NCube/papyrus huggingface dataset:
Détection et caractérisation de nanoparticules d’oxyde de zinc par spectrométrie de masse à plasma inductif en mode particule unique (single-particle ICPMS)

Les nanoparticules d’oxyde de zinc (ZnO NP) sont parmi les plus utilisées en industrie. Leur production croissante dans divers secteurs comme les cosmétiques et l’agriculture mène inévitablement à une augmentation de leur présence dans l’environnement, alors que leur risque écologique et leur persistance y sont méconnus. Cette problématique est en partie causée par les faibles concentrations auxquelles elles s’y trouvent, souvent inférieures aux limites de détection des méthodes analytiques classiques. Ainsi, le développement d’une méthode sensible et sélective, telle que la spectrométrie de masse à plasma inductif en mode particule unique (SP-ICPMS), est nécessaire. En permettant la détection une à une de particules métalliques à des concentrations de l’ordre des ng L-1, la SP-ICPMS est prometteuse pour la caractérisation des nanomatériaux (NM) métalliques en milieu aqueux. Toutefois, son utilisation est limitée pour les métaux qui, comme le zinc, se dissolvent rapidement, ou dont la concentration ionique est grande en solution car la limite de détection en taille est alors plus élevée. Lors de ces travaux, une résine échangeuse d’ions a été couplée avec la SP-ICPMS afin de retirer les Zn2+ et ses complexes labiles présents en solution avant l’analyse des suspensions de ZnO NP. Cette technique a été adaptée avec succès sur un instrument ICPMS de grande sensibilité, permettant de diminuer la limite de détection en taille de ZnO NP de 32 à 8,2 nm dans l’eau déionisée. Pour tester la méthode en milieu naturel, des ZnO NP ont été ajoutées à une eau de rivière et leur distribution de taille ainsi que leur concentration ont été analysées. Après 24 h, les particules ajoutées étaient plus stables dans l’eau de rivière qu’elles ne l’étaient dans l’eau déionisée, probablement en raison de son pH plus élevé. De même, la méthode développée a permis l’analyse de colloïdes naturels contenant du zinc et du cuivre dans une eau de rivière et dans une eau de pluie. La stabilité des particules dans ce milieu a par ailleurs été suivie pendant un mois, durant lequel le contenu métallique de ces particules ne s’est que légèrement dissous.

Keyphrases: Spectrométrie de masse à plasma inductif en mode particule unique, Nanoparticules, Oxyde de zinc, Eaux naturelles
Luminogènes-AIE à base de ligands hydroxyamidines : synthèse, caractérisation et application comme pigments pour dispositifs

Les dispositifs OLED (organic light-emitting diode) sont capables de la transduction efficace de l’énergie électrique en lumière; par leur flexibilité, leur légèreté et leur très haute qualité de couleurs elles sont aussi d’intérêt pour l’affichage sophistiqué sur écran plat. Cependant, l'emploi de cette technologie se voit ralenti par le cout élevé des matériaux et des méthodes de fabrication utilisés. Le but de cette recherche est de trouver des pigments pour OLED moins dispendieux tout aussi efficaces qui pourraient en même temps faciliter les méthodes de fabrication des dispositifs. Dans ce projet, on a développé une nouvelle série des ligands benzamidine-N-oxyde (AMOX) bidentés de type N,O capables d’émission induite par agrégation moléculaire (AIE) lorsque complexés à un centre cationique. L’AIE permet aux molécules non-émissives en solution de devenir intensément luminescentes à l’état solide. Les matériaux luminogènes AIE représentent une catégorie de pigments d’intérêt pour les dispositifs OLED puisque ces derniers fonctionnent selon le principe d’émission à l’état solide. Les propriétés AIE sont déclenchées par la rigidité accrue du cœur O-N-C=N du ligand avec la formation des complexes. La chimie de coordination nous permet d’utiliser les ligands et les centres métalliques comme des blocs de construction pour obtenir des complexes AIE avec des caractéristiques structurelles et photo-physiques très intéressantes. On additionne à cela la facile modulation des facteurs électroniques et stériques des complexes à base des ligands AMOX par la modification structurelle des ligands avec l’ajout des substituants. Exploiter cette propriété permettrait de varier la couleur d’émission des pigments. Finalement, en utilisant des centres cationiques à partir d’éléments abondants et peu toxiques les coûts de production et l’impact environnementale peuvent être réduits ouvrant ainsi la porte à la commercialisation d’une technologie durable et rentable.

