dockerで機械学習(28) with anaconda(28)「Feature Engineering for Machine Learning」 By Alice Zheng, Amanda Casari

# 1.すぐに利用したい方へ(as soon as)
「Feature Engineering for Machine Learning」 By Alice Zheng, Amanda Casari
![cat28.gif](https://qiita-image-store.s3.amazonaws.com/0/51423/3fd5b7f2-74b1-3817-b7fa-855d46eea26b.gif)
http://shop.oreilly.com/product/0636920049081.do

## docker
dockerを導入し、Windows, Macではdockerを起動しておいてください。
Windowsでは、BiosでIntel Virtualizationをenableにしないとdockerが起動しない場合があります。
また、セキュリティの警告などが出ることがあります。

## docker pull and run

```
$ docker pull kaizenjapan/anaconda-alice

$ docker run -it -p 8888:8888 kaizenjapan/anaconda-alice /bin/bash
```

以下のshell sessionでは
(base) root@f19e2f06eabb:/#は入力促進記号(comman prompt)です。実際には数字の部分が違うかもしれません。この行の#の右側を入力してください。
それ以外の行は出力です。出力にエラー、違いがあれば、コメント欄などでご連絡くださると幸いです。
それぞれの章のフォルダに移動します。

dockerの中と、dockerを起動したOSのシェルとが表示が似ている場合には、どちらで捜査しているか間違えることがあります。dockerの入力促進記号(comman prompt)に気をつけてください。

## ファイル共有または複写
dockerとdockerを起動したOSでは、ファイル共有をするか、ファイル複写するかして、生成したファイルをブラウザ等表示させてください。参考文献欄にやり方のURLを記載しています。

複写の場合は、dockerを起動したOS側コマンドを実行しました。お使いのdockerの番号で置き換えてください。複写したファイルをブラウザで表示し内容確認しました。


```
cd feature-engineering-book/
(base) root@b350954ba6b4:/feature-engineering-book# ls
02.02_Binning.ipynb				   06.01_PCA_on_MNIST_digits.ipynb
02.03-06_Counts.ipynb				   07.00_Swiss_roll.ipynb
02.06-11_Log-Transformation_prediction.ipynb	   07.01-02_K-means.ipynb
02.12-14_Box-Cox_Transform.ipynb		   07.03-05_K-means_featurization.ipynb
02.12_Power_Transforms.ipynb			   08.01_HOG_image_features.ipynb
02.17_Interaction_Features_Example.ipynb	   08.02_Gaussian_filter.ipynb
03.01_Count_words.ipynb				   09.01-05_[End-to-End_Example]_Recommender_Take_1.ipynb
03.02_Chunking_and_POS_Tagging.ipynb		   09.06-14_[End-to-End_Example]_Recommender_Take_2.ipynb
04.01-06_Tf-idf.ipynb				   LICENSE
05.01-02_Regression_on_Categorical_Variable.ipynb  README.md
05.05_Feature_Hashing.ipynb			   kmeans_featurizer.py
05.06_Bin_Counting.ipynb
(base) root@b350954ba6b4:/feature-engineering-book# python kmeans_featurizer.py 

```


## jupyternotebook


```
(base) root@b350954ba6b4:/feature-engineering-book# jupyter notebook --ip=0.0.0.0 --allow-root
[I 21:16:20.077 NotebookApp] JupyterLab extension loaded from /opt/conda/lib/python3.6/site-packages/jupyterlab
[I 21:16:20.078 NotebookApp] JupyterLab application directory is /opt/conda/share/jupyter/lab
[I 21:16:20.085 NotebookApp] Serving notebooks from local directory: /feature-engineering-book
[I 21:16:20.085 NotebookApp] The Jupyter Notebook is running at:
[I 21:16:20.085 NotebookApp] http://(b350954ba6b4 or 127.0.0.1):8888/?token=cb3eb124268a8a9368a4557db76e8424a244543312f27524
[I 21:16:20.085 NotebookApp] Use Control-C to stop this server and shut down all kernels (twice to skip confirmation).
[W 21:16:20.087 NotebookApp] No web browser found: could not locate runnable browser.
[C 21:16:20.087 NotebookApp] 
    
    Copy/paste this URL into your browser when you connect for the first time,
    to login with a token:
        http://(b350954ba6b4 or 127.0.0.1):8888/?token=cb3eb124268a8a9368a4557db76e8424a244543312f27524
```

