東京都の貝塚の一覧（とうきょうとのかいづかのいちらん）では、東京都内の貝塚のなかで、存在が確実な縄文・弥生時代のものの一覧を取り上げる。縄文時代の海水面は現代より高く（縄文海進）、都内の貝塚分布も当時の海岸線の位置を表している。

概要
東京にある貝塚の数は資料によって異なり、1974年の『東京都遺跡地図』初版では東京都内の貝塚として116か所が挙げられている。モースが発見し日本で最初に本格的な調査が行われた大森貝塚は東京都にあり、東京では貝塚の研究は早くから行われていた。しかし、明治時代の大まかな調査では貝塚とされたものの現代では名前だけが残っていて実態がよく分からない貝塚や、歴史時代のもの、後年に自然貝層と判明したものなども含まれる。したがって、各種資料でもその年代によって東京の貝塚の数は増減している。東京都はほぼ全面に開発の手が入り現代では湮滅してしまいもはや調査不能の貝塚や人知れず湮滅した貝塚も多いものと考えられている。本項で取り上げた貝塚には寺社地や公共用地内所在のものが多いが、逆に寺社地や公共用地以外にあった貝塚には人知れず破壊されたものが多いであろうと考えられる。また貝塚の定義も人によって異なるため弥生時代以降のものを資料によっては貝塚一覧に入れたり入れなかったりしている。したがってどこからも異論が出ない貝塚の一覧を作成することは困難であるが、本項では東京の貝塚に関する有力な資料、東京都教育委員会編『東京都遺跡地図』2015年インターネット版、東京都教育委員会編『都心部の遺跡』1985年、品川区立歴史館編『東京の遺跡を考える』2008年の3点の資料において共通して記載されている貝塚を一覧化する。

1988年の『東京都遺跡地図』第二版では東京の各区の貝塚の数は以下の通り
 千代田区　　　　　　7 中央区2 港区15 新宿区2 文京区10 台東区4 品川区6 目黒区1 大田区25 世田谷区3 渋谷区4 豊島区4 北区5 荒川区2 板橋区9 江戸川区6

以上105か所である。このなかで先史時代のものであることが明確な貝塚を一覧にした。江戸川区の貝塚6か所すべてが歴史時代や時代不明であり採録しなかったのをはじめ、縄文・弥生時代のものであることが明らかな貝塚以外は取り上げていない。

東京の時代別流域水域別の貝塚分布流域/水域縄文時代弥生時代　　計早期-前期前半前期後半　　　　 中期　　　　後期前半　　　 後期後半-晩期 荒川谷12352316 谷田川谷1332211 谷端川(小石川)谷1113 神田川谷123 溜池谷11 渋谷川谷11417 目黒川谷112 立会川谷11?2 内川谷1?1 呑川谷31116 多摩川谷4318 東京湾113218 合計79102391068東京都教育庁社会教育部文化課 編集『都心部の遺跡』、東京都教育委員会、1985年、p.75より引用。 ?は可能性
東京の貝塚の数は縄文後期前半に増えているが、内陸部の縄文遺跡の数は縄文中期よりもむしろ減っている。この時期に海面が後退して陸化した部分に縄文人が進出した結果であろうと考えられている。海から遠いように見える目黒区東山貝塚は目黒川沿い、明治神宮北池貝塚は渋谷川支流沿い、青山墓地内貝塚も渋谷川支流沿いにあり、池袋本町にある貝塚も矢端川(小石川)に面し、海面が高かった縄文時代には海水が近くまであがってきたものと考えられている。

