日本のキリシタン一覧は、戦国時代末期から明治時代初期までの日本の著名なキリシタン（当時のキリスト教徒）とその関係者の一覧。

 イエズス会の宣教師（伴天連 バテレン） 
フランシスコ・ザビエル （1506年頃 - 1552年）- 日本を初めて訪れた。
コスメ・デ・トーレス - (1510年 - 1570年) サビエルと共に来日し、その後を継いだ。
ルイス・フロイス - (1532年 - 1597年) 慶長2年5月24日 「日本史」を執筆したことで有名。
ルイス・デ・アルメイダ - (1525年? - 1583年) 医師にして商人出身、日本最初の病院・孤児院を設立。
ガスパル・ヴィレラ (1522年 - 1572年) - 京都布教を開始。
グネッキ・ソルディ・オルガンティノ - 京都を中心に活躍。
フランシスコ・カブラル - 日本地区布教長。トーレスの後を継ぐが、ヴァリニャーノと意見を異にして罷免。
アレッサンドロ・ヴァリニャーノ (1539年 - 1606年) - 東インド管区巡察師。総長の名代として日本を視察。
ガスパール・コエリョ (1530年 - 1590年）- カブラルの後任。初代日本準管区長。
ペドロ・ゴメス (1535年 - 1600年) - 第2代日本準管区長。西洋の学問を紹介した。
カルロ・スピノラ (1564年 - 1622年) - 数学者。「元和の大殉教」で処刑される。
ジロラモ・デ・アンゼリス（1568年 - 1623年）- 東北、蝦夷地方を中心に宣教を行った。蝦夷地を初めて訪れたヨーロッパ人でもある。
ベント・フェルナンデス(1579年 - 1633年）27年間の日本宣教中、京都の大殉教などローマへ書簡を多く書き送る。長崎にて穴吊刑で殉教。
クリストヴァン・フェレイラ (1580年 - 1650年) - 拷問の末に棄教して「転びバテレン」に。
ジュゼッペ・キアラ - 拷問の末に棄教して「転びバテレン」に。
ジョヴァンニ・バッティスタ・シドッティ（1668年 - 1714年） - 新井白石は　シドッティとの対話から得た知識をまとめ、『西洋紀聞』と『采覧異言』を著した。

 フランシスコ会の宣教師 
ペトロ・バプチスタ - 日本二十六聖人の中心的殉教者。
ルイス・ソテロ - 支倉常長をローマへ案内。

 日本人司祭・修道者 
鹿児島のベルナルド - ザビエルに見出され、ヨーロッパに学ぶも同地で病没。
ロレンソ了斎 - イエズス会士、修道者（イルマン）。元琵琶法師、サビエルの協力者。
 - 肥前国平戸の出身。イエズス会士。最初の日本人司祭 。
ペトロ岐部 - イエズス会士。ローマで叙階。日本人として初めてエルサレムを訪問。
ディオゴ結城 - 禁教下で20年にわたって宣教活動を続け、殉教。
ミゲル・ミノエス - イエズス会士。コインブラ大学にて日本人初の哲学の学位を取得。
小西マンショ - イエズス会士。「最後の日本人司祭」。
トマス西 - ドミニコ会司祭。
トマス荒木
ハビアン

 キリシタン大名・キリシタン武将・武士

 あ行 
安威了佐（シモン）-豊臣秀吉の右筆。
明石全登（ジュスト、ジョアン、ジョアニー、ヨハネ） - 宇喜多家の客将。関ヶ原の戦い、大坂の陣で活躍後行方不明。
甘粕信綱（ルイス） - 甘糟景継の次男。殉教。
天草鎮種（ドン・ミュッセル） - 天草種元の父と伝わる武将。伊豆守。
天草種元（ジョアン） - 天草五人衆。
天草久種（ドン＝ジョアン） - 天草種元の子。天草五人衆。
天野元信 - 熊谷元直娘婿。後に殉教者として列福。
有馬義貞（アンドレ） - 肥前日野江（島原）領主。
有馬晴信（プロタジオ） - 有馬義貞の次男。岡本大八事件で刑死。
有馬直純（サンセズ） - 有馬晴信の子、棄教後は迫害者に転じる。
石橋忠義（サンチョ） - 室町幕府御一家である石橋氏当主。織田信長より追放された後、松永久秀に身を寄せた際に入信。
池田教正（シメアン） - 丹後守。
伊智地文大夫（パウロ）
一条兼定（ドン・パウロ） - 土佐中村一条家当主。大友義鎮の甥であり娘婿。
市橋兵吉
一部勘解由（ドン・ジョアン）- 籠手田安昌の子、籠手田安経の弟。
一部正治（バルタザル） - 一部勘解由の子。
伊東祐勝（ジェロニモ） - 伊東義賢の弟。 
伊東義賢（バルトロメオ） - 伊東義祐の嫡孫。母方縁戚・大友宗麟の影響でキリシタンとなる。
宇喜多休閑（久閑）
宇久純尭（ドン＝ルイス） - 五島島主。宇久純定の次男。五島純玄の父。
宇久純定 - 宇久純尭、五島玄雅の父。
大谷吉継？
大友義鎮（ドン・フランシスコ） - 豊後領主。代表的なキリシタン大名の一人。宗麟の法号で知られている。
大友親家（セバスチャン） - 大友義鎮の次男。田原親貫の養子。
大友親盛（パンタレアン） - 大友義鎮の三男。田原親賢の養子。
大友義統（コンスタンチノ） - 大友義鎮の長男。棄教。
大村純忠（バルトロメオ） - 日本最初のキリシタン大名。
大村喜前（サンチョ） - 大村純忠の子。棄教。
大矢野種基（ジャコべ） - 天草五人衆。
大矢野種量（ジョアン） - 大矢野種基の子。天草五人衆。
岡越前守 - 宇喜多氏家臣。
岡清長 - 岡定俊の甥。
岡定俊
小笠原権之丞
小笠原玄也 - 小笠原秀清の三男。殉教。
小笠原長良 - 小笠原秀清の次男。棄教。
長船綱直 - 宇喜多氏家臣。
織田長益（ジョアン） - 織田信長の弟の一人。利休七哲の一人。
織田信秀 (侍従) - 織田信長の六男。
織田秀信（ペトロ） - 織田信忠の嫡男、信長の嫡孫。
織田秀則（パウロ） - 織田信忠の次男、信長の孫。

