コミックマーケットのジャンルコードにおいては、同人誌即売会コミックマーケットのジャンルコードの一覧を示す。コミックマーケットでは事務処理の効率化をはかるため、出展を希望するサークルを取り扱う頒布物のジャンルで分類している。サークルの出展位置や出展日はこのジャンルによって決定される。ジャンルの設定や分類は毎回、細かい変更や調整が加えられており、それらの変遷を追うことで、開催時に流行となった漫画・アニメ・ゲームといったサブカルチャーの潮流を知ることができる。

 ジャンルの設定 
ジャンルの分け方は、二次創作を中心とするサークル（FC：ファンサークル）の場合は初めて世に出た（初出）作品ごとに分かれる。例えば漫画であれば、掲載誌ごとの区切りで少年漫画・少女漫画・青年漫画に分けられる。そして「週刊少年ジャンプ」などその掲載作だけで多数のサークルが存在するものは雑誌単独のジャンルが作られ、さらに『テニスの王子様』などその時期の流行によってサークル数が多くなった単独の作品でのジャンルが分置される。

また「初出作品を元に作られた作品」はジャンルが違えど同じカテゴリに入れるという原則が存在しており、これを間違えるとジャンルの不備として扱われ、落選させられることもある。例としては「アニメが初出」のガンダムシリーズを原作とする形でメディアミックス展開された小説、漫画、ゲームを、それぞれのジャンルで（作品別に）取り扱わず、全て一律に「ガンダム」として取り扱う。

しかし、このように厳格に取り扱われるわけではなく、どの作品・題材をどのジャンルに入れるかは作品に申込サークルの傾向や参加者からのアンケート結果などにより、毎年のように細かいレベルで変更や調整が加えられている。コミックマーケット72（2006年夏）を例に取ると、競馬・競輪などの公営ギャンブルの扱いに準じて「スポーツ」ジャンルに含められていたパチンコ・パチスロが、萌えスロの流行などの理由により「ゲーム（その他）」の中に変更されている。

ジャンルごとの開催日やホール内の場所は、参加者の層（男女・年齢）が似かよっていると思われるジャンルが同じ開催日にまとめられ、ホール内の場所も近く配置されることが多いが、特定の場所に混雑が集中することを避けるため、全く違う傾向のジャンルが隣接することや、特定ジャンルの同日開催イベント（コンサートなど）に配慮して配置されることもある。カタログなどでは「お目当てのサークル以外にもいろいろ回ってみよう」と、参加者が幅広いジャンルに触れることが推奨されている（もっとも、現実的には一人で全てのスペースを回ることは困難である）。

他の企業系同人イベントと異なり、現在はジャンルの区分が曖昧な「よろず」は存在しないことになっている。ただし、一部の大手サークルは、列整理の都合上、本来の申込ジャンルの他のサークルから離れた場所・日程に配置されることがあり、カタログでは便宜上「ノンジャンル」として案内されることがある（以前は「その他」の一部として案内していたが、「その他」は「よろず」ジャンルを意味しない。#その他で後述）。「ノンジャンル」というコードが存在するわけではないので注意。

サークルの活動内容によっては、参加するジャンルを複数から選べることもある。たとえば、学校の部活動・サークルは通常は「学漫」ジャンルでの申込になるが、創作少年漫画が活動の中心なら、「創作（少年）」ジャンルで申し込んでもかまわない。比較的無名のジャンルであると、複数のジャンルに散らばってサークルが配置されることも珍しくない。

以下に一覧を記述する。なお、毎回なんらかの変更が加えられており、これまで割り当てられていたジャンルコードの統廃合による消滅などもあるため、実際に参加などをする際には参加する回の申込書セットやカタログ、公式サイトで最新のジャンルコードと過去の「配置担当者より一言」を確認のこと（なお、コミックマーケット91より全面的にジャンルコードが変更されている）。

