2016年の全日本F3選手権（2016ねんのぜんにほんF3せんしゅけん）は、2016年（平成28年）4月23日 - 24日に鈴鹿サーキットで開幕し、9月24日 - 25日にスポーツランドSUGOで閉幕した全17戦による2016年シーズンの全日本F3選手権である。

 前年からの主な変更点 

 エンジン 
フォルクスワーゲンが全日本F3に初参戦。前年までトヨタエンジンを使用していたB-MAX RACING TEAM勢が同エンジンに移行した。

 エントリーリスト 
 チーム No. ドライバー クラス シャシー エンジン 出場ラウンド TODA RACING 2 石川京侍 Dallara F312 Toda TR-F301 1-17 12 牧野任祐 Dallara F312 Toda TR-F301 1-17 EXEDY B-MAX Racing Team 3 三浦愛 Dallara F312 Toyota TOM'S TAZ31 1-17 Hanashima Racing 5 アレックス・ヤン N Dallara F306 Toyota TOM'S 3S-GE 1-17 46 久保田克昭 N Dallara F308 Toyota TOM'S 3S-GE 15-17 HFDP RACING 7 阪口晴南 Dallara F312 MUGEN MF204D 1-17 8 大津弘樹 Dallara F312 MUGEN MF204D 1-17 ALBIREX RACING TEAM 9 廣田築 N Dallara F306 Toyota TOM'S 3S-GE 1-17 10 岡崎善衛 N Dallara F308 Toyota TOM'S 3S-GE 1-10 B-MAX RACING TEAM 11 植田正幸 N Dallara F308 Toyota TOM'S 3S-GE 13-17 30 DRAGON N Dallara F308 Toyota TOM'S 3S-GE 1-17 Team KRC with B-Max 21 イェ・ホンリー Dallara F315 VOLKSWAGEN A41（OXY） 9-17 B-MAX Racing Team with NDDP21 佐々木大樹 Dallara F312 VOLKSWAGEN A41（OXY） 1-4 高星明誠 Dallara F312 VOLKSWAGEN A41（OXY） 5-8 22 ヤン・マーデンボロー Dallara F314 VOLKSWAGEN A41（OXY） 1-17 23 千代勝正 Dallara F315 VOLKSWAGEN A41（OXY） 1-10,15-17 高星明誠 Dallara F312 VOLKSWAGEN A41（OXY） 11-14 TEAM SAMURAI 25 松井孝允 N Dallara F306 Toyota TOM'S 3S-GE 9-10 EXCEED MOTOR SPORTS 28 山口大陸 Dallara F316 TOYOTA TOM'S TAZ31 1-17 ZENT TEAM TOM'S 36 山下健太 Dallara F312 Toyota TOM'S TAZ31 1-17 37 坪井翔 Dallara F314 Toyota TOM'S TAZ31 1-17 Petit Lemans Racing 78 片山義章 N Dallara F306 Toyota TOM'S 3S-GE 1-17 アイコン クラス N F3-N
※全チームともタイヤは横浜ゴム

 スケジュールおよび勝者 
 ラウンド 開催サーキット 決勝日 ポールポジション ファステストラップ 優勝ドライバー 優勝チーム F3-Nクラス勝者 備考 1 R1 鈴鹿サーキット 4月23日 山下健太 佐々木大樹 山下健太 ZENT TEAM TOM'S 片山義章 R2 4月24日 山下健太 山下健太 山下健太 ZENT TEAM TOM'S 片山義章 2 R3 富士スピードウェイ 5月14日 ヤン・マーデンボロー 佐々木大樹 佐々木大樹 B-MAX Racing Team with NDDP アレックス・ヤン R4 5月15日 佐々木大樹 佐々木大樹 佐々木大樹 B-MAX Racing Team with NDDP 片山義章 3 R5 岡山国際サーキット 5月28日 ヤン・マーデンボロー 山下健太 山下健太 ZENT TEAM TOM'S 片山義章 R6 5月29日 ヤン・マーデンボロー ヤン・マーデンボロー ヤン・マーデンボロー B-MAX Racing Team with NDDP 片山義章 4 R7 鈴鹿サーキット 6月11日 山下健太 ヤン・マーデンボロー 高星明誠 B-MAX Racing Team with NDDP 廣田築 R8 6月12日 山下健太 ヤン・マーデンボロー 高星明誠 B-MAX Racing Team with NDDP 廣田築 5 R9 富士スピードウェイ 7月16日 ヤン・マーデンボロー 千代勝正 ヤン・マーデンボロー B-MAX Racing Team with NDDP 松井孝允 R10 7月17日 ヤン・マーデンボロー 千代勝正 千代勝正 B-MAX Racing Team with NDDP 松井孝允 6 R11 ツインリンクもてぎ 8月20日 牧野任祐 ヤン・マーデンボロー ヤン・マーデンボロー B-MAX Racing Team with NDDP DRAGON R12 8月21日 ヤン・マーデンボロー ヤン・マーデンボロー ヤン・マーデンボロー B-MAX Racing Team with NDDP 片山義章 7 R13 岡山国際サーキット 9月10日 山下健太 山下健太 山下健太 ZENT TEAM TOM'S 片山義章熊本地震の影響により開催地変更 R14 9月11日 高星明誠 高星明誠 高星明誠 B-MAX Racing Team with NDDP 片山義章 8 R15 スポーツランドSUGO 9月24日 山下健太 山下健太 山下健太 ZENT TEAM TOM'S 片山義章 R16 9月25日 山下健太 坪井翔 山下健太 ZENT TEAM TOM'S DRAGON R17 9月25日 ヤン・マーデンボロー 山下健太 ZENT TEAM TOM'S DRAGON
当初は第13,14戦はオートポリスでの開催であったが熊本地震の影響により、岡山国際サーキットでの開催へと変更になった。

