耕雲本（こううんぼん）は、耕雲（花山院長親）が整えたとされる源氏物語の写本及びそれに由来する本文のことである。

 概要 
耕雲本とは、室町時代中期に耕雲（花山院長親）が将軍足利義持に献上した源氏物語の写本およびその写本のために整えた源氏物語の本文のことである。

旧注の一つ『明星抄』は、この「耕雲本」を「青表紙本でもなく河内本でもない」としており、それ以後の注釈書もほぼそのままこの記述を受け継いで来たため、かつてはこの「耕雲本」については「耕雲本」原本とそこからの転写本を一つの系統と考えて青表紙本でもなく河内本でもない耕雲が整えた第三の系統の本文であると考えられていた。そのような伝統的な考え方を受けて池田亀鑑の初期の本文研究の成果をとりまとめた『源氏物語系統論序説』などでは「耕雲本」を「青表紙本」、「河内本」と並ぶ一つの本文系統としてあげられており、これからの源氏物語の本文研究の課題として「できるだけ多くの写本を集め、青表紙本、河内本及び耕雲本の性格を明らかにする必要がある。」等とされていた。また青表紙本でも河内本でもないということでこの耕雲本を別本の一つに位置づける見解もあった。しかしながら実際に耕雲本に属するとされる高松宮本等の写本の本文の内容を巻別に青表紙本や河内本と比較してみると、松風の1帖のみが青表紙本系統。宇治十帖の中の橋姫、宿木、東屋、浮舟、蜻蛉、手習、夢浮橋の7帖が別本。他は河内本系統という河内本を主体とした取り合わせ本であることが明らかになった。そのため、現在では耕雲本を青表紙本や河内本と並ぶ一つの本文系統としてあげることはなく、耕雲本に由来する写本は「河内本の中の一系統」かまたは「河内本を主体とする取り合わせ本」として扱われるようになっている。

