Le conseil de gestion est composé de : 
1° Six représentants de l'Etat : 
a) Le commandant de la zone maritime Atlantique ; 
b) Le directeur régional de l'environnement de Bretagne ; 
c) Le directeur interrégional de la mer de Bretagne ; 
d) Le directeur départemental de l'équipement du Finistère ; 
e) Le directeur départemental de l'agriculture et de la forêt du Finistère ; 
f) Le directeur régional de l'environnement, de l'aménagement et du logement de Bretagne ; 
2° Onze représentants des collectivités territoriales ou de leurs groupements : 
a) Un représentant de la région Bretagne ; 
b) Un représentant du département du Finistère ; 
c) Un représentant de la commune d'Ile-Molène ; 
d) Un représentant de la commune d'Ouessant ; 
e) Un représentant de la commune d'Ile-de-Sein ; 
f) Un représentant de la communauté urbaine Brest métropole océane ; 
g) Deux représentants de la communauté de communes du pays d'Iroise ; 
h) Un représentant de la communauté de communes de la presqu'île de Crozon ; 
i) Un représentant de la communauté de communes du pays de Châteaulin et du Porzay ; 
j) Un représentant de la communauté de communes du pays de Douarnenez ; 
3° Un représentant du syndicat mixte chargé de la gestion du parc naturel régional d'Armorique ; 
4° Douze représentants des organisations représentatives des professionnels : 
a) Un représentant du comité régional des pêches maritimes et des élevages marins de Bretagne ; 
b) Un représentant de chacun des comités locaux des pêches et des élevages marins du Guilvinec, d'Audierne, de Douarnenez et du Nord-Finistère ; 
c) Un représentant des pêcheurs des îles sur proposition du président du comité régional des pêches et des élevages marins de Bretagne ; 
d) Un représentant de l'une des sections régionales conchylicoles de Bretagne sur proposition des sections concernées ; 
e) Un représentant de la chambre d'agriculture du Finistère ; 
f) Un représentant de la Chambre syndicale nationale des algues marines ; 
g) Un représentant d'une      chambre de commerce et d'industrie territoriale territorialement concernée ; 
h) Un représentant du comité départemental du tourisme ; 
i) Un représentant de l'Union nationale des industries de carrières et matériaux de Bretagne ; 
5° Huit représentants des organisations d'usagers : 
a) Un représentant de la Fédération française des pêcheurs en mer ; 
b) Un représentant de la Fédération française d'études et de sports sous-marins ; 
c) Un représentant de la Fédération nationale des pêcheurs plaisanciers et sportifs de France ; 
d) Un représentant de l'association Nautisme en Finistère ; 
e) Un représentant de l'Association pour la promotion des classes de mer en Bretagne ; 
f) Un représentant d'une association insulaire des usagers de la mer désignée par les maires des communes d'Ile-Molène, d'Ouessant et d'Ile-de-Sein ; 
g) Un représentant de la fédération départementale des chasseurs du Finistère ; 
h) Un représentant d'une association locale d'usagers ; 
6° Deux représentants d'associations de protection de l'environnement : 
a) Un représentant de l'association Bretagne vivante ; 
b) Un représentant de l'association Eaux et rivières de Bretagne ; 
7° Neuf personnalités qualifiées proposées par : 
a) Océanopolis ; 
b) L'association des îles du Ponant ; 
c) L'Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer ; 
d) L'Institut universitaire européen de la mer ; 
e) Le Centre de documentation, de recherche et d'expérimentation sur les pollutions accidentelles des eaux ; 
f) Le Centre d'études et de valorisation des algues ; 
g) L'organisme gestionnaire de la réserve naturelle nationale d'Iroise ; 
h) Le Conservatoire de l'espace littoral et des rivages lacustres ; 
i) L'Office national de la chasse et de la faune sauvage.