 シリーズポイントランキング 
ポイントシステム: 1位 2位 3位 4位 5位 6位 PP FL 10 7 5 3 2 1 1 1

 ドライバー部門 
 順位 ドライバー SUZ FSW OKA SUZ FSW TRM OKA SUG ポイント1 山下健太 1 1 5 2 1 6 Ret 2 6 4 5 2 1 5 1 1 1 1132 ヤン・マーデンボロー 2 3 2 4 8 1 10 3 1 2 1 1 4 8 2 2 2 1103 坪井翔 3 2 3 3 2 3 2 DNS 2 3 3 3 3 4 3 3 3 874 高星明誠 4 8 1 1 7 8 2 1 425 牧野任祐 8 6 6 6 Ret 2 4 6 3 5 2 5 5 3 4 9 7 416 千代勝正 4 8 4 16 3 9 3 4 4 1 WD WD WD WD Ret 7 8 347 佐々木大樹 5 4 1 1 298 石川京侍 6 5 7 5 Ret 5 5 5 7 9 4 7 9 7 5 4 4 229 阪口晴南 9 7 8 7 6 4 7 7 5 8 6 6 6 2 7 5 5 2010 大津弘樹 7 9 9 9 5 7 6 8 8 6 Ret 11 8 Ret 6 8 6 6 山口大陸 DNS DNS 11 10 7 Ret 9 10 12 10 9 9 11 Ret Ret 11 11 三浦愛 10 10 10 8 9 Ret 8 9 Ret 16 10 10 10 9 Ret 10 10 順位 ドライバー SUZ FSW OKA SUZ FSW TRM OKA SUG ポイント

 F3-Nクラス ドライバー部門 
 順位 ドライバー SUZ FSW OKA SUZ FSW TRM OKA SUG ポイント1 片山義章 11 11 Ret 11 10 10 Ret 13 11 15 13 12 12 10 9 13 Ret 1392 DRAGON Ret 12 13 12 14 11 12 12 Ret 12 11 13 13 11 10 12 12 1133 廣田築 12 13 14 13 12 Ret 11 11 Ret 13 12 15 14 13 12 14 15 824 アレックス・ヤン Ret 14 12 14 11 13 13 15 Ret Ret Ret 14 15 12 13 16 14 565 岡崎善衛 13 15 15 15 13 12 14 14 Ret 14 296 松井孝允 10 11 247 植田正幸 Ret Ret 11 15 13 158 久保田克昭 14 17 Ret 2 順位 ドライバー SUZ FSW OKA SUZ FSW TRM OKA SUG ポイント 太字 – ポールポジション
 斜体 – ファステストラップ

 チーム部門 
ポイントシステム: 1位 2位 3位 4位 5位 6位 10 7 5 3 2 1

 順位 チーム SUZ FSW OKA SUZ FSW TRM OKA SUG ポイント1 B-MAX Racing Team with NDDP 2 3 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 1452 ZENT TEAM TOM'S 1 1 3 2 1 3 2 2 2 3 3 2 1 4 1 1 1 1283 TODA RACING 6 5 6 5 Ret 2 4 5 3 5 2 5 5 3 4 4 4 504 HFDP RACING 7 7 8 7 5 4 6 7 5 6 6 6 6 2 6 5 5 24 順位 チーム SUZ FSW OKA SUZ FSW TRM OKA SUG ポイント

 エンジンチューナー部門 
 順位 チューナー SUZ FSW OKA SUZ FSW TRM OKA SUG ポイント1 SPIESS Motorenbau GmbH 2 3 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 1452 TOM'S 1 1 3 2 1 3 2 2 2 3 3 2 1 4 1 1 1 1283 戸田レーシング 6 5 6 5 Ret 2 4 5 3 5 2 5 5 3 4 4 4 504 M-TEC 7 7 8 7 5 4 6 7 5 6 6 6 6 2 6 5 5 24 順位 チューナー SUZ FSW OKA SUZ FSW TRM OKA SUG ポイント