2016 日本女子サッカーリーグ（2016 にほんじょしサッカーリーグ）は、2016年に開催された第28回の日本女子サッカーリーグである。

 概要 
2008年から引き続きプレナスが冠スポンサーを務め、「プレナスなでしこリーグ」「プレナスチャレンジリーグ」の名称で行われる。

2016年1月28日に以下の大会概要が、2月5日に競技日程がそれぞれ発表された。

なでしこリーグ1部・2部については、当初リオデジャネイロオリンピック本大会に日本女子代表が出場するものと想定して強化期間が設定された関係で、6月から9月までの3か月間一時中断、その間はプレナスなでしこリーグカップ2016を開催する日程が組まれている。

 なでしこリーグ1部
 3年ぶりに全10クラブによる2回総当たりのリーグ戦に戻る（前年まであった「エキサイティングシリーズ」は行われない。）。
 3年ぶりにカップ戦としてプレナスなでしこリーグカップ1部が復活。
 開催日程：3月26日-10月23日
5月29日の第11節終了を以って9月10日（第12節）まで3か月中断

 なでしこリーグ2部
 全10クラブによる2回総当たり。
 2部クラブ同士によるプレナスなでしこリーグカップ2部が行われる。
 開催日程：3月26日-10月16日
同様に6月4日の第12節終了を以って9月10日（第13節）まで3か月中断

 チャレンジリーグ
 全12クラブを「EAST」「WEST」に分け、それぞれ3回総当たりで対戦する。
 リーグ終了後、EASTおよびWESTの1位と2位、3位と4位、5位と6位が3グループに分かれ、各グループ4クラブにてプレーオフを行い、順位を決定する。
 開催日程
 EAST： 4月10日-7月24日
 WEST： 4月10日-7月23日
 プレーオフ（順位決定戦）： 8月27日-9月11日

 2016年の参加チーム 

 なでしこリーグ1部 
チーム名監督ホームタウン前年成績ベガルタ仙台レディース 千葉泰伸宮城県仙台市なでしこ1部 2位浦和レッドダイヤモンズ・レディース 吉田靖埼玉県さいたま市なでしこ1部 6位ジェフユナイテッド市原・千葉レディース 三上尚子千葉県市原市・千葉市なでしこ1部 5位日テレ・ベレーザ 森栄次東京都稲城市なでしこ1部 1位アルビレックス新潟レディース 辛島啓珠 ※新潟県新潟市・聖籠町なでしこ1部 4位AC長野パルセイロ・レディース 本田美登里長野県長野市なでしこ2部 1位 伊賀フットボールクラブくノ一 金鐘達三重県伊賀市なでしこ1部 7位コノミヤ・スペランツァ大阪高槻 本並健治大阪府高槻市なでしこ1部 9位INAC神戸レオネッサ 松田岳夫兵庫県神戸市なでしこ1部 3位岡山湯郷Belle 櫻井庄吾岡山県美作市なでしこ1部 8位

 監督交代 
チーム名前監督退任日監督代行新監督就任日備考伊賀フットボールクラブくノ一 金鐘達 5月11日 林一章(コーチ) 野田朱美5月16日外部からの招聘岡山湯郷Belle 櫻井庄吾6月1日 結城治男(コーチ)→ 谷口博志(コーチ)→ 森周三(コーチ) 亘崇詞12月1日

 なでしこリーグ2部 
チーム名監督ホームタウン前年成績ちふれASエルフェン埼玉 元井淳 ※埼玉県狭山市なでしこ1部 10位 スフィーダ世田谷FC 川辺学 ※東京都世田谷区なでしこ2部 4位日体大 FIELDS 横浜 矢野晴之介神奈川県横浜市なでしこ2部 3位ニッパツ横浜FCシーガルズ 中村宏紀神奈川県横浜市チャレンジEAST 1位 ノジマステラ神奈川相模原 菅野将晃神奈川県相模原市なでしこ2部 2位セレッソ大阪堺レディース 竹花友也大阪府大阪市・堺市チャレンジWEST 1位 ASハリマ アルビオン 田渕径二兵庫県姫路市なでしこ2部 7位FC吉備国際大学Charme 太田真司岡山県高梁市なでしこ2部 8位アンジュヴィオレ広島 奥村優之広島県広島市なでしこ2部 5位愛媛FCレディース 川井健太愛媛県松山市なでしこ2部 6位

