| Sulfolobus islandicus | L.D.8.5 | 2,722,000 | 2,996 | | Chromosome CP001731 Plasmid pLD8501 CP001732 | 2009 |
| Sulfolobus islandicus | L.S.2.15 | 2,736,000 | 3,068 | | CP001399 | 2009 |
| Sulfolobus islandicus | M.14.25 | 2,608,000 | 2,900 | | CP001400 | 2009 |
| Sulfolobus islandicus | M.16.27 | 2,692,000 | 2,956 | | CP001401 | 2009 |
| Sulfolobus islandicus | M.16.4 | 2,586,000 | 2,869 | | CP001402 | 2009 |
| Sulfolobus islandicus | REY15A | 2,522,000 | | | CP002425 | 2011 |
| Sulfolobus islandicus | Y.G.57.14 | 2,702,000 | 3,079 | | CP001403 | 2009 |
| Sulfolobus islandicus | Y.N.15.51 | 2,812,000 | 3,318 | | Chromosome CP001404 Plasmid pYN01 CP001405 | 2009 |
| Sulfolobus islandicus | LAL14/1 | 2,465,177 | 2,601 | | CP003928 | 2013 |
| Sulfolobus solfataricus | P2 | 2,992,245 | 2,995 | | AE006641 | 2001 |
| Sulfolobus solfataricus | 98/2 | 2,668,000 | 2,728 | DOE Joint Genome Institute | CP001800 | 2009 |
| Sulfolobus tokodaii | 7 | 2,694,765 | 2,826 | | BA000023 | 2001 |

## العتائق العريضة
### أركيوجلوبي

| صِنف | السلاسل | أزواج القاعدة | الجينات | مرجع | معرف الجينبنك | سنة النشر |
| أركيوجلوبس فولجيدوس | الدليل التشخيصي والإحصائي للاضطرابات العقلية رقم 4304 | 2,178,400 | 2,407 | | ايه اي 000782 | 1997 |
| أركيوجلوبس فينيفيكوس | SNP6، DSM 11195 | 1,901,000 | 2,194 | معهد الجينوم المشترك التابع لوزارة الطاقة | CP002588 | 2011 |
| أركيوجلوبس العميق | أف18، دي إس إم 5631 | 1,563,000 | 1,911 | | الكروموسوم CP001857 </br> البلازميد pArcpr01 CP001858 | 2010 |
| فيروجلوبس بلاسيدوس | AEDII12DO، DSM 10642 | 2,196,000 | 2,622 | | CP001899 | 2011 |

### الميثانوبيرى

| صِنف | أَضْنَى | أزواج القاعدة | الجينات | مرجع | معرف GenBank | سنة النشر |
| ميثانوبيرس كاندليري | ايه في 19 | 1,694,969 | 1,691 | | ايه اي 009439 | 2002 |

### ثيرموبلازما

| صِنف | أَضْنَى | أزواج القاعدة | الجينات | معرف GenBank | سنة النشر |
| حمض الفيروبلازما | فير1 | 1,865,000 | 1,742 | AABC00000000 | 2007 |
| بيكروفيلوس توريدوس | الدليل التشخيصي والإحصائي للأمراض النفسية 9790 | 1,545,895 | 1,535 | AE017261 | 2004 |
| ثيرموبلازما أسيدوفيلوم | الدليل التشخيصي والإحصائي للأمراض العقلية 1728 | 1,564,906 | 1,478 | NC_002578 (تسلسل مرجعي NCBI) | 2000 |
| البلازما الحرارية البركانية | جي اس اس 1 | 1,584,804 | 1,526 | NC_002689 (تسلسل مرجعي NCBI) | 2000 |

### العتائق العريضة غير المصنفة

| صِنف | أَضْنَى | أزواج القاعدة | الجينات | مرجع | معرف GenBank | سنة النشر |
| حمض البونيه | ت469 | 1,486,000 | 1,587 | معهد الجينوم المشترك التابع لوزارة الطاقة | CP001941 | 2010 |

