NCube/papyrus huggingface dataset:
L'immuno-modulation et l'immuno-suppression chez les grands brûlés

Les brûlures induisent une activation inflammatoire intense menant à un épuisement du système immunitaire des patients. Ceci génère une phase anti-inflammatoire immunosuppressive ouvrant la porte aux infections nosocomiales. Il a déjà été observé dans notre laboratoire, à partir d’échantillons de 25 patients grands brûlés (GB), une altération des monocytes, des niveaux de cytokines pro- et anti- inflammatoires et des fonctions des lymphocytes B (LB). Nous émettons l'hypothèse que les brûlures conduisent à une hyperactivation des cellules présentatrices d'antigènes (APC) qui génèrent un état immunosuppresseur. Nous proposons également que l'état inflammatoire des patients soit influencé par le microbiome. Nos objectifs sont d'évaluer la modulation immunologique des leucocytes périphériques, en particulier les APC, d'optimiser les techniques d'analyse du microbiome sanguin et d'étudier les populations bactériennes périphériques des patients.  Nos expériences in vitro révèlent qu'en présence de sérum de patients GB, les monocytes adoptent un profil régulateur de l'inflammation; et les LB prolifèrent moins et produisent moins d'IgA, IgG et IgM. Les monocytes stimulent la prolifération des LB par des interactions cellulaires mais inhibent la sécrétion d'anticorps. La concentration de BAFF soluble chez les patients GB augmente 5 jours post-brûlure et ceci pourrait établir un lien entre les monocytes et la dérégulation des LB. Les techniques d'extraction et de détection de l'ADN bactérien à partir du sang et de la peau ont été optimisées. La quantité d'ADN total en circulation varie post-brûlure mais la quantité d'équivalents bactériens dans le sang des patients GB n'est pas modifié.  Une meilleure compréhension de l’état d’activation du système immunitaire après une brûlure et son interaction avec le microbiome est très importante. Ceci permettra de développer de nouveaux traitements afin de supporter les fonctions immunitaires des patients afin de réduire les infections sévères résultant de l’épuisement immunologique.

Keyphrases: Brûlure, Inflammation, Infection, Monocyte, Microbiome, Bactérie, ADN, Inflammation, Infection, Monocyte, Microbiome
Les pratiques exemplaires en gestion de données de recherche en vue d’établissement de services de gestion de données de recherche en milieu collégial

Ce rapport formule des recommandations pour l’établissement de services de gestion de recherche dans les collèges québécois, particulièrement pour les bibliothèques du réseau collégial. À l’instar des universités canadiennes, les collèges devront se conformer aux futures exigences en gestion de données de recherche (GDR) des organismes subventionnaires canadiens de la recherche. Aussi, avoir des pratiques exemplaires en GDR amène de nombreux avantages tout en diminuant plusieurs risques pour les chercheurs et les institutions. Ce document aborde le besoin d’explorer et de mettre en place des mesures concernant la GDR par des actions concertées des cégeps et des centres collégiaux de transfert de technologie (CCTT). Par exemple, des services de consultation en GDR pourraient être offerts localement par les bibliothèques collégiales avec un service réseau en appui à celles-ci selon un principe de subsidiarité. Également, les collèges et les CCTT devraient envisager de joindre ou d’implanter des infrastructures partagées de GDR (dépôts canadiens de données ou un dépôt institutionnel de données commun pour le réseau collégial). Ce travail met l’accent sur l’importance de saisir et respecter les différentes particularités des acteurs du réseau collégial dans l’implantation de services de GDR. Afin de formuler les recommandations de ce rapport, une recension des écrits sur les pratiques exemplaires en GDR dans les institutions d’enseignements supérieurs (collèges et universités) a été faite. Les modes de productions savantes dans les collèges québécois sont substantiellement différents de ceux des universités en matière d’objectifs, d’infrastructures et de diffusion. Ainsi, une recension des écrits des modes de productions savantes en milieu collégial a été réalisée. De plus, une analyse bibliométrique des publications des cégeps et des CCTT de 2008 à 2017 à l’aide de Web of Science a été effectuée. Cette dernière couvre uniquement les cégeps et les CCTT officiellement reconnus par le ministère de l’Éducation et de l’Enseignement supérieur en 2018.

