湘南新宿ライン（しょうなんしんじゅくライン）は、山手線（山手貨物線）の池袋駅 - 大崎駅間を経由し、東北本線（宇都宮線）および高崎線と、東海道本線（東海道線）および横須賀線を直通運転する、東日本旅客鉄道（JR東日本）の系統路線名である。駅ナンバリングで使われる路線記号はJS。

本項では、正式な路線名を記す必要がある場合を除き、東北本線宇都宮駅方面を指す場合は愛称の「宇都宮線」を、東海道本線小田原駅方面を指す場合は旅客案内上の呼称である「東海道線」を用いる。

運行経路については、大宮駅 - 新宿駅 - 大船駅間では以下の路線を経由する（「運行経路」の節も参照）。
 東北本線（大宮駅 - 田端信号場駅間）：東北貨物線を走行
 山手線（田端信号場駅 - 品川駅間）：山手貨物線を走行
 東海道本線（品川駅 - 大船駅間）：品鶴線及び横須賀線専用線を走行（東海道線 - 高崎線系統は戸塚駅 - 大船駅間で東海道線列車線を走行）

 概要 
湘南新宿ラインは、主に東京駅・上野駅をターミナルとして放射状に運転していた首都圏の中距離電車を、池袋駅・新宿駅・渋谷駅の各副都心エリアを経由して相互に直通運転させる運転系統として、2001年（平成13年）12月1日のダイヤ改正から運行を開始した。上野駅・東京駅を経由する上野東京ラインとともに北関東と神奈川県を結ぶ路線系統である。新宿駅を経由して宇都宮線と横須賀線を直通する系統と、高崎線と東海道線を直通する系統の2つが存在する。運行区間は宇都宮線 - 横須賀線系統が宇都宮駅 - 逗子駅間、高崎線 - 東海道線系統が高崎駅 - 小田原駅であるが、一部の列車は高崎駅から上越線・両毛線を直通して前橋駅に至る。赤羽駅 - 横浜駅間は当路線より上野東京ラインの方が直線的なルートを通っており、2015年の上野東京ライン開業以降、埼玉県方面と神奈川県を移動する利用者は上野東京ラインにも分散した。

池袋駅 ‐ 大崎駅間は埼京線・相鉄線直通列車とともに山手線に対する速達列車としての役割、大宮駅 ‐ 大崎駅間は埼京線とともに東北・山形・秋田・北海道・上越・北陸新幹線と副都心のアクセス路線としての役割ももっている。

運行開始当初の本数は、日中のみ25往復の設定となっていた。その内訳は、宇都宮線・高崎線からの直通列車は18往復で、ほかは新宿と東海道線・横須賀線方面を結ぶ列車が存在する程度で、東京駅及び上野駅発着列車に対する補助的な役割に過ぎなかった。だが、もともとこれらの末梢路線と東京副都心間には大きな需要があったことからその後の増発が期待されていた。当初、池袋駅構内の配線の関係で大幅増発ができなかったが、開業前から計画されていた改良工事が完成した2004年（平成16年）10月16日のダイヤ改正では、湘南新宿ラインの全列車が南北直通運転となり、運転本数も運行開始当初と比べて2.4倍増の64往復となった。それ以降もダイヤ改正ごとに増発が行われ、現在はそれ以上の本数で運転されている。

 名称および旅客案内 
当初「湘南新宿ライン」は普通列車（快速を含む）の運転系統の名称として使用が開始され、同じ区間を走行する特急列車・通勤ライナー及び臨時列車などに「湘南新宿ライン」の呼称はあまり用いられなかった。近年ではこれらが湘南新宿ラインの走行区間（大宮駅 - 新宿駅 - 大船駅間）を経由する意味で主に音声案内に用いられる。

JTB時刻表やJR時刻表などでは、東海道線 - 高崎線系統は大崎駅 - 大船駅間で快速運転するため全区間で「快速」「特別快速」と表記されるが、一方の宇都宮線 - 横須賀線系統は全区間で各駅に停車するため「普通」と表記され、うち宇都宮線快速は宇都宮線のページでのみ「快速」と表記される。

JR東日本公式ホームページの各駅時刻表では、東海道線 - 高崎線系統は「快速」「特別快速」と表記されるほか、宇都宮線 - 横須賀線系統の快速（小山駅 - 大宮駅間快速）も全区間で「快速」と表記される。

