2006年のバレンシアグランプリは、ロードレース世界選手権の2006年シーズン最終戦として、10月27日から29日までスペインのバレンシア・サーキットで開催された。

概要
125ccクラス決勝では、地元エクトル・ファウベルが独走でシーズン2勝目を挙げ、年間ランキング3位の座を勝ち取った。2位には年間ランキング2位のミカ・カリオ、3位にセルヒオ・ガデアと続き、新チャンピオンアルバロ・バウティスタは4位で125ccクラスでの自身最後のレースを終えた。

タイトル決定が懸かった250ccクラス決勝では、アレックス・デ・アンジェリスが独走でクラス初優勝を遂げた。タイトル逆転を狙ったアンドレア・ドヴィツィオーゾは7位に終わり、ポイントリーダーのホルヘ・ロレンソは4位をキープする安全策で初のワールドチャンピオンに輝いた。

同じくタイトル決定が懸かったMotoGPクラス決勝は、翌シーズンからレギュレーションが変更され排気量が800ccに縮小されることから、今回が990ccマシンによる最後のレースとなった。

ポールポジションを獲得したポイントリーダーのバレンティーノ・ロッシはスタートに失敗し中団に沈み、さらに5周目には転倒を喫して最下位にまで沈んでしまった。一方ランキング2位から再逆転を狙うレプソル・ホンダのニッキー・ヘイデンは安定した走りで3位をキープ、最終的にロッシは13位にまで順位を挽回したものの、ヘイデンが5ポイント差で逃げ切り初のワールドチャンピオンに輝いた。

レースを制したのは負傷療養中のセテ・ジベルナウの代役としてドゥカティ・マルボロチームから出場した、のスーパーバイク世界選手権王者のトロイ・ベイリスだった。これはベイリスにとってGP初優勝となった。2位にはチームメイトのロリス・カピロッシが入り、ドゥカティはMotoGP初の1-2フィニッシュを達成した。

 MotoGPクラス決勝結果 
 順位 No ライダー マニュファクチャラー 周回 タイム/リタイヤ グリッド ポイント 1 12 トロイ・ベイリス ドゥカティ 30 46:55.415 2 25 2 65 ロリス・カピロッシ ドゥカティ 30 +1.319 3 20 3 69 ニッキー・ヘイデン ホンダ 30 +9.230 5 16 4 26 ダニ・ペドロサ ホンダ 30 +12.065 6 13 5 33 マルコ・メランドリ ホンダ 30 +16.306 12 11 6 24 トニ・エリアス ホンダ 30 +17.390 13 10 7 56 中野真矢 カワサキ 30 +19.329 4 9 8 10 ケニー・ロバーツ・ジュニア KR211V 30 +23.174 14 8 9 5 コーリン・エドワーズ ヤマハ 30 +26.072 10 7 10 7 カルロス・チェカ ヤマハ 30 +28.194 16 6 11 21 ジョン・ホプキンス スズキ 30 +29.364 9 5 12 6 玉田誠 ホンダ 30 +29.707 15 4 13 46 バレンティーノ・ロッシ ヤマハ 30 +38.546 1 3 14 77 ジェームス・エリソン ヤマハ 30 +1:20.013 19 2 15 8 ギャリー・マッコイ イルモア 23 +7 Laps 20 1 Ret 27 ケーシー・ストーナー ホンダ 23 アクシデント 7 Ret 71 クリス・バーミューレン スズキ 13 アクシデント 8 Ret 30 ホセ・ルイス・カルドソ ドゥカティ 12 18 Ret 66 アレックス・ホフマン ドゥカティ 9 アクシデント 17 Ret 17 ランディ・ド・プニエ カワサキ 5 アクシデント 11 

