ポケットモンスターSPECIAL

『ポケットモンスターSPECIAL』（ポケットモンスタースペシャル）は、ゲームソフト『ポケットモンスター』シリーズを題材とする漫画作品。通称はポケSP、ポケスペなど。シナリオ担当者は日下秀憲。作画担当者は真斗（1 - 9巻）、山本サトシ（10巻 - ）。

なお、2014年より「通常の単行本」（通巻版）と、それに先駆けて別レーベルで発売される「新章の先行版」の2形態でリリースされているが（詳細は後述）、本記事における「○巻」や「単行本」という用語は特記のない限り通巻版のものを指す。

 概要 
1997年4月から小学館の学年別学習雑誌『小学四年生』で連載開始。以降、2009年度までは『小学四年生』 - 『小学六年生』（2004年度は『小学三年生』-『小学六年生』　　2005年 度は『小学三年生』 - 『小学五年生』）の3誌で縦断連載され、『小学五年生』・『小学六年生』休刊後の2010年度からは、新たに『コロコロイチバン!』と『ポケモンファン』で連載開始。既存の『小学四年生』も休刊となった2012年度以降は『コロコロイチバン!』と『ポケモンファン』の2誌縦断連載となり、2015年からはWebコミックサイト『クラブサンデー』でも連載開始し（それに伴い『ポケモンファン』での連載は一時休止）、2016年途中より『サンデーうぇぶり』に移籍。過去には『ポケモンワンダーランド』に連載されていた時期もあった。

ちなみに学年誌時代の3誌縦断連載だが、学年誌の1話完結形式ではない漫画作品の中では非常に特徴的な連載形式であり、通常の学年誌での漫画は、学年誌で同じ年度学年別に同じ漫画を連載する際は同じ話を同時に掲載するか、学年度事に第1話、最終回を複数描き同じキャラクターで別のストーリーを展開するのが定席であった(単行本の時は複数の話からセレクトし、矛盾を防ぐ為全話が掲載される事は稀であった)。しかしこの作品はあらかじめ物語のロードマップを定め、各年度事に別のストーリーを展開しながら単行本の時に全話が本来の順番に戻され一つのストーリーとなるという方式で連載されていた(例を上げると1章では単行本第1話〜3話が「六年生」に掲載された1〜3話、4〜5話が「四年生」に掲載された1〜2話…などを雑誌でも単行本でも違和感なく構成している)。

ゲーム本編の新作が発売される度にそれを題材にした新章が連載されており、ポケモンを題材とする漫画の中では、穴久保版『ポケットモンスター』に次ぐ長期連載となっている。2017年12月時点で全世界累計発行部数は3000万部程度を記録している。2015年からは電子書籍としてもリリースされている。

当初は原作と同じ『ポケットモンスター』のタイトルで連載開始したが、単行本を発売する際に先行して単行本がリリースされていた穴久保版と書店・取次所に対しての区別をつけるために、判型の異なる『てんとう虫コミックススペシャル』レーベルでの発売が決まり、同様の理由でタイトルにもレーベル名から『SPECIAL』が付いたという経緯がある。他のタイトル候補には『ポケットモンスター G（ゲット）』、『ポケットモンスター Z』などがあった。

第一章と第二章の単行本の初期の版の帯には、田尻智・石原恒和・宮本茂・杉森建・イマクニ・増田順一らポケモンに関わった人達の推薦文が書かれており、田尻は「僕が伝えたかった世界に最も近い」との文章を寄せている。

 作風 
権威ある研究者から「ポケモン図鑑」を託された、ゲーム版に登場する人物を元にした個性豊かな主人公「図鑑所有者」たちが、ポケモンを悪事に使おうとする勢力と戦う中で成長していく物語。章ごとに主人公が交代していく体制であり、同じ主人公が一貫して登場することはなく、登場しない間隔も長期間である。ホウエン地方・シンオウ地方・イッシュ地方・カロス地方・アローラ地方・ガラル地方のシリーズではゲーム本編も過去の地方との繋がりがないため、登場キャラクターが一新されている事が多くなった。ただし、基本的に内容はゲーム版の発売順に進行していくため、次章で連続して同じ主人公が登場する場合もある。

他のポケモンメディアミックス作品に比べるとドラマ性が重視されたシリアスな作風が特徴であり、ストーリーはゲーム版をベースにしながらもアレンジが加えられた独自の展開で進んでいく。特に第3章（金・銀・クリスタル編）以前では、一部のジムリーダーや四天王が悪役として登場する場合もあった。

ポケモンの技・特性・姿や、ゲーム内でのポケモン図鑑の説明文や小ネタなどの設定が何らかの形でストーリーや演出に組み込まれることが多い。また、『ポケモンレンジャー』のような本編以外の外伝作品や、アニメ版（特に劇場版）やポケモンカードゲームといったゲーム以外のメディアにおける設定が反映されることもある。

戦闘シーンでは、戦っている最中に相手が気付かない内に違う技を仕掛けたり、複数のポケモンの技を合体させ威力を高めるといったゲームでは決して出来ない戦い方も特徴の1つ。悪人に至っては敵トレーナーを直接攻撃する、モンスターボールの開閉スイッチを破壊し控えポケモンを出せなくするなど、より悪人らしく手段を選ばず襲撃することもある。
各話のタイトルは、一部を除き全て「VS（ポケモンの名前）」となっており、第4章以降は別個にサブタイトルも設定されている。また、「全てのポケモンと技を登場させる」事を方針としており、第9章（ハートゴールド・ソウルシルバー編）完結時点で第四世代（『ポケットモンスターダイヤモンド・パール・プラチナ』『ポケットモンスター ハートゴールド・ソウルシルバー』）までに登場したポケモンと技は名前のみ登場の「わるあがき」を除き全て登場済みである。