また、実際の車両外側の種別等案内表示器や車内案内（音声・文字）、駅構内での案内では、宇都宮線 - 横須賀線系統の小山駅 - 大宮駅間快速の場合、南行列車の大宮駅以北区間では「快速」、大宮駅以南では「普通」として案内され、同北行列車の大崎駅以南区間では「普通」、大崎駅 - 小山駅間では「快速」として案内される。同様に、東海道線 - 高崎線系統の大崎 - 大船間快速の場合、南行列車の大宮駅 - 戸塚駅間では「快速」、またそれ以外の区間では「普通」として案内され、同北行列車の大崎駅以南区間では「快速」、大崎駅以北区間では「普通」として案内される。

車両外側の行き先表示は、両方面とも新宿駅直前まで「新宿経由」と表示する。

また、直通先路線に乗り入れた後、終点到着まで、車内の案内（行き先・停車駅表示及び自動アナウンス）では「湘南新宿ライン」「○○線直通」が省略され、その路線内完結の普通・快速列車と同じ案内となる（例 高崎線直通快速籠原行きの大宮以北主要駅発車時のアナウンス：「この電車は、高崎線 普通列車 籠原行きです」）。ただし、車両外側の行き先表示は、「湘南新宿ライン」「○○線直通」と表示される。

なお、交通新聞社発行の各時刻表では「大宮-新宿-大船間は湘南新宿ライン（愛称）です」と案内されている（上野東京ラインも同様）。

赤羽駅での北行の発車標では「宇都宮線（東北線）・高崎線（さいたま新都心通過）」となっており、湘南新宿ラインの名称を省略している。

スマートフォンアプリ「JR東日本アプリ」の列車位置情報では、宇都宮線・高崎線方面は赤羽駅以北で上野方面系統と、横須賀線・東海道線方面は西大井駅・横浜駅以南で横須賀・総武快速線系統及び東海道線東京方面系統と並行して扱われている。

 運転開始の背景 

 他社線との競合 
2000年代初頭、JR東日本の首都圏における在来線輸送量が下落傾向にあった。これは少子高齢化などの社会的変化に加え、東急目黒線が2000年（平成12年）に東京メトロ（当時は営団地下鉄）南北線・都営地下鉄三田線と、2001年（平成13年）からは南北線を経て埼玉高速鉄道線と相互直通運転を開始するなど、競合する他の鉄道会社が神奈川・東京・埼玉を結ぶネットワークを形成したことも理由の一つであった。こうした競合への対策として、新たに神奈川方面・東京・埼玉方面を新宿駅経由で直通する列車の設定に至った。

 北関東・南関東を結ぶ輸送需要の存在 
下表は、2000年（平成12年）の北関東と南関東間の鉄道旅客流動状況を示したものである。
+各都県間鉄道旅客流動状況（2000年） 出発地＼目的地 栃木県 群馬県 合計 - - 埼玉県 642 471 1,113 - - 東京都 3,075 1,869 4,944 - - 神奈川県 765 243 1,008 - - 千葉県 336 292 628 - - 合計 4,818 2,875 - - - 出発地＼目的地 埼玉県 東京都 神奈川県 千葉県 合計 栃木県 1,252 2,963 939 595 5,749 群馬県 935 2,027 415 485 3,862 合計 2,187 4,990 1,354 1,080 -
（単位：千人 / 年）、運輸省（現：国土交通省）調べ

 埼京線の延伸中止の見返りとしての性格 
1984年（昭和59年）2月ダイヤ改正時に貨物列車が大幅に削減された際に空いた線路容量を活用し、東北本線（宇都宮線） 小金井駅・高崎線 籠原駅からそれぞれ赤羽駅行きとして東北貨物線経由で1本ずつ設定された上り列車（片道のみ）が始まりである。

埼京線の高崎線宮原駅までの延伸が1985年の運輸政策審議会答申第7号で示されたのちも『埼京線延伸実現を』の意見が当時の大宮市や住民から繰り返し提出されたが、大宮駅以北は宇都宮線・高崎線方面ではなく、電化された川越線と直通運転をすることになった。

