PARTIE I
Liste des agents biologiques pathogènes des groupes 2, 3 et 4
Tableau A
Les bactéries
Agent biologique
Classification
Sigles et symboles
Actinomadura pelletieri
2
Actinomyces gerencseriae
2
Actinomyces israelii
2
Actinomyces pyogenes
2
Actinomyces spp.
2
Arcanobacterium haemolyticum (Corynebacterium haemolyticum)
2
Bacillus anthracis
3
Bacteroides fragilis
2
Bartonella (Rochalimaea) spp.
2
Bartonella quintana (Rochalimaea quintana)
2
Bordetella bronchiseptica
2
Bordetella parapertussis
2
Bordetella pertussis
2
V
Borrelia burgdorferi
2
Borrelia duttonii
2
Borrelia recurrentis
2
Borrelia spp.
2
Brucella abortus
3
Brucella canis
3
Brucella melitensis 1
3
Brucella suis
3
Burkholderia mallei (Pseudomonas mallei)
3
Burkholderia pseudomallei (Pseudomonas mallei)
3
Campylobacter fetus
2
Campylobacter jejuni
2
Campylobacter spp.
2
Cardiobacterium hominis
2
Chlamydia pneumoniae
2
Chlamydia trachomatis
2
Chlamydia psittaci (souches aviaires)
3
Chlamydia psittaci (souches non aviaires)
2
Clostridium botulinum
2
T
Clostridium perfringens
2
Clostridium tetani
2
T, V
Clostridium spp.
2
Corynebacterium diphtheriae
2
T, V
Corynebacterium minutissimum
2
Corynebacterium pseudotuberculosis
2
Corynebacterium spp.
2
Coxiella burnetii
3
Edwardsiella tarda
2
Ehrlichia sennetsui (Rickettsia sennetsui)
2
Ehrlichia spp.
2
Eikenella corrodens
2
Enterobacter aerogenes cloacae
2
Enterobacter spp.
2
Enterococcus spp.
2
Erysipelothrix rhusiopathiae
2
Escherichia coli (à l'exception des souches non pathogènes)
2
Escherichia coli, souches cytotoxiques (par exemple : 0157 : H7 ou 0103)
3
T (*)
Flavobacterium meningosepticum
2
Fluoribacter bozemanae (Legionella)
2
Francisella tularensis (type A)
3
Francisella tularensis (type B)
2
Fusobacterium necrophorum
2
Gardnerella vaginalis
2
Haemophilus ducreyi
2
Haemophilus influenzae
2
V
Haemophilus spp
2
Helicobacter pylori
2
Klebsiella oxytoca
2
Klebsiella pneumoniae
2
Klebsiella spp.
2
Legionella pneumophila
2
Legionella spp.
2
Leptospira interrogans icterohemorragiae
2
V
Leptospira interrogans (autres sérotypes)
2
Listeria monocytogenes
2
Listeria ivanovii
2
Morganella morganii
2
Mycobacterium africanum
3
V
Mycobacterium avium/intracellulare
2
Mycobacterium bovis (à l'exception de la souche BCG )
3
V
Mycobacterium chelonae
2
Mycobacterium fortuitum
2
Mycobacterium kensasii
2
Mycobacterium leprae
3
Mycobacterium malmoense
2
Mycobacterium marinum
2
Mycobacterium microti
3
(*)
Mycobacterium paratuberculosis
2
Mycobacterium scrofulaceum
2
Mycobacterium simiae
2
Mycobacterium szulgai
2
Mycobacterium tuberculosis
3
V
Mycobacterium ulcerans
3
(*)
Mycobacterium xenopi
2
Mycoplasma caviae
2
Mycoplasma hominis
2
Mycoplasma pneumoniae
2
Neisseria gonorrhoeae
2
Neisseria meningitidis
2
V
Nocardia asteroides
2
Nocardia brasiliensis
2
Nocardia farcinica
2
Nocardia nova
2
Nocardia otitidiscaviarum
2
Pasteurella multocida
2
Pasteurella spp.
2
Peptostreptococcus anaerobius
2
Plesiomonas shigelloides
2
Porphyromonas spp.
2
Prevotella spp.
2
Proteus mirabilis
2
Proteus penneri
2
Proteus vulgaris
2
Providencia alcalifaciens
2
Providencia rettgeri
2
Providencia spp.
2
Pseudomonas aeruginosa
2
Rhodococcus equi
2
Rickettsia akari
3
(*)
Rickettsia canada
3
(*)
Rickettsia conorii
3
Rickettsia montana
3
(*)
Rickettsia typhi (Rickettsia mooseri)
3
Rickettsia prowazekii
3
Rickettsia rickettsii
3
Rickettsia tsutsugamushi
3
Rickettsia spp.
