ニンジャスレイヤー

『ニンジャスレイヤー』（NINJA SLAYER）は、ブラッドレー・ボンド（Bradley Bond）とフィリップ・ニンジャ・モーゼズ（Philip Ninj@ Morzez）のアメリカ人作家コンビによるとされる小説作品。ジャンルは「サイバーパンク・ニンジャ活劇小説」。2010年よりクリエイターユニット「ダイハードテイルズ」の中心人物である本兌有、杉ライカらが日本語訳をTwitterとnote上に連載している（→Twitter連載）。

日本では『ニンスレ』と略されることもある。2021年8月時点でシリーズ累計発行部数は170万部を突破している。『このライトノベルがすごい！』単行本・ノベルズ部門では2017年版で6位を獲得している。

 概要 
「ブレードランナー」のような2030年以降の近未来サイバーパンク大都市を舞台に、「ニンジャを殺す者」である主人公ニンジャスレイヤーと、超能力を有しカラテを駆使する半神的存在、「ニンジャ」が率いる強大な悪の組織との戦いを描くアクション小説である。2020年現在、第4部の連載が行われている。

「忍殺語」と呼ばれる独特な文体が特徴。「ドーモ、○○＝サン」「アイエエエ！」「ニンジャナンデ！？」「アッハイゴメンナサイ」「古事記にもそう書かれている」などの一部の言い回しは現在でもインターネット・ミームとして知名度が高い。。

ストーリーの主軸はニンジャスレイヤーの戦いだが、各エピソードごとに、ゾンビ、サスペンス、ロボット、カンフー映画、ボーイ・ミーツ・ガール、コメディ、都市伝説、クトゥルフ、ミュージカルなど、アクションだけでなく様々なジャンルの映画をオマージュしていたり、ニンジャスレイヤー以外のキャラクターがメインのエピソードも多く存在したりするなど、同一世界観を舞台にしたオムニバス短編集・群像劇のような面も持っている。

2005年12月15日からMixi上にて有志による「Ninja Slayer Classics」の日本語訳が開始されたが、2010年に本兌有、杉ライカを中心としたクリエイターユニット「ダイハードテイルズ」の一部である『翻訳チーム』が作者から翻訳権を正式に取得、同年7月14日にアカウントを開設しTwitter上につぶやく形で連載を開始した。2012年にはエンターブレイン（現KADOKAWA エンターブレイン）から日本語版書籍の出版がスタートした。2016年11月からはnote上で有料コンテンツの「ニンジャスレイヤープラス」が開始している。

公式側は一貫して英語原作の実在を主張し、Web上にも2005年ごろから活動している痕跡が確認できるが、原作者や原書に関する情報が極端に少ないため不明瞭な点が多い。

 作者 

 原作者 
 ブラッドレー・ボンド（BRADLEY BOND）
 1968年生まれ。ニューヨーク在住。1990年代にインターネットを介してモーゼズと知り合い、共作を開始。言語学、歴史、伝統文化への造詣が深く、ニンジャ神話と北欧神話の類似点をいち早く指摘した。
 日本の歴史や伝統文化に関する知識が豊富で、ショドーやチャドーの嗜みもあり、また日本在住の甥から現代日本の写真や映像が定期的に送付されており、作中におけるリアリティ溢れる日本文化の描写には彼がメインとなって設定に関与している。
 フィリップ・ニンジャ・モーゼズ（PHILIP Ninj@ MORZEZ）
 1969年生まれ。ロサンゼルス近郊在住。ニンジャの脅威に警鐘を鳴らしつつ、ボンドと共に作品を執筆。
 学生時代にコンピュータ工学を学んでいた経験から、作中のサイバーパンク的考察に関しては彼が主導的立場にある。また日本人の命名規則をプログラム化しており、登場人物の一部はこのプログラムによって設定されている。

以上の内容は、書籍版公式サイトの著者紹介やTwitter上で公開されたインタビュー企画に基づいている。なお英語版を掲載しているTokyo Otaku Modeでもほぼ同等の記述となっている。2020年11月現在、二人は公の場に姿を現していない。アニメ化に際し「Anime Expo 2014」で公開されたティザーPVには原作者とされる白人男性二人が出演したものの、ピントがずらされており、はっきりとした人相は確認できない。その一方で、架神恭介が2010年12月に来日したブラッドレー・ボンドと食事を共にしたとブログに投稿したことがある。彼らも翻訳者とともに「ダイハードテイルズ」に所属する。

 翻訳者 
「ダイハードテイルズ」に所属する、本兌 有と杉 ライカの2名で行われている。

彼らは「翻訳チーム」を自称している。連載当初は使うクライアントにより「Saezuri」を使う「チームA（甲）」と iPhone用クライアントを使う「チームB（乙）」に分かれていたが、2020年現在はその限りはない。他に何名が関わっているのかは不明。Twitterアカウントの運営以外にも、商業展開についての窓口など、事務的な作業も担当している。ニンジャスレイヤー以外の翻訳作品として、トレヴォー・S・マイルズ他の海外作家アンソロジー『ハーン：ザ・ラスト・ハンター』やジェイ・クリストフのストームダンサー（『ロータス戦記』シリーズ）が存在する。

翻訳チームのアカウントでは、翻訳作品以外も連載されることがある。オリジナル小説『ブーブス・バンド 〜ロックンロール女囚軍団〜』や『スチーム・パワード』などのほか、作品ファンの少年「ボブ」と、ファンとして逸脱した彼の行動に対して忠告を与える「エルフのせんし」が登場する短編もある。また、エイプリルフールには決まってニンジャスレイヤーを他作品風にパロディした短編が連載される（「ニンジャモン」など）。

作中の登場キャラ「ザ・ヴァーティゴ」がつぶやかれた質問に答えるなどメタフィクションを利用した注意喚起もなされるなど、翻訳チーム自体をフィクション、あるいはメタフィクションに近い存在として描いている。公式サイトでも、作品宣伝や活動報告をストーリー仕立てとしたり、いらすとやなどのフリー素材を多用したりするなど独特の構成である。

翻訳チームが2002年前後に運営していたWEBサイト「ダイハードテイルズ」では、ニンジャスレイヤーのプロトタイプが掲載されていた。

翻訳チームの中心人物である本兌有と杉ライカは、2012年のSFセミナーに出演し翻訳時のエピソードを披露している。

 特徴 

 掲載順 
第1部から第3部までは、連載順と時系列が一致しない時系列シャッフル方式を採用していた。

これは、アメリカ人コンビにより原語版（英語）が複数の雑誌で不定期に掲載されていたため、と公式側は主張している。その影響を受けて、第2部の連載中に第3部のエピソードが始まるなど、時系列がバラバラになっている。書籍版でも各エピソードが時系列に沿っておらず、本文1ページめが「これまでのあらすじ」で始まっている。この点に関して原作者は、「シリーズではあるが読み切り形式の『コナン・サーガ』へのオマージュである」と述べ、翻訳チームは「『水戸黄門』や『キャプテン・アメリカ』を第一話から読んでるファンは少ない（ので読み進めるのにさほど予備知識は必要としていない）」と述べている。

第4部以降は時系列シャッフルは廃止し、時系列順に連載進行している（外伝的サブストーリーはその限りではない）。

 Twitter連載 
Twitter連載が行われる日にはサキブレと呼ばれる「◆○◆」の記号が昼頃にツイートされ、本日中に連載されることが読者に通知される。基本的に夜20時以降に連載が開始されるが、「◆昼◆」「◆夕◆」など別バターンのサキブレの場合はその限りではない。
Twitter連載直前や本文の場面転換時には「◆◆◆◆◆」と菱型記号を並べたものがツイートされる。日本語書籍版では専用の手裏剣型のアイコンに置き換えられている。

リアルタイム更新による連載を行っているため、小説作品でありながらテレビ番組のようにTwitter上でファンによる実況が行われている。「#njslyr」タグの利用が推奨されており、詳細なタグの使い方についてもダイハードテイルズによりまとめられている。

翻訳チーム側は読んでから実況の感想を投稿するまでのタイムラグを考慮し、次の文を投稿するタイミングを調整している。またテレビでの人気映画の放送など有力コンテンツとの競合を避ける、フォロワー増加率や1日あたりの投稿数とRemove数の関係を解析サービスを利用して分析するなど、Twitter上での連載に特化したスタイルが徹底されている。

2016年11月からはTwitterだけでなく、noteの有料定期購読マガジン機能を利用した定額制小説配信マガジンである「ニンジャスレイヤープラス」の販売を開始。以降も並行してTwitterで引き続き無償連載を行っているが、ニンジャスレイヤープラスではTwitterの物語を補完する書き下ろしのサブストーリー、設定資料が公開されている。翻訳チームは「手売りの月額制ホチキス綴じ同人誌」、「ニンジャフリックス」を謳っている。

書籍化した範囲であっても、Twitter連載分は現時点でもすべて無料で公開されている。Twitter連載は有志によりTogetterでエピソードごとでまとめられているほか、ダイハードテイルズのnoteでアーカイブ化が進められている（→外部リンク）。

 忍殺語 
本作は独特の文体で知られており、それらは総じて「忍殺語（にんさつご）」と呼ばれている。以下が原語版および日本語版の特徴である。

たとえ今から殺し合う敵同士でも礼節は重んじ、敬意と敬語は欠かさない。相手は「 -san（〜さん）」付けで呼び、戦闘前にはお辞儀をする。“ぶっ殺した”相手にもちゃんと挨拶をするのが通例である。

一般企業での懲罰として当然のように行われる「ケジメ（指詰め）」や「セプク（切腹）」、 戦闘中に繰り広げられる突拍子もないシャウト（武道で見られるような強く特徴的な発声）や演武など、曲解された日本文化がちりばめられている。欧米における感嘆詞の「ジーザス！」や「○○キリスト」などといった信仰に裏付けされた語について、本作ではキリスト教から仏教へと崇拝の対象が置換されており、例えば「ジーザス！」と叫ぶところで「ブッダ！」と叫ぶ。人体破壊の隠喩として頻繁に使われる「ネギトロ」、多数の死体が並ぶ光景に「まるでツキジ（cf. 築地市場）」など、日本文化に絡めた表現がある。「ヨイデワ・ナイカ・パッション重点」「エキサイティングは興奮する」など、映画『ブレードランナー』に登場したような日本語混じりの看板も登場する。

また、「Wasshoi（ワッショイ）」「Do-mo（どうも）」など、ローマ字表記された日本語や、「Jitsu（術）」「Suriken（手裏剣）」などといったカタコトジャパニーズのほか、「Chameshi Incident（茶飯インシデント） 」「Ushimitsu・Hour（丑三つアワー） 」「Soumato Recall（走馬灯リコール）」などといったダメな機械翻訳を信じて憶えてしまったような混合言語的ちゃんぽん語がいくつも飛び出す。文後に付く「Tatsujin!（達人！）」「Wazamae!（技前！）」などの感嘆詞も多い。「イヤーッ！」「グワーッ！」「イヤーッ！」「グワーッ！」「イヤーッ！」「グワーッ！」などといった叫びを何度も繰り返すことも多い。

なお、本作では、英語から日本語へ翻訳するにあたってTwitterを使用することから、一度に提示できる文字数が140に限られるため、1ツイート=1センテンスが徹底されているのに加え、以下のような独特の翻訳センスが見受けられる。

 「〜めいて」、「〜的な雰囲気」の意味で使われる「〜的アトモスフィア」、「実際のところ」「本当は」「実質的には」などの意味で使われる「実際○○ 」、「素晴らしい」の意味で使われることが多い「奥ゆかしい○○」、本来とは異なる「しめやかに走る」や「しめやかに爆発」などの用法で登場する「しめやかに○○」などといった、おかしな翻訳語が頻繁に使われる。
「アイエエエ！（痛みや警報の叫びを表す英語 "AIEEEE!" の日本語音写）」「ジツ（術）」「スリケン（手裏剣）」や「ウシミツ・アワー（丑三つ時）」「マルノウチ・スゴイタカイビル（"" のほぼ音写で一部翻訳）」（物語設定上、日本の首都ネオサイタマのマルノウチ地区に聳え立つスゴイタカイビル〈超高層ビル、凄く高いビルディング〉で、モデルは東京都千代田区にある丸の内ビルディング。）などの、原語表記をそのまま音写した片仮名表記が多く見られる。

これら「忍殺語」と称される独特の翻訳スタイルが話題を呼んだ。翻訳チームのアナウンスも作中と同じく、平仮名を多用したり、片仮名言葉を変形させた「ツイッターアー」「アナウンスーン」「マインゴマップ」「ごあんしんください」など、独特の言葉遣いで行われている。

 交流と二次創作 
原作者や翻訳チームは活動当初から、Twitterを利用したファンとの交流を積極的に行っており、時系列が曖昧で登場人物が多い本篇のフォローとして、公開済みエピソードの再放送や人物紹介の「ニンジャ名鑑」をつぶやくなど地道な活動を続けた。熱心な作品のファンを「ニンジャヘッズ」と呼称している。書籍版のイラストを担当したわらいなくも、以前からネット上にファンアート（ニンジャスレイヤーにおいては「ウキヨエ」と呼ぶ）を公開していたファンの一人である。

