NCube/papyrus huggingface dataset:
Élaboration pharmacométrique d’une stratégie d’échantillonnage limité dans l’évaluation de la bioéquivalence du dabigatran

L’évaluation de la bioéquivalence (BE) de formulations génériques (Test) et de marques commerciales (Référence) du dabigatran représente un défi de taille pour les sociétés pharmaceutiques en raison de la grande variabilité intra-individuelle et de la puissante relation concentration-effet du médicament. Soutenu par l'approche de modélisation pharmacocinétique de population (pop-PK), ce projet examine le potentiel d'évaluer la BE, avec des résultats comparables au paradigme actuel de BE, en utilisant un nombre réduit d'échantillons requis. Une étude de BE portant sur deux formulations de dabigatran (Test et Référence), comprenant 16 sujets et incluant 640 concentrations plasmatiques a été utilisée rétrospectivement pour l'analyse pop-PK. Un modèle pop-PK a été développé pour chaque formulation en suivant les techniques de modélisation standards. Des scénarios d'échantillonnage comportant un ensemble décroissant de prélèvements ont été sélectionnés selon une stratégie progressive et prudente basée sur les propriétés pharmacocinétiques (PK) connues du dabigatran ainsi que de connaissances cliniques acquises. Les modèles pop-PK Test et Référence ont été ajustés à chacun des scénarios d'échantillonnage réduits et leurs profils PK ont été simulés. Ensuite, des tests de BE ont été effectués pour identifier le scénario préservant les conclusions BE obtenues à partir du jeu de données d'origine tout en incluant le nombre minimal de prélèvements. Un modèle à deux compartiments avec élimination de premier ordre et absorption retardée décrivait le mieux les données de concentration plasmatique du dabigatran. Le sexe a été identifié en tant que covariable significative pour la biodisponibilité. Pour les scénarios d'échantillonnage réduit, tous les profils de PK simulés étaient similaires et robustes en termes de valeurs de paramètres PK et de courbes de concentrations, à l'exception des valeurs de Cmax. Les résultats ont également prouvé que le verdict de BE pouvait être maintenu jusqu'à un scénario d'échantillonnage réduit de cinq prélèvements en utilisant les normes et critères de BE réglementaires en vigueur. L’approche de modélisation pop-PK pourrait réduire le nombre d’échantillons utilisés pour l’évaluation de la BE du dabigatran, diminuant donc les coûts des futurs essais de BE cliniques en plus de représenter un bénéfice pour les participants de l’étude.

Keyphrases: Bioéquivalence, Dabigatran, Modélisation pharmacocinétique de population, stratégie d’échantillonnage limité
L’impact du type d’assurance médicaments (privée/publique) sur le coût des médicaments et les dépenses des Québécois

Au Québec, il est mandatoire d’avoir une assurance médicaments soit privée ou publique. De plus, le coût d’un médicament a trois composantes : le prix de la molécule, la marge bénéficiaire du grossiste et l’honoraire du pharmacien. Les deux premières composantes sont fixes et déterminées par la Régie de l’assurance médicaments du Québec (RAMQ) pour les personnes couvertes par les régimes privés d’assurance médicaments ou le régime public d’assurance médicaments (RPAM). L’honoraire du pharmacien est déterminé par la RAMQ pour les personnes couvertes par le RPAM (entre 8,50$ et 9,49$) alors qu’il est librement déterminé par le pharmacien propriétaire pour les personnes couvertes par les régimes privés d’assurance médicaments ce qui donne lieu à des différences dans le coût des médicaments. Les objectifs de ce mémoire étaient d’estimer la différence de coût et des dépenses des médicaments entre les patients couverts par les régimes privés d’assurance médicaments et le RPAM au Québec. Afin de répondre aux objectifs, les ordonnances remplies entre le 1er janvier 2015 et le 23 mai 2019 ont été sélectionnées de reMed, une banque de données qui contient l’information sur les ordonnances remplies par d’un échantillon de Québécois. Des strates d’ordonnances de médicaments ont été créées afin d’avoir à l’intérieur de chaque strate le même médicament (même DIN), même quantité et durée prescrites, acheté à la même pharmacie avec la même Liste des médicaments de la RAMQ. Chaque strate d’ordonnances remplies par les patients couverts par un régime privé d’assurance médicaments a été appariée à une strate d’ordonnances remplies par des patients couverts par le RPAM sur les mêmes critères utilisés pour la stratification. Des modèles de régression linéaires ont été utilisés afin d’estimer la différence de coût et de dépenses entre les régimes privés d’assurance médicaments et le RPAM. Basée sur 38 896 strates (un total de 162 019 ordonnances), l’étude a montré que globalement le coût d’une ordonnance de médicament est en moyenne 9,35$ (95% CI: 5,58 ; 13,01) plus élevé pour les patients couverts par les régimes privés d’assurance médicaments que pour ceux couverts par le RPAM (62,34$ vs 52,99$). Quant aux dépenses des patients pour une ordonnance de médicament, les patients couverts par un régime privé d’assurance médicaments déboursaient 1,01$ (95% CI: -1,22 ; -0,80) moins que ceux couverts par le RPAM (6.94$ vs 7.95$). Cette étude a montré qu’en moyenne le coût des médicaments est plus élevé et que les dépenses sont légèrement plus faibles pour les patients couverts par les régimes privés d’assurance médicaments. Donc, ces résultats seront utiles pour les décideurs et les autorités gouvernementales lorsqu’ils prendront des décisions éclairées sur les modalités d’assurance au Québec.

