全国厚生農業協同組合連合会（ぜんこくこうせいのうぎょうきょうどうくみあいれんごうかい）は、都道県および郡における厚生農業協同組合連合会（JA厚生連）の全国組織たる農業協同組合連合会である。略称、JA全厚連。昭和23年に設立された全国厚生文化農業協同組合連合会が前身。
会員数は36組合。各厚生連は、農山村地域を中心に105の病院と60の診療所を持ち（大阪府や京都府、一部の県には存在しない）、医療法第31条に規定する公的医療機関の開設者として地域の中核医療施設となっているものも多い。平成29年9月28日に設立された「地域医療を守る病院協議会」に当初から加盟している。

 事業 
組合員・地域住民に対する保健・医療・高齢者福祉

病院・診療所等の医療施設や保健施設の設置・運営
訪問看護・デイサービス・ショートステイ等の在宅サービスの実施など

 病院の一覧 
JA厚生連は原則として都道府県単位で設置されるが、栃木県では地域単位で設けられている厚生連もある。一覧
 都道府県 所轄厚生連（略称）設置病院・診療所その他の設置施設北海道JA北海道厚生連旭川厚生病院
帯広厚生病院
札幌厚生病院
札幌厚生病院共済クリニック
遠軽厚生病院
網走厚生病院
倶知安厚生病院
摩周厚生病院
むかわ町鵡川厚生病院
（2008年3月1日開設、公設民営、設置者はむかわ町、JA北海道厚生連が指定管理者を受託）
美深厚生病院
常呂厚生病院
まるせっぷ厚生クリニック
ゆうゆう厚生クリニック
沼田厚生クリニック
苫前厚生クリニック特別養護老人ホーム摩周
特別養護老人ホームところ
小清水町特別養護老人ホーム愛寿苑
旭川厚生看護専門学校岩手県JA岩手県厚生連岩手県厚生連診療所人間ドックセンター
介護老人保健施設ハートフルもりおか秋田県JA秋田厚生連かづの厚生病院（鹿角市）
北秋田市民病院（北秋田市）(2010年4月開院、公設民営、設置者は北秋田市、JA秋田厚生連が指定管理者を受託)
能代厚生医療センター（能代市）
湖東厚生病院（八郎潟町）
秋田厚生医療センター（秋田市）
由利組合総合病院（由利本荘市）
大曲厚生医療センター（大仙市）
平鹿総合病院（横手市）
雄勝中央病院（湯沢市）福島県JA福島厚生連白河厚生総合病院
塙厚生病院
高田厚生病院
坂下厚生総合病院
鹿島厚生病院
双葉厚生病院
福島県農協会館診療所茨城県JA茨城県厚生連総合病院水戸協同病院
県北医療センター高萩協同病院
総合病院土浦協同病院
なめがた地域医療センター（旧・なめがた地域総合病院）
土浦協同病院附属真鍋診療所
JAとりで総合医療センター
茨城西南医療センター病院
茨城西南医療センター病院附属八千代診療所土浦協同病院附属看護専門学校栃木県JAかみつが厚生連上都賀総合病院老人保健施設かみつがJA佐野厚生連佐野厚生総合病院群馬県JA群馬厚生連JA群馬厚生連検診センター千葉県JA千葉厚生連千葉県厚生連検診室東京都JA東京厚生連厚生連クリニック神奈川県JA神奈川県厚生連相模原協同病院
伊勢原協同病院
保健福祉センター内診療所介護老人保健施設ほほえみの丘新潟県JA新潟厚生連糸魚川総合病院
けいなん総合病院
上越総合病院
柏崎総合医療センター（旧刈羽郡総合病院）
中条病院（廃院）
メンタルケア中条
小千谷総合病院（旧魚沼病院が公益財団法人小千谷総合病院と統合し、発展的解消）
長岡中央綜合病院
三条総合病院
新潟医療センター
豊栄病院
村上総合病院
瀬波病院
佐渡総合病院
羽茂病院
あがの市民病院
栃尾郷クリニック中央看護専門学校
佐渡看護専門学校富山県JA富山厚生連厚生連高岡病院
厚生連滑川病院高岡健康管理センター
高岡訪問看護ステーション
滑川健康管理センター福井県JA福井県厚生連福井県厚生連巡回診療所山梨県JA山梨厚生連JA山梨厚生連健康管理センター長野県JA長野厚生連佐久総合病院
佐久総合病院佐久医療センター
佐久総合病院小海分院
佐久総合病院小海診療所
浅間南麓こもろ医療センター
浅間南麓こもろ医療センター附属美里診療所
北アルプス医療センターあづみ病院
北アルプス医療センターあづみ病院附属白馬診療所
北アルプス医療センターあづみ病院附属メンタルケアセンターあずみ