ブラウザで
localhost:8888
を開く

<img width="453" alt="68747470733a2f2f71696974612d696d6167652d73746f72652e73332e616d617a6f6e6177732e636f6d2f302f35313432332f34643333383165622d653832302d336437372d316635352d6665303161396231353731342e706e67.png" src="https://qiita-image-store.s3.amazonaws.com/0/51423/7c4bd7ae-2a80-cd52-e897-483f0c20267f.png">


上記の場合は、token に
cb3eb124268a8a9368a4557db76e8424a244543312f27524
を入れる。




<img width="985" alt="ju28-2.png" src="https://qiita-image-store.s3.amazonaws.com/0/51423/b6dff20a-5b51-5899-b63f-712a178b8e3e.png">

<img width="978" alt="ju28-2-6.png" src="https://qiita-image-store.s3.amazonaws.com/0/51423/3336a0fd-742b-bcfa-a461-55d46271e3af.png">



# 2. dockerを自力で構築する方へ

ここから下は、上記のpullしていただいたdockerをどういう方針で、どういう手順で作ったかを記録します。
上記のdockerを利用する上での参考資料です。本の続きを実行する上では必要ありません。
自力でdocker/anacondaを構築する場合の手順になります。
dockerfileを作る方法ではありません。ごめんなさい。
## docker

ubuntu, debianなどのLinuxを、linux, windows, mac osから共通に利用できる仕組み。
利用するOSの設定を変更せずに利用できるのがよい。
同じ仕様で、大量の人が利用することができる。
ソフトウェアの開発元が公式に対応しているものと、利用者が便利に仕立てたものの両方が利用可能である。今回は、公式に配布しているものを、自分で仕立てて、他の人にも利用できるようにする。
## python

DeepLearningの実習をPhthonで行って来た。
pythonを使う理由は、多くの機械学習の仕組みがpythonで利用できることと、Rなどの統計解析の仕組みもpythonから容易に利用できることがある。
### anaconda

pythonには、2と３という版の違いと、配布方法の違いなどがある。
Anacondaでpython3をこの１年半利用してきた。
Anacondaを利用した理由は、統計解析のライブラリと、JupyterNotebookが初めから入っているからである。
## docker公式配布

ubuntu, debianなどのOSの公式配布,gcc, anacondaなどの言語の公式配布などがある。
これらを利用し、docker-hubに登録することにより、公式配布の質の確認と、変更権を含む幅広い情報の共有ができる。dockerが公式配布するものではなく、それぞれのソフト提供者の公式配布という意味。
### docker pull

docker公式配布の利用は、URLからpullすることで実現する。
### docker Anaconda

anacondaが公式配布しているものを利用。

```
$  docker pull kaizenjapan/anaconda-keras
Using default tag: latest
latest: Pulling from continuumio/anaconda3
Digest: sha256:e07b9ca98ac1eeb1179dbf0e0bbcebd87701f8654878d6d8ce164d71746964d1
Status: Image is up to date for continuumio/anaconda3:latest

$ docker run -it -p 8888:8888 continuumio/anaconda3 /bin/bash
````
実際にはkeras, tensorflow を利用していた他のpushをpull

## apt

```shell-session
(base) root@d8857ae56e69:/# apt update

(base) root@d8857ae56e69:/# apt install -y procps

(base) root@d8857ae56e69:/# apt install -y vim

(base) root@d8857ae56e69:/# apt install -y apt-utils

(base) root@d8857ae56e69:/# apt install sudo
```

## ソース git

```
(base) root@f19e2f06eabb:/# git clone https://github.com/alicezheng/feature-engineering-book
```

## conda

```
# conda update --prefix /opt/conda anaconda
Solving environment: done

```

## pip

```
(base) root@f19e2f06eabb:/deep-learning-from-scratch-2/ch01# pip install --upgrade pip
Collecting pip
  Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/5f/25/e52d3f31441505a5f3af41213346e5b6c221c9e086a166f3703d2ddaf940/pip-18.0-py2.py3-none-any.whl (1.3MB)
    100% |████████████████████████████████| 1.3MB 2.0MB/s 
distributed 1.21.8 requires msgpack, which is not installed.
Installing collected packages: pip
  Found existing installation: pip 10.0.1
    Uninstalling pip-10.0.1:
      Successfully uninstalled pip-10.0.1
Successfully installed pip-18.0
(
```

#docker hubへの登録

```
$ docker ps
CONTAINER ID        IMAGE                   COMMAND                  CREATED             STATUS              PORTS                    NAMES
caef766a99ff        continuumio/anaconda3   "/usr/bin/tini -- /b…"   10 hours ago        Up 10 hours         0.0.0.0:8888->8888/tcp   sleepy_bassi

$ docker commit caef766a99ff kaizenjapan/anaconda-alice

$ docker push kaizenjapan/anaconda-alice
```

