NCube/papyrus huggingface dataset:
Relation entre la phosphorylation de Tau et la fragmentation de l'appareil de Golgi

Dans la maladie d’Alzheimer (MA), il y a deux lésions neuropathologiques majeures, les plaques séniles composées du peptide amyloïde-bêta et les enchevêtrements neurofibrillaires formés de la protéine Tau hyperphosphorylée et agrégée. L’une des caractéristiques cellulaires de la MA est la fragmentation de l’appareil de Golgi (AG). Cette fragmentation est observée tôt dans la MA, et peut être induite par le peptide amyloïde-bêta extracellulaire. Cependant, plusieurs études laissent croire que la protéine Tau hyperphosphorylée pourrait également contribuer à la fragmentation de l’AG. Nous avons donc examiné si la Tau hyperphosphorylée pouvait induire une fragmentation de l’AG lors de sa surexpression dans les cellules HeLa. Nos résultats montrent que la surexpression d’une forme hyperphosphorylée de Tau induit plus rapidement une fragmentation Golgienne qu’une forme non-phosphorylable de Tau. La protéine Tau peut être sécrétée dans l’espace extracellulaire, la tau hyperphosphorylée étant la forme de tau la plus sécrétée. Nous avons donc examiné la capacité de la protéine Tau extracellulaire à pouvoir induire une fragmentation Golgienne. La Tau hyperphosphorylée extracellulaire a été la seule forme de Tau à induire une fragmentation de l’AG. Nous nous sommes ensuite demandés si ce phénomène était du à la plus importante phosphorylation de cette forme de Tau ou bien à sa plus grande quantité dans le milieu extracellulaire. Nos expériences de dilution du milieu ont permis de démontrer une relation dose-dépendante entre la quantité de Tau hyperphosphorylée extracellulaire et la fragmentation Golgienne. Ensuite nous avons tenté d’identifier le domaine de Tau impliqué dans cette fragmentation. Nos résultats ont révélé que la séquence de Tau inductrice de la fragmentation Golgienne se trouve dans sa partie C-terminale qui contient les séquences répétées impliquées dans sa liaison avec les microtubules (MTBD). Toutefois, nos résultats indiquent que l’effet de Tau sur l’AG ne fait pas intervenir de modification microtubulaire, ce qui nous laisse à croire que la Tau intracellulaire n’est pas responsable de la fragmentation Golgienne. Finalement, nous avons vérifié si l’AG demeurait fonctionnel suite à la surexpression de Tau en examinant le transport de la protéine VSVG. Nos expériences indiquent que la surexpression de Tau n’affecte pas le transport de VSVG. En conclusion, nous avons démontré que la Tau extracellulaire peut induire une fragmentation de l’AG. Cependant, le lien entre ces deux évènements demeure inconnu. Sachant que la fragmentation de l’AG peut affecter le fonctionnement neuronal, la Tau extracellulaire pourrait devenir une cible thérapeutique pour la MA.

Keyphrases: Alzheimer, Golgi, fragmentation, Tau extracellulaire
Modulation dopaminergique dans le système olfactif