Keyphrases: assurance médicaments, coût du médicament, dépenses, différence de coût des médicaments, différence des dépenses, régime privé d’assurance médicament, régime public d’assurance médicaments
Facteurs prédictifs d’utilisation chronique d’opioïdes dans la population non atteinte de cancer

L’utilisation chronique d’opioïdes est associée à des méfaits graves tels que dépendance et surdosage. Ce mémoire vise à identifier les facteurs associés à l’utilisation chronique d’opioïdes dans une population adulte non atteinte de cancer et par là, à développer un modèle prédictif adapté à la pratique clinique. À partir des banques de données administratives du Québec (RAMQ), une étude de cohorte a été menée dans un échantillon aléatoire de 125,000 membres du régime général d’assurance médicaments (≥18 ans) ayant initié un opioïde entre le 1er janvier 2012 et le 31 décembre 2016. L'utilisation chronique a été définie par ≥90 jours consécutifs ou ≥120 jours cumulatifs pendant les 12 mois de suivi. Des modèles de régression logistique multivariés ont été effectués afin d’évaluer l’association entre les caractéristiques du patient ou du traitement et l’utilisation chronique. La performance prédictive des modèles a été évaluée par l’aire sous la courbe (AUC) de la «Receiver Operating Characteristic». Parmi les 124 664 nouveaux utilisateurs admissibles, 3,4% sont devenus utilisateurs chroniques et représentaient 51,1% des opioïdes délivrés à la cohorte. Le modèle prédictif le plus parcimonieux ayant une performance acceptable (AUC≥ 0,70) incluait: Durée de prescription initiale ≥30 jours et diagnostic associé à de la douleur chronique. De nombreux facteurs de risque d’utilisation chronique d’opioïdes ont été identifiés. Il est possible de prédire quels sont les patients qui évolueront vers une utilisation chronique uniquement à partir de la durée de l’ordonnance initiale et de l’indication. Ces prédicteurs seraient donc adaptés à la pratique clinique.

Keyphrases: Opioïdes, Utilisation de médicaments, Utilisation chronique, Abus de substances
Analyse phénoménologique interprétative de l’expérience de femmes qui ont une fratrie ayant souffert d’anorexie mentale

Les troubles de la conduite alimentaire sont un problème de santé mentale ayant de nombreuses conséquences chez les personnes atteintes (American Psychiatric Association, 2013; Mitchell et Crow, 2006), mais aussi sur leurs proches (Coomber et King, 2013; Treasure et al., 2001). Quelques études se sont intéressées à l’expérience d’individus ayant une soeur ou un frère atteint d’un trouble alimentaire et ont mis de l’avant que ceux-ci pouvaient vivre des difficultés et des émotions négatives (Garley et Johnson, 1994; Scelles et al., 2009). Toutefois, ces études ont des échantillons variés et hétérogènes (p. ex. écarts d’âge chez les participants, différents types de trouble alimentaire chez la fratrie). Ces caractéristiques des échantillons sont pourtant importantes à considérer sachant qu’il est possible qu’elles influencent leur expérience. La présente étude avait pour objectif d’explorer, de décrire et d’interpréter, à l’aide d’une méthodologie de nature qualitative, l’expérience de cinq femmes qui ont une fratrie ayant souffert d’anorexie mentale. Une analyse phénoménologique interprétative a été effectuée afin d’explorer l’expérience des participantes de façon détaillée et d’un point de vue idiographique, tout en intégrant un volet interprétatif afin d’enrichir les connaissances concernant ces personnes. Les résultats suggèrent que les femmes rencontrées vivent un bouleversement dans leur vie lorsque leur fratrie développe un trouble d’anorexie. Le trouble occupe une place centrale dans la famille. Le soutien est manquant pour plusieurs participantes qui discutent peu ou pas de ce qui arrive ou qui peuvent se sentir mises de côté. Parmi les émotions exprimées par les participantes face à l’expérience vécue, la colère, fréquemment associée à de l’incompréhension, peut surgir chez elles dans différents contextes. Les participantes vivent aussi de l’impuissance, une émotion centrale dans leur expérience qui est souvent associée à leur implication dans la famille. Elles mettent leurs besoins de côté afin d’aider leurs proches et plusieurs réalisent peu ou pas l’influence du trouble sur elles au moment où celui-ci est actif. Des répercussions personnelles sur les plans émotionnel et relationnel sont présentes à court, moyen et long terme. Enfin, l’expérience des participantes apparait comme étant singulière, ce qui influence leurs besoins face aux services. Les résultats de l’étude sont discutés en lien avec les modèles théoriques de stress et d’adaptation de Lazarus et Folkman (1984) et de Mackay et Pakenham (2012). À partir des thèmes ressortis, des pistes d’intervention potentielles sont proposées afin d’ouvrir la réflexion sur les services possibles à offrir auprès de cette population.

