エクセレンス・イニシアティブ（、）は、ドイツ連邦政府・州政府共同の教育研究費配分制度。

「将来的構想（Zukunftskonzepte）」「大学院（Graduiertenschulen）」「エクセレンス・クラスター（Exzellenzcluster）」の3プログラムから成る。

 第一次 

 将来的構想 
大学名（アルファベット順）タイトルアーヘン工科大学RWTH 2020: Meeting Global Challengesベルリン自由大学International Network Universityアルベルト・ルートヴィヒ大学フライブルクWindows for Researchゲッティンゲン大学Göttingen. Tradition – Innovation – Autonomieハイデルベルク大学Heidelberg: Realising the Potential of a Comprehensive Universityコンスタンツ大学Modell Konstanz – towards a culture of creativity

 大学院 
所属大学（アルファベット順）タイトルバイロイト大学Bayreuth International Graduate School of African Studiesベルリン自由大学Muslim Cultures and Societies: Unity and Diversityベルリン自由大学Friedrich Schlegel Graduate School of Literary Studiesフンボルト大学ベルリンBerlin-Brandenburg School for Regenerative Therapiesフンボルト大学ベルリンBerlin Graduate School of Social Sciencesビーレフェルト大学Bielefeld Graduate School in History and Sociologyボン大学Bonn-Cologne Graduate School of Physics and Astronomyブレーメン大学Bremen International Graduate School of Social Sciencesダルムシュタット工科大学Graduate School of Computational Engineering „Beyond Traditional Sciences“ゲッティンゲン大学Göttingen Graduate School for Neurosciences and Molecular Biosciencesハイデルベルク大学Heidelberg Graduate School of Mathematical and Computational Methods for the Sciencesハイデルベルク大学The Hartmut Hoffmann-Berling International Graduate School of Molecular and Cellular Biologyフリードリヒ・シラー大学イェーナJena School for Microbial Communicationクリスティアン・アルブレヒト大学キールGraduate School for Integrated Studies of Human Development in Landscapesコンスタンツ大学Konstanz Research School „Chemical Biology“ライプツィヒ大学Building with Molecules and Nano-Objectsリューベック大学Graduate School for Computing in Medicine and Life Sciencesマインツ大学Materials Science in Mainzザールラント大学Saarbrücken Graduate School of Computer Scienceシュトゥットガルト大学Graduate School for advanced Manufacturing Engineering in Stuttgart (GSaME)ウルム大学International Graduate School in Molecular Medicine Ulm

 エクセレンス・クラスター 
所属大学（アルファベット順）タイトルアーヘン工科大学Tailor-Made Fuels From Biomass (Maßgeschneiderte Kraftstoffe aus Biomasse)ベルリン自由大学/フンボルト大学ベルリンTopoi. The Formation and Transformation of Space and Knowledge in Ancient Civilizationsベルリン自由大学Languages of Emotion (2007–2014)フンボルト大学ベルリン / ベルリン自由大学NeuroCure: Towards a Better Outcome of Neurological Disordersベルリン工科大学Unifying Concepts in Catalysisビーレフェルト大学Center of Excellence Cognitive Interaction Technologyブレーメン大学MARUM – The Ocean in the Earth Systemダルムシュタット工科大学Smart Interfaces: Understanding and Designing Fluid Boundariesフリードリヒ・アレクサンダー大学エアランゲン＝ニュルンベルクEngineering of Advanced Materials – Hierarchical Structure Formation for Functional Devicesフランクフルト大学（マイン）The Formation of Normative Orders (2007–2019)フライブルク大学Centre for Biological Signalling Studies – From Analysis to Synthesisハンブルク大学Integrated Climate System Analysis and Predictionライプニッツ大学ハノーファーCentre for Quantum Engineering and Space-Time Research (QUEST)ルプレヒト・カール大学ハイデルベルクAsia and Europe in a Global Context: Shifting Asymmetries in Cultural Flowsクリスティアン・アルブレヒト大学キールInflammation at Interfacesケルン大学Cellular Stress Responses in Aging-Associated Diseasesヴェストファーレン・ヴィルヘルム大学Religion and Politics in Pre-Modern and Modern Culturesザールラント大学Multimodal Computing and Interactionシュトゥットガルト大学Simulation Technologyエバーハルト・カール大学テュービンゲンWerner Reichardt Centrum für Integrative Neurowissenschaften (CIN)

 第二次 

 将来的構想 
大学名（アルファベット順）タイトルアーヘン工科大学RWTH 2020: Meeting Global Challengesベルリン自由大学International Network Universityフンボルト大学ベルリンBildung durch Wissenschaftブレーメン大学Ambitioniert und agilドレスデン工科大学Die Synergetische Universitätルプレヒト・カール大学ハイデルベルクHeidelberg: Realising the Potential of a Comprehensive Universityケルン大学Die Herausforderung von Wandel und Komplexität annehmenコンスタンツ大学Modell Konstanz − towards a culture of creativityルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘンLMUexcellent: Working brains − Networking minds − Living knowledge − 2006ミュンヘン工科大学TUM. The Entrepreneurial University − 2006エバーハルト・カール大学テュービンゲンResearch − Relevance − Responsibility