日本語翻訳テキストを許可なく公開・再配布する行為は、一般的な作品と同じく引用を除き認められていないが、同人誌など二次創作（ファンジン）については、「もしあなたが「ファン活動の範疇で」それらの二次創作物を発表したり、同人誌を頒布したり、イベントなどを開催するのであれば、ダイハードテイルズ出版局に対して事前に申請したり許可を取る必要はありませんし、出典元アドレスの記載も必要ありません。」としたり、書籍に掲載するイラストの募集についても「わらいなくのデザインに準拠する必要は無い」と明言するなど、ファンの活動に対し寛容な姿勢をとっている。各漫画、アニメのような公式メディアミックスであってもそれぞれ異なったキャラクターデザインであるなど、一貫してデザインを固定化していない。

二次創作は「#ウキヨエ」タグをつけてのアップロードを推奨している。現在でもファンアートや小説、コスプレ写真などが多数投稿されている。

また、定期的に「ニンジャソン」と称して、決められたテーマに沿った二次創作を一定期間募集し、優秀作品に表彰する企画も行われている。受賞者には景品が贈呈される。

他にもニンジャスレイヤーの同人ゲーム「バリキジャンプ」を公開していたネコ忍者コアに公式サイトのミニゲーム制作や「AREA4643」の制作を依頼したり、ファンの一人にグラフィックノベルとキャラクターアイコンの制作を依頼したり、LINEスタンプの図柄の案を募集したり、有志の作成したまとめwikiにリンクを張るなど、ファンを巻き込んだ活動を継続している。

 あらすじ 
ニンジャスレイヤーは2021年現在、4部構成となっている。ダイハードテイルズのnoteでは第1部〜3部をトリロジー、第4部をAoM（エイジ・オブ・マッポーカリプス）と呼び明確に区分されているため、本項でも同様に分けて扱う。

 トリロジー 
IRCネットワークが世界を網羅し、サイバネティックス技術が普遍化した近未来。鎖国体制下にある日本は、影から暗黒メガコーポと称される巨大企業によって操られ、首都である巨大人工島ネオサイタマの治安は悪化、そして時を越えて蘇った半神的存在「ニンジャ」が暗躍を繰り返し、まさに古事記に予言されたマッポーの世を迎えていた。

平凡なサラリマンであったフジキド・ケンジは、マルノウチ・スゴイタカイビル内で家族団欒していたところをニンジャ同士の抗争に巻き込まれ、妻子を殺されてしまう。しかし瀕死の重傷を負った彼に、全てのニンジャへの憎悪を燃やすナラク・ニンジャのソウルが憑依。フジキドは赤黒い装束を纏い、「忍」「殺」の二文字と共に復活する。

ニンジャを殺すもの、ニンジャスレイヤーとして。

 第1部 ネオサイタマ炎上 
原題は「Neo-Saitama in flames」

 ニンジャスレイヤーとなったフジキド・ケンジは、仇であるソウカイヤのニンジャを殺害してまわるが、ナラク・ニンジャに意識を支配され、ニンジャのみならず一般人まで無差別に巻き込み暴走してしまう（フジキドはこの時期をのちに「暗黒の七日間」と呼ぶ）。これを危ぶんだドラゴン・ゲンドーソーはナラクのソウルを封印することで、フジキドの自我を取り戻すことに成功。
ニンジャとしての師となったゲンドーソーだったが、ソウカイヤニンジャの襲撃により毒薬をその身に受け生死の境をさまよう。ニンジャスレイヤーは解毒剤の情報を探るため、ジャーナリストを名乗るハッカーのコーカソイドの女性、ナンシー・リーと共闘する。
解毒剤を入手しゲンドーソーのもとへ向かったニンジャスレイヤーだったが、そこにソウカイヤの首魁ラオモト・カンからニンジャスレイヤー抹殺指令をうけた、ラオモトの懐刀であるダークニンジャが現れる。ニンジャスレイヤーは苦戦を強いられ重症を負い、ゲンドーソーはニンジャスレイヤーを守るため自爆し死亡してしまう。ニンジャスレイヤーはダークニンジャが携えたカタナ「ベッピン」を目にし、妻子を直接殺害した仇敵である事に気づき激怒。ベッピンをへし折りダークニンジャの撃退に成功する。
ゲンドーソーの孫娘であるユカノはダークニンジャ襲撃のおりに逃亡後行方不明、記憶喪失となってしまう。後に反企業体組織「イッキ・ウチコワシ」に洗脳され、アムニジアと名を変え市民に害を加える存在となってしまったが、ニンジャスレイヤーは彼女の意向を汲み決裂する。
ソウカイヤ首魁ラオモト・カンの「ネオサイタマ知事となって表裏から都市を支配する」計画を掴んだニンジャスレイヤー。しかし焦りから策なく挑んだことでラオモト・カンに敗北を喫し、ナンシーがさらわれてしまう。彼女を救出してラオモトを殺すため、ニンジャスレイヤーは単身、ソウカイヤ本拠地である超高層ビル・トコロザワピラーへと走る。
ニンジャスレイヤーはラオモトへの道を塞ぐニンジャを撃破し続け、ダークニンジャと相対する。しかし突然現れた運命者と名乗る二人組ニンジャの説得により、ニンジャスレイヤーとの決着をつけることなく、ダークニンジャはソウカイヤを裏切り姿を消す。
ナンシーの救出に成功したニンジャスレイヤーは彼女の手を借り天守閣に上り詰め、ラオモト・カンとの直接対決が始まる。フジキドはナラク・ニンジャの力を力づくで利用することで優位に立とうとするが、逆にナラクに意識を乗っ取られてしまう。フジキドは自我を失いかけるなか、ナラクを受け入れることを選択し和解に成功、一心同体の共鳴状態となる。ニンジャスレイヤーは過去のニンジャとのイクサの経験から、ラオモトが持つ七つのニンジャソウルの各個攻略に成功する。しかしナラク・ニンジャはラオモトのヒサツ・ワザからフジキドを庇い、休眠状態に陥ってしまう。互いにニンジャソウルを使い尽くした肉弾戦の末、ニンジャスレイヤーは天守閣からラオモトを蹴り落とし、爆発四散せしめる。

 第2部 キョート殺伐都市 
原題は「Kyoto: Hell on earth」

 ソウカイヤの壊滅直後、ザイバツ・シャドーギルドなる組織の襲撃によってネオサイタマは炎上した。妻子を奪ったのはソウカイヤとザイバツによる抗争が原因だと知ったフジキドは、ザイバツの本拠地キョート・リバプリックへと向かい、ナンシーから紹介された探偵タカギ・ガンドーと共にザイバツとの戦いを開始する。しかしラオモトとの死闘でナラク・ニンジャのソウルは休眠状態に陥っているため、ニンジャスレイヤーはザイバツ・グランドマスターたちを相手にこれまで以上の苦戦を強いられる。
 紆余曲折の末、古の三種の神器を揃えたザイバツ首領にしてショーグン・オーバーロードの末裔、ロード・オブ・ザイバツの手により古代遺跡キョート城が浮上し、モータル生命の無差別吸収が始まった。さらにはオムラ社の決戦兵器モーターツヨシと合体したネブカドネザルの襲来、格差社会に反発したアンダーガイオン市民の暴動、無軌道ニンジャ・デスドレインによる無差別虐殺、そして密かに刃を研ぎすませていたダークニンジャとザイバツ・シテンノの謀反が重なり、キョートは生き地獄へと転じた。マッポー・アポカリプスが訪れる中、ニンジャスレイヤーはロードの首を狙い、ユカノを救うため、戦いの中で知遇を得た仲間と共にキョート城へと挑む。

 第3部 不滅のニンジャソウル 
原題は「Ninjaslayer Never Dies」

 ソウカイヤ、ザイバツ、ダークニンジャと仇敵を討ち果たし、生きる目的を見失っていたフジキド。無為に日々を過ごしていた彼は、やがて「ニンジャを殺す暗黒非合法探偵」として再起し、ネオサイタマを支配する新たな組織、アマクダリ・セクトとの戦いに身を投じることになる。しかしラオモトの息子ラオモト・チバを傀儡にして張り巡らされたアマクダリの陰謀は根深く、ニンジャスレイヤーはネオサイタマという名の「システム」と、これまでにない戦いを強いられることになる。
 か細い情報の糸を手繰り寄せ、ついにアマクダリの最高幹部集団である「12人」の全容を把握するに至ったニンジャスレイヤー。再びナンシー・リーと共に一転して攻勢に転じたニンジャスレイヤーが「忍」「殺」の旗を掲げた時、殺戮の嵐がネオサイタマに吹き荒れ、一人、また一人と「12人」は殺害されていく。10月10日、「アマクダリの最も長い日」が始まったのだ。
 「テロリスト フジキド・ケンジ」による要人の連続暗殺事件、その真の目的はアマクダリの機密データを手に入れるための陽動であった。そして市民の敵となることを代償に、彼らはアマクダリの参謀であり今やネオサイタマの知事代行となったシバタことアガメムノンが「世界の再定義」を目論んでいることを知るに至る。2038年1月18日、あの「アマクダリの最も長い日」から100日経ったその日、アガメムノンは「鷲の翼」を開くべく、月面よりネットワークを支配するニンジャ「アルゴス」のもとへ赴く。そして、アマクダリの管理社会を良しとしない者たちもまた、それを阻止すべく行動を開始した。

 AoM 

 第4部 エイジ・オブ・マッポーカリプス 
原題は「AGE OF MAPPOR-CALYPSE」

第4部は全てのエピソードが時系列順に連載されている。海外ドラマのようなシーズン方式を採用している。
アマクダリの壊滅から10年。磁気嵐が消えた時代、日本という国家は崩壊し、世界は暗黒メガコーポが実質的に国家を形成していた。各地で眠りについていたリアルニンジャが次々と帰還を果たし、古事記に予言されたマッポーの世が訪れていた。

 シーズン1 

 将来有望なオリガミアーティストだったマスラダ・カイは、幼馴染のアユミをサツガイという名のニンジャに殺され、彼自身も死の淵にあったその時、ナラク・ニンジャが憑依、ニンジャスレイヤーとなった。マスラダは復讐のため、サツガイを信仰するニンジャのネットワークである「サンズ・オブ・ケオス（SoC）」との戦いを開始する。
 かつてニンジャスレイヤーであったフジキド・ケンジはサツバツナイトと名を変えていた。リアルニンジャ達の襲撃によりユカノから奪われた三種の神器を取り返すため、各地を旅している。
 ピザ屋「ピザ・タキ」を隠れ蓑にする情報屋タキ、ウキヨの少女コトブキを仲間に加え、ニンジャスレイヤーはサンズ・オブ・ケオスと戦うなか、ニンジャスレイヤーの力を狙うダークニンジャが率いる新ザイバツ、青年となったラオモト・チバを首魁としたネオサイタマを支配するソウカイヤといった、10年で大きく変わった過去の組織とも接触する。

 シーズン2 

 サツガイに敗れシトカへと流れ着いたニンジャスレイヤーは、その地で出会ったグレイハーミットと名乗るニンジャと、彼が匿う幼い少女ゾーイと交友を深める。彼女はコトダマ空間から質量を持った物質を生成する特殊な力をもっていたが、それも目的とした組織「過冬」にゾーイは誘拐されてしまい、グレイハーミットは正体を明かしシルバーキーとして戦うも致命傷を負う。彼らを救うためニンジャスレイヤーは過冬との戦いを決意する。

 シーズン3 

 カナダについたニンジャスレイヤーは、ニンジャの暴虐に蹂躙される村を目撃する。カナダはリアルニンジャ、タイクーンことアケチ・ニンジャに占領されており、「ネザーキョウ」と呼ばれる国に成り果てていた。インターネットを使用するものは惰弱と見なされ虐殺されてしまうため、市民は平安時代の日本を思わせる旧文明的な生活を強いられる。

 しかしマスラダはサツガイとの戦いを経て、ニンジャスレイヤーの力をほとんど失っていたため、並のニンジャにも苦戦する程に弱体化していた。マスラダはニンジャスレイヤーの力を取り戻すため、そしてタイクーンを倒すため戦いを挑む。

 シーズン4 

 旧き神話の時代に君臨した7人のリアルニンジャ達「ダークカラテエンパイア」は、「ストラグル・オブ・カリュドーン」と呼ばれる狩りの儀式の標的としてニンジャスレイヤーを指名する。「狩人の印」を刻んだ獲物の心臓の血を飲んだものが勝者となる。勝者はダークカラテエンパイア内での絶対の承認権限を得ることができる。リアルニンジャは直接手をくださず、各々が代理戦士となるニンジャをニンジャスレイヤーのもとに派遣する。
 7人の代理戦士のリンチにあい「狩人の印」を刻まれてしまったニンジャスレイヤーは、反撃のため代理戦士の各個撃破を開始する。

 他 
第3部直後のラオモト・チバを主人公に据えたスピンオフ小説「スズメバチの黄色」、数百年前を舞台にした平安時代のニンジャスレイヤーであるキルジマ・タカユキの活躍を描く「サムライ・ニンジャスレイヤー」などが展開されている。

 用語 

 ニンジャ 
ニンジャとは、様々なカラテとジツを操り、人智を超えた驚異的な戦闘能力を得た半神的存在を指す。

栄えている文明に忍び込み、カラテやジツによって社会を乗っ取り支配する存在で、平安時代の日本を暴力と恐怖によって支配し一般人を平然と虐げた半神のごとき存在である。日本に限らず、いわば世界史を裏側から動かしてきた力であり、作中では古代エジプトなど世界各地にもニンジャがいたことが示唆されている。織田信長やヴラド・ツェペシュなどもニンジャである。