Keyphrases: Trouble alimentaire, Anorexie mentale, Soeur, Fratrie, Proche, Expérience, Émotion, Relation, Analyse phénoménologique interprétative, Psychologie clinique
Apprentissage de l’orthographe lexicale : évaluation de l’efficacité de pratiques d’enseignement auprès d’élèves francophones de la deuxième année du primaire

L’apprentissage de l’orthographe lexicale, c’est-à-dire l’orthographe des mots comme on la retrouve dans le dictionnaire, constitue un défi de taille pour les élèves francophones (Fayol et Jaffré, 2014). Les études descriptives menées auprès d’élèves québécois montrent que la plupart des erreurs d’orthographe lexicale sont associées aux propriétés visuelles des mots et, plus précisément, aux phonèmes multigraphémiques (sons s’écrivant de plusieurs manières) et aux lettres muettes non porteuses de sens (Daigle, Costerg, Plisson, Ruberto et Varin, 2016 ; Plisson, Daigle et Montésinos-Gelet, 2013). Dans la présente recherche, une étude quasi expérimentale a été menée auprès de 131 élèves francophones (âge moyen : 7,5 ans) afin de définir les pratiques d’enseignement les plus efficaces pour favoriser l’apprentissage de phonèmes multigraphémiques et de lettres muettes non porteuses de sens. Deux conditions expérimentales d’enseignement ont été mises à l’essai dans quatre classes ordinaires de la deuxième année du primaire : 1) enseignement des propriétés visuelles et des propriétés sémantiques des mots (PVS, n = 43) et 2) enseignement des propriétés visuelles des mots (PV, n = 44). Deux autres classes étaient associées à la condition contrôle (C, n = 44). Dans les deux conditions expérimentales, 24 mots ont été enseignés au total. La moitié des mots a été entrainée en contexte de lecture et l’autre moitié en contexte de lecture et d’écriture. Pour évaluer les apprentissages, les participants ont réalisé une dictée de phrases trouées avant l’intervention (prétest), une semaine après l’intervention (post test immédiat) et six semaines après (post-test différé). Des analyses de variance ont été menées pour comparer les performances des élèves des différentes conditions (PVS, PV et C) avant et après l’intervention. Les résultats montrent que l’intervention offerte dans les conditions PVS et PV a mené à des gains, ce qui n’a pas été observé chez les élèves de la condition C. De plus, les gains réalisés se maintiennent plus d’un mois après la fin de l’intervention. Enfin, les résultats indiquent que l’entrainement des mots en contexte de lecture et d’écriture favorise davantage l’apprentissage que l’entrainement des mots en contexte de lecture seulement. Ces résultats amènent un éclairage intéressant au sujet des pratiques que les enseignants devraient privilégier pour favoriser l’apprentissage de l’orthographe lexicale.