JR発足後の1988年（昭和63年）に宇都宮線・高崎線が東北貨物線を使用して池袋駅までの運転を開始し、後に湘南新宿ラインとして発展する。

 車両運用の合理化と都心車両基地の活用 
湘南新宿ラインを含む南北直通運転は、JR東日本の経営上の観点から
 車両の共通運用化による所要運用数・車両数の削減
 車両基地の共通化による整備コストの削減
 都心に立地する車両基地の郊外移転と再開発を可能とする
などの点で大きな利点がある。JR東日本は2015年（平成27年）の上野東京ライン運行開始後に、田町車両センターの廃止と品川車両基地の整理・再開発、それに関連した山手線・京浜東北線高輪ゲートウェイ駅開設などの事業を進めている。詳細は「上野東京ライン#品川車両基地について」「田町車両センター#今後の予定」を参照されたい。

 競合各社の動き 

湘南新宿ラインの登場は競合する私鉄にも影響を与えた。特に渋谷駅 - 武蔵小杉駅 - 横浜駅間で競合する東急電鉄（2019年以前は東京急行電鉄）と新宿駅 - 藤沢駅・小田原駅間で競合する小田急電鉄は新たな対抗策を打ち出した。
東急電鉄
東急は、湘南新宿ライン運転開始に先立つ2001年（平成13年）3月28日のダイヤ改正から東横線で特急の運転を開始し、渋谷駅 - 横浜駅 - 桜木町駅（2004年2月1日からはみなとみらい線元町・中華街駅）間の速達輸送を強化した。2013年（平成25年）3月16日からは東京地下鉄（東京メトロ）副都心線（和光市駅 - 渋谷駅間）と相互直通運転を開始したことで、競合区間がさらに延びて横浜駅 - 池袋駅間になった。
小田急電鉄
小田急は、2002年（平成14年）3月23日のダイヤ改正で藤沢駅 - 新宿駅間に「湘南急行」を新設した。2004年（平成16年）12月11日のダイヤ改正では「湘南急行」の種別を廃止する代わりに江ノ島線と小田原線に「快速急行」を新設するなど、速達性を向上させている。

 運行経路 

湘南新宿ラインは、東北本線（大宮駅 - 田端信号場駅間）・山手線（田端信号場駅 - 品川駅間）・東海道本線（品川駅 - 大船駅間）を介し、大宮以北の宇都宮線・高崎線と大船以南の横須賀線・東海道線とそれぞれ直通している。

運転系統としては、
 宇都宮線と横須賀線を直通する系統
 高崎線と東海道線を直通する系統
の2つがある。上野東京ラインのような東海道線と宇都宮線を直通する系統は設定されていない。

大宮駅 - 大船駅間（東北本線・山手線・東海道本線）の走行区間のほとんどが元来は主に貨物列車が走行する線路で、1980年のSM分離や1980年代の貨物輸送合理化と武蔵野線の開通により旅客輸送に転用された線路が多い。

 大宮駅 - 田端信号場駅間 
大宮駅から田端信号場駅までは東北本線の貨物線（通称・東北貨物線）を走行する。大宮駅から赤羽駅までは東北本線旅客線（上野・東京・品川・川崎方面の宇都宮線・高崎線列車〈上野東京ライン〉が走る線路）及び京浜東北線（線籍上は東北本線）と並走する。宇都宮線・高崎線が停車するさいたま新都心駅は貨物線にホームがないため通過する。

王子駅付近で尾久車両センター方面（尾久駅）への東北本線旅客線と別れた後、東京新幹線車両センター沿いを京浜東北線と並走し、田端駅の直前の田端信号場駅で京浜東北線と分かれて中里トンネルに入り、大きく西へカーブして山手線の南側に出る。そのため、田端駅には湘南新宿ラインの列車は停車しない。

 田端信号場駅 - 大崎駅間 

田端信号場駅から大崎駅までは山手線の貨物線（通称・山手貨物線）を走行し、山手線電車と並行しながら駒込駅・巣鴨駅・大塚駅を通過する。

池袋駅 - 大崎駅間は埼京線と線路を共有しており、途中の新宿駅・渋谷駅・恵比寿駅にホームがある。高崎線 - 東海道線系統の特別快速は恵比寿駅を通過するが、他の列車はこれらのすべての駅に停車する。池袋駅 - 大崎駅間は並走する各駅に停車する山手線に対して、湘南新宿ラインは埼京線とともに普通列車も含めて快速列車の役割を果たす。 