 連載に関する事項 

 作画担当者交代 
第3章（金・銀・クリスタル編）連載途中の2000年後半、作画担当の真斗が体調を崩し休載が増加。最終的に本人の申し出により降板となり、物語上ではそれまでの主人公であるゴールドとシルバーが「行方不明」という形で一旦退場となった。代理原稿として『小学六年生』2月号では10ページの特集記事が、『小学四年生』・『小学五年生』・『小学六年生』の3月号にはお詫びを知らせる1ページの記事が掲載された。編集部の間では心機一転の意もあって、日下と新しい作画担当者の手で「本作とは別の新しいポケモン漫画」を連載する案もあったが、日下の強い希望により「SPECIALのつづき」を連載することになった。

新しい作画担当者は3組の候補から選考の末、2000年末に山本サトシに決定し、2001年度より新キャラクターのクリスタルへ主人公を交代した『クリスタル編』の連載が開始。連載が軌道にのるにつれて、徐々に2000年度までの『金・銀編』の内容や布石に合流させていき、最終的に『金・銀・クリスタル編』という一貫したストーリーになった。

この影響もあって、第3章の単行本化は7巻（第2章完結分）発売から1年以上経過した後に8・9・10巻同時発売という形で開始され、山本担当分は10巻からの収録とすることで区切りがつけられた。なお、作画交代の直後はクリスタル以外の当時の図鑑所有者の素顔が見えないように描かれていた。

山本担当後も、回想シーンで真斗が担当していた時代のシーンが載ることもある。

 単行本発売のペース 
本作品は単行本の発売が不定期になりやすい。これは、章が変わっても巻数が継続する仕様上、単行本において古い章が完結するまでは新しい章の単行本化が行われないためである。

章ごとに違う雑誌で並行連載が行われている場合、主要な連載誌である月刊誌では、ゲーム本編の最新作に合わせた新しい章の連載が優先して行われる。一方の古い章は、不定期刊行雑誌で連載される場合もあるが、それさえも新しい章の連載が優先されて、完結しないまま連載停止になってしまうことも少なくない。その結果、章の終盤に差し掛かるとストック切れが深刻になり、残りのストーリーは単行本へ直接の描き下ろしを余儀なくされるため、単行本の刊行ペースは鈍化する。その為、連載誌と単行本では大幅に台詞や展開が異なる場合も存在する。

一方の新しい章は、単行本において古い章が完結するまでは、単行本化ができないままひたすらストックを増やしていくことになり、最終的に単行本化が実現するのは、連載開始から2年近く経った後になることも多い。逆にひとたび単行本化が可能になれば、それまでに溜まった膨大なストックを一気に消費できるため、数か月連続で刊行されることもある。

このことは以下のような事情にも発展した。特に第7 - 9章は掲載誌の休刊や第10章の開始でペースが複雑化している。

 第6章（エメラルド編）描き下ろしの事情
 第6章は中盤以降から、連載を学年誌から『ポケモンワンダーランド』に移行したが、同誌は不定期刊行であったため、2007年7月14日のvol.9発売から2008年10月18日のvol.10発売まで、1年3ヵ月の期間を要した。その影響で単行本化が出来ず、『ポケモンワンダーランド』での連載は当初vol.11まで行う予定だったが、それをvol.10で打ち切り、残りの部分は29巻に直接描き下ろされた。そのため28巻が発売されてから29巻が発売されるまで約1年かかることになり、第7章（ダイヤモンド・パール編）の単行本への収録は、第7章（ダイヤモンド・パール編）連載開始から約2年が経過した2008年12月発売の30巻からとなった。
 学年誌の休刊に伴う連載雑誌変更および連載停止事情
 2009年度をもって『小学五年生』と『小学六年生』が休刊となったため、第7章と第8章（プラチナ編）が連載停止。2010年度からは『コロコロイチバン!』と『ポケモンファン』に移行し、既存の『小学四年生』を含めた3誌とも、新たに第9章の連載を開始したが、同年9月より第10章（ブラック・ホワイト編）に順次移行した。そのため第7章・第8章・第9章が停止状態となった。この結果、これらの章の終盤は単行本描き下ろしの割合が非常に多くなり、第8章完結分が収録された40巻に至っては全ページ描き下ろしとなった。
 さらに2011年度をもって『小学四年生』が休刊になったため、3誌縦断連載というスタイルが維持できなくなり、2012年度からは『コロコロイチバン!』と『ポケモンファン』の2誌のみでの縦断連載へ変更。その為、第12章（X・Y編）に順次移行し、第11章（ブラック2・ホワイト2編）は連載数僅か6回で連載休止。加えて『ポケモンファン』は不定期発売のため、連載ペースは過去に比べると大幅に低下、その後『ポケモンファン』上での連載も中止された。
 2015年からは学年誌の代わりにWebサイト『クラブサンデー』にて第13章（オメガルビー・アルファサファイア編）が連載開始され、休止となっていた第11章も第13章完結後に後継として『サンデーうぇぶり』で再開された。
第12章（X・Y編）より先行単行本化（2ライン化）の開始
 以上のような事例を重ねた結果、第12章は単行本1冊分のストックが溜まり次第、第11章（ブラック2・ホワイト2編）の単行本化に先駆けて『ポケットモンスターSPECIAL X・Y』のタイトルで、従来とは別の巻数による単行本を発売するようになった。
 ただし、これはあくまで「『コロコロイチバン!』の読者をメインターゲットにした先行単行本化」という形であり、これまでの巻数がリセットされたわけではない。従来の販売フォーマットも「通巻版」として継続し、第12章の通巻版は従来通り前章（第11章）が単行本上で完結した後のリリースを予定している。第13章（オメガルビー・アルファサファイア編）以降も同様の2ライン体制を採用しており、『ポケットモンスターSPECIAL オメガルビー・アルファサファイア』などといったタイトルで、通巻版に先駆けて先行版を別途発売している。
なお、この先行版は収録内容に加えてレーベルや判型も通巻版と異なっており、通巻版が「てんとう虫コミックススペシャル」（B6サイズ）であるのに対し、先行版は「てんとう虫コロコロコミックス」や「てんとう虫コミックス」（いずれもB40（新書判）サイズ）となっている。

