五稜郭駅（ごりょうかくえき）は、北海道函館市亀田本町にある、北海道旅客鉄道（JR北海道）・道南いさりび鉄道の駅である。両社の共同使用駅であり、JR北海道が管轄する。JR北海道の駅番号はH74。事務管理コードは▲140102。

本稿では営業キロ上で同一地点にある日本貨物鉄道（JR貨物）の函館貨物駅（はこだてかもつえき）や、かつて駅前にあった函館市交通局（現・函館市企業局交通部、函館市電）本線の五稜郭駅前停留場（ごりょうかくえきまえていりゅうじょう）についても記述する。

 歴史 

 JR北海道・JR貨物・道南いさりび鉄道 

JR貨物五稜郭機関区、かつて設置されていたJR北海道青函運転所についてはそれぞれのリンク先を参照。

 1911年（明治44年）9月1日：国有鉄道函館本線の駅として開業。旅客・荷物を取扱い。
 時期不詳：貨物の取扱いを開始。正確な時期は不明だが、1912年（大正元年）の停車場一覧では一般駅となっている。
 1913年（大正2年）9月15日：国有鉄道上磯軽便線として、当駅 - 上磯駅間が開業。
 1922年（大正11年）
 6月15日：函館工場が移転、五稜郭工場と改称。
 9月2日：上磯軽便線が上磯線に改称。
 1924年（大正13年）：線路移設により、北海瓦斯会社（現・北海道ガス）函館工場への専用線が函館駅から五稜郭駅へ移管。
 1936年（昭和11年）11月10日：上磯線が江差線に改称。
 1942年（昭和17年）
 9月11日：五稜郭工場が五稜郭工機部と改称。
 12月27日：函館本線の函館駅 - 当駅間が複線化。
 1943年（昭和18年）1月10日：五稜郭操車場設置、一部使用開始。
 1944年（昭和19年）
 1月10日：有川桟橋の第3岸壁（第1可動橋）が竣工。青函連絡船（貨車航送船）による貨車の積み降ろしが開始。
 9月30日：函館本線の当駅 - 桔梗駅間が複線化。有川埠頭に青函連絡船（貨物便）用の第4岸壁（第2可動橋）が竣工、使用開始。
 1949年（昭和24年）6月1日：日本国有鉄道法施行に伴い、日本国有鉄道（国鉄）に移管。
 1950年（昭和25年）
 1月10日：五稜郭工機部が五稜郭工場と改称。
 2月10日：五稜郭貨車区設置。有川埠頭に貨物駅設置。
 1973年（昭和48年）9月1日：五稜郭工場が苗穂工場五稜郭車両センターとなる。
 1977年（昭和52年）10月：駅舎改築。
 1980年（昭和55年）
 5月1日：貨物ターミナル使用開始。
 10月1日：函館駅のコンテナホームを当駅に移転。コンテナ貨物の取り扱いを開始。
 1984年（昭和59年）2月1日：五稜郭操車場使用停止。同時に、有川桟橋での青函連絡船（貨車航送船）による貨車の積み降ろしも廃止。
 1985年（昭和60年）3月20日：苗穂工場五稜郭車両センターが五稜郭車両所となる。
 1986年（昭和61年）11月1日：荷物の取り扱いを終了。五稜郭貨車区を函館運転所に統合。
 1987年（昭和62年）4月1日：国鉄分割民営化に伴い、北海道旅客鉄道（JR北海道）・日本貨物鉄道（JR貨物）の駅となる。江差線の当駅 - 木古内駅間を自動閉塞化およびCTC化。
 1988年（昭和63年）
 3月13日：海峡線（津軽海峡線）開業に伴い、函館本線の函館駅 - 当駅間と江差線の当駅 - 木古内駅間が電化（交流20,000V・50Hz）。
 8月8日：駅構内にトラベルセンターを開設。
 1997年（平成9年）10月1日：快速「海峡」・特急「はつかり」の全列車と、早朝・深夜の特急「北斗」「スーパー北斗」停車駅となる。
 2002年（平成14年）12月1日：ダイヤ改正に伴い、快速「海峡」・特急「はつかり」が廃止。特急「白鳥」・「スーパー白鳥」の停車駅となる。前日までは津軽海峡線の特急列車がすべて停車していたが、この改正で大半の列車が通過となる。
 2007年（平成19年）
 3月：窓口営業時間・改札時間延長のため、営業要員の泊まり勤務を復活。
 10月1日：JR北海道の駅が駅番号表示を開始。
 2009年（平成21年）5月24日：貨物駅構内に置かれていたコンテナが多数物色され、中に入っていた砂糖などが盗まれているのが発見される。この事件を受けJR貨物は、夜間に貨物駅構内の照明を行うことや、パトロールの強化を実施することになった。
 2010年（平成22年）12月4日：特急「北斗」・「スーパー北斗」のうち、15号を除く全列車が停車するようになる。
 2011年（平成23年）
 3月12日：貨物駅を函館貨物駅に改称。
 8月5日：開業100周年を記念して駅舎の外装をリニューアルし、あわせて駅名標を五稜郭をモチーフにした星型に変更。
 2013年（平成25年）11月1日：特急「北斗」・「スーパー北斗」全列車が停車するようになる。
 2016年（平成28年）
 3月26日：北海道新幹線新青森駅 - 新函館北斗駅間開通に伴い、函館本線の当駅 - 新函館北斗駅間が電化（交流20,000 V・50 Hz）。江差線の当駅 - 木古内駅間がJR北海道から経営分離され、道南いさりび鉄道に移管。路線名が同社の道南いさりび鉄道線に変更。五稜郭駅はJR北海道と道南いさりび鉄道の共同使用駅となる。
 10月14日：指定席券売機の使用開始。
 2022年（令和4年）度：話せる券売機を設置。
 2024年（令和6年）
 3月16日：自動改札機導入、函館本線でICカード「Kitaca」の利用が可能となる。
 4月1日：函館貨物駅構内にコンテナと一般トラックの積替ステーションを開設。