 ジャンルコード 

 マンガ 
創作（少年） : オリジナル作品で少年漫画風のもの。青年漫画風もこことなる。
創作（少女） : オリジナル作品で少女漫画風のもの。女性漫画風もこことなる。
創作（JUNE/BL） : オリジナル作品でやおいを題材としたもの。男性向けゲイコミックもここに配置される。
学漫 : 学校の「漫画研究会」などの部活・サークルによる発行物。汎学校間組織であってもこのジャンルでの参加は可能であるが、学校名（汎学校間組織であればどういう立場で「学漫」に申し込むのか）がわからない場合、書類の不備となる。
評論・情報 : 評論と名が付けばあらゆるジャンルを内包する。ただし、アニメ・ゲーム・特撮に関する評論は、それぞれのジャンルで申し込む必要がある。幅広い分野を内包する「コミケの縮図」とも言えるジャンルであり、コミケット以外に参加しないサークルの割合が群を抜いて高いため、ここをコミケットの醍醐味とする参加者も少なくない。自主企画または企業系同人イベントの主催もここに含まれ、サブジャンル「同人イベント」は企業名義でのサークル参加が唯一許されるジャンルでもある。もし、自分のジャンルが何処になるのかわからなければこのジャンルを選び「○○の評論」と付け加えれば無難である。同人界とは縁のない一般人からは「ノンフィクション」と呼ばれるジャンル群である。なお、「その他」で申し込んだサークルは、過去の例では評論・情報に隣接、あるいは内包して配置されている。
FC（少年） : 少年漫画家・作品のファンクラブ（Fan Club） および、二次創作で少年漫画を題材としたもの。また手塚治虫、石ノ森章太郎、高橋留美子、皆川亮二の作品については題材が違えどこちらに誘導している。また、『週刊少年サンデー』『週刊少年マガジン』『週刊少年チャンピオン』の全作品はここに配置される。
留美子 C32（1987夏） - C47（1994冬）（C45以降、魔法少女と統合）
弱虫ペダル C91（2016冬） - C95（2018冬）：舞台版・実写ドラマ版が題材になっているものはここではなく「TV・映画・芸能」に分類される。
進撃の巨人 C91（2016冬） - C98（2020GW）：作品の完結が近づいたとして統合された。
ダイヤのA C91（2016冬） - C93（2017冬）
名探偵コナン C96（2019夏） - C105（2024冬）：その他の青山剛昌作品もここに含まれる。
FC（少女） : 少女漫画家・作品のファンクラブおよび、二次創作で少女漫画を題材としたもの。FC（女性）のジャンルコードが存在しないため、女性漫画を題材としたものもこちらに含まれた。C91からは「FC（少女・青年）」に統合。
FC（青年） : 青年漫画家・作品のファンクラブおよび、二次創作で青年漫画を題材としたもの。『まんがタウン』や『まんがタイムグループ』といった4コマ漫画も概ねこちらに配置される。C91からは「FC（少女・青年）」に統合。
FC（少女・青年） :FC（少女）とFC（青年）を統合したジャンルコード。C91（2016年冬）から使用開始。
ヘタリア C77（2009冬） - C99（2021冬）：C100からは「FC（ジャンプその他）」に統合。
血界戦線 C91（2016冬） - C96（2019夏）：FC（ジャンプその他）に誤って申込むことが多発したことから、独立した。その他の内藤泰弘作品もここに含まれる。C97からは「FC（ジャンプその他）」に統合。
FC（ガンガン） : 『ヤングガンガン』もここに含まれていた。衰退に伴いC90で廃止され、C91より「FC（少年）」に統合。
鋼の錬金術師 C67（2004夏） - C79（2010冬）
FC（ジャンプその他） : 単体コードがある作品を除いて、すべてのジャンプ系少年誌と青年誌では『ジャンプスクエア』（統合前では『スーパージャンプ』）掲載作がこのジャンル。また、ジャンプではないが『コミックバンチ』掲載作もこのジャンルになる。ただし、ジャンプ系青年誌のうち『週刊ヤングジャンプ』『ウルトラジャンプ』『グランドジャンプ』掲載作はFC（青年）として扱われる。
星矢 C32（1987夏） - C49（1995冬）
C翼 C32（1987夏） - C57（1999冬）
幽遊白書 C45（1993冬） - C63（2002冬）:『レベルE』や『HUNTER×HUNTER』もここに含まれる。C57（1999冬）からは冨樫義博にコード名および番号を変更。
SLAM DUNK C46（1994夏） - C63（2002冬）
FC（ジャンプ球技） : C64（2003夏） - C76（2009夏）・C85（2013冬） : 「SLAM DUNK」のコードを解体するに当たり、当時サークル数は多いものの単体でコードを作るには至らない、球技を主な題材とした週刊少年ジャンプ掲載作を1つのジャンルとすることで成り立った。
ワンピース C59（2000冬） - C87（2014冬）
NARUTO C60（2001夏） - C87（2014冬）
テニスの王子様 C63（2002冬） - C90（2016夏）: ミュージカル作品が題材になっているものはここではなく「TV・映画・芸能」に分類される。
銀魂 C72（2007夏） - C90（2016夏）
REBORN! C72（2007夏） - C87（2014冬）
ワールドトリガー C91（2016冬） - C96（2019夏）
黒子のバスケ C91（2016冬） - C99（2021冬）：C83（2012冬）は脅迫事件の影響で頒布が規制された。
ハイキュー!! C91（2016冬） - C99（2021冬）