## العتائق الشابة

| صِنف | أالسلاسل | أزواج القاعدة | الجينات | مرجع | معرف الجينبنك | سنة النشر |
| Candidatus Korarchaeum cryptofilum | أو بي إف 8 | 1,590,000 | 1,661 | | CP000968 | 2008 |

## العتائق الصغروية

| صِنف | السلاسل | أزواج القاعدة | الجينات | مرجع | معرف الجينبنك | سنة النشر |
| نانوآركيوم إيكويتانس | كين4-M | 490,885 | 536 | | AE017199 | 2003 |

## العتائق العجيبة
### سينارخياليس

| صِنف | السلاسل | أزواج القاعدة | الجينات | مرجع | معرف الجينبنك | سنة النشر |
| سيناركايوم سيمبيوسوم | أ | 2,045,000 | 2,066 | | رقم DP000238 | 2006 |

### نيتروسوبوميلاس

| صِنف | السلاسل | أزواج القاعدة | الجينات | مرجع | معرف الجينبنك | سنة النشر |
| Candidatus Nitrosoarchaeum limnia | إس إف بي 1 | 1,769,000 | 2,171 | | جنيه مصري00000000 | 2011 |
| نيتروسوبوميلوس ماريتيموس | سكم1 | 1,645,000 | 1,842 | | CP000866 | 2010 |

## العتائق غير المصنفة

| صِنف | السلاسل | أزواج القاعدة | الجينات | مرجع | معرف الجينبنك | سنة النشر |
| العتائق المحبة للملوحة دي ال 31 | | | | غير منشور | CP002988 | 2011 |

