スペイン領フィリピン総督（スペインりょうフィリピンそうとく、）とは、1565年から1898年まで設置されていたスペイン統治時代のフィリピン（スペイン領東インド）における行政長官である。

 ヌエバ・エスパーニャ下の総督（1565年 - 1761年） 
1565年から1898年までフィリピンはスペイン統治下にあった。1565年から1821年までフィリピン総督は国会の推薦に基づきヌエバ・エスパーニャ副王によって任命され、スペイン国王の名代としてフィリピンを統治した。総督の死亡や総督交代などで総督職に空白が生じた場合はマニラのアウディエンシアがそのメンバーの中から新総督の着任まで総督代理を立てた。

1821年にフィリピン総督はヌエバ・エスパーニャ副王の管轄下ではなくなり、以前ヌエバ・エスパーニャ副王が果たしていた役割はマドリード政府が直接担うこととなり、フィリピン総督はスペイン国王直属の存在となった。

 
 代数 肖像 氏名 就任日 退任日ヌエバ・エスパーニャ副王 スペイン王 1 ミゲル・ロペス・デ・レガスピ<small>(Miguel López de Legazpi) 1565年4月27日 1572年8月20日(1564年8月1日 – 1566年10月19日)フェリペ2世(Felipe II)ハプスブルグ家 (1554年7月25日 – 1598年9月13日)第3代ガストン・デ・ペラルタ(1566年10月19日 – 1567年11月11日)(1567年11月11日 – 1568年4月)(1568年4月 – 1568年4月14日)(1568年4月14日 – 1568年11月4日)マルティン・エンリケス・デ・アルマンサ(1568年11月5日 – 1580年10月4日) 2 <small>(Guido de Lavezaris ) 1572年8月20日 1575年8月25日 3 <small>(Francisco de Sande Picón) 1575年8月25日 1580年4月4<small>(Gonzalo Ronquillo de Peñalosa)1580年4月1583年3月10日第5代ロレンソ・スアレス・デ・メンドーサ(1580年10月4日 – 1583年6月19日)5 <small>(Diego Ronquillo)1583年3月10日1584年5月16日(1583年6月19日 – 1584年9月24日)6<small>(Santiago de Vera)1584年5月16日1590年5月ペドロ・モヤ・デ・コントレラス()(1584年9月25日 – 1585年10月17日)初代アルバロ・マンリケ・デ・スニガ (1585年10月17日 – 1590年1月27日) 7<small>(Gómez Pérez das Mariñas y Ribadeneira) 1590年6月1日 1593年10月25日初代ルイス・デ・ベラスコ・イ・カスティーリャ(1590年1月27日 – 1595年11月5日)8<small>(Pedro de Rojas) 1593年10月 1593年12月3日9<small>(Luis Pérez Dasmariñas y Páez de Sotomayor)1593年12月3日1596年7月14日第5代ガスパール・デ・スニガ・アセベド・イ・ベラスコ(1595年11月5日 – 1603年10月27日) 10 <small>(Francisco de Tello de Guzmán) 1596年7月14日 1602年5月フェリペ3世(Felipe III)ハプスブルグ家 (1598年9月13日 – 1621年3月31日)11<small>(Pedro Bravo de Acuña)1602年5月1606年6月24日第3代フアン・デ・メンドーサ・イ・ルナ(1603年10月27日 – 1607年7月2日)12<small>(Cristóbal Téllez de Almazán)1606年6月24日1608年6月15日初代ルイス・デ・ベラスコ・イ・カスティーリャ(1607年7月2日 – 1611年6月19日) 13 ロドリゴ・デ・ビベロ・イ・アベルサ(Rodrigo de Vivero y Aberrucia)
| style="background:lightgrey;" | 1608年6月15日
| style="background:lightgrey;" | 1609年4月
|-
! rowspan="4" |14
| rowspan="4" |
| rowspan="4" |
| rowspan="4" |1609年4月
| rowspan="4" |1616年4月19日
|- style="background:lightgrey;"