 函館市電 
 1955年（昭和30年）11月27日：函館市交通局（函館市電）五稜郭駅前停留所が開業。
 1978年（昭和53年）11月1日：函館市電五稜郭駅前停留所廃止。

 JR北海道・道南いさりび鉄道 五稜郭駅 

 乗り入れ路線 
当駅はJR北海道函館本線と道南いさりび鉄道線が乗り入れる。道南いさりび鉄道線の列車はすべてJR函館本線函館駅まで直通運転する。JR貨物は両路線における第二種鉄道事業（他者の線路を借り受けて運送）を行う。

札幌方面の特急「北斗」（2号を除く）、新函館北斗発着の新幹線アクセス列車「はこだてライナー」の全列車が停車する。かつては優等列車の停車は一部のみだったが、のちに津軽海峡線（かつての海峡線経由の在来線系統）の快速・特急列車がすべて停車するようになり、函館本線の特急列車も停車列車が増加した。2002年（平成14年）12月1日のダイヤ改正で津軽海峡線の列車がすべて特急となり、停車列車が大幅に削減された。2013年（平成25年）11月1日のダイヤ修正で函館本線の特急がすべて停車するようになった。2016年（平成28年）3月26日の北海道新幹線開業に伴い、津軽海峡線の定期旅客列車の運行は終了し、当駅から本州方面へ直通する旅客列車はなくなった。

 駅構造 
島式ホーム2面4線を有する地上駅。ホーム番号は駅舎側から3・4・5・6番のりばとなっている。1・2番線は側線で、6番線以降も12番線まで存在するが、いずれもホームはない。7・8番線は貨物列車の着発線となっている。本線は、下りが5番線、上りが4番線である。

駅舎は構内東側（1番線側）にあり、2つのホームとは跨線橋で連絡している。

駅舎内にはみどりの窓口・JRの自動券売機・指定席券売機・話せる券売機・いさりび鉄道の自動券売機が設置されている。自動改札機が設置されているがKitacaは函館本線でのみ利用可能であり、道南いさりび鉄道線では利用できない。

かつては売店としてキヨスクがあったが2018年（平成30年）3月に閉店、その後同年4月10日に道南いさりび鉄道が自社運営の売店を開設している。

直営駅であり、管理駅として函館本線の桔梗駅を管理下に置く。道南いさりび鉄道移管前は七重浜駅 - 釜谷駅間の各駅も管理していた。終日社員配置で営業社員のほか、信号詰所には運転社員が配置されている。

駅構内の西側にはJR北海道五稜郭車両所、構内の北側にはJR貨物五稜郭機関区がある。かつては五稜郭機関区の周囲には五稜郭操車場が広がっていた。

1967年（昭和42年）から駅そばの店舗が設けられ、2014年（平成26年）10月からは北海道キヨスクが「駅そば みかど JR五稜郭駅店」として運営していたが、店舗の老朽化のため2016年（平成28年）2月28日をもって営業を終了した。

 のりば 

のりば路線方向行先3（待避線）4函館本線上り函館方面5函館本線下り新函館北斗・札幌方面道南いさりび鉄道線上り上磯・木古内方面6（臨時ホーム）

6番のりばは現在定期列車の発着がない。2002年（平成14年）12月1日のダイヤ改正まで、一部の札幌発の特急「北斗」・「スーパー北斗」が盛岡行の特急「はつかり」と連絡するために使用していた。3番のりばは通常、機関車の待避線として用いられている。ただし、七飯方面からの一部列車の乗客の降車に用いられることがあるほか、寝台特急「トワイライトエクスプレス」が機関車付け替えのため同のりばに運転停車を行っていた。

5番のりばのホームは機関車を含めて8両分しかなく、快速「海峡」が増結運転された場合には前7両のみドア扱いをし、後の車両は締切だった（ドアカット）。なお、4番のりばは13両分あったため、すべての車両においてドア扱いを行っていた。