 巻末の跋歌 
耕雲本は、各巻の巻末に以下のような巻名を詠み込んだ耕雲による跋歌と耕雲の署名を記していることを一つの特徴としている。
 桐壺 ことの葉のちゝのなさけもきりつぼの秋のこゝろやはしのなりけん
 帚木 跋歌は無く「本云此巻無耕雲之歌」と記されている。
 空蝉 かすならぬ身をうつせみのから衣うすきになしてなにうらみけん
 夕顔 置露のはかなくきえし夕かほはけにくちおしの花のちきりや
 若紫 すゑつゐにふかさそまさるむらさきの一もとゆへにそめしこゝろは
 末摘花 ふかゝらぬ心そ見えしくれなゐのすゑつむ花の色やあせたる
 紅葉賀 神無月みゆきのにはの舞の袖かさすもみちは色なかりけり
 花宴 はてはまたすまのわかれになけく哉おほろ月夜の花の名残を
 葵 うかりけるもの見事の我からにめぐりあふひのけふもうらめし
 賢木 たのまめやたをる榊のことの葉ゝかはらすなからかはるこゝろを
 花散里 袖の香をのちしのへとや橘の花ちるさとにやとをかりけむ
 須磨 しほなれてほさぬなみたのころもてをたれかみとせのすまのうら人
 明石 あかしかたよその恨の袖ぬれて松よりこえし浪のこゝろよ
 澪標 袖ぬらすけふはうき世の身をつくしのちにそふかきしるしをもみし
 蓬生 里はあれて軒をあらそふよもきふのもとの心にわけしわりなさ
 関屋 なをそうき行あふさかの名のみしてむねにせきやる下の涙は
 絵合 なにとかはまことすくなき絵合のそのかちまけをしゐてさためむ
 松風 ことかよふちきりもたえぬ中の緒になけきくはゝるみはねのまつ風
 薄雲 おもかけのたちそふさへにかなしきはきえしけふりのあとのうす雲
 朝顔 ほのかにもみるへきはなのあさかほをいかのへたつるきりのまかきそ
 少女 いにしへの雲のかよひ路跡ふりぬきをとめのすかたいまはわすれよ
 玉鬘 夕かほのなこりの露の玉かつらいかなるすちに又みたれけん
 初音 鶯の初音のけふのひめこまつきかはや見はや千代の春まで
 胡蝶 よしやそのあそふこてふの夢の世にみはてぬ花の春のさかりは
 蛍 われもまた思ひにもえてかこつかな面影見せし夜半のほたるを
 常夏 たれかしるもとのかきねはあれはてゝとこなつかしき花のかた見を
 篝火 光なきむねのほのほのしられねはもゆとやみけるよそほかゝり火
 野分 野分せし秋の篭のはなのかほわれもしほれて物おもへとや
 行幸 ふりけるみゆきの跡そ小塩山たえなんとする道いかにせむ
 藤袴 むらさきのゆかりもつらし藤はかまつるゝ露のかことはかりは
 真木柱 槇はしらたちはなれても身にそふは人につゆらぬ涙なりけり
 梅枝 春の色ものとかにうたふ梅か枝に又こゑそふる宮のうぐひす
 藤裏葉 けふはまたあさきちきりの色もなし藤のうら葉のうらみのこすな
 若菜上 けふはまつよそちのわかなつみそめつ老すしなすの春をちきらむ
 若菜下 跋歌は無く「本云此巻無耕雲歌」と記されている。
 柏木 うかりけるたかねき事のはてならむしけきなけきのもりのかしは木
 横笛 つたへきてしらへかはらぬよこふえにむかしをしのふねをやそへけむ
 鈴虫 ふりすてしもとのうき世の秋とたにわせれむとすれはすゝむしのこゑ
 夕霧 心さへはれぬゆきゝにまよふかな夕きりふかきをのゝほそみち
 御法 さりともとたのむみのりの蓮葉になとかけとめぬ露の命そ
 幻 まほろしにいさことゝはむ別にし玉の行ゑにありやなしやと
 雲隠 見るやいかに心の月の雲かくれかくれぬ物をもとの光は
 匂宮 にほふ梅かほるさくらも色／＼によしやあたなり花もひと時
 紅梅 くれなゐの梅さく窓は心せよひまもとむなりよその春風
 竹河 ふかゝらぬちきりしらるゝ竹川の行すゑたのむ一ふしもなし
 橋姫 今みても袖こそぬるれ橋姫の心くまるゝうちの川木
 椎本 散はてし椎かもとこそあはれなれたちよるかけもあらしふきけり
 総角 つゐにきてこゝろもとけぬあけまきのなとなをさりによりあひにけん
 早蕨 おりふしのうつるを見てもかなしきはわすれかたみにつめる早蕨
 宿木 世を秋のたよりうれしきやとり木になにともよほす袖のしくれそ
 一名かほ鳥 あはれなとむかしおほゆるかほ鳥をおなししけみに猶たつねけむ
 東屋 あつまやのほとなかるへきちきりゆへ袖ぬらせとのあまそゝきかな
 浮舟 一かたによるへさためぬうき舟のうき名をさへになかしけるかな
 蜻蛉 かけろふのあるかなきかの身をしらは人のうき世をさのみなけかし
 手習 みつくきのあとはかもなきてならひになみたなからやかきなかすらん
 夢浮橋 ありなしのふたつにわたる道たえてみしはきのふの夢のうきはし
 一名法のし 色にそむこゝろのぬしをたつねみよ法のしるへはほかにやはある
以上の跋歌に現れる巻名や巻序について、若菜下巻や雲隠の扱いについてはしばしば古い時代の巻序に現れるものであるが、貌鳥や法の師については余り例が無いものの、寺本直彦による「かつて宿木巻の後半部分は宿木とは別の貌鳥という巻であり、夢浮橋巻の後半部分は夢浮橋とは別の法の師という巻であった」とする説の根拠の一つになっている。

 奥書の署名 
耕雲本の特色の一つは各巻の巻末に耕雲による奥書を持つことである。この奥書の署名の名義は巻ごとに、また同じ巻でも写本ごとに細かく異なるが、なぜそのような異なりが生じるのかは不明である。

