マウスバンク（英：Mouse Repository）とは、遺伝子改変マウスの作製、収集、保管、供給を行う研究施設である。

遺伝子改変マウスには、外部から特定の遺伝子を導入したトランスジェニックマウス（遺伝子改変動物）や遺伝子を欠損させたノックアウトマウスなどがあり、遺伝子の機能や人間が病気になる原因を調べたり、薬の開発において有効性を調べるモデル動物（ヒト疾患モデルマウス）として利用されている。マウスバンクは、マウスリソースに関する情報や試料を管理することで、生命科学研究における遺伝子改変マウスの利活用を促進し、持続的な研究活動を支える研究基盤になっている。

マウスバンクでは、遺伝子改変マウスを効率的に管理するために生殖工学技術が活用され、凍結保存した受精卵や精子を液体窒素中で保管している。遺伝子改変マウスの受精卵や精子を凍結保存することで、研究者が必要な時に体外受精や胚移植により個体を復元し、速やかに研究に使用することができる。また、遺伝子改変マウスを生体として飼育する必要が無いため、動物実験の基本原則である3Rsにおける動物の削減（英：Reduction）にも貢献している。

マウスバンクは、世界中に創設されており、代表的な研究機関として米国のジャクソン研究所（英：Jackson Laboratory）やカリフォルニア大学デービス校マウスバイオロジープログラム（英：UC Davis Mouse Biology Program）、英国のMRCハーウェル研究所マリー・ライオンセンター（英：Mary Lyon Centre）、日本では熊本大学生命資源研究・支援センター動物資源開発研究施設（Center for Animal Resources and Development, CARD）および理化学研究所バイオリソース研究センターが知られている。

米国におけるマウスバンク組織としてMutant Mouse Regional Resource Centers (MMRRC)、欧州における マウスバンク組織としてEuropean Mouse Mutant Archive（EMMA）、アジアにおけるマウスバンク組織としてAsian Mouse Mutagenesis and Resource Association (AMMRA)、豪州のAustralian Phenomics Facilities（APF）がある。

マウスバンクは国際的に連携しており、各マウスバンクに保管されている遺伝子改変マウスの情報を共有し、International Mouse Strain Resource（IMSR）から検索できるようになっている。研究者は、IMSRで見つけた遺伝子改変マウスをマウスバンクから入手することができる。現在、IMSRでは、80,443系統の遺伝子改変マウスを管理している。

研究者がマウスバンクに寄託した遺伝改変マウスは、マウスに関する遺伝子などの情報がマウスバンクのデータベースに登録され、論文で使用された資源を特定する研究資源識別子であるRRID（英：Research Resource Identifier）が賦与される。RRIDは、研究資源の特定・発見・利用を促進を目的とており、生物リソースを特定するための標準的なフォーマットである。論文に使用した遺伝子改変マウスなどの生物材料のRRIDの引用が、研究の再現性や持続性を向上させる取り組みとしてNature誌などの学術誌で推奨されている。

医学・生命科学における遺伝子改変動物を用いた研究の再現性、信頼性、完全性を高める国際的な取り組みとして、Improving laboratory animal genetic reporting: LAG-R guidelines（LAG-Rガイドライン）が策定され、マウスバンクにおける試料の保管やIDの管理が推奨されている。