## انظر أيضا

* مشروع الجينوم
* مشروع الميكروبيوم البشري
* قوائم الجينومات المتسلسلة

## مراجع

* ↑ Bult CJ، White O، Olsen GJ، Zhou L، Fleischmann RD، Sutton GG، وآخرون (أغسطس 1996). "Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii". Science. ج. 273 ع. 5278: 1058–73. Bibcode:1996Sci...273.1058B. DOI:10.1126/science.273.5278.1058. PMID:8688087. S2CID:41481616.
* ↑ Mardanov AV، Svetlitchnyi VA، Beletsky AV، Prokofeva MI، Bonch-Osmolovskaya EA، Ravin NV، Skryabin KG (أغسطس 2010). "The genome sequence of the crenarchaeon Acidilobus saccharovorans supports a new order, Acidilobales, and suggests an important ecological role in terrestrial acidic hot springs". Applied and Environmental Microbiology. ج. 76 ع. 16: 5652–7. Bibcode:2010ApEnM..76.5652M. DOI:10.1128/AEM.00599-10. PMC:2918975. PMID:20581186.
* ↑ Kawarabayasi Y، Hino Y، Horikawa H، Yamazaki S، Haikawa Y، Jin-no K، وآخرون (أبريل 1999). "Complete genome sequence of an aerobic hyper-thermophilic crenarchaeon, Aeropyrum pernix K1". DNA Research. ج. 6 ع. 2: 83–101, 145–52. DOI:10.1093/dnares/6.2.83. PMID:10382966.
* ↑ Ravin NV، Mardanov AV، Beletsky AV، Kublanov IV، Kolganova TV، Lebedinsky AV، وآخرون (أبريل 2009). "Complete genome sequence of the anaerobic, protein-degrading hyperthermophilic crenarchaeon Desulfurococcus kamchatkensis". Journal of Bacteriology. ج. 191 ع. 7: 2371–9. DOI:10.1128/JB.01525-08. PMC:2655497. PMID:19114480.
* ↑ Brügger K، Chen L، Stark M، Zibat A، Redder P، Ruepp A، وآخرون (مايو 2007). "The genome of Hyperthermus butylicus: a sulfur-reducing, peptide fermenting, neutrophilic Crenarchaeote growing up to 108 degrees C". Archaea. ج. 2 ع. 2: 127–35. DOI:10.1155/2007/745987. PMC:2686385. PMID:17350933.
* ↑ Podar M، Anderson I، Makarova KS، Elkins JG، Ivanova N، Wall MA، وآخرون (2008). "A genomic analysis of the archaeal system Ignicoccus hospitalis-Nanoarchaeum equitans". Genome Biology. ج. 9 ع. 11: R158. DOI:10.1186/gb-2008-9-11-r158. PMC:2614490. PMID:19000309.
* ↑ Göker M، Held B، Lapidus A، Nolan M، Spring S، Yasawong M، وآخرون (أغسطس 2010). "Complete genome sequence of Ignisphaera aggregans type strain (AQ1.S1)". Standards in Genomic Sciences. ج. 3 ع. 1: 66–75. DOI:10.4056/sigs.1072907. PMC:3035270. PMID:21304693.
* ↑ Anderson I، Göker M، Nolan M، Lucas S، Hammon N، Deshpande S، وآخرون (يوليو 2011). "Complete genome sequence of the hyperthermophilic chemolithoautotroph Pyrolobus fumarii type strain (1A)". Standards in Genomic Sciences. ج. 4 ع. 3: 381–92. DOI:10.4056/sigs.2014648. PMC:3156397. PMID:21886865.
* ↑ Anderson I، Wirth R، Lucas S، Copeland A، Lapidus A، Cheng JF، وآخرون (أكتوبر 2011). "Complete genome sequence of Staphylothermus hellenicus P8". Standards in Genomic Sciences. ج. 5 ع. 1: 12–20. DOI:10.4056/sigs.2054696. PMC:3236042. PMID:22180806.
* ↑ Anderson IJ، Dharmarajan L، Rodriguez J، Hooper S، Porat I، Ulrich LE، وآخرون (أبريل 2009). "The complete genome sequence of Staphylothermus marinus reveals differences in sulfur metabolism among heterotrophic Crenarchaeota". BMC Genomics. ج. 10: 145. DOI:10.1186/1471-2164-10-145. PMC:2678158. PMID:19341479.
* ↑ Spring S، Rachel R، Lapidus A، Davenport K، Tice H، Copeland A، وآخرون (يونيو 2010). "Complete genome sequence of Thermosphaera aggregans type strain (M11TL)". Standards in Genomic Sciences. ج. 2 ع. 3: 245–59. DOI:10.4056/sigs.821804. PMC:3035292. PMID:21304709.
