NLP-CISUC/PROPOR_FOS_Classification huggingface dataset:
Estudo do perfil imunológico de transplantados renais – abordagem molecular a potenciais marcadores de disfunção crónica do enxerto

Palavras-chave: Transplantação renal,Rejeição crónica,Tolerância,Biomarcadores

A transplantação é a terapia de eleição para doentes com insuficiência renal crónica terminal. Desde o nascimento da área da transplantação de órgãos, o progresso das técnicas cirúrgicas e a introdução de novos agentes imunossupressores têm conduzido ao aumento da sobrevivência do enxerto a curto prazo. Contudo, este aumento dos resultados das taxas de sobrevivência do enxerto a curto prazo não tem sido acompanhado com o aumento dos resultados a longo prazo. E a acompanhar a perda tardia do enxerto estão as complicações associadas a uma terapia imunossupressora contínua. Hoje em dia, a monitorização funcional dos enxertos renais é feita pela determinação da creatinina sanguínea, cujas variações não serão específicas da rejeição, e pela análise da biópsia renal, sendo este um procedimento invasivo. Portanto, o desenvolvimento de ensaios não invasivos, que detectem biomarcadores moleculares de rejeição, pode revolucionar a monitorização dos receptores de transplantes, pela identificação de um perfil de pré-rejeição que permita a intervenção atempada antes da disfunção do enxerto estar instalada. O objectivo deste trabalho foi fazer uma avaliação genética, genómica, celular e humoral de doentes transplantados com função renal estável há mais de dez anos e transplantados aos quais foi diagnosticada rejeição/ disfunção crónica do enxerto. De forma, a encontrar algum aspecto diferencial entre os grupos, que pudesse constituir um potencial alvo de estudo, com o intuito de monitorizar a evolução do transplante sem recorrer a técnicas invasivas e, acima de tudo, avaliar o impacto dessas características na longevidade do enxerto. Ao nível de incompatibilidades HLA os grupos de estudo não apresentaram diferenças, assim como, no perfil farmacogenético. Foram observadas diferenças entre os grupos, nomeadamente, na presença de anticorpos anti-HLA, na análise da expressão génica em células do sedimento urinário, em células do sangue periférico e em subpopulações celulares. As diferenças encontradas tendem a ser indiciadoras de algum grau de tolerância nos transplantados com função renal estável há mais de dez anos, tendo em atenção que estes doentes continuam a realizar uma terapêutica imunossupressora.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais
Inventário Florístico e Atividades de Educação Ambiental na Mata da Santa Casa da Misericórdia de Arganil

Palavras-chave: Mata da Misericórdia de Arganil,Flora vascular,Diásporos,Líquenes,Educação ambiental

A Mata da Misericórdia de Arganil é uma mata antiga, secular, do domínio privado, mas aberta ao público em geral. Nos últimos anos tem sofrido algumas transformações, que, em alguns casos, não têm sido muito benéficas no que respeita à conservação do espaço, bem como da biodiversidade aí existente. Necessitando, por isso, de algumas estratégias de gestão sustentável, aliadas à conservação da natureza e de educação/sensibilização ambiental, para a preservação e manutenção da biodiversidade, assegurando, ao mesmo tempo, um progresso e crescimento adequado às necessidades da população. Os objetivos deste trabalho foram vários, destacando-se o levantamento florístico exaustivo de todos os estratos vegetais ali existentes, bem como o levantamento liquénico das espécies dominantes em locais estratégicos da Mata. Em ambas as situações foram recolhidos espécimes dos indivíduos identificados, que posteriormente foram conservados para a criação de um herbário e de uma coleção liquénica. Também foi elaborada uma coleção de diásporos, onde constam alguns dos frutos recolhidos ao longo de várias saídas de campo, além da sua forma de dispersão e agente dispersor. Outro dos objetivos passou pela elaboração de atividades de educação ambiental, tendo sido criado um percurso Botânico, cuja finalidade seria transmitir aos visitantes algumas informações relevantes sobre determinadas espécies vegetais importantes. Também foi elaborada uma atividade no âmbito dos líquenes identificados, de forma a demonstrar a sua importância para os ecossistemas, uma vez que se tratam de espécies pioneiras e indicadoras dos níveis de poluição.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais
O VIH/SIDA e as suas representações : uma análise antropológica dos discursos sobre o VIH/SIDA no jornal Diário

