Denvanlige på Magic High School -- historien tar plass på en alternativ historie hvor magi finnes og er polert gjennom moderne teknologi. Den følger Tatsuya og Miyki Shiba, søsker som ruller inn i første høy magi high school. Mens de holder deres forbindelser til den uungøse Yotunderen hemmelig, prøver de å leve sitt daglige liv i fred der Tatsuya er shunned for hans tilsynelatende ulikhet og Miyui er validert for hennes magiske egenskaper.
Det uregelmessig ved magi på skolen er de virkelig søsker