分子系統学演習をdockerで（作業中）

分子系統学演習 データセットの作成から仮説検定まで 田辺晶史 2015/10/20
https://www.fifthdimension.jp/documents/molphytextbook/molphytextbook.ja.html

をdockerで動かそうと悪戦苦闘中（作業中）

# java
最適な Java の Docker イメージを選びたい
https://k11i.biz/blog/2018/05/17/base-docker-images-for-java/

Java 11 リリース後のオススメ Docker イメージを考える
https://k11i.biz/blog/2018/10/29/base-docker-images-for-java11/

Javaのサポートについてのまとめ2018
https://qiita.com/nowokay/items/edb5c5df4dbfc4a99ffb

JDKの公式Dockerイメージを使って手っ取り早くjshellを使うメモ
https://qiita.com/hi5san/items/d2f2fc77683530073267

```
$ docker run -v /tmp/work:/tmp/work -it openjdk /bin/bash
docker: Cannot connect to the Docker daemon at unix:///var/run/docker.sock. Is the docker daemon running?.
See 'docker run --help'.
```

```
# apt update; apt -y upgrade
bash: apt: command not found
```

# openjdk
https://hub.docker.com/_/openjdk

adoptopenjdk

https://hub.docker.com/_/adoptopenjdk

adoptopenjdk/openjdk11 - Docker Hub
https://hub.docker.com/r/adoptopenjdk/openjdk11/

```
$ docker run -v /tmp/work:/tmp/work -it adoptopenjdk/openjdk11:alpine-slim  /bin/bash
Unable to find image 'adoptopenjdk/openjdk11:alpine-slim' locally
alpine-slim: Pulling from adoptopenjdk/openjdk11
c9b1b535fdd9: Pull complete 
c27d8e400471: Pull complete 
deee333e69e3: Pull complete 
951b04c9812e: Pull complete 
Digest: sha256:9f18e54372102ed0cd3cb782d49d147d03cc2f3a8f08f096ee95b84563685441
Status: Downloaded newer image for adoptopenjdk/openjdk11:alpine-slim
docker: Error response from daemon: OCI runtime create failed: container_linux.go:346: starting container process caused "exec: \"/bin/bash\": stat /bin/bash: no such file or directory": unknown.
```

# 参考資料(reference)
Dockerで色んなJDKを試す
https://qiita.com/kikutaro/items/d140f519253f276b94e0

DockerコミュニティがメンテしているOpenJDKイメージを使って遭遇した問題
https://matsumana.info/blog/2018/10/13/openjdk11-docker/

## 自己参考資料(self reference)
生物系統計資料
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/6ebfb7bae0495424061e

日本語（０）一欄
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/7498dcfa3a9ba7fd1e68

英語(0) 一覧
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/680e3f5cbf9430486c7d

音楽　一覧(0) 
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/b6e5f42bbfe3bbe40f5d

「@kazuo_reve 新人の方によく展開している有益な情報」確認一覧 
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/b9380888d1e5a042646b

鉄道（０）鉄道のシステム考察はてっちゃんがてつだってくれる
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/faa4ea03d91d901a618a

OSEK OS設計の基礎　OSEK(100)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/7528a22a14242d2d58a3

coding (101) 一覧を作成し始めた。omake:最近のQiitaで表示しない5つの事象
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/20667f09f19598aedb68

官公庁・学校・公的団体（NPOを含む）システムの課題、官（０）
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/04ee6eaf7ec13d3af4c3

「はじめての」シリーズ　 ベクタージャパン　
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/2e41634f6e21a3cf74eb

AUTOSAR(0)Qiita記事一覧, OSEK(75)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/89c07961b59a8754c869

プログラマが知っていると良い「公序良俗」
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/9fe7c0dfac2fbd77a945

LaTeX(0) 一覧　
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/e3f7dafacab58c499792

自動制御、制御工学一覧（０）
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/7767a4e19a6ae1479e6b

Rust(0) 一覧　
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/5e8bb080ba6ca0281927

programの本質は計画だ。programは設計だ。
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/c8545a769c246a458c27