キンカク・テンプルでの「ハラキリ・リチュアル」によって歴史から姿を消して以降、こうしたニンジャ真実は徹底した隠蔽と改竄により、物語開始時点では伝説にしか出てこない架空の存在とみなされている。ニンジャはフィクション上の存在としては人気のあるモチーフであり、子供向けの玩具などに用いられることもある。だが、かつてのニンジャクランの抗争の歴史を暗喩的に表現した民話や神話は世界中に存在し、ニンジャの恐ろしさは今もなお日本人の心の奥底に残っている。桃太郎や浦島太郎などの昔話、吸血鬼やゾンビといった怪物もニンジャの伝承を一般向けに改変されたもの。そのため、一般人は本物のニンジャを目にすると、それだけで拒絶反応を起こし恐怖におののき発狂してしまう（後述のニンジャ・リアリティショック）。

古代や平安時代では厳しい修行の末に自力でニンジャになるほかなかった。自力でニンジャになった者はリアルニンジャと呼ばれる。リアルニンジャの中でも平安時代前から活躍し、伝説に名を残すほどの強力なニンジャを特に「神話級ニンジャ」と呼ぶ。その一方で現代のニンジャは、普通の人間が「ニンジャソウル」に憑依されて超人的な能力を得た、ソウル憑依者がほとんどである。憑依直後から筋力の増強など身体の変化が起こり、個人差はあるが最低でもバックフリップやメイアルーア・ジ・コンパッソ（カポエイラの技）を軽々こなす身体能力、既に発射された銃弾を回避する程の反射神経、拳銃弾が数発当たった程度では致命傷とならず戦闘を継続可能な耐久力を獲得する。ニンジャ特有の超人的な能力は「ニンジャ握力」「ニンジャ視力」など「ニンジャ○○」と表現される。また憑依直後に自ら、あるいはソウルや第三者によって新たに「ニンジャネーム」を名付けられる事が多い。ソウル憑依者は、自分の能力が大幅に拡張された結果、社会生活を営む上で制御していた・制御すべき欲望や感情（殺人癖といったものから、ちょっとした苛立ちのような単純なものまで）を御するのは馬鹿馬鹿しいことである、と断じる場合が多い。そうなると人格は豹変し、略奪や殺害を平然と行う邪悪な存在へと変わってしまう。なお、超人的な身体能力をこそ有するものの、回復力を上回る強力な重火器や回避できない量の飽和攻撃、耐性のない薬物には戦闘力を奪われ致命傷を負うなど、必ずしも絶対無敵の存在ではない。

平安時代のニンジャは主にクランと呼ばれる集団に属し、名無しのゲニンであるレッサー・ニンジャ（Lesser Ninja）、それを束ねるグレーター・ニンジャ（Greater Ninja）、厳しい修行などにより名を持つことを許されたアーチ・ニンジャ（Arch Ninja）の3つの階級に分けられていた。現代ではほとんどが企業などに所属しているか、フリーランスとして契約しているか、あるいは自分で表向きの組織を作って潜伏しているのが普通であり、なんらの所属先をもたないニンジャは少ない。

女性のニンジャであっても、くノ一ではなく「女のニンジャ」と表記される。

細胞レベルで人間とは違う存在のため、ニンジャは子を成すことはできない。作中に登場する子持ちのニンジャ（ラオモト・カン、ニンジャスレイヤーら）は、それ以前に子を成したもの。
 ニンジャソウル
 平安時代に生きたニンジャ達が、何らかの原因によりキンカク・テンプルにてハラキリ・リチュアルを敢行して自害し、魂と化した（アセンション）状態。現代に出現したニンジャソウルが、人間に憑依（ディセンション）する事でその者をニンジャへと変える。
 憑依後に自我を保つニンジャソウルはごくわずかであり、最初のインストラクションを終えた後は自我を失う場合がほとんどである。
 憑依には何らかの選定基準があるのか、無差別なのかは不明。瀕死の老人にニンジャが憑依し、結局死亡してしまうなどの事例も起きている。分かっている事は「ニンジャソウルは同性にしか憑依しない」ということであり、現代の憑依者に男性が多いのはこのためである。またニンジャソウルが憑依すれば、人間だけでなく犬や猿、あまつさえ死体であってもニンジャになれる。
 基本的にレッサーよりもグレーター、グレーターよりもアーチ・ニンジャのソウル憑依者の方が強い力を持つとされるが、カラテの練磨や戦闘経験の多寡・人生経験など憑依された本人の資質にも影響されるため、絶対的な基準ではない。その場のソウルの残量はヨロシサンのニンジャソウル測定器によって数値化できる（単位はカラテ）。
 憑依者が死ぬ際は、「サヨナラ!」（Sayonara!）のアイサツと共に体内に宿るニンジャソウルのパワーが暴走し、肉体を爆発四散 せしめて最期を迎える（ただし徐々に消耗した場合爆発四散しないことがあるほか、爆発四散すら許されずに殺されたニンジャも存在する）。憑依者を失ったニンジャソウルがどうなるのかは不明である。
 リアルニンジャ
 厳しい修行の末に自力でニンジャになった者。平安時代は全てリアルニンジャだったが、修行のプロセスが半ば失伝しているため現代では稀少な存在である。
 作中には複数人が登場するが、ドラゴン・ゲンドーソーが「最後にリアルニンジャになった者」とされる。
 憑依ニンジャと違い、ニンジャソウルの力を完全に使いこなす事が出来る為、高い戦闘力を持つ。
リアルニンジャのニンジャネームは、「ドラゴン・ニンジャ」「シ・ニンジャ」など「○○・ニンジャ」という表記である。
 アニメイシヨン版の英語字幕でもReal ninja（リアルニンジャ）だが、吹替版ではTrue ninja（トゥルーニンジャ）になっている。
 ニンジャアニマル
 動物のニンジャ。人間と同等の知性を持ち会話も可能であるが、その声はニンジャにしか聞き取れない。
 平安時代には忍犬のような動物を使うクランもおり、中には主人と修行を続けた結果「リアルニンジャアニマル」になった例もあるという。
 作中には犬の「ストライダー」と猿の「マンモンキー」などが登場している。
 カツ・ワンソー
 世界最古のニンジャで、暗殺拳「チャドー」の開祖。
 伝説のハトリ・ニンジャとニンジャ六騎士の謀反によって討たれたとされる。
 アイサツ
 ニンジャ同士が出会った時は、まず互いに「ドーモ、〇〇（相手の名前）=サン。××（自分の名前）です」と言ってオジギを交わす一連の行動「アイサツ」を行う。
 アイサツは欠かすことの出来ない礼儀であると同時に相手を威圧する役目をも果たす。これは攻防の手を止めて隙を晒すことも厭わず「相手のために」名乗る行動なので、アイサツをしないことや、アイサツ中の攻撃は「スゴイ・シツレイ」なことであるとされる。ただしアイサツ前に一度だけアンブッシュを仕掛けることが許されており、その結果相手が死亡しても、それはアイサツをするだけの力量も無かったということになる。一方的なアイサツも「カナリ・シツレイ」なことであるとされている 。
 アイサツに慣れていないニンジャはオジギからの復帰に時間がかかり、その隙を突いて一撃で倒されたり、アイサツ中に不意打ちをしかけるモータルに重傷を与えられる者もいる。
 アイサツは必ずしも口頭によるものでなくても良く、ショドーでアイサツすることや仲間による紹介、オジギだけで済ませることも許される 。名前に関してはさほど重要ではないらしく、偽名を名乗るニンジャや改名するニンジャがシツレイとされたことは無い。アイサツができない距離の場合は相手がアイサツできる距離に来た場合にアイサツが行われる（これもシツレイとはされない）。
 ハイク
 対決に敗北したニンジャは、死ぬ寸前に辞世の句のごとく「ハイク」を詠む慣わしがある。ニンジャ同士の戦いが決着する際に、勝っている側が負けている側にかける言葉「ハイクを詠め」はここから来ており「お前の負けだ、潔く覚悟を決めろ」「念仏でも唱えろ」というような意味がある。ただし、ハイクを詠む暇もなく死ぬニンジャも数多く、詠んだとしても実際の俳句のルール（五・七・五の定形に揃えて季語を入れる）が守られることはあまりなく、自分の心情やこの世への未練、相手への恨み言などを連ねたものが多い。
 ニンジャ達だけでなく、（主に上流階級の）市民たちの間でも、伝統的かつ文化的な趣味として嗜まれており、コンクールなども開催されている。こちらは現実の俳句とほぼ同様。
 ジツ（Jitsu）
 いわゆる忍術だが、ニンジャソウルの超能力であるため、実質的には忍法に近いが、作中においては「ニンポ（忍法）はマンガやアニメに出てくる荒唐無稽なもので、ジツとは全く異なる」と説明されている。
 体を硬質化させる「ムテキ・アティチュード 」や炎を発生させる「カトン・ジツ」などがあり、使い手によって様々な変種が存在する。
 アーチ級ニンジャはユニーク・ジツ（Unique Jitsu）と呼ばれる強力な独自のジツ(ほとんどの場合一人につき一技のみ)を習得している事が多い他、コロスニンジャ・クランの「キリングフィールド・ジツ」やトカゲ・ニンジャクランの「ドク・ジツ」など、クラン特有のジツも存在する。
 カラテ
 格闘技のみならず武術全般と、その力量を示す単語。鍛錬の度合いなども含まれ、幅広い意味合いを持つ。
 本作においてはジュー・ジツ、コッポ・ドー、イアイドーやパンキドー 、ピストル・カラテなどもカラテと称される。
 その他、武器にカラテをこめて強化する「エンハンスメント・ジツ」、体内の「血中カラテ」を弾丸のように打ち出す「カラテ・ミサイル」が存在するなど、体内のエネルギーとしても表現される。
 作品のテーマの一つとして「ノー・カラテ、ノー・ニンジャ」が掲げられており、ニンジャの戦闘能力の基本はカラテであるとして、如何に強力なニンジャソウルやジツであっても、カラテの技術に優れたニンジャの前に、手も足も出ずに敗れることが多い。
 ニンジャソウル測定器でソウルを数値化した際の単位でもある。
 イクサ
 主にニンジャ同士の直接戦闘を指す。
 ジュー・ジツ
 ニンジャスレイヤーが基本とする戦闘スタイルで、「ジュー・ジツを構える」という表現が頻繁に登場する。
 「アラバマオトシ」などの投げ技や「サマーソルトキック」などの打撃技がある。
 古代ローマカラテ
 「古代ローマカラテ文明」を築いたカラテ流派の一つだが、ニンジャ大戦によって滅亡した。
 ニンジャの基本動作であるブリッジによる攻撃回避の源流であり、作中でも複数の使い手が登場するが、いずれも技を見せる前に死ぬか、技の描写の暇さえなく決着が記述されていたため長い間詳細が不明だった。しかし第3部終盤、筆頭伝承者であるスパルタカスとの決闘において、ニンジャスレイヤーとそれまでの使い手との対決が回想され、またスパルタカスによる技の数々が明らかになった。
 スリケン（Suriken）
 ニンジャが投げる飛び道具で、手裏剣のことを指す。ソウルの力により生成されるため基本的に弾切れはない。
 形状もニンジャによって千差万別で、クナイ・ダートや卍型のアフリカ式投げナイフを使う者もいる。
 チャドー
 カツ・ワンソーを開祖とする暗殺拳。現代ではゲンドーソーが継承しており、フジキドは彼に助けられたことで後継者となった。
 「タツマキケン」「アラシノケン」などの強力な攻撃技と「ウケミ 」による防御の他、独特の呼吸法によってカラテの威力を上昇させたり、回復速度の向上や解毒も可能。精神鍛錬のために茶の湯と坐禅が用いられており、その部分は独立した趣味・嗜好として嗜まれている。そのため、暗殺拳としての側面を知らない一般人にとっては、茶の作法として受け止められている。継承者ではないラオモトも似た呼吸法が使える。
 フーリンカザン
 ニンジャの戦闘において重要な考え。周囲の環境を利用したり、敵のジツやワザを逆に利用して優位に立つなど、現実の風林火山と類似した意味をもつ。
 ゲンドーソーによると、ニンジャとは「地水火風の精霊と常にコネクトし操る存在」であり、これを「フーリンカザン」と称するという。
 メンポ
面頬。マスクや覆面など、顔に装備するものは共通してメンポと呼ばれる。頭全体を覆うものはフルメンポ、もしくはフルフェイスメンポと呼ばれる。ニンジャは本能的に顔を隠したくなる習性があるらしく、共通して装備している。マフラーやサングラスで代用する者や、何もつけない例もある。
 ニンジャ装束
ニンジャの衣装。ニンジャスレイヤーのようにニンジャとして活動する際に無から生成する者から、自作して着替える者もいる。ニンジャソウルの格が低いと生成ができない。
 聖なる三種の神器
 一般に知られる剣、鏡、玉というのは真実を隠蔽するための嘘で、真の神器はヌンチャク、メンポ、ブレーサーである。
 カツ・ワンソーの遺骨が埋め込まれており、特殊な効果を発揮する。
 モータル
 ニンジャではない普通の人間のこと。
 身体的にはニンジャに劣るが、タカギ・ガンドーやヤクザ天狗などのように、技量や戦法によって互角に戦える者もいる。
 ニンジャ・リアリティショック（NRS）
 ニンジャは一般的には実在しないとされている一方、その恐怖は精神に今なお根付いており、モータルが遭遇した場合「アイエエエエエエ！ ニンジャ！？ ニンジャナンデ！？」と悲鳴をあげ、ニンジャ・リアリティショック（Ninja RealityShock）と呼ばれる恐慌状態に陥る。嘔吐・失禁・記憶喪失が代表的な症状。
 モータルであっても精神的に強かったり、想像力の乏しい者はNRSに陥らない。