 ゲーム 
同人ソフト : オリジナル・二次創作問わず、ソフトウェア、ハードウェアでの頒布の場合このジャンルになる。同人ソフトを題材にした二次創作（同人の同人）もこのジャンルになる。
東方Project C76（2009夏） - : サークル数の増大に伴い「同人ソフト」から分割された。東方Projectに関するありとあらゆる創作（同人ソフト、グッズ、イラスト、漫画、音楽アレンジ、コスプレなど）を扱う。
デジタル（その他） : ビデオ・CD・レコードなどの媒体頒布。VOCALOID及びそれを題材とした二次創作、2ちゃんねるやニコニコ動画などのネット上のコンテンツ、YouTuberやニコニコ生放送の生主を始めとする動画配信者とそれに対するファン活動もこちらに入る。Sound Horizonは元々は当ジャンルでの扱いであったが、C97から「アニメ（その他）」に移動。注意点として、日本音楽著作権協会（JASRAC）を始めとする音楽著作権管理団体が管理する楽曲のアレンジ・カバーを施した作品を頒布する場合は、管理団体への届出を行う必要がある。
コスプレ C82（2012夏） - : コスプレ写真集やコスプレ用衣装・アクセサリーを頒布する場合、こちらに該当する。
VTuber C98（2020GW） -：VTuberの配信者本人だけでなく、VTuberを元にしたファン活動も対象になる。
ギャルゲー : エロゲーもこのジャンルになる。
Leaf&Key C60(2001夏) - C85(2013冬): Leafのブランド元であるアクアプラスや、過去の経緯からTacticsの『同棲』、『MOON.』、『ONE 〜輝く季節へ〜』も含まれる。また、テレビアニメ『Angel Beats!』もこのジャンルに含む。
TYPE-MOON C68（2005夏） - :『月姫』など、法人化以前の（同人作品として発表された）作品も「同人ソフト」からこちらに移された。『Fate/Grand Order』もこのジャンルの管轄となる。
アイドルマスター C91（2016冬） - ：『SideM』は「ゲーム（恋愛）」→「ゲーム（ソーシャル女性向）」となるが、このジャンルでも申し込み可能。
ラブライブ! C91（2016冬） - ：『サンシャイン!!』（及び『幻日のヨハネ』）『虹ヶ咲学園スクールアイドル同好会』『スーパースター!!』『蓮ノ空女学院スクールアイドルクラブ』も含まれる。『スクールアイドルミュージカル』も「TV・映画・芸能・特撮」ではなく本ジャンルの管轄となる。
ゲーム（その他） : パチンコやパチスロもこのジャンルになる。
ゲーム（格闘） C48（1995夏） - C81（2011冬）
ゲーム（歴史） C73（2007冬） - C90（2016夏）: 『三國志シリーズ』・『信長の野望シリーズ』などのシミュレーションゲーム、『無双シリーズ』・『戦国BASARAシリーズ』といったアクションゲームなど、ジャンルは問わない。C90（2016夏）でゲーム（その他）に統合。
ゲーム（電源不要） : カードゲーム、テーブルトークRPGや『モノポリー』や『人生ゲーム』などの市販ボードゲーム、リアル脱出ゲームなど。自主制作のアナログゲームそのものもこのジャンルになる。カジノゲームは含まれない。囲碁・将棋・麻雀・プレイバイEメール・プレイバイウェブはC91（2016年冬）からこのジャンルに指定されている。
ゲーム（ネット・ソーシャル）: C90までは「オンラインゲーム」であった。MMORPG、ソーシャルゲーム、ブラウザゲームがこのカテゴリ。ただしC83（2012年冬）以降、スクウェア・エニックス関連の『ファイナルファンタジーシリーズ』などは「スクウェア・エニックス（RPG）」とされる。
艦これ C86（2014年夏） - : 「東方Project」同様、サークル数の増大に伴い「オンラインゲーム」から分割された。
アズールレーン C95（2018年冬） - ：「艦これ」同様、サークル数の増大に伴い「ゲーム（ネット・ソーシャル）」から分割。
ウマ娘 C101（2022年冬） - ：上記2ジャンル同様にサークル数の増大に伴い「ゲーム（ネット・ソーシャル）」から分割。なお、本ジャンルにおいて性的描写を含む作品の頒布は、公式の二次創作ガイドラインにより禁止されている。
ブルーアーカイブ C103（2023年冬） - ：上記ジャンル同様にサークル数の増大に伴い「ゲーム（ネット・ソーシャル）」から分割。
ゲーム（RPG）
スクウェア・エニックス（RPG） : C82（2012年夏）までは『FF11』などは「オンラインゲーム」とされた。『ドラゴンクエストシリーズ』もこちらに含まれる。注意点として、『いただきストリート』シリーズや『ガンスリンガー ストラトス』など、RPGではない作品は「ゲーム（その他）」として扱われる。
 ゲーム（恋愛・ソーシャル女性向） C100（2020冬） - ：「ゲーム（恋愛）」と「ゲーム（ソーシャル女性向）」を統合し、名称を変更。
 ゲーム（恋愛） C50（1996夏） - C99（2021冬）：発足当時は「ゲーム（育成）」であったが、C60（2001年夏）より名称変更。主に乙女ゲームなど女性向けのものを取り扱い、男性向けは「ギャルゲー」などになる。同人ゲームでも内容が女性向けの場合こちらに申し込むことが推奨されているが、サークル参加者が望む場合は同人ソフトで申し込むことも可能である。
刀剣乱舞 C89(2015冬) - : 「東方Project」「艦これ」同様、サークル数の増大に伴い「ゲーム（恋愛）」から分割された。
ゲーム（ソーシャル女性向） C93（2017冬） - C99（2021冬）：ソーシャルゲームのうち男性キャラ（男性アイドル等）中心など女性向けの作品はこちらで扱う。『ディズニー ツイステッドワンダーランド』も暫定的にここに配置される。
あんさんぶるスターズ! C91（2016冬） - C98（2020GW）：サークル数の増大に伴い「ゲーム（恋愛）」から分割された。

