La liste des centres nationaux de référence pour la lutte contre les maladies transmissibles (CNR) et, le cas échéant, des CNR-Laboratoires associés, est arrêtée ainsi qu'il suit pour la période allant du 1er janvier 2023 au 31 décembre 2027 :
1. Centre national de référence Agents transmissibles non conventionnels (ATNC)
CNR-Laboratoire coordonnateur : Equipe Maladies à Prions, Maladie d'Alzheimer, Inserm, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Département de Neuropathologie Raymond Escourolle, Hôpital Pitié-Salpêtrière, AP-HP, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Biochimie et Biologie Moléculaire, Hôpital Lariboisière, AP-HP, Paris.
2. Centre national de référence Arbovirus
CNR-Laboratoire coordonnateur : Unité des Virus Emergents, Inserm, Marseille.

CNR-Laboratoire associé : Unité de virologie, IRBA, Marseille.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Virologie, Institut Pasteur de la Guyane, Cayenne, Guyane.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Microbiologie, Centre Hospitalier Universitaire Félix Guyon, Saint-Denis, La Réunion.
3. Centre national de référence Borrelia
CNR : Laboratoire de Bactériologie, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg.
4. Centre national de référence Campylobacter et Helicobacter
CNR : Laboratoire de Bactériologie, Groupe Hospitalier Pellegrin, Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux, Bordeaux.
5. Centre national de référence Coqueluche et autres bordetelloses
CNR : Unité de Recherche Biodiversité et Epidémiologie des bactéries Pathogènes, Institut Pasteur, Paris.
6. Centre national de référence Corynébactéries du complexe diphtheriae
CNR : Unité de Recherche Biodiversité et Epidémiologie des bactéries Pathogènes, Institut Pasteur, Paris.
7. Centre national de référence Cryptosporidioses, microsporidies et autres protozooses digestives
CNR-Coordonnateur : Laboratoire de Parasitologie, Hôpital Charles Nicolle, Centre Hospitalier Universitaire de Rouen, Rouen.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Parasitologie Mycologie, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon, Dijon.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Parasitologie Mycologie, Hôpital Gabriel Montpied, Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Clermont-Ferrand, Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Clermont-Ferrand.
8. Centre national de référence Echinococcoses
CNR : Laboratoire de Parasitologie et Mycologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire Jean-Minjoz, Besançon.
9. Centre national de référence Entérovirus et parechovirus
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Virologie médicale, Centre de Biologie, Hôpital Gabriel-Montpied, Centre Hospitalier Universitaire de Clermont-Ferrand, Clermont-Ferrand.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Hôpital de la Croix-Rousse, Groupement Hospitalier Nord, Hospices Civils de Lyon, Lyon.

CNR-Laboratoire associé : Centre coordonnateur Poliovirus OMS, Institut Pasteur, Paris.
10. Centre national de référence Escherichia coli, shigelles, salmonelles
CNR-Laboratoire coordonnateur : Unité de Recherche et d'Expertise des Bactéries Pathogènes Entériques, Institut Pasteur, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Microbiologie, Hôpital Robert Debré, AP-HP, Paris.
11. Centre national de référence Fièvres hémorragiques virales
CNR-Laboratoire coordonnateur : Unité de Biologie des Infections Virales Emergentes (UBIVE), Institut Pasteur, Lyon.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire P4 Jean Mérieux, INSERM US003, Lyon.
12. Centre national de référence Hantavirus
CNR laboratoire-coordonnateur : Unité Environnement et risques infectieux, Institut Pasteur, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Virologie, Institut Pasteur de la Guyane, Cayenne, Guyane Française.
13. Centre national de référence Herpes Virus
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Bactériologie-Virologie-Hygiène, CBRS, Centre Hospitalier Universitaire de Limoges, Limoges.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Microbiologie Clinique, Hôpital Necker-Enfants Malades, AP-HP, Paris

