1988年-1989年のJSL（第24回日本サッカーリーグ1部および第17回日本サッカーリーグ2部）は、1部が1988年9月23日から1989年5月1日まで、2部が1988年9月15日から1989年4月29日まで行われた。

優勝は、1部が日産自動車サッカー部で2部が東芝サッカー部であった。

 JSL1部 

このシーズンから勝ち点制度が変更され、勝利は3、引き分けは1になった（従来は勝利に2、引き分けに1）。引き分けの価値を低くし、積極的な試合を増やすという狙いがあった。

日産が開幕から11連勝して前期終了時点で独走状態に入った。しかしヤマハとの後期開幕戦を1-2で落として連勝が終わり、その後も鳴かず飛ばずで後期は3勝4分4敗という成績だった。一時期は2位以下のチームに僅差にまで追い上げられたが、4月26日、三ツ沢球技場での本田技研戦に1-0で勝利して初優勝を決めた。日産は前年に加入した元ブラジル代表キャプテンのオスカーを中心とした守備が固く、スポーツニッポン社が制定してこの年から始まった最優秀選手賞には柱谷哲二が選ばれた。

1989年2月26日に国立競技場で行われた読売クラブ対三菱重工、日産対ヤマハのダブルヘッダーによる後期開幕戦は、リーグ活性化のために入場料を無料とし、事前に入念な宣伝を行った。その結果、試合当日は雨が降り寒い気候だったにもかかわらず、4万1000人を集め、21年ぶりにリーグ記録を更新した（従来の記録は1968年の三菱重工対ヤンマーの4万人）。

 大会概要 
 開催期間：1988年9月23日-1989年5月1日。
 勝ち点制度変更：勝3 分1 敗0

 参加クラブ 
このシーズンから日本鋼管サッカー部が会社の名称変更によりNKKサッカー部に名称を変更した。

 ヤマハ発動機サッカー部
 NKKサッカー部
 三菱重工業サッカー部
 日産自動車サッカー部
 読売サッカークラブ
 ヤンマーディーゼルサッカー部
 古河電気工業サッカー部
 本田技研工業サッカー部
 フジタ工業クラブサッカー部
 住友金属工業蹴球団
 全日空サッカークラブ
 松下電器産業サッカー部

 成績 

 年間順位 

順位クラブ勝点勝利 引分 敗戦 得点 失点 得失差1位日産自動車4614443217+152位全日空クラブ4012463722+153位ヤマハ発動機3912373121+104位フジタ工業3610663420+145位読売クラブ328862523+26位古河電工298592119+27位松下電器298592630-48位ヤンマー287782322+19位本田技研工業277692023-310位NKK1931091731-1411位住友金属1947111237-2512位三菱重工14111101427-13

 優勝・アジアクラブ選手権出場 自動降格

 住友金属（JSL1部11位）と三菱重工（JSL1部12位）はJSL2部へ自動降格。
 東芝（JSL2部優勝）と日立製作所（JSL2部準優勝）はJSL1部へ自動昇格。

 得点ランキング 

 順位 選手名 所属クラブ 得点数1 アディウソン ヤマハ発動機112 前田治 全日空クラブ103 柱谷幸一 日産自動車9 小林幸一 フジタ工業 山口正信 松下電器 草木克洋 ヤンマー7 木村和司 日産自動車88 アンドレヤマハ発動機7 黒崎久志本田技研10 浜田秀樹全日空クラブ6 ハインズ フジタ工業 菅野将晃古河電工

 アシストランキング 

 順位 選手名 所属クラブ アシスト数1 和田昌裕 松下電器9 2 水沼貴史 日産自動車8 ホルヘ 全日空クラブ 後藤義一 古河電工5 ハインズ フジタ工業76 松浦敏夫 NKK67 ロペス 日産自動車5 前田治全日空クラブ 吉田光範ヤマハ発動機 矢藤敏則本田技研

 表彰 

 賞 選手名 所属クラブ 受賞回数得点王 アディウソン ヤマハ発動機初アシスト王 和田昌裕 松下電器得点王 ゴールデンボール賞 アディウソン ヤマハ発動機アシスト王 シルバーボール賞 和田昌裕 松下電器最優秀選手賞 柱谷哲二 日産自動車新人王 前田治 全日空クラブ_ベストGK賞 松永成立 日産自動車初 年間優秀11人賞 松永成立 オスカー 2 堀池巧 読売クラブ 初 モネール 全日空クラブ 佐野達 日産自動車 2 和田昌裕 松下電器 初 水沼貴史 日産自動車 4 木村和司 長谷川健太 初 前田治 全日空クラブ 柱谷幸一 日産自動車 3