 250ccクラス決勝結果 
 順位 No ライダー マニュファクチャラー 周回 タイム/リタイヤ グリッド ポイント 1 7 アレックス・デ・アンジェリス アプリリア 27 43:52.247 3 25 2 15 ロベルト・ロカテリ アプリリア 27 +4.524 4 20 3 80 エクトル・バルベラ アプリリア 27 +9.551 6 16 4 48 ホルヘ・ロレンソ アプリリア 27 +11.366 2 13 5 6 アレックス・デボン アプリリア 27 +14.957 10 11 6 73 青山周平 ホンダ 27 +17.621 8 10 7 34 アンドレア・ドヴィツィオーゾ ホンダ 27 +18.505 7 9 8 54 マヌエル・ポジャーリ KTM 27 +18.846 11 8 9 52 ダビド・デ・ヘア ホンダ 27 +20.362 9 7 10 50 シルバン・ギュントーリ アプリリア 27 +24.257 13 6 11 96 ヤコブ・シュムルツ アプリリア 27 +36.071 12 5 12 25 アレックス・バルドリーニ アプリリア 27 +40.323 17 4 13 42 アレックス・エスパルガロ ホンダ 27 +49.222 15 3 14 37 ファブリシオ・ペレン ホンダ 27 +51.787 18 2 15 8 アンドレア・バレリーニ アプリリア 27 +53.194 23 1 16 44 関口太郎 アプリリア 27 +57.940 21 17 31 アルバロ・モリーナ アプリリア 27 +1:16.334 19 18 23 アルトゥーロ・ティゾン ホンダ 27 +1:29.704 22 19 14 アンソニー・ウエスト アプリリア 27 +1:30.923 14 20 65 アレッサンドロ・ブランネッティ ホンダ 27 +1:31.558 25 21 57 チャズ・デイビス ホンダ 27 +1:31.982 26 22 24 ジョルディ・カルチャノ アプリリア 26 +1 Lap 24 23 53 サンティアゴ・バラガン ホンダ 26 +1 Lap 30 24 22 ルカ・モレリ アプリリア 26 +1 Lap 27 Ret 4 青山博一 KTM 20 アクシデント 1 Ret 58 マルコ・シモンチェリ ジレラ 12 アクシデント 5 Ret 28 デューク・ヘイドルフ アプリリア 10 16 Ret 45 ダン・リンフット ホンダ 8 29 Ret 85 アレッシオ・パルンボ アプリリア 4 アクシデント 28 Ret 16 ジュール・クルーセル アプリリア 1 20 DNQ 55 高橋裕紀 ホンダ 

 125ccクラス決勝結果 
 順位 No ライダー マニュファクチャラー 周回 タイム/リタイヤ グリッド ポイント 1 55 エクトル・ファウベル アプリリア 24 40:15.460 2 25 2 36 ミカ・カリオ KTM 24 +1.764 5 20 3 33 セルヒオ・ガデア アプリリア 24 +1.938 3 16 4 19 アルバロ・バウティスタ アプリリア 24 +8.646 1 13 5 52 ルーカス・ペセック デルビ 24 +8.673 7 11 6 42 ポル・エスパルガロ デルビ 24 +12.428 6 10 7 22 パブロ・ニエト アプリリア 24 +18.925 19 9 8 14 ガボール・タルマクシ ホンダ 24 +22.056 12 8 9 75 マティア・パシーニ アプリリア 24 +22.102 4 7 10 1 トーマス・ルティ ホンダ 24 +25.405 13 6 11 18 ニコラス・テロル デルビ 24 +25.605 11 5 12 38 ブラッドリー・スミス ホンダ 24 +28.700 23 4 13 34 エステベ・ラバト ホンダ 24 +36.206 17 3 14 71 小山知良 マラグーティ 24 +41.651 18 2 15 8 ロレンツォ・ザネッティ アプリリア 24 +41.748 20 1 16 21 マテオ・トゥネス アプリリア 24 +45.893 26 17 20 ロベルト・タンブリーニ アプリリア 24 +46.005 22 18 11 サンドロ・コルテセ ホンダ 24 +47.510 9 19 24 シモーネ・コルシ ジレラ 24 +52.287 16 20 6 ホアン・オリベ アプリリア 24 +54.531 21 21 43 マヌエル・エルナンデス ホンダ 24 +56.966 27 22 12 フェデェリコ・サンディ アプリリア 24 +57.995 24 23 16 ミケーレ・コンティ ホンダ 24 +1:01.336 35 24 9 ミハエル・ランセデール KTM 24 +1:02.918 28 25 37 ジョーイ・リットジェーン ホンダ 24 +1:02.992 38 26 30 ペレ・トゥトゥサウス デルビ 24 +1:04.324 33 27 90 葛原大陽 アプリリア 24 +1:07.021 30 28 53 シモーネ・グロツキー アプリリア 24 +1:08.649 29 29 25 ドミニク・エガーター アプリリア 24 +1:08.682 32 30 49 渡辺一馬 ホンダ 24 +1:08.809 36 31 13 ディノ・ロンバルディ アプリリア 24 +1:09.140 34 32 67 ブレイク・レイ＝スミス KTM 24 +1:19.944 42 33 45 イムレ・トス アプリリア 24 +1:20.568 31 34 87 ロベルト・ラカレンドーラ アプリリア 24 +1:31.922 43 35 40 Nico Vivarelli マラグーティ 24 +1:31.995 31 36 77 Daniel Saez アプリリア 24 +1:38.898 40 37 83 Clement Dunikowski アプリリア 23 +1 Lap 39 Ret 32 ファブリツィオ・ライ アプリリア 18 14 Ret 35 ラファエレ・デ・ロサ アプリリア 11 25 Ret 60 フリアン・シモン KTM 6 アクシデント 8 Ret 44 カレル・アブラハム アプリリア 6 アクシデント 15 Ret 54 ランディ・クルメナッハ KTM 5 アクシデント 10 Ret 78 ヒューゴ・ファン・デン・ベルク アプリリア 3 アクシデント 37