|フランシスコ・ガルシア・ゲラ()(1611年6月19日 – 1612年2月22日)
|- style="background:gold;"
|(1612年2月22日 – 1612年10月18日)
|-
| rowspan="3" |初代ディエゴ・フェルナンデス・デ・コルドバ(1612年10月18日 – 1621年3月14日)
|- style="background:gold;"
! 15
| 
| 
| 1616年4月19日
| 1618年7月3日
|-
! rowspan="3" | 16
| rowspan="3" | 
| rowspan="3" | 
| rowspan="3" | 1618年7月3日
| rowspan="3" | 1624年7月
|-
| style="background:gold;" |パス・デ・バジェシージョ(1621年3月14日 – 1621年9月11日)
| rowspan="20" |フェリペ4世Felipe IVハプスブルク家 (1621年3月31日 – 1665年9月17日)
|-
| rowspan="2" |初代ヘルベス侯爵(1621年9月12日 – 1624年11月1日)
|- style="background:gold;"
! rowspan="2" | 17
| rowspan="2" | 
| rowspan="2" | ジェロニモ・デ・シルバ
| rowspan="2" | 1624年7月
| rowspan="2" | 1625年6月
|-
| rowspan="6" |3代(1624年11月3日 – 1635年9月16日)
|- style="background:lightgrey;"
! 18
| 
| 
| 1624年7月
| 1626年6月29日
|-
! 19
| 
| 
| 1626年6月29日
| 1632年7月22日
|- style="background:gold;"
! 20
| 
| ロレンソ・デ・オラサ・イ・レクバリ
| 1632年7月22日
| 1633年
|- style="background:lightgrey;"
! 21
|
|
| 1633年8月29日
| 1635年6月25日
|-
! rowspan="5" | 22
| rowspan="5" | 
| rowspan="5" | 
| rowspan="5" | 1635年6月25日
| rowspan="5" | 1644年8月11日
|-
|(1635年9月16日 – 1640年8月28日)
|-
|7代(1640年8月28日 – 1642年6月10日)
|- style="background:lightgrey;"
|フアン・デ・パラフォクス・イ・メンドーサ(プエブラ司教)(1642年6月10日 – 1642年11月23日)
|-
| rowspan="2" |2代(1642年11月23日 – 1648年5月14日)
|-
! rowspan="4" | 23
| rowspan="4" |
| rowspan="4" |
| rowspan="4" | 1644年8月11日
| rowspan="4" | 1653年7月25日
|- style="background:lightgrey;"
|()(1648年5月15日 – 1649年4月22日)
|- style="background:gold;"
|マティアス・デ・ペラルタ(1649年4月22日 – 1650年6月28日)
|-
|9代(1650年6月28日 – 1653年8月15日)
|-
! rowspan="2" | 24
| rowspan="2" | 
| rowspan="2" |
| rowspan="2" | 1653年7月25日
| rowspan="2" | 1663年9月8日
|8代(1653年8月15日 – 1660年9月16日)
|-
| rowspan="2" |5代(1660年9月16日 – 1664年6月29日)
|-
! rowspan="3" | 25
| rowspan="3" | 
| rowspan="3" |
| rowspan="3" | 1663年9月8日
| rowspan="3" | 1668年9月28日
|-
| style="background:lightgrey;" |()(1664年6月29日 – 1664年10月15日)
| rowspan="15" |カルロス2世ハプスブルク家 (1665年9月17日 – 1700年11月1日)
|-
| rowspan="3" |2代(1664年10月16日 – 1673年11月20日)