Palavras-chave: VIH/SIDA,Notícias,Discursos,Sexualidade

Esta dissertação procura analisar a linguagem presente nas notícias sobre o VIH/SIDA, presentes no jornal Diário de Coimbra, ao longo de 32 anos. Partindo destas notícias serão analisados em particular os discursos religiosos, científicos, governamentais e não-governamentais para percebermos como se originou a evolução do pensamento social sobre a SIDA. Através da análise discursiva das notícias iremos “perseguir as metáforas” do VIH, ou seja, iremos captar e descrever metodologicamente os enredos de formação discursiva e as suas conexões, produzidas pelas múltiplas fontes de informação acima mencionadas. Ao longo deste trabalho pretendemos mostrar quais os grupos populacionais mencionados nas notícias e quais as entidades que se destacam no papel de divulgação de informações sobre a epidemia. Veremos ainda como se articulam os discursos sobre o VIH/SIDA e os discursos sobre a sexualidade

Área científica: Ciências Exactas e Naturais
“Um Lento Entardecer de Verão”: as narrativas pessoais de portadores de retinopatia

Palavras-chave: Retinopatia,Experiência,Visão,Representação,Antropologia médica

A presente investigação, ancorada em abordagens teórico-metodológicas utilizadas pela antropologia médica, tem como pendor a análise, através da recolha de narrativas de sujeitos portadores de retinopatia, do sentido atribuído à experiência subjectiva da doença. A retinopatia caracteriza-se por um grupo de doenças degenerativas da retina, que conduzem à perda progressiva da visão ao longo da vida. O sentido da visão está permeado de significados sociais que marcam a vida de quem dele não pode fazer uso. Sendo considerado o sentido mais importante no acesso ao mundo, a experiência das pessoas que o perderam ou o vão perdendo é circunscrita a uma “narrativa de tragédia pessoal” fundada na ideia de incapacidade e infortúnio, erigida pela biomedicina consagrada na modernidade ocidental. Assim, seguindo uma abordagem que concilia a representação e a experiência da doença, o mais intrigante desta dissertação é o tentar perceber como as pessoas com retinopatia experienciam e dão significado à perda da visão ao longo da vida e ao mesmo tempo de que modo a experiência da doença é influenciada pelas representações erigidas sob a perda deste sentido, através da perpetuação de preconceitos e estereótipos. Constata-se que o modo como os indivíduos vivenciam a perda de visão está dependente de concepções, representações e significações de ordem pessoal e social, num quadro sociocultural dinâmico, onde estão em constante reavaliação.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais
Caraterização molecular e funcional de variantes alfa de hemoglobina identificadas no Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra

Palavras-chave: Hemoglobina,Hemoglobinopatias,Variantes de hemoglobina e talassémias

