日蓮宗（にちれんしゅう）は、

 日本仏教の宗旨の一つ。法華宗とも称する。鎌倉時代中期に日蓮によって興され、かつては（天台法華宗に対し）日蓮法華宗とも称した。

 日本仏教の宗派の一つ。
 1872年（明治5年）、政策「一宗一管長」制に基づいて合同した日蓮門下の全門流の宗号。1874年（明治7年）、日蓮宗一致派と日蓮宗勝劣派に分かれ解散。
 1876年（明治9年）、日蓮宗一致派が公称を許された宗号。1941年（昭和16年）、三派合同により解散。
 1941年（昭和16年）、三派合同により成立した現行の「宗教法人・日蓮宗」。身延山久遠寺を総本山とする。現在国内に5300を越える寺院がある。

 宗旨・日蓮宗の概要 

本節では、鎌倉仏教の宗旨日蓮宗/法華宗（≠宗教法人日蓮宗）の宗祖日蓮の教えの大要を紹介する。

 教学と教義 
日蓮が説いた本尊(大曼荼羅)・題目・戒壇を三大秘法として、諸経の王と位置付けられる経典、妙法蓮華経（法華経）を釈迦の本懐にして最高無上としている。題目（南無妙法蓮華経）を唱えること（唱題）を重視している。「南無妙法蓮華経」とは「妙法蓮華経（法華経）に帰依する」の意であり、「題目」は経典の表題を唱えることに由来する。

開祖である日蓮の主要著作『立正安国論』のタイトルから類推して、国家主義的（ナショナリズム）傾向の強い教えと見る者がいる。

 日蓮に対する天台教学の影響 
日蓮は、天台の教観二門(教相門・止観門)を教学の大綱とし、
 妙法蓮華経（法華経）に対しては天台智顗の本迹分文により、方便品の開権顕実、寿量品の開近顕遠を二門の教意とする。
 二乗作仏と久遠実成を妙法蓮華経（法華経）の二箇の大事とする。
などは天台教学を踏襲するとともに、「妙法蓮華経（法華経）の行者」としての自覚と末法観を基調とした独自性を示した。しかし、日蓮の時代は末法であり、天台宗の宗祖の説いた法華経には衆生を救う力がないとされ、南無妙法蓮華経こそが肝心であるとされる。

よく混同されるが、今日の宗教法人日蓮宗は身延山久遠寺を中心とする本迹一致派であり、大石寺を中心とする日蓮正宗及び日蓮正宗系新宗教の創価学会や冨士大石寺顕正会は本迹勝劣派に属し、全く別の系統である。創価学会とは小樽問答を越えて、無関係であり交流はない。

 末法観と法華経 
日蓮は、鎌倉仏教の他の祖師たちと同様、鎌倉時代をすでに末法に入っている時代とみなしており、阿弥陀信仰、禅、密教の盛行によって邪法が広がっていると考えた。

そして、法華経を、滅後末法の世に向けて説かれた経典とみなし、とりわけ「如来寿量品」を、在世の衆生に対してではなく、滅度後の衆生の救済を目的として説かれたものとみなした。そして法華経に説かれた
 久遠本仏の常住
 遣使還告の譬
 勧持品二十行の偈文
等を「末法悪世の相」を説いたものとみなした。そして当時の現実の世相（鎌倉幕府内部の権力闘争、天変地異、元寇）を、日本において法華経が蔑ろにされてきた結果とみなした。

日蓮にとっては「末法における顛倒の衆生」・「末法重病の衆生」を済度しうる唯一最勝の良薬は「法華経」のみであった。「真言亡国・禅天魔・念仏無間・律国賊」と激しく他宗を攻撃する「四箇格言」は、法華経のみが末法において衆生を救済する唯一の教義であり、他の教えは、かえって衆生を救済から遠ざけてしまう、という確信に基づくものであった。