 監督交代 
チーム名前監督退任日新監督就任日備考アンジュヴィオレ広島 奥村優之 4月28日 内藤就行4月28日ヘッドコーチから昇格 内藤就行9月1日 奥村優之9月1日GM兼任

 チャレンジリーグ 

 EAST 
チーム名監督ホームタウン前年成績ノルディーア北海道 藤原英昭 ※北海道札幌市チャレンジEAST 5位常盤木学園高等学校 阿部由晴宮城県仙台市チャレンジEAST 2位つくばFCレディース 福浦隆晃茨城県つくば市チャレンジEAST 6位オルカ鴨川FC 北本綾子千葉県鴨川市千葉県1部 1位 大和シルフィード 佐藤美雪神奈川県大和市チャレンジEAST 4位JAPANサッカーカレッジレディース 板垣雄平 ※新潟県聖籠町なでしこ2部 10位 

 WEST 
チーム名監督ホームタウン前年成績新潟医療福祉大学女子サッカー部 奥山達之 ※新潟県新潟市チャレンジEAST 3位JFAアカデミー福島 木村リエ静岡県御殿場市チャレンジWEST 3位静岡産業大学磐田ボニータ 村松大介静岡県磐田市チャレンジWEST 2位NGU名古屋FCレディース 菅野裕二愛知県名古屋市チャレンジWEST 5位バニーズ京都SC 千本哲也京都府京都市チャレンジWEST 4位福岡J・アンクラス 山口剛福岡県春日市なでしこ2部 9位 

