保健所（ほけんしょ、ほけんじょとも言う）とは、地域住民の健康や衛生を支える公的機関の一つであり、地域保健法に基づき都道府県、政令指定都市、中核市、その他指定された市（保健所政令市）、特別区（東京23区）が設置する。

1938年（昭和13年）に保健所の設置が始まった当初は、国民、殊に農村の保健生活を向上させることを目的として無料の健康相談、保健相談に応じるほか衛生思想の普及、栄養食の改善、料理講習会、食品の腐敗防止、住宅改善の相談、学校給食、子供服の相談など幅広い業務を担うこととされていた。配置される職員は医師2人、薬剤師2人、看護婦3人、衛生指導員3人、書記1人を最小限の人員数とした。こうした目的や体制は戦中、戦後の社会情勢の変化を通じて大きく変化した。

近年では市町村保健センター、福祉事務所などと統合され「保健福祉事務所」「福祉保健所」「保健福祉センター」「健康福祉センター」といった名称となっている場合もあるが、地域保健法に基づき保健所を設置する必要があることから、その地方公共団体の組織規定上は○○保健所という名称も併せて付けている場合が多い。また、政令指定都市・中核市・保健所政令市において、とくに保健所を一つのみ設置している場合には、本庁の保健、衛生を所掌する部局と保健所が一体化している場合も多い。一方、全国の保健所の数は1989年（平成元年）の848から2020年の469まで統廃合が進んでいる。

 沿革 
 1937年（昭和12年）4月5日 : 保健所法公布、7月15日施行。
 1938年（昭和13年）
 1月11日 - 内務省から分離して厚生省設立
 3月24日 - 東日本18か所、西日本35か所に保健所を開設。この時の計画では1942年までに全国550か所に設置される予定であった。
 1947年（昭和22年）9月5日 : 保健所法改正
 1994年（平成6年）6月30日 : 地域保健対策強化のための関係法律の整備に関する法律（保健所法の地域保健法への改正および関連法の改正を目的）制定
 1997年（平成9年）4月1日 : 地域保健法施行

 業務 

保健所の業務は大別すると対人保健と対物保健に分けられる。

 対人保健(住民に対するもの)
 一般に保健指導または保健サービスと呼ばれる分野で、母子保健や老人保健など一般的なものは市町村保健センターに任せ、保健所は災害医療や感染症、精神保健など、専門的・広域的な業務に特化している場合が多い。ただし、中核市や政令指定都市、特別区などは保健所設置主体と一致するため、保健所がかなり詳細な部分まで行っている例もある。

 対物保健(地域に関するもの)
 一般に生活衛生と呼ばれ、食品衛生、獣医衛生、環境衛生および医事・薬事衛生の4分野からなる。これらは営業許可や立ち入り検査、違反施設に対する営業停止など、いわゆる「権力行政」としての権限を多く持っている。対応する法律により資格が規定されており、食品衛生監視員、狂犬病予防員、動物愛護担当職員、環境衛生監視員、医療監視員、薬事監視員がそれぞれの業務を受け持つ。

 具体的な業務の例 
保健所の業務を例示すると次のような多様な業務の全部又は一部を行っている。

 地域保健に関する思想の普及及び向上に関する事項等
 健康日本21に関すること。
 人口動態統計その他地域保健に係る統計に関する事項
 栄養の改善及び食品衛生に関する事項
 調理師及び製菓衛生師免許交付手続き。
 食品の製造、流通、調理及び販売施設・卸売市場・集団給食施設(飲食店など)に対する営業許可及び監視指導、諸届出の受理。
 イベントなどで食品を取り扱う場合の相談。
 食品に関する苦情相談の受付。
食品や容器包装等の収去（抜き取り）検査。
 食中毒について、医師からの報告の受理（食品衛生法第58条）。
 食中毒の原因調査、及び食中毒予防のための普及啓発活動。
 化製場等に関する法律に基づく事務。
 社会福祉施設（老人ホームなど）や特定給食施設（学校給食センターなど）に対する栄養指導。
 住宅、水道、下水道、廃棄物の処理、清掃その他の環境の衛生に関する事項
 上水道等水道の諸届出の受理、立入検査、指導。
 河川や井戸、プールなどの水質検査。
 公害対策（大気汚染、水質汚濁、土壌汚染など）。
 美容所、理容所、クリーニング所、旅館（ホテルなど宿泊施設全般）、興行場（映画館、劇場）、公衆浴場の営業許可及び監視指導。
 動物の管理についての相談。
 動物取扱業（ペットショップなど）の登録（動物愛護法）。
 狂犬病について獣医師からの届出の受理（狂犬病予防法第8条）。
 野犬・野良猫等の管理及び殺処分、引き取り先の募集（里親募集）。
 地域猫に関すること。
 医療及び薬事に関する事項
 医療関係免許（医師、歯科医師、看護師、薬剤師、栄養士など）申請の受付窓口。
 医薬品販売業、毒劇物販売業の許可・登録等。
 病院、診療所、施術所、薬局などの開設許可及び苦情処理等。
 医療法に基づく医療監視(医療機関への立ち入り検査)。
 保健師に関する事項
 市町村保健師等への教育や研修、指導、相談など。
 公共医療事業の向上及び増進に関する事項
 災害時に災害医療コーディネーターを介して、所管地域内のDMAT等の救護班へ指示・調整を行う 。
 母性及び乳幼児並びに老人の保健に関する事項
 母子健康手帳の交付、妊婦健康診査、乳幼児健康診査及び相談の受付。
 介護予防健診、介護予防事業に関すること（健康増進法）
 歯科保健に関する事項
 8020運動に関すること。
 精神保健に関する事項
 精神保健に関する相談の受付。
 措置入院について、通報・申請の受理及び入院の決定（精神保健福祉法29条）（覊束裁量）。
 医療保護入院、応急入院について精神科病院からの届出の受理。
 治療法の確立していない疾病その他の特殊の疾病により長期に療養を必要とする者の保健に関する事項
 難病対策（難病法）。
 エイズ、結核、性病、伝染病その他の疾病の予防に関する事項
 エイズの検査、相談、啓発。
 第1～4類感染症および指定感染症について、医師からの届出の受理（感染症法第12条）及び入院の勧告。
 発熱相談センターの設置。
 ガンや生活習慣病の集団検診。
 衛生上の試験及び検査に関する事項
 その他地域住民の健康の保持および増進に関する事項
 保健師による健康への相談、アドバイス、一般的な健康診断。