 大学院 
所属大学（アルファベット順）タイトルアーヘン工科大学Aachener Graduiertenschule für computergestützte Natur- und Ingenieurwissenschaftenオットー・フリードリヒ大学バンベルクBamberger Graduiertenschule für Sozialwissenschaftenバイロイト大学Bayreuther Internationale Graduiertenschule für Afrikastudienベルリン自由大学Graduiertenschule für Nordamerikastudienベルリン自由大学Berlin Graduate School Muslim Cultures and Societiesベルリン自由大学Friedrich Schlegel Graduiertenschule für literaturwissenschaftliche Studienベルリン自由大学Graduiertenschule für Ostasienstudienベルリン自由大学/フンボルト大学ベルリンBerlin-Brandenburg Schule für Regenerative Therapienベルリン自由大学/フンボルト大学ベルリンBerliner Graduiertenschule für Integrative Onkologieフンボルト大学ベルリンBerlin School of Mind and Brainフンボルト大学ベルリンGraduiertenschule für Analytical Sciences Adlershofベルリン工科大学Berlin Mathematical Schoolビーレフェルト大学Bielefeld Graduate School in History and Sociology (BGHS)ルール大学ボーフムRuhr University Research School Plusブレーメン大学Bremen International Graduate School of Social Sciences (BIGSSS)ダルムシュタット工科大学Computational Engineeringダルムシュタット工科大学Darmstädter Graduiertenschule für Energiewissenschaft und Energietechnikドレスデン工科大学Dresden International Graduate School for Biomedicine and Bioengineeringフリードリヒ・アレクサンダー大学エアランゲン＝ニュルンベルクGraduiertenschule für Fortschrittliche Optische Technologienアルベルト・ルートヴィヒ大学ブライスガウ・イム・ブライスガウSpemann Graduiertenschule für Biologie und Medizin (SGBM)ユストゥス・リービッヒ大学ギーセンInternationales Graduiertenzentrum Kulturwissenschaftenゲオルク・アウグスト大学ゲッティンゲンGöttinger Graduiertenschule für Neurowissenschaften, Biophysik und Molekulare Biowissenschaftenルプレヒト・カール大学ハイデルベルクHeidelberger Graduiertenschule für fundamentale Physikルプレヒト・カール大学ハイデルベルクHeidelberger Graduiertenschule der mathematischen und computergestützten Methoden für die Wissenschaftenルプレヒト・カール大学ハイデルベルクDie Hartmut Hoffmann-Berling Internationale Graduiertenschule für Molekular- und Zellbiologie Heidelbergフリードリヒ・シラー大学イェーナGraduiertenschule für Mikrobielle Kommunikation – Jenaカールスルーエ工科大学Karlsruhe School of Optics and Photonics (KSOP)カールスルーエ工科大学Karlsruhe School of Elementary Particle and Astroparticle Physics: Science and Technology (KSETA)クリスティアン・アルブレヒト大学キールIntegrierte Studien zur menschlichen Entwicklung in Landschaftenケルン大学Graduiertenschule Bonn-Köln in Physik und Astronomieケルン大学a.r.t.e.s. Graduate School for the Humanities Cologne (AGSHC)コンスタンツ大学Konstanzer Graduiertenschule Chemische Biologieコンスタンツ大学Graduiertenschule für Entscheidungswissenschaftenヨハネス・グーテンベルク大学マインツMaterialwissenschaft IN MainZマンハイム大学Graduiertenschule in Wirtschafts- und Sozialwissenschaften: Empirische und quantitative Methodenルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘンGraduiertenschule für Systemische Neurowissenschaftenルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘンGraduiertenschule für Quantitative Biowissenschaften München (QBM)ルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘンFerne Welten: Altertumswissenschaftliches Kolleg Münchenルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘン/レーゲンスブルク大学Graduiertenschule für Ost- und Südosteuropastudienミュンヘン工科大学International Graduate School of Science and Engineering (IGSSE)ザールラント大学Saarbrücker Graduiertenschule für Informatikシュトゥットガルト大学Graduiertenschule für Advanced Manufacturing Engineeringエバーハルト・カール大学テュービンゲンGraduiertenschule LEAD (Learning, Educational Achievement, and Life Course Development)ウルム大学Internationale Graduiertenschule für Molekulare Medizin Ulm (IGradU)ユリウス・マクシミリアン大学ヴュルツブルクGraduiertenschule der Lebenswissenschaften