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Virologie, Hôpital Pitié-Salpêtrière, AP-HP, Paris
14. Centre national de référence Infections sexuellement transmissibles (IST) bactériennes
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Bactériologie, Groupe Hospitalier Pellegrin, Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux, Bordeaux, Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux, Bordeaux.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Bactériologie, Hôpital Saint-Louis, AP-HP, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Dermatologie, Hôpital Cochin, AP-HP, Paris.
15. Centre national de référence Legionella
CNR : Laboratoire de Microbiologie, Institut des Agents Infectieux, Hôpital de la Croix-Rousse, Groupement Hospitalier Nord, Hospices civils de Lyon, Lyon.
16. Centre national de référence Leishmania
CNR-Laboratoire coordonnateur : Département de Parasitologie-Mycologie, Centre Hospitalier Universitaire de Montpellier, Montpellier.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire Hospitalo-Universitaire de Parasitologie-Mycologie, Centre Hospitalier Andrée Rosemon, Cayenne, Guyane Française.
17. Centre national de référence Leptospirose
CNR : Unité Biologie des Spirochètes, Institut Pasteur, Paris.
18. Centre national de référence Listeria
CNR : Unité de Biologie des Infections, Institut Pasteur, Paris.
19. Centre national de référence Méningocoques et Haemophilus influenzae
CNR : Unité des Infections Bactériennes Invasives, Institut Pasteur, Paris.
20. Centre national de référence Mycobactéries et résistance aux antituberculeux
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Bactériologie-Hygiène Hospitalière, Hôpital Pitié-Salpêtrière, Faculté de médecine Sorbonne Université, AP-HP, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Mycobactériologie spécialisée et de référence, Hôpital Bichat, AP-HP, Paris.
21. Centre national de référence Mycoses invasives et antifongiques
CNR-Laboratoire coordonnateur : Unité de Mycologie Moléculaire, Institut Pasteur, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Parasitologie et Mycologie, Hôpital La Pitié-Salpêtrière, Groupe Hospitalo-Universitaire AP-HP, Sorbonne Université, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Pontchaillou, CHU de Rennes, Rennes.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Pellegrin, CHU de Bordeaux, Bordeaux.
22. Centre national de référence Paludisme
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Parasitologie, Hôpital Bichat, AP-HP, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Hôpital Pitié-Salpêtrière, AP-HP, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Unité de Parasitologie et d'Entomologie, Institut de Recherche Biologique des Armées (IRBA), Marseille.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Parasitologie, Institut Pasteur de Guyane, Cayenne-Guyane Française.
23. Centre national de référence Papillomavirus
CNR : Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire, Hôpital Jean Minjoz, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon, Besançon.
24. Centre national de référence Peste et autres yersinioses
CNR : Unité de Recherche Yersinia, Institut Pasteur, Paris.
25. Centre national de référence Pneumocoques
CNR : Centre de Recherche Clinique et Biologique, Centre Hospitalier Intercommunal Créteil, Créteil.
26. Centre national de référence Rage
CNR : Unité Lyssavirus, Epidémiologie et Neuropathologie, Institut Pasteur, Paris.
27. Centre national de référence Résistance aux antibiotiques
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Bactériologie, Centre Hospitalier Universitaire Gabriel-Montpied, Clermont-Ferrand.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, Hôpital Le Kremlin-Bicêtre, AP-HP, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Bactériologie, Pôle Biologie Anatomopathologie, Hôpital Jean-Minjoz, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Bourgogne-Franche-Comté, Besançon.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Bactériologie-Hygiène, Hôpital Pontchaillou ; Centre Hospitalier Universitaire de Rennes, Rennes.
28. Centre national de référence Rickettsia, Coxiella et Bartonella
CNR : Pôle des maladies infectieuses, Aix Marseille Université.
29. Centre national de référence Staphylocoques
CNR : Centre de Biologie et Pathologie Nord, Institut des Agents Infectieux, Hôpital de la Croix-Rousse, Groupement Hospitalier Nord, Hospices civils de Lyon, Lyon.
30. Centre national de référence Streptocoques
CNR : Laboratoire de Bactériologie, Hôpital Cochin, AP-HP, Paris.
31. Centre national de référence Toxoplasmose
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Parasitologie, Pôle de Biologie Territorial, Hôpital Maison Blanche, Centre Hospitalier Universitaire de Reims, Reims.

CNR-Laboratoire associé : Département de Parasitologie-Mycologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Montpellier, Montpellier.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Parasitologie et Mycologie Médicale, Institut de Parasitologie et de Pathologie Tropicale, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg.
32. Centre national de référence Vibrions et choléra
CNR : Unité des Bactéries Pathogènes Entériques, Institut Pasteur, Paris.
33. Centre national de référence Virus de l'Immunodéficience Humaine (VIH)
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Virologie, Hôpital Saint-Louis, AP-HP, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Bactériologie, Virologie & Hygiène Hospitalière, Hôpital Bretonneau, Centre Hospitalier Régional Universitaire, Tours.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Virologie, Département de Microbiologie, Institut de Biologie Clinique, Hôpital Charles Nicolle, Centre Hospitalier Universitaire, Rouen.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Virologie, Hôpital Bichat - Claude Bernard, AP-HP, Paris.
34. Centre national de référence Virus de la rougeole, de la rubéole et des oreillons
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Virologie, Pôle de Biologie, Centre Hospitalier Universitaire, Caen.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Virologie, Hôpital Paul-Brousse, AP-HP, Villejuif.
35. Centre national de référence Virus des gastro-entérites
CNR : Laboratoire de Microbiologie et Agents Transmissibles, Plateforme de Biologie Hospitalo-Universitaire, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon-Bourgogne, Dijon.
36. Centre national de référence Virus des hépatites à transmission entérique (hépatites A et E)
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Virologie, Hôpital Purpan, Centre Hospitalier Universitaire, Toulouse.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Virologie, Hôpital Paul-Brousse, AP-HP, Villejuif.
37. Centre national de référence Virus des hépatites B, C et Delta
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Virologie, Département Prévention-Diagnostic-Traitement des Infections, Hôpital Universitaire Henri Mondor, AP-HP, Créteil.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Microbiologie Clinique, Hôpital Avicenne, Hôpitaux Universitaires de Paris-Seine-Saint-Denis, Bobigny.
38. Centre national de référence Virus des infections respiratoires (dont la grippe et le SARS-CoV-2)
CNR-Laboratoire coordonnateur : Laboratoire de Virologie, Institut des Agents Infectieux, Hôpital de la Croix-Rousse, Groupement Hospitalier Nord, Hospices civils de Lyon, Lyon.

CNR-Laboratoire associé : Unité de Génomique évolutive des virus à ARN (GEVA), Département de Virologie, Institut Pasteur, Paris.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Virologie, Institut Pasteur de Guyane, Cayenne, Guyane Française.

CNR-Laboratoire associé : Laboratoire de Microbiologie, Centre Hospitalier Universitaire Saint Denis La Réunion, Saint Denis.
39. Centre national de référence Bactéries anaérobies et botulisme

 CNR-Laboratoire coordonnateur : Unité des Toxines Bactériennes, Institut Pasteur, Paris.

 CNR-Laboratoire associé : Service de Microbiologie de l'Environnement, Hôpital Saint-Antoine - UHLIN, AP-HP, Paris.