 法律上の保健所 

 建築物衛生法における保健所 
建築物衛生法3条に規定されている。
 環境衛生上の正しい知識の普及に図ること。
 環境衛生上の相談に応じ、環境衛生上必要な指導を行うこと。

 児童福祉法における保健所 
 児童の保健について、正しい衛生知識の普及を図ること。
 児童の健康相談に応じ、又は健康診査を行い、必要に応じ、保健指導を行うこと。
 身体に障害のある児童及び疾病により長期にわたり療養を必要とする児童の療育について、指導を行うこと。
 児童福祉施設に対し、栄養の改善その他衛生に関し、必要な助言を与えること。

 地域保健法における保健所 
地域保健法第6条により、保健所は、次の事項に係る企画、調整、指導などの事業を行うこととされている。
 地域保健に関する思想の普及及び向上に関する事項
 人口動態統計その他地域保健に係る統計に関する事項
 栄養の改善及び食品衛生に関する事項
 住宅、水道、下水道、廃棄物の処理、清掃その他の環境の衛生に関する事項
 医療及び薬事に関する事項
 保健師に関する事項
 公共医療事業の向上及び増進に関する事項
 母性及び乳幼児並びに老人の保健に関する事項
 歯科保健に関する事項
 精神保健に関する事項
 治療法の確立していない疾病その他の特殊の疾病により長期に療養を必要とする者の保健に関する事項
 エイズ、結核、性病、伝染病その他の疾病の予防に関する事項
 衛生上の試験及び検査に関する事項
 その他地域住民の健康の保持および増進に関する事項

 職員 
地域保健法施行令第5条第1項により、「保健所には、医師、歯科医師、薬剤師、獣医師、保健師、助産師、看護師、診療放射線技師、臨床検査技師、衛生検査技師、管理栄養士、栄養士、歯科衛生士、統計技術者、その他保健所の業務を行うために必要な者のうち、当該保健所を設置する法第5条第1項に規定する地方公共団体の長が必要と認める職員を置くものとする。」とされている。

その他保健所の業務を行うために必要な者とは、保健所の業務を担うために必要な任用資格を有する職員として、薬事監視員、食品衛生監視員、環境衛生監視員、医療監視員、狂犬病予防員などがある。

 保健所の所長 
地域保健法施行令第4条第1項では、保健所の所長とは保健所の医師であって、次の各号のいずれかに該当する技術吏員でなければならないとされている。
 3年以上公衆衛生の実務に従事した経験がある者
 厚生労働省組織令（平成12年政令第252号）第135条に規定する国立保健医療科学院の行う養成訓練の課程（現行1年、平成19年度までの例外規定で3か月コースあり）を経た者
 厚生労働大臣が、第2号に掲げる者と同等以上の技術又は経験を有すると認めた者（健康局長通知では「外国において、養成訓練課程に準じる課程を修了し公衆衛生修士 (MPH、MSPH) の学位を取得した者」とある。国内の公衆衛生大学院は対象となっていない）

ただし、地域保健法施行令第4条第2項では「地方公共団体の長が医師をもつて保健所の所長に充てることが著しく困難であると認めるときは、2年以内の期間を限り、次の各号のいずれにも該当する医師でない技術吏員をもつて保健所の所長に充てることができる。」とも定められている。
 厚生労働大臣が、公衆衛生行政に必要な医学に関する専門的知識に関し医師と同等以上の知識を有すると認めた者
 5年以上公衆衛生の実務に従事した経験がある者
 養成訓練課程を経た者

健康局長通知によると「厚生労働大臣が、公衆衛生行政に必要な医学に関する専門的知識に関し医師と同等以上の知識を有すると認めた者」とは、国立保健医療科学院教育訓練規程第5条第4項第1号に定める者と同等以上の学力を有すると国立保健医療科学院長が認め、「専門課程Ⅰ」の受講資格を得た者とされ、これを認めるに当たっては、国立保健医療科学院において、次に掲げる出題範囲の試験を行うとされる。

医師国家試験出題基準における
 必修の基本的事項に関する事柄
 医学総論に関する事柄
 医学各論のうち
 ア 健康危機管理関係業務を行う際に必要な感染症、精神疾患、中毒及び外因による疾患に関する事柄
 イ 健康増進関係業務を行う際に必要な主要な生活習慣病（悪性新生物、脳血管疾患、心疾患及び糖尿病）及び関連疾患に関する事柄
 ウ その他、公衆衛生行政（特定疾患、小児慢性疾患等の申請を含む）において関与する可能性の高い疾患に関する事柄