* ↑ You XY، Liu C، Wang SY، Jiang CY، Shah SA، Prangishvili D، وآخرون (يوليو 2011). "Genomic analysis of Acidianus hospitalis W1 a host for studying crenarchaeal virus and plasmid life cycles". Extremophiles. ج. 15 ع. 4: 487–97. DOI:10.1007/s00792-011-0379-y. PMC:3119797. PMID:21607549.
* ↑ Liu LJ، You XY، Zheng H، Wang S، Jiang CY، Liu SJ (يوليو 2011). "Complete genome sequence of Metallosphaera cuprina, a metal sulfide-oxidizing archaeon from a hot spring". Journal of Bacteriology. ج. 193 ع. 13: 3387–8. DOI:10.1128/JB.05038-11. PMC:3133273. PMID:21551305.
* ↑ Auernik KS، Maezato Y، Blum PH، Kelly RM (فبراير 2008). "The genome sequence of the metal-mobilizing, extremely thermoacidophilic archaeon Metallosphaera sedula provides insights into bioleaching-associated metabolism". Applied and Environmental Microbiology. ج. 74 ع. 3: 682–92. Bibcode:2008ApEnM..74..682A. DOI:10.1128/AEM.02019-07. PMC:2227735. PMID:18083856.
* ↑ Chen L، Brügger K، Skovgaard M، Redder P، She Q، Torarinsson E، وآخرون (يوليو 2005). "The genome of Sulfolobus acidocaldarius, a model organism of the Crenarchaeota". Journal of Bacteriology. ج. 187 ع. 14: 4992–9. DOI:10.1128/JB.187.14.4992-4999.2005. PMC:1169522. PMID:15995215.
* 1 2 Guo L، Brügger K، Liu C، Shah SA، Zheng H، Zhu Y، وآخرون (أبريل 2011). "Genome analyses of Icelandic strains of Sulfolobus islandicus, model organisms for genetic and virus-host interaction studies". Journal of Bacteriology. ج. 193 ع. 7: 1672–80. DOI:10.1128/JB.01487-10. PMC:3067641. PMID:21278296.
* 1 2 3 4 5 6 7 Reno ML، Held NL، Fields CJ، Burke PV، Whitaker RJ (مايو 2009). "Biogeography of the Sulfolobus islandicus pan-genome". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 106 ع. 21: 8605–10. Bibcode:2009PNAS..106.8605R. DOI:10.1073/pnas.0808945106. PMC:2689034. PMID:19435847.
* ↑ Jaubert C، Danioux C، Oberto J، Cortez D، Bize A، Krupovic M، وآخرون (أبريل 2013). "Genomics and genetics of Sulfolobus islandicus LAL14/1, a model hyperthermophilic archaeon". Open Biology. ج. 3 ع. 4: 130010. DOI:10.1098/rsob.130010. PMC:3718332. PMID:23594878.
* ↑ She Q، Singh RK، Confalonieri F، Zivanovic Y، Allard G، Awayez MJ، وآخرون (يوليو 2001). "The complete genome of the crenarchaeon Sulfolobus solfataricus P2". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 98 ع. 14: 7835–40. Bibcode:2001PNAS...98.7835S. DOI:10.1073/pnas.141222098. PMC:35428. PMID:11427726.
* ↑ Kawarabayasi Y، Hino Y، Horikawa H، Jin-no K، Takahashi M، Sekine M، وآخرون (أغسطس 2001). "Complete genome sequence of an aerobic thermoacidophilic crenarchaeon, Sulfolobus tokodaii strain7". DNA Research. ج. 8 ع. 4: 123–40. DOI:10.1093/dnares/8.4.123. PMID:11572479.
* ↑ Klenk HP، Clayton RA، Tomb JF، White O، Nelson KE، Ketchum KA، وآخرون (نوفمبر 1997). "The complete genome sequence of the hyperthermophilic, sulphate-reducing archaeon Archaeoglobus fulgidus". Nature. ج. 390 ع. 6658: 364–70. Bibcode:1997Natur.390..364K. DOI:10.1038/37052. PMID:9389475.
* ↑ von Jan M، Lapidus A، Del Rio TG، Copeland A، Tice H، Cheng JF، وآخرون (يونيو 2010). "Complete genome sequence of Archaeoglobus profundus type strain (AV18)". Standards in Genomic Sciences. ج. 2 ع. 3: 327–46. DOI:10.4056/sigs.942153. PMC:3035285. PMID:21304717.
* ↑ Anderson I، Risso C، Holmes D، Lucas S، Copeland A، Lapidus A، وآخرون (أكتوبر 2011). "Complete genome sequence of Ferroglobus placidus AEDII12DO". Standards in Genomic Sciences. ج. 5 ع. 1: 50–60. DOI:10.4056/sigs.2225018. PMC:3236036. PMID:22180810.