 翻訳版 
公式に翻訳版が発売されているのは、北アメリカなどの英語圏のほか、シンガポール・マレーシア・タイ・ベトナム・中国・台湾・香港・韓国といったアジア、またイタリア・フランス・ドイツ・スペイン・フィンランド・ポーランド・ギリシャなどの欧州、メキシコ・ブラジル・アルゼンチンなどの中南米を含め、20か国以上である。

日本では『ポケットモンスター 赤・緑』が発売された後に『ポケットモンスター青』が発売されたのに対して、国外では日本版の『緑』にあたるものが『Blue（青）』として発売され、『Green（緑）』という名前のバージョンは発売されなかった（ただしリメイク版は海外版も『ファイアレッド（FireRed）』・『リーフグリーン（LeafGreen）』として発売されている）ため、日本版のグリーンは海外版ではブルーに、日本版のブルーは海外版ではグリーンという名前になっている。

中国語版では『神奇寶貝特別篇（台青文版）/寵物小精靈特別篇（港青文版）/精灵宝可梦特别篇（吉林版）』というタイトルで図鑑所有者の名前はそれぞれ種類が異なり（青文版）、レッドとグリーンは中国語では「小智（サトシ)」・「小茂(シゲル)」というデフォルト名であり、ブルー・ゴールド・シルバー・ラクツ・ファイツ・そうど（創人）は「小藍」・「阿金」・「阿銀」・「黑次」・「白慈」・「創人」という外来語の中国語読み、イエロー・クリスタル・ルビー・サファイア・エメラルド・ダイヤモンド・パール・プラチナ・ブラック・ホワイト・エックス・ワイ・サン・ムーン・シルドミリア（しーちゃん）は「小洛」・「克麗絲塔兒」・「路比」・「莎菲雅」・「米拉特」・「戴亞蒙德」・「帕爾」・「普蘭汀娜」・「布萊克」・「懷特」・「艾克斯」・「華依」・「桑恩」・「暮恩」・「希露朵米莉雅（小希）」という外来語の当て字読みである。

日本の漫画が大人気の欧米では、ゲーム版の人気がピークの内に漫画版を販売したかったため、第10章（ブラック・ホワイト編）が英語とフランス語に翻訳されて、日本に先駆けて単行本が発売された。このため、海外では章によっては別の巻数で発売されている。アメリカ版は、ニコロデオンマガジンまんが賞の「Favorite Manga Series」（1番好きな漫画賞）を受賞した。

 補足 
過去に2度、限定版が出版されている。連載10周年記念として2007年8月に発売された27巻限定版（10万部限定）には、特製アートボードが付属。節目となる50巻目を迎えたことを記念して2014年3月に発売された50巻限定版には、64ページのカラーイラスト集が付属した。いずれも値段は通常版よりやや高め。

2013年に刊行されたムック本『ポケモン・ザ・コミック』（）に、描き下ろしとして『シロガネ山修行編』が掲載された。主役は単行本累計発行部数1000万部突破記念の人気投票で1位になったレッドとピカ（ピカチュウ）。時系列は第3章から第5章までの間であり、第6章や第9章では当該エピソードの出来事について触れられているが、現時点で単行本未収録。

教育出版から発行されている小学5年生向けの国語の教科書（2002年度版以降）の漫画の表現方法について解説している単元に、本作の1巻の一部が掲載されている。

東京書籍から発行されている中学2年生向けの英語の教科書の異文化交流を行う設定の単元に、日本の漫画文化の代表例の一つとして本作の1巻の表紙が載っていたが、2009年度版以降の版では別の漫画に差し換わっている。

