第64回国民体育大会陸上競技・男子100mは、2009年10月2日に少年男子A、10月3日に少年男子Bが新潟県の東北電力ビッグスワンスタジアムで行われた。

 少年男子A 

 記録 
大会前の主な記録は次の通り
記録名 選手 所属 記録 場所 年月日 日本記録 伊東浩司 神奈川・富士通 10秒00 バンコク 1998年12月13日 ジュニア日本記録 高橋和裕 奈良・添上高 10秒24 富山 1994年8月2日 日本高校記録 大会記録 宮田英明 群馬・東京農大二高 10秒27 福岡 1990年10月22日

 競技日程 
 日 時 ラウンド2009年10月2日金曜日 10:30 予選 14:30 準決勝 16:30 決勝

 競技結果 
q 記録による通過Q 順位による通過

 予選 
通過条件：各組上位4着（Q）と各組5着以下の記録上位4名（q）風：　1組:+2.0 m/s , 2組:+1.8 m/s , 3組:+0.2 m/s , 4組:+0.8 m/s , 5組:+2.5 m/s
 組 順位 選手 県 所属 記録 備考 1 1 九鬼巧 和歌山 和歌山北高 10秒55 Q 1 2 村吉星児 鹿児島 川薩清修館高 10秒69 Q 1 3 中村圭祐 茨城 東洋大牛久高 10秒77 Q 1 4 椛島有一 福岡 八女工高 10秒78 Q 1 5 上田祐司 奈良 添上高 10秒81 q 1 6 西川陽一 滋賀 米原高 10秒84 q 1 7 船水優哉 青森 田名部高 11秒01 1 8 佐々木靖典 島根 大社高 11秒14 2 1 辰巳友哉 石川 星稜高 10秒64 Q 2 2 竹井尚也 京都 龍谷大平安高 10秒68 Q 2 3 本間圭祐 神奈川 橘高 10秒70 Q 2 4 冨田智 熊本 鹿本高 10秒74 Q 2 5 近藤崇裕 三重 四日市高 10秒77 q 2 6 大和正作 富山 新川高 10秒88 q 2 7 伊藤類圭 北海道 白樺学園高 10秒98 2 8 藤嶋裕介 秋田 鷹巣高 11秒04 3 1 飯塚翔太 静岡 藤枝明誠高 10秒51 Q 3 2 嵐川愛斗 千葉 東海大浦安高 10秒69 Q 3 3 木村淳 沖縄 中部商高 10秒71 Q 3 4 能美新吾 山口 山口鴻城高 10秒80 Q 3 5 奥村周平 岐阜 清翔高 10秒95 3 6 野川大地 福島 郡山商高 11秒03 3 7 深沢宏之 長野 松代高 11秒19 3 8 欠畑岳 岩手 盛岡一高 14秒38 4 1 女部田亮 東京 東京高 10秒58 Q 4 2 勝山和成 福井 足羽高 10秒62 Q 4 3 松本浩太郎 宮城 仙台東高 10秒79 Q 4 4 諏訪裕祐 岡山 倉敷青陵高 10秒81 Q 4 5 八木維信 長崎 長崎日大高 10秒91 4 6 荒井恵太 山形 山形中央高 10秒93 4 7 梅崎祐介 佐賀 佐賀北高 10秒98 4 8 小田雅士 高知 高知工高 11秒71 5 1 三輪将之 愛知 中京大中京高 10秒55 Q 5 2 石川直人 群馬 桐生南高 10秒63 Q 5 3 手塚嗣音 栃木 国学院栃木高 10秒88 Q 5 4 構恭太 香川 香川西高 10秒90 Q 5 5 坪内諒 鳥取 八頭高 10秒98 5 6 佃直樹 愛媛 松山北高 11秒03 5 7 古本洋規 広島 宮島工高 11秒05 5 8 三嶋翔太 山梨 甲府南高 11秒06 