 五綱教判 
法華経を唯一の正法であり、時間と空間を超越した絶対の真理とした日蓮は、教・機・時・国・序のいずれにおいても法華経が至高であるとする「五綱の教判」を立てた。つまり、「教」（教え）においては、法華経のうち前半14章を迹門、後半14章を本門とし、本門こそ人びとを救済する法華経であるとし、「機」（素質能力）においては、末法に生きて素質や能力の低下した人間にふさわしい教義は法華経であり、「時」は末法であることから法華経が正法とされ、「国」は大乗仏教の流布した日本国にふさわしいのはやはり法華経、「序」（順序）は最後に流布するのは法華経本門の教えであるとした。
「五綱の教判」のなかで、信仰における重要な契機として「時」（末法の世である現在）・「国」（日本国）を掲げるあり方から、今日でも、日蓮宗系の各宗派においては、他の宗派にはあまりみられない政治問題への積極的な関わりがみられる。

 日蓮の一念三千 
日蓮は、天台教学を「迹門の妙法蓮華経（法華経）」であり「理の一念三千」と呼んで、その思弁性・観念性を批判し、自らの教義を本門として「事の一念三千」を説き、実践的・宗教的であらねばならないとした。日蓮はまた、法（真理）をよりどころとすべきであって、人（権力）をよりどころとしてはならないと説いた。さらに、仏法と王法が一致する王仏冥合を理想とし、正しい法にもとづかなければ、正しい政治はおこなわれないと主張したのである。また、王法（政治）の主体を天皇とし、天皇であっても仏法に背けば仏罰をこうむるとし、宗教上での天皇の権威を一切否認する仏法絶対の立場に立った。

 分派 
思想面(本仏の位置付け、妙法蓮華経の解釈)から、次のような分派(門流)が成立した。

権力との距離という実践面 から、桃山時代末期より江戸時代にかけて
 受不施派
 不受不施派（悲田派・恩田派）
という区分も生じた。

 檀林・法類（法縁・法眷）・本末関係 
日蓮入滅後、教団は六老僧を中心にして拡大していったが、師弟の繋がりによって浜門流（日昭）、池上門流（日朗）、四条門流（日像）、六条門流（日静）、身延門流（日向）、富士門流（日興）、中山門流（日常）などの門流にわかれ、たがいに異なった秘伝・法門を相続し、ときには門流の対立から分派もみられた 。

江戸時代に入ると僧侶の養成機関として各地に檀林が創設された。檀林の講堂は高台地に立てられ、学寮は谷間に立てられたが、飯高地方では「谷」を「サク」と呼ぶところから、「谷名（さくめい）」が学寮の異名となった 弟子はその師匠の出た学寮に入るようになり、学系が固定するにつれ、ある寺の住職はどの学寮の出身者に限るとか、修行階梯による出世寺格が定まり、寮ごとに「持ち寺」・「出生次第」・「出世寺」が固定し、「法類」（法縁・法眷とも）制度が確立されていった。このようにして、従来からあった門流意識に、新たにできた学系意識が加わり、法類制度はきわめて強固なものになっていった 。

檀林は、明治5年（1872年）、太政官政府による学制（日本最初の近代的学校制度）の制定・公布にともない、相次いで廃止された。また1941年、旧・日蓮宗・顕本法華宗・本門宗は、三派合同により対等合併して新「日蓮宗」として再編を行った際、本末制度を解体、法類関係も解消し、行政府としての宗務院が本山にかわって住職の任免を行い、宗費課金を徴収するなど、組織制度を大幅にあらためた。しかし長年つちかわれてきた本山・法類関係は完全には払拭されず、各法類とも法類内の結束をはかり、2024年（令和6年）現在でも住職の移動は基本的に法類の内部だけでおこなわれている 。

総本山━┓
大本山━╋━┳━中本寺━┳━小本寺━━末寺③
本　山━┛　┗━末寺①　┗━末寺②
 末寺① --- 直末（じきまつ）
 末寺② --- 又末（またまつ）
 末寺③ --- 又末末（またまたまつ）
 孫末 ----- ある寺院からみて、末寺のさらに末寺。（統属関係が 2段階はなれている寺院。）
 直門 ----- ある寺院からみて直接の統属関係をもつ末寺。
 近松 ----- ある寺院からみて徒歩半日以内の距離にある末寺。
 客末 ----- 様々な事情により統属関係を有するようになった末寺。
 触頭 ----- 江戸時代、江戸市中にあって江戸幕府と各門流との窓口の役割を課された寺院。