|- style="background:lightgrey;"
! 26
| 
|
| 1668年9月28日
| 1669年9月24日
|-
! rowspan="3" | 27
| rowspan="3" |
| rowspan="3" | マヌエル・デ・レオン
| rowspan="3" | 1669年9月24日
| rowspan="3" | 1677年9月21日
|-
|6代ベラグア公爵(1673年11月20日 – 1673年12月13日)
|- style="background:lightgrey;"
| rowspan="4" |(及び)(1673年12月13日 – 1680年11月7日)
|- style="background:gold;"
! 28
| 
|
| 1677年4月11日
| 1677年9月25日
|- style="background:gold;"
! 29
| 
| フランシスコ・ソトマヨル・イ・マンシージャ
| 1677年9月21日
| 1678年9月28日
|-
! rowspan="2" | 30
| rowspan="2" |
| rowspan="2" | フアン・デ・バルガス・ウルタード
| rowspan="2" | 1678年9月28日
| rowspan="2" | 1684年8月24日
|-
| rowspan="2" |3代3rd Marquess of La Laguna de Camero Viejo(1680年11月7日 – 1686年6月16日)
|-
! rowspan="3" | 31
| rowspan="3" |
| rowspan="3" | ガブリエル・デ・クルセアレギ・イ・アリオラ
| rowspan="3" | 1684年8月24日
| rowspan="3" | 1689年4月
|-
|3代(1686年6月16日 – 1688年11月20日)
|-
| rowspan="3" |9代(1688年11月20日 – 1696年2月27日)
|- style="background:gold;"
! 32
| 
| アロンソ・デ・アビラ・フエルテス
| 1689年4月
| 1690年7月
|-
! rowspan="3" | 33
| rowspan="3" |
| rowspan="3" |
| rowspan="3" | 1690年7月25日
| rowspan="3" | 1701年12月8日
|-
| style="background:lightgrey;" |(・グアテマラ司教 ・・メキシコ大司教)(1696年2月27日 – 1696年12月18日)
| rowspan="11" |フェリペ5世ボルボン家(1700年11月1日 – 1724年1月15日)
|-
|初代(1696年12月18日 – 1701年11月4日)
|-
! rowspan="2" | 34
| rowspan="2" |
| rowspan="2" | ドミンゴ・サバルブル・デ・エチェバリ(Domingo Zabálburu de Echevarri)
| rowspan="2" | 1701年12月8日
| rowspan="2" | 1709年8月25日
| style="background:lightgrey;" |(メキシコ大司教)(1701年11月4日 – 1702年11月27日)
|-
| rowspan="2" |10代アルブルケルケ公爵(1702年11月27日 – 1710年11月13日)
|-
! rowspan="2" | 35
| rowspan="2" |
| rowspan="2" |初代(Martín de Urzúa y Arizmendi)
| rowspan="2" | 1709年8月25日
| rowspan="2" | 1715年2月4日
|-
| rowspan="2" |3代(1710年11月13日 – 1716年7月16日)
|- style="background:gold;"
! rowspan="2" | 36
| rowspan="2" |
| rowspan="2" | 
| rowspan="2" | 1715年2月4日
| rowspan="2" | 1717年8月9日
|-
| rowspan="5" |初代(1716年7月16日 – 1722年10月15日)
|-
! 37
|
|
| 1717年8月9日
| 1719年10月11日
|- style="background:lightgrey;"
!-
|
|(代理)
| 1719年10月11日
| 1721年8月6日
|-
! rowspan="3" |38
| rowspan="3" |