 大崎駅構内 
大崎駅からは、埼京線と相互直通運転する東京臨海高速鉄道りんかい線を上下線の間に挟む形で同線と分岐し、通称「大崎支線」（蛇窪線）と呼ばれる短絡線に入る。この線は横須賀線列車の走る東海道本線の支線（通称品鶴線）と立体交差した後、大きくカーブし、西大井駅の手前の旧蛇窪信号場（大崎駅構内）にて品鶴線と合流する。大崎支線はかつて山手貨物線（線籍上は山手線）であったが、現在は旧蛇窪信号場も含めて大崎駅構内の扱いである。

 大崎駅 - 大船駅間 

旧蛇窪信号場 - 鶴見駅間は品鶴線を、鶴見駅 - 戸塚駅間は東海道本線の旧貨物線（現在は横須賀線専用線）を走行する。

この区間は貨物線として利用されていたが、品川駅から大船駅までの区間は1980年10月1日のSM分離により同線から横須賀線列車の専用線路に転用された。旧蛇窪信号場 - 戸塚駅間には横須賀線のすべての列車が停車する西大井駅・武蔵小杉駅・新川崎駅・横浜駅・保土ケ谷駅・東戸塚駅があり、湘南新宿ラインも宇都宮線 - 横須賀線系統の列車（大船行を含む）はこれと同様に全駅に停車するが、高崎線 - 東海道線系統の列車は武蔵小杉駅と横浜駅にのみ停車する（詳しくは運行形態の項を参照）。東海道線直通列車は戸塚駅を出ると同駅構内南端の渡り線を通り、横須賀線専用線路から東海道旅客線に転線する。

 運賃及び料金の計算 
大崎駅 - 西大井駅間の運行上の経路は大崎支線経由であるが、営業線とみなされていないため、運賃及び料金の計算には山手線 - 品川駅 - 品鶴線経由を用いる（大崎駅から品川駅を通過して西大井駅に至る経路扱い）。

また、前記の原則とは別に、運賃及び料金の計算の特例が設けられている区間もある。
経路特定区間の規定における特定の区間の普通運賃及び料金の計算は、二つの経路のうち短い方を用い、券面上は経路を指定しない。
 品川駅以遠（高輪ゲートウェイ駅または大崎駅方面）の各駅と、鶴見駅以遠（新子安駅、羽沢横浜国大駅または国道駅方面）の各駅との相互間（湘南新宿ラインにおいては大崎駅 - 横浜駅を含む区間を乗車する場合）は、大井町駅経由で普通運賃及び料金を計算する。
電車大環状線を通過する区間の普通運賃及び料金の計算は最短経路で行い、券面上は経路を指定しない。電車大環状線内の各駅発着の普通運賃は最短経路を指定した上で迂回乗車として取り扱うことで事実上同様であり、電車大環状線内の各駅発着の料金も、2015年3月14日より迂回乗車扱いが可能となった。
 湘南新宿ラインでは、赤羽駅 - 西大井駅間を含む区間を乗車する場合は東京駅経由で、赤羽駅 - 池袋駅間を含む区間を乗車する場合は十条駅経由で普通運賃及び料金を計算する。
列車特定区間の規定における運賃計算経路の選択
 赤羽駅以遠（川口駅方面） - 池袋駅以遠（目白駅方面）の各駅との相互間は、湘南新宿ライン乗車（東北本線及び山手線経由）でも途中下車しない場合は、赤羽線（埼京線）経由で運賃及び料金を計算できる。普通運賃及び料金は電車大環状線の規定が適用されるため、湘南新宿ラインでは実質定期運賃のみに適用される規定である。旅客営業規則には記載がないため、原則通り田端駅経由の定期券を購入することもできる（この場合湘南新宿ラインと京浜東北線・山手線に加えて埼京線にも乗車でき、東十条駅 - 大塚駅の各駅でも乗降できるが、十条駅・板橋駅での乗降はできない）。
特定分岐区間の規定に基づく、区間外乗車を認める特例
 西大井駅以遠（武蔵小杉駅方面） - 品川駅以遠（高輪ゲートウェイ駅方面）の各駅との相互間の乗車券において、分岐駅（品川駅）を通過する列車（湘南新宿ライン）に乗車する場合に、大崎駅で途中下車をしない限り大崎駅 - 品川駅間の乗車が認められる。この場合、区間外となる大崎駅 - 品川駅間は運賃計算に含めない。
 鶴見駅・新子安駅・東神奈川駅または川崎駅以遠（蒲田駅または尻手駅方面）・国道駅以遠（鶴見小野駅方面）もしくは大口駅以遠（菊名駅方面）の各駅 - 新川崎駅・西大井駅または武蔵小杉駅以遠（武蔵中原駅または向河原駅方面）の各駅との相互間の乗車券において、分岐駅（鶴見駅及び東神奈川駅）及び発駅または着駅（新子安駅）を通過する列車（湘南新宿ライン・横須賀線電車）に乗車する場合に、横浜駅など乗車券区間外で途中下車をしない限り鶴見駅・新子安駅・東神奈川駅 - 横浜駅間の乗車が認められる。この場合、区間外となる鶴見駅・新子安駅・東神奈川駅 - 横浜駅間は運賃計算に含めない。
 分岐駅通過列車に対する区間外乗車の取り扱いの特例の規定に基づく、区間外乗車を認める特例
 東神奈川駅を通過する急行（特急を含む）列車へ東神奈川駅から分岐する横浜線から乗り継ぐ（急行〈特急を含む〉列車から普通列車への乗継ぎを含む）ため、東神奈川駅 - 横浜駅間を乗車する旅客（定期乗車券を所持する旅客を除く）には、東神奈川駅 - 横浜駅間内で途中下車をしない限り、東神奈川駅 - 横浜駅間について乗車券面の区間外乗車の取扱いができる。急行（特急を含む）に限らず、東神奈川駅に停車しない普通列車（東海道線列車・横須賀線電車・湘南新宿ライン・上野東京ライン）の場合についても準用する。後記の大都市近郊区間内相互発着における選択乗車による券面区間外乗車時においても準用する。