 エクセレンス・クラスター 
所属大学（アルファベット順）タイトルアーヘン工科大学Integrative Produktionstechnik für Hochlohnländerアーヘン工科大学Maßgeschneiderte Kraftstoffe aus Biomasseベルリン自由大学/フンボルト大学ベルリンNeuroCure – neue Perspektiven in der Therapie neurologischer Erkrankungenベルリン自由大学/フンボルト大学ベルリンTopoi – Die Formation und Transformation von Raum und Wissen in den antiken Kulturenフンボルト大学ベルリンBild Wissen Gestaltung. Ein interdisziplinäres Laborベルリン工科大学Unifying Concepts in Catalysisビーレフェルト大学Kognitive Interaktionstechnologieルール大学ボーフムRESOLV (Ruhr Explores Solvation) – Verständnis und Design lösungsmittelabhängiger Prozesseライン・フリードリヒ・ヴィルヘルム大学ボンMathematik: Grundlagen, Modelle, Anwendungenライン・フリードリヒ・ヴィルヘルム大学ボンImmunoSensation: Das Immunsensorische Systemブレーメン大学Der Ozean im Erdsystem – MARUM – Zentrum für Marine UmweltwissenschaftenTechnische Universität ChemnitzTechnologiefusion für multifunktionale Leichtbaustrukturen – MERGEドレスデン工科大学Center for Regenerative Therapies Dresden (CRTD)ドレスデン工科大学Center for Advancing Electronics Dresden (cfAED)ハインリッヒ・ハイネ大学Exzellenzcluster für Pflanzenwissenschaften – von komplexen Eigenschaften zu synthetischen Modulenフリードリヒ・アレクサンダー大学エアランゲン＝ニュルンベルクNeue Materialien und Prozesse – Hierarchische Strukturbildung für funktionale Bauteileヨハン・ヴォルフガング・ゲーテ大学フランクフルト・アム・マインDynamik Makromolekularer Komplexeヨハン・ヴォルフガング・ゲーテ大学フランクフルト・アム・マインDie Herausbildung normativer Ordnungenヨハン・ヴォルフガング・ゲーテ大学フランクフルト・アム・マイン/ユストゥス・リービッヒ大学ギーセンKardiopulmonales Systemアルベルト・ルートヴィヒ大学ブライスガウ・イム・ブライスガウBIOSS Zentrum für Biologische Signalstudien – von der Analyse zur Syntheseアルベルト・ルートヴィヒ大学ブライスガウ・イム・ブライスガウBrainLinks – BrainToolsゲオルク・アウグスト大学ゲッティンゲンMikroskopie im Nanometerbereich und Molekularphysiologie des Gehirnsハンブルク大学Integrierte Klimasystemanalyse und -vorhersageハンブルク大学The Hamburg Centre for Ultrafast Imaging (CUI): Struktur, Dynamik und Kontrolle von Materie auf atomarer Skalaハノーファー医科大学REBIRTH – Von Regenerativer Biologie zu Rekonstruktiver Therapieルプレヒト・カール大学ハイデルベルクZelluläre Netzwerke: Von der Analyse molekularer Mechanismen zum quantitativen Verständnis komplexer Funktionenルプレヒト・カール大学ハイデルベルクAsien und Europa im globalen Kontext: Die Dynamik der Transkulturalitätクリスティアン・アルブレヒト大学キールOzean der Zukunftクリスティアン・アルブレヒト大学キールEntzündungen an Grenzflächenケルン大学Zelluläre Stressantworten bei Alters-assoziierten Erkrankungenコンスタンツ大学Kulturelle Grundlagen von Integrationヨハネス・グーテンベルク大学マインツPräzisionsphysik, Fundamentalkräfte und Struktur der Materieルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘンNanosystem Initiative München (NIM)ルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘンZentrum für Integrierte Proteinforschung (CIPSM)ルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘンMünchner Zentrum für fortgeschrittene Photonik (MAP)ルートヴィヒ・マクシミリアン大学ミュンヘンCluster für Systemneurologie – Münchenミュンヘン工科大学Origin and Structure of the Universe – The Cluster of Excellence for Fundamental Physicsヴェストファーレン・ヴィルヘルム大学Religion und Politik in den Kulturen der Vormoderne und der Moderneヴェストファーレン・ヴィルヘルム大学Cells in Motion – CiM: Visualisierung und Verstehen zellulären Verhaltens in lebenden Organismenカール・フォン・オシエツキー大学オルデンブルクHören für alle: Modelle, Technologien und Lösungsansätze für Diagnostik, Wiederherstellung und Unterstützung des Hörensザールラント大学Multimodal Computing and Interaction. Robust, Efficient and Intelligent Processing of Text, Speech, Visual Data and High Dimensional Representationsシュトゥットガルト大学Simulationstechnikエバーハルト・カール大学テュービンゲンKontrolle von Mikroorganismen zur Bekämpfung von Infektionen (CMFI)エバーハルト・カール大学テュービンゲンImage-guided and Functionally Instructed Tumor Therapies (iFIT)エバーハルト・カール大学テュービンゲンMaschinelles Lernen für die Wissenschaft