| rowspan="3" | トリビオ・ホセ・ミゲル・デ・コシオ
| rowspan="3" | 1721年8月6日
| rowspan="3" | 1729年8月14日
|-
|ルイス1世ボルボン家(1724年1月15日 – 1724年8月31日)
|-
| rowspan="2" |初代(1722年10月15日 – 1734年3月17日)
| rowspan="8" |フェリペ5世ボルボン家(September 6, 1724 – July 9, 1746)
|-
! rowspan="2" |39
| rowspan="2" |
| rowspan="2" | フェルナンド・バルデス・イ・タモン
| rowspan="2" | 1729年8月14日
| rowspan="2" | 1739年7月
|- style="background:lightgrey;"
| rowspan="2" |(メキシコ大司教)(1734年3月17日 – 1740年8月17日)
|-
! rowspan="4" |40
| rowspan="4" |
| rowspan="4" | 
| rowspan="4" | 1739年7月
| rowspan="4" | 1745年9月21日
|-
|初代(1740年8月17日 – 1741年8月22日)
|- style="background:gold;"
|,President of the Audiencia(August 23, 1741 – November 2, 1742)
|-
| rowspan="2" |5代(1742年11月3日 – 1746年7月9日)
|- style="background:lightgrey;"
! rowspan="2" |-
| rowspan="2" |
| rowspan="2" | 司教
| rowspan="2" | 1745年9月21日
| rowspan="2" | 1750年7月20日
|-
| rowspan="3" |初代(1746年7月9日 – 1755年11月9日)
| rowspan="5" |フェルナンド6世ボルボン家(1746年7月9日 – 1759年8月10日)
|-
! 41
|
|初代ブリンディシ侯爵
| 1750年7月20日
| 1754年7月26日
|-
! rowspan="2" |42
| rowspan="2" |
| rowspan="2" |
| rowspan="2" | 1754年7月26日
| rowspan="2" | 1759年5月31日
|-
| rowspan="2" |2代（1755年11月10日 – 1760年2月5日）
|- style="background:lightgrey;"
! rowspan="4" |-
| rowspan="4" |
| rowspan="4" | 司教
| rowspan="4" | 1759年6月
| rowspan="4" | 1761年5月31日
|-
| style="background:gold;" |(1760年2月5日 – 1760年4月28日)
| rowspan="4" |カルロス3世ボルボン家(1759年8月10日 – 1788年12月14日)
|-
|
|-
| rowspan="2" |初代クルイリャス侯爵-大司教1761年7月1762年10月6日

 イギリス占領期の総督（1761年 - 1764年） 
七年戦争中の1762年に起きたマニラの戦いでスペイン軍がイギリス軍に敗れた後、短期間だが、イギリスとスペインが両方フィリピン総督を置いた時期がある。イギリスは占領したマニラとカビテの軍港を支配し、スペインはパンパンガ州に総督府を移して残った部分を支配した。

 代数 肖像 氏名 就任日 退任日 君主43 1762年10月6日 1764年2月10日 カルロス3世ボルボン家(1759年8月10日 – 1788年12月14日)44 1762年11月2日 1764年5月31日 ジョージ3世ハノーヴァー家(1760年10月25日 – 1820年1月29日)

 ヌエバ・エスパーニャ下の総督（1764年 - 1821年） 
1764年にイギリスはフィリピンをスペインに返還し、フィリピン総督はヌエバ・エスパーニャ副王の権限の下でのフィリピン統治に戻った。ナポレオン戦争期にはスペインがフランス第一帝政に支配されたため、フィリピンは事実上フランスの植民地と化していた。
 代数 肖像 氏名 就任日 退任日ヌエバ・エスパーニャ副王 スペイン王45 1764年3月17日 1765年7月6日初代クルイリャス侯爵(1760年10月5日 – 1766年8月24日)カルロス3世ボルボン家(1759年8月10日 – 1788年12月14日)46 1765年7月6日 1770年7月初代クロワ侯爵カルロス・フランシスコ・デ・クロワ(1766年8月24日 – 1771年9月22日) 1770年7月 1776年10月30日アントニオ・マリア・デ・ブカレリ・イ・ウルスア(1771年9月22日 – 1779年4月9日)47 ペドロ・デ・サリオ 1776年10月30日 1778年7月 48 1778年7月 1787年9月22日(1779年4月10日 – 1779年8月22日)(1779年8月23日 – 1783年4月28日)(1783年4月28日 – 1784年10月20日)ビセンテ・デ・ヘレラ・イ・リベロ(1784年10月20日 – 1785年6月17日)初代ベルナルド・デ・ガルベス(1785年6月17日 – 1786年11月30日)(1786年11月30日 – 1787年5月8日)Alonso Núñez de Haro y Peralta(Archbishop of Mexico)(May 8, 1787 – August 16, 1787)Manuel Antonio Flórez Maldonado(August 16, 1787 – October 16, 1789) ペドロ・デ・サリオ 1787年9月22日 1788年7月1日49 1788年7月1日 September 1, 1793年9月1日カルロス4世ボルボン家(1788年12月14日 – 1808年3月19日)第2代レビジャ・ヒヘド伯爵フアン・ビセンテ・デ・グエメス(1789年10月17日 – １９９年7月11日)50 1793年9月1日 1806年8月7日初代ブランシフォルテ侯爵ミゲル・デ・ラ・グルア・タラマンカ(1794年7月12日 – 1798年5月31日)初代サンタ・フェ侯爵ミゲル・ホシ・デ・アサンサ(1798年5月31日 – 1800年4月30日)フェリクス・ベレンゲル・デ・マルキナ(1800年4月30日 – 1803年1月4日)ホセ・デ・イトゥリガライ(1803年1月4日 – 1808年9月16日)51    1806年8月7日 1810年3月4日ペドロ・デ・ガリバイ(1808年9月16日 – 1809年7月19日) フェルナンド7世ボルボン家(1808年3月19日 – 1808年5月6日)Francisco Javier de Lizana y Beaumont(Archbishop of Mexico)(July 19, 1809 – May 8, 1810)ホセ1世ボナパルト家(1808年6月6日 – 1813年12月11日)52マヌエル・ゴンサレス・デ・アギラール1810年3月4日1813年9月4日Pedro Catani(May 8, 1810 – September 14, 1810)初代レウニオン・デ・ヌエバ・エスパーニャ侯爵フランシスコ・ハビエル・ベネガス(1810年9月14日 – 1813年3月4日)初代カルデロン伯爵フェリクス・カジェハ(1813年3月4日 – 1816年9月20日)53 ホセ・ガルドキ・デ・ハラベイティア 1813年9月4日 1816年12月10日初代ベナディート伯爵フアン・ルイス・デ・アポダカ(1816年9月20日 – 1821年7月5日)フェルナンド7世ボルボン家(1813年12月11日 – 1833年9月29日) 1816年12月10日 1821年9月15日Francisco Novella Azabal Pérez y Sicardo(July 15, 1821 – July 21, 1821)フアン・オドノフ(1821年7月21日 – 1821年9月28日)

 スペイン政府の直接監督下の総督（1821年 - 1898年） 
1821年のメキシコ独立革命後、メキシコは独立してスペインの一部ではなくなった。ヌエバ・エスパーニャ副王位も廃止された。その結果、フィリピン総督はヌエバ・エスパーニャ副王管轄下から本国政府（スペイン王冠）に直属する地位となった。

 代数 肖像 氏名 就任日 退任日 スペイン国王 1821年9月16日 1822年10月30日 フェルナンド7世ボルボン家(1813年12月11日 – 1833年9月29日)54 フアン・アントニオ・マルティネス 1822年10月30日 1825年10月14日55 1825年10月14日 1830年12月23日56 1830年12月23日 1835年3月1日イサベル2世ボルボン家(1833年9月29日 – 1868年9月30日)57 ガブリエル・デ・トレス 1835年3月1日 1835年4月23日 58 ホアキン・デ・クラーメ 1835年4月23日 1835年9月9日59 ペドロ・アントニオ・サラザール・カスティーリョ・イ・バロナ 1835年9月9日 1837年8月27日60 アンドレス・ガルシア・カンバ 1837年8月27日 1838年12月29日61 ルイス・ラルディサバル 1838年12月29日 1841年2月14日62 1841年2月14日 1843年6月17日63 フランシスコ・デ・パウラ・アルカラ・デ・ラ・トレ 1843年6月17日 1844年7月16日64 初代マニラ伯爵 1844年7月16日 1849年12月26日65 アントニオ・マリア・ブランコ 1849年12月26日 1850年7月29日66 ラ・ソラーナ侯爵 1850年7月29日 1853年12月20日67 ラモン・モンテロ・イ・ブランディノ 1853年12月20日 1854年2月2日68 1854年2月2日 1854年10月28日 ラモン・モンテロ・イ・ブランディノ 1854年10月28日 1854年11月20日69 マヌエル・クレスポ・イ・セブリアン 1854年11月20日 1856年12月5日 ラモン・モンテロ・ブランディノ 1856年12月5日 1857年3月9日70 1857年3月9日 1860年1月12日71 ラモン・マリア・ソラノ・イ・Llanderal( 1860年1月12日 1860年8月29日72 フアン・ヘレラ・ダビア 1860年8月29日 1861年2月2日73 1861年2月2日 1862年7月7日 74 サルバドル・バルデス 1862年7月7日 1862年7月9日75 ラファエル・デ・エチャグェ・イ・ベルミンガム 1862年7月9日 1865年3月24日76 ホアキン・デル・ソラル・エ・イバニェス 1865年3月24日 1865年4月25日77 フアン・デ・ララ・エ・イリゴイェンJuan de Lara e Irigoyen 1865年4月25日 1866年7月13日78 ホセ・ラウレアーノ・デ・サンス・イ・ポセ 1866年7月13日 1866年9月21日79 フアン・アントニオ・オソリオ 1866年9月21日 1866年9月27日 ホアキン・デル・ソラル・エ・イベニェス 1866年9月27日 1866年10月26日80 1866年10月26日 1869年6月7日空位81 マヌエル・マルドナド 1869年6月7日 1869年6月23日82 1869年6月23日 1871年4月4日 アマデオ1世
サヴォイア家 (1870年12月16日 – 1873年2月11日)83 1871年4月4日 1873年1月8日84 マヌエル・マククロン 1873年1月8日 1873年1月24日85 1873年1月24日 1874年3月17日空位- マヌエル・ブランコ・バルデラマ(代理) 1874年3月17日 1874年6月18日86 1874年6月18日 1877年2月28日アルフォンソ12世ボルボン家(1874年12月29日 – 1885年11月25日)87 ドミンゴ・モリノネス・イ・ムリーリョ 1877年2月28日 1880年3月20日88 ラファエル・ロドリゲス・アリアス 1880年3月20日 1880年4月15日89 初代 1880年4月15日 1883年3月10日- (代理) 1883年3月10日 1883年4月7日90 1883年4月7日 1885年4月1日- (代理) 1885年4月1日 1885年4月4日91 1885年4月4日 1888年4月25日 アルフォンソ13世ボルボン家(1886年5月17日 – 1898年8月14日)- アントニオ・モルト・イ・ディアス・ベリオ(代理) 1888年4月25日 1888年6月4日- フェデリコ・ロバトン・イ・プリエト(代理) 1888年6月4日 1888年6月5日92 1888年6月5日 1891年11月17日93 1891年11月17日 1893年3月1日- (代理) 1893年3月1日 1893年5月4日 94 初代ペニャ・プラタ侯爵 1893年5月4日 1896年12月13日- (代理) 1896年12月13日 1897年4月15日- (代理) 1897年4月15日 1897年4月23日95 初代 1897年4月23日 1898年4月11日 96 1898年4月11日 1898年7月24日- (代理) 1898年7月24日 1898年8月13日- (代理) 1898年8月13日 1898年9月- (代理) 1898年9月 1899年6月3日
1898年の米西戦争のスペインの敗戦により約330年に及んだスペインのフィリピン植民地統治は終焉し、アメリカ合衆国によるフィリピン植民地統治が開始された。アメリカ統治時代の総督についてはアメリカ領フィリピンの総督・高等弁務官を参照。