北アルプス医療センターあづみ病院附属あるぷすメンタルクリニック
長野松代総合病院
長野松代総合病院附属若穂病院
長野松代総合病院附属ちくま診療所
北信総合病院
北信総合病院附属北信州診療所
鹿教湯三才山リハビリテーションセンター鹿教湯病院
鹿教湯三才山リハビリテーションセンター三才山病院
鹿教湯三才山リハビリテーションセンター鹿教湯病院附属豊殿診療所
南長野医療センター新町病院
南長野医療センター篠ノ井総合病院
富士見高原医療福祉センター富士見高原病院
富士見高原医療福祉センター中新田診療所
富士見高原医療福祉センターみすず診療所
富士見高原医療福祉センターみづうみ診療所
富士見高原医療福祉センター両小野診療所
下伊那厚生病院長野PET・画像診断センター
佐久総合病院健康管理センター
佐久総合病院看護専門学校
佐久総合病院老人保健施設
佐久総合病院老人保健施設「こうみ」
浅間南麓こもろ医療センター老人保健施設「こまくさ」
北信総合病院老人保健施設「もえぎ」
鹿教湯三才山リハビリテーションセンター介護療養型老人保健施設「いずみの」
富士見高原医療福祉センター老人保健施設「あららぎ」
富士見高原医療福祉センター老人保健施設「すずたけ」
富士見高原医療福祉センター老人保健施設「さくらの」
富士見高原医療福祉センター老人保健施設「みづうみ」岐阜県JA岐阜厚生連久美愛厚生病院
東濃厚生病院
中濃厚生病院
揖斐厚生病院
岐北厚生病院
西美濃厚生病院
高山厚生病院JA岐阜厚生連看護専門学校静岡県JA静岡厚生連JA静岡厚生連遠州病院
JA静岡厚生連静岡厚生病院
JA静岡厚生連清水厚生病院
JA静岡厚生連リハビリテーション中伊豆温泉病院介護老人保健施設きよみの里
静岡県厚生連看護専門学校
静岡県厚生連するが看護専門学校（2012年4月開校）愛知県JA愛知厚生連安城更生病院
渥美病院
江南厚生病院
海南病院
豊田厚生病院
稲沢厚生病院
足助病院
知多厚生病院
知多厚生病院附属篠島診療所JAあいち健診センター
介護老人保健施設あおみ
あつみの郷介護老人保健施設
更生看護専門学校
愛北看護専門学校
加茂看護専門学校三重県JA三重厚生連松阪中央総合病院
鈴鹿中央総合病院
三重北医療センター菰野厚生病院
三重北医療センターいなべ総合病院
大台厚生病院
南島メディカルセンター
鈴鹿厚生病院滋賀県JA滋賀厚生連滋賀県厚生連巡回診療所兵庫県JA兵庫厚生連農業会館診療所島根県JA島根厚生連島根県厚生連巡回診療所岡山県JA岡山厚生連岡山県厚生連診療所広島県JA広島厚生連尾道総合病院
吉田総合病院
廣島総合病院
高田地区休日夜間救急診療所山口県JA山口厚生連周東総合病院
長門総合病院
小郡第一総合病院徳島県JA徳島厚生連阿南医療センター（令和元年5月1日、阿南共栄病院と阿南中央病院を統合・合併）
吉野川医療センター
阿波病院 香川県JA香川厚生連屋島総合病院
滝宮総合病院愛媛県JA愛媛厚生連愛媛県厚生連健診センター高知県JA高知厚生連JA高知病院熊本県JA熊本厚生連熊本県厚生連診療所大分県JA大分県厚生連大分県厚生連鶴見病院
大分県厚生連しおはま診療所健康管理センター
老健施設シェモア鶴見
老健施設しおはま鹿児島県JA鹿児島県厚生連鹿児島厚生連病院

 かつて存在した厚生連 

 都道府県 所轄厚生連（略称） 廃止経緯設置していた病院・診療所その他の設置施設島根県津和野町JA石西厚生連2008年12月破産申請津和野共存病院（⇒ 町に施設を売却、医療法人橘井堂が指定管理者として運営を受託）
日原診療所（同上）（ほか2つの介護施設）栃木県JA栃木厚生連2013年4月解散下都賀総合病院（2013年4月新法人 とちぎメディカルセンターに譲渡、⇒現在移転してとちぎメディカルセンター しもつが）
石橋総合病院（2013年4月「医療法人社団友志会」に譲渡）
塩谷総合病院（2009年に国際医療福祉大学に譲渡、⇒現国際医療福祉大学 塩谷病院）埼玉県JA埼玉県厚生連2016年7月に自己破産熊谷総合病院（⇒現・社会医療法人 熊谷総合病院）
久喜総合病院（旧幸手総合病院を移転）（⇒現・社会医療法人巨樹の会 新久喜総合病院）