ダ・ヴィンチが2012年に調査した「アニメ化してほしい小説・コミック」では3位にランクインした。

 各章の概要・あらすじ 
現在までに計16章（第15章まで完結済）が発表されており、以下の通りに構成されている。

 章 タイトル 連載媒体 話数 通算話数 通巻版 先行版 第1章 赤・緑・青編 小学四年生-六年生1997年4月号 - 1999年12月号Chu’net 99年春号 全40話 第1 - 40話 1 - 3巻 未発売 第2章 イエロー編 全50話 第41 - 90話 4 - 7巻 第3章 金・銀・クリスタル編 小学四年生2000年1月号 - 2003年1月号小学五年生2000年1月号 - 2003年3月号小学六年生2000年1月号 - 2003年2・3合併号 全90話 第91 - 180話 8 - 15巻 第4章 ルビー・サファイア編 小学四年生2003年2月号 - 2005年3月号小学五年生2003年4月号 - 2006年3月号小学六年生2003年4月号 - 2004年10月号、2006年4月号 - 9月号小学三年生2003年5月号 - 7月号 全87話 第181 - 267話 15 - 22巻 第5章 ファイアレッド・リーフグリーン編 小学三年生2004年4月号 - 2005年3月号→小学四年生2005年4月号 - 2006年3月号→小学五年生2006年4月号 - 2007年3月号→小学六年生2007年4月号 全35話 第268 - 302話 22 - 26巻 第6章 エメラルド編 小学三年生2005年4月号 - 2006年3月号→小学四年生2006年4月号 - 2007年3月号ポケモンワンダーランドvol.9・vol.10 全35話 第303 - 337話 26 - 29巻 第7章 ダイヤモンド・パール編 小学三年生2006年12月号 - 2007年3月号小学四年生2007年4月号 - 2009年3月号小学五年生2007年4月号 - 2010年3月号小学六年生2007年4月号 - 2010年2・3合併号 全79話 第338 - 416話 30 - 38巻 第8章 プラチナ編 小学四年生2009年4月号 - 2010年3月号ポケモンファン第13号（vol.13） 全25話 第417 - 441話 38 - 40巻 第9章 ハートゴールド・ソウルシルバー編 小学四年生2010年4月号 - 12月号コロコロイチバン!新4号 - 新7号（2010年1月号 - 4月号）ポケモンファン第12号（vol.12） 全19話 第442 - 460話 41 - 43巻 第10章 ブラック・ホワイト編 小学四年生2010年12月号 - 2012年3月号コロコロイチバン!新8号 - 新37号（2010年5月号 - 2013年8月号）ポケモンファン第14号 - 第30号（vol.14 - 30） 全64話 第461 - 524話 43 - 51巻 第11章 ブラック2・ホワイト2編 コロコロイチバン!新38号 - 新40号（2013年9月号 - 11月号）ポケモンファン第25号・第31号・第32号（vol.25・31・32）サンデーうぇぶり2016年11月22日更新分 - 2020年4月17日更新分 全24話 第525 - 548話 52 - 55巻 第12章 X・Y編 コロコロイチバン!新41号（2013年12月号） - 2017年1月号ポケモンファン第33号 - 第39号（vol.33 - 39） 全47話 第549 - 595話 55 - 62巻 全6巻 第13章 オメガルビー・アルファサファイア編 クラブサンデー2015年1月6日更新分 - 2016年7月5日更新分サンデーうぇぶり2016年8月2日更新分 - 2016年9月6日更新分 全23話（連載回数） 第596話 - 62 - 65巻（予定） 全3巻 第14章 サン・ムーン・ウルトラサン・ウルトラムーン編 コロコロイチバン!2017年1月号 - 2020年1月号 全37話（連載回数） 65巻（予定） - 全6巻 第15章 ソード・シールド編 コロコロイチバン!2020年1月号 - 2023年8月号 全43話（連載回数） 全7巻 第16章 スカーレット・バイオレット編 コロコロイチバン!2023年10月号 - 既刊3巻

各章は全て同一世界観となっており、時系列は第1章→第2章→第3章→第4章→第5章→第6章→第9章→第13章→第7章→第8章→第10章→第11章の順。地方間の年単位での時系列が判明しているのはカントー・ジョウト・ホウエンを舞台とする章だけで、それ以外の地方同士における時系列上の正確な互換性は現時点で明らかにされていない。第12章は少なくとも第13章より後、第11章より前の時系列、第14章と第15章は少なくとも第12章より後の時系列だが前章から具体的にどれだけ時間が経過しているかは不明となっている。話数は第1章から通し番号になっている。

 第1章/赤・緑・青編 
ポケットモンスターSPECIALの最初の物語。ゲーム『ポケットモンスター 赤・緑・青』をモチーフにした章。主な舞台はカントー地方。
 あらすじ
 カントー地方の小さな町・マサラタウンにいる少年レッドは町内では有名な腕利きのポケモントレーナー。
 ある日、レッドは森で何かを捜索している様子の黒ずくめの男たちと遭遇する。そこで「西の森に幻のポケモンがいる」という情報を入手した彼は単身で西の森へ向かう。レッドがそこで見たのは、自分と同い年の少年・グリーンが光り輝く謎のポケモン（ミュウ）と戦闘している様子だった。レッドはグリーンに加勢し、ニョロゾを戦闘に参加させるが、その謎のポケモンの一撃を受けて倒されてしまう。
 落胆した彼は「強いポケモントレーナーになる方法」を聞くためにオーキド博士の元へ向かう。そこで彼はオーキド博士に「フシギダネ」というポケモンとポケモンの生態を記録する装置「ポケモン図鑑」を譲り受け、“究極のポケモントレーナー”を目指し長い旅に出る。
 謎の少女・ブルーやジムリーダーたちとの出会いを通じトレーナーとして成長を続けるレッドはやがてカントー地方全土で暗躍するロケット団の陰謀に立ち向かっていく。

 第2章/イエロー編 
ゲーム『ポケットモンスター 赤・緑・青・ピカチュウ』をモチーフにした第1章の続編となる章。主な舞台はカントー地方とスオウ島。
 あらすじ
 ロケット団とのシルフカンパニーの戦いから2年の歳月が流れた。レッドはポケモンリーグの優勝者として挑戦者の相手を続け、ブルー・グリーンもそれぞれの目標に向かいマサラタウンを離れていた。ある時、マサラタウンへと帰郷したレッドは新たな挑戦状を受け取り、その挑戦を受けにマサラタウンを後にする。
 その後、レッドからの音沙汰はないまま1ヵ月後、オーキド博士の元にやってきたのは傷つき瀕死の状態になったレッドのピカであった。ただならぬ雰囲気を感じた博士の前に現れたのはドードーに乗った麦わら帽子を被った謎の子供・イエローであった。
 「レッドの知り合い」だというその子供に戸惑い・不審を感じるオーキド博士だったが、イエローの持つポケモンへの並外れた優しさと気難しい筈のピカが主人（おや）ではないイエローに懐く様子を見た博士はイエローにレッドの捜索を依頼し、レッドのポケモン図鑑とピカを託す。
 こうしてイエローはレッドを探すため旅に出るが、ポケモンが人間に害されない世界を作ろうとするカントー四天王との戦いに巻き込まれていく。

 第3章/金・銀・クリスタル編 
ゲーム『ポケットモンスター 金・銀・クリスタル』をモチーフにした章。主な舞台はジョウト地方。

名目上の主人公はゴールドとなっているが、前述の作画交代から一時はクリスタルが主人公として描かれており、連載時にはそれに伴い一時期「ポケットモンスター☆SPECIAL クリスタル(crystal)」というタイトルになっていた。ゴールド合流後の後半においても、各話でスポットが当てられる人物が目まぐるしく変わる。