Keyphrases: orthographe, enseignement, apprentissage de l’orthographe, français, écriture
Biceps brachii synergy and its contribution to target reaching tasks within a virtual cube

Ces dernières années, des travaux importants ont été observés dans le développement du contrôle prothétique afin d'aider les personnes amputées du membre supérieur à améliorer leur qualité de vie au quotidien. Certaines prothèses myoélectriques modernes des membres supérieurs disponibles dans le commerce ont de nombreux degrés de liberté et nécessitent de nombreux signaux de contrôle pour réaliser plusieurs tâches fréquemment utilisées dans la vie quotidienne. Pour obtenir plusieurs signaux de contrôle, de nombreux muscles sont requis mais pour les personnes ayant subi une amputation du membre supérieur, le nombre de muscles disponibles est plus ou moins réduit selon le niveau de l’amputation. Pour accroître le nombre de signaux de contrôle, nous nous sommes intéressés au biceps brachial, vu qu’anatomiquement il est formé de 2 chefs et que de la présence de compartiments a été observée sur sa face interne. Physiologiquement, il a été trouvé que les unités motrices du biceps sont activées à différents endroits du muscle lors de la production de diverses tâches fonctionnelles. De plus, il semblerait que le système nerveux central puisse se servir de la synergie musculaire pour arriver à facilement produire plusieurs mouvements. Dans un premier temps on a donc identifié que la synergie musculaire était présente chez le biceps de sujets normaux et on a montré que les caractéristiques de cette synergie permettaient d’identifier la posture statique de la main lorsque les signaux du biceps avaient été enregistrés. Dans un deuxième temps, on a réussi à démontrer qu’il était possible, dans un cube présenté sur écran, à contrôler la position d’une sphère en vue d’atteindre diverses cibles en utilisant la synergie musculaire du biceps. Les techniques de classification utilisées pourraient servir à faciliter le contrôle des prothèses myoélectriques.

Keyphrases: membre supérieur, prothèses myoélectriques, biceps brachial, cube virtuel, synergie musculaire, électromyographie, cibles
Revues systématiques et méta-analyses en chirurgie cardiaque : défis et solutions

Objectif: Explorer, adapter et développer de nouvelles méthodologies permettant de réaliser des revues systématiques et méta-analyses en chirurgie cardiaque. Méthodes: Le text mining et la citation chasing ont été utilisés pour l’optimisation de l’efficience et de la sensibilité de la recherche. Nous avons participé à l’évaluation des nouveaux outils (Risk of Bias 2.0 et Risk of bias in non-randomized studies of interventions) pour l’évaluation de la qualité des études randomisées et non randomisées et qui ont été adoptés pour nos projets futurs. Une nouvelle méthodologie graphique a été développée pour la réalisation des méta-analyses de données de survie. Résultats: Ces approches ont été utilisées pour répondre à diverses questions de recherche touchants différents aspects de la chirurgie cardiaque : 1) la rédaction des premières lignes directrices de l’Enhanced Recovery After Cardiac Surgery, 2) une  revue systématique des résultats de la chirurgie valvulaire et aortique chez le transplanté cardiaque, démontrant les bons résultats de ces procédures dans une population à haut risque et l’émergence des techniques trans-cathéters dans la prise en charge de ces pathologies, 3) une méta-analyse portant sur les arythmies supra-ventriculaires chez les patients ayant eu une intervention de Fontan, concluant à un effet bénéfique de la technique du conduit extra-cardiaque et 4) une méta-analyse portant sur l’insuffisance aortique chez les patients porteurs d’assistance ventriculaire gauche, objectivant une incidence sous-estimée de cette situation clinique avec un impact significatif sur la survie de cette population de patients. Conclusion: Cette thèse aborde certaines contraintes de la littérature en chirurgie cardiaque comme la sensibilité sous optimale de la recherche systématique et les méta-analyses de données de survie, et  a proposé des solutions. D’autres contraintes telles que les comparaisons multiples subsistent. Des recherches futures axées sur de nouvelles approches comme le network meta-analysis ou l’approche bayésienne pourraient offrir des solutions.

Keyphrases: Revue systématique, méta-analyse, méthodologie, données de survie, chirurgie cardiaque, Meta-analysis, Cardiac surgery
Youth employment incentives : activation policy in Denmark, France and the United Kingdom (2008-2016)