 檀林 
 【関東八檀林】 
 飯高檀林（千葉県、1596 - 明治）：脱師法縁、潮師法縁、通師法縁、池上法縁、堺法縁
 中村檀林（千葉県、1594 - 明治）：達師法縁、親師法縁（精師法縁、貞師法縁）、境師法縁、奠師法縁、要師法縁、莚師法縁
 小西檀林（千葉県、1590 - 明治）：小西法縁
 西谷檀林（山梨県、1604 - 1874）：鏡師法縁
 三昧堂檀林（茨城県、1681 - 明治）：水戸法縁
 玉造檀林（千葉県、1637 - 天保年間）
 小室檀林（山梨県、1600 - 1700）
 【関西六檀林】 
 松ヶ崎檀林（京都府、1573 - 1872）：生師法縁
 東山檀林（京都府、1624 - 1873）：達師法縁、親師法縁（精師法縁、貞師法縁）、奠師法縁、莚師法縁
 鷹ヶ峰檀林（京都府、1627 - 明治）：親師法縁（精師法縁、貞師法縁）
 山科檀林（京都府、1643 - 明治）：勇師法縁
 鶏冠井（かいで）檀林（京都府、1654 - 1875）：奠師法縁、莚師法縁
 求法院檀林（京都府、1591 - 1873）

 【その他】
 南谷檀林（東京都、1688 - 1873）
 野呂檀林：合師法縁
 【旧・勝劣派檀林】
 大亀谷檀林（京都府、 1652 - 明治）
 細草檀林（千葉県、1600 - 明治）:江戸寛永年間より明治初頭まで。興統法縁各法脈。2023年（令和5年）現在、興統法縁の寺院は日蓮宗（本山3か寺）・日蓮正宗（本山2か寺）・日蓮本宗（本山1か寺）、単立（本山2か寺）などに分かれている。細草檀林跡の法雲山遠霑寺は、2023年（令和5年）現在日蓮正宗寺院。
 大沼田檀林（千葉県）
 三沢檀林（神奈川県、1724 - 明治）
 宮谷檀林（千葉県、1600 - 明治）：什師法縁 各法脈（禹師寮法縁・迂師寮法縁・清師寮法縁・乗師寮法縁・宏師寮法縁・饒師寮法縁・厳師寮法縁 など）
 小栗栖檀林（京都府、1658 - 明治）

 法縁（法類・法脈） 
江戸期に檀林から発生した法縁であるが、最近では法音寺（愛知県）の進師法縁や龍潜寺（福岡県）の諦師法縁など檀林によらない法縁がある。おもな法縁は下記の通り。什師法縁（日什門流）については、日蓮宗と顕本法華宗、単立と分かれているため縁頭寺、出世寺については触れない。興統法縁（日興門流）の場合、日蓮正宗（総本山大石寺）や日蓮本宗（総本山要法寺）については本末制のみのため法縁はない。宗教法人・日蓮宗の内部で合同を維持している寺院は興統法縁会を組織し、かつて本門宗の宗務院が置かれた北山本門寺を縁頭寺としている。