# 参考資料(reference)

なぜdockerで機械学習するか 書籍・ソース一覧作成中 (目標100)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/ddd12477544bf5ba85e2

dockerで機械学習(1) with anaconda(1)「ゼロから作るDeep Learning - Pythonで学ぶディープラーニングの理論と実装」斎藤 康毅 著
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/a7e94ef6dca128d035ab

dockerで機械学習(2)with anaconda(2)「ゼロから作るDeep Learning2自然言語処理編」斎藤 康毅 著
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/3b80dfc76933cea522c6

dockerで機械学習(3)with anaconda(3)「直感Deep Learning」Antonio Gulli、Sujit Pal　第1章,第2章
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/483ae708c71c88419c32

dockerで機械学習(71) 環境構築(1) docker どっかーら、どーやってもエラーばっかり。
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/690d806a4760d9b9e040

dockerで機械学習(72) 環境構築(2) Docker for Windows
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/c4daa5cf52e9f0c2c002

dockerで機械学習(73) 環境構築(3) docker/linux/macos bash スクリプト, ms-dos batchファイル
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/3f7b39110b7f303a5558

dockerで機械学習(74) 環境構築(4) R 難関いくつ？
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/5fb44773bc38574bcf1c

dockerで機械学習(75)環境構築(5)docker関連ファイルの管理
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/4f03df9a42c923087b5d

OpenCVをPythonで動かそうとしてlibGL.soが無いって言われたけど解決した。
https://qiita.com/toshitanian/items/5da24c0c0bd473d514c8

サーバサイドにおけるmatplotlibによる作図Tips
https://qiita.com/TomokIshii/items/3a26ee4453f535a69e9e

Dockerでホストとコンテナ間でのファイルコピー
https://qiita.com/gologo13/items/7e4e404af80377b48fd5

Docker for Mac でファイル共有を利用する
https://qiita.com/seijimomoto/items/1992d68de8baa7e29bb5


「名古屋のIoTは名古屋のOSで」Dockerをどっかーらどうやって使えばいいんでしょう。TOPPERS/FMP on RaspberryPi with Macintosh編 ５つの関門
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/9c46c6da8ceb64d2d7af

64bitCPUへの道 and/or 64歳の決意
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/cfb5ffa24ded23ab3f60

ゼロから作るDeepLearning２自然言語処理編　読書会の進め方（例）
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/025eb3f701b36209302e


Ubuntu 16.04 LTS で NVIDIA Docker を使ってみる
https://blog.amedama.jp/entry/2017/04/03/235901

Ethernet 記事一覧　Ethernet(0)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/88d35e99f74aefc98794

Wireshark 一覧 wireshark(0)、Ethernet(48)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/fbed841f61875c4731d0

線網（Wi-Fi）空中線(antenna)(0) 記事一覧(118/300目標)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/5e5464ac2b24bd4cd001

C++ Support(0)　
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/8720d26f762369a80514

Coding Rules(0) C Secure , MISRA and so on
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/400725644a8a0e90fbb0

Autosar Guidelines C++14 example code compile list(1-169)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/8ccbf6675c3494d57a76

Error一覧(C/C++, python, bash...) Error(0)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/48b6cbc8d68eae2c42b8

なぜdockerで機械学習するか 書籍・ソース一覧作成中 (目標100)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/ddd12477544bf5ba85e2

言語処理100本ノックをdockerで。python覚えるのに最適。:10+12
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/7e7eb7c543e0c18438c4

プログラムちょい替え（0）一覧:4件
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/296d87ef4bfd516bc394

一覧の一覧( The directory of directories of mine.) Qiita(100)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/7eb0e006543886138f39

官公庁・学校・公的団体（NPOを含む）システムの課題、官（０）
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/04ee6eaf7ec13d3af4c3

プログラマが知っていると良い「公序良俗」
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/9fe7c0dfac2fbd77a945

LaTeX(0) 一覧　
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/e3f7dafacab58c499792

自動制御、制御工学一覧（０）
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/7767a4e19a6ae1479e6b

Rust(0) 一覧　
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/5e8bb080ba6ca0281927

小川清最終講義、最終講義（再）計画, Ethernet(100) 英語(100) 安全(100)
https://qiita.com/kaizen_nagoya/items/e2df642e3951e35e6a53
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