 か行 
加賀山興良（ディエゴ） - 通称隼人、高山右近、蒲生氏郷、細川忠興らに仕える。1619年、禁教令に叛いて殉教、斬首された。
蒲生氏郷（レオ） - 日野、会津を領す。
蒲生郷成
蒲生郷安
木下勝俊（ペテロ） - 若狭小浜城主。北政所（ねね）の甥。
岐部信泰 - 大友家臣。石垣原の戦いで戦死。
木村清久（ジョアン） - 豊臣家臣。大坂夏の陣で戦死。
京極高吉 - 晩年に受洗するも急死。
京極高次 - 秀吉、家康に仕えて近江大津、若狭小浜を領す。
京極高知 - 秀吉、家康に仕えて信州伊奈、丹後宮津を領す。
清田鎮忠 - 大友家臣。
熊谷元直（メルキオール） - 安芸熊谷氏。後に主君の毛利輝元により処刑される。死後、殉教者として祭られる。
黒田直之（ミゲル） - 黒田孝高の弟。黒田二十四騎の一人。
黒田長政（ダミアン） - 棄教後、迫害者に転じる。
黒田孝高（シメオン） - 官兵衛の通称と如水の号で知られる。豊臣秀吉の家臣。
黒田利高 - 黒田孝高の同母弟。黒田二十四騎の一人。
黒田利則 - 黒田孝高の同母弟。黒田二十四騎の一人。
上津浦鎮貞 - 天草五人衆。
上津浦種直（ドン＝ホクロン） - 天草五人衆。
籠手田安一（ジェロニモ） - 籠手田安経の子。
籠手田安経（アントニオ） - 平戸松浦氏重臣。日本キリシタンの礎石と仰がれる。1550年代に受洗。
籠手田安昌（ルイス） - 籠手田安経の父。
五島純玄（ドン＝ルイス） - 宇久純尭の子。
五島玄雅（ルイス） - 宇久純定の四男。棄教。
小西如清（ベント） - 小西隆佐の長男。
小西主殿介（ペトロ） - 小西隆佐の子、小西行長の異母兄。
小西行景（ジョアン） - 小西隆佐の三男。
小西行重（ドン・ヤコボ（ヤコブ） - 小西氏家老。
小西行長（アウグスティノ） - 関ヶ原敗戦後、キリシタンであるため切腹を拒み刑死。
小西隆佐（ジョウチン） - 小西如清、主殿介、行長、行景の父。
小早川秀包（シマオ） - 毛利元就の子、小早川隆景の養子。筑後国久留米城主。

 さ行 
税所敦朝（レオ） - 北郷三久家臣。薩摩の殉教者。
坂崎直盛（パウロ） - 宇喜多忠家の子。石見津和野藩主。
三箇頼連（マンショ） - 三箇頼照の子。
三箇頼照（サンチョ） - 明智光秀に味方し没落。
志賀親次（ドン＝パウロ） - 大友義統家臣。島津軍の侵攻を何度も食い止めた。
志岐鎮経（麟泉）（ドン＝ジョアン） - 後に棄教し、迫害側に回る。
志岐諸経 - 有馬晴純の五男。志岐麒泉の養子。親重、親弘？
斯波義銀?（サンショ?） - 尾張守護斯波義統の子。但し実際には同時期に共に追放された石橋忠義（サンチョ）と混同されたものと思われる。
柴田礼能 - 大友氏家臣。
栖本鎮通（バルトロメウ） - 天草五人衆。
栖本親高（ジョアン）- 栖本鎮通の子。天草五人衆。
瀬田左馬丞
宗義智（ダリオ） - 対馬領主。小西行長の娘マリアを妻に迎えたときに受洗したが、関ヶ原の合戦後すぐに棄教、マリアも離縁した。

