Avaliação do estado fitossanitário e correlação com caraterísticas fenológicas de Quercus spp. em ambiente urbano e periurbano

Palavras-chave: Atributos funcionais,BLAST,Extracção de DNA,LA,LDMC,PCR,Quercus,SLA,Variabilidade

Cada vez mais se torna evidente a importância das várias espécies do género Quercus existentes em Portugal, seja pelo seu papel ecológico enquanto espécies-chave nos ecossitemas como os montados, onde são essenciais para a preservação de espécies ameaçadas que dependem desses mesmos ecossitemas, seja pela sua importãncia cultural e económica enquanto fonte de matéria prima e produtos de exportação. As várias espécies de carvalho existentes em Portugal são atacadas por vários patógenos e pragas, desde insetos a microfungos que causam prejuízos importantes. O trabalho aqui desenvolvido visou identificar as espécies de carvalho amostradas e avaliar alguns dos seus atributos funcionais, bem como caracterizar a variabilidade de microfungos presente na porção aérea das mesmas, identificando possíveis patógenos do género Quercus na zona urbana e periurbana da cidade de Coimbra. Nesta área, foram selecionadas 8 zonas representativas (4 urbanas e 4 periurbanas) onde foram feitas as amostragens para o estudo. Em cada zona foram selecionados aleatoriamente 5 espécimes cuja posição foi georeferenciada e de cada um foi feita uma colheita de material vegetal da porção aérea, incluindo folhas, ramos e casca. Do material recolhido, foram seleccionadas aleatoriamente 50 folhas por espécime para análise de cada atributo funcional, nomeadamente área foliar (Leaf Area - LA), área foliar específica (Specific Leaf Area - SLA) e conteúdo foliar de massa seca (Leaf Dry-Matter Content - LDMC). A análise do LDMC foi feita realizando pesagens de cada uma das 50 folhas, logo após a colheita e após secagem ao ar. A análise de LA foi feita utilizando um scanner digital e o software open source ImageJ, sendo depois o valor utilizado para calcular SLA. Os dados recollhidos foram depois tratados estatisticamente por espécime e por zona. A identificação das espécies amostradas foi feita utilizando uma chave dicotómica. Para avaliar a variabilidade de microfungos, foram recolhidos, do material vegetal amostrado, pequenos fragmentos de folhas, ramos e casca. Estes foram submetidos a uma esterilização superficial com hipoclorito de sódio a 2% tendo sido posteriormente inoculados em PDA (Potato Dextrose Agar) e incubados a 25ºC durante 5 dias. As culturas resultantes foram repicadas para PDA e incubadas a 25ºC até estarem completamente desenvolvidas. Para se proceder à identificação das espécies de microfungos, foi extraído o DNA de cada colónia pura tendo este sido depois amplificado por PCR (Polimerase Chain Reaction) utilizando primersespecíficos para fungos para a região ITS. A verificação do sucesso de cada amplificação foi feita através de uma eletroforese em gel de agarose. Os produtos de PCR foram depois sequenciados. Com as sequências obtidas foram realizados BLASTs em bases de dados online. Foram isoladas, e sequenciadas 109 amostras da região ITS que resultaram em 52 espécies de microfungos no total, 42 presentes na zona urbana e 37 presentes na zona periurbana de Coimbra. Destas 52 espécies, foram identificados 3 patógenos conhecidos do género Quercus, os microfungos Amphiporthe leiphaemia, responsável pela doença conhecida como antracnose dos carvalhos, Biscogniauxia mediterranea, responsável pela doença conhecida como carvão do entrecasco e Tubakia dryina, responsável pela doença conhecida como oak-leaf spot. Foram também encontrados outros patógenos vegetais que não afetam diretamente o género. Toda a informação recolhida neste trabalho vai ser utilizada para criar uma base de informação no software open source Quantum GIS completa com georeferenciação das zonas e indivíduos amostrados.

Área científica: Ciências Exactas e Naturais