Une voie neuronale sous-tendant la locomotion induite par la détection d’odorants a été découverte chez la lamproie (Derjean et al., 2010). Le signal olfactif est relayé du bulbe olfactif médian au tubercule postérieur, puis à la région locomotrice mésencéphalique et enfin aux cellules réticulospinales qui activent les réseaux locomoteurs spinaux. Des études récentes démontrent que le bulbe olfactif médian est sous l’influence d’une inhibition GABAergique tonique qui régule les réponses des cellules réticulospinales à la stimulation du nerf olfactif (Daghfous et al., 2013). Des mécanismes de modulation supplémentaires pourraient exister dans le bulbe olfactif de Petromyzon marinus puisqu’il contient aussi des fibres dopaminergiques. Chez tous les vertébrés étudiés, la dopamine joue un rôle important dans le traitement olfactif. Des techniques anatomiques (traçage et immunofluorescence) et physiologiques (enregistrements intracellulaires) ont été utilisées pour étudier la  modulation dopaminergique de la voie olfacto-motrice. L’immunofluorescence ciblant la dopamine a révélé des fibres plus nombreuses dans la partie médiane du BO et à proximité de neurones de projection et de fibres olfactives. De plus, aucun corps cellulaire immunopositif n’a été détecté dans le bulbe olfactif. L’enregistrement des réponses synaptiques des cellules réticulospinales à la stimulation du nerf olfactif a été réalisé dans le cerveau isolé in vitro. L’injection locale de dopamine dans le bulbe olfactif médian diminue de moitié l’amplitude de réponse. Sous l’effet d’un antagoniste des récepteurs GABAA dans le bain ou localement dans le bulbe olfactif médian, les dépolarisations soutenues enregistrées sont supprimées par l’injection de dopamine. Cependant, l’injection individuelle ou combinée dans le bulbe olfactif médian d’antagonistes sélectifs des récepteurs D1 ou D2, soit le SCH 23390 et l’éticlopride, demeure sans effet significatif sur les réponses olfacto-motrices, indiquant l’absence d’activité dopaminergique tonique. Pour localiser les neurones responsables de cette modulation, des injections de traceur axonal ont été combinées avec l’immunofluorescence ciblant la dopamine. Des cellules dopaminergiques projetant au BO médian ont été observées dans les noyaux dopaminergiques du tubercule postérieur et de l’hypothalamus périventriculaire. Dans l’ensemble, nos résultats montrent anatomiquement et physiologiquement la présence d’une innervation dopaminergique dans le bulbe olfactif médian qui a une action inhibitrice sur le traitement olfacto-moteur.

Keyphrases: Couplage sensori-moteur, Bulbe olfactif, Dopamine, Nerf olfactif, Neurones de projection, Tubercule postérieur, Cellules réticulospinales, Neuroanatomie, Électrophysiologie
PKB mediates Insulin-Like Growth Factor 1-induced phosphorylation and nuclear export of Histone Deacetylase 5 via NADPH Oxidase 4 activation in vascular smooth muscle cells

L’Insulin-like growth factor-1 (IGF-1) est un peptide vasoconstricteur qui joue un rôle proéminent dans la progression des maladies cardiovasculaires, grâce à la génération d'espèces réactives de l'oxygène (ERO), ainsi que par l'hyperactivation des voies de signalisation qui promeuvent la croissance et l'expression aberrante des gènes. Les histones désacétylases (HDACs), par leur aptitude à modifier le statut d'acétylation des résidus lysine dans les protéines d'histones et non-histones, régulent la transcription des gènes. Des études récentes ont montré qu'une activation accrue des HDACs, notamment HDAC5, est associée à des troubles vasculaires tels que l'athérosclérose. Cependant, le rôle de l'IGF-1 dans l'activation des HDACs par phosphorylation demeure mal caractérisé. Donc, dans les études présentes, on a examiné l’effet de l’IGF-1 sur la phosphorylation de HDAC5 dans les cellules musculaires lisses vasculaires (CMLV) de type A10 et on a identifié les voies de signalisation impliquées dans ce processus. Le traitement des CMLV avec l’IGF-1 a augmenté la phosphorylation de HDAC5 sur la serine 498 de manière temps- et dose-dépendante. La pré-incubation des cellules avec l’AG1024, un inhibiteur pharmacologique du récepteur membranaire à l’IGF-1, a significativement atténué la phosphorylation d’HDAC5 induite par l'IGF-1. Par contre, le prétraitement avec l’AG1478, un inhibiteur du récepteur du facteur de croissance épidermique, n'a pas eu d'effet significatif sur les niveaux de phosphorylation d’HDAC5. En outre, le blocage pharmacologique de la voie MAP kinase avec divers inhibiteurs (PD98059, UO126, SP600125 et SB203580) n’a pas abrogé la phosphorylation d’HDAC5, cependant les inhibiteurs de la voie protéine kinase B (PKB)/PI3-K, SC-66 et wortmannine respectivement, ont complètement aboli la phosphorylation d’HDAC5 induite par l’IGF-1. Ces données ont été confirmées par des expériences d’immunofluorescence et de silençage génique de PKB par interférence d’ARN. En outre, le prétraitement des cellules avec le diphénylèneiodonium (DPI) et l’apocynine, deux inhibiteurs de la NAD(P)H oxydase, ainsi que l'antioxydant N-acétyl-cystéine (NAC), a atténué la phosphorylation de HDAC5 et de PKB par l’IGF-1. De plus, le silençage génique de Nox4, la principale NAD(P)H oxydase des CMLV, a atténué la phosphorylation d’HDAC5 induite par l’IGF-1. De plus, l’utilisation des techniques d’extraction nucléaire a indiqué que le SC-66 et le DPI inhibent l’exportation nucléaire de HDAC5 induit par IGF-1. En résumé, ces données suggèrent que l'IGF-1 induit la phosphorylation et l’exportation nucléaire de HDAC5 de façon ERO et PKB-dépendante dans les CMLV.