 あらすじ
 カントー四天王事件から1年後。ジョウト地方・ワカバタウンに住む少年・ゴールドは近所では有名な「ポケモン屋敷の坊」であり、近所の人気者でもあった。
 ある夜、ゴールドはひょんなことからたんぱんこぞうのゴロウと出会う。オーキド博士から言い付かってウツギ博士に荷物を届けに行く途中だというゴロウの話を聞いたゴールドは、オーキド博士とラジオで共演している憧れのアイドル・クルミちゃんのサイン目当てにゴロウが荷物を届けオーキド博士の所に戻るまでの道中に強引に同行することを決める。
 ところが道中でゴールドのリュックと、中に入っていたポケモンが何者か（ロケット団残党）に盗まれてしまう。犯人はウツギ博士へ届ける荷物と間違えてゴールドのリュックを盗んだのではないかと推測したゴールド達は犯人が次にウツギ博士のところに向かうと予想し、ウツギ博士の研究所へと向かう。研究所に到着したゴールドが遭遇したのは赤色の髪をしたゴールドと同年代の少年だった。その少年がウツギ博士が研究中の3匹のポケモンの中の1匹・ワニノコを盗み出した事を知ったゴールドは、ワニノコとリュックを取り返すために、3匹の中のもう1匹・ヒノアラシと共に少年と戦うも少年には逃げられ、リュックを取り返すことも出来なかった。この事件は警察には任せておけないと感じたゴールドは自分の手で少年を捕まえることを決める。
 その夜、ゴールドはオーキド博士と出会う。オーキド博士が偶然見つけてくれた自身のリュックに喜ぶゴールド。しかし、あの赤髪の少年が“ポケモン図鑑”を盗んだことを知ると少年に対抗するために自分もポケモン図鑑が欲しい、とオーキド博士に頼み込む。最初は断られたがゴールドの熱意がオーキド博士の心を動かし、ポケモン図鑑を譲り受ける。ゴールドはリュックのポケモンをゴロウに任せ、新たな相棒・ヒノアラシの「バクたろう」とともに赤髪の少年・シルバーを追って冒険へと出発する。
 シルバーとの共闘や捕獲の専門家クリスタルとの出会いを経たゴールドは復活したロケット団残党を影から操る「仮面の男」に挑む。

 第4章/ルビー・サファイア編 
ゲーム『ポケットモンスター ルビー・サファイア』をモチーフにした章。主な舞台はホウエン地方。

連載時に「ルビー・サファイア・エメラルド編」と書かれていた時期があったが正式には、ルビー・サファイア編。従来の「人とポケモンとの交流」よりも人間同士のドラマが主体となって描かれている(以降この主体が強く現れてくる)。

4年間に渡って連載され、ゲーム『ポケットモンスター ファイアレッド・リーフグリーン』・『ポケットモンスター エメラルド』はおろか、『ポケットモンスター ダイヤモンド・パール』発売直前まで連載が続いていたため、後の第5章・第6章・第7章の連載や単行本化に大きく影響を与えた。

また、本章の後半から山本独自の絵柄に変化していった。
 あらすじ
 ジョウト地方の「仮面の男」事件から1年半後。ホウエン地方にジョウト地方・コガネシティから1人の少年・ルビーが母親と共に引っ越してきた。彼の父親はトウカシティのジムリーダーで別名「強さを追い求める男」センリ。バトルが大嫌いなルビーはセンリに今の自分を認めさせるため、ホウエン地方で開催されている全てのポケモンコンテストで優勝する事を決意し、引っ越して来たその日に家出するがその途中でセンリの友人・オダマキ博士の娘・サファイアと出会う。ポケモンコンテストを軟弱と嫌う彼女と言い争った末、2人は「80日以内にルビーはポケモンコンテストを、サファイアはポケモンジムを全て制覇する」という賭けをする事になる。
 それぞれの目標を果たす旅に出た2人だが、その道中でルビーは赤い装束の一味「マグマ団」、サファイアは青い装束の一味「アクア団」と遭遇し、彼らの起こす事件に巻き込まれていく。これらの組織は伝説の超古代ポケモングラードンとカイオーガを狙っていた。旅の中で様々な人とのふれ合いや挫折を経験して、ルビーとサファイアはホウエン地方を巻き込む大災害を止めるべく、2つの組織との戦いに挑む。

 第5章/ファイアレッド・リーフグリーン編 
ゲーム『ポケットモンスター ファイアレッド・リーフグリーン』をモチーフにした章。主な舞台はカントー地方とナナシマ。

リメイク作品が原作ということもあり、初めて新主人公が登場しない章。また、この章は終始デオキシスを追うストーリーのためか、単行本では「VS（ポケモンの名前）」というタイトルが使われていない。他にも、ミュウツーの拘束具や登場時の台詞・2体存在するデオキシスとその分身体の登場など、劇場版ポケモンと同様の設定が多く登場するのも特徴。

