薬用植物園（やくようしょくぶつえん）は、主として薬用植物を保存・栽培する植物園。薬草園と称する施設もある。

 歴史と目的 
ヨーロッパには庭園的薬用植物園あるいは薬草園と呼ばれる施設があり、これらは17世紀に初期の修道院の庭園から発展して成立したものである。また同時期に日本では小石川植物園などの植物園が設立されている。

大学附属の植物園では薬局方に記載される薬用植物の実物を薬学教育に供することを主たる目的としている。薬用植物の中には効き目が穏やかなものから有毒植物に相当するものまであり、判別を誤ると危険を伴う。これらを扱う者にとっては正確かつ適切に鑑定することが必須である。社会一般の健康意識の高まりから薬用植物の個人的利用も増えつつあり、基原植物と類似植物との比較ができる環境が求められる。地域への社会貢献として、学外の者を対象とした年数回の公開講座を行うところも多い。

製薬会社が運営する植物園では企業秘密の点、また有毒植物を扱うことから安全性の面においても公開に積極的でない場合も少なくないが、エーザイの創業者が岐阜県各務原市に開設した内藤記念くすり博物館および附属の薬用植物園は、企業博物館の一つとして薬に関する知識の普及を通じて、広く社会に貢献することを目的としている。生物多様性に関する取り組みも重要な役割であり、薬学系の植物園の中では北里大学薬学部附属薬用植物園、摂南大学薬学部附属薬用植物園、熊本大学薬学部附属薬用資源エコフロンティアセンターと武田薬品工業京都薬用植物園が日本植物園協会の「植物多様性保全拠点園」に認定されている。

 各国の薬用植物園 

 英国の薬用植物園 
 スコットランド国立植物園（4植物園で構成）
 
 スコットランド国立植物園の本部がある。1670年設立。
 
 ヒマラヤ地域などのシャクナゲ類や世界各地の温帯域に分布する針葉樹が多く栽培されている。
 
 南オーストラリア、アルゼンチンおよびニュージーランドの暖温帯の植物が多く栽培されている。
 
 スコットランド自生の植物のほか高山植物及び冷温帯植物が多く栽培されている。また、コケ、シダ、地衣、菌類のための隠花植物園もある。
 チェルシー薬草園
 イギリス・ロンドンのチェルシー薬草園は1673年開園の古い歴史を持つ。

 中国の薬用植物園 
中国の広西チワン族自治区南寧市にある広西薬用植物園は、栽培面積が202ヘクタールで世界最大、かつ保存されている薬用植物の品種が281科6000種あまりで世界最多であるとして、2011年12月にギネス世界記録に認定された。

 日本の薬用植物園 
日本植物園協会に加盟する植物園は第一分野（学校に属する植物園）、第二分野（国公立園、またはこれに準ずる施設）第三分野（会社や個人が経営する植物園）、第四分野（薬用植物を扱う専門植物園）のいずれかの部会に所属しており、第四分野には2014年1月現在38園が所属している。そのうち31園が大学の薬学部附属で、他に地方公共団体や製薬会社が運営する薬用植物園もある。

専門職大学設置基準（文部科学省令第33号）第49条によると、薬学に関する学部又は学科を置く大学には、教育研究に必要な附属施設として薬用植物園（薬草園）を設けることが定められている。薬科系大学附属の植物園のうち、日本植物園協会に加盟しているのは半数ほどである。

日本植物園協会非加盟の中には、東京都小平市の東京都薬用植物園、奈良県宇陀市の「森野旧薬園」などがある。森野旧薬園は吉野葛店が運営する私設の薬草園で、開園は享保年間。小石川植物園（東京大学大学院理学系研究科附属植物園）と並び、江戸時代からの歴史を持つ。

水戸市植物公園内の水戸養命酒薬用ハーブ園のように、一般の植物園内に薬草エリアを設けているところもある。

+ 日本の薬用植物園 ※ 開設年 所在地 開設者 面積 品種 特記 東京大学大学院薬学系研究科附属薬用植物園 402 1973年 千葉市花見川区 東京大学 6123 350種 日本大学薬学部附属薬用植物園 403 1954年 千葉県船橋市 日本大学薬学部 12000 1000種 昭和大学薬学部附属薬用植物園 404 東京都品川区 昭和大学 296.66 星薬科大学薬用植物園 405 東京都品川区 星薬科大学 3000 800種 北里大学薬学部附属薬用植物園 406 1972年 相模原市南区 北里大学 7072 2000 北陸大学薬学部附属薬用植物園 407 石川県金沢市 北陸大学 14832 1200種* 名城大学薬用植物見本園 408 愛知県春日井市 名城大学 3000 内藤記念くすり博物館附属薬用植物園 409 1971年 岐阜県各務原市 エーザイ 22417 1000種 塩野義製薬油日植物園 410 1947年 滋賀県甲賀市 塩野義製薬 40000 1700種 京都薬科大学薬用植物園 411 1925年 京都市伏見区 京都薬科大学 13016 1100種 日本新薬山科植物資料館 412 1994年 京都市山科区 日本新薬 7920 3000種 武田薬品工業京都薬用植物園 413 1933年 京都市左京区 武田薬品工業 94000 2800種* 神戸薬科大学薬用植物園 415 1933年 神戸市東灘区 神戸薬科大学 36700 1000種 東京薬科大学薬用植物園 420 1931年 東京都八王子市 東京薬科大学 41000 2700種 城西大学薬用植物園 421 1973年 埼玉県毛呂山町 城西大学 6000 850種 帝京大学薬用植物園 422 1977年 相模原市緑区 帝京大学 5000 500種 明治薬科大学薬用植物園 425 1933年 東京都清瀬市 明治薬科大学 920 湧永満之記念庭園 426 1993年 広島県安芸高田市 湧永製薬 137000 750種 北海道大学薬学部附属薬用植物園 427 1954年 札幌市北区 北海道大学 6272 1300種 薬用植物指導センター 428 1967年 富山県上市町 富山県 43050 1000種* 熊本大学薬学部附属薬用資源エコフロンティアセンター 429 1756年 熊本市中央区 熊本大学 51264 1300種* 摂南大学薬学部附属薬用植物園 430 大阪府枚方市 摂南大学 10000 1500種 東邦大学薬学部薬用植物園 431 1927年 千葉県船橋市 東邦大学 28000 1250種 岐阜薬科大学薬草園 432 1937年 岐阜県岐阜市 岐阜薬科大学 9202 700種 徳島文理大学附属薬用植物園 433 2005年 香川県さぬき市 徳島文理大学 3018 500種 富山大学薬学部附属薬用植物園 434 1923年 富山県富山市 富山大学 13334 2000種 金沢大学薬用植物園 436 1971年 石川県金沢市 金沢大学 39000 昭和薬科大学薬用植物園 437 1990年 東京都町田市 昭和大学 111784 633種* 名古屋市立大学薬学部薬用植物園 438 1885年 名古屋市瑞穂区 名古屋市立大学 3500 370種 三栄源エフ・エフ・アイ有用植物研究所 439 1993年 兵庫県川西市 三栄源エフ・エフ・アイ 3000 非公開 北海道医療大学薬用植物園 441 1985年 北海道当別町 北海道医療大学 3900 400種 大阪薬科大学薬用植物園 443 大阪府高槻市 大阪薬科大学 4995 1000種 城西国際大学薬草園 444 1987年 千葉県大多喜町 城西国際大学 16000 500種 2015年3月閉園 崇城大学薬学部薬用植物園 445 熊本市西区 崇城大学 27108 1200種 日本薬科大学薬用植物園 446 埼玉県伊奈町 日本薬科大学 3600 500種 同志社女子大学薬用植物園 447 京都府京田辺市 同志社女子大学 2000 400種 奥羽大学薬学部薬用植物園 448 2005年 福島県郡山市 奥羽大学 8300 静岡県立大学薬用植物園 449 1989年 静岡市駿河区 静岡県立大学 3300 800 北海道科学大学薬用植物園 北海道小樽市 北海道科学大学 岩手医科大学薬用植物園 岩手県 岩手医科大学 東北医科薬科大学薬用植物園 1939年 仙台市青葉区 東北医科薬科大学 2437.5 350 東北大学大学院薬学部附属薬用植物園 1974年 仙台市青葉区 東北大学 52956 1200 医療創生大学薬用植物園 福島県いわき市 医療創生大学 国際医療福祉大学薬用植物園 栃木県大田原市 国際医療福祉大学 高崎健康福祉大学薬用植物園 2007年 群馬県高崎市 高崎健康福祉大学 200 慶應義塾大学附属薬用植物園 さいたま市緑区 慶應義塾大学 3500 700 千葉大学薬用資源教育研究センター 1967年 千葉市中央区 千葉大学 900 東京理科大学薬用植物園 千葉県野田市 東京理科大学 千葉科学大学薬用植物園 千葉県銚子市 千葉科学大学 武蔵野大学薬学部附属薬用植物園 2004年 東京都西東京市 武蔵野大学 873 170 横浜薬科大学薬草園 横浜市戸塚区 横浜薬科大学 新潟薬科大学薬用植物園 新潟市秋葉区 新潟薬科大学 3000 300 新潟薬科大学薬用植物園五頭分園 1984年 新潟県阿賀野市 新潟薬科大学 13000 300 愛知学院大学薬草園 愛知県日進市 愛知学院大学 545 金城学院大学薬用植物園 名古屋市守山区 金城学院大学 1100 150 鈴鹿医療科学大学薬草園 三重県鈴鹿市 鈴鹿医療科学大学 近畿大学薬学部薬用植物園 1954年 大阪府東大阪市 近畿大学 大阪大学大学院薬学研究科附属薬用植物園 1974年 大阪府吹田市 大阪大学 10610 800 大阪大谷大学万葉植物園・薬草園 大阪府富田林市 大阪大谷大学 武庫川女子大学薬用植物園 1986年 兵庫県西宮市 武庫川女子大学 563 250 神戸学院大学薬草園 神戸市西区 神戸学院大学 5705 600 兵庫医療大学薬用植物園 神戸市中央区 兵庫医療大学 70 姫路獨協大学薬用植物園 兵庫県姫路市 姫路獨協大学 300 徳島大学薬用植物園 1986年 徳島県徳島市 徳島大学 9647 松山大学薬用植物園 愛媛県松山市 松山大学 1806 岡山大学薬用植物園 1978年 岡山市北区 岡山大学 500 就実大学薬用植物園 2003年 岡山市中区 就実大学 800 福山大学薬用植物園 1984年 広島県福山市 福山大学 広島大学薬学部附属薬用植物園 1971年 広島市南区 広島大学 2100 158 広島国際大学薬学部附属薬用植物園 2004年 広島県呉市 広島国際大学 安田女子大学薬学部附属薬用植物園 2010年 広島市安佐南区 安田女子大学 500 山陽小野田市立山口東京理科大学薬学部附属江汐公園薬用植物園 山口県山陽小野田市 山陽小野田市立山口東京理科大学 3000 福岡大学薬学部薬草園 福岡大学 第一薬科大学薬用植物園 第一薬科大学 100 九州大学附属薬用植物園 1967年 福岡市東区、福岡県篠栗町 九州大学 28400 長崎大学附属薬用植物園 1969年 長崎県長崎市 長崎大学 2016 457 長崎国際大学薬学部付属薬用植物園 2006年 長崎県佐世保市 長崎国際大学 180 九州保健福祉大学薬学部附属薬用植物園 2003年 宮崎県延岡市 九州保健福祉大学 3531 285 東京都薬用植物園 東京都小平市 東京都健康安全研究センター 31398 あいち健康の森薬草園 2015年 愛知県大府市 愛知県 森野旧薬園 享保年間 奈良県宇陀市 森野吉野葛本舗 奈良県薬用植物見本園 奈良県御所市 奈良県薬事研究センター 200 手柄山薬用植物園 兵庫県姫路市 姫路市 250 22 丹波市立薬草薬樹公園 兵庫県丹波市 丹波市 300 重井薬用植物園 1964年 岡山県倉敷市 医療法人創和会 800 宮崎県総合農業試験場薬草・地域作物センター 宮崎県小林市 宮崎県 佐多旧薬園 不詳 鹿児島県南大隅町 南大隅町 3000 薬用植物資源研究センター種子島研究部 鹿児島県中種子町 医薬基盤・健康・栄養研究所 108693 
※=日本植物園協会会員番号。空欄の施設は非加盟