Les jeunes (15 à 29 ans) sont particulièrement vulnérables aux chocs économiques et la capacité à intégrer le marché du travail est une étape importante influençant leur bien-être à long terme. La crise financière de 2007-08 a donc eu des effets importants sur eux. En réponse, les États capitalistes avancés ont adopté une série de politiques pour aider les jeunes. Pourtant, malgré ces nouvelles politiques, les dépenses publiques pour le marché du travail n’ont pas augmenté de manière stable lors de la période. Les analyses récentes semblent confirmer qu’au lieu d’investir dans les programmes plus dispendieux, les États adoptent des politiques axées sur une rhétorique de droits et de responsabilités. En effet, selon certains chercheurs, les États ont adopté des politiques qui créent des incitatifs pour joindre le marché du travail au lieu d’investir dans le capital humain. La recherche actuelle appuie l'argumentaire que les États-providence convergent autour de politiques de faible coût. Nonobstant les pressions pour le changement, les États ont différents besoins. Ainsi, il reste improbable qu’ils adoptent les mêmes solutions. Aucune analyse récente n’a étudié les politiques d’emploi des jeunes adoptées depuis la crise financière. Cette thèse pose alors la question, comment est-ce que les États-providence ont modifié leurs politiques de transition depuis la crise financière? La thèse répond à cette question à partir de trois cadres analytiques du changement politique. Ces cadres sont appliqués à trois études de cas : le Danemark, la France et le Royaume-Uni.  Afin de pleinement considérer ces politiques dans toute leur complexité, cette thèse se sert d'une typologie des incitatifs d'activation pour comparer des mélanges d'instruments entre gouvernements. Une fois les mélanges d'incitatifs déterminés, une analyse de process-tracing détermine comment les États ont modifié leurs politiques de transition depuis la crise financière. Ces recherches nous permettent de constater que ces trois pays ont adopté de nouvelles politiques pour l’emploi des jeunes depuis la crise financière. Dans chaque étude de cas, les États ont adopté des politiques qui perpétuent la logique d’action dominante. Or, chaque étude de cas a aussi adopté des politiques qui dévient de la logique d’action dominante. Ces changements sont expliqués à l'aide de trois cadres théoriques, l'apprentissage, les ressources et l'institutionnalisme historique. Cette recherche contribue à la littérature de l'État-providence en outrepassant la littérature existante et donnant un rapport détaillé des politiques d'activation pour les jeunes et de leur adoption depuis la crise financière.

Keyphrases: État providence comparé, jeunesse, activation, politiques de transition, politiques du marché du travail, changement institutionnel
Les réseaux de trafic de drogue à Genève, Suisse : application des outils d'analyse de réseaux sociaux

Le projet de maîtrise qui fait l’objet de ce rapport de recherche s’intéresse à l’application des méthodes d’analyse de réseaux sociaux (ARS) sur des réseaux de trafic de drogues actifs dans le canton de Genève, en Suisse. Deux objectifs généraux encadrent cette étude. Le premier est d’enrichir les connaissances empiriques sur l’utilisation des techniques d’ARS dans les enquêtes policières; et le second est de proposer des recommandations pratiques afin d’optimiser les interventions de la police dans la lutte contre le trafic de stupéfiants. Pour ce faire, deux réseaux sont étudiés, chacun ayant fait l’affaire d’une enquête par la Brigade des stupéfiants (BSTUP) de la Police cantonale de Genève. La première affaire concerne un réseau de trafic de cocaïne (affaire LITOS), et la seconde un réseau de trafic d’héroïne (affaire VRAN). Dans l’analyse de ces deux réseaux, il s’agit tout d’abord d’évaluer leur structure, ensuite d’identifier les trafiquants clés, puis de mesurer le potentiel de fragmentation de chacun des réseaux. L’importance de certains attributs est également examinée, notamment l’appartenance ethnique des trafiquants et leurs liens familiaux et intimes.   Les résultats dévoilent que les réseaux des deux affaires adoptent une structure dite ‘sans-échelle’ et centralisée autour de quelques trafiquants faisant partie du cœur du réseau. Les deux réseaux se structure également de sorte à former des cliques, lesquelles s’organisent autour des trafiquants au centre qui partagent de nombreux liens familiaux ou intimes. Dans les deux réseaux, les participant centraux sont également les courtiers principaux. Cependant, le réseau LITOS montre la présence d’un courtier positionné plus stratégiquement, et qui fait partie de la minorité d’acteurs clés non-appréhendés aux aboutissants de cette affaire. Quant au potentiel de démantèlement des réseaux, les analyses démontrent qu’il est possible, dans les deux cas, d’arriver à une fragmentation complète des réseaux, brisant tous les liens entre les acteurs non-retirés. Si l’on regarde les arrestations réellement effectuées par les policiers, l’on voit pour le réseau LITOS que les enquêteurs ont presque entièrement démantelé ce réseau, en arrêtant la majorité des trafiquants importants. Pour le réseau VRAN, les arrestations réelles ont aussi eu un impact de fragmentation considérable, mais la non-arrestation de certains acteurs clés empêche un démantèlement total. De plus, l’étude de ces deux affaires suggère la présence d’un avantage comparatif pour certaines minorité ethniques dans le trafic de stupéfiants, et révèle l’importance des liens de parenté et intimes entre les trafiquants quant à la structure et au fonctionnement de ces réseaux de trafic. Découlant des résultats et de leur interprétation, cinq recommandations policières sont également proposées.

Keyphrases: Analyse de réseaux sociaux, Trafic de drogue, Données policières, Démantèlement, Analyse criminologique