 監督交代 
チーム名前監督退任日新監督就任日備考ノルディーア北海道 藤原英昭 6月3日 浮田あきな6月3日コーチからの昇格

 結果 

 なでしこリーグ1部 
||降格または残留

, 2017 なでしこリーグ2部へ降格

 なでしこリーグ2部 
||昇降格または残留

,2017 なでしこリーグ1部へ昇格

, 残留

 チャレンジリーグ 

 チャレンジリーグEAST 
2016年7月24日全日程終了
||備考

|}
出典: 日本女子サッカーリーグ・チャレンジイースト順位表

 チャレンジリーグWEST 
2016年7月24日全日程終了
||備考

|}
出典: 日本女子サッカーリーグ・チャレンジイースト順位表

 チャレンジリーグ順位決定戦1位-4位 
2016年9月11日全日程終了
||昇格または残留

, 残留

|}
出典: 日本女子サッカーリーグ・チャレンジ1位 - 4位順位表

 チャレンジリーグ順位決定戦5位-8位 
2016年9月11日全日程終了

|}
出典: 日本女子サッカーリーグ・チャレンジ5位 - 8位順位表

 チャレンジリーグ順位決定戦9位-12位 
2016年9月10日全日程終了
||降格または残留

, 残留

, 北信越リーグへ降格
|}
出典: 日本女子サッカーリーグ・チャレンジ9位 - 12位順位表

 表彰 
表彰式は2016年10月25日に行われた。

 表彰式 受賞者 
賞受賞者所属なでしこリーグ 最優秀選手賞（MVP）阪口夢穂日テレ・ベレーザ得点王田中美南（18得点）日テレ・ベレーザ敢闘賞横山久美AC長野パルセイロレディース新人賞杉田妃和INAC神戸レオネッサ　ベストイレブン山下杏也加（GK）日テレ・ベレーザ岩清水梓（DF）有吉佐織（DF）村松智子（DF）阪口夢穂（MF）籾木結花（MF）川村優理（MF）ベガルタ仙台レディース鮫島彩（MF）INAC神戸レオネッサ上尾野辺めぐみ（MF）アルビレックス新潟レディース田中美南（FW）日テレ・ベレーザ横山久美（FW）AC長野パルセイロレディース優勝監督賞森栄次日テレ・ベレーザフェアプレー賞日テレ・ベレーザなでしこリーグ2部 最優秀選手賞（MVP）尾山沙希ノジマステラ神奈川相模原得点王南野亜里沙（11得点）ノジマステラ神奈川相模原ミッシェル・パオ（11得点）植村祥子（11得点）日体大FIELDS横浜新人賞高木ひかりノジマステラ神奈川相模原フェアプレー賞ちふれASエルフェン埼玉チャレンジリーグ 最優秀選手賞（MVP）松長佳恵オルカ鴨川FC　得点王平野麻美（14得点）静岡産業大学磐田ボニータ新人賞三堀静佳大和シルフィードフェアプレー賞バニーズ京都SCその他表彰通算200試合出場上尾野辺めぐみアルビレックス新潟レディース深澤里沙ジェフユナイテッド市原・千葉レディース阪口夢穂日テレ・ベレーザ加戸由佳岡山湯郷Belle最優秀審判賞梶山芙紗子

 入れ替え 

 なでしこリーグ1部となでしこリーグ2部 
なでしこリーグ1部10位となでしこリーグ2部1位は自動入れ替え。なでしこリーグ1部9位となでしこリーグ2部2位のチームでホーム&アウェイ方式による入れ替え戦を実施し、勝者が1部へ昇格または残留する。

 なでしこリーグ1部・2部入替戦 
日程は以下の通りである。

2試合合計で5-1となり、ちふれASエルフェン埼玉の1部昇格が決定した。

 なでしこリーグ2部とチャレンジリーグ 
なでしこリーグ2部10位とチャレンジリーグ1位は自動入れ替え。なでしこリーグ2部9位とチャレンジリーグ2位のチームでホーム&アウェイ方式による入れ替え戦を実施し、勝者がなでしこリーグ2部へ昇格または残留する。ただしチャレンジリーグのチームは、「なでしこリーグガイドライン」の認定を受けているチームに限り昇格できる。

 なでしこリーグ2部・チャレンジリーグ入替戦 
日程は以下の通りとなる。

2試合合計で4-0でFC吉備国際大学Charmeの2部残留が決定した。

 チャレンジリーグと地域リーグ 
チャレンジリーグEASTおよびWESTのそれぞれの最下位のチームが、地域リーグからの2チームとホーム&アウェイ方式の入れ替え戦を実施し、勝者がチャレンジリーグに昇格または残留する。なお地域リーグからのチャレンジリーグ参入希望チーム数により、以下の通り入れ替え戦を実施する。
 参入希望チームがない場合は入れ替えは行わない
 参入希望チームが1チームの場合は、チャレンジリーグEASTおよびWESTのそれぞれの最下位のチームによる入れ替え戦進出チーム決定戦を実施したうえで入れ替え戦を実施する
 参入希望チームが2チームの場合は、それらのチームと入れ替え戦を実施する
 参入希望チームが3チーム以上の場合は、それらのチームにより予選大会を実施したうえで入れ替え戦を実施する

 チャレンジリーグ入替戦予選大会 
大会方式は以下の通り。
 出場8チームを4チームずつの2グループに分け、それぞれ1回戦総当たりのリーグ戦を行う。
 リーグ戦では、決着しない場合はPK戦で決着を付ける。リーグ戦の勝ち点は「勝ち3・PK戦勝ち2・負け0」。
 リーグ戦各組の1位同士・2位同士でそれぞれ順位決定戦を行い、1位から4位までを決定する。
 試合時間は70分。

 Aグループ 

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 Bグループ 

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 3位決定戦 

 決勝 

 チャレンジリーグ入替戦 
入替戦予選大会1位のFC十文字VENTUS、2位のMITO EIKO FC 茨城レディースとチャレンジリーグ11位のつくばFCレディース、12位のJAPANサッカーカレッジレディースが対戦。11月7日に発表された日時・会場による。第1戦を地域リーグのチームのホームゲーム、第2戦をチャレンジリーグのチームのホームゲームで実施する。

2試合合計で4 - 3でつくばFCレディースのチャレンジリーグ残留が決定した。

2試合合計で6 - 4でFC十文字VENTUSのチャレンジリーグ昇格が決定した。