 水戸法縁
 檀林：三昧堂檀林
 縁祖：壽遠院日遵
 縁頭寺：本山靖定山久昌寺（茨城県常陸太田市）
 脱師法縁
 檀林：飯高檀林中台谷（龍眠庵）
 縁祖：一圓院日脱
 縁頭寺：本山明星山妙純寺（神奈川県厚木市）、休息山立正寺（山梨県甲州市）
 出世寺：総本山身延山久遠寺など
 潮師法縁
 檀林：飯高檀林中台谷（龍眠庵）
 縁祖：六牙院日潮
 縁頭寺：本山慈雲山瑞輪寺(東京都台東区）
 出世寺：総本山身延山久遠寺・大本山小湊山誕生寺 など
 通師法縁（縁祖寂遠院日通の師が法性院日勇で西国では勇師法縁と呼ぶ。）
 檀林：飯高檀林松和田谷（松和軒）
 縁祖：寂遠院日通
 縁頭寺
 通師・堀之内法縁　本山日圓山妙法寺（東京都杉並区）
 通師・雑司ヶ谷法縁　威光山法明寺（東京都豊島区）
 通師・千駄ヶ谷法縁　法霊山仙寿院（東京都渋谷区）
 通師・一之瀬法縁　高峯山妙了寺（山梨県南アルプス市）
 出世寺：総本山身延山久遠寺、本山金栄山妙成寺、本山法王山妙法寺 など
 池上法縁
 檀林：飯高檀林城下谷（向城庵）
 縁祖：妙玄庵法縁（妙玄院日等）、樹下庵法縁（成壽院日芳）、中道不二庵法類（守玄院日顗）
 縁頭寺：妙玄庵と樹下庵が合併し池上・芳師法類となる。縁頭寺は妙玄山実相寺（東京都大田区）。池上・中道不二庵法類縁頭寺は長栄山中道院（東京都大田区）。中道不二庵法類の中には更に以下の七法縁がある。
 池上・中道・中延法縁　八幡山法蓮寺（東京都品川区）
 池上・中道・感応寺法縁（西国では堺法縁という)　光照山感応寺（東京都台東区）
 池上・中道・土富店法縁　安立山長遠寺（東京都台東区）
 池上・中道・大坊顕之字法縁　本山長崇山本行寺（東京都大田区）
 池上・中道・柳嶋法縁　妙見山法性寺（東京都墨田区）
 池上・中道・神楽坂法縁　鎮護山善國寺（東京都新宿区）
 池上・中道・大久保法縁　春時山法善寺（(東京都新宿区）
 出世寺：大本山長栄山本門寺、本山長興山妙本寺、本山真間山弘法寺 など
 堺法縁（東国では池上・中道・感応寺法縁という。）
 檀林：飯高檀林城下谷（向城庵）
 縁祖:守玄院日顗
 縁頭寺：本山広普山妙國寺（大阪府堺市堺区）
 出世寺：大本山正中山法華経寺 など
 達師法縁（繋珠会）
 檀林：中村檀林東法眷（真如庵）
 縁祖：了義院日達
 縁頭寺：本山聞法山頂妙寺（京都府京都市左京区）
 出世寺：大本山正中山法華経寺、大本山大光山本圀寺 など
 親師法縁
 檀林：中村檀林東法眷（真如庵）
 縁祖：精師法縁（縁祖修光院日精）と貞師法縁（縁祖本是院日貞）が合併し久遠成院日親を縁祖とする
 縁頭寺：本山叡昌山本法寺（京都府京都市上京区）
 出世寺：大本山正中山法華経寺、大本山大光山本圀寺など
 境師法縁（明和会）
 檀林：中村檀林東法眷（真如庵）
 縁祖：通心院日境
 縁頭寺：本山経王山妙法華寺（静岡県三島市）
 奠師法縁（奠統会）
 檀林：中村檀林西法眷（観月庵）
 縁祖：妙心院日奠
 縁頭寺：本山具足山妙覚寺（京都府京都市上京区）、福聚山常圓寺（東京都新宿区）
 出世寺：大本山具足山妙顕寺、大本山大光山本圀寺、本山長谷山本土寺など
 莚師法縁（隆源会）
 檀林：中村檀林西法眷（観月庵）
 縁祖：隆源院日莚
 縁頭寺：本山広布山本満寺（京都府京都市上京区）、誉師山長満寺（愛知県額田郡幸田町）
 出世寺：大本山大光山本圀寺、大本山具足山妙顕寺など
 鏡師法縁（善学会）
 檀林：西谷檀林
 縁祖：善學院日鏡
 縁頭寺：恵光山長遠寺（山梨県南アルプス市）
 出世寺：総本山身延山久遠寺　など
 勇師法縁（寂遠院日通が法性院日勇の弟子で東国では通師法縁と呼ぶ）
 檀林：山科檀林
 縁祖：法性院日勇
 縁頭寺：本山法鏡山妙傳寺（京都府京都市左京区）
 生師法縁
 檀林：松ヶ崎檀林
 縁祖：教蔵院日生
 縁頭寺：本山具足山立本寺（京都府京都市上京区）
 小西法縁
 檀林：小西檀林
 縁頭寺
 小西・法恩寺法縁(藻原谷寮)　平河山法恩寺（東京都墨田区）
 小西・一乗寺法縁(藻原谷寮)　大法山一乗寺（東京都台東区）
 小西・幸龍寺法縁(江戸谷寮)　妙祐山幸龍寺（東京都世田谷区）
 小西・本法寺法縁（江戸谷寮）　長瀧山本法寺（東京都台東区）
 小西・浄心寺法縁(江戸谷寮)　法苑山浄心寺（東京都江東区）
 出世寺：総本山身延山久遠寺、本山常在山藻原寺、本山徳栄山妙法寺 など
 什師・禹師寮法縁
 檀林：宮谷檀林東谷
 縁祖：瑞光院日禹
 什師・清師寮法縁
 檀林：宮谷檀林東谷
 縁祖：制心院日清
 什師・饒師寮法縁
 檀林：宮谷檀林東谷
 縁祖：念事院日饒
 什師・厳師寮法縁
 檀林：宮谷檀林西谷
 縁祖：啓運院日厳
 什師・迂師寮法縁
 檀林：宮谷檀林北谷
 縁祖：徳善院日迂
 什師・乗師寮法縁
 檀林：宮谷檀林北谷
 縁祖：養徳院日乗
 什師・宏師寮法縁
 檀林：宮谷檀林南谷
 縁祖：本光院日宏