Keyphrases: Gestion des données de recherche, Recherche au collégial, Bibliothèques collégiales, Production scientifique, Cégeps, Centres collégiaux de transfert de technologie
Suivi longitudinal de la charge externe de joueurs professionnels de hockey sur glace au cours d’une saison

Pour une équipe de la ligue américaine de hockey (LAH), le calendrier compte 76 matchs répartis sur 28 semaines au cours desquelles les équipes se battent pour une place en séries éliminatoires. En plus des matchs, les joueurs doivent participer à des séances d’entraînement sur glace et hors glace afin de maintenir et développer leurs habiletés et leur forme physique spécifiques au hockey. Le présent mémoire avait les objectifs suivants: (1) tracer un portrait de la tâche du joueur de hockey et mieux comprendre l'évolution et les changements du hockey sur glace moderne (2) décrire l’impact de ces changements selon la position du joueur (3) détailler les différentes méthodes de suivi de la charge externe qui sont utilisées par d’autres sports collectifs tels le soccer, le rugby et le football australien et exposer les défis associés à leur mise en place au sein d’une équipe professionnelle de hockey sur glace (4) faire le suivi de la charge externe d’une équipe de hockey professionnelle, avec l’aide d’accéléromètres, pour mieux comprendre l’évolution de la charge externe lors de la saison. Pour ce faire, cinquante joueurs, qui à un moment ou à un autre, ont fait partie de l'alignement d’une équipe de la ligue américaine de hockey durant la saison 2017-18 de la LAH, ont participé à une étude sur le suivi de la charge externe. Avec l’aide d’accéléromètres, les données de chaque séance d’entraînement et match au cours de la saison ont été recueillies et analysées. Les résultats ont révélé que l’intensité et la charge d’entrainement diffèrent selon la position du joueur lors des matchs et des entrainements précédant un match. Ces résultats soulèvent l’importance d’un suivi attentif de la charge externe et l’utilisation d’accéléromètres semble présenter un grand potentiel pour le suivi individualisé des joueurs tout au long d’une saison de hockey.

Keyphrases: Sport professionnel, Accélérométrie, Charge d’entrainement sur glace
La nature, le rôle et l’impact du déni et de la minimisation chez les délinquants sexuels au sein des programmes d’intervention

Objectif : Trop d’importance semble être accordée au déni et à la minimisation au sein des programmes d’intervention pour réduire la récidive sexuelle en recherchant une pleine prise de responsabilité. Certains auteurs affirment plutôt que l’intervention sur le déni et minimisation n’est pas nécessaire pour obtenir une progression et des bénéfices au cours d’un programme. Cependant, le déni et la minimisation étant considérés comme des facteurs de réceptivité, la reconnaissance minimale des gestes commis serait nécessaire, comparativement à la prise de responsabilité. Ce projet vise à illustrer le rôle, la nature et l’impact du déni et de la minimisation sur les programmes d’intervention en explorant l’expérience vécue par des délinquants sexuels adultes. L’importance d’intervenir sur le déni et minimisation en programme et les interventions à prioriser pour augmenter la réceptivité des participants est examinée. Méthode : Afin d’atteindre l’objectif visé par ce travail, des études de cas ont été réalisées dans le cadre d’un stage effectué au CETAS. La collecte de données s’est déroulée à travers la documentation de dossiers et des entrevues semi-structurées auprès de trois hommes qui ont été condamnés suite à des gestes de nature sexuelle. Interprétation des résultats : Les participants ont considéré le déni et la minimisation de la gravité des gestes comme étant des facteurs de réceptivité. Ils ont accordé beaucoup d’importance à l’élimination du déni et de la minimisation lors de programmes d’intervention afin que l’individu puisse progresser et changer. Certains ont toutefois soutenu que l’individu peut vouloir changer même s’il fait preuve de minimisations par rapport au délit.

Keyphrases: Déni, Minimisation, Réceptivité, Facteur risque, Fonction, Objectif, Traitement, Délinquant sexuel, Denier
La perception du végétarisme chez les adolescents