A hemoglobina é uma proteína tetramérica constituída por dois pares de cadeias globínicas e quatro grupos heme. A sua principal função é realizar o transporte de moléculas de oxigénio dos pulmões para os restantes tecidos do corpo humano. As hemoglobinopatias são caraterizadas pela presença de mutações nos genes globínicos. Estas mutações podem resultar na síntese de hemoglobinas com estrutura alterada (variantes de hemoglobina) ou na síntese reduzida de cadeias globínicas (talassémias). Na Unidade de Anemias Congénitas e Hematologia Molecular do Centro Hospitalar e Universitário de Coimbra (CHUC), um centro de referência para as doenças do glóbulo vermelho, identificaram-se vários indivíduos com as seguintes variantes alfa de Hb já descritas, Hb J-Paris-I, Hb Hirosaki, Hb G-Pest, Hb Toulon, Hb Setif, Hb Groene Hart, Hb Plasencia e Hb J-Camaguey. Adicionalmente identificaram-se indivíduos com variantes alfa de Hb não descritas, caraterizadas pelas seguintes mutações 40(C5)(LysAsn)(AAGAAT (1) e 104(G11)(CysArg)(TGCCGC) (2). Estas duas mutações foram designadas no laboratório por Hb HUC e Hb Iberia, respetivamente. Pelo estudo das variantes descritas, in silico, foi possível verificar o efeito das mutações na estrutura e na função da hemoglobina. Este estudo inicial ajudou a prever o efeito das variantes não descritas identificadas no laboratório. As mutações que caraterizam a Hb HUC e a Hb Ibéria ocorrem no contato 12 e no contato 11, respetivamente. A nível funcional verificou-se que a Hb HUC é uma variante estável com uma ligeira alta afinidade para o oxigénio (na presença de 2,3- difosfoglicerato) e a Hb Iberia é uma variante estável.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais
Estudo da frequência dos carateres discretos do esterno e costelas numa amostra populacional portuguesa

Palavras-chave: Carateres discretos,Esterno,Costelas,Tomografia computorizada,Amostra população portuguesa,Antropologia forense,Identificação

Os ossos são o material mais resistente do corpo humano e têm a capacidade de manter o registo de episódios ocorridos antemortem, perimortem e postmortem. Em muitos casos de antropologia forense, a avaliação do perfil biológico (idade, sexo, ancestralidade, e estatura) não é suficiente para se conseguir uma identificação positiva, uma vez que vários indivíduos podem partilhar o mesmo perfil, sendo por isso necessário recorrer a fatores de identidade e individualização. O recurso a carateres nãométricos pode ser uma ferramenta útil na identificação e individualização de indivíduos, sendo o objetivo primordial deste estudo conhecer o potencial de determinados carateres discretos axiais como fator de identidade. Para alcançar os objetivos avaliou-se a frequência de carateres discretos do esterno (foramen xifóide, foramen esternal e terminação do processo xifóide) e costelas (costela bífida e ausência da 12ª costela) numa amostra populacional portuguesa, com 100 imagens de tomografias axiais computadorizadas (TAC's) de indivíduos com idade entre os 15 e 60 anos e numa coleção de esqueletos identificada (CEI) do século XXI com indivíduos que registam uma idade à morte que varia de 33 a 99 anos. Todas os exames computadorizados foram analisados em imagens MIP e 3D, já coleção foi objeto de uma avaliação macroscópica. Das 100 imagens computadorizadas, as frequências das variações esternais e costais foram as seguintes: foramen xifóide com 11,9%, foramen esternal com 4%, terminação simples do xifóide com 84%, terminação dupla com 15,8%, não havendo registos para a terminação tripla e ausência de xifóide, costela bífida com 1% e ausência da 12ª costela com 6,9%. Já na CEI/XXI as frequências foram: foramen xifóide com 5,7%, foramen esternal com 7,6%, terminação simples do xifóide com 22,7%, terminação dupla com 11,3%, ausência de xifóide com 66% não havendo registos para a terminação tripla, costela bífida com 2,7% e ausência da 12ª costela com 39,2%. Nenhum carater se encontra associado com sexo ou idade. A comparação entre as duas amostras revela resultados distintos em alguns carateres nomeadamente na ausência do processo xifóide e na 12ª costela, podendo este resultado estar influenciado pela recuperação incompleta durante a exumação das peças osteológicas. Para fins de identificação em antropologia forense as imagens de TAC fornecem resultados mais fiáveis que os resultados apresentados pela CEI.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais
Estratificação vertical das comunidades microbianas da zona mesopelágica, no Atlântico Norte (38º64.90N, 28º31.45W), determinada por pirosequenciação do 16S DNAr

