La sindrome di DiGeorge può causare una serie di disturbi (sintomi) da lievi a gravi; i più comuni includono:

caratteristiche specifiche del viso
problemi di apprendimento e comportamento, inclusi ritardi nel camminare o nel parlare, difficoltà di apprendimento, disturbo da deficit di attenzione e iperattività (ADHD) e autismo
problemi di linguaggio e udito, inclusa perdita dell'udito temporanea a causa di frequenti otiti, lentezza nell'iniziare a parlare e voce marcatamente nasale (ipernasale)
problemi alla bocca e nell'alimentazione, oltre il 75% delle persone ha anomalie del palato quali fessure del palato o del labbro e palato (chiamate rispettivamente palatoschisi e labiopalatoschisi) o incapacità di chiudere il passaggio tra rinofaringe e orofaringe (chiamata insufficienza velofaringea), che possono causare voce nasale, disturbi alimentari e della deglutizione
problemi cardiaci, il 77% dei casi soffre di difetti cardiaci fin dalla nascita (cardiopatia congenita) come tronco arterioso (ossia dal cuore origina una sola arteria), tetralogia di Fallot (dove la struttura del cuore è alterata) e difetto del setto ventricolare (il cuore presenta un foro nella parete che separa i due ventricoli)
problemi immunitari, il 75% delle persone ha una riduzione del funzionamento del sistema di difesa dell’organismo (immunodeficienza), causato dalla mancanza o dall’insufficiente sviluppo (ipo/aplasia) del timo (ghiandola del sistema linfatico che produce i linfociti T e stimola i linfociti B a produrre anticorpi), che le rende predisposte alle infezioni
aumento del rischio di sviluppare una malattia autoimmune quali porpora trombocitopenica idiopatica (caratterizzata da reazioni autoimmuni contro le piastrine con conseguenti problemi di coagulazione), anemia emolitica (caratterizzata da reazioni autoimmuni contro i globuli rossi), pancitopenia autoimmune (caratterizzata da reazioni autoimmuni contro tutte le cellule del sangue), tireopatia (ridotta capacità della tiroide di produrre quantità sufficienti di ormone tiroideo a causa di reazioni autoimmuni), vitiligine (caratterizzata da reazioni autoimmuni contro cellule pigmentate della pelle chiamate melanociti) e l'artrite idiopatica giovanile (caratterizzata da infiammazione cronica delle articolazioni)
problemi ormonali, come lo sviluppo non sufficiente o assente delle ghiandole paratiroidi (ipocalcemia), responsabili di tremori e convulsioni

Altri possibili problemi includono:

problemi ossei, muscolari e articolari, inclusi dolori alle gambe ricorrenti, anomalie della colonna vertebrale quali scoliosi (deviazione della colonna vertebrale), malformazioni delle vertebre (vertebre a farfalla, emivertebre) e artrite reumatoide (malattia infiammatoria autoimmune che colpisce e articolazioni)
bassa statura, bambini e adulti possono essere più bassi della media
problemi di salute mentale, gli adulti hanno maggiori probabilità di manifestare schizofrenia e disturbi d'ansia
anomalie gastrointestinali quali malrotazione intestinale (l’incompleta rotazione dell'intestino durante lo sviluppo) e ano imperforato (in cui l’apertura dell’ano è mancante o bloccata)
anomalie renali, mancanza di uno o entrambi i reni (chiamata agenesia renale)
anomalie dei denti, difetto nello sviluppo dello smalto che ricopre i denti (chiamato ipoplasia dello smalto)