Contexte. Le végétarisme est un comportement qui gagne en popularité chez les adultes au Canada, mais qui est cependant peu étudié chez les adolescents. La consommation de protéines végétales a démontré plusieurs bienfaits sur l’environnement et sur de multiples facteurs de santé. Objectifs. Le but de cette étude est d’examiner la perception que des adolescents québécois participant aux ateliers des Brigades Culinaires expriment à l’égard d’autres jeunes végétariens et leurs attitudes générales face au végétarisme. D’autre part, une grille de codification inspirée par la littérature et bonifiée par les réponses transmises par le corpus de données est également créée. Méthodes. Une approche qualitative et quantitative fut retenue en utilisant un questionnaire auto administré lequel a été distribué à deux moments dans les 67 écoles participantes aux Brigades Culinaires soit en pré- et post-atelier (début et fin d’année). Pour la phase qualitative, en préatelier, les jeunes devaient répondre à la question ouverte « Pour moi un adolescent végétarien c’est... » . Pour la phase quantitative en post-atelier ils devaient indiquer s’ils étaient d’accord (oui) ou pas d’accord (non) avec une liste de onze énoncés sur le végétarisme. Le projet a reçu l’approbation éthique du comité de la recherche en santé Une méthode inductive et déductive a été utilisée pour créer la grille de codification permettant d’analyser les données qualitatives en préatelier. À l’aide du logiciel SPSS, les données quantitatives ont été analysées et comparées afin d’observer la présence ou l’absence de relation statistique. Résultats. En pré-atelier, la thématique de l’alimentation a été l’élément de réponse le plus mentionnée par les jeunes (62,3 %, n=810 éléments de réponses), suivi, en ordre, des motivations (27,9 %, n=363), des normes sociales (21,1 %, n=274), de la santé (17,4 %, n=226) et de l’individu (1,9 %, n=25). L’analyse des éléments de réponse a permis de constater que la perception du végétarisme était généralement bonne chez les jeunes utilisant des mots positifs pour décrire l’alimentation, mais n’était pas majoritairement mentionnée par les jeunes (14 %). En post-atelier, les jeunes avaient généralement une vision positive du végétarisme en acquiesçant à plusieurs énoncés positifs sur ce type d’alimentation soit, par exemple, que l’alimentation végétarienne est bonne pour l’environnement, qu’elle n’est pas fade, qu’elle est bonne pour la santé. Conclusion. L’étude suggère que la perception du végétarisme chez les jeunes de cette cohorte est généralement bonne. De plus, les éléments de réponse montrent que les participants comprennent plusieurs facteurs en lien avec le végétarisme, dont les motivations (éthiques, environnementales, religieuses...), l’aspect nutritionnel de ce régime alimentaire et le goût.

Keyphrases: végétarisme, végétariens, adolescents, jeune
Domination éternelle dans les graphes

Le présent mémoire traite du problème de domination éternelle dans les graphes. Nous considérons trois modèles différents du problème, à savoir le modèle du garde, de l’anglais one-guard moves model, le modèle des gardes, de l’anglais all-guards move model, et le modèle fractionnaire. Dans un premier temps, nous étudions quelques questions fondamentales liées à la relation entre le nombre de stabilité́, le nombre de domination éternelle et la cardinalité́ d’une couverture minimum d’un graphe dans le modèle du garde. Dans un second temps, nous proposons une stratégie qui borne supérieurement par mi/7 + O(m+n) le nombre de domination éternelle de la grille forte Pm ⊠ Pn dans le modèle des gardes. Finalement, nous nous inspirons de quelques résultats de la théorie fractionnaire des graphes pour introduire une analogue fractionnaire du problème.

Keyphrases: Théorie des graphes, Protection de graphes, Ensemble dominant fractionnaire, Domination éternelle
Estimation efficace en présence de non-réponse dans les enquêtes

L’utilisation efficace d’informations auxiliaires pour l’estimation des paramètres descriptifs dans une population finie en présence de non-réponse totale est devenue assez courante. Ce mémoire porte sur des procédures de repondération qui impliquent une modification du poids des répondants pour traiter la non-réponse totale. Une approche communément utilisée est l’ajustement par le score de propension qui consiste à multiplier le poids de base par l’inverse de la probabilité de réponse estimée obtenue au moyen d’un modèle de réponse. Afin d’améliorer l’efficacité de l’estimateur ajusté par score de propension, nous proposons une méthode basée sur le calage assisté par un modèle. Cette méthode consiste à modéliser la relation entre des variables d’intérêt identifiées comme clés et un vecteur de variables auxiliaires, puis à incorporer les informations auxiliaires dans des valeurs prédites obtenues par le modèle et ce qui conduira à un système de pondération unique. L’estimateur résultant peut améliorer l’efficacité des estimations en utilisant davantage l’information auxiliaire disponible. Une étude par simulation évalue les propriétés des estimateurs proposés en termes de biais et d’erreur quadratique moyenne.