 文化 
暗黒メガコーポ
 世界の経済を裏から操る巨大企業。重役や用心棒がニンジャであることも多い。勢力拡大のためなら手段を選ばないところがあり、ソウカイヤ、ザイバツなどのニンジャ組織とも取引を行っている。たびたびニンジャスレイヤーとも敵対する。 ヨロシサン製薬、オムラ・インダストリが代表的な例。
経済
 通貨単位は円で、物価は現実の日本（2000年代前半）に近い。
 作中では電子マネーやオンライン決済が一般的であり、実体のある貨幣で支払う場面は少ない。
 電子マネーにはクレジットタイプの素子や定額トークンなどがある。
第4部現在では既存の国家体制が崩壞した為、暗黒メガコーポ各社が価値を保証する企業マネーが一般化している
 古事記（Record of Ancient Matters）
 本作における古事記は実在する文章とは大きく異なり、ニンジャとしての作法や、黙示録のように予言的な内容まで含まれており、重要な存在として扱われる。
 ニンジャ同士のアイサツも、古事記に書かれているためと説明されている他、登場人物や地の文が「○○と古事記にも書いてある」など引用することもある。
 ヤクザ
 作中に登場する非合法組織とその構成員。
 「組」に相当する「クラン」の形成、企業舎弟や個人商店への用心棒行為によるミカジメ・フィー の徴収、麻薬の製造・取引、売春への関与など、現実のヤクザと同じ活動を行っている。しかし、遺跡調査の身辺警護など傭兵に近い行為を請け負う者もいる。
 なお作中の表記は「ヤクザ」に統一されており「極道」や「暴力団」という語は登場していない。
 クローンヤクザの台頭による経営合理化が進んでおり、多くのクランは経営者のリアルヤクザ（人間のヤクザ）が必要な数のクローンヤクザを購入することで構成されている。しかしクローンヤクザの導入を拒みあくまで生身に拘る者も僅かに残っている。
 モータルからは恐れられる存在ではあるが、ニンジャから見ればただの人間に過ぎず、ただ蹂躙されるだけの存在である。一方でモータルの搾取、オヤブンを頂点にグレーターがレッサーを束ねるクラン構造、ヤクザのミーミーを伝えるなどニンジャに類似した要素を併せ持つ。
 レッサーから上に上がるには「ソンケイ」と呼ばれる精神的な要素の蓄積が不可欠であり、高いソンケイを有するオヤブンの中には人間でありながらニンジャを従える者すらいる。
 クランの名称は「デッドフェニックス・クラン」「ダークオニ・ヤクザクラン」など「英語・（ヤクザ）クラン」が多く、「○○組」「○○会」など現実的な名称は登場していない。
 着用するスーツは「ヤクザスーツ」、使用する強力な拳銃は「ヤクザガン」や「チャカガン」、乗っている車は「ヤクザベンツ」や「ヤクザカマロ」など、使用する物品には「ヤクザ○○」という名称が多い。
 オスモウ
 「スモトリ」と呼ばれる格闘家が、ドヒョウ・リングで行う格闘技。
 上から鎖で吊された武器を奪い合い、得た武器を相手に対して使うなど、現実の相撲とはかけ離れた殺人ショーである。
 様々な小団体が存在する、例え勝利を重ねても面白味の無い試合を続ければ公然と批判を受け、団体そのものの人気に影響が出るなど作中の扱いはプロレスに近い。
 スモトリ
 「スモトリ戦士」とも。巡業インディペンデントスモトリ団体所属の者も含めれば日本に10万以上は存在するとされる。
 合成食物チャンコ072によって異常なまでに体を肥大化させているものがほとんど。
 ごく一握りのスモトリだけが「リキシ・リーグ」と呼ばれる上級リーグに出場でき、それらリキシ・スモトリやそのトップであるヨコヅナは強さの純粋性ゆえに信仰対象に近い扱いを受ける。
 しかし、それ以外のスモトリは、人造生物であるバイオスモトリの登場で解雇されるなど生活は苦しい。
 劇中では元スモトリのラッパー「2COOLリリック」や元ヨコヅナの「ゴッドハンド」以外にも、スモトリ崩れのヤクザや肉体労働者などが多数登場している。
 ネコネコカワイイ
 高度な人工知能を搭載したオイランドロイドによるアイドルデュオ。
 容姿や声を流行にあわせて改造する事が可能なため、登場から間をおかずに爆発的な人気を獲得した。ライブの度に死傷者を出すほど暴れる親衛隊「NERDZ」が存在する。
 彼女たちの登場で人間のアイドルに対する需要が少なくなったため、多くの少女は夢を諦め、オイラン養成学校に行く事を余儀なくされたという。
 ZBR
 ヨロシサン製薬が製造する覚醒剤。劇中では快楽目的や鎮痛剤としてだけでなく、自決用らしき濃縮剤を携行する者もいる。
 アンプルからの静脈注射が多いが、錠剤やカプセル、タバコのように吸引するタイプの他、カクテルに混ぜることもある。腕を切断された痛みを消すほど強力だが、副作用や依存性も強く、緊急の痛み止めとして大量に投与し痙攣を起こす者、依存症に陥っている者が複数登場する。
 薬の効果が効いているときは「遥かに良い」と表現される。
 原語版やTwitterでの連載では「ズバリ・アドレナリン/Zubari Adrenaline」や「ズバリ」の表記だったが、中央薬品が類似した名称の鎮痛剤 を販売しており、実在商品のブランドイメージを考慮してか書籍販売以降は「ZBR」に変更されている。アニメでは「ズバリ・アドレナリン」と略さずに発音されている 。
 他にも「シンピテキ」や「シャカリキ・タブレット」などの薬物が存在し、作中ではどれも簡単に手に入る。
 スシ
 劇中でのスシは、魚粉末と調味料のペーストをネタとする大量生産された食品であり、登場人物がよく口にしている。
 基本的には「スシ・バー」と呼ばれる店舗で提供され、回転寿司に近い有人店の「回転スシ・バー」や、人と顔を合わせずに食事が出来る「無人スシ・バー」など、店側もニーズに合わせて細分化されている。
 現実の寿司に近いものは「オーガニック・スシ」と呼ばれ、高級食品とされており、ラオモト・カンなどの富裕層しか口にできない。
 非常にエネルギー効率のいい食料であるとされ、ニンジャの持つニンジャ回復力を最大限に高める効果を持つため、しばしばニンジャスレイヤーは連戦中やその合間にスシを確保し食べる事がある。
 ネタは卵やマグロの他、ナチョ・スシのような創作寿司もあり、ネオサイタマとキョートでも違いがある。
 他にもエピソードの投稿途中に長時間途切れる際には、「スシが切れたので更新停止」などと翻訳チームのアナウンスが入ることもある。
 オハギ
 そのまま食べるだけでなく、時代劇の「金の饅頭」のように賄賂としても使われる。
 あんこには中毒症状があるらしく、オハギ中毒者が登場するなど一種の麻薬として描写されているが、無毒のものも存在し、合法オハギを使用した寿司のメニューに「オハギ・スシ」も存在する。
 ショドー
 作中では、筆で文字を書くことのみならず、筆文字で書かれた掛け軸や看板なども総称して「ショドー」と呼ばれている。
 アドバンスド・ショーギ（Advanced Shogi）
 作中でたびたび登場する将棋風のボードゲーム。詳細は不明だが、18×18の盤を使い、ライオンなどの駒を使う。
 3D表示と音声操作に対応した盤も登場している。
 ミヤモト・マサシ（Masashi Miyamoto）
 平安時代の哲学者にして剣豪。劇中では「泥棒がばれたら家に火をつけろ」「非常に明るいボンボリの真ん前はかえって見にくい」などの我々の世界のことわざ に類似した格言が頻繁に引用される。
 二本の愛刀「ナンバン」「カロウシ」はラオモト・カンが所持している。
 言語・文字文化
 作中で交わされる言葉・文字は、現実の日本とずれた意味合いで使われるものが数多く登場する。以下はその例である。
 ドーモ
 ニンジャが使うアイサツとして前述されているが、モータルも使用する。
 オタッシャデー
 別れのアイサツだが、治りようがない病気の患者に余命を伝えるときに使う「オタッシャ重点」という言葉もある。基本的には、もう一度会う予定の相手に対する別れのアイサツであり、これに対し「サヨナラ」は、ニンジャの死に際など、二度と会うことのない相手へのアイサツとして用いられる。
 サヨナラ!
 ニンジャが致命傷を負い、ニンジャソウルが爆発四散する直前に言うアイサツ。
 ユウジョウ!
 サラリマンや学生同士が、お互いの労苦を称えるためにかけ合うアイサツ。ニンジャのアイサツ同様、非常に重要なものとされている。
 ヤクザスラング
 ヤクザが威嚇や攻撃する際に叫ぶ定型句。クローンヤクザやヤクザだったニンジャなども使う。代表的な句は「ザッケンナコラー！」や「スッゾコラー！」など。中には「チャルワレッケオラー！」のような元の意味が不明なスラングもある。
 インガオホー
 「因果応報」の意。失敗などによって登場人物が死んだ場合、地の文で感嘆詞のように使われたり、登場人物が失敗を振り返って自嘲気味に呟いたりする。
 ゴウランガ!（Gouranga!）
 登場人物が劇的な活躍を見せたり、絶体絶命の危機から立ち直った際などに地の文で使われる。
 本来は1966年にアメリカで誕生した宗教団体ハレ・クシュリナ教団の呪文で、これを唱えることで幸福が訪れるとされる。アメリカでは信徒らによって道路や商店のシャッターなどにステッカーが多数貼られた他、ヒッピー文化と共にイギリスなどにも伝播した。
 グランド・セフト・オートで信徒特有の服装をした人間を轢くと「GOURANGA!」というメッセージが登場するが、日本語版では「ナムアミダブツ！」と訳されている。
 ルーンカタカナ
 古代ニンジャ文明の時代から使われているルーン文字のような片仮名。武器などに刻むことで特別な効果を付加する。
 「6フィートボー」「ツーハンデッド・カタナブレードツルギ」「ツラナイテタオス」などに刻まれている。
 ミンチョ
 明朝体のこと。意味の強調や装飾文字として使われている。
 オスモウ・フォント
 詳細は不明だが、相撲体や勘亭流のような太い書体。
 看板の文字や刺青だけでなく、マッポが使うサーチライトの光がこの書体になっている。
 オブシダン（obsidian）
 漆黒の比喩に使われる他、無慈悲さや残酷さの例えにも使われる。
 囲んで警棒で叩く
 恐怖心を煽ったり、私刑、制裁の暗喩として使われる言葉。ヘルカイトの凧にも書かれている。
 「囲んで棒で叩く」など微妙な違いがある。
 ネギトロ
 食べ物としての名前はもとより、肉塊となるような無残な死に方も「ネギトロ」と称されている。作中では「車で轢いてネギトロにする」などのような表現で用いられている。
 ハッカー 
 この世界ではタイピング速度が早いものほど高度の技術を持つとされる。下から「スゴイ級」「テンサイ級」「ヤバイ級」の順でレベルわけされる。テンサイ級以上は並のニンジャでも到達できない。
豊満
 巨乳の意。反対に貧乳の場合は平坦と称される。
 前後
 セックス の意。作中では「セックス」の表記はほぼ置き換えられている。同義語に「上下」がある。

日本
本作での日本の歴史は現実の日本史とは様相を異にする。まず太古の暗黒の時代に、最初のニンジャであるカツ・ワンソーと、彼の支配に反旗を翻したハトリ・ニンジャらによるニンジャ大戦が起こり、その後ニンジャが支配する平安時代（Heian Era）が続く。平安時代の末期にモータルであるエド・トクガワをはじめとするウォーロードらがニンジャの支配に対して江戸戦争を起こし、ニンジャたちはやがてキンカク・テンプルでハラキリ・リチュアルをして世を去りニンジャ・ソウルと化し、江戸戦争が終わって江戸時代が始まる、となっている。

