ハプログループA (mtDNA)（ハプログループA (ミトコンドリアDNA)、）とは、分子人類学で用いられる、人類のミトコンドリアDNAハプログループ（型集団）の分類のうち、ハプログループNを祖先に持ち「152, 235, 523-524d, 663, 1736, 4248, 4824, 8794, 16290, 16319」により定義されるものである。東アジア北部にて50000-30000年前に誕生した。

分布
下位系統のA2はチュクチ・カムチャツカ系民族とアメリカ先住民に高頻度に見られる。

その他の系統A(xA2)はそれほど高頻度でないが、アジアにおいて広くみられる。アジアでは、A(xA2)は特に、中国南西部、チベット人などのチベット・ビルマ系民族に比較的多く(6/65 = 9.2%, 25/216 = 11.6%, 11/73 = 15.1%)みられる。また朝鮮民族の約8.0%
、漢民族の約7.320%、日本人の約6.7%～6.86%（3.9% 平取町アイヌ、5.0% 東海、6.0% 北海道、6.6% 九州北部、6.7% 沖縄、6.8% 東京、6.95% 岐阜県立病院にて受診をした人、8.6% 東北）、モンゴル人の約6.36%が属す。ベトナム人、タタール人、トルコ人、ペルシャ人、タジク人 など、アジア大陸では広く見られるが、オーストロネシア系民族（マレー諸島）ではほとんど見られない。

現代日本に於けるハプログループAはA5a（A5をベースとして2156.1AとG4655AとC11647Tの変異を有するミトコンドリアDNA）が断然と多く、現代日本人全体の約4.0%を占めている。A5aは日本以外に韓国でも見られる。 現代日本で見られるハプログループAのサブクレードはかなり多様だがA5a以外の系統はおしなべて割合が小さく、その中で比較的多く見られるものはA3（0.6%）、A5c（0.4%）、A5b1a（0.4%）。

下位系統
A (N+A235G+A663G+A1736G+T4248C+A4824G+C8794T+C16290T+G16319A)
A5 (A+A8563G+C11536T)
A5a (A5+T2150TA+G4655A+C11647T) 日本（4.0%、東京都・愛知県等）、韓国、中国（漢族 0.157%）
A5a1 (A5a+C14944T) 韓国
A5a1a (A5a1+G10801A) 日本（東京都）、アメリカ合衆国、中国（河南省漢族1人・山東省漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.014%）
A5a1a1 (A5a1a+G5773A+T12880C) 日本、韓国
A5a1a2 (A5a1a+C8628T) 日本
A5a1a2a (A5a1a2+T6956C) 日本（愛知県）
A5a1a3 (A5a1a+C16296T) 日本（東京都等）
A5a1b (A5a1+A16160G) 日本（東京都・愛知県）、中国（上海市漢族1人・計0.0046%）
A5a2 (A5a+T13461C) 日本（東京都・愛知県等）
A5a3 (A5a+A12909G) アメリカ合衆国（黒人）
A5a3a (A5a3+T15341C) 日本（東京都）
A5a3a1 (A5a3a+A14118G) 日本（愛知県等）
A5a4 (A5a+G10325A) 日本、アメリカ合衆国
A5a4a (A5a4+T10235C) 日本（愛知県等）
A5a5 (A5a+C7694T) 日本、韓国（ソウル）、中国（ウイグル族、遼寧省漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.009%）
A5a5a (A5a5+C16360T) 日本
A5a6 (A5a+C16174T) 韓国
A5a7 (A5a+C14425T) 中国
A5a8 (A5a+T8598C) 韓国
A5a9 (A5a+C13809T) 韓国