 JSL2部 

 JSL2部大会概要 
今シーズンから2部も1部同様のシーズン表記へ改められた。
 前期：16チームを東西ブロックに分け、2回戦のリーグ戦で行われた。
 後期：前期の東西ブロックそれぞれの上位4チーム（計8チーム）で上位リーグを行い、下位4チーム（計8チーム）を東西ブロックに分け下位リーグを行う。
 下位リーグ順位決定戦：下位リーグの東西ブロックそれぞれの1-4位が直接対決により、9・10位、11・12位、13・14位、15・16位決定戦を行った。
 開催期間：
前期 1988年9月19日-12月4日
後期・上位リーグ 1989年1月28日-4月29日
後期・下位リーグ 1989年1月28日-3月5日
順位決定戦 1989年3月11日-3月12日

 JSL2部参加クラブ 
このシーズンから川崎製鉄水島サッカー部が川崎製鉄サッカー部に名称を変更した。

 マツダサッカークラブ
 トヨタ自動車サッカー部
 東芝サッカー部
 日立製作所サッカー部
 NTT関東サッカー部
 田辺製薬サッカー部
 コスモ石油サッカー部
 川崎製鉄サッカー部
 新日本製鐵サッカー部
 富士通サッカー部
 東邦チタニウムサッカー部
 大阪ガスサッカー部
 甲府サッカークラブ
 NTT関西サッカー部
 帝人サッカー部
 藤枝市役所サッカー部

 JSL2部成績 

 JSL2部年間順位 
順位クラブ1位東芝2位日立製作所3位田辺製薬4位富士通5位マツダ6位トヨタ自動車7位NTT関東8位大阪ガス9位甲府クラブ10位新日本製鐵11位コスモ石油12位川崎製鉄13位帝人14位東邦チタニウム15位NTT関西16位藤枝市役所
1位-8位は上位リーグ、9位-16位は下位リーグ・順位決定戦の結果による。

 自動昇格 自動降格

 前期 

 東ブロック 

順位クラブ勝点勝利 引分 敗戦 得点 失点 得失差 1 東芝 23950387+31 2 富士通 208422213+9 3 日立製作所 19752189+9 4 NTT関東 166441612+4 5 甲府クラブ 147071924-5 6 東邦チタニウム 93381024-14 7 コスモ石油 82481325-12 8 藤枝市役所 31112729-22

 西ブロック 

順位クラブ勝点勝利 引分 敗戦 得点 失点 得失差 1 マツダ 22941246+18 2 トヨタ自動車 21851278+19 3 田辺製薬 198332011+9 4 大阪ガス 187432018+2 5 新日本製鐵 124461619-3 6 川崎製鉄 8167815-7 7 帝人 82481832-14 8 NTT関西 41211731-24

 後期 

 上位リーグ 

順位クラブ勝点勝利 引分 敗戦 得点 失点 得失差 1 東芝 218512010+10 2 日立製作所 18824139+4 3 田辺製薬 176531713+4 4 富士通 166441615+1 5 マツダ 14545169+7 6 トヨタ自動車 125271818±0 7 NTT関東 123651820-2 8 大阪ガス 20212529-24

 下位リーグ・東ブロック 

順位クラブ勝点勝利 引分 敗戦 得点 失点 得失差 1 甲府クラブ 209292429-5 2 コスモ石油 176592530-5 3 東邦チタニウム 1345111733-16 4 藤枝市役所 824141138-27

 下位リーグ・西ブロック 

順位クラブ勝点勝利 引分 敗戦 得点 失点 得失差 1 新日本製鐵 207672525±0 2 川崎製鉄 1421081522-7 3 帝人 1345112642-16 4 NTT関西 933141742-25

下位リーグの成績は前期からの累計

 下位リーグ順位決定戦 

 名称 東ブロック スコア 西ブロック 9・10位決定戦 甲府クラブ 1-1(PK3-1) 新日本製鐵 11・12位決定戦 コスモ石油 0-0(PK3-2) 川崎製鉄 13・14位決定戦 東邦チタニウム 2-3 帝人 15・16位決定戦 藤枝市役所 0-3 NTT関西

 東芝と日立がJSL1部昇格。
 NTT関西と藤枝市役所が地域リーグ降格。
 マツダオート広島サッカー部（地域リーグ優勝）と京都紫光サッカークラブ（地域リーグ準優勝）がJSL2部昇格。

 JSL2部表彰 
 賞 選手名 所属クラブ 備考 得点王 カルバネッセ 東芝 22得点 アシスト王 ペレス 9アシストベスト11 ディド・ハーフナー マツダ 石崎信弘 東芝 西野朗 日立製作所 沖宗敏彦 富士通 信藤克義 マツダ 八木裕二 東芝 ゼ・セルジオ 日立製作所 沈祥福 富士通 カルバネッセ 東芝 向島建 呂洪祥 富士通 
得点ランキング、アシストランキングは前後期（東西・上位下位）通算であったが、個人タイトルとしては表彰されなかった。