Khoản 1.3. Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu: a. Hàng hoá xuất khẩu, nhập khẩu trong các trường hợp sau đây không thuộc diện chịu thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu: - Máy móc, thiết bị, linh kiện, nguyên vật liệu nhập khẩu một lần vào đảo Phú Quốc để chế tạo thiết bị, máy móc trong dây chuyền sản xuất và các tài sản cố định khác trong thời gian đầu tư dự án; Máy móc, thiết bị, linh kiện, nguyên vật liệu nhập khẩu vào đảo Phú Quốc để mở rộng quy mô dự án hoặc để thay thế, đổi mới công nghệ; Nhiên liệu, nguyên liệu, vật tư nhập khẩu vào đảo Phú Quốc thuộc loại trong nước chưa sản xuất được để phục vụ xây dựng, vận hành công trình BOT. Các dự án đầu tư vào đảo Phú Quốc còn được hưởng ưu đãi miễn thuế nhập khẩu khác theo quy định tại Thông tư số 113/2005/TT-BTC áp dụng đối với dự án đầu tư tại địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn. - Hàng hoá từ Khu phi thuế quan xuất khẩu ra nước ngoài; Hàng hoá từ nước ngoài nhập khẩu vào Khu phi thuế quan và chỉ sử dụng trong khu phi thuế quan; - Hàng hoá từ khu phi thuế quan chuyển sang hoặc bán cho các khu phi thuế quan khác (là khu phi thuế quan quy định tại khoản 1, Điều 5 Luật thuế Xuất khẩu, thuế nhập khẩu (sửa đổi) năm 2005), cho doanh nghiệp chế xuất, cho kho ngoại quan, và ngược lại. - Hàng hoá không thuộc diện chịu thuế xuất khẩu có xuất xứ từ nội địa Việt Nam đưa vào Khu phi thuế quan. b. Hàng hoá thuộc diện chịu thuế xuất khẩu có xuất xứ từ nội địa Việt Nam đưa vào Khu phi thuế quan để xuất khẩu mà không qua sản xuất, gia công, tái chế, lắp ráp trong Khu phi thuế quan thì phải nộp thuế xuất khẩu đối với toàn bộ giá trị hàng hoá xuất khẩu vào Khu phi thuế quan. c. Hàng hoá thuộc diện chịu thuế xuất khẩu có xuất xứ từ nội địa Việt Nam đưa vào Khu phi thuế quan để tiếp tục sản xuất, gia công, tái chế, lắp ráp trong Khu phi thuế quan nhằm xuất khẩu ra nước ngoài chỉ phải nộp thuế xuất khẩu đối với phần giá trị hàng hoá có xuất xứ nội địa Việt Nam cấu thành trong sản phẩm xuất khẩu. Căn cứ để xác định thuế xuất khẩu phải nộp đối với phần nguyên liệu, linh kiện nhập khẩu từ nội địa Việt Nam cấu thành trong hàng hoá xuất khẩu ra nước ngoài là: Giá tính thuế xác định theo quy định hiện hành; số lượng hàng hoá xuất khẩu ra nước ngoài; thuế suất thuế nhập khẩu đối với từng loại nguyên liệu, linh kiện. Giá tính thuế và thuế suất áp dụng tại thời điểm mở tờ khai xuất khẩu ra nước ngoài. Tổ chức, cá nhân sản xuất kinh doanh có trách nhiệm đăng ký với cơ quan Hải quan về danh mục hàng hoá nhập khẩu sử dụng làm nguyên liệu sản xuất hàng xuất khẩu ra nước ngoài và định mức nguyên liệu, linh kiện dùng để sản xuất hàng xuất khẩu trước khi xuất khẩu. d. Hàng hoá từ Khu phi thuế quan nhập vào nội địa Việt Nam phải nộp thuế nhập khẩu theo quy định sau: - Hàng hoá có xuất xứ từ nước ngoài nộp thuế nhập khẩu theo quy định hiện hành. - Hàng hoá được sản xuất, gia công, tái chế, lắp ráp tại Khu phi thuế quan nếu đủ điều kiện theo quy định hiện hành về chính sách thuế nhập khẩu ưu đãi theo Hiệp định về Chương trình ưu đãi thuế quan có hiệu lưc chung của các nước ASEAN (CEPT) thì được áp dụng theo quy định hiện hành. - Hàng hoá sản xuất, gia công, tái chế, lắp ráp tại Khu phi thuế quan trong đảo Phú Quốc có sử dụng nguyên liệu, linh kiện nhập khẩu trực tiếp từ nước ngoài (không bao gồm hàng hoá nhập từ nội địa Việt Nam có sử dụng nguyên liệu, linh kiện nhập khẩu từ nước ngoài), khi nhập khẩu vào nội địa Việt Nam chỉ phải nộp thuế nhập khẩu đối với phần nguyên liệu, linh kiện nhập khẩu từ nước ngoài cấu thành trong hàng hoá đó. Căn cứ để xác định thuế nhập khẩu phải nộp đối với phần nguyên liệu, linh kiện nhập khẩu từ nước ngoài cấu thành trong hàng hoá nhập vào nội địa Việt Nam là: Giá tính thuế xác định theo quy định hiện hành; số lượng hàng hoá nhập khẩu vào nội địa Việt Nam; thuế suất thuế nhập khẩu đối với từng loại nguyên liệu, linh kiện. Giá tính thuế và thuế suất áp dụng tại thời điểm mở tờ khai nhập khẩu vào nội địa. Tổ chức, cá nhân sản xuất kinh doanh có trách nhiệm đăng ký với cơ quan Hải quan về danh mục hàng hoá nhập khẩu sử dụng làm nguyên liệu sản xuất hàng nhập khẩu vào nội địa và định mức nguyên liệu, linh kiện dùng để sản xuất hàng nhập khẩu trước khi nhập vào nội địa Việt Nam. Giá trị nguyên liệu, linh kiện nhập khẩu cấu thành trong mỗi đơn vị hàng hoá nhập khẩu vào nội địa được xác định theo quy định về giá tính thuế nhập khẩu đối với hàng nhập khẩu tại thời điểm nhập khẩu vào nội địa Việt Nam. Thủ tục, hồ sơ miễn thuế, kê khai và quyết toán thuế nhập khẩu đối với trường hợp này được thực hiện theo Thông tư số 113/2005/TT-BTC ngày 15/12/2005 của Bộ Tài chính về hướng dẫn thi hành thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu. đ. Các tổ chức, cá nhân trong nước và nước ngoài hoạt động sản xuất, kinh doanh trong Khu phi thuế quan nhập nguyên liệu sản xuất, vật tư, hàng hoá từ nước ngoài nhưng không sử dụng hết và các thứ phẩm còn có giá trị thương mại được phép bán vào nội địa Việt Nam sau khi hoàn tất thủ tục hải quan phải nộp thuế nhập khẩu theo quy định hiện hành.