A5b (A5+T961C) 中国（漢族 0.951%）
A5b1 (A5b+G1709A+T16126C+A16235G)
A5b1a (A5b1+C10637T) 日本（東北・中部北陸・近畿・計0.4%）、韓国（慶尚南道）
A5b1a1 (A5b1a+A16235G) 日本（東京都）、中国（天津市漢族1人・遼寧省漢族1人・上海市漢族1人・計0.014%）
A5b1a1a (A5b1a1+G15806A)
A5b1a1a1 (A5b1a1a+A955AC) 日本（東京都）、韓国
A5b1a2 (A5b1a+A9545G) 日本
A5b1b (A5b1+C16234T) 韓国、中国（黒竜江省ダウール族、漢族 0.397%）
A5b1c (A5b1+T8260C) 中国（漢族 0.106%）
A5b1c1 (A5b1c+T152C!+G5054C+A15442G) 台湾（ブヌン族・客家）、中国（漢族 0.083%）
A5b1c1a (A5b1c1+T961C) アメリカ合衆国
A5b1c1a1 (A5b1c1a+G16235A!) 台湾（パイワン族）、マレーシア
A5b1d (A5b1+A11172G) 中国（漢族 0.074%）
A5b1d1 (A5b1d+A9016G) タイ王国（中部タイ人）、ベトナム（タイー族）、中国（貴州省漢族1人・広西チワン族自治区漢族1人・北京市漢族1人・河北省漢族1人・計0.018%）
A5b2 (A5b+T13260C) 中国（漢族 0.226%）
A5b2a (A5b2+G16000T)
A5b2a1 (A5b2a+A6254G) 中国（黒竜江省ダウール族・香港）
A5b2a2 (A5b2a+A14903G)
A5b2b (A5b2+A8659G) 中国（トゥチャ族等、漢族 0.097%）
A5c (A5+T152C!+G16129A!+G16213A) 日本（東北地方等・計0.4%、愛知県等）、中国（バルガ族、漢族 0.069%）、ロシア（ブリヤート・ハムニガン）
A5c1 (A5c+C12816T) 日本（北海道・東北・中部北陸・計0.3%、千葉県・東京都・愛知県等）
A8 (A+C16242T) コロンビア（デサノ族）
A8a (A8+C64T+T146C!) 日本（東北・中部北陸・計0.2%）、韓国、中国（漢族 0.097%、貴州省漢族・遼寧省）
A8a1 (A8a+T152C!+G6962A+G8865A+A12777G) 中国（吉林省漢族1人・湖北省漢族1人・計0.009%、ウイグル族）
A8a1a (A8a1+A16066G) ロシア（ヤクート・ブリヤート）、中国（バルガ族）
A8a1a1 (A8a1a+G15301A!!) 中国（ウイグル族）
A8a1b (A8a1+C16278T!) 中国（ウイグル族）、アメリカ合衆国（ルイジアナ州）
A8a1c (A8a1+A5811G) ウクライナ（ヴィーンヌィツャ州）
A8a1c1 (A8a1c+C9318T) ポーランド、ウクライナ（ヴィーンヌィツャ州）
A8a1d (A8a1+T12705C) 中国（ウイグル族）
A8a1d1 (A8a1d+A6663G) ハンガリー（今より約1135年前の人骨ERS9945283）、セルビア（ベオグラード）
A8a1e (A8a1+T7142C) 中国（新疆ウイグル自治区出土の今より約2600年前の人骨と今より約2160年前の人骨）
A8a2 (A8a+A6779G)
A8a2a (A8a2+T15229C) ロシア（トファ人）
A8a2a1 (A8a2a+A9007G) ロシア（ケット人）
A8a2b (A8a2+G7762A) ロシア（トゥヴァ人）、中国（バルガ族）、ポーランド
A8a2c (A8a2+T16290C!) パキスタン（コー人）
A8a2c1 (A8a2c+C15007A) パキスタン（コー人）
A8b (A8+T12175C) ロシア（カムチャツカ地方コリャーク）
A-a (A+T152C!)