 沿線概況 

 運行形態 

 運行系統と列車種別 
宇都宮線 - 横須賀線の系統と高崎線 - 東海道線の系統がほぼ交互に運行されており、大宮駅 - 大船駅間で1時間に朝は6本、日中は4本運行されている。日中の新宿駅の発車時刻は南行が毎時00・15・30・45分、北行が毎時09・19・39・49分の15分間隔となっている。埼京線や横須賀・総武快速線といった他路線と共用する区間があることから、上野東京ラインと比べると列車本数が限られる。全列車が2階建てグリーン車を2両連結している。

前述の通り、普通列車であっても、ホームがないためさいたま新都心駅には停車しない。線路別複々線の構造上、新宿・池袋方面から同駅まで乗車するためには、赤羽駅または浦和駅で階段等の昇り降りを伴う乗り換えが必要となる（同一ホームでは乗り換えできない）。これは同方面から宇都宮線直通快速で土呂駅、高崎線直通特別快速で宮原駅へ向かう場合も同様。ただしこの2駅は大宮駅で乗り換えても行くことができる。

横須賀線系統は湘南新宿ラインとの直通運転はあるが、上野東京ラインとの直通運転は設定されていない。また、上野東京ラインのように東海道線と宇都宮線を直通する系統は存在しない。

+日中1時間あたりの運行本数種別＼駅名…………………特急2本→成田線 成田空港特別快速高崎線 高崎←1本→東海道線 小田原快速高崎線 籠原←1本→東海道線 平塚宇都宮線 宇都宮←1本→横須賀線 逗子普通1本快速埼京線経由 川越線 川越←3本→りんかい線 新木場各駅停車埼京線経由 大宮←3本埼京線経由 武蔵浦和←3本2本→相鉄線 海老名