 た行 
高山友照（ダリオ） - 飛騨守。高山右近の父。畿内における最初期のキリシタン大名の一人。
高山右近（ドン・ジュスト） - 代表的なキリシタン大名。一時、明石城主。追放先のマニラで客死。
田中吉政（バルトロメオ）
田原親虎（シマン） - 公卿柳原氏から田原親賢の養子。
筒井定次 - 筒井順国の長男。筒井順慶の養子。
津軽信堅 - 津軽為信の次男。
津軽信建 - 津軽為信の長男。
津軽信枚 - 津軽為信の三男。
佃又右衛門
寺沢広高（アゴスティニョ） - 棄教後は迫害者に転じる。
利光宗魚 - 大友家臣。
朝長純安（ドン＝ルイス） - 大村家臣。

 な行 
内藤如安（ジョアン） - 追放され、マニラで客死。
中川秀休
長崎純景（ベルナルド）
新納久饒 - 新納康久の次男。
新納康久 - 鶴丸城主。
新納旅庵 - 新納康久の三男。

 は行 
支倉常長（ドン・フィリッポ・フランシスコ） - 伊達政宗の家臣。
原胤信（ジョアン） - 江戸時代初期の旗本。
福田兼次（ジョーチ） - 大村家臣。福田城主。
畠山高政 - 河内国畠山氏の当主。晩年に帰依。
蜂須賀家政 - 蜂須賀正勝の子。
林田助右衛門（レオ） - 肥前国有馬氏四天王
細川興秋（ジョアン？） - 細川忠興の次男。
細川興元 - 細川幽斎の次男。細川忠興の弟。

 ま行 
前田秀以（パウロ） - 前田玄以の長男。
前田茂勝（コンスタンチノ） - 前田玄以の次男。
前野長康
牧村利貞 - 利休七哲の一人。稲葉一鉄の孫。
益田好次 - 小西家臣。島原の乱の一揆軍の首謀者の一人。
松浦隆信（宗陽） - 松浦氏28代当主。松浦隆信（道可）の曽孫。江戸幕府の禁教令のため棄教。
真鍋貞成 - 第一次木津川口合戦で織田方に属して戦死した真鍋貞友（七五三兵衛）の子。ローマ法王に宛てた手紙に署名している。
三木半太夫 - パウロ三木の父。
毛利重政 - 豊後速水郡の内で1万石。豊後守。
毛利高政 - 豊後佐伯領主。伊勢守。
毛利元鎮（フランシスコ） - 小早川秀包の長男。

 や行 
安富左兵衛尉徳円（ジョアン）- 有馬家臣。 入道の子。
安富入道徳円（シモン）- 有馬家臣。
矢野兼雲 - 島津家臣。
結城忠正（アンリケ） - 山城守。畿内における最初期のキリシタン大名の一人。
結城左衛門尉（アンタン） - 結城忠正の子。
結城弥平次（ジョルジュ） - 結城忠正の甥。小西家臣。
山科勝成（ロルテス） - 蒲生氏郷に召抱えられたとされるローマ人武士。架空の存在という指摘がある。

 ら行 
六角義賢 - 織田信長の侵攻の前に敗れ所領を失った晩年に受洗。

 わ行 
脇田直賢 - 李氏朝鮮出身の加賀前田氏の家臣。金沢町奉行。

 遣欧使節 

 天正遣欧少年使節 
伊東マンショ - 主席正使、大友宗麟の名代
千々石ミゲル - 正使、有馬晴信・大村純忠の名代
中浦ジュリアン - 副使
原マルティノ - 副使

 慶長遣欧使節 
支倉常長（ドン・フィリッポ・フランシスコ） - 伊達政宗家臣

 日本に関連する聖人・福者 
フランシスコ・ザビエル - 1619年列福、1622年列聖
日本二十六聖人 - 1597年に殉教。1627年列福、1862年列聖（ピウス9世による）
パウロ三木、フランシスコ吉、ディエゴ喜斎など
 - 元和の大殉教における殉教者55人を含め、1598年から1632年にかけて殉教した宣教師・司祭・信徒。1867年列福（ピウス9世による）。
カルロ・スピノラ（イタリア人宣教師）、ルイス・ソテロ（スペイン人宣教師）など。
聖トマス西と15殉教者 - 1633年から1637年にかけて殉教した宣教師・司祭・信徒。1981年列福、1987年列聖（ともにヨハネ・パウロ2世による）。
トマス西、長崎のマグダレナ、大村のマリナ、ロレンソ・ルイス（フィリピン人宣教師）など。
ペトロ岐部と187殉教者 - 1603年から1639年にかけて殉教した司祭・信徒。2008年列福（ベネディクト16世による）
ペトロ岐部、中浦ジュリアン、ディオゴ結城、ガスパル西、メルキオール熊谷豊前守元直など
高山右近 - 2017年列福（フランシスコによる）