Keyphrases: IGF-1, HDAC5, PKB, PI3-K, ROS, ERO, CMLV
Analyse de l’impact de la radiothérapie sur l’ultrastructure des capsules périprothétiques en reconstruction mammaire

Avec près de 25 000 cas en 2015, le cancer du sein est de loin le cancer le plus fréquent chez les femmes canadiennes. En termes de mortalité, le cancer du sein se place au deuxième rang (13,8%), derrière le cancer du poumon (26,5%). Suite au diagnostic, 70% des femmes avec un cancer de stade avancé et 30% des femmes avec cancer précoce choisiront de subir une mastectomie totale. Plusieurs options de reconstructions mammaires sont ensuite offertes. Plus de 70% des reconstructions se feront par la mise en place d’implants mammaires (plutôt que par reconstruction autologue utilisant les tissus de la patiente). Parmi les complications survenant après cette intervention, la contracture capsulaire en est une des plus fréquente. La contracture capsulaire se définit comme la contraction anormale de la capsule fibreuse se formant autour des implants mammaires, pouvant causer des douleurs en plus d’un mauvais résultat sur le plan esthétique. Les études cliniques ont démontré un risque accru de développer une contracture capsulaire chez les femmes ayant du suivre un protocole de radiothérapie. Si plusieurs études ont cherché à démontré l’influence des radiations sur l’histologie et l’immunologie du tissu capsulaire, aucune étude ne s’était intéressée à leur effet sur l’ultrastructure capsulaire. Notre équipe a récemment démontré que l’ultrastructure capsulaire dépendait de plusieurs facteurs, notamment de la texture prothétique et du délai de reconstruction. L’objectif de ce mémoire était de décrire l’impact de la radiothérapie sur l’ultrastructure capsulaire en comparant des capsules irradiées et non-irradiées en utilisant la microscopie éléctronique à balayage. Nous avons observé, chez les échantillons issus de capsules irradiés, une perte de relief au niveau de l’interface prothèse-capsule par rapport au échantillons non irradiés. Nous avons aussi démontré que cette caractéristique ultrastructurale est associée à la présence de contracture capsulaire. Enfin, ces effets néfastes de la radiothérapie semblent altérer la capacité de la capsule à adhérer à la prothèse mammaire. En conclusion, mon projet de maîtrise aura permis de décrire pour la première fois l’impact de la radiothérapie sur l’ultrastructure des capsules périprothétiques. Bien que nos résultats ne nous permettent pas d’expliquer de façon certaine le lien potentiel avec l’évolution vers un état de contracture capsulaire, ils laissent croire que cela serait associé avec un diminution de la stabilité de la capsule sur son implant, facteur auparavant évoqué comme ayant une rôle protecteur sur la contracture capsulaire.

Keyphrases: Cancer du sein, Prothèses mammaires, Reconstruction mammaire par implant, Capsules périprothétiques, Contracture capsulaire, Radiothérapie, Ultrastructure capsulaire, Microscopie électronique à balayage
Effets cardiométaboliques de la restriction calorique seule ou en combinaison avec l’activité physique dans le diabète de type 2

Le diabète de type 2 (DbT2) est une maladie chronique caractérisée par des taux sanguins élevés de glucose pouvant engendrer de multiples complications, sources de morbidité et mortalité importantes. De façon alarmante, la prévalence mondiale est en augmentation due en grande partie au vieillissement de la population et à l’adoption d’habitudes de vie (HDV) malsaines. La sédentarité et la mauvaise qualité alimentaire sont à la base d’une épidémie d’obésité qui joue un rôle crucial dans la pathogénèse du DbT2. La modification des HDV en visant une balance calorique négative demeure un traitement primordial dans la prise en charge de cette maladie. Toutefois, il persiste un doute par rapport à la thérapie à privilégier entre une restriction calorique (RC) ou une combinaison d’une thérapie à base de RC et d’activité physique (AP), afin de favoriser une perte de masse grasse et de gras épicardique. Ce dernier représente le gras viscéral du cœur et est un marqueur émergent qui pourrait aider dans la stratification du risque cardiovasculaire. Le but général de ce mémoire est de caractériser les effets indépendants de la RC et de l’AP sur le gras total, le gras épicardique et le profil cardiométabolique des personnes atteintes de DbT2. Pour ce faire, une étude randomisée contrôlée de 16 semaines fut menée avec 73 patients répartis en 3 groupes de randomisation (Contrôle, RC, RC+AP) en visant un déficit calorique similaire dans les 2 groupes d’intervention. Les résultats ont démontré que la combinaison RC+AP favorise une réduction plus significative de la masse grasse totale et de l’épaisseur du gras épicardique. Toutefois, il n’y a pas eu d’amélioration additionnelle du profil cardiométabolique. Ces résultats doivent maintenant être validés dans de plus grosses études.

Keyphrases: Diabète de type 2, Restriction calorique, Activité physique, Masse grasse totale, Épaisseur du gras épicardique, Profil cardiométabolique
Utilisation de lymphocytes T en thérapie cellulaire pour le traitement de la néphropathie au polyomavirus BK chez les greffés rénaux

Le polyomavirus BK est un virus très prévalent qui demeure normalement en phase de latence dans l’uroépithélium sans entrainer de complications. Chez les greffés rénaux, il peut cependant se réactiver et mener à une néphropathie pouvant nuire à la survie du greffon. L’immunité du receveur est la pierre angulaire de la prévention et du traitement de cette néphropathie, puisque le seul traitement démontré efficace est une diminution de l’immunosuppression. Cependant, une augmentation non spécifique de l’immunité augmente également le risque de rejet. Notre objectif était donc d’adapter et de valider un protocole transférable en clinique d’immunothérapie adoptive antivirale nous permettant de produire des lignées de lymphocytes T BKvirus spécifiques à partir du sang de patients greffés virémiques, afin de prévenir et traiter ces néphropathies. Nous avons tout d’abord comparé les lignées cellulaires produites à partir de donneurs sains à celles de patients immunosupprimés soumis à une immunosuppression chronique. Par la suite, nous avons adapté le protocole en ajoutant une stimulation à l’aide de cellules dendritiques afin de maximiser l’expansion cellulaire, le statut de différentiation et la spécificité. Bien que les lignées étaient polyclonales, elles n’ont pas démontré de potentiel alloréactif in vivo et in vitro, et ce, malgré une persistance et une prolifération in vivo. Nous avons donc élaboré un protocole qui est prêt à être transféré en étude clinique de phase I/II et qui pourrait nous permettre de prévenir et traiter la néphropathie associée au polyomavirus BK, sans augmenter le risque de rejet.

Keyphrases: transplantation rénale, immunothérapie, thérapie cellulaire, néphropathie associée au polyomavirus
Implantation du processus de soins en nutrition

Problématique : Au Québec, le Processus de soins en nutrition (PSN) est peu utilisé, les organisations appréhendent que l’implantation sera ardue mais sont motivées à procéder.  Objectif : Accompagner deux services de nutrition clinique d’établissements de santé de la grande région de Montréal dans le déploiement du PSN et documenter les barrières et facteurs facilitants. Méthodologie : L’Hôpital du Sacré-Cœur de Montréal et le CSSS Champlain–Charles-Le Moyne ont été recrutés. La collecte de données fut réalisée via des séances d’accompagnement tout au long du déploiement du PSN. Une rencontre de bilan fut effectuée dans chaque milieu, avec les nutritionnistes et les chefs de service. Les données colligées sont qualitatives. Les échanges furent enregistrés et un cahier de bord complété. La synthèse a été rédigée selon un modèle de gestion de changement. Résultats : Au total, 18 séances d’accompagnement eurent lieu et cinq rencontres de bilan. Les principaux obstacles à la mise en œuvre du PSN sont en grande partie liés à l'engagement des nutritionnistes, à la formation et aux contraintes de temps. Les principaux facteurs facilitants sont les présentations d’histoires de cas accompagnées de discussion et le manuel de la Terminologie internationale de diététique et de nutrition (TIDN).  Discussion : Notre système de santé est de plus en plus sujet à des changements et les dirigeants devront optimiser les ressources.  L’International Confederation of Dietetic Associations a suggéré d’adopter, à l’échelle internationale, le PSN en tant que cadre pour la profession. Les stratégies d’implantation portant sur des principes de gestion du changement organisationnel faciliteront l’intégration de ces changements importants. L’expérience des deux milieux documentés sera éclairante pour les autres organisations désirant implanter le PSN.

Keyphrases: Processus de soins en nutrition, Terminologie du processus de soins en nutrition, Implantation, Modèle de gestion de changement, Barrière et facteur facilitant, Optimisation des ressources, Pratique professionnelle
Fragmentation et stagnation : enjeux de mobilisation du mouvement LGBTIQ aux Philippines

Le présent mémoire s’intéresse au développement du mouvement social Lesbien, Gai, Bisexuel, Trans, Intersex et Queer (LGBTIQ) depuis la chute de la dictature de Ferdinand Marcos en 1986 jusqu’à aujourd’hui. À partir de 1990, le mouvement est caractérisé par un développement rapide. Il était parmi les premiers en Asie du Sud-est à organiser une marche de la fierté et à créer un parti politique LGBTIQ. Toutefois, malgré le dynamisme inhérent à ce mouvement, les communautés LGBTIQ sont toujours discriminées sur le marché du travail, à l’université ou encore dans le système de santé. De plus, elles sont toujours les victimes de violence et de meurtre commis sur la base de leur orientation sexuelle ou de leur genre. Actuellement, le mouvement LGBTIQ n’a toujours pas été en mesure d’obtenir des gains politiques afin de mieux protéger les droits et la sécurité de ces communautés. Même si ce problème pourrait être attribué au conservatisme de l’élite politique ou encore à l’influence du Catholicisme et de l’homophobie dans la société philippine, l’argumentation de ce mémoire propose plutôt que la fragmentation et le manque de cohérence au sein du mouvement ont compliqué la formulation et l’adoption de politiques pouvant régler ces enjeux. Mon analyse du mouvement pendant les 30 dernières années identifie quatre conflits internes majeurs expliquant ce problème 1. la définition de l’identité collective 2. le cadrage utilisé afin de conceptualiser cet enjeu 3. les différentes idéologies structurant l’action des militant.es et 4. les divergences par rapport aux modes d’organisation et aux stratégies employées. Ainsi, ce mémoire tourne l’attention vers ces conflits internes plutôt que vers les facteurs exogènes. Mon argumentation est basée sur 17 entrevues semi-dirigées réalisées à Manille avec des militant.es du mouvement, de mai à octobre 2015. Dans les deux premiers chapitres de ce mémoire, j’analyse la littérature portant sur la théorie des mouvements sociaux en général pour ensuite aborder la littérature traitant précisément sur les Philippines et l’Asie du Sud-est. Cette revue servira de base théorique afin de comprendre les quatre facteurs identifiés ainsi que leur rôle dans la fragmentation du mouvement. Dans le quatrième chapitre, j’analyse la fragmentation du mouvement selon les échelles d’action des militant.es, leurs cibles ainsi que leur trajectoire de mobilisation. Dans le cinquième chapitre, j’explique cette fragmentation à l’aide des quatre facteurs identifiés dans la littérature.

Keyphrases: Mouvements sociaux, LGBTIQ, Identité collective, Cadrage, Idéologies, Modes organisationnels, Stratégies
L’influence de mitochondries exogènes : changements phénotypiques chez Chrosomus eos

Les interactions mito-nucléaire sont au centre des fonctions de la mitochondrie, telles que la production d’énergie. Or, peu d’informations sont connues sur comment le génome mitochondrial peut influencer la réponse nucléaire. Les cybrides (hybrides cytoplasmiques) peuvent présenter des modifications phénotypiques (adaptatives ou non) dûe à ces interactions. Dans cette étude, les différents mitotypes (haplotype mitochondriale) de l'espèce Chrosomus eos furent utilisés comme modèle afin d’étudier plus en profondeur les interactions entre les différents génomes d’une cellule. Ce complexe présente en plus du type sauvage, deux types de cybrides, dont les mitochondries proviennent de deux refuges glaciaires différents : Mississippien et Atlantique. Cette étude fut effectuée sur des individus en sympatrie afin de prendre en compte l’influence environnementale. Des populations en allopatrie furent également mesurés séparément afin de complémenter les études précédentes. Afin de répondre à ces objectifs, plusieurs approches furent employées, adressant ainsi divers niveaux d’intégration : la méthylation, la transcription, la protéomique et l’activité enzymatique. Des différences entre les divers mitotypes furent observées, mais de magnitude inférieure à l’influence environnementale. Ce résultat suggère donc que les différences associées au mitotype en sympatrie affecte leur répartition et leur habileté à coloniser différents types d’environnements, créant ainsi la similarité intra-mitotype inter-lac observé dans les études précédentes. Pour adresser l’analyse transcriptomique, une référence a été produite. Cette référence offre beaucoup d’informations pour des applications futures.

Keyphrases: Transcriptomique, Cybride, Chrosomus eos, méthylome, protéome, Enzymatique, Cybrid, proteome
Socrate et la conciliation ergon-logos dans les Mémorables de Xénophon

Cette étude propose un commentaire thématique des Mémorables de Xénophon prenant comme fil conducteur la conciliation ergon-logos. En relevant les manifestations nombreuses et variées de ce thème, en les regroupant thématiquement et en les analysant, on peut apprécier dans quelle mesure la conciliation ergon-logos est centrale dans la philosophie socratique de Xénophon.  Le premier chapitre considère la place de la conciliation ergon-logos dans l’intention globale des Mémorables – qui est fixée sur le motif apologétique de l’utilité de Socrate –, tout en soulevant un enjeu philosophique de taille concernant les limites du logos, enjeu qui permet de renforcer d’autant plus l’intérêt et l’importance philosophique de la conciliation ergon-logos.  Le second chapitre examine à quel point la conciliation ergon-logos est impliquée dans la morale socratique de Xénophon, non seulement parce que Socrate lui-même incarne de façon exemplaire les principales vertus en acte et en parole, mais aussi parce que la conception morale de Xénophon est à la fois intellectualiste et ascétique, impliquant, d’un côté, l’apprentissage et la connaissance, et de l’autre, la maîtrise de soi, l’exercice, la fréquentation d’un maître et la vertu de l’exemple.  Le troisième chapitre explore le rôle de la conciliation ergon-logos à titre de condition de l’amitié, d’une part en tant qu’exigence éthique, d’autre part en tant que moyen pour se faire des amis. Enfin, le dernier chapitre montre au moyen de la notion d’imposture que les principes de la morale socratique de Xénophon s’étendent aussi au domaine technique.

Keyphrases: Socrate, Xénophon, Mémorables, Ergon-logos, Actes et paroles, Philosophie socratique, Ascétisme, Amitié, Compétence technique, Imposture, Ergon-logos, Imposture