Palavras-chave: Zona mesopelágica,Diversidade microbiana,DGGE,Pirosequenciação,RubisCO,Ciclo de Calvin-Benson-Bassham,gene cbbL

Pretendeu-se determinar e comparar a diversidade microbiana num ambiente marinho de alto mar a diferentes profundidades, na zona mesopelágica, no Atlântico Norte mais propriamente num spot com as coordenadas (38º64.90N, 28º31.45W). Para tal, foram recolhidas amostras de água do mar a três diferentes profundidades na zona mesopelágica (255m, 532m e 809m). A diversidade microbiana presente nas diferentes amostras foi determinada por análise das sequências do gene que codifica a subunidade 16S do RNA ribossomal - gene 16S RNAr dos domínios Bacteria e Archaea obtidas por pirosequenciação. A diversidade microbiana foi também comparada nas diferentes amostras através de análise visual por DGGE. A presença dos genes cbbL e cbbM que codificam a forma I e II de RubisCO, respectivamente, enzima “chave” da via de fixação de CO2 do ciclo de Calvin- Benson- Bassham (CBB), foi também determinada nas amostras recolhidas a diferentes profundidades. As populações que parecem constituir a esmagadora maioria da comunidade bacteriana na zona mesopelágica estudada estavam filogeneticamente afiliadas com a Classe Alphaproteobacteria, muito frequentes em ecossistemas marinhos, nomeadamente bactérias pertencentes ao grupo geralmente designado por Roseobacter que incluem, entre outras, as bactérias da família Rhodobacteraceae. E mais, a análise por pirosequenciação mostrou estratificação vertical atendendo aos resultados verificados para as OTUs: 1, 2, 3, 6, 8, e 10 que compreendiam os géneros Sulfitobacter, Hyphomonas, Erythrobacter. Em relação ao Domínio Archaea, a análise por pirosequenciação mostrou que a maioria das populações estavam filogeneticamente afiliadas com o Filo Euryarchaeota. Em toda a zona mesopelágica apenas as sequências que codificam a forma I de RubisCO foram detectadas, formando um cluster com vários “phylotypes” muito similares. Pelos resultados obtidos, foi possível concluir que a zona mesopelágica, de facto, não será seguramente a zona oceânica onde a produção primária, terá a relevância fundamental na sustentabilidade dos ecossistemas marinhos. Tudo parece indicar que nesta zona existem populações microbianas diversas que asseguram funções diversificadas no ecossistema.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais
Estudo de marcadores bialélicos (SNPS) do cromossoma Y numa população africana (Angola)

Palavras-chave: Cromossoma Y,SNP,Angola,Ovimbundu,Mbundu,Bakongo

O estudo do cromossoma Y permite definir as linhagens paternas de um indivíduo ou populações. Neste estudo foram analisados polimorfismos do cromossoma Y, nomeadamente marcadores bialélicos ou SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms), caracterizados como um evento mutacional único. A análise destes polimorfismos permite a atribuição de linhagens, definindo assim os haplogrupos característicos de uma população. A informação resultante desta análise permite inferir quanto à origem de uma população, revelando ser essencial em estudos de genética populacional e de grande importância em genética forense. A grande vantagem destes marcadores bialélicos deve-se ao facto de resultarem em produtos de amplificação bastante reduzidos (50pb ou menos), revelando ser muito úteis na análise de amostras de ADN degradadas. Neste estudo foram utilizadas amostras de indivíduos não aparentados de uma população angolana de três diferentes etnias (Ovimbundo, Mbundu e Bakongo). Tendo em conta a origem geográfica da população, foi adoptada uma estratégia hierárquica para definir os haplogrupos das amostras (Karafet et al. 2008). As amostras foram extraídas segundo o método de Chelex® 100 (Walsh et al. 1991) e caracterizadas para o sistema Multiplex E (P2, M154, M293, M81, M85, M78, M35, M96, V6, M191, M33, M123, M2) (Gomes et al. 2010) pelo método de minisequenciação com o kit Snapshot, da Applied Biosystems. Foi ainda necessário recorrer a outros sistemas para caracterizar amostras que não se enquadravam no haplogrupo E (Multiplex 1 e Multiplex B) (Gomes et al. 2010; Brion et al. 2005). A detecção foi realizada no ABI PRISM ® 310 Genetic Analyzer. Após análise dos resultados observou-se que grande parte das amostras se enquadrava no haplogrupo E (E1b1a * (xE1b1a4, 7)), característico das populações do centro e da costa ocidental subsariana de África. Algumas amostras foram definidas para haplogrupo R, presente principalmente em populações europeias. Este facto poderá ser explicado como resultado de eventos demográficos, como a colonização africana por populações europeias. Este trabalho teve como objectivo caracterizar uma população de Angola, nomeadamente as três principais etnias, definindo os haplogrupos presentes nesta população, para posterior aplicação à genética forense.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais
Micropropagação de clones híbridos de Castanea sativa x C. crenata e C. sativa x C. mollissima para posterior estudos de resistência a Phytophthora cinamomi