 IMSRに参加する機関および組織 
+Mouse RepositoryHoldingsAustralian Phenome Bank (APB)
Australian Phenomics Facility
The Australian National University
117 Garran Road
, Acton ACT 2601 Australia Strains:
 1,766
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 1,766Animal Resources Centre (ARC)
Farm Road
Murdoch, Western Australia 6164 Australia Strains:
 16
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 16Center for Animal Resources and Development (CARD)
Kumamoto University
2-2-1 Honjo
Kumamoto, 860-0811 Japan Strains:
 1,944
 ES Cell lines:
 31
 Total:
 1,944Cornell Heart Lung Blood Resource for Optogenetic Mouse Signaling (CHROMus)
Cornell University
T4002 VRT
618 Tower Road
Ithaca, NY 14853 USA Strains:
 8
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 8Canadian Mouse Mutant Repository (CMMR)
25 Orde Street
Toronto, Ontario M5T 3H7 Canada Strains:
 845
 ES Cell lines:
 13,654
 Total:
 14,499Cam-Su Genomic Resource Center (Cmsu)
Soochow University
199 Renai Road
Suzhou, Jiangsu 215123 P.R. China Strains:
 366
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 366Charles River Laboratories (CRL)
251 Ballardvale Road
Wilmington, MA 01887 USA Strains:
 56
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 56Cystic Fibrosis Mouse Model Core (CWR)
Case Western Reserve University
2109 Adelbert Road
Cleveland, OH 44106-4948 USA Strains:
 10
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 10European Mouse Mutant Archive (EMMA)
Helmholtz Zentrum München - German Research Center for Environmental Health, GmbH
Institute of Experimental Genetics
Ingolstädter Landstraße 1
Neuherberg / München, 85764 Germany Strains:
 7,431
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 7,431Dr. Elizabeth M. Simpson, Ph.D. (EMS)
Centre for Molecular Medicine and Therapeutics
University of British Columbia
950 West 28th Avenue
Vancouver, B.C. V5Z 4H4 Canada Strains:
 4
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 4Envigo an Inotiv Company (ENV)
8520 Allison Pointe Blvd
Suite 400
Indianapolis, IN 46250 USA Strains:
 60
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 60European Mouse Mutant Cell Repository (EuMMCR)
Helmholtz Zentrum München
Ingolstädter Landstraße 1
München, 85764 Germany Strains:
 0
 ES Cell lines:
 16,828
 Total:
 16,828genOway (GENO)
31 Rue Saint Jean de Dieu
Lyon, 69007 France Strains:
 19
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 19GemPharmatech (GPT)
12 Xuefu Road, Pukou High-Tech District
Nanjing, 210061 P.R. China Strains:
 19,447
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 19,447MRC Harwell (HAR)
Harwell Science and Innovation Campus
, Oxfordshire OX11 0RD UK Strains:
 2,059
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 2,059JAX Mice and Services (JAX)
610 Main Street
Bar Harbor, ME 04609 USA Strains:
 11,840
 ES Cell lines:
 2
 Total:
 11,842CLEA Japan, Inc. (JCL)
1-2-7 Higashiyama, Meguro-ku
Tokyo, 153-8533 Japan Strains:
 45
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 45Korea Mouse Phenotyping Center (KMPC)
520ho 81Dong
Seoul National University
Seoul, Republic of Korea Strains:
 257
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 257Mutant Mouse Regional Resource Centers (MMRRC)
Mouse Biology Program
2795 Second Street, Suite 400
Davis, CA 95618 USA Strains:
 17,753
 ES Cell lines:
 42,613
 Total:
 60,366National Cancer Institute at Frederick (NCIMR)
P.O. Box B, Thompson & Beasley Drive
Building 1021, Room 10
Frederick, MD 21702 USA Strains:
 139
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 139National Institute of Genetics (NIG)
Mammalian Genetics Laboratory
1111 Yata
Mishima, Shizuoka 411-8540 Japan Strains:
 142
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 142Oriental BioService, Inc. (OBS)
Minamiyamashiro Laboratory
181 Minamiyamashiro-mura
Souraku-gun, Kyoto 619-1401 Japan Strains:
 29
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 29Oak Ridge Collection at JAX (ORNL)
The Jackson Laboratory
600 Main Street
Bar Harbor, ME 04609 USA Strains:
 907
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 907RIKEN BioResource Research Center (RBRC)
RIKEN BRC
3-1-1 Koyadai
Tsukuba, Ibaraki 305-0074 Japan Strains:
 5,702
 ES Cell lines:
 1,747
 Total:
 7,449National Applied Research Laboratories (RMRC-NLAC)
128 Academic Road Sec 2
Nankang, Taipei 11529 Taiwan, R.O.C. Strains:
 351
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 351Shanghai Model Organisms Center, Inc. (SMOC)
3rd Floor, Building 2, No 178 Banxia Road
Pudong New District, Shanghai 201318 P.R. China Strains:
 6,215
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 6,215Taconic Biosciences (TAC)
One Hudson City Centre
Hudson, NY 12534 USA Strains:
 2,725
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 2,725Texas A&M Institute for Genomic Medicine (TIGM)
670 Raymond Stotzer Pkwy
4485 TAMU
College Station, TX 77843-4485 USA Strains:
 195
 ES Cell lines:
 142,543
 Total:
 142,543University of North Carolina, Chapel Hill - Systems Genetics Core (UNC)
120 Mason Farm Road
5047 Genetic Medicine Building, CB #7264
University of North Carolina, Chapel Hill
Chapel Hill, NC 27599-7264 USA Strains:
 75
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 75Vanderbilt Cryopreserved Mouse Repository (VCMR)
2213 Garland Avenue
9410 MRB IV
Nashville, TN 37232-0494 USA Strains:
 37
 ES Cell lines:
 0
 Total:
 37Summary Report: Strains:
 80,443
 ES Cell lines:
 217,418
 Total:
 297,635