その後化石燃料の枯渇に先立ち、Y2Kに伴うIPアドレスの枯渇問題が発生。違法プロキシサーバー基地を巡り、暗黒メガコーポ群主導による論理物理両面での『電子戦争』が世界規模で勃発した。この結果、宇宙開発計画は中断。環境汚染は深刻で、衛星から地上が撮影できないほどの大気汚染により昼でも薄暗く、汚染された重金属混じりの酸性雨が降り注ぐ。EMP障害や磁気嵐による航空機への影響と、環境汚染から生まれた殺人マグロにより、物理的にも電子的にも日本は鎖国状態になっている。外国との往来は磁気対策が施されたガイオンの空港など一部に限られている。社会面ではカチグミ（勝ち組）とマケグミ（負け組）の経済格差が激しく、二極化が進んでいる。
 ネオサイタマ
 主に第1部と第3部の舞台となる。東京湾を埋め立てた人工島に建設された巨大都市で、作中では日本の首都。他の地域よりも酸性雨が強く、強盗や殺人も日常茶飯事であるなど、治安や住環境は非常に悪い。
 暗黒メガコーポとヤクザに牛耳られ、第1部ではソウカイ・シンジケートが裏から政財界を支配している。
 中国地方
 ネオサイタマの北にある無人の地域で、メガロ・ハイウェイによって結ばれている。
 かつては工業区として整備されたがプロジェクトが失敗したことで過疎化、50%は重金属酸性雨への耐性を持つ植物で形成された「タマチャン・ジャングル」に覆われている。都市部に比べると酸性雨は少ないという。
 ゲンドーソーの「ドラゴン・ドージョー」もここにある。
 セキバハラ
 キョートとネオサイタマの国境に位置する乾燥した荒野。落武者の霊が出るという噂がある古戦場で、武装強盗団も寄りつかない。
 キョート・リパブリック
 主に第2部の舞台となる。ネオサイタマとは荒野を隔てた土地にある、日本から独立した都市国家。キョート独立国とも呼ばれる。首都の「ガイオン」は、現実の京都のイメージに近い観光地としての地上都市（アッパー・ガイオン）と、虐げられる多数の労働者が生活する多層地下都市(アンダー・ガイオン)という二面性を持つ。ザイバツによって牛耳られている。
 岡山県
 キョート近辺にあるカッパドキアを思わせる高地。昔から政治犯や異端とされた宗教者が隠れ住んでいる。
 ドサンコ・ウェイストランド
 広大な雪原の土地。
 住人は五角形の隔壁で形成されたコロニー内部に居住している。
 長期間雪に閉ざされているため他地域との交流が少なく、「メガデモ」などの独自文化が発展している。
 オキナワ水没都市
 温暖なリゾート地とされる。 交通手段はキョートからの空路。
 日本国外
我々の世界以上に日本文化の影響が広まっており、各地で日本語のショドーやネオン看板が見受けられる。

メキシコはニンジャが泳いで渡れる距離にある。薬物の取引の際にロシアとの為替が言及されている。またロシア出身のニンジャが登場するエピソードもある。イギリスでは古式ボックス・カラテが流行したという。また大英博物館にはニンジャのミイラが展示されているらしい。

第4部からは日本の鎖国体制が解かれたため、アメリカ、中国、インド、ブラジルなど世界中が舞台となる。

 組織 
 ソウカイ・シンジケート
 または「ソウカイヤ」、第1部の敵組織。ネオサイタマに本拠地を置く、ラオモト・カンを首領とした暗黒経済組織。カンがCEOを務める「ネコソギ・ファンド」社を隠れ蓑にして日本経済を操作している。
 威力部門としてソウカイ・シックスゲイツや多数のニンジャを従えており、暗黒メガコーポ群や他のヤクザとの繋がりも厚いが、実質的にラオモト・カンのワンマン組織である。
 ニンジャであっても利用価値がないと判断すれば捨て駒にし、一部は「ヨクバリ計画」やINWで実験台として利用されている。
 組織は二本のカタナをクロスし「キリステ」と刻印されたエンブレム「クロスカタナ」を掲げ、メンバーはエンブレムの入ったバッジを身につけるか、ニンジャ装束のどこかにエンブレムを刻んでいる。
 ザイバツ・シャドーギルド
 第2部の敵組織。ソウカイヤと対立する西のニンジャ組織であり、キョートに本拠を置く。漢字表記は「罪罰影業組合」。ニンジャを絶対的な強者として、全ての人間を支配する格差社会の構築が最終目標であり、それ故に下級ニンジャと言えど非常に尊いものとして扱っている。そのため、イモータル・ニンジャ・ワークショップのようなニンジャを実験材料と見なす者を嫌う。
 指導者であるロード・オブ・ザイバツに忠誠を誓うニンジャ達で構成されており、その数や質はソウカイヤと比べても圧倒的である。組織内では明確に位階が分けられており、戦力や知力だけでなくワビチャの作法にも長けた幹部級の「グランドマスター」、ザイバツ・シテンノも所属する上級ニンジャの「マスター」、大勢のニンジャが所属する下級ニンジャの「アデプト」、新人ニンジャが所属し、マスターなどの下で学ぶ「アプレンティス」がある。一方で内部では様々に派閥争いが起こっており、組織としてのフットワークは非常に重い。ワンマンゆえの行動力を持つソウカイヤに対しては、ラオモト・カンが健在である限り迂闊に手出しできないと考え、相互不可侵協定を結んでいる。
 アマクダリ・セクト
 第3部の敵組織。元ソウカイヤ所属ニンジャを中心に、ネコソギ・ファンドを母体として結成されたニンジャ組織。漢字表記は「天下網」。首領はラオモト・カンの嫡子であるラオモト・チバだが、チバの参謀であるアガメムノンが事実上の指揮官として君臨している。最高幹部「12人」が日本各地の重要施設・企業の重役として潜入している。
 ワンマンであったソウカイヤの欠点を省みて、「アマクダリ・アクシス」と呼ばれる少数精鋭の幹部級ニンジャに、テリトリーごとに別れた複数の下部組織を運営させるという形をとっている。そのため、組織としての全容はチバにさえわからず、全てを把握しているのはアガメムノンただ一人である。
 こうした組織構造上、広い領域を支配下におき、第1部・2部においてニンジャスレイヤーのとった「下から順番にニンジャを抹殺して情報を辿り、最終的にトップにたどり着く」という戦術も通用しない。しかし、身内での派閥争いこそほぼ無い（旧ソウカイヤ組と新規参入組の確執が多少ある程度）ものの、全体的にはあまり統制がとれておらず、手柄争いによる抜け駆けなども起きている。
 サンズ・オブ・ケオス
 第4部シーズン1の敵組織。組織というよりはサツガイと接触した者たちのサークル。メンバー間でSNSによる情報共有を行ったり、旅行やバーベキューを行うなどライトな集まりで、サツガイ自身は含まれない。
 過冬
 第4部シーズン2の敵組織。読みは「カトー」。アラスカのシトカを拠点とするヤクザクラン。首領はロシアンヤクザのシンウインター。
 精鋭ニンジャ集団「ワイズマン」と呼ばれる上級戦士を抱えている。
 ネザーキョウ
 第4部シーズン3の敵組織。タイクーンことアケチ・ニンジャがカナダに築いた国。
 配下の中でも最強とされるニンジャ「アケチ・シテンノ」（4人ではない）、下位のニンジャ「センシ」、「コクダカ」と呼ばれる力をタイクーンから授かったモータル「ゲニントルーパー」たちにより構成される。
 イモータル・ニンジャ・ワークショップ（INW）
 ニンジャソウルを人為的に憑依させる「イモータルニンジャ計画」のために、リー・アラキが設立した研究機関。
 憑依させるための装置も「イモータル・ニンジャ・ワークショップ（INW）」と称される。
 ヨロシサン製薬や資金源だったソウカイ・シンジケートだけでなくアマクダリ・セクトなどとも関係があるが、ニンジャを実験台にするため、ザイバツからは嫌われている。
 サヴァイヴァー・ドージョー
 ヨロシサン製薬の研究員フォレスト・サワタリがニンジャソウルに憑依され、開発に携わったバイオニンジャたちと共に脱走し結成した組織。
 マキモノに記された文字は「生き残り達が道場」(アニメ版では「生き残りたちが道場」)
 ネオサイタマ周辺のジャングルに潜伏しつつ、バイオニンジャの生体維持に欠かせないバイオインゴット調達のため、ヨロシサンの工場などを襲撃している。
 リーダーであるフォレスト・サワタリの方針から「生きるための必要最低限の殺し」を心がけているが、活動上モータルに害をなす武装集団には違いなく(地の文で「狂人の理屈」と評している)、ニンジャスレイヤーからも警戒されている。
 フォレスト・サワタリを「大将」に戴き、よくまとまっているが、メンバーの殆どが賢くなく、サワタリが一時消息不明になったときは、他の忍者の口車に乗って新たなリーダーに戴き、村々を襲っては虐殺・強奪を繰り返すなどし、サワタリをして「ドージョーの理念を逸脱している」と嘆かせた。
 イッキ・ウチコワシ
 反企業闘争を繰り広げる赤色テログループ。鎌と槌のマークに赤色がシンボル。
 伝説的な英雄であるバスター・テツオに率いられた暴力集団であり、複数の組織と共闘したりデモの支援などを行いながら、資本階級に対する自由革命闘争を繰り広げている。
 構成員は新左翼用語によるアジテートや、タオルで口元をかくしヘルメットをかぶるなど、日本の学生運動に類似した要素が散見される。
 パチンコ球を武器とする「フリックショット（Flickshot）」などのニンジャも多数所属している。
 オムラ・インダストリ
 代表的な暗黒メガコーポのひとつ。巨大なハイテク関連企業であり社員はカチグミだという。社章は雷神を意匠化したもの。漫画版（無印）では社歌も公開された。
 オムラ一族による同族経営組織で、幹部や重役には自分のクローンを配置している。後述されるモーターシリーズのような戦闘兵器群の実戦テストを貧民街で行うなど、マケグミに対する非道な行いも数多い。
 社長であるモーティマーの掲げたリスクを省みず巨大で強力な兵器を開発する経営方針「モーター理念」は、社内外からの強い反発を招き、人材の流出によるライバル企業の台頭や業績悪化の原因となった。第2部終盤、オナタカミをはじめとする企業連合やアマクダリ、イッキ・ウチコワシなどの反逆により倒産する。しかし倒産してなおオムラ再興を画策する残党が暗躍しており、第3部において様々な事件を引き起こすこととなる。
 第4部では海外のオムラ関連企業が統合されたオムラ・エンパイアとなって復活しており、年収の高さを誇る社員たちの愛社精神は極めて強い。
 作中には製品である各種武器が多数登場し、オムラ専属ニンジャには自社技術で身体改造した者も多い。
 オナタカミ社
 オムラの提携企業だったが、赤字埋め合わせのため不採算物件を押しつけられるなどの不当な行為に憤慨し、イッキ・ウチコワシに協力を申し出る。
 またモーティマーの方針に不満を持ったエンジニアをヘッドハンティングし、ドラグーンなどの製品を開発した。
 オムラ・インダストリ倒産後、製品や社屋、人員や関連企業を接収し勢力を急激に拡大した。オムラ製品と比べ洗練度が増し無駄を省いた製品を主力とする。第3部ではオナタカミ製品で武装したニンジャも現れている。
 ヨロシサン製薬
 代表的な暗黒メガコーポのひとつ。創業は江戸37年の老舗製薬会社で、キャッチコピーは「ビョウキ、トシヨリ、ヨロシサン」。漢字表記は「養老師散」。
 表向きは普通の製薬会社だが、その実態は「バリキドリンク」などの麻薬成分を含む飲料の販売、クローンヤクザなどの生物兵器の製造などの非合法活動によって、日本政府やソウカイヤ、ザイバツといった各組織とも繋がりを持つ組織である。
 ネオサイタマ市警
 ネオサイタマの治安を維持する警察機構。通称はマッポであり、これが警察組織や警察官に対する呼称にもなっている。
 基本的に人間であるためニンジャには対抗できないが、戦闘・捜査に長けたデッカーやケンドー機動隊などの精鋭部隊と戦術次第ではサンシタのニンジャとも戦える。
 ニンジャが事件に関わる場合は無視を決め込むなど、基本的にニンジャに対して及び腰だったが、ニンジャ関連の事件が増え始めた第3部では49課がデッカーニンジャを中心とした対ニンジャ部隊として強化されるなど、キョート警察機構（ケビーシ・ガード）に比べるとニンジャへの対応力が強い。
 ニチョーム自治会
 ネオサイタマの歓楽街「ネオカブキチョ」でマイノリティが集まる「ニチョーム・ストリート」の自治会組織。
 ザクロの折衝によってソウカイヤなどと不可侵条約を結んでいる。
 ボンジャン・テンプル
 キョート郊外の山中にあるバトルテンプル。多くのボンズがカラテの修行を積んでいる。
 「ボンジャン・シンイチ」により建設されたという。
 ドウグ社
 ネオサイタマの「オオヌギ・ジャンク・クラスターヤード」にある、江戸時代から続く老舗の製作所。モットーは「人の手足な 」。第1部の時点ではサブロ老人が一人で経営している。
 「巻き上げ機構付きフックロープ」や「マキビシ」などの武器を制作しているが、本来は義肢の制作が源流だという。
 ガンドー探偵事務所
 ガンドーがキョートのアンダーガイオンで開いている探偵事務所。元はガンドーの師匠であるクルゼ・ケンの事務所だった。シンボルマークは龕灯とカラス。
 ドラゴン・ドージョー
 中国地方でゲンドーソーが開いていた道場。侵入者対策として多数のトラップが仕掛けられている。
 襲撃で十人の弟子全員が死亡したが、それ以前にサラマンダーやアンサラーなど複数の出身者が存在する。
 これとは別に岡山県の山奥には、ドラゴン・ニンジャクラン発祥の地であるエンシェント・ドラゴン・ドージョーがあり、後にユカノにより再建された。
 サークル・シマナガシ
 フィルギアが立ち上げた反アマクダリを掲げるニンジャによる暴走族。
 ネオサイタマの市街地の廃ビルなどに潜伏し、アマクダリに対して散発的な攻勢をかけている。
 スガモ重犯罪刑務所
 ネオサイタマを流れるタマ・リバーの中州にある巨大な監獄島。
 島全体が刑務所になっており、重犯罪者が収監されている。
 ネオサイタマ湾岸警備隊
 ネオサイタマ国防軍やマッポとは独立した軍事組織。主にネオサイタマ周辺海域と湾岸部で活動しており、湾岸警備隊と称しているが海軍並みの艦隊を有するほか、多数のニンジャが所属している。
 元司令官でアマクダリ・アクシスのハーヴェスターの意向により国防軍から航空戦艦の提供を受けるほか、インターセプター、ダイアウルフ、ファイアブランドなどの元所属ニンジャがハーヴェスターに従っているなど、アマクダリ軍としての側面が強い。