* ↑ Slesarev AI، Mezhevaya KV، Makarova KS، Polushin NN، Shcherbinina OV، Shakhova VV، وآخرون (أبريل 2002). "The complete genome of hyperthermophile Methanopyrus kandleri AV19 and monophyly of archaeal methanogens". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 99 ع. 7: 4644–9. Bibcode:2002PNAS...99.4644S. DOI:10.1073/pnas.032671499. PMC:123701. PMID:11930014.
* ↑ Allen EE، Tyson GW، Whitaker RJ، Detter JC، Richardson PM، Banfield JF (فبراير 2007). "Genome dynamics in a natural archaeal population". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 104 ع. 6: 1883–8. Bibcode:2007PNAS..104.1883A. DOI:10.1073/pnas.0604851104. PMC:1794283. PMID:17267615.
* ↑ Fütterer O، Angelov A، Liesegang H، Gottschalk G، Schleper C، Schepers B، وآخرون (يونيو 2004). "Genome sequence of Picrophilus torridus and its implications for life around pH 0". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 101 ع. 24: 9091–6. Bibcode:2004PNAS..101.9091F. DOI:10.1073/pnas.0401356101. PMC:428478. PMID:15184674.
* ↑ Ruepp A، Graml W، Santos-Martinez ML، Koretke KK، Volker C، Mewes HW، وآخرون (سبتمبر 2000). "The genome sequence of the thermoacidophilic scavenger Thermoplasma acidophilum". Nature. ج. 407 ع. 6803: 508–13. Bibcode:2000Natur.407..508R. DOI:10.1038/35035069. PMID:11029001.
* ↑ Kawashima T، Amano N، Koike H، Makino S، Higuchi S، Kawashima-Ohya Y، وآخرون (ديسمبر 2000). "Archaeal adaptation to higher temperatures revealed by genomic sequence of Thermoplasma volcanium". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 97 ع. 26: 14257–62. Bibcode:2000PNAS...9714257K. DOI:10.1073/pnas.97.26.14257. PMC:18905. PMID:11121031.
* ↑ Elkins JG، Podar M، Graham DE، Makarova KS، Wolf Y، Randau L، وآخرون (يونيو 2008). "A korarchaeal genome reveals insights into the evolution of the Archaea". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 105 ع. 23: 8102–7. Bibcode:2008PNAS..105.8102E. DOI:10.1073/pnas.0801980105. PMC:2430366. PMID:18535141.
* ↑ Waters E، Hohn MJ، Ahel I، Graham DE، Adams MD، Barnstead M، وآخرون (أكتوبر 2003). "The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 100 ع. 22: 12984–8. Bibcode:2003PNAS..10012984W. DOI:10.1073/pnas.1735403100. PMC:240731. PMID:14566062.
* ↑ Hallam SJ، Konstantinidis KT، Putnam N، Schleper C، Watanabe Y، Sugahara J، وآخرون (نوفمبر 2006). "Genomic analysis of the uncultivated marine crenarchaeote Cenarchaeum symbiosum". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 103 ع. 48: 18296–301. Bibcode:2006PNAS..10318296H. DOI:10.1073/pnas.0608549103. PMC:1643844. PMID:17114289.
* ↑ Blainey PC، Mosier AC، Potanina A، Francis CA، Quake SR (فبراير 2011). "Genome of a low-salinity ammonia-oxidizing archaeon determined by single-cell and metagenomic analysis". PLOS ONE. ج. 6 ع. 2: e16626. Bibcode:2011PLoSO...616626B. DOI:10.1371/journal.pone.0016626. PMC:3043068. PMID:21364937.
* ↑ Walker CB، de la Torre JR، Klotz MG، Urakawa H، Pinel N، Arp DJ، وآخرون (مايو 2010). "Nitrosopumilus maritimus genome reveals unique mechanisms for nitrification and autotrophy in globally distributed marine crenarchaea". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 107 ع. 19: 8818–23. Bibcode:2010PNAS..107.8818W. DOI:10.1073/pnas.0913533107. PMC:2889351. PMID:20421470.
* ↑ "GOLD". مؤرشف من الأصل في 2015-03-27.
* بوابة علم الأحياء
* بوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي