ジャパンラグビートップチャレンジリーグは、かつて関東ラグビーフットボール協会・関西ラグビーフットボール協会・九州ラグビーフットボール協会が主体で日本ラグビーフットボール協会と連携し運営していたリーグ戦である。ジャパンラグビートップリーグの第2部に相当する。

 創設概要 
これまでラグビートップリーグはトップリーグと各地域協会主催による地域リーグ（トップイーストリーグ、トップウェスト、トップキュウシュウ）の構成で行われていたが、2019 ラグビーワールドカップ・日本大会開催を念頭に、日本のラグビー界の更なる発展と強化・進化を目指す観点から、これまでの2部相当とされていた各地域リーグの上に、各地域リーグの成績上位クラブを対象としたトップリーグの2部リーグを作り、実力の拮抗した試合を数多く提供してレベルアップを図り、魅力のあるゲームを増やすことを目指している。

初年度参加チームは、
 ジャパンラグビートップリーグ・2016-2017シーズン16位チーム。
 2016-2017トップリーグ入替戦の結果
 入替戦で敗退したトップリーグ所属チーム。
 入替戦で敗退・引き分けたトップチャレンジ1参加チーム。
 トップチャレンジ2の2・3位チーム
 ジャパンラグビートップチャレンジリーグ参入マッチの上位2チーム。
により決定された。

1.によりホンダヒート、2.は、2.1は該当なし、2.2により九州電力キューデンヴォルテクス・日野自動車レッドドルフィンズ・三菱重工相模原ダイナボアーズの3チーム、3.により中部電力・中国電力レッドレグリオンズの2チーム、4.により釜石シーウェイブスRFC・マツダブルーズーマーズの2チームが決まった。

なお、2019-20シーズンまでは8チーム、かつ2020-21シーズンは地域リーグからの昇格を認めない方針だったが、2021ｰ22シーズンからのトップリーグ再編で唯一中国電力レッドレグリオンズが地域リーグからの参加を希望（のちに再編後のリーグへの加盟が承認される）したため、急遽同クラブの昇格を認め、9チームでのリーグ戦となった。2021ｰ22シーズン以後はジャパンラグビーリーグワンに改称の上、チャレンジリーグの機能はそれぞれ2部と3部に移行する予定である。当初は2部が7チーム、3部が6チームの予定とされたが、2020-21シーズン終了時を最後としてコカ・コーラレッドスパークスが活動終了による事実上の休部が発表され、最初の2022年シーズンは2部・3部とも6チームずつで行われることになった。

 大会方式 

2018-19年シーズンまで
年間各クラブにつき10試合、総合計40試合を、下記の2ステージ制で行う。
1stステージ　8クラブによる1回総当たり（各クラブ7試合）
2ndステージ　1stステージの上位（1-4位まで）、下位（5-8位まで）の各4クラブずつによる1回総当たり（各クラブ3試合）

2019-20年シーズン
2019 ラグビーワールドカップ開催による日程上の都合から8クラブによる1回総当たりのみを開催。

2020-21年シーズン
2021-22年シーズン開幕時に実施されるトップリーグの再編に伴い、その再編リーグに参加を希望した中国電力（昨年度はトップキュウシュウ所属）を含めた9クラブで行う。
当初の日程
1回総当たり8試合のリーグ戦を行い、トップチャレンジとしての優勝チーム、並びに順位を確定後、上位4クラブについてはその後のトップリーグセカンドステージへの出場権を与える。その後のプレーオフで優勝した場合はトップリーグ優勝クラブとみなす。
延期後の再日程
トップリーグの延期に伴い、トップチャレンジリーグも延期となったため日程を再編。9チームを2カンファレンス（A・B）に分け、各カンファレンス1回戦総当たりのリーグ戦を行う。
各カンファレンスの上位2チームにはジャパンラグビートップリーグ2021・プレーオフトーナメントへの出場権が与えられる。
Bカンファレンスの5位チームを除いた8チームはその後順位決定戦（2試合/チーム）を行い最終順位を決める。Bカンファレンスの5位は順位決定戦には進めず全体の最下位（9位）が決定。

 入れ替え制度（トップリーグ・チャレンジシリーズ） 
トップチャレンジリーグとトップリーグ間、トップチャレンジリーグと地域リーグ間の入れ替えはともに自動昇降格と入れ替え戦によるものである。

 トップチャレンジリーグ・トップリーグ間 

 2017-2018シーズン 
順位結果トップリーグ13位トップチャレンジリーグ4位と入れ替え戦トップリーグ14位トップチャレンジリーグ3位と入れ替え戦トップリーグ15位トップチャレンジリーグ2位と入れ替え戦トップリーグ16位トップチャレンジリーグへ自動降格トップチャレンジリーグ優勝トップリーグへ自動昇格トップチャレンジリーグ2位トップリーグ15位と入れ替え戦トップチャレンジリーグ3位トップリーグ14位と入れ替え戦トップチャレンジリーグ4位トップリーグ13位と入れ替え戦
 前年までのトップチャレンジと同様、自動降格枠「1」、入れ替え戦枠「3」。

 2018-2019シーズン 
順位結果トップリーグ13位トップチャレンジリーグ4位と入れ替え戦トップリーグ14位トップチャレンジリーグ3位と入れ替え戦トップリーグ15位トップチャレンジリーグ2位と入れ替え戦トップリーグ16位トップチャレンジリーグ1位と入れ替え戦トップチャレンジリーグ優勝トップリーグ16位と入れ替え戦トップチャレンジリーグ2位トップリーグ15位と入れ替え戦トップチャレンジリーグ3位トップリーグ14位と入れ替え戦トップチャレンジリーグ4位トップリーグ13位と入れ替え戦
 トップリーグの日程短縮により自動昇降格がなく、入れ替え戦枠「4」に変更。

 2019-2020シーズン 
トップリーグが新型コロナウイルス感染症の流行拡大に伴い中止となったため入れ替え戦は行われなかった。

 トップチャレンジリーグ・地域リーグ間 

 2017-2018シーズン 
順位結果トップチャレンジリーグ7位3地域チャレンジ2位と入れ替え戦トップチャレンジリーグ8位各地域リーグへ自動降格3地域チャレンジ1位トップチャレンジリーグへ自動昇格3地域チャレンジ2位トップチャレンジリーグ7位と入れ替え戦
自動降格枠「1」、入れ替え戦枠「1」。トップチャレンジリーグからは8位が各所属の地域リーグへ自動降格、7位が入れ替え戦へ回る。地域リーグからは各リーグの優勝チームが総当たりリーグ戦（3地域チャレンジ）を行い1位が自動昇格、2位が入れ替え戦出場となる。

 2018-2019シーズン 
順位結果トップチャレンジリーグ7位3地域チャレンジ2位と入れ替え戦トップチャレンジリーグ8位3地域チャレンジ1位と入れ替え戦3地域チャレンジ1位トップチャレンジリーグ8位と入れ替え戦3地域チャレンジ2位トップチャレンジリーグ7位と入れ替え戦
自動昇降格がなく入れ替え戦枠「2」に変更。

 2019-2020シーズン 
トップチャレンジリーグ・地域リーグ間の入れ替えは行われなかったが、来季のリーグ戦がラグビーの新リーグのディビジョン決めとなるため新リーグに参入を希望した中国電力レッドレグリオンズ（トップキュウシュウ所属）が昇格となった。

 2020-2021シーズン 
上述の通り、2021-22シーズンに予定される新リーグへの再編に伴い、成績面での入れ替えは行わないが、トップチャレンジの上位4位までの入賞クラブが、トップリーグのセカンドステージに進出する。

 参加チーム 

 最終シーズン（2020-2021シーズン）参加チーム 
前年（2019-2020シーズン）の成績上位順に記載。太字は初年度（2017-2018）参加チーム。
チーム名創設年参加シーズントップリーグ在籍シーズン練習グラウンド優勝回数次年度リーグワン参加ディビジョン備考近鉄ライナーズ1929年2018-2019〜2003-2004〜2004-2005、2008-2009〜2017-2018大阪府東大阪市1回DIVISION 2現・花園近鉄ライナーズトップリーグ創設時に参加豊田自動織機シャトルズ1984年2019-2020〜2010-2011、2013-2014〜2018-2019愛知県刈谷市1回DIVISION 32009-2010までは「豊田自動織機ラグビー部」コカ・コーラレッドスパークス1966年2019-2020〜2006-2007〜2011-2012、2013-2014〜2018-2019福岡県福岡市0回不参加2005-2006までは「コカ・コーラウエストジャパンラグビー部」2006-2007〜2013-2014までは「コカ・コーラウエストレッドスパークス」2020-2021シーズンをもって活動終了（休部）発表釜石シーウェイブスRFC2001年2017-2018〜-岩手県釜石市0回DIVISION 2現・日本製鉄釜石シーウェイブス前身は「新日鉄釜石ラグビー部」栗田工業ウォーターガッシュ1962年2018-2019〜-東京都昭島市0回DIVISION 3現・クリタウォーターガッシュ昭島マツダブルーズーマーズ1961年2017-2018〜-広島県府中町0回DIVISION 2現・スカイアクティブズ広島九州電力キューデンヴォルテクス1951年2017-2018〜2007-2008〜2009-2010、2012-2013〜2013-2014福岡県福岡市0回DIVISION 3清水建設ブルーシャークス1976年2019-2020〜-東京都世田谷区0回DIVISION 3現・清水建設江東ブルーシャークス2000-2001までは「清水建設ラグビー部」2001-2002よりクラブチーム化中国電力レッドレグリオンズ1987年2017-2018〜2018-20192020-2021〜-広島県広島市0回DIVISION 3

 過去に参加実績のあるチーム 

 トップリーグ昇格 
チーム名創設年参加シーズン練習グラウンド優勝回数備考ホンダヒート1960年2017-2018三重県鈴鹿市1回現・三重ホンダヒート日野自動車レッドドルフィンズ1950年2017-2018東京都日野市0回現・日野レッドドルフィンズNTTドコモレッドハリケーンズ1994年2018-2019大阪府大阪市1回現・レッドハリケーンズ大阪2007-2008までは「NTTドコモ関西ラグビー部」三菱重工相模原ダイナボアーズ1971年2017-2018〜2018-2019神奈川県相模原市0回

 地域リーグ降格 
チーム名創設年参加シーズン現在所属する地域リーグ練習グラウンド優勝回数備考中部電力ラグビー部1951年2017-2018トップウェスト愛知県日進市0回

 結果 

 歴代リーグ戦結果 
 色はトップリーグへの自動昇格チーム、色は入れ替え戦の結果トップリーグへの昇格チーム、は入れ替え戦出場チーム、は入れ替え戦の結果地域リーグへの降格チーム、色は地域リーグへの自動降格チーム。
シーズン1位2位3位4位5位6位7位8位9位備考2017-2018ホンダヒート日野自動車三菱重工相模原九州電力マツダ中国電力釜石シーウェイブス中部電力 2018-2019NTTドコモ三菱重工相模原近鉄栗田工業九州電力マツダ釜石シーウェイブス中国電力2019-2020近鉄豊田自動織機コカ・コーラ釜石シーウェイブス栗田工業マツダ九州電力清水建設2020-2021豊田自動織機近鉄コカ・コーラ清水建設釜石シーウェイブス栗田工業九州電力マツダ中国電力

 歴代自動昇降格・入れ替え戦結果 

 トップリーグ・トップチャレンジリーグ間 
 入れ替え戦の太字チームが次シーズントップリーグ所属、引き分けの場合は規定によりトップリーグ所属チームの残留。
年自動昇降格入れ替え戦枠数トップチャレンジトップリーグトップチャレンジ結果トップリーグ2017-2018ホンダヒート（1位）近鉄ライナーズ（16位）日野自動車レッドドルフィンズ（2位） 20-17 NTTドコモレッドハリケーンズ（15位）自動昇降格枠「1」入れ替え戦枠「3」三菱重工相模原ダイナボアーズ（3位） 27-27 コカ・コーラレッドスパークス（14位）九州電力キューデンヴォルテクス（4位） 21-40 宗像サニックスブルース（13位）2018-2019自動昇格なし自動降格なしNTTドコモレッドハリケーンズ（1位） 33-24 コカ・コーラレッドスパークス（16位）入れ替え戦枠「4」三菱重工相模原ダイナボアーズ（2位） 31-7 豊田自動織機シャトルズ（15位）近鉄ライナーズ（3位） 11-21 日野レッドドルフィンズ（14位）栗田工業ウォーターガッシュ（4位） 0-75 宗像サニックスブルース（13位）2019-2020昇降格なし2020-2021新リーグ開催のためなし

 トップチャレンジリーグ・地域リーグ間 
 入れ替え戦の太字チームが次シーズントップチャレンジリーグ所属。引き分けの場合は規定によりトップチャレンジリーグ所属チームの残留。
年自動昇降格入れ替え戦枠数トップチャレンジ3地域チャレンジトップチャレンジ結果3地域チャレンジ2017-2018中部電力（8位）栗田工業ウォーターガッシュ（3地域チャレンジ・1位）釜石シーウェイブスRFC（7位）55-19大阪府警察（3地域チャレンジ・2位）自動昇降格枠「1」入れ替え戦枠「1」2018-2019自動降格なし自動昇格なし釜石シーウェイブスRFC（7位）41-7中部電力（3地域チャレンジ・2位）入れ替え戦枠「2」中国電力レッドレグリオンズ（8位） 28-33 清水建設ブルーシャークス（3地域チャレンジ・1位）2019-2020なし中国電力レッドレグリオンズ（トップキュウシュウ 優勝）入れ替え戦なし2020-2021新リーグ開催のためなし

 通算成績 
2020-2021シーズン終了時点（2021シーズンの順位決定戦の成績を含む）

^は初年度在籍チーム、*は2020-2021在籍チーム
チーム名試合勝数負数引分マツダ^*3312201九州電力^*3312210釜石^*3212182中国電力^*245190近鉄*221930栗田工業*229130三菱重工相模原^201460豊田自動織機*131120コカ・コーラ*13841清水建設*121110ホンダヒート^101000NTTドコモ10910日野自動車^10820中部電力^100100