Palavras-chave: Castanheiro,Enraizamento,Meios de cultura,Aclimatização

A Castanea sativa é uma espécie economicamente relevante para os países europeus, pela produção de madeira e fruto. No entanto a sua produção tem vindo a reduzir devido a suscetibilidade a determinados fungos. Medidas mitigadoras foram implementadas em 1945. Em 1957 iniciou-se o melhoramento genético através da hibridação com C. crenata. Em 2006 foram estabelecidos cruzamentos entre C. sativa x C. crenata e C. sativa x C. molíssima . O trabalho experimental desta tese teve como objetivo de micropropagação de 44 clones híbridos desses cruzamentos. Na fase de estabelecimento e multiplicação onde foram testados macronutrientes dos diferentes meios de cultura: Murashige&Skoog (MS); MS com macronutrientes reduzidos a metade (MS/2); Greshoff and Doy (GD); e Fossard (FS). Aos meios testados foram adicionados micronutrientes de Murashige and Skoog, vitaminas de Fossard e 0,087M de açúcar. Foi testada a adição de benzilaminopurina (BAP) nas concentrações: 0,45; 0,89 e 2,22 μM. No enraizamento e aclimatização testaram-se os seguintes métodos: 1) ex vitro – indução de enraizamento é por “Dipping”(imersão da base do rebento) (4,9 mM IBA; durante 15’’) em simultâneo com aclimatização; 2) in vitro two steps – indução de enraizamento in vitro em meio de cultura Knop (14,8 μM IBA; durante 7 dias), com posterior transferência para o mesmo meio base Knop adicionado CA 1% (durante 30 dias); 3) in vitro dipping – indução de enraizamento in vitro por “Dipping” (4,9 mM IBA; durante 15’’), com posterior transferência para o mesmo meio base Knop adicionado CA 1% (durante 30 dias). A aclimatização foi realizada em caixas de polietileno de plástico transparente contendo perlite. Após quatro semanas as plantas foram transferidas para vasos. Os melhores resultados observados durante a fase de estabelecimento foram obtidos com BAP 0,89μM. De 44 clones híbridos foram estabelecidos 30 clones. Os meios FS e MS/2 com BAP 0,45μM mostraram melhores resultados na fase de multiplicação. A formação de callus, vitrificação e clorose mostraram ser consequências do fator genótipo Clone. O enraizamento ex vitro em simultâneo com a aclimatização mostrou ser o mais eficaz dos procedimentos.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais
Biomarcadores em tumores das células germinativas

Palavras-chave: Tumores células germinativas,Anticorpos,Epitélio respiratório,Epitélio intestinal,Epiderme

