Điều 4. - Thuế tài nguyên coi là một yếu tố chi phí, được hạch toán vào giá thành sản phẩm khai thác.. 5- Cơ quan thuế kiểm tra phát hiện tổ chức, cá nhân khai thác lâm sản trái phép (không có giấy phép; khai thác vượt số lượng chủng loại cho phép) thì toàn bộ số lâm sản khai thác trái phép sẽ bị tịch thu và xử lý theo quy định tại Điều 50 Luật Bảo vệ và phát triển rừng. Việc tịch thu lâm sản phải lập biên bản công khai, có chữ ký của người bị tịch thu, của cán bộ trực tiếp kiểm tra và lãnh đạo cơ quan ra quyết định tịch thu. Biên bản lập thành 3 bản: một bản gửi cơ quan trực tiếp thu thuế, một bản giao cho người bị tịch thu lâm sản, một bản do đơn vị lập biên bản giữ. Căn cứ vào biên bản tịch thu, cơ quan quyết định tịch thu lâm sản phải làm "phiếu nhập hàng tạm giữ và tịch thu", theo mẫu CTT21 do Bộ Tài chính phát hành, gồm 3 liên: Liên 1 thủ kho lưu, liên 2 giao cho người giao hàng, liên 3 chuyển kế toán ghi số hàng tạm giữ tịch thu và phải thực hiện bảo quản theo chế độ chung của Nhà nước quy định. Những lâm sản tịch thu, chỉ được xuất kho khi có quyết định xử lý của cơ quan có thẩm quyền. Tiền bán hàng lâm sản tịch thu sau khi bù đắp chi phí vận chuyển, bảo quản hợp lý, tuỳ tính chất vụ việc được trích từ 1-15% theo quy định tại Điều 39, Pháp lệnh xử phạt vi phạm hành chính để thưởng cho các tổ chức và cá nhân có công phát hiện, bắt giữ lâm sản khai thác trái phép; số còn lại nộp ngân sách Nhà nước. Cơ quan ra quyết định xử lý lâm sản trái phép quyết định tỷ lệ thưởng cụ thể cho từng vụ việc. 6- Thuế tài nguyên khai thác lâm sản là khoản thu ngân sách Nhà nước thực hiện theo chế độ phân cấp quản lý ngân sách của Nhà nước quy định. 7- Quyết toán thu nộp thuế tài nguyên:
a) Các Lâm trường quốc doanh và cơ sở khai thác thường xuyên quy mô lớn nộp thuế theo phương pháp kê khai; chậm nhất là 30 ngày sau khi kết thúc quý, 45 ngày sau khi kết thúc năm, phải quyết toán việc nộp thuế tài nguyên với cơ quan thuế theo mẫu quy định (mẫu số 2 kèm theo) và chậm nhất không quá 15 ngày kể từ ngày nhận được thông báo của cơ quan thuế, phải nộp đủ số thuế còn thiếu, nếu đã nộp thừa thì được trừ ngay vào số thuế phải nộp của kỳ sau.
b) Các cơ sở khai thác (không thường xuyên, nhỏ) đã nộp thuế dứt điểm từng kỳ, từng lần khai thác vận chuyển, nên không phải thanh toán, quyết toán vào cuối quý, cuối năm.
c) Cơ quan kiểm lâm nhân dân: Kiểm tra, phát hiện, bắt giữ và tịch thu lâm sản trái phép: khi thực hiện sử phạt vi phạm Luật bảo vệ và phát triển rừng hoặc xử lý xuất kho bán lâm sản tịch thu phải nộp đầy đủ kịp thời vào ngân sách Nhà nước các khoản phải nộp (bao gồm tiền phạt vi phạm hành chính, tiền bán hàng lâm sản tịch thu sau khi đã trừ khoản được trích theo chế độ). Đồng thời phải quyết toán với cơ quan thuế cùng cấp về các khoản phải thu, phải nộp ngân sách Nhà nước và việc sử dụng quỹ tiền thưởng, chậm nhất 45 ngày sau khi kết thúc quý, năm.
d) Cơ quan thuế: - Thực hiện kế toán kịp thời số thuế tài nguyên đã thu theo từng cơ sở khai thác, từng ngành nghề khai thác theo đúng mục lục ngân sách Nhà nước quy định. - Hàng tháng, tổng hợp báo cáo két quả thu thuế tài nguyên trên dịa bàn (kể cả tiền bán hàng tịch thu hạch toán riêng) lên cơ quan thuế cấp trên, sau khi đã kiểm tra đối chiếu với số thu ở kho bạc cùng cấp theo chế độ báo cáo của Bộ Tài chính. - Kiểm tra việc sử dụng, thanh toán, quyết toán biên lai thu thuế tài nguyên với cơ quan thuế cấp trên theo chế độ quản lý kế toán ấn chỉ của Bộ Tài chính. - Quyết toán số thuế tài nguyên do cơ quan thuế trực tiếp thu và số đã nộp ngân sách Nhà nước cuối mỗi tháng, quý, năm chậm nhất sau 15 ngày kết thúc năm. Nghiêm cấm việc toạ chi, biển thủ tiền thuế.