 大正時代の門下統合運動 
大正時代、顕本法華宗の本多日生を牽引役として、門下各派による統合運動が展開された。

1914年（大正3年）には、日蓮門下7宗派 の管長が池上本門寺に集まって、「各教団統合大会議」を開催。1914年（大正3年）12月、「日蓮門下統合後援会」が組織された。翌1915年（大正4年）6月、一致派の日蓮宗が離脱したのを除く、勝劣派の6宗派 の統合が成立した。また、1917年（大正6年）、門下合同講習会が開催され、1917年（大正6年）11月には統合修学林を開校するにいたった。

この時期には門下の9宗派 による、宗祖日蓮への「大師」号の授与運動が展開され、1914年（大正3年）11月にいたり、宮内省より日蓮にたいする「立正大師」の諡号宣下が行われた。

 近現代の動向 
明治以降の動向は次表の通り。
 身延山久遠寺 中山法華経寺 京都妙満寺 京都妙満寺末約200か寺 京都妙満寺末180か寺 北山本門寺とその末36か寺、伊豆実成寺、京都要法寺末34か寺、保田妙本寺末9か寺ほか 京都要法寺とその末50か寺 京都要法寺末30か寺 宮崎県内日郷門流8か寺 宮崎県内日郷門流1か寺 日向妙国寺 西山本門寺 保田妙本寺 日知屋山定善寺 下条妙蓮寺とその末6か寺 讃岐本門寺 富士大石寺 越後本成寺 京都本隆寺 京都本能寺 大阪本因妙寺 福島正福寺 京都妙蓮寺 宥清寺 岡山妙覚寺 岡山本覚寺 最上稲荷 清澄寺 石塔寺 1872年(明治5年) 日蓮宗 1872年(明治5年) 1874年(明治7年) 日蓮宗一致派 日蓮宗勝劣派 1874年(明治7年) 1876年(明治9年) (名称変更) 日蓮宗妙満寺派 日蓮宗興門派 法華宗本成寺派 法華宗本隆寺派 日蓮宗八品派 日蓮宗不受不施派 1876年(明治9年) 1882年(明治15年) 日蓮宗 日蓮宗不受不施講門派 1882年(明治15年) 1898年(明治31年) (名称変更) (名称変更) (名称変更) (名称変更) 1898年(明治31年) 1899年(明治32年) 顕本法華宗 (名称変更) 法華宗 本妙法華宗 本門法華宗 1899年(明治32年) 1900年(明治33年) 本門宗 日蓮宗富士派 1900年(明治33年) 1912年(明治45年) (名称変更) 1912年(明治45年) 1941年(昭和16年) 日蓮宗 本化正宗 1941年(昭和16年) 1946年(昭和21年) 中山妙宗 日蓮宗