Keyphrases: Chimie de coordination, Ligands, N,O-donneurs, Amidine N-oxyde, Benzamidine N-oxyde, Substituants, Isomérie, Interactions électrostatiques, Émission à l’état solide, Morphologie, Émission induite par agrégation moléculaire, AIE, CIEE, Mécanochromisme, Vapochromisme, Thermochromisme, OLED
Évolution des pratiques du sevrage à Montréal (XVIIe – XIXe siècles) : analyse isotopique des concentrations en azote 15 par micro-échantillonnage de la dentine

Le sevrage correspond au moment où la contribution du lait maternel diminue relativement de l’alimentation totale de l’enfant par rapport à une augmentation d’autres aliments. Les choix concernant l’arrêt de l’allaitement peuvent refléter une large variété de conditions socio-économiques. Dans le cadre de cette recherche paléochimique, nous examinons les différences et similarités dans les pratiques du sevrage (présence ou absence d’allaitement, âge au sevrage, alimentation post-sevrage) de deux populations coloniales situées sur l’île de Montréal : Pointe-aux-Trembles (N=17) et Notre-Dame (N=29). L’étude de ces deux cimetières, le premier rural et le deuxième urbain, a permis de comparer les pratiques du sevrage en fonction de ces milieux de vie différents. Elle a été réalisée sur des individus ayant survécu et des individus décédés durant l’enfance, ce qui permet d’évaluer les effets du stress du sevrage (allaitement trop court, alimentation post-sevrage inadéquate). Des micro-prélèvements de la dentine et les analyses isotopiques de l’azote permettent d’observer l’enrichissement trophique entre la mère et l’enfant à l’échelle individuelle. Un âge moyen au sevrage autour de 18-24 mois a été déterminé pour les deux groupes rassemblés. Toutefois, la population de Pointe-aux-Trembles sevrait leurs enfants plus tôt (avant 12 mois) qu’à Notre-Dame (entre 18 et 24 mois), voire n’allaitait pas du tout. En effet, à la campagne, les mères donnaient probablement de la nourriture post-sevrage dès les premiers mois de la vie. Selon les données historiques, elles étaient employées comme nourrice pour allaiter les enfants de la ville et cela pourrait expliquer ces résultats. Aucune différence entre les sexes concernant l’âge au sevrage n’a été observée, mais l’alimentation post-sevrage semble être plus protéinée chez les garçons que chez les filles. Un sevrage plus précoce (avant douze mois) ou une absence d’allaitement (N=19) pourrait aussi refléter une diversité de pratiques propres aux individus et/ou communautés autochtones et colons, qui ont peuplé l’île de Montréal.

Keyphrases: Sevrage, Bioarchéologie, Montréal, Azote, Micro-prélèvement, Mise en nourrice
« On n’est pas devenus sādhu, on était faits sādhu » : Saṃskāra et espace de légitimité chez les ascètes occidentaux en Inde

Le présent mémoire propose une réflexion quant à la construction de l’identité religieuse des ascètes occidentaux en Inde. Basé sur une enquête de terrain, il expose l’aspect transformationnel de la construction de soi de mes répondants pour ensuite examiner la négociation de cette nouvelle identité religieuse dans l’interaction. Plus largement, cette recherche offre des avenues pertinentes pour penser les mobilités religieuses contemporaines et le phénomène de conversion.  Un ascète occidental m’a confié sur le terrain : « On n’est pas devenus sādhu, on était faits sādhu. »  Il faisait alors référence à ses saṃskāra, soit les traces issues de ses vies antérieures, comme élément fondateur de son parcours. Cette affirmation reflète précisément l’orientation de la présente recherche qui insiste sur la perspective et la subjectivité des acteurs en tenant compte leur lecture de leur trajectoire religieuse et leur propre vision de l’ascétisme hindou. Je souhaite en effet combiner la pertinence de la tradition anthropologique qui insiste sur l’analyse des dynamiques sociales et culturelles à une perspective phénoménologique, soit une analyse de l’expérience religieuse telle que perçue par les sujets étudiés.  Dans les paramètres de cette recherche, je chercherai à appréhender comment mes répondants vivent et négocient la recomposition de leur système de sens (Mary & Piault 1998; 8) en analysant la formation de l’identité religieuse individuelle et collective. Parce qu’un affranchissement total des repères initiaux est peu probable, la construction identitaire des ascètes occidentaux se doit d’être comprise en tant que processus incessant d’hybridation (Bhabha & Rutherford 2006). Mes répondants cherchent à négocier et à légitimer cette identité hybride à l’intersection d’espaces culturels en apparente contradiction : modernité occidentale et ascétisme hindou. Référant d’abord à la notion de saṃskāra pour justifier et interpréter leurs choix, ils cherchent ensuite à valider leurs pratiques ascétiques dans l’interaction avec les pairs. Délimitant des catégories d’inclusion et d’exclusion, les ascètes occidentaux établissent un cadre autoréférentiel de reconnaissance qui s’appuie sur leur perception d’un ascète « authentique. » Un espace de légitimité est donc formé, leur permettant de se mouvoir dans l’univers ascétique hindou et d’aspirer à l’atteinte de la mokşa.