 保健所の一覧 
この節の参考資料

 北海道 
保健所所在地管轄区域札幌市保健所札幌市中央区札幌市市立函館保健所函館市函館市旭川市保健所旭川市旭川市小樽市保健所小樽市小樽市江別保健所江別市江別市、石狩市、石狩郡千歳保健所千歳市千歳市、恵庭市、北広島市岩見沢保健所岩見沢市岩見沢市、美唄市、三笠市、夕張市、樺戸郡（月形町）、空知郡（南幌町）、夕張郡滝川保健所滝川市芦別市、赤平市、滝川市、砂川市、歌志内市、空知郡（奈井江町、上砂川町）、樺戸郡（浦臼町、新十津川町）、雨竜郡（雨竜町）深川保健所深川市深川市、雨竜郡（妹背牛町、秩父別町、北竜町、沼田町）富良野保健所富良野市富良野市、空知郡（上富良野町、中富良野町、南富良野町）、勇払郡（占冠村）名寄保健所名寄市士別市、名寄市、上川郡、中川郡岩内保健所岩内町岩内郡、古宇郡倶知安保健所倶知安町島牧郡、寿都郡、磯谷郡、虻田郡（ニセコ町、真狩村、留寿都村、喜茂別町、京極町、倶知安町）、積丹郡、古平郡、余市郡江差保健所江差町檜山郡、爾志郡、奥尻郡渡島保健所函館市北斗市、亀田郡、松前郡、上磯郡、茅部郡八雲保健所八雲町二海郡、山越郡、瀬棚郡、久遠郡室蘭保健所室蘭市室蘭市、登別市、伊達市、虻田郡（豊浦町、洞爺湖町）、有珠郡苫小牧保健所苫小牧市苫小牧市、白老郡、勇払郡（厚真町、安平町、むかわ町）浦河保健所浦河町浦河郡、様似郡、幌泉郡静内保健所新ひだか町沙流郡、新冠郡、日高郡帯広保健所帯広市帯広市、河東郡、河西郡、中川郡、十勝郡、上川郡、広尾郡、足寄郡釧路保健所釧路市釧路市、釧路郡、厚岸郡、阿寒郡、白糠郡、川上郡根室保健所根室市根室市中標津保健所中標津町野付郡、標津郡、目梨郡網走保健所網走市網走市、斜里郡、網走郡（大空町）北見保健所北見市北見市、網走郡（美幌町、津別町）、常呂郡（訓子府町、置戸町）紋別保健所紋別市紋別市、紋別郡、常呂郡（佐呂間町）稚内保健所稚内市稚内市、天塩郡（幌延町、豊富町）、宗谷郡、枝幸郡、礼文郡、利尻郡留萌保健所留萌市留萌市、増毛郡、留萌郡、苫前郡、天塩郡（遠別町、天塩町）上川保健所旭川市上川郡、雨竜郡（幌加内町）

 青森県 
保健所所在地管轄区域青森市保健所青森市青森市八戸市保健所八戸市八戸市弘前保健所弘前市弘前市、黒石市、平川市、中津軽郡、南津軽郡、北津軽郡（板柳町）三戸地方保健所八戸市上北郡（おいらせ町）、三戸郡五所川原保健所五所川原市五所川原市、つがる市、西津軽郡、北津軽郡（鶴田町、中泊町）むつ保健所むつ市むつ市、下北郡上十三保健所十和田市十和田市、三沢市、上北郡（野辺地町、七戸町、六戸町、横浜町、東北町、六ヶ所村）東地方保健所青森市東津軽郡

 岩手県 
保健所所在地管轄区域盛岡市保健所盛岡市盛岡市県央保健所盛岡市八幡平市、滝沢市、岩手郡、紫波郡中部保健所花巻市花巻市、遠野市、北上市、和賀郡奥州保健所奥州市奥州市、胆沢郡一関保健所一関市一関市、西磐井郡大船渡保健所大船渡市大船渡市、陸前高田市、気仙郡釜石保健所釜石市釜石市、上閉伊郡宮古保健所宮古市宮古市、下閉伊郡（山田町、岩泉町、田野畑村）久慈保健所久慈市久慈市、下閉伊郡（普代村）、九戸郡（野田村、洋野町）二戸保健所二戸市二戸市、九戸郡（軽米町、九戸村）、二戸郡

 宮城県 
保健所所在地管轄区域仙台市保健所仙台市青葉区仙台市石巻保健所石巻市石巻市、登米市、東松島市、牡鹿郡塩釜保健所塩竈市塩竈市、多賀城市、名取市、岩沼市、富谷市、宮城郡、亘理郡、黒川郡大崎保健所大崎市大崎市、栗原市、加美郡、遠田郡気仙沼保健所気仙沼市気仙沼市、本吉郡仙南保健所大河原町白石市、角田市、刈田郡、柴田郡、伊具郡

 秋田県 
保健所所在地管轄区域秋田市保健所秋田市秋田市大館保健所大館市大館市、鹿角市、鹿角郡北秋田保健所北秋田市北秋田市、北秋田郡能代保健所能代市能代市、山本郡秋田中央保健所潟上市男鹿市、潟上市、南秋田郡由利本荘保健所由利本荘市由利本荘市、にかほ市大仙保健所大仙市大仙市、仙北市、仙北郡横手保健所横手市横手市湯沢保健所湯沢市湯沢市、雄勝郡

 山形県 
保健所所在地管轄区域山形市保健所山形市山形市村山保健所山形市寒河江市、上山市、村山市、天童市、東根市、尾花沢市、東村山郡、西村山郡、北村山郡最上保健所新庄市新庄市、最上郡置賜保健所米沢市米沢市、長井市、南陽市、東置賜郡、西置賜郡庄内保健所三川町鶴岡市、酒田市、東田川郡、飽海郡

 福島県 
保健所所在地管轄区域福島市保健所福島市福島市郡山市保健所郡山市郡山市いわき市保健所いわき市いわき市県北保健所福島市二本松市、伊達市、本宮市、伊達郡、安達郡県中保健所須賀川市須賀川市、田村市、岩瀬郡、石川郡、田村郡県南保健所白河市白河市、西白河郡、東白川郡会津保健所会津若松市会津若松市、喜多方市、耶麻郡、河沼郡、大沼郡南会津保健所南会津町南会津郡相双保健所南相馬市相馬市、南相馬市、双葉郡、相馬郡