(興統法縁会) 法華宗 本門佛立宗 妙法華宗 日蓮講門宗

(いつの頃からか、不受不施日蓮講門宗) 1946年(昭和21年) 1947年(昭和22年) 1947年(昭和22年) 1948年(昭和23年) 日蓮宗 (日蓮宗什師会) 1948年(昭和23年) 1949年(昭和24年) 顕本法華宗 日蓮宗(真言宗智山派より帰属) 1949年(昭和24年) 1950年(昭和25年) 日蓮本宗 日蓮正宗 本門法華宗 1950年(昭和25年) 1951年(昭和26年) 本化日蓮宗(日蓮宗より独立) 1951年(昭和26年) 1952年(昭和27年) 法華宗陣門流 法華宗真門流 法華宗本門流 日蓮法華宗 (名称変更) 1952年(昭和27年) 1954年(昭和29年) 日蓮宗不受不施派 最上稲荷教(日蓮宗より独立) 1954年(昭和29年) 1957年(昭和32年) 日蓮宗(興統法縁会、島根尊門会) 大日蓮宗 日蓮正宗 日蓮正宗(のちに無効
) 本派日蓮宗 1957年(昭和32年) 1958年(昭和33年) 日蓮宗郷門派 1958年(昭和33年) 1972年(昭和47年) 1972年(昭和47年) 1975年(昭和50年) 単立 1975年(昭和50年) 1976年(昭和51年) 1976年(昭和51年) 1989年(平成元年) 1989年(平成元年) 1995年(平成7年) 単立 1995年(平成7年) 2006年(平成18年) 日蓮宗 2006年(平成18年) 2009年(平成21年) 日蓮宗 2009年(平成21年) 身延山久遠寺 中山法華経寺 京都妙満寺 京都妙満寺末約200か寺 京都妙満寺末180か寺 北山本門寺とその末36か寺、伊豆実成寺、京都要法寺末34か寺、保田妙本寺末9か寺ほか 京都要法寺とその末50か寺 京都要法寺末30か寺 宮崎県内日郷門流8か寺 宮崎県内日郷門流1か寺 日向妙国寺 西山本門寺 保田妙本寺 日知屋山定善寺 下条妙蓮寺とその末6か寺 讃岐本門寺 富士大石寺 越後本成寺 京都本隆寺 京都本能寺 大阪本因妙寺 福島正福寺 京都妙蓮寺 宥清寺 岡山妙覚寺 岡山本覚寺 最上稲荷 清澄寺 石塔寺 

 宗派・日蓮宗の概要 

 概要 
身延山久遠寺を総本山とし、宗務院を池上本門寺（東京都大田区池上）に置く日蓮系諸宗派中の最大宗派。中世期に成立していた門流の多くと、思想的潮流の相当部分を包含する。祖山1（総本山）、霊跡寺院14（大本山7、本山7）、由緒寺院42（本山42）、寺院数5,200か寺、直系信徒330万人。

なお、日什門流・日興門流は、門流に所属する寺院の一部が日蓮宗に帰属している。詳細は日蓮宗什師会・興統法縁会を参照。

 寺院本堂の祭壇および檀信徒の仏壇における本尊の形式 

2024年（令和6年）現在の宗教法人・日蓮宗は、中世期よりそれぞれ独自の伝統を育んできた勝劣派、一致派の様々な門流が参加しており、。

寺院の本堂に祀られる本尊には、次のような形式がある。
 大曼荼羅……中央部に題目(南無妙法蓮華経)が大書され、その周囲に釈迦如来・多宝如来など諸仏諸菩薩、諸天善神の名称を記入したもの。
 一塔両尊四士……中央に題目塔。題目塔の左に蓮台に座した釈迦如来、右に蓮台に座した多宝如来が配置され、そのさらに右側に上行菩薩・無辺行菩薩が、左に浄行菩薩・安立行菩薩が配置される。
 一尊四士……中央に釈迦如来像。釈尊像の向かって右側に上行菩薩・無辺行菩薩が、左に浄行菩薩・安立行菩薩が配置される。
いずれの形式の場合でも、本尊の前に、さらに日蓮座像、法華経八巻を乗せた経机を前置する。

檀信徒の各家庭における仏壇では、奥から手前へ順番に大曼荼羅・一塔両尊・日蓮座像を配置し、場合によってその両脇に七面天女・鬼子母神・大黒天・妙見菩薩など法華経守護の諸天・善神を祀る。

（関連項目 → 法華曼荼羅、一塔両尊、三宝尊）

 境内摂社／堂内堂、神札の配布 
。

 大黒天（松ヶ崎大黒天,本鏡山妙智寺ほか）
 鬼子母神
 七面天女
 三十番神
 稲荷
 毘沙門天
 帝釈天
 妙見大菩薩
 烏蒭沙摩明王
 三宝大守護神(三宝神)