Keyphrases: ascétisme hindou, conversion, négociation identitaire, hybridité, phénoménologie, interaction
Évaluation du lien entre la caudophagie et le microbiote intestinal chez le porc

La caudophagie chez le porc est un comportement qui se définit comme étant le mordillage de la queue entre congénères. Ce désordre comportemental représente un énorme défi dans la production porcine, car il engendre des pertes économiques considérables et affecte lourdement le bien-être animal. Il y a actuellement certaines solutions qui sont mises en place pour atténuer le phénomène, comme par exemple l’enrichissement du milieu ou la caudectomie, mais ces solutions ne sont pas optimales ou présentent des enjeux importants quant au bien-être animal. L’alimentation a aussi un impact sur la caudophagie et elle pourrait être liée au microbiote intestinal. Chez l’humain, le microbiote intestinal pourrait être un modulateur du comportement à travers une action qui passe par l'axe microbiote intestinal-cerveau. Le but de cette étude était d’évaluer le lien entre la caudophagie et le microbiote intestinal chez le porc. Le microbiote intestinal de porcs mordeurs et de porcs mordus a été comparé à celui de porcs-contrôle négatifs (ni mordeurs, ni mordus). Les différents groupes de porcs (n= 36 au total) ont été sélectionnés au début de l’engraissement par l’analyse d’un comportement cible centré sur le mordillage de la queue (groupe mordeur) et une grille de notation de dommages pour la queue (groupe mordu). Des échantillons composites de matières fécales ont été prélevés au début et à la fin d’un épisode de caudophagie dans un élevage commercial adapté pour y effectuer des recherches terrains. L’hormone de stress (cortisol) a aussi été dosée en utilisant un test ELISA réalisé à partir d’échantillons sanguins.  En utilisant le séquençage du segment V4 des gènes codant pour l'ARNr 16S, l’étude de la structure et de la composition du microbiote intestinal des différents groupes a été effectuée (NMDS, LEfse).  Une technique de PCR quantitative (qPCR) a été également utilisée pour quantifier les lactobacilles dans les différents groupes. Pour la diversité bêta, la structure du microbiote intestinal des porcs mordeurs et des porcs mordus était différente de celle des porcs-contrôle négatifs quant à l’abondance relative des unités taxonomiques opérationnelles. En ce qui concerne la composition, entre autres, les Lactobacillus ont été significativement plus associées aux porcs-contrôle négatifs. Les résultats par qPCR ont montré des quantités supérieures de lactobacilles chez ce même groupe. Cependant, pour la diversité alpha, aucune différence significative n’a été remarquée entre les différents groupes. Le taux de cortisol était significativement plus élevé chez les porcs mordeurs et les porcs mordus versus les porcs-contrôle négatifs (p=0,02, p=0,0076 respectivement). Cette étude démontre pour la première fois que la caudophagie est associée à la structure et la composition du microbiote intestinal chez le porc.

Keyphrases: Porcs, Microbiote intestinal, Trouble du comportement, Caudophagie
Role of interleukin-1 in the pathogenesis of the infection caused by Streptococcus suis serotype 2