初代図鑑所有者達の作画は第3章では真斗の絵柄に近かったが、本章では山本独自の絵柄となる。

 あらすじ
 ホウエン地方で起きたカイオーガとグラードンの激突から約半年後。レッドとグリーンはオーキド博士に呼び出され、マサラタウンのオーキド研究所を訪れるも当のオーキド博士はおらず、机の上には手紙とボイスチェッカーが置かれていた。ボイスチェッカーには「ポケモン図鑑を取り上げる!」というオーキド博士の言葉が吹き込まれており、何かあると感じた2人はオーキド研究所の転送装置でポケモン図鑑をオーキド博士の元に送り、手紙に同封されていたトライパスが使用出来るクチバシティの港を目指す。
 その頃、クチバシティの港では長い間離れ離れだった両親と連絡のついたブルーが両親との再会のために船「シーギャロップ号」に乗り込んでいた。後にレッドとグリーンも乗り込むが、別の場所にいたブルーは肉眼では見えない正体不明の怪物に襲撃される。
 やがて船は目的地・「1の島」に到着。拘束されて身動きの取れないブルーの元へブルーの両親が走り寄ってくるが、2人は突如足下に発生した闇に飲み込まれてしまう。またも両親と引き裂かれたショックでブルーはその場で意識を失ってしまう。レッドとグリーンが事を目撃した時には敵は既に去った後だった。
 やがて全ての元凶が再結成したロケット団にあることを知ったレッド達はブルーの両親と攫われていたオーキド博士を助け出すため、「2の島」の老女・キワメが守ってきた3つの究極技を授かり、ロケット団首領のサカキと新幹部・三獣士との戦いに身を投じる。

 第6章/エメラルド編 
ゲーム『ポケットモンスター エメラルド』の主にバトルフロンティアをモチーフにした章。主な舞台はホウエン地方・バトルフロンティア。

エメラルド・ゴールド・クリスタル・ルビー・サファイアが石化から復活したレッド・グリーン・ブルー・イエロー・シルバーと合流し、カントー地方・ジョウト地方・ホウエン地方10人の歴代図鑑所有者達が集結する。

当初は「バトルフロンティア編」と呼ばれていたが、単行本化の際、「エメラルド編」に変更された。先述の第4章の連載長期化や『ポケモンワンダーランド』の発売状況などにより、連載が大幅に遅れたため、終盤部分は連載されず初めて直接単行本に描き下ろされた。

 あらすじ
 ナナシマの騒動から約3ヵ月後。ホウエン地方にバトルフロンティアと呼ばれるポケモンバトルの専門エリアが完成し、オープニングセレモニーが行われようとしていた。そこへむげんポケモン・ラティアスとラティオスに連れられ、1人の少年が降り立った。名はエメラルドといい、ポケモンを1匹も所持せずに「ポケモンバトル」が好きでバトルフロンティアを制覇しに来たという。挑戦の申し込みにバトルタワーへ向かったエメラルドだが、そのハチャメチャな行動でオープニングセレモニーを台無しにしてしまう。当然フロンティアブレーンたちに絞られるエメラルドだがマスコミからはセレモニーの一部だと思われてしまい、混乱を避けるべくフロンティアブレーン達はエメラルドにマスコミに対しての施設公開の7日間（7月1日 - 7日）、バトルフロンティアに挑戦する権利を与える。
 時を同じくしてバトルフロンティアで目覚めた「願い星」と呼ばれる存在、そしてその力を手に入れんとする魔の手が忍び寄りつつあった。エメラルドとフロンティアブレーン達は願い星・ジラーチを甲冑を着た謎の男・鎧流（ガイル・ハイダウト）から守るため、そしてバトルフロンティアを無事にオープンするため、ジラーチを巡るガイルとの攻防を繰り広げる。

 第7章/ダイヤモンド・パール編 
ゲーム『ポケットモンスター ダイヤモンド・パール』をモチーフにした章。主な舞台はシンオウ地方。

ダイヤモンドとパールの2人は物語の始まる前、ポケモンと無関係の夢を持っていたり、プラチナの本名が34巻まで明かされないなど、歴代のシリーズの中でも異色と言える章。連載雑誌である『小学五年生』・『小学六年生』の休刊に伴い、37巻・38巻で描き下ろしが行われた。

当初は他の章との繋がりはあるものの、時間間隔がストーリー中に一切語られておらず、物語全体の世界観のいつ頃の時期なのかがハッキリしていなかったが、第9章の終盤でこの章に繋がる出来事やその冒頭が描かれ、時系列が第6章→第9章→第7章→第8章であった事が明らかとなった。さらに、、第9章の約半年後であると捉えることができる。

 あらすじ
 ある日、シンオウ地方の名家「ベルリッツ家」の令嬢・プラチナは、旅立ちの日を迎えていた。ベルリッツ家には跡継ぎの者は「家紋を刻んだアクセサリーを作るために自分でその材料をテンガン山の山頂まで取りに行かねばならない」という伝統がある。彼女は父に頼みこみ、2人のボディガードをつけるという条件で伝統への挑戦を許可された。
 その頃、コトブキシティではダイヤモンドとパールという2人の少年がお笑いコンテストに出場していた。本番では失敗したものの特別賞をもらった2人は先に渡された景品の旅行券を手に表彰式へ向かう途中、2人の男性と衝突してしまう。その後、2人は賞品の旅行券を確認するとそこには「旅の任務：護衛　旅の目的地：テンガン山山頂　待ち合せ場所：コトブキマンション前」と書かれていた。奇妙な内容に首をかしげながら2人が待ち合わせ場所に向かうとそこにはボディーガードを待つプラチナがいた。
 実は2人が衝突した相手はプラチナの父・ベルリッツ氏とベルリッツ親子が助手を務めるナナカマド博士であり、4人が衝突した際にダイヤモンドが持っていた「旅行券」がナナカマド博士の持っていたボディーガードへの「依頼書」と入れ替わっていたのだ。ダイヤモンドとパールはプラチナのことを「旅行のツアーガイド」と、プラチナは2人を「同年代の旅行と見せかけるためのカモフラージュをしたボディガード」と勘違いし、お互いに納得してしまう。
 こうして広大なシンオウ地方を舞台にダイヤモンド・パール・プラチナの3人はお互いに勘違いを抱えたまま、テンガン山の山頂を目指す旅が始まる。しかし、その道中で3人は新宇宙の創造を目論む謎の組織「ギンガ団」の計画に巻き込まれていく。