Keyphrases: Calage, Calage assisté par un modèle, Estimateur ajusté par le score de propension, Information auxiliaire, Non-réponse, Repondération
Évaluer la réalisation d’une intention avec le Virtual Multitasking Test 3e édition : une étude de validité du construit

Problématique : La mémoire prospective (MP) est un processus cognitif complexe qui implique de se souvenir de réaliser une intention dans le futur (Ellis, 1996). La MP est reconnue pour sa contribution à l’autonomie et à la sécurité de la personne dans la vie quotidienne. Ainsi, dans plusieurs contextes cliniques, dépister les troubles de la MP pourrait avoir une utilité pronostique et thérapeutique. Or, les tests neuropsychologiques traditionnels ne reflètent pas assez bien la complexité des tâches quotidiennes. La réalité virtuelle (RV) apparaît être une alternative intéressante, étant donné les protocoles d'évaluation écologiquement valides qu’elle permet d’élaborer. Dans cette foulée, le Virtual Multitasking Test-3 (VMT-3), un appartement tridimensionnel, permet d’évaluer la MP grâce à plusieurs types de tâches similaires au quotidien. Objectif : L’objectif de cette recherche était de valider le VMT-3 sur plan du construit en le comparant avec deux outils standardisés, et reconnus comme étant écologiques, soit le Rivermead Behavioural Memory Test-3 (RBMT-3) et le Cambridge Prospective Memory Test (CAMPROMPT). Méthode : L’échantillon final comprenait 102 participants sains, dont 48 femmes et 54 hommes d’une moyenne d’âge de 41 ans. Nous avons comparé les performances des sujets à des épreuves traditionnelles de MP et de mémoire épisodique (ME), ainsi que dans le VMT-3. Résultats : Les corrélations issues de la présente étude ont principalement révélé des liens significatifs entre les indices du VMT-3 et les indices de ME et de MP du RBMT-3. Le CAMPROMPT est quant à lui seulement corrélé avec les tâches event-based du VMT-3. Conclusion : Ces résultats suggèrent que le VMT-3 propose des indices valides de MP de type EB. Des recherches supplémentaires sont nécessaires afin de poursuivre cette étude de validation. L’interprétation des résultats suggère que la réalisation du VMT-3 est possible grâce  à un amalgame de fonctions cognitives, dont la MP, les fonctions exécutives et le multitasking. Nous suggérons que le VMT-3 soit maintenant comparé à des tests neuropsychologiques écologiques qui évaluent le multitasking.

Keyphrases: Mémoire prospective, Validité concomitante, Psychométrie, Neuropsychologie, Évaluation écologique, Réalité virtuelle, Prospective memory
Les chambres de leucoréduction sont une nouvelle source de cellules pour la génération de lignées de lymphocytes T en immunothérapie

La réactivation de virus latents est une cause importante de morbidité et mortalité chez les patients immunocompromis. Le transfert adoptif de lymphocytes T pathogène spécifiques est une stratégie prometteuse pour le traitement de ces complications. Un problème important dans le développement de nouveaux protocoles de thérapie cellulaire est la source limitée de cellules. Afin de pallier cette limitation, nous avons évalué, en collaboration avec Héma-Québec, le potentiel des PBMC provenant de chambres de leucoréduction (LRSC) pour générer des lignées de lymphocytes T pour la thérapie cellulaire. Les LRSC sont habituellement utilisées par les agences de sang pour « leucodéplèter » les dons de plaquettes et celles-ci sont ensuite considérées comme des déchets. Pour évaluer leur potentiel, nous avons comparé des PBMC contenus dans des LRSC ou le sang périphérique provenant d’un même donneur sain, prélevé au même moment. Les PBMC provenant des LRSC contiennent les mêmes proportions des principales populations mononucléaires que ceux contenus dans le sang périphérique pour chacun des donneurs. Toutefois, les LRSC semblent induire le clivage du marqueur de différenciation CD62L, dont l’expression est rétablie après leur culture. Suite à une stimulation polyclonale, les PBMC des LRSC et ceux du sang périphérique ont une expansion, une différenciation et démontrent un potentiel de polyfonctionnalité similaires. La prolifération, le phénotype et la réactivité des lignées virus spécifiques générées à partir d’un répertoire mémoire étaient similaires selon qu’elles proviennent des LRSC ou du sang périphérique. À partir des LRSC, nous avons généré des lignées pathogène spécifiques fonctionnelles à partir d’un répertoire naïf. Finalement, l’ensemble des résultats démontrent que les LRSC sont une nouvelle source de PBMC de qualité. Le repositionnement des LRSC permettrait de valoriser un déchet. La quantité de cellules contenue par les LRSC et la possibilité d’utiliser une série de donneurs de plaquettes réguliers pourraient permettre la création d’une banque de lymphocytes T pathogènes spécifiques pour usage immédiat en immunothérapie adoptive.