Streptococcus suis sérotype 2 est un pathogène important du porc et un agent zoonotique en émergence causant des morts subites (porcs), des chocs septiques (humains) et des méningites (chez les deux espèces), où une réaction inflammatoire sévère est caractéristique de l’infection. Une réponse rapide et efficace du système immunitaire inné contre S. suis est critique pour contrôler la croissance bactérienne et pour limiter la propagation du pathogène sans occasionner une inflammation excessive. Bien que l’interleukine (IL)-1 soit considérée comme l’un des médiateurs pro-inflammatoires les plus efficaces et produit le plus rapidement, son rôle dans la pathogénèse de l’infection par S. suis n’a pas encore été étudié. En utilisant un modèle murin d’infection systémique bien standardisé, nous avons démontré que la souche nord-américaine de virulence intermédiaire de « sequence type » (ST) 25, la souche européenne hautement virulente ST1 ainsi que la souche épidémique chinoise ST7, induisent toutes de hauts niveaux d’IL-1 dans des organes de filtration, tels que le foie et la rate. De plus, les cellules dendritiques et les macrophages, deux types de cellules jouant un rôle central dans la pathogénèse de S. suis, sont des sources importantes de cette cytokine. Les études des mécanismes impliqués dans la production de cette cytokine ont démontré que la production d’IL-1, indépendamment de la souche bactérienne utilisée, dépendait de MyD88 et impliquait les récepteurs TLR2 et possiblement TLR7 et TLR9. Cela suggère que les composantes bactériennes responsables de l’activation cellulaire sont similaires et conservées entre les différentes souches. Cependant, seuls de très hauts niveaux de suilysine, produite par la souche ST7, provoquaient une maturation importante de proIL 1β. Cette maturation implique l’activation des inflammasomes NLRP3, NLRP1, AIM2 et NLRC4, qui est due à la formation de pores et à un efflux d’ions.  De surcroît, nous avons évalué le rôle global de cette cytokine chez des souris IL-1R-/-, démontrant que l’IL-1 pourrait jouer un rôle bénéfique lors d’une infection systémique par S. suis en modulant l’inflammation requise pour contrôler et éliminer la charge bactérienne, ce qui favorise la survie de l’hôte. Toutefois, au-delà d’un certain seuil, l’inflammation causée par S. suis ne peut plus être contrebalancée par cette signalisation, ce qui complique la détermination exacte du rôle de l’IL-1. Une meilleure compréhension des mécanismes sous-jacents impliqués dans le contrôle de l’inflammation et de la charge bactérienne aiderait à développer de meilleures mesures de contrôle pour ce pathogène important à la fois chez le porc et chez l’Homme.

Keyphrases: Streptococcus suis sérotype 2, Cellules dendritiques, Inflammation, Infection systémique, Suilysin
Localisation immunohistochimique de l’enzyme 5α-réductase type 1 et 3 dans la peau et la prostate de chiens beagle en santé

Les isoenzymes 5α-réductase (5αR), 5αR1, 5αR2 et 5αR3 sont responsables de la conversion de la testostérone en dihydrotestostérone (DHT). Récemment, le niveau d'expression des gènes de la 5αR dans la peau canine a été décrit, démontrant la présence de l'ARNm codant pour 5αR1 et 5αR3. Dans la prostate du chien, les trois formes de l’enzyme (5αR1, 5αR2 et 5αR3) sont présentes. La localisation exacte des isoenzymes 5αR dans la peau, le follicule pileux et la prostate du chien n’a toutefois pas encore été établie. Les objectifs de cette étude étaient de démontrer la localisation spécifique des isoenzymes 5αR type 1 et 3 dans la peau normale des chiens, des follicules pileux et de la prostate par immunohistochimie. Huit jeunes chiens beagle matures et intacts, (4 mâles et 4 femelles) sans antécédents de maladie dermatologique ont été sélectionnés pour cette étude. Des biopsies cutanées ont été obtenues à partir de trois sites anatomiques normalement affectés par l'alopécie X (cou dorsal, face postérieure des cuisses et base de la queue) et de deux sites généralement non affectés (tête dorsale et région thoracique ventrale). La glande prostatique (n = 3) a été prélevée. Dans la prostate, la présence de 5αR1 a été démontrée dans les cellules épithéliales sécrétoires et basales ainsi que dans les vaisseaux sanguins, tandis que la 5αR3 est présente seulement dans les cellules épithéliales basales et les vaisseaux sanguins. Concernant la peau, la 5αR1 a été détectée dans les follicules pileux en phase anagène au niveau de la gaine de tissu conjonctif, de la gaine externe et interne de la racine, de la tige pilaire et de la papille dermique. Elle a également été détectée dans les glandes sébacées et sudoripares, dans le muscle piloérecteur et dans les cellules endothéliales vasculaires. L’isoenzyme 5αR3 a été détectée dans la gaine de tissu conjonctif et la papille dermique des follicules pileux en phase anagène ainsi que dans les cellules endothéliales vasculaires. À notre connaissance, il s’agit de la première étude qui décrit la localisation spécifique des isoenzymes 5αR1 et 5αR3 dans la peau normale, les follicules pileux et la prostate de chiens.