 武器・兵器 
 巻き上げ機構付きフックロープ
 フジキドがドウグ社から購入した鉤つきロープ。金具には焼き色のグラデーションがある。ニンジャでも破壊できない強度があるため、侵入だけでなく戦闘にも利用している。
 マキビシ
 撒菱。作中では非人道兵器とされ、江戸時代には禁止されていたという。スリケンとは違いニンジャでも無から生成できないため取り寄せる必要がある。
 テッコ
 戦闘用の義手。
 シガキが与えられた旧式から、ブラックヘイズが「年収の半分」と発言した高機能型など、複数のモデルが存在する。
 モーターシリーズ
 声 - 田中秀幸
 オムラ・インダストリ製の戦闘用のロボット・ニンジャ。ニンジャと称しているがニンジャソウルは憑依していない。
 マッポの人員削減や軍事需要を見込んだラオモトの命令によって開発されたが、AIが弱く、敵味方の識別が不正確、投降してきた相手に発砲する、指定した場所に着地しないなど多数の問題を抱えている。
 モーターヤブ、モーターヤブ改善、モーターヤブ再び改善、モータードクロ、モーターカニ、モーターナガサマ、など、多数のバリエーションが登場する。
 モーターチビ
 モーターの名を冠しているが、主に通信の中継や映像記録に使われ、攻撃能力はない。
 握り拳ほどの大きさの正十二面体でAIによる自律制御で飛行する。ダークニンジャも「命を預けるには繊細で脆弱すぎる」としながら高性能さは評価していたが、モーティマーの判断により量産には至らなかった。
 処理中には「ヌンヌンヌンヌン」という声を出す。
 なお、ジャッジメントが持っていた赤色の試作機はガンスリンガーとの戦闘で破壊されるが、その後タカギ・ガンドーが回収。修理され「モーターチイサイ」と改称し、ガンドーのサポート役として活躍した。第3部ではナンシー・リーの手に渡っている。
 モーターツヨシ
 モーティマーが起死回生の切り札として投入した超大型パワードスーツ。装着者とは脊髄で直結されている。
 ジェットパックによる機動力、電磁バリアよる防御力、「アンタイ・ニンジャ・アサルトキャノン」をはじめとした強力な火器により、ドラゴンベインやフジキドを同時に圧倒する戦闘力をもつ。またロケットによる飛行システム「モーター・アブナイ・アットー・アグリゲイトシステム（MAAA）」によって、長距離の侵攻も可能。
 強力な兵器ではあるが、並のニンジャでは耐えられない重量のため、装備できるのはネブカドネザルのみである。またジツではなく兵器であるため燃料や弾薬の補給を必要とする。
 ドラグーン
 オナタカミ社が開発したロボットニンジャ。走行時はオートバイだが、戦闘時には人型に変形する。
 制御にはクローンヤクザの脳を利用しているため、モーターシリーズで問題だった敵味方識別精度を向上させた他、各機の情報を共有することで高度な連係攻撃を可能としている。その一方、クローンヤクザの生体脳を搭載したため高コストなロボニンジャであるらしい。

 テクノロジー 
 クローンヤクザ
 声 - 玄田哲章（旧型クローンヤクザ：後藤淳一）
 ヨロシサン製薬によって開発されたヤクザのような風貌のクローン人間。作中では戦闘員や警備員として各組織に利用されている。
 かつて単独で内閣総理大臣を暗殺したというレジェンド・ヤクザ、ドゴジマ・ゼイモンの遺伝子を利用して作られた(ドゴジマ本人の生死は不明である)。
 クローンであるため外見は没個性的で、出荷前に洗脳処理が施されているため命令に忠実に従うが、自我は存在しており、勤務時間の合間には将棋をしたり、愚痴を零したり、内容不明な日常会話を交わしたりもする。
 幾度かバージョンアップが行われており、クローン・マッポとしてネオサイタマ市警に導入する計画も存在した。スポーツ選手や研究員など顧客の用途に応じてカスタムされた個体も存在している。
 主にドス・ダガーやチャカ・ガンを始めとした銃火器類で装備しており、一般人にとっては統制力や死を恐れない行動力が脅威となるが、ニンジャにとっては一撃で倒せる雑魚でしかない。またバイオ・テクノロジーにより運用可能期間（寿命）は三年ほどに設定されており、それを過ぎると免疫能力が低下してしまう。
 時系列が掴みにくい本作であるが、言及される型番（Y-10、Y-11など）からエピソードの大まかな順番が推測できる。
 バイオ・スモトリ
 ヨロシサン製薬のクローン技術で量産された、スモトリ型の生物兵器。知性が低く、巨体を活かしての突進などが主な攻撃手段。
 マザーと呼ばれる母体から量産されることが示唆されているが、オムラ社と共同設置されたプラントが爆発事故を起こした後は、野生化した個体が郊外や廃墟を占拠・徘徊しており、ハンティングがカチグミによるレクリエーションの一つとして確立されている。
 オイランドロイド
 オイラン（作中における娼婦の総称）を模したガイノイド。バーコードが首の後ろにあったり、一部の部品が見えていることもあるが、非常に可愛らしい姿。
 受付嬢やメイドだけではなくセクサロイドとして使う風俗文化も定着しており、自宅に複数体を侍らせる者もいる。
 値段によって性能は様々であるが、上位機種はほぼ人間と変わらない動作や反応を行うため、贈物品とされることもある。一部医療保険が適用される物もある。
 ウキヨ
 第4部から登場した、人間並みの自我を得たオイランドロイド。自我が芽生える前の、乱暴に性的玩具として扱われた際の記憶があるため、集団で一斉に持ち主に反乱・殺戮した、俗に「オイランドロイド戦争」と呼ばれる事件が起きた。
 LAN
 劇中ではネットワーク系のハードウェア全般や、BMI技術を指す言葉として使われる。
 LAN端子や無線LAN機器を体内にインプラントし、ネットに接続したり機器制御が行える「LAN直結者」も多く登場するが、多くは違法な手術であるという。
 UNIXデッキ
 この世界でのコンピュータの総称。作中ではUNIXが普及しており、機器制御やフジキドが自宅に設置したサーバにもUNIXが使われている。パンチシートへの印刷も多く使われている。
 起動音は「パワリオワー」。
 サイバーサングラス
 UNIX端末が内蔵されたサングラス型のウェアラブルコンピュータ。
 IRCへの接続と拡張現実の他、前面に文字を表示する機能もありコミュニケーションにも利用される。
 多くの人物利用しているが、料金プランによっては建物の壁などに広告が表示される。
 IRCネットワーク
 インターネットのような全世界規模の情報通信ネットワーク。
 本作におけるクラッキングは特定のコマンドを打ち合う形で表現されており、もっぱらタイピング速度が重視される。そのため超人的ニンジャ身体能力を持つニンジャのタイピング速度は圧倒的で、モータルが対抗する事は難しく、ネットワーク越しに殺害される事もある。
 コトダマ空間
 優秀なハッカーが知覚できる一種のサイバースペース。最初にログインした者のイメージが可視化される。
 イメージにかかわらず、頭上には黄金の立方体が常に浮遊している。
 アイアンオトメ
 ヘルヒキャク社製の大型バイク。排気量は1200cc。漢字表記は「大人女」。
 当初はウォーロック が所有していたが、以降たびたび持ち主を変えている。
 排気量を1330ccにするなど、シリーズを通して多数の改造を施している。非常に高度な人工知能を搭載しており、ある程度の自律行動も可能。