 準決勝 
通過条件：各組上位2着（Q）と各組3着以下の記録上位2名（q）風：　1組:0.0 m/s , 2組:+0.6 m/s , 3組:+0.1 m/s
 組 順位 選手 県 所属 記録 備考 1 1 九鬼巧 和歌山 和歌山北高 10秒48 Q 1 2 女部田亮 東京 東京高 10秒72 Q 1 3 嵐川愛斗 千葉 東海大浦安高 10秒76 1 4 村吉星児 鹿児島 川薩清修館高 10秒82 1 5 冨田智 熊本 鹿本高 10秒84 1 6 近藤崇裕 三重 四日市高 10秒86 1 7 手塚嗣音 栃木 国学院栃木高 10秒98 1 7 上田祐司 奈良 添上高 10秒98 2 1 三輪将之 愛知 中京大中京高 10秒59 Q 2 2 辰巳友哉 石川 星稜高 10秒67 Q 2 3 竹井尚也 京都 龍谷大平安高 10秒70 q 2 4 本間圭祐 神奈川 橘高 10秒77 2 5 松本浩太郎 宮城 仙台東高 10秒83 2 6 西川陽一 滋賀 米原高 10秒88 2 7 椛島有一 福岡 八女工高 10秒94 2 8 構恭太 香川 香川西高 10秒99 3 1 飯塚翔太 静岡 藤枝明誠高 10秒50 Q 3 2 勝山和成 福井 足羽高 10秒69 Q 3 3 石川直人 群馬 桐生南高 10秒72 q 3 4 木村淳 沖縄 中部商高 10秒73 3 5 能美新吾 山口 山口鴻城高 10秒82 3 6 中村圭祐 茨城 東洋大牛久高 10秒91 3 7 諏訪裕祐 岡山 倉敷青陵高 10秒94 3 8 大和正作 富山 新川高 11秒03 

 決勝 
風:0.0 m/s
 順位 選手 県 所属 記録 備考 飯塚翔太 静岡 藤枝明誠高 10秒38 九鬼巧 和歌山 和歌山北高 10秒44 竹井尚也 京都 龍谷大平安高 10秒65 4 勝山和成 福井 足羽高 10秒67 5 女部田亮 東京 東京高 10秒67 6 石川直人 群馬 桐生南高 10秒68 6 三輪将之 愛知 中京大中京高 10秒68 8 辰巳友哉 石川 星稜高 10秒69 

 少年男子B 

 記録 
大会前の主な記録は次の通り
記録名 選手 所属 記録 場所 年月日 日本記録 伊東浩司 神奈川・富士通 10秒00 バンコク 1998年12月13日 ジュニア日本記録 高橋和裕 奈良・添上高 10秒24 富山 1994年8月2日 日本高校記録 日本中学記録 梨本真輝 千葉・流山南部 10秒67 旭 2008年7月28日 大会記録 荒川岳士 栃木・宇都宮東高 10秒51 福岡 1990年10月22日