 茨城県 
保健所所在地管轄区域出先機関水戸市保健所水戸市水戸市中央保健所水戸市笠間市、小美玉市、東茨城郡ひたちなか保健所ひたちなか市常陸太田市、ひたちなか市、常陸大宮市、那珂市、那珂郡、久慈郡ひたちなか保健所常陸大宮支所（常陸大宮市所在、同市、常陸太田市、那珂市および久慈郡を管轄）日立保健所日立市日立市、高萩市、北茨城市潮来保健所潮来市鹿嶋市、潮来市、神栖市、行方市、鉾田市潮来保健所鉾田支所（鉾田市所在、同市および行方市を管轄）竜ケ崎保健所龍ケ崎市龍ケ崎市、取手市、牛久市、守谷市、稲敷市、稲敷郡、北相馬郡土浦保健所土浦市土浦市、石岡市、かすみがうら市つくば保健所つくば市常総市、つくば市、つくばみらい市筑西保健所筑西市結城市、下妻市、筑西市、桜川市、結城郡古河保健所古河市古河市、坂東市、猿島郡

 栃木県 
保健所所在地管轄区域出先機関宇都宮市保健所宇都宮市宇都宮市県西保健所鹿沼市鹿沼市、日光市県西保健所今市支所（日光市所在、同市のみ管轄）県東保健所真岡市真岡市、芳賀郡県南保健所小山市小山市、下野市、栃木市、河内郡、下都賀郡県南保健所栃木支所（栃木市所在、同市および下都賀郡（壬生町）を管轄）県北保健所大田原市大田原市、那須塩原市、矢板市、さくら市、那須烏山市、那須郡、塩谷郡県北保健所矢板支所（矢板市所在、同市、さくら市および塩谷郡を管轄）県北保健所烏山支所（那須烏山市所在、同市および那須郡（那珂川町）を管轄）安足保健所足利市足利市、佐野市

 群馬県 
保健所所在地管轄区域前橋市保健所前橋市前橋市高崎市保健所高崎市高崎市伊勢崎保健所伊勢崎市伊勢崎市、佐波郡渋川保健所渋川市渋川市、北群馬郡藤岡保健所藤岡市藤岡市、多野郡富岡保健所富岡市富岡市、甘楽郡吾妻保健所中之条町吾妻郡利根沼田保健所沼田市沼田市、利根郡館林保健所館林市館林市、邑楽郡安中保健所安中市安中市桐生保健所桐生市桐生市、みどり市太田保健所太田市太田市

 埼玉県 
保健所所在地管轄区域さいたま市保健所さいたま市中央区さいたま市川越市保健所川越市川越市川口市保健所川口市川口市越谷市保健所越谷市越谷市南部保健所川口市蕨市、戸田市朝霞保健所朝霞市朝霞市、志木市、和光市、新座市、富士見市、ふじみ野市、入間郡（三芳町）鴻巣保健所鴻巣市鴻巣市、上尾市、桶川市、北本市、北足立郡東松山保健所東松山市東松山市、比企郡（滑川町、嵐山町、小川町、ときがわ町、川島町、吉見町）、秩父郡（東秩父村）秩父保健所秩父市秩父市、秩父郡（横瀬町、皆野町、長瀞町、小鹿野町）本庄保健所本庄市本庄市、児玉郡熊谷保健所熊谷市熊谷市、深谷市、大里郡加須保健所加須市行田市、加須市、羽生市春日部保健所春日部市春日部市、北葛飾郡（松伏町）幸手保健所幸手市久喜市、蓮田市、幸手市、白岡市、南埼玉郡、北葛飾郡（杉戸町）坂戸保健所坂戸市坂戸市、鶴ヶ島市、入間郡（毛呂山町、越生町）、比企郡（鳩山町）草加保健所草加市草加市、八潮市、三郷市、吉川市狭山保健所狭山市所沢市、飯能市、狭山市、入間市、日高市

 千葉県 
保健所所在地管轄区域出先機関千葉市保健所千葉市美浜区千葉市船橋市保健所船橋市船橋市柏市保健所柏市柏市市川保健所市川市市川市、浦安市松戸保健所松戸市松戸市、流山市、我孫子市松戸保健所我孫子連絡所（我孫子市所在、同市のみ管轄）野田保健所野田市野田市印旛保健所佐倉市佐倉市、四街道市、八街市、印西市、白井市、成田市、富里市、印旛郡印旛保健所成田支所（成田市所在、同市および富里市を管轄）長生保健所茂原市茂原市、長生郡夷隅保健所勝浦市勝浦市、いすみ市、夷隅郡市原保健所市原市市原市君津保健所木更津市木更津市、君津市、富津市、袖ケ浦市習志野保健所習志野市習志野市、八千代市、鎌ケ谷市習志野保健所鎌ケ谷連絡所（鎌ケ谷市所在、同市のみ管轄）香取保健所香取市香取市、香取郡海匝保健所銚子市銚子市、旭市、匝瑳市海匝保健所八日市場地域保健センター（匝瑳市所在、同市および旭市を管轄）山武保健所東金市東金市、山武市、大網白里市、山武郡安房保健所館山市館山市、鴨川市、南房総市、安房郡安房保健所鴨川地域保健センター（鴨川市所在、同市のみ管轄）

 東京都 
保健所所在地管轄区域出先機関千代田保健所千代田区千代田区中央区保健所中央区中央区みなと保健所港区港区新宿区保健所新宿区新宿区文京保健所文京区文京区台東保健所台東区台東区墨田区保健所墨田区墨田区江東区保健所江東区江東区品川区保健所品川区品川区目黒区保健所目黒区目黒区大田区保健所大田区大田区世田谷保健所世田谷区世田谷区渋谷区保健所渋谷区渋谷区中野区保健所中野区中野区杉並保健所杉並区杉並区池袋保健所豊島区豊島区北区保健所北区北区荒川区保健所荒川区荒川区板橋区保健所板橋区板橋区練馬区保健所練馬区練馬区足立保健所足立区足立区葛飾区保健所葛飾区葛飾区江戸川保健所江戸川区江戸川区八王子市保健所八王子市八王子市町田市保健所町田市町田市多摩府中保健所府中市武蔵野市、三鷹市、府中市、調布市、小金井市、狛江市西多摩保健所青梅市青梅市、福生市、羽村市、あきる野市、西多摩郡島しょ保健所新宿区大島町、利島村、新島村、神津島村、三宅村、御蔵島村、八丈町、青ヶ島村、小笠原村島しょ保健所大島出張所（大島町所在、同町、利島村、新島村および神津島村を管轄）島しょ保健所三宅出張所（三宅村所在、同村および御蔵島村を管轄）島しょ保健所八丈出張所（八丈町所在、同町および青ヶ島村を管轄）島しょ保健所小笠原出張所（小笠原村所在、同村のみ管轄）南多摩保健所多摩市日野市、多摩市、稲城市多摩立川保健所立川市立川市、昭島市、国分寺市、国立市、東大和市、武蔵村山市多摩小平保健所小平市小平市、東村山市、清瀬市、東久留米市、西東京市

 神奈川県 
保健所所在地管轄区域出先機関横浜市保健所横浜市中区横浜市川崎市保健所川崎市幸区川崎市相模原市保健所相模原市中央区相模原市横須賀市保健所横須賀市横須賀市藤沢市保健所藤沢市藤沢市茅ヶ崎市保健所茅ヶ崎市茅ヶ崎市、高座郡平塚保健福祉事務所平塚市平塚市、秦野市、伊勢原市、中郡平塚保健福祉事務所秦野センター（秦野市所在、同市および伊勢原市を管轄） 鎌倉保健福祉事務所鎌倉市鎌倉市、逗子市、三浦市、三浦郡鎌倉保健福祉事務所三崎センター（三浦市所在、同市のみ管轄） 小田原保健福祉事務所小田原市小田原市、南足柄市、足柄下郡、足柄上郡小田原保健福祉事務所足柄上センター（開成町所在、南足柄市および足柄上郡を管轄） 厚木保健福祉事務所厚木市厚木市、海老名市、座間市、大和市、綾瀬市、愛甲郡厚木保健福祉事務所大和センター（大和市所在、同市および綾瀬市を管轄） 

 新潟県 
保健所所在地管轄区域新潟市保健所新潟市中央区新潟市新発田保健所新発田市新発田市、阿賀野市、胎内市、北蒲原郡新津保健所新潟市秋葉区五泉市、東蒲原郡三条保健所三条市三条市、加茂市、燕市、西蒲原郡、南蒲原郡長岡保健所長岡市長岡市、小千谷市、見附市、三島郡魚沼保健所魚沼市魚沼市南魚沼保健所南魚沼市南魚沼市、南魚沼郡十日町保健所十日町市十日町市、中魚沼郡柏崎保健所柏崎市柏崎市、刈羽郡糸魚川保健所糸魚川市糸魚川市村上保健所村上市村上市、岩船郡佐渡保健所佐渡市佐渡市上越保健所上越市妙高市、上越市

 富山県 
保健所所在地管轄区域富山市保健所富山市富山市高岡厚生センター高岡市高岡市、氷見市、射水市新川厚生センター黒部市黒部市、魚津市、下新川郡中部厚生センター上市町滑川市、中新川郡砺波厚生センター南砺市砺波市、南砺市、小矢部市

 石川県 
保健所所在地管轄区域金沢市保健所金沢市金沢市南加賀保健所小松市小松市、能美市、加賀市、能美郡石川中央保健所白山市白山市、野々市市、かほく市、河北郡能登中部保健所七尾市七尾市、羽咋市、羽咋郡、鹿島郡能登北部保健所輪島市輪島市、珠洲市、鳳珠郡

 福井県 
保健所所在地管轄区域出先機関福井市保健所福井市福井市　福井保健所福井市吉田郡　坂井保健所あわら市あわら市、坂井市 二州保健所敦賀市敦賀市、三方郡、三方上中郡（若狭町のうち旧三方町域）　若狭保健所小浜市小浜市、大飯郡、三方上中郡（若狭町のうち旧上中町域）　奥越保健所大野市大野市、勝山市　丹南保健所鯖江市鯖江市、越前市、今立郡、南条郡、丹生郡丹南保健所武生保健部（越前市所在、同市および今立郡、南条郡を管轄） 

 山梨県 
保健所所在地管轄区域甲府市保健所甲府市甲府市中北保健所韮崎市韮崎市、南アルプス市、北杜市、甲斐市、中央市、中巨摩郡峡東保健所山梨市山梨市、笛吹市、甲州市峡南保健所富士川町西八代郡、南巨摩郡富士・東部保健所富士吉田市富士吉田市、都留市、大月市、上野原市、南都留郡、北都留郡

 長野県 
保健所所在地管轄区域長野市保健所長野市長野市松本市保健所松本市松本市佐久保健所佐久市小諸市、佐久市、南佐久郡、北佐久郡上田保健所上田市上田市、東御市、小県郡諏訪保健所諏訪市岡谷市、諏訪市、茅野市、諏訪郡伊那保健所伊那市伊那市、駒ヶ根市、上伊那郡飯田保健所飯田市飯田市、下伊那郡木曽保健所木曽町木曽郡松本保健所松本市塩尻市、安曇野市、東筑摩郡大町保健所大町市大町市、北安曇郡長野保健所長野市須坂市、千曲市、埴科郡、上高井郡、上水内郡北信保健所飯山市中野市、飯山市、下高井郡、下水内郡