A11 (A+C9650T+A16293C) 中国（漢族 0.286%）、日本（北海道・東北・中部北陸・計0.2%）
A11a (A11+T1005C+G6755A+T8843C) 中国（甘粛省漢族1人・黒竜江省漢族1人・河北省漢族2人・計0.018%）、ネパール、インド、マレーシア
A11+C16234T 中国（チベット自治区）
A11b (A11+C16234T+T3290C+C16527T) 中国（広西チワン族自治区漢族1人・雲南省漢族1人・四川省漢族3人・安徽省漢族1人・河北省漢族1人・計0.032%、ウイグル族・雲南省漢族）
A11b1 (A11b+C3204T) 中国（ナシ族・チャムド市チベット族等）
A11b2 (A11b+T8843C) 中国（ティンリ県チベット族）
A11c (A11+C13650T!) 中国
A11d (A11+C16184T) 日本（東京都）、韓国、中国（陝西省漢族1人・湖南省漢族1人・計0.009%）
A3 (A+T2857C+A8962G+C9711T) 日本（東北・中部北陸・近畿等・計0.6%、東京都等）、韓国、アメリカ合衆国、中国（吉林省漢族1人・安徽省漢族1人・上海市漢族1人・四川省漢族1人・計0.018%）
A3a (A3+A13140G) 日本（北海道・東北・中部北陸・計0.2%、東京都・愛知県等）
A7 (A+A16051G+T146C!) 中国（漢族 0.097%）
A7a (A7+G10172A) 日本（東京都等）
A7b (A7+C12411T) 中国（チベット自治区ローバ族）
A7b1 (A7b+T4314A) 中国（チベット自治区ローバ族）
A7b2 (A7b+T9128C) 中国（チベット自治区ローバ族・モンパ族）
A+T16362C
A1 (A+T152C!+T16362C+G1442A) 日本（中部北陸等・計0.2%）
A1a (A1+G9713A+T16249C) 日本（関東甲信越・計0.1%、愛知県）、中国（タシュクルガンタジク自治県サリコリタジク人）、スリランカ、イタリア
A1a1 (A1a+T4928C) モンゴル、ロシア
A1a1a (A1a1+G235A!) ロシア（アルタイ人）、中国（黒竜江省ダウール族）
A1a1a1 (A1a1a+T9756G) ロシア（ブリヤート）、中国（モンゴル族）
A1a1b (A1a1+G15043A) ロシア（ブリヤート）、中国（バルガ族）
A1a1b1 (A1a1b+C9776T) ロシア（ブリヤート）、中国（バルガ族）
A1a2 (A1a+G9477A) ロシア（バシキール人・ノヴゴロドロシア人）、イラン（トルクメン人）
A1a3 (A1a+A1299G) ウクライナ（ドネツィク州出土の今より約700年前の人骨UKR074）、ギリシャ、アルバニア、イタリア、ドイツ、イギリス、アメリカ合衆国
A1a4 (A1a+G1007A) トルコ（イズミル）
A1b (A1+T471C) 韓国、日本
A15 (A+T152C!+T16362C+G207A+G263A+A8459G+T16111C!) 中国
A15+C14067T 日本（中部北陸等・計0.3%）
A15a 中国（漢族 0.632%、ナクチュ市チベット族・ティンリ県チベット族・ウイグル族・モンゴル族・四川省）、台湾
A15a1 (A15a+A11974G) 台湾、タイ王国（ヤオ族）、オーストラリア
A15a2 (A15a+C959T) 中国
A15a3 (A15a+A188G) 中国、シンガポール
A15a4 (A15a+C12363T) 中国（福建省漢族2人・陝西省漢族1人・湖南省漢族1人・湖北省漢族1人・計0.023%）
A15a5 (A15a+T15984C) 日本（東京都）、中国
A15b 日本（北海道・東北・中部北陸・計0.2%）、中国（漢族 0.060%）
A15c (A15+T15262C) 中国、カザフスタン（今より約1250年前の人骨ERS2374414）
A15c1 (A15c+A9052G+T13111C+A15924G) 中国（遼寧省）
A15c1a (A15c1+T4216C) ネパール
A15c1a1 (A15c1a+A15924G) ネパール及びチベット（シェルパ）
A15c1b (A15c1+A153G) 中国（ナシ族・ウイグル族等）、ネパール
A15c2 (A15c+G3849A) 中国（北京市漢族等）
A16
A18
A19
A2 アメリカ大陸先住民
A20 (A+T152C!+T16362C+A14696G) 日本（東北地方・計0.1%）、中国（陝西省漢族1人・河南省漢族1人等・計0.032%）
A20a (A20+C16148T) 中国（遼寧省漢族1人・浙江省漢族2人・広東省漢族1人・江蘇省漢族1人・計0.023%）、台湾
A21
A22
A24
A25
A26
A6
A+A200G
A+T16189C!
A+G3834A
A+G16125A
A+A6890G
A+A9033G
A+G11914A!
A+T8686C
A+A10967G
A+T9126C
A+T3732C
A+G3483A
A+C9317T
A+C7493T
A+A4243G
A+T10275C
A+A16525C
A+T5794C