 主要寺院 
現在の日蓮宗宗制では寺院は祖山、霊跡寺院、由緒寺院、一般寺院に分けられている。江戸時代の本末制度に始まる寺格は1941年（昭和16年）の本末解体で消滅し実態はないが、日蓮宗宗制では総本山・大本山・本山の称号を用いることができると規定されている。

祖山は日蓮の遺言に従い遺骨が埋葬された祖廟がある身延山久遠寺（日蓮棲神の霊山とされる）で、貫首を法主と称する。霊跡寺院は日蓮一代の重要な事跡、由緒寺院は宗門史上顕著な沿革のある寺院で、住職(法律上の代表役員)を貫首と称する。

祖山、霊跡寺院、由緒寺院は「日蓮宗全国本山会」を組織している。総裁は身延山久遠寺内野日總法主、会長は北野立本寺上田日瑞貫首、事務局長は堺妙國寺岡部日聡貫首。

本山妙教寺は2009年（平成21年）7月に一般寺院として日蓮宗に帰一したが、客員として長らく日蓮宗全国本山会に参加している為、その他本山としてあげておく。

 祖山 

 総本山身延山久遠寺(みのぶさんくおんじ、通称身延山、山梨県南巨摩郡身延町)

 霊跡寺院 

 大本山小湊山誕生寺(こみなとさんたんじょうじ、通称小湊誕生寺、千葉県鴨川市)
 大本山千光山清澄寺(せんこうざんせいちょうじ、通称清澄清澄寺、千葉県鴨川市)
 大本山正中山法華経寺(しょうちゅうざんほけきょうじ、通称中山法華経寺、千葉県市川市)
 大本山富士山本門寺根源(ふじさんほんもんじこんげん、通称重須本門寺、北山本門寺、静岡県富士宮市)
 大本山長栄山本門寺(ちょうえいざんほんもんじ、通称池上本門寺、東京都大田区)
 大本山具足山妙顕寺(ぐそくさんみょうけんじ、通称顕山、京都府京都市上京区)
 大本山大光山本圀寺(だいこうざんほんこくじ、通称光山、京都府京都市山科区)
 本山小松原山鏡忍寺(こまつばらざんきょうにんじ、通称小松原鏡忍寺、千葉県鴨川市)
 本山長興山妙本寺(ちょうこうざんみょうほんじ、通称比企谷妙本寺、神奈川県鎌倉市)
 本山寂光山龍口寺(じゃっこうざんりゅうこうじ、通称片瀬龍口寺、神奈川県藤沢市)
 本山海光山佛現寺(かいこうざんぶつげんじ、通称伊東佛現寺、静岡県伊東市)
 本山岩本山実相寺(がんぽんざんじっそうじ、通称岩本実相寺、静岡県富士市)
 本山塚原山根本寺(つかはらさんこんぽんじ、通称塚原根本寺、新潟県佐渡市)
 本山妙法華山妙照寺(みょうほっけざんみょうしょうじ、通称一谷妙照寺、新潟県佐渡市)