巻序巻名高松宮家本金子元臣旧蔵本伝冷泉為清筆本1桐壺畊雲山人明魏誌畊雲山人明魏誌署名を欠く2帚木署名を欠く3空蝉耕雲上人判耕雲山人判署名を欠く4夕顔畊雲山人明魏畊雲山人明魏題畊雲山人明魏題5若紫畊雲山人畊雲散人明魏耕雲散人明魏6末摘花畊雲山人明魏判畊雲山人明魏判畊雲山人明魏7紅葉賀畊雲山人明魏題畊雲山人明魏題畊雲山人明魏題8花宴畊雲山人明魏畊雲山人明魏判畊雲山人明魏判9葵畊雲山人明魏署名を欠く10賢木畊雲山人明魏畊雲山人明魏判耕雲山人明魏判11花散里畊雲山人明魏畊雲散人判畊雲散人判12須磨畊雲山人明魏題畊雲山人明魏題畊雲山人明魏題13明石畊雲山人欠巻畊雲山人題14澪標畊雲山人耕雲散人明魏耕雲散人明魏15蓬生畊雲山人明魏畊雲山人明魏題畊雲山人明魏題16関屋畊雲山人明魏畊雲山人明魏判耕雲山人明魏判17絵合畊雲山人明魏題欠巻畊雲山人明魏題18松風畊雲山人畊雲山人判畊雲山人判19薄雲耕雲山人明魏判耕雲山人明魏判署名を欠く20朝顔畊雲山人明魏判畊雲山人明魏判耕雲山人明魏判21少女畊雲山人耕雲山人明魏題22玉鬘畊雲山人明魏畊雲山人明魏畊雲山人明魏23初音耕雲山人明魏畊雲山人判署名を欠く24胡蝶耕雲山人畊雲山人明魏題畊雲山人明魏題25蛍畊雲山人明魏耕雲山人明魏題耕雲山人明魏題26常夏畊雲山人畊雲山人明魏畊雲山人明魏27篝火畊雲山人明魏畊雲山人題畊雲山人題28野分畊雲山人畊雲散人明魏判畊雲散人明魏判29行幸耕雲山人明魏畊雲山人明魏畊雲山人明魏30藤袴耕雲山人耕雲山人明魏判署名を欠く31真木柱耕雲山人欠巻畊雲散人判32梅枝畊雲山人明魏畊雲散人題耕雲散人題33藤裏葉耕雲山人欠巻畊雲山人判34若菜上畊雲山人耕雲山人明魏青表紙本別筆35若菜下欠巻青表紙本別筆36柏木耕雲山人畊雲山人明魏判畊雲山人明魏37横笛畊雲山人判欠巻畊雲山人判38鈴虫畊雲山人明魏署名を欠く畊雲山人題39夕霧畊雲山人題畊雲山人題畊雲山人題40御法耕雲山人耕雲山人明魏畊雲山人明魏41幻畊雲山人明魏耕雲散人明魏耕雲散人明魏42匂宮耕雲山人欠巻耕雲山人判43紅梅耕雲山人欠巻耕雲山人判44竹河畊雲山人明魏畊雲山人明魏畊雲山人明魏45橋姫畊雲山人畊雲山人書署名を欠く46椎本畊雲山人題欠巻畊雲山人題47総角耕雲題青表紙本別筆48早蕨畊雲山人題畊雲山人題署名を欠く49宿木畊雲山人耕雲山人題畊雲山人題50東屋畊雲山人欠巻青表紙本別筆51浮舟耕雲山人欠巻畊雲題52蜻蛉畊雲山人明魏題欠巻耕雲題53手習畊雲山人題畊雲山人題畊雲山人題54夢浮橋畊雲山人明魏欠巻青表紙本別筆

 主要な伝本 
耕雲本とされる伝本として以下のようなものが確認されている。
高松宮家本
金子本
冷泉為清筆本
五四帖揃い本。若菜上下・総角・東屋・夢浮橋の五帖は別筆（青表紙本）、その他帚木・葵に別人の加筆がある（青表紙本）。桐壺・帚木・空蝉・葵・薄雲・初音・藤袴・橋姫・早蕨には耕雲の跋歌と署名がない。大島雅太郎旧蔵。
曼殊院本
上野図書館蔵本
蜻蛉巻のみの零本。高松宮家本からの転写本
伝二条為氏筆薄雲・朝顔
保坂潤治旧蔵本・現天理図書館蔵（善本叢書本）