Le biopsie possono essere effettuate in molte zone del corpo. I modi per ottenere un campione del tessuto da esaminare variano in relazione al tipo di materiale da prelevare e alla zona del corpo da cui proviene: 

biopsia punch, è eseguita per prendere piccoli pezzi di pelle (cute) utilizzando un bisturi monouso, cilindrico (punch), metallico che consenta, con il suo margine affilato, di ottenere delle sezioni circolari, di varia grandezza e profondità, della pelle. In genere, è eseguita in anestesia locale per addormentare solo la zona da cui sarà asportato il tessuto. La ferita potrà essere chiusa con pochi punti di sutura
biopsia mediante ago aspirato, è effettuata utilizzando uno speciale ago vuoto all'interno che permette di aspirare una parte di tessuto o un insieme di cellule. L'ago, di dimensioni variabili, è guidato sino alla zona da prelevare utilizzando i raggi X , l'ecografia, la TAC o la risonanza magnetica nucleare (RMN). Spesso, l'esame è utilizzato anche per prendere campioni di cellule da un organo o da aree che si trovano al di sotto della superficie della pelle. Se la parte da prelevare è grande, sarà usato un ago di dimensioni maggiori. Per evitare che la persona da sottoporre alla biopsia possa sentire dolore, di solito l'area su cui dovrà essere effettuata è addormentata utilizzando un anestetico locale. Questo tipo di biopsia, di solito, è impiegata per analizzare dei noduli al seno o per prelevare del tessuto dal midollo osseo
biopsia endoscopica, è eseguita, ad esempio, per prendere del tessuto dallo stomaco durante una gastroscopia o dall'intestino crasso (colon) durante una colonscopia. Si effettua attraverso l'endoscopio, un tubo sottile e flessibile con una luce e una telecamera ad una estremità, che consente di visualizzare l'interno del corpo. Ad esso possono essere collegati strumenti da taglio di piccole dimensioni per consentire all'endoscopista (chirurgo, infermiere specializzato) di prelevare un campione di tessuto. Durante la biopsia endoscopica è utilizzato un anestetico
biopsia di escissione (asportazione), è un'operazione chirurgica utilizzata per rimuovere un'area più grande di tessuto non prelevabile con gli altri tipi di tecnica. Consiste nell'eliminazione dell’intera zona che presenta delle alterazioni e di una porzione dei tessuti normali circostanti come avviene, ad esempio, per un linfonodo “sentinella” (cioè un linfonodo che può indicare al medico lo stato di avanzamento di una malattia) oppure un nodulo al seno. È eseguita dal chirurgo in sala operatoria, in genere addormentando solo la zona da operare (anestesia locale). In questo caso, di solito, dopo l’esame si può tornare a casa. Se, invece, la biopsia escissionale riguarda un organo interno potrebbe essere necessario rimanere in ospedale per una notte
biopsia perioperatoria (o estemporanea o intraoperatoria), è eseguita in sala operatoria durante un'operazione chirurgica. Il campione di tessuto  asportato  è  analizzato immediatamente per informare il chirurgo sulla natura delle cellule prelevate mentre l'operazione è in corso. Il risultato della biopsia, infatti, aiuta il chirurgo a decidere come proseguire l'intervento

Al termine dell’esame, e nei giorni successivi, la persona sottoposta alla biopsia dovrà fare attenzione ai punti di sutura e dovrà evitare alcuni movimenti.