Os TCG (tumores de células germinativas), tal como o nome indica, são originários de células germinativas primordiais, células que darão mais tarde origem aos espermatozoides nos homens e aos oócitos nas mulheres. As células germinais migram para as gónadas, mas podem ocorrer erros, e adquirirem localização extra-gonadal. A incidência de tumores de células germinativas está bem determinada, tanto no ovário como nos testículos, sendo a sua etiologia conhecida. No entanto, podem também ocorrer em localizações incorretas como é o caso do mediastino (corresponde ao espaço compreendido entre os dois pulmões, delimitado pela pleura mediastinal). O objetivo principal deste trabalho consistiu em estudar a morfologia destes tumores com recurso a imunohistoquímica, com diferentes e variados marcadores relacionados com a maturação e organogénese do embrião humano. Com a metodologia referida tentámos também estabelecer linhagens celulares no desenvolvimento tumoral, considerando as potencialidades das células durante o desenvolvimento embrionário dos seres Humanos. Como principais conclusões verificámos que o Oct3/4 (marcador de células pluripotentes) é diferente nos TCG seminomas e carcinomas embrionários (marcação nuclear no seminoma e nuclear e citoplasmática no carcinoma embrionário). A LP34 (citoqueratinas 5, 6 e 18), a Ck7 (citoqueratinas 7) e o TTF1 (marcador pulmonar) permitiram recapitular o desenvolvimento do aparelho respiratório, sabendo que há coincidência embrionária com o CDX2 considerando este marcador intestinal. E por fim, verificámos que o Nanog (marcador de células pluripotentes) só marca TCG muito indiferenciados, correspondendo assim a um marcador de células pluripotentes, o que nos permite pensar que a proteína Nanog se encontra expressa num estádio muito precoce do desenvolvimento embrionário dos indivíduos. O mesmo acontece com a vimentina que é expressa em TCG muito indiferenciados e deixa de ser expressa quando começa a organogénese. A vimentina é um marcador importante porque em tumores/carcinomas pouco diferenciados volta a estar expressa. O painel de anticorpos selecionado visou assim caracterizar a evolução de tecidos imaturos para tecidos maduros. Pudemos perceber a linhagem celular sob a qual diferentes tumores/carcinomas podem ser classificados, de acordo com os anticorpos específicos de células/tecidos adultos e/ou ainda através da marcação com anticorpos que caraterizam as células pluripotentes.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais
Ensinar biologia e geologia nos jardins e praças de Coimbra

Palavras-chave: Actividades de exterior,Modelo de Orion,rochas sedimentares,Sistemática dos seres vivos,trabalho de campo

O trabalho de campo é uma actividade de ensino realizada no exterior, decorrendo nos locais onde é possível aplicar e aprofundar os conhecimentos construídos na sala de aula. Embora as actividades de exterior sejam sugeridas nas orientações programáticas como estratégia a utilizar na disciplina de Biologia e Geologia, verifica-se que, frequentemente, os professores que leccionam a disciplina evitam realizá-las, apontando dificuldades organizacionais e logísticas como factores desmotivadores da sua implementação. Neste trabalho pretendeu-se avaliar a importância das actividades de exterior como estratégia facilitadora da aprendizagem de temas de Biologia e de Geologia. O estudo foi efectuado numa escola pública localizada junto ao centro histórico de uma cidade da região centro do país e participaram 35 alunos de duas turmas do 11º ano de escolaridade, do curso científico – humanístico de Ciências e Tecnologias. Durante a leccionação dos temas “Sistemática dos vivos” e “Rochas sedimentares” realizaram-se aulas de campo, planificadas com base num modelo construtivista. A avaliação do trabalho de campo fez-se com base em dados qualitativos obtidos a partir de diversos instrumentos de avaliação: testes diagnósticos e sumativos, cadernos de campo, grelhas de observação e questionários. Concluiu-se que as actividades de exterior implementadas contribuíram para uma leccionação mais dinâmica da sistemática dos seres vivos e das rochas sedimentares. Além disso, foram estratégias motivadoras para o estudo destes conteúdos, contribuindo também para o desenvolvimento de aprendizagens significativas e de atitudes positivas.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais