ミカン科（ミカンか、Rutaceae）は双子葉植物の科で約150属、900種からなる。木（一部草本）の状態で存在し、温帯から熱帯に分布する。精油を含み芳香（異臭の場合もある）を有する。花に芳香のあるものも多い。かつての日本ではヘンルーダ科と呼ばれていた。 はマツカゼソウ（）から取ってマツカゼサウ科としている。

 特徴 
ミカン科の全体像というものは捉えづらいものである。しかし概ねは、
 複葉を持つ木本（高木か低木）
 托葉は持たない
 花盤を持つ
 子房上位である
といった特徴を持つグループと考えるのが妥当である。ミカン科植物として最も知られているのはミカンであるが、子房内部の毛が多汁質のミカン状果を成すのはミカン類のみの特徴であって、ミカン科を代表するものであるとは言い難い。実際、果実の形態は蒴果、石果、ミカン状果などと変化に富んでいる。ミカン科の学名である Rutaceae の基となったヘンルーダ属 () に関しては草本であるという点が科内では特殊であり、また科内で種数が最多であるサンショウ属 () にしてものある木本であり葉が羽状複葉、果実が乾燥しており2-3個に分裂するという特徴は代表的とは認めがたいものである。

ミカン科を識別する際に最も手掛かりとなる特徴は、葉肉内に油点が含まれているという点である。

 利用 
ミカン科の柑橘類（ミカン属、キンカン属、カラタチ属などのグループ）は果樹として非常に重要であるとされ、サンショウ、コブミカン、オオバゲッキツなどは、香辛料として用いられる。キハダ、ゴシュユ、ヘンルーダなど薬用に用いられたものや、ミヤマシキミなど有毒植物もある。観賞用に栽培されるものとして、ゲッキツなどがある。また、アゲハチョウ科のチョウの食草としても知られる。

 属（アルファベット順） 
特に断りのない限り、分布情報や命名者情報は による。

目次
__NOTOC__
A B C D E F G
H I J K L M N
O P Q R S T U
V W X Y Z

 A 
 
 - および の2種
 （オオバゲッケイ属）
 - オーストラリアのクイーンズランド州南東部からヴィクトリア州南東部にかけて分布する木本。
 オオバゲッケイ 
 
 - (Wikispecies) 1種のみ
 （ベンガルカラタチ属/アエグル属）- ベルノキ（別名: ベンガルカラタチ） 1種のみ
 
 
 - 1種のみ
 （アガトスマ属/アガソスマ属）- ブッコノキ （シノニム: ）
（）→ 
 （アミリス属）- タイマツノキ 
 - 1種のみ
 
 - 1種のみ
 （アステロラシア属）
 （アタランティア属）- ツゲコウジ （シノニム: ）

 B 
 - および マルフィン の2種
 - および の2種
（）→ 
 （マツカゼソウ属）- マツカゼソウ 1種のみ
（ シロテツ属）→ 
 （ボロニア属）- ボロニア・メガスティグマ 
 
 - 1種のみ。かつてはムクロジ科植物として扱われていたが、APG IVでは本科に分類されている。
 - 1種のみ
 - および の2種
 - マレー群島区系西部産の高木 1種のみ

 C 
 （カロデンドラム属/カロデンドルム属）- ケープチェストナット および の2種
 - シロサポテ 
 （ケドレロプシス属）
 - インドシュスボク 
 （ショワジア属/チョイジア属/コイシア属）- チョイシア・テルナタ 
 - 1種のみ
 
 （ミカン属）- ウンシュウミカン、ユズ、レモンなど
 （ワンピ属）- ワンピ
（）→ 
 - 1種のみ
 （クネオルム属）- および の2種
 - 1種のみ
 （コレオネマ属）
（）→ 
 
 （コレア属）- コレア・バックホウセアーナ 
 - および の2種
 （クロウエア属）- クロウエア・サリグナ 
（ クスパリア属）→ 

 D 
 - 2種
 - 2種
 - および の2種
 - 1種のみ
 （ハクセン属）- ハクセン
 （ディクティオロマ属）- 少なくともディクティオロマ・ウァンデリアヌム 1種
 
 （ディオスマ属）
（）→ 
（）→ 
 
 
 - 1種のみ
（）→ 

 E 
 - 2種
 （エリオステモン属）- 2種
 - 2種
 （エリトゥロキトン属）
 （エセンベッキア属）
 
 （オガサワラゴシュユ属）
 - パウアマレロ 1種のみ
（）→ 

 F 
 
（）→ 
（）→ 
 （フリンデルシア属）- クイーンズランドメープル 
（ キンカン属 - キンカン）→ 

 G 
 （ガリペア属）
 
 - 1種のみ
 （ハナシンボウギ属）

 H 
 - 1種のみ
 - クサヘンルーダ 
 
（）→ 
 

 I 
 

 J 

 K 
（）→ 

 L 
 
 （レプトティルサ属）
Limnocitrus
 - ウッドアップル（別名: ナガエミカン、ゾウノリンゴ） 1種のみ
 - 1種のみ
 - 1種のみ
 

 M 

（）→ 
 （マクロスティリス属）
 
 
 （アワダン属）
 - ハワイ諸島固有の高木。
 アワダン（ ）- インドのアッサム地方から南西諸島（日本）ならびに太平洋地域南西部にかけて分布する木本。
 - 1種のみ
 - 1種のみ
 
（）→ 
 
 （ミクロメルム属）
 
（）→ 
 - 1種のみ
 （ゲッキツ属）- ゲッキツ
 

 N 
 - 1種のみ
 - 1種のみ
 
 - 1種のみ
 
 - 2種
 - 1種のみ

 O 
（）→ 
（）→ 
 （コクサギ属）- コクサギ1種のみ
（）→ 

 P 
 - 1種のみ
 
 （ペルトスティグマ属）- 2種
 - 1種のみ
 - 1種のみ
 （フェバリウム属）
 （キハダ属）- キハダ およびシナキハダ の2種
 
 - 2種
 → 
 （ピロカルプス属）- ピロカルプス・ペナティフォリウス 
 - 1種のみ
 → 
 
 - 2種
 - 1種のみ
 （カラタチ属）
 - 1種のみ
 - 1種のみ
 （プタエロクシロン属）- タンザニアから南部アフリカにかけて分布する高木プタエロクシロン・オブリクウム 1種のみの属。
 （ホップノキ属）- ホップノキ 

 Q 

 R 
 
 - 2種
 
 - 1種のみ
 （ラウェニア属）
 
 
 （ヘンルーダ属）- ヘンルーダ
 - 1種のみ

 S 
（）→ 
 → 
（）→ 
 - 1種のみ
 - 1種のみ
 （ミヤマシキミ属）- ツルシキミ
 
 
 - および の2種
 - 1種のみ

 T 
（）→ 
Tetractomia
 （ゴシュユ属）
 （タムノスマ属）
Ticorea
 （サルカケミカン属）- サルカケミカン 1種のみ
（）→ 
Tractocopevodia
 - グミミカン（別名: トゲナシカラタチ）

 U 

 V 
 （ウェプリス属）

 W 
Wenzelia

 X 

 Y 

 Z 
 （サンショウ属）- サンショウ
Zieria
Zieridium

 下位分類 
一部不確定であるが、一般に次のように下位分類（亜科・連・属）されている。
ヘンルーダ亜科 Rutoideae
サンショウ連 Zanthoxyleae
Bosistoa
サンショウ属
Evodiella
コクサギ属
アワダン属
Choisya
Platydesma
マツカゼソウ連 Ruteae
マツカゼソウ属
Psilopeganum
ヘンルーダ属
Thamnosma
Cneoridium
ハクセン属
ボロニア連 Boronieae
Eriostemon
Phebalium
Asterolasia
Correa
ボロニア属
Diosmeae連
Agathosma
Diosma
Cusparieae連
Pilocarpus
Esenbeckia
Euxylophora
Erythrochiton
サルカケミカン亜科 Toddalioideae
キハダ属
ホップノキ属
Oricia
Vepris
Acronychia
サルカケミカン属
ミヤマシキミ属
Amyris
Teclea
ミカン亜科 Aurantioideae
ミカン連 Citreae
カラタチ属
ミカン属
Clymenia
Microcitrus
キンカン属
Citropsis
Limonia
Triphasia
ワンピ連 Clauseneae
ゲッキツ属
ワンピ属
Atalantia
Swinglea
Aegle
ハナシンボウギ属
Spathelioideae亜科
Spathelia
Dictyolomatoideae亜科
Dictyoloma