 競技日程 
 日 時 ラウンド2009年10月3日土曜日 10:30 予選 14:25 準決勝 17:10 決勝

 競技結果 
q 記録による通過Q 順位による通過DNF 棄権

 予選 
通過条件：各組上位4着（Q）と各組5着以下の記録上位4名（q）風：　1組:-0.3 m/s , 2組:0.0 m/s , 3組:0.0 m/s , 4組:-0.2 m/s , 5組:-0.5 m/s
 組 順位 選手 県 所属 記録 備考 1 1 梨本真輝 千葉 市船橋高 10秒80 Q 1 2 渡辺将志 愛知 名古屋高 10秒95 Q 1 3 頼駿智 神奈川 慶応高 11秒02 Q 1 4 岡本理紀斗 香川 英明高 11秒13 Q 1 5 伊藤侃嗣 茨城 中根台中 11秒15 q 1 6 吉持隆博 鳥取 鳥取中央育英高 11秒38 1 7 早坂祐哉 宮城 古川工高 11秒39 1 8 池田翔亮 福島 会津学鳳高 11秒47 1 9 松井良允 富山 高岡高 11秒51 2 1 塚本和也 奈良 平城高 10秒88 Q 2 2 宮内康成 愛媛 松山北高 10秒95 Q 2 3 東克俊 鹿児島 出水高 11秒00 Q 2 4 大口健太 石川 星稜高 11秒14 Q 2 5 藤間優介 新潟 日本文理高 11秒16 q 2 6 松尾慎太郎 三重 桑名工高 11秒17 q 2 7 遠藤優希 山形 米沢中央高 11秒35 2 8 元戎勇斗 和歌山 富田中 11秒64 2 9 川井龍志 高知 高知小津高 11秒75 3 1 北村拓也 広島 広島皆実高 10秒78 Q 3 2 谷川鈴扇 群馬 邑楽中 11秒00 Q 3 3 手塚康太 岐阜 大野白川中 11秒04 Q 3 4 高須晃宏 岩手 黒沢尻北高 11秒05 Q 3 5 矢川喬平 静岡 岩松中 11秒16 q 3 6 内堀直也 長野 岩村田高 11秒28 3 7 山本大介 宮崎 宮崎北高 11秒42 3 8 石田豪 熊本 熊本中央高 11秒42 3 9 内田智也 山梨 櫛形中 11秒70 4 1 永沼 賢治 大分 大分舞鶴高 10秒82 Q 4 2 大瀬戸一馬 福岡 新津中 10秒87 Q 4 3 近久伊吹 岡山 明誠学院高 11秒08 Q 4 4 福富晃希 佐賀 啓成中 11秒15 Q 4 5 小笹幸平 山口 西京高 11秒19 4 6 鈴木崇仁 栃木 国学院栃木高 11秒32 4 7 吉田健作 島根 大社高 11秒34 4 8 仲島諒 福井 美浜中 11秒46 5 1 時光龍一 東京 立正高 11秒08 Q 5 2 葛西俊也 青森 青森北高 11秒12 Q 5 3 魚里勇介 兵庫 青雲中 11秒14 Q 5 4 橋本光平 滋賀 彦根東高 11秒33 Q 5 5 小石川統 北海道 岩内一中 11秒34 5 6 小徳真 秋田 鳳中 11秒52 5 7 新村真人 沖縄 八重山高 11秒54 5 8 福山翼 長崎 日宇中 11秒58 

 準決勝 
通過条件：各組上位2着（Q）と各組3着以下の記録上位2名（q）風：　1組:-0.6 m/s , 2組:0.0 m/s , 3組:+0.4 m/s
 組 順位 選手 県 所属 記録 備考 1 1 北村拓也 広島 広島皆実高 10秒74 Q 1 2 大瀬戸一馬 福岡 新津中 10秒78 Q 1 3 宮内康成 愛媛 松山北高 10秒94 q 1 4 大口健太 石川 星稜高 11秒09 1 5 松尾慎太郎 三重 桑名工高 11秒16 1 6 頼駿智 神奈川 慶応高 11秒17 1 7 手塚康太 岐阜 大野白川中 11秒18 1 8 福富晃希 佐賀 啓成中 11秒25 2 1 永沼 賢治 大分 大分舞鶴高 10秒79 Q 2 2 塚本和也 奈良 平城高 10秒88 Q 2 3 高須晃宏 岩手 黒沢尻北高 11秒08 2 4 葛西俊也 青森 青森北高 11秒08 2 5 魚里勇介 兵庫 青雲中 11秒13 2 6 谷川鈴扇 群馬 邑楽中 11秒14 2 7 伊藤侃嗣 茨城 中根台中 11秒16 2 8 藤間優介 新潟 日本文理高 11秒25 3 1 渡辺将志 愛知 名古屋高 10秒85 Q 3 2 時光龍一 東京 立正高 10秒89 Q 3 3 東克俊 鹿児島 出水高 10秒97 q 3 4 岡本理紀斗 香川 英明高 11秒06 3 5 近久伊吹 岡山 明誠学院高 11秒12 3 6 矢川喬平 静岡 岩松中 11秒19 3 7 橋本光平 滋賀 彦根東高 11秒30 3 梨本真輝 千葉 市船橋高 DNF

 決勝 
風:+0.6 m/s
 順位 選手 県 所属 記録 備考 北村拓也 広島 広島皆実高 10秒75 永沼賢治 大分 大分舞鶴高 10秒80 大瀬戸一馬 福岡 新津中 10秒82 4 塚本和也 奈良 平城高 10秒89 5 宮内康成 愛媛 松山北高 10秒97 6 渡辺将志 愛知 名古屋高 10秒98 7 時光龍一 東京 立正高 11秒09 8 東克俊 鹿児島 出水高 11秒12