 由緒寺院 

 本山光明山孝勝寺(こうみょうざんこうしょうじ、通称仙台孝勝寺、宮城県仙台市宮城野区)
 本山宝光山妙國寺(ほうこうざんみょうこくじ、通称会津妙國寺、福島県会津若松市)
 本山靖定山久昌寺(せいていざんきゅうしょうじ、通称水戸久昌寺、茨城県常陸太田市)
 本山開本山妙顕寺(かいほんざんみょうけんじ、通称佐野妙顕寺、栃木県佐野市)
 本山広栄山妙覚寺(こうえいざんみょうかくじ、通称興津妙覚寺、千葉県勝浦市)
 本山常在山藻原寺(じょうざいざんそうげんじ、通称茂原藻原寺、千葉県茂原市)
 本山妙高山正法寺(みょうこうざんしょうほうじ、通称小西正法寺、千葉県大網白里市)
 本山正東山日本寺(しょうとうざんにちほんじ、通称中村日本寺、千葉県香取郡多古町)
 本山長崇山妙興寺(ちょうそうざんみょうこうじ、通称野呂妙興寺、千葉県千葉市若葉区)
 本山真間山弘法寺(ままさんぐほうじ、通称真間弘法寺、千葉県市川市)
 本山長谷山本土寺(ちょうこくざんほんどじ、通称平賀本土寺、千葉県松戸市)
 本山長崇山本行寺(ちょうそうざんほんぎょうじ、通称大坊本行寺、東京都大田区)
 本山日圓山妙法寺(にちえんざんみょうほうじ、通称堀之内妙法寺、東京都杉並区)
 本山慈雲山瑞輪寺(じうんさんずいりんじ、通称谷中瑞輪寺、東京都台東区)
 本山法華山本興寺(ほっけざんほんこうじ、通称飯田本興寺、神奈川県横浜市泉区)
 本山妙厳山本覚寺(みょうごんざんほんがくじ、通称小町本覚寺、神奈川県鎌倉市)
 本山明星山妙純寺(みょうじょうざんみょうじゅんじ、通称星下妙純寺、神奈川県厚木市)
 本山経王山妙法華寺(きょうおうざんみょうほっけじ、通称玉澤妙法華寺、静岡県三島市)
 本山大成山本立寺(だいじょうざんほんりゅうじ、通称韮山本立寺、静岡県伊豆の国市)
 本山東光山實成寺(とうこうざんじつじょうじ、通称柳瀬實成寺、静岡県伊豆市)
 本山富士山久遠寺(ふじさんくおんじ、通称小泉久遠寺、静岡県富士宮市)
 本山龍水山海長寺(りゅうすいざんかいちょうじ、通称村松海長寺、静岡県静岡市清水区)
 本山貞松山蓮永寺(ていしょうざんれんえいじ、通称みまつ蓮永寺、静岡県静岡市葵区)
 本山青龍山本覚寺(せいりゅうざんほんがくじ、通称池田本覚寺、静岡県静岡市駿河区)
 本山本立山玄妙寺(ほんりゅうざんげんみょうじ、通称見附玄妙寺、静岡県磐田市)
 本山延兼山妙立寺(えんけんざんみょうりゅうじ、通称吉美妙立寺、静岡県湖西市)
 本山徳栄山妙法寺(とくえいざんみょうほうじ、通称小室妙法寺、山梨県南巨摩郡富士川町)
 本山大野山本遠寺(おおのさんほんのんじ、通称大野本遠寺、山梨県南巨摩郡身延町)
 本山法王山妙法寺(ほうおうざんみょうほうじ、通称村田妙法寺、新潟県長岡市)
 本山蓮華王山妙宣寺(れんげおうざんみょうせんじ、通称阿仏房妙宣寺、新潟県佐渡市)
 本山金栄山妙成寺(きんえいざんみょうじょうじ、通称滝谷妙成寺、石川県羽咋市)
 村雲御所瑞龍寺門跡(むらくもごしょずいりゅうじもんぜき、通称村雲御所、滋賀県近江八幡市)
 本山法鏡山妙伝寺(ほうきょうざんみょうでんじ、通称二条妙傳寺、京都府京都市左京区)
 本山聞法山頂妙寺(もんぽうざんちょうみょうじ、通称川端頂妙寺、京都府京都市左京区)
 本山叡昌山本法寺(えいしょうざんほんぽうじ、通称小川本法寺、京都府京都市上京区)
 本山広布山本満寺(こうふざんほんまんじ、本称広宣流布山本願満足寺、通称寺町本満寺、京都府京都市上京区)
 本山具足山妙覚寺(ぐそくさんみょうかくじ、通称鞍馬口妙覚寺、京都府京都市上京区)
 本山具足山立本寺(ぐそくさんりゅうほんじ、通称北野立本寺、京都府京都市上京区)
 本山広普山妙國寺(こうふざんみょうこくじ、通称堺妙國寺、大阪府堺市堺区)
 本山白雲山報恩寺(はくうんざんほうおんじ、通称紀州報恩寺、和歌山県和歌山市)
 本山自昌山國前寺(じしょうざんこくぜんじ、通称広島国前寺、広島県広島市東区)
 本山松尾山光勝寺(まつおざんこうしょうじ、通称小城光勝寺、佐賀県小城市)