登壇直後版 色使い(JIS安全色) Qiita Engineer Festa 2023〜私しか得しないニッチな技術でLT〜 スライド編 0.15
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プログラマが知っていると良い「公序良俗」
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逆も真：社会人が最初に確かめるとよいこと。OSEK(69)、Ethernet(59)
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統計の嘘。仮説（127）
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自分の言葉だけで論理展開できるのが天才なら、文章の引用だけで論理展開できるのが秀才だ。仮説（136）
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参考文献駆動執筆(references driven writing)・デンソークリエイト編
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「何を」よりも「誰を」。１０年後のために今見習いたい人たち
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Qiitaの記事に３段階または５段階で到達するための方法
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出力(output)と呼ばないで。これは状態(state)です。
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祝休日・謹賀新年 2025年の目標
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あなたは「勘違いまとめ」から、勘違いだと言っていることが勘違いだといくつ見つけられますか。人間の間違い(human error(125))の種類と対策
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プログラマの「プログラムが書ける」思い込みは強みだ。３つの理由。仮説（168）統計と確率(17) , OSEK(79)
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出力(output)と呼ばないで。これは状態(state)です。
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/80b8b5913b2748867840

これからの情報伝達手段の在り方について考えてみよう。炎上と便乗。
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ISO/IEC JTC1 SC7 Software and System Engineering
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/48b43f0f6976a078d907

アクセシビリティの知見を発信しよう！（再び）
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/03457eb9ee74105ee618

統計論及確率論輪講（再び）
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/590874ccfca988e85ea3

読者の心をグッと惹き寄せる7つの魔法
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/b1b5e89bd5c0a211d862

「@kazuo_reve 新人の方によく展開している有益な情報」確認一覧
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/b9380888d1e5a042646b

ソースコードで議論しよう。日本語で議論するの止めましょう（あるプログラミング技術の議論報告）
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/8b9811c80f3338c6c0b0

脳内コンパイラの3つの危険
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/7025cf2d7bd9f276e382

心理学の本を読むよりはコンパイラ書いた方がよくね。仮説（34）
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/fa715732cc148e48880e

NASAを超えるつもりがあれば読んでください。
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/e81669f9cb53109157f6

データサイエンティストの気づき!「勉強して仕事に役立てない人。大嫌い!!」『それ自分かも?』ってなった!!! 
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/d85830d58d8dd7f71d07

「ぼくの好きな先生」「人がやらないことをやれ」プログラマになるまで。仮説（37）　
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/53e4bded9fe5f724b3c4

なぜ経済学徒を辞め、計算機屋になったか（経済学部入学前・入学後・卒業後対応） 転職(1)  
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/06335a1d24c099733f64    

プログラミング言語教育のXYZ。 仮説（52） 
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/1950c5810fb5c0b07be4

【24卒向け】9ヶ月後に年収１０００万円を目指す。二つの関門と三つの道。
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/fb5bff147193f726ad25

「【25卒向け】Qiita Career Meetup for STUDENT」予習の勧め
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/00eadb8a6e738cb6336f

大学入試不合格でも筆記試験のない大学に入って卒業できる。卒業しなくても博士になれる。
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/74adec99f396d64b5fd5

全世界の不登校の子供たち「博士論文」を書こう。世界子供博士論文遠隔実践中心 安全(99)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/912d69032c012bcc84f2

日本のプログラマが世界で戦える16分野。仮説(53),統計と確率(25) 転職(32)、Ethernet(58)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/a7e634a996cdd02bc53b

小川メソッド　覚え（書きかけ）
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/3593d72eca551742df68

DoCAP（ドゥーキャップ）って何ですか？
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amazon 殿堂入りNo1レビュアになるまで。仮説(102)
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水道局10年(1976,4-1986,3)を振り返る
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小川清最終講義、最終講義（再）計画, Ethernet(100) 英語(100) 安全(100)
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＜この記事は個人の過去の経験に基づく個人の感想です。現在所属する組織、業務とは関係がありません。＞
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Este artículo es una impresión personal basada en mi experiencia personal. No tiene nada que ver con la organización o empresa a la que pertenezco actualmente.
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ver. 0.01 初稿 20200323
ver. 0.04 URL追記　20230307
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