2
Salmonella arizonae
2
Salmonella enteritidis
2
Salmonella typhimurium
2
Salmonella paratyphi A, B, C
2
V
Salmonella typhi
3
V (*)
Salmonella (autres variétés sérologiques)
2
Serpulina spp.
2
Shigella boydii
2
Shigella dysenteriae (autre que le type 1)
2
Shigella dysenteriae (type 1)
3
T (*)
Shigella flexneri
2
Shigella sonnei
2
Staphylococcus aureus
2
Streptobacillus moniliformis
2
Streptococcus pneumoniae
2
Streptococcus pyogenes
2
Streptococcus spp.
2
Streptococcus suis
2
Treponema carateum
2
Treponema pallidum
2
Treponema pertenue
2
Treponema spp.
2
Vibrio cholerae (y inclus El Tor )
2
Vibrio parahaemolyticus
2
Vibrio spp.
2
Yersinia enterocolitica
2
Yersinia pestis
3
V
Yersinia pseudotuberculosis
2
Yersinia spp.
2
Tableau B
Les virus
Agent biologique
Classification
Sigles et symboles
Adenoviridae
2
Arenaviridae :
Complexe de la chorioméningite lymphocytaire-Lassa (arénavirus ancien monde) :
Virus Lassa
4
Virus de la chorioméningite lymphocytaire (souches neurotropes)
3
Virus de la chorioméningite lymphocytaire (autres souches)
2
Virus Mopeia
2
Autres complexes de la chorioméningite lymphocytaire-Lassa
2
Complexe Tacaribe (arénavirus nouveau monde) :
Virus Guanarito
4
Virus Junin
4
Virus Sabia
4
Virus Machupo
4
Virus Flexal
3
Virus Lujo
4
Virus Whitewater Arroyo
4
Virus Chapare
4
Autres complexes Tacaribe
2
Bunyaviridae :
Virus Belgrade (également appelé Dobrava)
3
Virus Bhanja
2
Virus Bunyamwera
2
Virus Germiston
2
Virus Oropouche
3
Virus de l'encéphalite de Californie
2
Virus Sir Nombre (anciennement Muerto Canyon)
3
Hantavirus :
Hantaan (fièvre hémorragique avec syndrome rénal)
3
Virus Andes
3
Virus Choclo
3
Virus Laguna Negra
3
Virus Séoul
3
Virus Puumala
2
Virus Prospect Hill
2
Autres Hantavirus
2
Nairovirus :
Virus de la fièvre hémorragique de Crimée/Congo
4
Virus Hazara
2
Phlébovirus :
Fièvre de la vallée du Rift
3
V
Fièvre à phlébotomes
2
Virus Toscana
2
Autres Bunyavirus connus comme pathogènes
2
Caliciviridae :
Norwalk-Virus
2
Autres Caliciviridae
2
Coronavidae :
Betacoronavirus
Coronavirus responsable du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV)
3
Coronavirus responsable du Syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV)
3
Coronavirus responsable du Syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SARS-CoV-2)
3
(i)
Autres Coronavidae
2
Virus de l'hépatite E
3
(*)
Filoviridae :
Virus Ebola
4
Virus de Marbourg
4
Flaviviridae :
Encéphalite d'Australie (encéphalite de la vallée de Murray)
3
Encéphalite à tiques d'Europe centrale
3
V (*) (a)
Absettarov
3
V (a)
Hanzalova
3
V (a)
Hypr
3
V (a)
Kumlinge
3
V (a)
Virus de la dengue, types 1-4
3
Virus de l'hépatite C
3
(*)
Encéphalite B japonaise
3
V
Maladie de la forêt de Kyasanur
3
V
Louping ill
3
(*)
Fièvre hémorragique d'Omsk
3
V
Powassan
3
Rocio
3
Encéphalite verno-estivale russe
3
V (a)
Encéphalite de Saint-Louis
3
Wesselsbron
3
(*)
West Nile
3
Fièvre jaune
3
V
Autres Flavivirus connus pour être pathogènes
2
Virus de l'hépatite G
3
(*)
Hepadnaviridae :
Virus de l'hépatite B
3
V (*)
Virus de l'hépatite D (delta)
3
V (*) (b)
Herpesviridae :
Cytomégalovirus
2
Herpesvirus hominis 7
2
Herpesvirus hominis 8
2
Virus d'Epstein-Barr
2
Virus du cercopithèque type 1 (virus B du singe)
3
Virus de l'herpès humain, types 1 et 2