 岐阜県 
保健所所在地管轄区域岐阜市保健所岐阜市岐阜市関保健所美濃市関市、美濃市、郡上市東濃保健所多治見市多治見市、瑞浪市、土岐市恵那保健所恵那市中津川市、恵那市岐阜保健所各務原市羽島市、各務原市、山県市、瑞穂市、本巣市、羽島郡、本巣郡西濃保健所大垣市大垣市、海津市、養老郡、不破郡、安八郡、揖斐郡可茂保健所美濃加茂市美濃加茂市、可児市、加茂郡、可児郡飛騨保健所高山市高山市、飛騨市、下呂市、大野郡

 静岡県 
保健所所在地管轄区域静岡市保健所静岡市葵区静岡市浜松市保健所浜松市中央区浜松市賀茂保健所下田市下田市、賀茂郡熱海保健所熱海市熱海市、伊東市御殿場保健所御殿場市御殿場市、駿東郡（小山町）富士保健所富士市富士市、富士宮市東部保健所沼津市沼津市、三島市、裾野市、伊豆の国市、伊豆市、田方郡、駿東郡（清水町、長泉町）中部保健所藤枝市島田市、焼津市、藤枝市、牧之原市、榛原郡西部保健所磐田市磐田市、袋井市、湖西市、掛川市、菊川市、御前崎市、周智郡

 愛知県 
保健所所在地管轄区域名古屋市保健所名古屋市中区名古屋市豊橋市保健所豊橋市豊橋市岡崎市保健所岡崎市岡崎市一宮市保健所一宮市一宮市豊田市保健所豊田市豊田市瀬戸保健所瀬戸市瀬戸市、尾張旭市、豊明市、日進市、長久手市、愛知郡半田保健所半田市半田市、知多郡春日井保健所春日井市春日井市、小牧市豊川保健所豊川市豊川市、蒲郡市、田原市津島保健所津島市津島市、愛西市、弥富市、あま市、海部郡西尾保健所西尾市西尾市、額田郡江南保健所江南市犬山市、江南市、岩倉市、丹羽郡新城保健所新城市新城市、北設楽郡知多保健所知多市常滑市、東海市、大府市、知多市清須保健所清須市稲沢市、清須市、北名古屋市、西春日井郡衣浦東部保健所刈谷市碧南市、刈谷市、安城市、知立市、高浜市、みよし市

 三重県 
保健所所在地管轄区域四日市市保健所四日市市四日市市桑名保健所桑名市桑名市、いなべ市、桑名郡、員弁郡、三重郡鈴鹿保健所鈴鹿市鈴鹿市、亀山市津保健所津市津市松阪保健所松阪市松阪市、多気郡伊勢保健所伊勢市伊勢市、鳥羽市、志摩市、度会郡伊賀保健所伊賀市名張市、伊賀市尾鷲保健所尾鷲市尾鷲市、北牟婁郡熊野保健所熊野市熊野市、南牟婁郡

 滋賀県 
保健所所在地管轄区域大津市保健所大津市大津市草津保健所草津市草津市、守山市、栗東市、野洲市甲賀保健所甲賀市甲賀市、湖南市東近江保健所東近江市近江八幡市、東近江市、蒲生郡彦根保健所彦根市彦根市、愛知郡、犬上郡長浜保健所長浜市長浜市、米原市高島保健所高島市高島市

 京都府 
保健所所在地管轄区域京都市保健所京都市中京区京都市乙訓保健所向日市向日市、長岡京市、乙訓郡山城北保健所宇治市宇治市、城陽市、八幡市、京田辺市、久世郡、綴喜郡山城南保健所木津川市木津川市、相楽郡南丹保健所南丹市亀岡市、南丹市、船井郡中丹西保健所福知山市福知山市中丹東保健所舞鶴市舞鶴市、綾部市丹後保健所京丹後市宮津市、京丹後市、与謝郡

 大阪府 
保健所所在地管轄区域大阪市保健所大阪市阿倍野区大阪市堺市保健所堺市堺区堺市豊中市保健所豊中市豊中市高槻市保健所高槻市高槻市枚方市保健所枚方市枚方市八尾市保健所八尾市八尾市東大阪市保健所東大阪市東大阪市寝屋川市保健所寝屋川市寝屋川市吹田市保健所吹田市吹田市池田保健所池田市池田市、箕面市、豊能郡茨木保健所茨木市茨木市、摂津市、三島郡守口保健所守口市守口市、門真市四條畷保健所四條畷市大東市、四條畷市、交野市藤井寺保健所藤井寺市松原市、羽曳野市、柏原市、藤井寺市富田林保健所富田林市富田林市、河内長野市、大阪狭山市、南河内郡和泉保健所和泉市泉大津市、和泉市、高石市、泉北郡岸和田保健所岸和田市岸和田市、貝塚市泉佐野保健所泉佐野市泉佐野市、泉南市、阪南市、泉南郡

 兵庫県 
保健所所在地管轄区域神戸市保健所神戸市中央区神戸市姫路市保健所姫路市姫路市尼崎市保健所尼崎市尼崎市あかし保健所明石市明石市西宮市保健所西宮市西宮市芦屋保健所芦屋市芦屋市伊丹保健所伊丹市伊丹市、川西市、川辺郡宝塚保健所宝塚市宝塚市、三田市加古川保健所加古川市加古川市、高砂市、加古郡加東保健所加東市西脇市、三木市、加西市、小野市、加東市、多可郡龍野保健所たつの市たつの市、宍粟市、揖保郡、佐用郡赤穂保健所赤穂市相生市、赤穂市、赤穂郡福崎保健所福崎町神崎郡豊岡保健所豊岡市豊岡市、美方郡朝来保健所朝来市養父市、朝来市丹波保健所丹波市丹波市、丹波篠山市洲本保健所洲本市洲本市、淡路市、南あわじ市