東京の貝塚の一覧
東京都内の貝塚のなかで、存在が確実な縄文・弥生時代の貝塚の一覧を示す。
東京の貝塚の一覧（縄文・弥生時代の物で複数の文献で確認できる貝塚)個別に出典を提示した事項以外は『都心部の遺跡』1985年『東京の貝塚を考える』2008年による名称 場所 貝塚の年代 主な形成期 現状 別名・別称 特記事項海戸貝塚板橋区赤塚4丁目20・21縄文中期-後期　縄文後期(堀之内・加曾利B） 湮滅赤塚城址貝塚 板橋区赤塚5丁目33-35 縄文前期-晩期縄文後期 （堀之内2-加曾利B1)良好おはやし山、出口辻山貝塚 板橋区徳丸7丁目14-16,18-19、8丁目17不明不明湮滅徳丸高山貝塚 板橋区徳丸6丁目25・26 縄文前期・後期縄文前期湮滅徳丸貝塚、高山貝塚中台馬場崎貝塚 板橋区若木3丁目4・5 縄文早期-晩期縄文前期（諸磯a）一部残存中台、志村中台町四枚畑貝塚 板橋区前野町4丁目60・61、志村1丁目11縄文早期-前期縄文前期（諸磯b)湮滅小豆沢貝塚 板橋区小豆沢2丁目25-26、4丁目4-10 縄文中期-晩期縄文中期（加曾利E）一部遺存宮ノ前袋町貝塚 北区北赤羽1丁目10、2丁目1・6・32 縄文中期-後期縄文中期(加曾利E）-後期(加曾利B)一部遺存袋低地遺跡、窪田、貝島赤羽台貝塚 北区赤羽台4丁目2 弥生弥生時代後期湮滅清水坂貝塚 北区中十条4丁目13 縄文早期-前期縄文早期-前期不明上十条、中十条亀山貝塚 北区王子本町1丁目26 弥生中期(宮ノ台)弥生中期(宮ノ台)不明飛鳥山公園内貝塚 北区王子1丁目1 縄文前期(関山)、縄文後期縄文前期(関山)、縄文後期不明大蔵省印刷局内貝塚 北区西ヶ原2丁目1-5,8,11-13 縄文前期-中期縄文中期(勝坂-加曾利E)一部残存七社神社裏貝塚 北区西ヶ原2丁目11 縄文中期(勝坂)縄文中期(勝坂)不明資料によっては大蔵省印刷局内貝塚の一部とする滝野川八幡社裏貝塚 北区滝野川5丁目25-27付近 縄文後期縄文後期不明西ヶ原貝塚 北区西ヶ原3丁目3-6・12-13 縄文中期-晩期縄文中期-晩期一部遺存西ヶ原昌林寺都指定史跡中里貝塚 北区上中里2丁目 縄文中期-後期縄文中期-後期一部遺存国の史跡幅100m、長さ500mに及ぶ日本最大級の貝塚道灌山貝塚 荒川区西日暮里4丁目2 弥生後期(久が原)弥生後期湮滅開成高校内延命院内貝塚 荒川区西日暮里3丁目10 縄文後期縄文後期(堀之内)一部残存日暮里領玄寺貝塚 台東区谷中4丁目4 縄文中期-後期縄文中期(加曾利E)一部残存谷中坂町、領玄寺坂、谷中三崎町寺院内キリスト教墓地貝塚 台東区谷中7丁目1・12・13 縄文後期縄文後期(堀之内)一部残存？谷中天王寺、谷中谷中墓地内線路側新坂貝塚 台東区上野桜木1丁目16、上野公園18番地 縄文後期縄文後期一部残存？鶯谷湯島切通貝塚 台東区池之端1丁目3 縄文前期-晩期縄文後期-晩期一部残存湯島旧岩崎邸内、最高裁判所書記研修所内動坂貝塚 文京区本駒込3丁目18縄文前期-中期、弥生後期縄文中期一部残存都指定史跡駒込神明町貝塚 文京区本駒込3丁目40・41、4丁目1-5、11-17、5丁目7-13、24-28 縄文中期縄文中期(勝坂)一部残存?神明町貝塚千駄木貝塚 文京区千駄木1丁目10・11 縄文前期-晩期縄文中期一部遺存林町、太田邸内弥生町貝塚群 文京区弥生1丁目-2丁目縄文後期、弥生後期縄文後期、弥生後期一部残存弥生町貝塚、向ヶ丘貝塚、旧浅野邸内貝塚国の史跡 弥生時代の弥生は当地の地名に由来する。資料によっては弥生町貝塚、向ヶ岡貝塚、旧浅野邸貝塚などに細分する。いまだに全貌は明らかではない。お茶の水貝塚 文京区湯島1丁目5 縄文前期-晩期縄文後期(加曾利B)湮滅東京医科歯科大学内、湯島元町貝塚 文京区本郷1丁目2・3・6 縄文中期(加曾利E)縄文中期(加曾利E)一部遺存?