2
Varicellovirus
2
Virus lymphotrope B humain (HBLV-HHV 6)
2
Orthomyxoviridae :
Virus grippal (influenza), types A, B et C
2
V (c)
Orthomyxoviridae transmis par les tiques : virus Dhori et Thogoto
2
Papovavioridae :
Virus BK et JC
2
Papillomavirus humain
2
Paramyxoviridae :
Virus de la rougeole
2
V
Virus des oreillons
2
V
Virus de la maladie de Newcastle
2
Virus parainfluenza , types 1 à 4
2
Virus respiratoire syncytial
2
Henipavirus
4
Virus Nipah
4
Parvoviridae :
Parvovirus humain (B 19)
2
Picornaviridae :
Virus de la conjonctivite aiguë hémorragique (AHC)
2
Virus Coxsackie
2
Virus Echo
2
Virus de l'hépatite A (hépatovirus)
2
V
Virus poliomyélitique
2
V
Rhinovirus
2
Poxviridae :
Virus de la variole du buffle
2
(d)
Virus de la variole bovine
2
Virus de la variole de l'éléphant
2
(e)
Virus du nodule des trayeurs
2
Virus du Molluscum contagiosum
2
Virus de la variole du singe
3
V
Virus Orf
2
Virus de la variole du lapin
2
(f)
Virus de la vaccine
2
Virus de la variole (majeure et mineure)
4
V
Virus de la variole blanche
4
V
Virus Tana et Yaba
2
Reoviridae :
Coltivirus
2
Rotavirus humains
2
Orbivirus
2
Reovirus
2
Retroviridae :
Virus de l'immuno-déficience humaine
3
(*)
Virus de leucémies humaines à cellules T (HTLV), types 1 et 2
3
(*)
Virus SIV
3
(*) (g)
Rhabdoviridae :
Virus de la rage
3
V (*)
Virus de la stomatite vésiculeuse
2
Togaviridae :
Alphavirus :
Encéphalomyélite équine est-américaine
3
V
Virus Bebaru
2
Virus Chikungunya
3
(*)
Virus Everglades
3
(*)
Virus Mayaro
3
Virus Mucambo
3
(*)
Virus Ndumu
3
Virus O'nyong-nyong
2
Virus de la rivière Ross
2
Virus de la forêt de Semliki
2
Virus Sindbis
2
Virus Tonate
3
(*)
Encéphalomyélite équine du Venezuela
3
V
Encéphalomyélite équine Ouest-américaine
3
V
Autres alphavirus connus
2
Rubivirus (virus de la rubéole)
2
V
Toroviridae :
2
Virus non classés :
Morbillivirus équin
4
Virus d'hépatites non encore identifiés
3
(*)
Agents transmissibles non conventionnels associés avec les encéphalopathies spongiformes transmissibles (EST) :
Maladie de Creutzfeldt-Jakob
3
(*)
Variante de la maladie de Creutzfeld-Jakob
3
(*)
Encéphalopathie spongiforme bovine (ESB) et autres EST animales associées
3
(*) (h)
Syndrome de Gerstman-Sträussler-Scheinker
3
(*)
Kuru
3
(*)
Tableau C
Les parasites
Agent biologique
Classification
Sigles et symboles
Acanthamoeba castellani
2
Ancylostoma duodenale
2
Angiostrongylus cantonensis
2
Angiostrongylus costaricensis
2
Ascaris lumbricoides
2
A
Ascaris suum
2
A
Babesia divergens
2
Babesia microti
2
Balantidium coli
2
Brugia malayi
2
Brugia pahangi
2
Capillaria philippinensis
2
Capillaria spp.
2
Clonorchis sinensis
2
Clonorchis viverrini
2
Cryptosporidium parvum
2
Cryptosporidium spp.
2
Cyclospora cayetanensis
2
Dipetalonema streptocerca
2
Diphyllobothrium latum
2
Dracunculus medinensis
2
Echinococcus granulosus
3
(*)
Echinococcus multilocularis
3
(*)
Echinococcus vogeli
3
(*)
Entamoeba histolytica
2
Fasciola gigantica
2
Fasciola hepatica
2
Fasciolopsis buski
2
Giardia lamblia (Giardia intestinalis)
2
Hymenolepis diminuta
2
Hymenolepis nana
2
Leishmania braziliensis
3
(*)
Leishmania donovani
3
(*)
Leishmania ethiopica
2
Leishmania mexicana
2
Leishmania peruviana
2
Leishmania tropica
2
Leishmania major
2
Leishmania spp.