 奈良県 
保健所所在地管轄区域奈良市保健所奈良市奈良市郡山保健所大和郡山市大和郡山市、天理市、生駒市、山辺郡、生駒郡中和保健所橿原市橿原市、桜井市、宇陀市、大和高田市、御所市、香芝市、葛城市、磯城郡、宇陀郡、高市郡、北葛城郡吉野保健所下市町五條市、吉野郡

 和歌山県 
保健所所在地管轄区域和歌山市保健所和歌山市和歌山市海南保健所海南市海南市、海草郡岩出保健所岩出市紀の川市、岩出市橋本保健所橋本市橋本市、伊都郡湯浅保健所湯浅町有田市、有田郡御坊保健所御坊市御坊市、日高郡（美浜町、日高町、由良町、印南町、日高川町）田辺保健所田辺市田辺市、日高郡（みなべ町）、西牟婁郡新宮保健所新宮市新宮市、東牟婁郡

 鳥取県 
保健所所在地管轄区域鳥取市保健所鳥取市鳥取市、八頭郡、岩美郡倉吉保健所倉吉市倉吉市、東伯郡米子保健所米子市米子市、境港市、西伯郡、日野郡

 島根県 
保健所所在地管轄区域松江市・島根県共同設置松江保健所松江市松江市、安来市雲南保健所雲南市雲南市、仁多郡、飯石郡出雲保健所出雲市出雲市浜田保健所浜田市浜田市、江津市益田保健所益田市益田市、鹿足郡県央保健所大田市大田市、邑智郡隠岐保健所隠岐の島町隠岐郡

 岡山県 
保健所所在地管轄区域出先機関岡山市保健所岡山市北区岡山市倉敷市保健所倉敷市倉敷市備中保健所倉敷市総社市、笠岡市、井原市、浅口市、都窪郡、浅口郡、小田郡備中保健所井笠支所（笠岡市所在、同市、井原市、浅口市、浅口郡および小田郡を管轄）備北保健所高梁市高梁市、新見市備北保健所新見支所（新見市所在、同市のみ管轄）真庭保健所真庭市真庭市、真庭郡美作保健所津山市津山市、美作市、苫田郡、久米郡、勝田郡、英田郡美作保健所勝英支所（美作市所在、同市、勝田郡および英田郡を管轄）備前保健所岡山市中区玉野市、瀬戸内市、備前市、赤磐市、加賀郡、和気郡備前保健所東備支所（和気町所在、備前市、赤磐市および和気郡を管轄）

 広島県 
保健所所在地管轄区域出先機関広島市保健所広島市中区広島市福山市保健所福山市福山市呉市保健所呉市呉市西部保健所廿日市市大竹市、廿日市市、安芸高田市、江田島市、安芸郡、山県郡西部保健所広島支所（広島市中区所在、安芸高田市、安芸郡および山県郡を管轄）西部保健所呉支所（呉市所在、江田島市を管轄）西部東保健所東広島市竹原市、東広島市、豊田郡東部保健所尾道市三原市、尾道市、府中市、世羅郡、神石郡東部保健所福山支所（福山市所在、府中市および神石郡を管轄）北部保健所三次市三次市、庄原市

 山口県 
保健所所在地管轄区域下関保健所下関市下関市岩国環境保健所岩国市岩国市、玖珂郡柳井環境保健所柳井市柳井市、大島郡、熊毛郡周南環境保健所周南市下松市、光市、周南市防府保健所防府市防府市山口環境保健所山口市山口市宇部環境保健所宇部市宇部市、美祢市、山陽小野田市長門環境保健所長門市長門市萩環境保健所萩市萩市、阿武郡

 徳島県 
保健所所在地管轄区域徳島保健所徳島市徳島市、鳴門市、小松島市、勝浦郡、名東郡、名西郡、板野郡阿南保健所阿南市阿南市、那賀郡美波保健所美波町海部郡吉野川保健所吉野川市吉野川市、阿波市美馬保健所美馬市美馬市、美馬郡三好保健所三好市三好市、三好郡

 香川県 
保健所所在地管轄区域高松市保健所高松市高松市小豆保健所土庄町小豆郡西讃保健所観音寺市観音寺市、三豊市東讃保健所さぬき市さぬき市、東かがわ市、木田郡、香川郡中讃保健所丸亀市丸亀市、坂出市、善通寺市、綾歌郡、仲多度郡

 愛媛県 
保健所所在地管轄区域松山市保健所松山市松山市四国中央保健所四国中央市四国中央市今治保健所今治市今治市、越智郡中予保健所松山市伊予市、東温市、上浮穴郡、伊予郡宇和島保健所宇和島市宇和島市、北宇和郡、南宇和郡西条保健所西条市新居浜市、西条市八幡浜保健所八幡浜市八幡浜市、大洲市、西予市、喜多郡、西宇和郡

 高知県 
保健所所在地管轄区域高知市保健所高知市高知市幡多福祉保健所四万十市宿毛市、土佐清水市、四万十市、幡多郡須崎福祉保健所須崎市須崎市、高岡郡（中土佐町、梼原町、津野町、四万十町）中央東福祉保健所香美市南国市、香南市、香美市、長岡郡、土佐郡中央西福祉保健所佐川町土佐市、吾川郡、高岡郡（佐川町、越知町、日高村）安芸福祉保健所安芸市室戸市、安芸市、安芸郡