Keyphrases: Immunothérapie adoptive, LRSC, Réactivation virale, Thérapie cellulaire, Répertoire naïf, Répertoire mémoire
Étude de la relation entre les oligomères amyloïde-bêta et la protéine d'adhésion synaptique Neuroligine-1

Dans la maladie d'Alzheimer (MA), les pertes synaptiques et la neurodégénérescence, causées en partie par les oligomères amyloïdes-bêta (Aßo), sont les meilleurs prédicteurs des troubles de mémoire. Une priorité actuelle est d'identifier un biomarqueur affecté précocement par les Aßo. La protéine post-synaptique Neuroligine-1 (NL-1) pourrait être une candidate due à son implication dans la plasticité synaptique et la mémoire. La première hypothèse de cette étude est que les dysfonctions synaptiques engendrées par les Aβo1-42 pourraient affecter de façon précoce et progressive le niveau de NL-1. L'expression de NL-1 a été mesurée lors d'injections hippocampiques chroniques d'Aßo1-42, d'exposition de neurones primaires d'hippocampe aux Aßo1-42, ainsi que chez les souris 3xTg. En utilisant 5 ensembles d’amorces informant sur les transcrits de Nl-1, une augmentation des niveaux d'ARNm après 2 jours d'injections d'Aßo1-42 a été détectée pour 2 ensembles d’amorces, et une diminution d’expression de 3 ensemble d’amorces a été mesuré après 4 jours d'injections. Par contre, aucun changement du niveau protéique n'a été observé. In vitro, le niveau de NL-1 diminue après 72h d'exposition aux Aβo1-42, concordant avec une diminution de la viabilité des neurones. Finalement, les souris 3xTg femelles démontrent une diminution de NL-1 à 4 mois. Notre deuxième hypothèse stipulant que l’absence de NL-1 entraîne une toxicité accrue des Aßo1-42 a été confirmée. Les souris NL-1 KO injectées aux Aßo1-42 ont obtenus de plus faibles performances au test de la reconnaissance d'objet et à la piscine de Morris, ainsi qu’une perte neuronale plus importante que les autres groupes testés. Cette étude confirme la relation étroite entre NL-1 et les Aßo1-42, apportant possiblement une nouvelle cible thérapeutique ou biomarqueur pour le développement de nouvelles thérapies aux stades précoces de la MA.

Keyphrases: Maladie d’Alzheimer, Neuroligine-1, Amyloïde-bêta, Mémoire, Hippocampe
Étude d’un modèle murin transgénique spontané d’encéphalomyélite auto-immune expérimentale : investigation de l’état de la barrière hémo-encéphalique et des différences liées au sexe

Le modèle murin transgénique TCR1640 possède un récepteur de cellule T spécifique pour le peptide 92-106 de la glycoprotéine oligodendrocyte myéline et développe spontanément une encéphalomyélite autoimmune expérimentale (EAE). Celle-ci est plus prévalente chez les femelles, développant un décours de la maladie de type poussée-rémission (RR), alors que la majorité des mâles présente une EAE primaire progressive (PP). Ce modèle reflète parfaitement les différences liées au sexe, l’hétérogénéité de la présentation, la pathologie ainsi que l’implication de diverses populations de cellules immunitaires observées dans la sclérose en plaques. Ce projet vise l’étude des changements pathologiques au cours des diverses phases de la maladie, ainsi que des mécanismes responsables des différences inhérentes au sexe. La caractérisation pathologique in situ par immunohistochimie révèle que la barrière hémo-encéphalique (BHE) est altérée lors des phases actives de l’EAE spontanée, de façon concomitante à une activation de l’endothélium ainsi qu’une infiltration du système nerveux central par les cellules immunitaires. Or, la perméabilité de la BHE semble rétablie lors de la phase de rémission. Le transfert adoptif de cellules issues de TCR1640 dans des animaux nontransgéniques, a permis de démontrer que le cours de la maladie dépend du sexe du donneur. En effet, les souris receveuses de cellules de mâles développent une EAEPP, alors que celles recevant des cellules de femelles développent une EAE-RR, et ce indépendamment du sexe de l’animal receveur. Des analyses transcriptomiques révèlent des différences d’expression génique entre les cellules immunitaires issues de mâles et de femelles TCR1640, suggérant que le cours de la maladie RR versus PP est déterminé par des gènes sexe-dépendants du compartiment immun.

Keyphrases: Sclérose en plaques, Encéphalomyélite autoimmune expérimentale, Différences liées au sexe, Barrière hémoencéphalique