 宇都宮線 - 横須賀線系統 
 湘南新宿ライン普通（全区間普通）
2001年12月1日の湘南新宿ライン開業から運転開始。1時間に日中が1本、ラッシュ時が2-3本の運行である。基本的に宇都宮駅 - 逗子駅間の運行であるが、小金井駅・大船駅発着の設定があるほか、平日には古河駅発着も1往復運転されている。多くは全区間15両で運転されるが、一部列車は小金井駅で5両編成の連結・切り離し作業をするため、小金井駅 - 宇都宮駅間では10両となる。また、全区間10両編成の列車も設定されている。E233系のフルカラーLED表示では全区間緑色で表示される。
 北行宇都宮方面への湘南新宿ライン終電は高崎線系統よりも30分ほど早いが、後続の高崎線系統の列車に乗車しても、大宮駅で上野発宇都宮線終電に乗り換えることができる。
 運行開始当初は横須賀駅までの運行であった。また、宇都宮線黒磯駅発着の列車もあったが、2004年3月13日改正で宇都宮駅で系統分離となり廃止された。
 以前は毎週金曜日（祝日は除く）の夜に臨時扱いで宇都宮線へは直通しない新宿駅発着の横須賀線直通列車が1往復設定されていた（9740Y:大船駅21時31分発・新宿駅22時24分着、9741Y:新宿駅22時31分発・大船駅23時22分着）。この新宿駅発着列車は、車両の方向幕が「湘南新宿ライン」（直通路線名なし）として運行される。また、駅の接近放送では単に「普通 新宿行」と案内され「湘南新宿ライン」の名は使われず、戸塚駅に設置されているフルカラーLED表示板でも東海道線の東京駅・品川駅発着列車と同様に黒色で「普通」とのみ案内するなど、南北直通運転を行う通常の湘南新宿ライン列車とは異なる。なお、以前は定期列車でもこの形態があった。
 湘南新宿ライン普通／湘南新宿ライン快速（宇都宮線内快速、大宮 - 大船間・横須賀線：普通）
2004年10月16日運転開始。朝から日中にかけて宇都宮駅 - 大船駅・逗子駅間で1時間に1本運転されている。宇都宮線内は快速として運行され、日中の上野駅発着の快速「ラビット」を湘南新宿ラインに置き換えた形で運行されている。一部列車を除き、南行・北行ともに大宮駅で上野東京ラインの列車に接続する。多くは全区間15両で運転されるが、一部列車は小金井駅で5両編成の連結・切り離し作業を行うため、小金井駅 - 宇都宮駅間では10両になる。また、全区間10両の列車も設定されている。なお、宇都宮線 - 横須賀線系統は、快速も横須賀線内では各駅に停車するため「快速」の種別表示は、北行は大崎駅で表示され、南行は大宮駅で消滅する。2015年頃より、車両外側の行先表示で北行は大崎駅まで「宇都宮線内快速」、南行は大宮駅まで「横須賀線内普通」を行先と交互に表示するようになった。また北行きの「快速」表示は小山で消滅するようになった。E233系のフルカラーLED表示では橙色（上記の「快速」と案内される区間）と緑色（「普通」と案内される区間）で表示される。