原町貝塚 文京区白山4丁目15・16・23 縄文不明不明小石川植物園内貝塚 文京区白山3丁目7 縄文中期-後期縄文中期-後期良好白山御殿町、指ヶ谷町池袋東貝塚 豊島区池袋本町4丁目縄文不明不明氷川神社裏貝塚 豊島区池袋本町3丁目18-20縄文後期-晩期縄文晩期不明池袋、池袋西染井墓地内貝塚 豊島区駒込5丁目5、7丁目3 弥生弥生湮滅染井豊島遺跡調査会九段坂上貝塚 千代田区九段北1丁目14 弥生後期弥生後期湮滅牛ヶ淵貝塚 千代田区九段南1丁目6 弥生後期弥生後期湮滅九段坂下、旧軍人会館前九段会館敷地内旧本丸西貝塚 千代田区千代田皇居東御苑 縄文前期-晩期縄文後期一部遺存皇居内明治神宮北池貝塚 渋谷区代々木神園町 縄文後期-晩期縄文後期(加曾利B)一部残存？豊沢貝塚 渋谷区恵比寿2丁目27-33 縄文前期-後期縄文後期一部遺存羽沢貝塚 渋谷区広尾3丁目7、4丁目1 縄文後期(堀之内)縄文後期(堀之内)一部遺存羽根沢、宮代町、東京女学館、日赤病院東山貝塚 目黒区東山3丁目11-13縄文中期-晩期縄文後期一部残存上目黒青山墓地内貝塚 港区南青山2丁目32 縄文前期・後期縄文後期一部遺存？西久保八幡貝塚 港区虎ノ門5丁目10 縄文早期-晩期縄文後期一部遺存八幡町、我善坊町都指定史跡東京タワー脇貝塚港区芝公園4丁目縄文不明一部遺存紅葉館内丸山貝塚 港区芝公園4丁目8 縄文中期・後期縄文後期遺存芝丸山、芝公園、元麻布2丁目貝塚 港区元麻布2丁目5 縄文後期縄文後期(堀之内、加曾利B)一部遺存？三軒屋町、宮村町、麻布高校本村町貝塚 港区南麻布3丁目8、11 縄文前期縄文前期(黒浜、諸磯)一部遺存伊皿子貝塚 港区三田4丁目19 縄文早期-晩期縄文後期湮滅旧海軍墓地貝塚 港区白金台1丁目2 縄文中期(加曾利E)縄文中期(加曾利E)湮滅白金今里町、明治学院内上大崎貝塚 品川区上大崎1丁目3 縄文前期縄文前期不明池田山北貝塚 品川区東五反田5丁目5 縄文前期縄文前期不明御殿山貝塚 品川区北品川5丁目18 縄文前期縄文前期不明居木橋遺跡 品川区大崎2丁目6・7、3丁目14、西品川3丁目5・6 縄文前期(黒浜、関山、諸磯)縄文前期(諸磯)遺存東大崎、峯原権現台貝塚 品川区広町1丁目-2丁目 縄文後期縄文後期湮滅JR大井工場内西光寺貝塚 品川区大井4丁目22 縄文後期縄文後期不明大森貝塚 品川区大井6丁目27 縄文早期-晩期縄文後期-晩期一部遺存国の史跡望翠楼ホテル内貝塚 大田区山王3丁目30-35 弥生後期(久ヶ原)弥生後期(久ヶ原)湮滅桐里町貝塚大田区池上1丁目11 縄文前期縄文前期湮滅池上本門寺公園馬込貝塚 大田区中馬込1丁目9・14-19、3丁目1、上池台5丁目1-4・7 縄文中期-晩期縄文後期(堀之内)一部遺存塚越貝塚 大田区西馬込2丁目35 縄文前期(関山)縄文前期(関山)湮滅雪ヶ谷貝塚 大田区南雪谷5丁目4-7 縄文前期-縄文中期縄文前期(諸磯b)一部遺存庄仙貝塚 大田区北嶺町25・26、久が原1丁目15-19 縄文前期縄文前期湮滅久ヶ原(北)久ヶ原貝塚 大田区久が原3丁目28-30・40、4丁目14-17 弥生後期(久ヶ原)弥生後期(久ヶ原)一部遺存久ヶ原(南)千鳥窪貝塚 大田区南久が原1丁目4・7・8 縄文中期-後期縄文中期(勝坂)一部遺存増明院裏貝塚 大田区鵜の木1丁目15・17 縄文時代前期?縄文時代前期?一部現存土器等は出土しておらず貝塚形成期ははっきりしない下沼部貝塚 大田区田園調布本町37-39 縄文早期-晩期縄文後期-晩期一部遺存丸子多摩川園北貝塚 大田区田園調布1丁目56・58 縄文後期(加曾利B)縄文後期(加曾利B)湮滅上沼部貝塚大田区田園調布4丁目27-29、5丁目4 縄文前期・後期・晩期縄文前期(諸磯)・縄文後期一部遺存六所東貝塚世田谷区野毛1丁目25・26、2丁目17・18縄文前期-中期縄文前期(諸磯a)一部遺存?稲荷丸北貝塚 世田谷区上野毛3丁目3・4・8 縄文早期-晩期縄文前期(諸磯)一部遺存瀬田貝塚 世田谷区瀬田1丁目8・13 縄文前期(諸磯a）縄文前期(諸磯a）一部遺存?時代の(　)内は時代細分。例えば縄文後期(加曾利B)は縄文時代後期のなかで加曾利B式土器期の意味。関山式期はおよそ6700-6450年前(1950年起点、以下同じく)、黒浜式期は6450-6050年前、諸磯式期は6050-5600年前(そのなかで諸磯aは6050-5950年前)、勝坂式期は5380-4900年前、加曾利E式期は4900-4420年前、堀之内式期は4240-3820年前、加曾利B式期は3820-3470年前、いずれも1950年起点