 第8章/プラチナ編 
ゲーム『ポケットモンスター プラチナ』をモチーフとした章。主な舞台はシンオウ地方・バトルゾーンとこの世の裏側と呼ばれるやぶれた世界。

第7章とは舞台・主人公・時期はほぼ変わっておらず、第7章第2部とも言える章。連載雑誌である『小学五年生』・『小学六年生』の休刊に伴い、39巻・40巻で描き下ろしが行われ、40巻に至っては全ページ描き下ろしとなった。

 あらすじ
 やりの柱での決戦後、ダイヤモンドとパールはプルートから奪ったメモに記載された伝説のポケモンを調査する旅に出発する事となった。その一方で行方不明となっている本来のボディガード・パカとウージを見つけ出すべく、新たな決意を胸に秘めるプラチナは母であるヤナセ教授から「やぶれた世界」を調査するように言われ、プラチナはバトルゾーンのリゾートエリアにある別荘を購入し、調査の拠点とする。調査方法はバトルゾーンのファイトエリアにあるバトルフロンティアに挑戦し、各施設のフロンティアブレーンやフロンティアブレーンに挑戦するトレーナー達から「やぶれた世界」の情報を得る方針に固めた。同時にヤナセより連絡を受けた国際警察のハンサムと出会い、バトルゾーンに潜伏しているというギンガ団の追跡にも協力する事に。
 四天王・オーバの弟・バクの一方的なハードマウンテンでの調査も相まって、いよいよプラチナのバトルフロンティアへの挑戦が本格的に始まった。そして同時に"この世の裏側"と言われる、未知の世界を見つけ出すという挑戦の火蓋が切られたのだった。

 第9章/ハートゴールド・ソウルシルバー編 
ゲーム『ポケットモンスター ハートゴールド・ソウルシルバー』をモチーフにした章。主な舞台はジョウト地方とシント遺跡。

『小学五年生』と『小学六年生』が休刊になったため連載開始当初から学年誌以外での連載が行われていたが、第10章の連載開始のために僅か半年間で連載休止。終盤単行本に描き下ろしで補完はされたものの、歴代最短章となった。

小学館ホームページの単行本案内(42巻)では本章が「ゴールドとシルバーの最後の戦い」とある。

 あらすじ
 バトルフロンティアでのジラーチを巡る騒動から3年後、ジョウト地方各地にてロケット団が再び活動を再開し始めていた。
 オーキド博士からの依頼を受けたゴールドはワタルから復活したロケット団が狙う幻のポケモン・アルセウスの情報を得るため、ジョウト地方の新施設・ポケスロンに向かい、スポーツ競技に挑んでいた。そこへ突如、我を失ったワタルのカイリューが出現する。カイリューの暴走を沈め、ワタルが何者かの襲撃にあったことを掴んだゴールドはエンジュシティに向かう。
 同じ頃、サカキの関与の可能性を考えながらも独自にロケット団の動きを調べ続けていたシルバーはうずまき島のワタルの隠れ家に赴く。だがそこにワタルの姿はなく、同じくワタルを探すイブキからワタルが残した「サファリゾーン」・「プレート」・「アルセウス」という謎のメッセージを掴み、タンバシティ近辺に出来たサファリゾーンに向かう。そしてサファリゾーンでシルバーはクリスタルと再会する。
 一方、ロケット団では首領の地位を得んと企むかつての三獣士の一人・チャクラを退け、「サカキの意志を継ぐ4将軍」を自称するアポロ・アテナ・ラムダ・ランスの面々が新たにロケット団のトップに君臨。4人は人間に絶望した幻のポケモン・アルセウスを手中に収めるべく暗躍する。
 4将軍らロケット団の野望を阻止するため、ゴールド・シルバー・クリスタルが奮闘する。

 第10章/ブラック・ホワイト編 
ゲーム『ポケットモンスター ブラック・ホワイト』をモチーフにした章。主な舞台はイッシュ地方。

主人公であるブラックとホワイトは共に物語開始時点で14歳であり、新主人公が14歳となるのは初めてとなる。

モチーフになったゲームソフトと最初に連載された雑誌の発売が同日になったのはこの章が初めてである。また、2011年度をもって『小学四年生』が休刊になったため、学年誌で連載された最後の章となった。

本章が初めて単行本で発売された頃の一方、連載誌では物語の展開は終盤に突入していた。そのため単行本の刊行ペースが非常に早く、全9巻がわずか1年半の内にリリースされた。

 あらすじ
 イッシュ地方のカノコタウンに「ポケモンリーグ優勝」という夢を持つ少年ブラックがいた。9年がかりで旅の準備を進めてきたブラックはアララギ博士からやや強引にポケモン図鑑とポカブを受け取り、1年後に開かれるポケモンリーグの会場を目指し旅立つ。
 旅立ちから間もない日、ブラックは野生ポケモンとのバトルで近くで行われていたCM撮影を台無しにしてしまう。困り果てたブラックであったが、そこに居合わせていたポケモン芸能事務所「BWエージェンシー」の女社長ホワイトの助け船で難を逃れる。ホワイトから撮影費用の弁償の肩代わりをする代わりに旅の同行を依頼されたブラックは社員としてホワイトと共に旅立つ。
 ポケモンリーグ優勝と一流のポケモンタレント育成というそれぞれの夢をかなえるため冒険を続ける二人だが、旅の行き先でポケモンの解放を目的とする集団プラズマ団やプラズマ団の王・Nと遭遇し、プラズマ団の数々の陰謀に立ち向かう。

第11章/ブラック2・ホワイト2編 
ゲーム『ポケットモンスター ブラック2・ホワイト2』をモチーフにした章。主な舞台はイッシュ地方。

時系列は第10章の出来事から2年後であり、主人公のキャラ設定は、歴代の中でも特に異色な設定がなされている。

第10章とは対照的に、連載開始はモチーフとなったゲームソフトの発売より1年以上後となった。また、第12章の連載が優先されたため、『コロコロイチバン!』と『ポケモンファン』合わせて僅か6回で連載休止したため、単行本1巻目（52巻）にして早くも描き下ろしが追加された。

第13章の連載終了後に2016年11月22日の更新から『サンデーうぇぶり』にて連載が再開された。その後2018年2月から休載状態にあったが、2019年3月15日の更新から連載再開され、2020年4月17日の更新において完結した。

 あらすじ
 プラズマ団の事件でブラックが行方不明になってから2年後。ヒオウギシティの「ポケモントレーナーズスクール」ではチェレンが教師となり、女の子にモテモテな少年・ラクツが友人のヒュウやペタシと共にスクールに通っていた。
 ある日、ラクツたちのクラスにファイツという名の少女が転入して来る。バトル大会で優勝したラクツとファイツはベルからポケモン図鑑を貰う。何故か目立つことを嫌がるファイツだったが、彼女は元プラズマ団の下っ端だった。そしてラクツ自身も国際警察の警視という裏の顔を持ち、プラズマ団について調査していた。
 スクール内の生徒を調べ尽くしたラクツは残るファイツに調査対象を絞り、後から来たハンサムを部下にファイツの調査に動く。そんな中、プラズマ団は闇の科学者・アクロマを新リーダーに迎え活動を再開する。

 第12章/X・Y編 
ゲーム『ポケットモンスター X・Y』をモチーフにした章。主な舞台はカロス地方。

第7章の出来事から数年後の話だが、具体的な時系列は現時点で不明となっている。

前述のように今章から今までの単行本とは別に、『コロコロイチバン!』連載分を収録した先行版が『ポケットモンスターSPECIAL X・Y』のタイトルで発売された（全6巻で、全39話）。先行版では、話数を『エピソード○』と表記し、サブタイトルは「（ポケモンの名前）、【動詞】」という方式になっており、通常版でも同様になっている。

 あらすじ
 アサメタウンに住んでいるポケモントレーナーの少年・エックスはポケモンバトルのジュニア大会で優勝し、次期四天王候補等と持て囃され、一目置かれていたがマスコミや取材陣が原因で家に引きこもるようになってしまう。元サイホーンレーサーでスカイトレーナーを目指すエックスの幼馴染の少女・ワイを始めとする友人たちはなんとか彼を家から出そうとするが、それは叶わずにいた。
 ある日、ワイ達がいつものようにエックスを説得している途中、ゼルネアスとイベルタルの伝説ポケモン2匹が戦いを始め、アサメタウンは壊滅的な被害を受けてしまう。さらに混乱の中でエックスは所持品のメガリングを「フレア団」と名乗る組織に狙われ、自宅も燃やされてしまう。一連の事件によって大切なものを失ったエックスたち5人はアサメタウンから出発することになる。

 第13章/オメガルビー・アルファサファイア編 
ゲーム『ポケットモンスター オメガルビー・アルファサファイア』の「エピソードΔ（デルタ）」をモチーフにした章。主な舞台はホウエン地方。

本編では初となるWebコミックとしての連載となり、『クラブサンデー』および『サンデーうぇぶり』で毎月第一火曜日に更新された。

先行版では話数を『EPISODE ○』と表記し、タイトルは設定されていないが、通常版ではサブタイトルは『X・Y編』と同様に「（ポケモンの名前）、【動詞】」という方式になっている。

 あらすじ
 カイオーガとグラードンの出現でホウエン地方が天変地異に晒されてから4年が過ぎたころ、突如として進行方向を変えた巨大隕石がこの星に接近しつつあることが判明する。残り10日で星が壊滅するという危機的な状況の中、ホウエン地方の図鑑所有者たちが立ち上がる。

 第14章/サン・ムーン・ウルトラサン・ウルトラムーン編 
ゲーム『ポケットモンスター サン・ムーン』および『ポケットモンスター ウルトラサン・ウルトラムーン』をモチーフにした章。主な舞台はアローラ地方。

Webコミックへの連載により『ポケモンファン』での連載が休止した為、『コロコロイチバン!』のみでの連載となった。先行版では話数を『エピソード○』と表記し、サブタイトルは「【漢字二文字】!!〇〇!」という方式になっている。 

 あらすじ
 届け物を持ってアローラ地方を旅する少女・ムーンは、貯金1億円を目指しナマコブシ投げのバイトに励む少年・サンに出会う。

 第15章/ソード・シールド編 
ゲーム『ポケットモンスター ソード・シールド』をモチーフにした章。主な舞台はガラル地方。

先行版では話数を『エピソード○』と表記し、サブタイトルは「【カタカナの動詞】!!〇〇」という方式になっている。。

 第16章/スカーレット・バイオレット編 
ゲーム『ポケットモンスター スカーレット・バイオレット』をモチーフにした章。主な舞台はパルデア地方。

この章から『コロコロイチバン！』から1月遅れでwebサイト『週刊コロコロコミック』でも同内容の連載を開始した。また、2025年3月号で『コロコロイチバン！』での掲載を終了し『週刊コロコロコミック』の連載に一本化する事が発表されついる。

 登場人物 

 カントー地方 
 レッド
 オーキド・グリーン
 ブルー
 イエロー・デ・トキワグローブ

 ジョウト地方 
 ゴールド
 シルバー
 クリスタル

 ホウエン地方 
 ルビー
 サファイア
 エメラルド

 シンオウ地方 
 ダイヤモンド
 パール
 プラチナ・ベルリッツ

 イッシュ地方 
ブラック
ホワイト
ラクツ
ファイツ

 カロス地方 
エックス
ワイ・ナ・ガーベナ

 アローラ地方 
サン
ムーン

 ガラル地方 
剣創人
盾シルドミリア

 パルデア地方 
バイオレット・ラング
スカーレット・コイト