 男性向 
男性向創作 : 成人男性を主たる頒布対象とし、性描写に重きを置く頒布の場合このジャンルとなる。原作作品によってジャンルが分けられている他ジャンルと異なり、創作、アニメ、ゲームの区別なく一つのジャンルコードが割り当てられている（下の3つは便宜上の区分であり、カタログ上はいずれも「男性向創作」として案内される）。ジャンルの性格上、同じ原作の二次創作を扱うサークルが当ジャンルとそれぞれの作品に対応するジャンルとに分かれていることも多い。C96からC98は会場の規模縮小と4日間開催にともない、3日目と4日目に振り分けられる。
創作（男性向） : 頒布物がオリジナルのいわゆる成人向け漫画であるもの（第1号は無気力プロが1979年に創刊した『シベール』とされる）。
アニメ（男性向） : アニメの二次創作で内容が成人向けのもの。
ゲーム（男性向） : ゲームの二次創作で内容が成人向けのもの。独立したジャンルコードがある作品でも成人向けの場合はこのジャンルとなる。

 アニメ 
アニメ（その他） : 声優のファンサークルもこのジャンルになる。『ポケットモンスター』及びその関連作品は初出がゲームであるがこのジャンル。
魔法少女 C42（1992夏） - C49（1995冬）（C42のみ、ナディア・魔法少女） : アニメが初出の魔法少女作品を扱う。そうでないものはそれぞれのジャンルで取り扱う。本来『プリキュアシリーズ』や『魔法少女まどか☆マギカ』（『マギアレコード』などの外伝作品も含む）はこのジャンルに入るはずであったが、当ジャンルはすでに消滅していたため、当初は「アニメ（その他）」、その後「アニメ（少女）」となった。
セーラームーン C48（1995夏） - C55（1998冬）
アニメ（少年） C50（1996夏） - C59（2000冬）
アニメ（少女） C50（1996夏） - C67（2004夏）、C94（2018夏） - ：『プリキュアシリーズ』『プリティーシリーズ』（『キンプリ』は「アニメ（その他）」扱い）『アイカツ!シリーズ』等の少女向けアニメのほか、対象を問わずアニメが初出の魔法少女作品も含む。C68で「アニメ（その他）」に統合されたが、C94より再分割された。
おそ松さん C91（2016冬） - C96（2019夏）：サークル数の増大に伴い「アニメ（その他）」から分割されていた。『おそ松くん』は「FC（少年）」扱い。
ユーリ C93（2017冬） - C101（2022冬）：サークル数の増大に伴い「アニメ（その他）」から分割されていた。
ガルパン C94（2018夏） - 
アニメ（サンライズ） C60（2001夏） - C91（2016冬）: 『スーパーロボット大戦』もこのジャンルになる。『アイカツ!』については始めから「アニメ（その他）」として扱われていた。
トルーパー C36（1989夏） - C57（1999冬）
TIGER & BUNNY C82（2012夏） - C105（2024冬）
ガンダム C49（1995冬） -

 小説 
FC（小説） : ライトノベルを題材にした二次創作など。池井戸潤・有川浩などの小説作品、夏目漱石・太宰治などの文学作品についてもここで扱う。ただし、『文豪ストレイドッグス』は「FC（少女・青年）」、『文豪とアルケミスト』は「ゲーム（ソーシャル女性向）」として扱う。