 登場人物 
担当声優はドラマCD版およびテレビアニメ版での配役。

 ニンジャスレイヤーと協力者 
 ニンジャスレイヤー（NINJA Slayer） / フジキド・ケンジ（藤木戸 健二 / Fujikido Kenji）
 声 - 森川智之 / 中山祥徳（ゲーム『ネオサイタマ炎上』）
 第1部から第3部までの本編の主人公 。平凡な中流サラリマンだったが、クリスマスの夜にニンジャの抗争に巻き込まれて妻子を殺害され、自身も重傷を負ってしまう。しかし、正体不明のニンジャソウル「ナラク・ニンジャ」に憑依されたことでニンジャとして蘇った。自身の復讐心と行動への疑問、家族を失った悲しみなどの複雑な感情に苦しみながら戦い続けている。
 「NINJA Slayer（ニンジャを殺す者）」の名の通り、妻子を殺害したダークニンジャや事件の発端となった組織への復讐だけでなく、関わったニンジャ全ての抹殺を目標とし、情報を引き出すためには殺害を宣告した上での拷問すら躊躇しないが、復讐とは無関係であれば基本的に手を出さない。
 決め台詞は「ニンジャ、殺すべし！」、敵の目の前に突然現れる際には「Wasshoi！」とシャウトする。ユニーク・ジツはないが、強力なカラテとジュー・ジツ、ゲンドーソー直伝のチャドーにより大半のニンジャを圧倒する強さを見せる。加えてナラクの記憶している敵ニンジャの操るユニーク・ジツやカラテ、クランから推察される戦法に関する情報、意表をつく登場や皮肉を交えた挑発などの情報戦・心理戦も多用する。一方、ソウカイニンジャの分析によれば射撃戦は不得手とされるが、「ツヨイ・スリケン」などのスリケンを使った技も使用する。
「スゥーッ！ハァーッ！」とチャドーの呼吸を行うことで、精神統一と急速な肉体の回復を行うことができる。
 赤黒いニンジャ装束と「忍殺」と刻まれたメンポ、ドウグ社製のブレーサーを装備する。特に装束とメンポは彼を表現する重要な要素となっており、度々「赤黒のニンジャ」と称される。
 普段は「イチロー・モリタ」という偽名を使い、ハンチング帽にトレンチコートという姿で行動している。
 第4部ではリアルニンジャ「サツバツナイト」として活動している。ニンジャスレイヤーの力を失ったためかつてほどの戦闘力はないものの、並のリアルニンジャならタイマンで撃破できるほどのカラテを有している。
 『このライトノベルがすごい！』男性キャラクター部門では2017年版で6位を獲得している
 ナラク・ニンジャ（Naraku Ninja）
 声 - 麦人
 フジキドに憑依したニンジャソウル。全てのニンジャを憎悪していること以外に詳細は不明。カツ・ワンソーに対する憎しみの記憶を持ち、古事記にさえその存在が書かれていないなど、正体は謎に包まれている。
 他のソウルとは違い憑依してなお自我を保っており、老人のような口調で一人称は「ワシ」。
 アーチ・ニンジャでさえ「こわっぱ」と称するほどの圧倒的なカラテを持ち、ニンジャに対する知識も幅広い。苦戦するフジキドに対して情報と引き替えに表に出すように持ちかけるなど狡猾さもある。戦闘の際は度々力を貸すが、「全てのニンジャはいずれ闇に飲まれる」「殺し損ねれば禍根を残す」として敵対していないニンジャはおろかモータルの巻き添えも躊躇しないため、フジキドからは警戒されている。
 ナラクの力が表に出る「ナラク化」がおこると、フジキドの目にセンコのような赤く細い光が灯り、フジキドを超える強力なカラテ、黒い炎を操るジツと血を黒い金属に変化させる再生能力を得る。ただしナラクに肉体を操られる危険性も高いため、その制御は極めて困難である。事実ニンジャスレイヤー誕生当初からゲンドーソーのインストラクションを受けるまでは、たびたびナラクに身体を乗っ取られていた。このナラク共振能力こそがニンジャスレイヤーのユニーク・ジツとする見方もあり、アマクダリではカラテ窮地に対するニンジャスレイヤーの異常な反応を「ニンジャスレイヤー・アブノーマル・リアクション・アゲンスト・カラテ・アージェンシー」（Ninjaslayer Abnormal Reaction Against Karate Urgency）と称している。
 第3部終盤にフジキドと分離し、第4部では新たにマスラダに憑依。彼を新たな『ニンジャスレイヤー』へと変える。
 ドラゴン・ゲンドーソー（Dragon Gendosoh）
 声 - 秋元羊介
 鍛錬によってニンジャになった「日本最後のリアル・ニンジャ」。フジキドの師匠（名鑑では3日間だけ）。ニンジャネームは「ローシ・ニンジャ」。
 平安時代から続くドラゴン・ニンジャ・クランのマスターであり、暗殺拳・チャドーの継承者。またカラテやジュー・ジツも達人級である。フジキドからは「センセイ」と呼ばれる。
 ニンジャソウル憑依直後のニンジャスレイヤーの暴走を止め、後に彼を弟子と認めて教えを授けるが、ソウカイ・シンジケートの刺客との戦いで、アンタイ・ニンジャウィルス「タケウチ」を受けて衰弱してしまう。その後は療養生活を送っており、フジキドの手に入れた薬でいくらか持ち直すも、ダークニンジャによって殺害されてしまう。しかし彼の教え「インストラクション」はフジキドの心に刻まれ、幾度も命を救っていくことになる。
 ドラゴン・ユカノ（Dragon Yukano）
 声 - 種田梨沙
 ゲンドーソーの孫娘。
 フジキドを慕っており、ゲンドーソーが療養生活に入ってからはフジキドにも教えを請うている。「その胸は豊満であった」と頻繁に描写されるグラマラスな体型が特徴。シャウトは「キエーッ！」。
 一時期はフジキドと行動を共にするも、ドラゴン・ドージョーが襲撃されて以降は行方不明となる。その後、記憶喪失のニンジャ「アムニジア」としてイッキ・ウチコワシに属していたことが明らかになる。
 その出自に秘められた謎は、第2部後半にて明かされる。本作のキーパーソンの一人とも言える人物である。
 ナンシー・リー（Nancy Lee）
 声 - 斎藤千和
 フジキドに協力する自称フリーランスのジャーナリスト。
 鎖国体制下の日本には珍しいコーカソイド系の美女で、ユカノらと同様に登場する度に豊満な胸が強調される。モータルでありながら、ニンジャと渡り合うほどのハッキング能力をもつなど出自には謎が多い。
 ニンジャの真実を知らずに企業の陰謀に接近しすぎ、ニンジャに襲われた所をフジキドに救われ、協力体制を結ぶ。
 デッドムーン（Dead Moon） / ミフネ・ヒトリ
 声 - 武内駿輔
 死体を専門とする凄腕の運び屋で、伝説のクラシック・スポーツカー「ネズミハヤイDIII」を改造した装甲霊柩車を操る。
 逆モヒカン状の髪型に、通り名の由来である花札の「デッドムーン・オン・ザ・レッドスカイ」の刺青などパンク的な容貌であるが、依頼に対しては誠実で、モットーは「家族が大事」。愛車を「レディ」と呼んで偏愛している。
 当初は敵としてフジキドを襲撃するが、以降はフジキドらから依頼を請け、幾度と無くその窮地を救うことになる。ザイバツからもフジキドの協力者と目されている。
 シルバーキー（Silver Key） / カタオキ（Kataoki）
 フジキドに協力する青年のニンジャ。気弱な性格だが、窮地においては大胆な行動に出る。決め台詞は「俺だ！」。
 ニンジャソウル憑依によって精神に介入する「ユメミル・ジツ」を体得し、それを活かしてキョートで鍼灸師を営んでいたが、ジツに目をつけたザイバツに拉致され、どこにいても位置を把握できるように発信機を体に埋め込まれてしまった。
 カラテの技量が絶望的なこともあって、当初は自らの安全を求めての協力体制であったが、やがてフジキドとは友情関係で結ばれていく。
 エーリアス・ディクタス（Alias Dictus）
 第3部から登場する、ネオサイタマに暮らす少女ニンジャ。
 他者の肉体を憑依操作する「ユメミル・ジツ」の使い手。ニンジャとは思えぬ気弱な性格をしている。黒いショートボブに痩せて小柄。永久脱毛した眉には茨のようなタトゥー。「地獄お（Hell-Oの意）」と書かれたマフラーを巻いている。なお、エーリアスの身体は女性だが人格は男性（本人にとっては不本意な状態であるらしい）。その正体はイグナイトの身体を借りたシルバーキー。
第4部では2人が分離したためエーリアスとしては登場しない、と思われたが……？
 ブレイズ（Blaze）
 エーリアスと肉体を共有しているもう一つの人格。「インプルーブド・カトン・ジツ」を使う。
 実は二重人格ではなく、エーリアスの身体の元になったイグナイトの人格がその正体。時折エーリアスの人格と入れ替わって表に出る。両者の人格はエーリアスが表に出ている時はそのまま意思疎通ができるが、ブレイズが表に出ている時はお互いが交互に喋らなければならない。性格は粗暴だが面倒見が良く、普段は用心棒をしている。
 サブロ老人
 ニンジャが使う道具の数々を製作する「有限会社ドウグ」の代表。
 江戸時代から伝わる生産方式を変えることなく現代に伝え、商品の一つ一つを手作りし、顧客の情報が漏れるのを防ぐために帳簿を残さず全て頭の中に記憶するなど、職人気質の極めて強い老人。それ故、極端なオートメーション化を進めて労働者をないがしろにするオムラ・インダストリを蛇蝎の如く憎む。
 マノキノという一人息子がいるが、意見の相違の末に家を出てオムラ・インダストリに入社してしまい、それ以降は実質的に絶縁状態にある。
 シバカリ
 第2部でザゼン中毒で動けないナンシー・リーが自分とニンジャスレイヤー達を支援するため雇った傭兵ハッカー。
 腕前は凄腕レベルで的確な情報収集能力や状況判断力の持ち主で、ナビゲーション能力も優秀。強敵ニンジャとニアミスすることも多いが、的確な状況判断を武器に生き残っている。
 ユンコ・スズキ
 第3部から登場する女子大生。ネオサイタマの高級住宅街でオムラ・メディテックのエンジニアの父親と暮らしていた。
 父親がニンジャに殺害されたことで状況は一変し、彼女も知らなかった自身の秘密を巡る事件に巻き込まれる。ニンジャスレイヤーやナンシーの協力で事件が解決してからはナンシーの元でハッカー修行をしながら、ナンシーやニンジャスレイヤーをサポートする協力者の一人となっている。

 ニンジャスレイヤーと協力者（第4部） 
 マスラダ・カイ（Masurada Kai）
第4部の主人公。元はオリガミアーティスト志望の青年だったが、サツガイの攻撃を受け重症を負いナラクが憑依、ネオサイタマでは二人目のニンジャスレイヤーとなる。アユミの死の原因であるサツガイの居場所を探るため、関連があると思しきニンジャ達を襲い、「サツガイを知っているか」と問いかけ情報を集めては、殺し続けている。
他人の言動に対しことあるごとに「知らん」「どうでもいい」と切り捨てる近寄りがたさがあるが、人助けを厭わないところもある。孤児のため施設で育ったことから、学校やサラリマンの知識を持ち合わせていない。
戦闘スタイルはフジキドと異なり、獣のような前傾姿勢の構えから、爪を駆使した引っ掻きやアイアンクローなどで荒々しく戦うものになっている。また、フジキドはドウグ社製のフックロープを使用していたが、マスラダはナラクの黒炎からフックロープを自前で生成する事ができる。
チャドーの呼吸法はフジキドと異なる「スゥーッ！フゥーッ！」であり、歪な我流のもの。
戦闘の中で敵の戦い方を把握し、理解することで攻略法を編みだす。決め台詞は「理解したぞ」「だいたいわかった」など。
 アユミ
マスラダとともに育てられた幼馴染の女性。突然現れたサツガイとの遭遇の中、死亡する。マスラダと恋愛関係にあったかは不明。
コトブキ（Kotobuki）
自我を持ったオイランドロイドである「ウキヨ」の少女。淡いオレンジ色の髪が特徴。DIYが趣味。誰に対しても敬語で話す。
自我がないころは、所有者により雑居ビルの出口のない一室に閉じ込められ、壁一面の古い映画のビデオを見せ続けられる教育を施されていたが、すべて見終わったことと、ニンジャ同士の戦いにより壁を破壊されたことを機に脱出。ニンジャスレイヤーに助けられて以降は行動を共にする。
正義感が強く、「困っている人を助けないのは腰抜け」をモットーにしており無関係な一般市民にも優しいが、映画の知識で育ったためか言動が奇妙である。
アオザイを正装と認識しているほか、スーツケースを持ち歩き、国やシチュエーションに合わせて民族衣装やタキシードなどに逐一着替える習性がある。
カンフー映画の影響と後の修練、オイランドロイドとしての身体能力の高さから、ニンジャには及ばないものの高い格闘能力をもつ。
本来セクサロイドとして作られたが、性交を求められた際は「自我があるのでダメ」と拒絶する。
 タキ（Taki）
ピザ屋「ピザタキ」を営む、日本人とアメリカ人のハーフ。本名ではなく偽名。黒髪混じりの金髪。情報屋が本業だが、ハッカーとしての能力は二流。しかし物語の進行と共に能力を高めつつあり、最高時にはテンサイ級の腕前を発揮、合成麻薬ブラックベルトを用いUNIX無しでのIRCダイブを可能とする。
マスラダに命を救われたのをきっかけに、脅される形でサツガイ探しに協力することとなる。
性格は軽薄で無責任だが、ニュースでマスラダ達の危機を知り動揺するなど仲間思いな面もある。
ニンジャとの戦闘はできないため、自らは「ピザタキ」地下アジトからUNIXでのナビゲーションとハッキングにより、IRCを通じてマスラダ達を支援する。

 ガンドー探偵事務所 
 ディテクティヴ（Detective） / タカギ・ガンドー（Takagi Gando）
 声 - 小山力也
 身長190cmを越える壮年の私立探偵。ナンシーに紹介されたことで、第2部を通してフジキドの相棒となる。
 カートゥーンとオスモウを好む明るく快活な性格。「かつてはアニメに出てくるニンジャに憧れたこともあったが、現実的ではないので、探偵に憧れるようになった」と語る。
 49口径マグナムの二丁拳銃とその反動を利用する「暗黒武道ピストル・カラテ」の達人。モータルでありながら下級ニンジャとある程度は戦える程の腕前だが、ZBRの中毒によりすでに白髪で腕も錆びつきつつある。LAN直結者であるが、そのハッキングの技量はナンシー程ではない様子。
 ある事件にて瀕死の重傷を負うも、カラス・ニンジャに憑依されニンジャ「ディテクティヴ」として甦った。影からカラスを生成して操ったり、弾丸として銃に装填できるユニーク・ジツを使う。しかし当人のニンジャに関する知識が少ない（それでも一般人と比較すれば破格である）ため、ジツではなくニンポと言ったり、能力を直感的に使っていることが多い。
第4部ではヤタガラスの姿で登場する。
 シキベ・タカコ（Shikibe Takako）
 ガンドーの助手だった女性。本編時点では故人。
 かつてクルゼと助手のガンドーに殺人鬼から救助され、失職した際にその縁で探偵事務所に雇用された。
 ネオサイタマで人気のアニメ「サムライ探偵サイゴ」の原作者。
 ある事件の捜査中に何者かに射殺され、現在はその人格だけが移植されたチップのみが残っている。ガンドーはその犯人を見つけること、そして復讐することを誓っている。
第4部ではチップによる人格の蘇生が成功、オイランドロイドボディに体を移している。
 クルゼ・ケン（Kurse Ken）
 伝説の私立探偵。ガンドーにとっては探偵業とピストルカラテの師匠。
 劇中では既に故人であり、回想にのみ登場する。ガンドーによれば「シリアスになり過ぎて死んだ」とのこと。
 ガンドーより背は低く痩せており、ストライプが入ったレトロなスーツと目元が隠れる帽子を身につけている。

 ソウカイ・シンジケート 
 ラオモト・カン（Laomoto Khan）
 声 - 津嘉山正種
 ネオサイタマに君臨する悪の帝王。「ソウカイ・シンジケート」のボス。「リアル・ニンジャ」を称することもあるが、真相は定かではない。
「ヨクバリ計画」による人体改造の結果 「ブケ・ニンジャ」をはじめとした七つのニンジャソウルを宿し ニンジャネームとして「デモリション・ニンジャ」と表現される。黄金のメンポにアルマーニのスーツという派手な出で立ちで、「ムッハハハハハハ！」という笑い声が特徴。金髪の白人オイランを侍らせていることが多い。
 ミヤモト・マサシの信奉者で、その愛刀「ナンバン」「カロウシ」を振るう。その強さは圧倒的で、シンジケート自体「自分で動くまでもない些事に対応するために」作っただけに過ぎないという。
 弱者が苦しむ姿を見ることを何よりも好む残忍な性格だが、絶大なカリスマ性を持ち多くの信奉者がいる。「ネコソギ・ファンド」の社長としてネオサイタマ知事選挙に出馬し、表裏両方からネオサイタマの支配を画策する。
 自らの欲望のままに無辜の人々を犠牲にしており、フジキドの妻子はそのための抗争に巻き込まれて死亡した。
 ダークニンジャ（Dark Ninja） / フジオ・カタクラ（Fujio Katakura）
 声 - 速水奨
 フジキドの妻子を殺し、ニンジャスレイヤー誕生のきっかけを作った男。本作におけるライバルキャラクター。
 憑依したソウルは「ハガネ・ニンジャ」。己のカラテのみを頼りとする戦闘機械のような人物で、心の奥底には貪欲な戦闘者の意思と残虐性を秘めている。カラテだけでなく妖刀「ベッピン」の使い手で、必殺の「デス・キリ」により多くの敵を葬り去ってきた。クナイ・ダートを使う。
 彼の先祖は名も無きモータルであったが、村に落ち延びてきたハガネ・ニンジャを殺害したため、子孫末代に至るまで解けることがないエンシェント・カンジの呪いをかけられた。以降、カタクラ家の当主は背中に消えない漢字が刻まれ、若くして命を落としたり、精神を病んだ者が続発したりという不運が代々続いた。フジオ自身も一族に伝わる呪いに加え、事業に失敗した両親から捨てられるなど、恵まれない幼少時代を過ごした。そんな自らの運命に抗うため、世界各地をトレジャーハンターとして放浪し、エジプトの遺跡にてついにベッピンを手に入れた。それと同時にカンジの呪いが解け、ハガネ・ニンジャのソウルが憑依したことでダークニンジャとなり、第1部ではラオモトの懐刀、第2部ではザイバツの懲罰騎士として、ニンジャスレイヤーの前に幾度と無く立ちはだかる。