 福岡県 
保健所所在地管轄区域北九州市保健所北九州市小倉北区北九州市中央保健所福岡市中央区福岡市中央区博多保健所福岡市博多区福岡市博多区南保健所福岡市南区福岡市南区早良保健所福岡市早良区福岡市早良区東保健所福岡市東区福岡市東区西保健所福岡市西区福岡市西区城南保健所福岡市城南区福岡市城南区久留米市保健所久留米市久留米市宗像・遠賀保健福祉環境事務所宗像市中間市、宗像市、福津市、遠賀郡粕屋保健福祉事務所粕屋町古賀市、糟屋郡筑紫保健福祉環境事務所大野城市筑紫野市、春日市、大野城市、太宰府市、那珂川市糸島保健福祉事務所糸島市糸島市田川保健福祉事務所田川市田川市、田川郡北筑後保健福祉環境事務所朝倉市小郡市、うきは市、朝倉市、朝倉郡、三井郡南筑後保健福祉環境事務所柳川市大牟田市、柳川市、八女市、筑後市、大川市、みやま市、三潴郡、八女郡京築保健福祉環境事務所行橋市行橋市、豊前市、京都郡、築上郡嘉穂・鞍手保健福祉環境事務所飯塚市直方市、飯塚市、宮若市、嘉麻市、鞍手郡、嘉穂郡

 佐賀県 
保健所所在地管轄区域佐賀中部保健福祉事務所佐賀市佐賀市、多久市、小城市、神埼市、神埼郡鳥栖保健福祉事務所鳥栖市鳥栖市、三養基郡唐津保健福祉事務所唐津市唐津市、東松浦郡伊万里保健福祉事務所伊万里市伊万里市、西松浦郡杵藤保健福祉事務所武雄市武雄市、鹿島市、嬉野市、杵島郡、藤津郡

 長崎県 
保健所所在地管轄区域長崎市保健所長崎市長崎市佐世保市保健所佐世保市佐世保市西彼保健所長崎市西海市、西彼杵郡県央保健所諌早市諌早市、大村市、東彼杵郡県南保健所島原市島原市、雲仙市、南島原市県北保健所平戸市平戸市、松浦市、北松浦郡（佐々町）五島保健所五島市五島市上五島保健所新上五島町北松浦郡（小値賀町）、南松浦郡壱岐保健所壱岐市壱岐市対馬保健所対馬市対馬市

 熊本県 
保健所所在地管轄区域熊本市保健所熊本市中央区熊本市山鹿保健所山鹿市山鹿市菊池保健所菊池市菊池市、合志市、菊池郡阿蘇保健所阿蘇市阿蘇市、阿蘇郡御船保健所御船町上益城郡八代保健所八代市八代市、八代郡水俣保健所水俣市水俣市、葦北郡人吉保健所人吉市人吉市、球磨郡有明保健所玉名市荒尾市、玉名市、玉名郡宇城保健所宇城市宇土市、宇城市、下益城郡天草保健所天草市上天草市、天草市、天草郡

 大分県 
保健所所在地管轄区域出先機関大分市保健所大分市大分市東部保健所別府市別府市、杵築市、国東市、速見郡、東国東郡東部保健所国東保健部（国東市所在、同市および東国東郡管轄）中部保健所臼杵市臼杵市、津久見市、由布市中部保健所由布保健部（由布市所在、同市のみ管轄）南部保健所佐伯市佐伯市豊肥保健所豊後大野市豊後大野市、竹田市西部保健所日田市日田市、玖珠郡北部保健所中津市中津市、宇佐市、豊後高田市北部保健所豊後高田保健部（豊後高田市所在、同市のみ管轄）

 宮崎県 
保健所所在地管轄区域宮崎市保健所宮崎市宮崎市都城保健所都城市都城市、北諸県郡延岡保健所延岡市延岡市日南保健所日南市日南市、串間市小林保健所小林市小林市、えびの市、西諸県郡高鍋保健所高鍋町西都市、児湯郡高千穂保健所高千穂町西臼杵郡日向保健所日向市日向市、東臼杵郡中央保健所宮崎市東諸県郡

 鹿児島県 
保健所所在地管轄区域鹿児島市保健所鹿児島市鹿児島市指宿保健所指宿市指宿市加世田保健所南さつま市枕崎市、南さつま市、南九州市伊集院保健所日置市日置市、いちき串木野市、鹿児島郡出水保健所出水市阿久根市、出水市、出水郡大口保健所伊佐市伊佐市志布志保健所志布志市曽於市、志布志市、曽於郡鹿屋保健所鹿屋市鹿屋市、垂水市、肝属郡西之表保健所西之表市西之表市、熊毛郡（中種子町、南種子町）屋久島保健所屋久島町熊毛郡（屋久島町）名瀬保健所奄美市奄美市、大島郡（大和村、宇検村、瀬戸内町、龍郷町、喜界町）徳之島保健所徳之島町大島郡（徳之島町、天城町、伊仙町、和泊町、知名町、与論町）川薩保健所薩摩川内市薩摩川内市、薩摩郡姶良保健所霧島市霧島市、姶良市、姶良郡

 沖縄県 
保健所所在地管轄区域那覇市保健所那覇市那覇市北部保健所名護市名護市、国頭郡（国頭村、大宜味村、東村、今帰仁村、本部町、伊江村）、島尻郡（伊平屋村、伊是名村）南部保健所南風原町糸満市、浦添市、豊見城市、南城市、中頭郡（西原町）、島尻郡（与那原町、南風原町、八重瀬町、渡嘉敷村、座間味村、粟国村、渡名喜村、南大東村、北大東村、久米島町）宮古保健所宮古島市宮古島市、宮古郡八重山保健所石垣市石垣市、八重山郡中部保健所沖縄市宜野湾市、沖縄市、うるま市、国頭郡（恩納村、宜野座村、金武町）、中頭郡（読谷村、嘉手納町、北谷町、北中城村、中城村）