2
Loa loa
2
Mansonella ozzardi
2
Mansonella perstans
2
Naegleria fowleri
3
Necator americanus
2
Onchocerca volvulus
2
Opisthorchis felineus
2
Opisthorchis spp.
2
Paragonimus westermani
2
Plasmodium falciparum
3
(*)
Plasmodium (humain et simien) spp.
2
Sarcocystis suihominis
2
Schistosoma haematobium
2
Schistosoma intercalatum
2
Schistosoma japonicum
2
Schistosoma mansoni
2
Schistosoma mekongi
2
Strongyloides stercoralis
2
Strongyloides spp.
2
Taenia saginata
2
Taenia solium
3
(*)
Toxocara canis
2
Toxoplasma gondii
2
Trichinella spiralis
2
Trichuris trichiura
2
Trypanosoma brucei brucei
2
Trypanosoma brucei gambiense
2
Trypanosoma brucei rhodesiense
3
(*)
Trypanosoma cruzi
3
Wuchereria bancrofti
2
Tableau D
Les champignons
Agent biologique
Classification
Sigles et symboles
Aspergillus fumigatus
2
A
Blastomyces dermatitidis (Ajellomyces dermatitidis)
3
Candida albicans
2
A
Candida tropicalis
2
Cladophialophora bantiana (anciennement Xylohypha bantiana, Cladosporium bantianum ou trichoïdes)
3
Coccidioides immitis
3
A
Cryptococcus neoformans var. neoformans (Filobasidiella neoformans var. neoformans)
2
A
Cryptococcus neoformans var. gattii (Filobasidiella bacillispora)
2
A
Emmonsia parva var. parva
2
Emmonsia parva var. crescens
2
Epidermophyton floccosum
2
A
Fonsecaea compacta
2
Fonsecaea pedrosoi
2
Histoplasma capsulatum var. capsulatum (Ajellomyces capsulatus)
3
Histoplasma capsulatum duboisii
3
Madurella grisea
2
Madurella mycetomatis
2
Microsporum spp.
2
A
Neotestudina rosatii
2
Paracoccidioides brasiliensis
3
Penicillium marneffei
2
A
Scedosporium apiospertnum (Pseudallescheria boydii)
2
Scedosporium prolificans (inflatum)
2
Sporothrix schenckii
2
Trichophyton rubrum
2
Trichophyton spp.
2
Partie II
Lexique des sigles et symboles
A. - Lexique général
(*)
Accolé à certains agents biologiques pathogènes du groupe 3, cet astérisque indique qu'ils peuvent présenter un risque d'infection limité car ils ne sont normalement pas infectieux par l'air.
A
Agent biologique pathogène qui peut avoir des effets allergisants
T
Agent biologique qui est susceptible de produire des toxines
V
Un vaccin efficace est disponible
spp
Cette mention (species) signifie qu'il est fait référence aux autres espèces qui sont connues pour être pathogènes chez l'homme
B. - Lexique propre aux virus
(a)
Encéphalite à tiques
(b)
La vaccination contre le virus de l'hépatite B protégera les travailleurs contre le virus de l'hépatite D (delta) dès lors qu'ils ne sont pas affectés par le virus de l'hépatite B
(c)
Uniquement en ce qui concerne les types A et B
(d)
Deux virus peuvent être identifiés sous cette rubrique, celui de la variole du buffle et une variante du virus de la vaccine
(e)
Variante de la variole bovine
(f)
Variante de la vaccine
(g)
Il n'existe actuellement aucune preuve de maladie de l'homme par les autres rétrovirus d'origine simienne. Par mesure de précaution, un confinement de niveau 3 est recommandé pour les travaux exposant à ces rétrovirus.
(h)
Il n'y a pas de preuve concernant l'existence chez l'homme d'infections dues aux agents responsables d'autres EST animales. Néanmoins, les mesures de confinement des agents classés dans le groupe de risque 3 (*) sont recommandées par précaution pour les travaux en laboratoire, à l'exception des travaux en laboratoire portant sur un agent identifié de tremblante du mouton, pour lequel le niveau de confinement 2 est suffisant.
(i)
Les travaux de diagnostic sans mise en culture portant sur le SARS-CoV-2 devraient être réalisés dans des installations ayant adopté des procédures équivalentes au confinement de niveau 2 au moins. Les travaux avec mise en culture faisant intervenir le SARS-CoV-2 devraient être menés dans des laboratoires de confinement de niveau 3 dans lesquels la pression de l'air est inférieure à la pression atmosphérique