 ソウカイ・シックスゲイツ（6 Gates） 
伝説のニンジャ六騎士にちなむソウカイヤの威力部門。文脈によってはその中の最高幹部、シックスゲイツの六人を指している。

ニンジャスレイヤーによって次々に殺害されており、アンダーカードと呼ばれる下級幹部から補充されるために六人は入れ替わりが激しい。ここでは複数のエピソードに登場するメンバーのみ紹介する。

下記以外の代表的なメンバーは、常人の三倍の脚力を誇るバンディット（声 - 広瀬淳）」、フドウカナシバリ・ジツの使い手ビホルダー（声 - てらそままさき）、氷のスリケンを操るフロストバイト、ショーゴーとヤモトを勧誘するために現れたソニックブーム（声 - 黒田崇矢）など。

入れ替わりが激しいために力量は時期によってまちまちだが、初期メンバーの六人はザイバツ・グランドマスター級と比較しても遜色のない実力者揃いであったとされる。

 アースクエイク（Earthquake）
 声 - 白熊寛嗣
 2.5mの巨体を誇るビッグ・ニンジャクランのニンジャ。ヒュージシュリケンとコンビを組んでドラゴン・ドージョーを襲撃した。
 巨体から繰り出す強力なカラテとナラク化したニンジャスレイヤーの猛攻に耐える耐久力が武器。一方で頭脳も明晰であり時には冷徹な判断をも下す。
 ヒュージシュリケン（Huge Shuriken）
 声 - 代永翼
 背中に背負った巨大な強化セラミック製スリケンを操るニンジャ。
 一対多数の戦闘を得意とし、アースクエイクとコンビを組んで接近戦の不利を補っている。
 なぜか「スリケン（suriken）」ではなくhが入った「シュリケン（shuriken）」の表記。ニンジャ名鑑では「ヒュージスリケンとも」と記述されているが、書籍版の名鑑では翻訳チームが原作者に問い合わせたものの、回答はなかったとされている。
 グラマラス・キラーズの単行本第1巻には、アースクエイクとの出会いを描いた漫画オリジナル作品が収録されている。
 ヘルカイト（Hell Kite）
 声 - 高木渉
 「ハリキリ」「殺伐」といった威圧的なショドーで飾られた折りたたみ式巨大凧で自在に宙を舞う、斥候および後方支援に長けたニンジャ。バイオバンブーの槍で上空から急襲する戦法で直接戦闘もこなす。
 専用のトレーニングルームを持つなど、若くしてシックスゲイツの座に登り詰めたが、そのスピード出世には多くの同僚から疑惑と嫉妬の目を向けられている。
 物語開始時点ではシックスゲイツの中では新参者であったが、ニンジャスレイヤーとの直接戦闘を回避し続けたため長期に渡り在籍し続け、第1部終盤には最古参のメンバーとなっていた。
 ダイダロス（Daedalos）
 声 - 宮下栄治
 ソウカイヤのネットセキュリティを担当するハッカーニンジャ。
 カラテには優れないが驚異的タイピング能力により電脳戦は敵無し。数々のLAN直結者のニューロンを破壊し廃人に追いやってきた。
 自身に匹敵するハッキング能力を持つナンシーを「電子のヨメ」と呼びしつこく追い掛け回す。
 ウォーロック（Warlock）
 声 - 緑川光
 遠方に居ながらにして他人の精神を乗っ取り、肉体を遠隔操作できるフドウノリウツリ・ジツの使い手。
 新参者ながらその特異な能力を活かして組織の重鎮にのし上がったが、胸の内にはさらなる野心をひた隠しにしている。
 ゲイトキーパー（Gatekeeper）
 声 - 糸博
 シックスゲイツ創始者であり、ラオモトの懐刀。エンハンスメント・ジツで強化された、攻防一体のトンファー・ジツを操る。
 現在は名誉構成員として第一線を退き管理維持にあたっているものの、未だその実力は衰えず、他のニンジャとは別格のワザマエを誇る。また戦闘の中にあっても敵の力量を素直に認めて讃えるなど、人格面も優れている。
 ラオモトを「清濁併せ呑む大樹のごとき器」と称し心酔。彼ならば無軌道なニンジャ達を従え、混迷のネオサイタマに秩序を齎すものと忠誠を誓っている。そのためなら多少の犠牲をも厭わない。

 ザイバツ・シャドー・ギルド 
 ロード・オブ・ザイバツ（Lord of Zaibatsu）
 「ザイバツ・シャドー・ギルド」の首領で、顔をベールで覆った車椅子の老人として描写される。
 しかし自分の存在を巧妙に隠匿しており、その正体を知るのはパラゴンのみ。すべてが謎に包まれた存在である。
 何らかの陰謀のため、三種の神器とユカノを求めている。
 第2部クライマックスにてその正体が明かされるが、正体について読者が公表することは作者サイドから禁止されている 。

 グランドマスター 
 パラゴン（Paragon）
 グランドマスターの筆頭。事実上のザイバツNo2。
 様々な知識に通じた完璧主義者。政治力にも長けた曲者であり、他のグランドマスターからは警戒されている。
 しかしロードへの忠誠心は本物で、唯一その素顔と正体を知っている人物でもある。
 ダークドメイン（Dark Domain）
 次元操作能力を持つ唯一のニンジャソウル「マイニュ・ニンジャ」憑依者。
 己の腕のみを信頼する武闘派であり、自身の気晴らしのためだけに眉一つ動かさず民間人を殺傷するなど非常に残忍な性格。
 アンタイ・ウェポンと呼ばれる武器を呼び寄せるユニーク・ジツ「ムシアナ・ジツ」の使い手。ニンジャスレイヤーとメイアルーアジコンパッソの応酬を繰り広げる等、カラテの力量も高い。
 サラマンダー（Salamander）
 ドラゴン・ドージョー出身。
 何の特殊能力も持たないゲニン憑依者でありながら、その類いまれなる学習能力とカラテの強さで伸し上がった。
 死の格闘大会「シャドー・コン」の主催者として兄弟弟子のニンジャスレイヤーを待ち受ける。
 ケイビイン（Keibiin）
 憑依したニンジャソウルは「オダ・ニンジャ」。
 「警備員」の名の通り、キョート城本丸の警備および庭園の管理を担っており、敵の侵入を許したならば相手を倒した後に自らもセプクして償う覚悟を持つなど、強い責任感の持ち主。
 その実力も極めて高く、念力で刀や盾を操る「アスラ・カラテ」の力量は「アイサツの時点でカラテの格が伝わる」と表現された。
 スローハンド（Slow Hand）
 憑依したニンジャソウルは「イダテン・ニンジャ」。
 自らの肉体を一気に加速させる「ヘイスト・ジツ 」の使い手だが、加速にともなって老化も進行するという弱点があり、多用はできない。
 老化を治療し、またロードの支配を盤石にするため、ヨロシサン製薬と密かに手を組まんと画策している。
 イグゾーション（Exhaustion）
 声 - 鳥海浩輔
 強力な「マズダ・ニンジャ」の憑依者。
 生命力を活性化、暴走させる「バリキ・ジツ」の使い手で、敵の肉体を爆発四散させることも出来る。また「バリキ・ジツ」は脳にも影響を与え、判断力を低下させる 。
 鷹揚かつ典雅な物腰だが、モータルはおろか自身の部下すら消耗品として扱う酷薄な人物。政治手腕にも長け、パラゴンを警戒しつつ、同じ上流階級出身のスローハンド、パーガトリーらと派閥を形成する。
 他のものに先んじてロードの求める三種の神器を入手しようと、セキバハラを舞台に計画を張り巡らせた。
 パーガトリー（Purgatory）
 全身に暗黒カラテ粒子をまとってバリアにする他、連射が可能な「暗黒カラテミサイル」の使い手。
 政治闘争にばかり注力する小心な愚鈍者として他のグランドマスターから軽んじられているが、これらは自らの本心を隠すための演技に過ぎない。
 ニーズヘグ（Nidhogg）
 逆棘状の異形の銛のようなヘビ・ケンを振る優れたカラテの持ち主。武人気質な戦闘狂。
 高い戦闘能力を持ったダークニンジャに惹かれ、彼とその配下であるシテンノの後ろ盾となる。
 ヴィジランス（Vigilance）
 電算機室の最高責任者で、普段は電算機室の天井裏にいる。
 元エコノミストであり、キョートの経済監視、ザイバツの秘密に迫った者を社会的に抹殺するなどの激務を24時間体制でこなしている。電脳担当にも関わらずLAN直結者ではない。
 カラテでの戦闘力は他のグランドマスターに劣るが、情報管理能力・外交能力の高さとエコノミック・カラテの実力からグランドマスターの地位にある。

 マスター 
 ディプロマット（Diplomat）、アンバサダー（Ambassador）
 ザイバツのマスター位階に就く双子のニンジャ。
 兄弟が力を合わせる事で離れた空間を繋ぐ「ポータル・ジツ」を使い、それぞれが有事に備えキョートとネオサイタマに待機している。
 ワイルドハント（Wild Hunt）
 ザイバツには珍しくハイテクや外部協力者の使用を躊躇しない合理的な思想の持ち主。組織へ忠誠心はあるが意志決定の遅い上層部への不満を持っている。
 アデプトのモスキートやインペイルメントらと共に先遣隊としてネオサイタマへ駐留している。
 現場指揮官として上層部との折衝に腐心しつつ、直接戦闘においても様々な機能を持つ独楽を駆使して活躍する優秀な指揮官ニンジャ。

 ザイバツ・シテンノ 
 パープルタコ（Purple Tako）
 ザイバツ・サイバネ強化ニンジャ集団「ザイバツ・シテンノ」のメンバー。シテンノの中では唯一の女性。ダークニンジャの腹心の一人となる。
 その眼力と色香で相手を魅惑し操るヒュプノ・ジツの使い手。性交しながら口の触手で相手の精気を吸い取って殺すことを好むという異常性欲者である。
 ブラックドラゴン（Black Dragon）
 漆黒の装束と竜頭型のメンポを装着したニンジャ。バイオサイバネ手術により爬虫類を思わせる口に改造しているが、極端な性格が多い「シテンノ」の中では常識的な性格。
 状況分析に優れ、素手のカラテだけでなく武器術の力量も高い。シャウトは「シテンノ！」。
 自在に操作できる黒い霧を放つユニーク・ジツを持つが、目くらましの一種に過ぎないと自覚しており、強力なユニーク・ジツをもつレイジをアプレンティスとして迎え、彼のメンターとして指導している。
 レッドゴリラ（Red Gorilla）
 「何事も暴力で解決するのが一番」という過激な思想の持ち主で、筋力を武器とするビッグニンジャ・クランのソウル憑依者である。
 役立たずと見なした部下は容赦なく切り捨てる非情さや、暴力主義的な思想からレイジには嫌われているが、同じビッグニンジャ・クランの部下からは精神的なメンターとして慕われている。
 アイボリーイーグル（Ivory Eagle）
 寡黙かつ冷静に任務を遂行する人物で、イーグルの名の通り飛行能力を持つ。戦闘ではナパーム弾や空中からのエアロカラテを使う。
 誰にも明かさないある秘密があり、それは任務中に明らかになる。

 アデプト 
 シャドウウィーヴ（Shadow Weave） / ナブナガ・レイジ
 ザイバツに所属するアデプト・ニンジャ。本名は「ナブナガ・レイジ」。
 「Shadow Weave（影を編む）」の名の通り、影を自在に操る強力なジツを使えるが、未熟なため力は制限されておりクナイ・ダートの生成も出来ない。またカラテの力量も低く、モータルであるガンドーにさえ苦戦した。
 自身に道を示してくれたブラックドラゴンに心酔する一方で、ザイバツの理想であるニンジャ階級社会には疑問を抱いている。
 フェイタル（Fatal）
 アンバサダー配下のアデプト。
 普段はプラチナブロンドで豊満な胸の美しい女性だが、「ヘンゲヨーカイ・ジツ」により醜怪な獣へと変化する。
 アムニジア誘拐の命令を受け、ブラックヘイズと共に行動するが、ザイバツの壊滅以降もそのままコンビを組んでいる。
 イグナイト（Ignite）
 アンバサダー配下のアデプト。髪を赤く染め左側だけを丸刈りにしている。
 強力なカトン・ジツの使い手で、短距離ではあるが瞬間移動能力も持つ。短気で粗暴な性格ではあるが、上司であるアンバサダーのことは尊敬している。