 高崎線 - 東海道線系統 
当系統は、定期列車としては横須賀線内西大井駅・新川崎駅・保土ケ谷駅・東戸塚駅に停車する列車は設定されていない。これら各駅へは、湘南新宿ライン宇都宮線 - 横須賀線系統、総武快速線 - 横須賀線系統（西大井駅 - 東戸塚駅の各駅）または埼京線 - 相鉄線系統（西大井駅のみ）への乗り換えが必要となる。
 湘南新宿ライン普通／湘南新宿ライン快速（高崎線内：普通、大宮 - 戸塚間：快速、戸塚 - 東海道線内：普通）
 2001年12月1日の湘南新宿ライン開業から運転開始。日中は籠原駅 - 平塚駅・国府津駅間で1時間に1本が運行されている（2015年6月10日時点のダイヤ）。特別快速の設定がないラッシュ時には、最長で高崎駅 - 国府津駅・小田原駅間の列車があり、1時間に2 - 3本が運行されている。朝の南行及び夜間の北行には上越線経由で両毛線前橋駅発着の列車もあるほか、平日朝には深谷駅発も1本運行されている。大崎駅 - 戸塚駅間は横須賀線電車と同じ線路上を走り、横須賀線の西大井駅・新川崎駅・保土ケ谷駅・東戸塚駅を通過するため「湘南新宿ライン快速」と称されるが、基本的には高崎線普通列車と東海道線普通列車を直通させた普通列車で、南行の大宮着までと戸塚駅以西、北行の大崎駅以北では車内及び駅構内ともに「湘南新宿ライン普通」と案内される。また「快速」と称される北行でも、東海道線内は各駅に停車するため「快速」の表示は始発駅から表示されているが、戸塚駅まで普通とも案内される。2015年頃より、快速運転区間内は車両外側の行先表示で北行は「高崎線内普通」を行先と交互に表示するようになった。全列車において一部区間を除き15両で運転される（高崎線内籠原駅・深谷駅発着列車は全区間15両で運転される。深谷駅より先の高崎駅・前橋駅まで運転される列車は、籠原駅で5両編成の連結・切り離しを行い、小田原駅・国府津駅・平塚駅 - 籠原駅間は15両、籠原駅 - 高崎駅・前橋駅間は10両となる）。運行開始当初は高崎線内でも快速運転を行う列車（高崎線内の停車駅は現在の特別快速と同じ）が設定されていたが、特別快速に置き換える形で2004年10月16日改正で廃止された。E233系のフルカラーLED表示では橙色（上記の「快速」と案内される区間）と緑色（「普通」と案内される区間）で表示される。
 ダイヤが乱れた場合上記の横須賀線内で通過する4駅に停車することがある。大部分が朝ラッシュ時間帯である。
 湘南新宿ライン特別快速（全区間特別快速）
 2004年10月16日運転開始。日中に1時間に1本運行されている（2015年6月20日現在のダイヤ）。高崎線内は日中の上野駅発着の快速「アーバン」を湘南新宿ラインに置き換えた形で運行されている。置き換え対象である日中の「アーバン」が北本駅に停車していたため、現在の「アーバン」が停車しない北本駅に特別快速が停車している。
 東海道線内は2023年3月に廃止される前の快速「アクティー」と停車駅が同一となっている。こちらは湘南新宿ライン「特別快速」と上野東京ライン快速「アクティー」が併存していたが、2021年3月のダイヤ改正でアクティーは夜の下りのみになったため、併存状態は解消された。また、2023年3月のダイヤ改正にて快速「アクティー」が廃止されたため、普通列車と同じ車両を使用する東海道線（JR東日本区間）の定期列車の優等種別は当種別のみとなった。
 北行の1本目が平塚駅発である以外は高崎駅 - 小田原駅間で運行されている。高崎線内では南行は桶川駅で先行する上野東京ラインの列車に、北行は大宮駅で後続の上野東京ラインの列車に接続する（北行の一部列車を除く）。東海道線内では南行は平塚駅で、北行は国府津駅・平塚駅・大船駅のいずれかで東京方面の普通列車と接続する（一部列車を除く）。全列車、籠原駅で5両編成の連結・切り離しを行い、小田原駅・平塚駅 - 籠原駅間は15両、籠原駅 - 高崎駅間は10両となる。以前は土休祝日や長期休暇を中心に、土休日ダイヤで2往復が小田原駅 - 熱海駅間で臨時列車として延長運転を行っていた。この区間の途中停車駅は真鶴駅と湯河原駅のみとなり、早川駅・根府川駅は快速「アクティー」は停車するが、特別快速は通過する。これは2004年10月15日以前における一部の快速「アクティー」停車駅と同じである。E233系のフルカラーLED表示では全区間青色で表示される。

 列車番号 
湘南新宿ラインの列車の列車番号は、4桁の数字と英字1字からなる（例：2521Y）。この列車番号は、以下の規則に従って決められている。ただし、かつて金曜日夜間に運行された臨時新宿 - 大船間普通はこの通りではなかった。
 千の位
 運転系統と種別を表す。 
 2：湘南新宿ライン普通（宇都宮線普通 - 横須賀線普通）・湘南新宿ライン普通／快速（高崎線普通 - 東海道線普通）
 4：湘南新宿ライン普通／快速（宇都宮線快速 - 横須賀線普通）・湘南新宿ライン特別快速（高崎線特別快速 - 東海道線特別快速）
 百の位
 宇都宮線 - 横須賀線系統は5、高崎線 - 東海道線系統は8。
 十の位・一の位
 南行（大船方面）は21から、北行（大宮方面）は20から始まり、南行は奇数、北行は偶数で表される。
 末尾の英字
 全列車Yで表される。