Keyphrases: Alopécie X, 5α-réductase isoenzymes, 5α-réductase type 1, 5α-réductase type 3, Immunohistochimie, Peau, Prostate
Staufen1 est un régulateur post-transcriptionnel du cycle cellulaire

Le cycle cellulaire est crucial pour la croissance, mais aussi pour le développement. Ce mécanisme est tellement critique que la moindre atteinte faite à l’une de ses étapes peut conduire à des problèmes de croissance et de développement, mais aussi à l’apparition d’anomalies, tels que les cancers, et ultimement la mort. De ce fait, la prolifération cellulaire est un mécanisme finement régulé, évitant au mieux les défaillances et les déséquilibres éventuels. Les mécanismes de régulation des étapes du cycle cellulaire sont rassemblés à plusieurs niveaux, et sont hautement hiérarchisés et structurés : les régulations transcriptionnelle et post-traductionnelle font partie des aspects les mieux étudiés à ce jour. D’autres processus, comme la régulation post-transcriptionnelle, se trouvent moins documentés. Cependant, les découvertes des protéines liant l’ARN, et ayant un rôle clé lors des différentes phases du cycle de division, semblent de plus en plus fréquentes. L’épissage, l’export nucléaire, la localisation, la dégradation et la traduction des ARNm représentent les multiples facettes de la régulation post-transcriptionnelle, et justifient amplement leur importance dans l’affinement du contrôle des différentes phases du cycle cellulaire. Staufen1 (STAU1), une protéine liant l’ARN, fait partie de ces incroyables découvertes qui ont contribué à révolutionner notre approche de la régulation de l’expression génique, et qui ont aidé à approfondir notre compréhension des mécanismes régissant divers processus cellulaires et physiologiques. Les travaux de recherche entrepris dans le cadre de cette thèse ont contribué à approfondir nos connaissances sur le rôle de la protéine Staufen1 dans la régulation post-transcriptionnelle du cycle cellulaire et de la prolifération. En occurrence, nous avons identifié un nouveau mécanisme de dégradation de STAU1 en sortie de mitose, impliquant le système ubiquitine-protéasome. Nous avons également montré pour la première fois que STAU1 pourrait inhiber la prolifération tumorale dans le cas du cancer colorectal, et les résultats de nos travaux ont été confirmés et approfondies dans des études ultérieures. Par ailleurs, les résultats de nos approches expérimentales, en vue de l’étude de l’impact de STAU1 sur le contrôle de la prolifération dans des modèles cellulaires non transformées suggèrent fortement un rôle positif dans le développement du potentiel prolifératif en cas de transformation tumorale. Ces résultats sont en harmonie avec une multitude d’études portant sur le rôle positif de STAU1 dans la régulation de la prolifération et sur son implication dans divers types de cancers. Cependant, l’examen plus exhaustif des études portant sur Staufen1 suggère un modèle multi-mécanistique dans les divers processus carcinogènes, et ouvre un champ d’investigation futur d’une grande ampleur pour élucider les mécanismes moléculaires qui soutiennent les fonctions STAU1 associés à la prolifération cellulaire et le développement tumoral.

Keyphrases: Staufen, Cycle cellulaire, Prolifération, Régulation post-transcriptionnelle
Intégration sensorielle chez les individus ayant un trouble du spectre de l’autisme

La capacité du cerveau humain à intégrer les informations issues d’une ou de plusieurs modalités sensorielles est essentielle pour percevoir le monde de manière unifiée et cohérente. Il a été suggéré que le trouble du spectre de l’autisme (TSA) puisse être associé à une dysfonction de la capacité à intégrer les informations provenant de différentes modalités sensorielles. Toutefois, les données empiriques à cet effet demeurent complexes et équivoques. Dans ce contexte, le présent projet de thèse a pour but de permettre une meilleure compréhension du lien qui existe entre le TSA et les performances d’intégration sensorielle. Les résultats obtenus suggèrent que le TSA est associé à une diminution de la capacité à intégrer des informations provenant de différentes modalités sensorielles (IMS). Contrairement à ce qui était suggéré dans la littérature, cette atteinte serait présente indépendamment du type de stimuli traités, mais semble un peu plus manifeste pour les informations de nature sociale. Celle-ci semble également spécifique au traitement multisensoriel, dans le contexte où aucun déficit n’a été objectivé lors de l’intégration de stimuli de même modalité chez les individus ayant un TSA. Par ailleurs, cette diminution d’IMS n’est pas sous-tendue par une atteinte des processus attentionnels nécessaires pour la transition d’une modalité à l’autre lors du traitement multisensoriel. De façon générale, ces résultats ont permis d’approfondir les connaissances en lien avec l’intégration sensorielle chez les individus ayant un TSA. Ceux-ci témoignent de la présence d’atypies au niveau des processus d’IMS qui devront être approfondies davantage, et ouvrent la voie à des études futures qui tenteront de préciser l’étiologie, les corrélats neuronaux et, de façon primordiale, l’impact clinique associés à ces différences d’IMS.

Keyphrases: Intégration sensorielle, Trouble du spectre de l'autisme