NCube/papyrus huggingface dataset:
Impact de Heterodera glycines sur la réaction de défense du soya (Glycine max) et influence sur la gestion de Aphis glycines dans un contexte climatique actuel et futur

La culture du soya (Glycine max) est l’une des plus importantes au Québec depuis la dernière décennie. Néanmoins, les changements climatiques et les échanges commerciaux ont permis l’établissement de nouveaux ravageurs, mettant ainsi la culture en péril. C’est le cas du puceron du soya, Aphis glycines et du nématode à kyste du soya, Heterodera glycines qui ont une aire de distribution commune au Québec depuis 2013. Les interactions entre ces organismes sont peu connues et pourraient avoir un impact négatif sur la culture, notamment dans un contexte de changements climatiques. Nous avons étudié l’effet de l’infestation du nématode sur les traits d’histoire de vie du puceron sur différents cultivars, sensibles et résistants aux nématodes, et dans différentes conditions climatiques. Aucun effet du nématode n’a été détecté sur le temps de développement, la longévité et la fécondité du puceron. Le séquençage du transcriptome de feuilles de soya a mis en évidence 36 gènes différemment exprimés lors de la présence du nématode sur les racines. Parmi ces gènes, 23 sont directement liés à l’activation, au transport ou à la synthèse d’acide salicylique, une hormone de défense naturellement produite par la plante lors d’une infestation de pucerons. Toutefois, cette dernière n’a pas d’impact négatif sur les traits d’histoire de vie de l’arthropode dans les conditions climatiques actuelles ou en simulant la concentration de CO2 de 2050. Il semble que le puceron soit peu sensible à cette phytohormone, mais qu’elle pourrait avoir un effet répulsif chez les pucerons ailés fondateurs lors du choix de la plante à coloniser au printemps.

Keyphrases: Dynamique des populations, Réaction de défense végétale, Parasitisme, Interaction souterraine/aérienne, Trait d’histoire de vie
Impacts de l’urbanisation et de l’historique d’utilisation des sites sur la diversité taxonomique et fonctionnelle de la flore des milieux humides non-riverains

L’urbanisation est l’une des principales causes de l’homogénéisation biotique dans le monde. Ce mémoire de maîtrise vise à comprendre les effets de l’urbanisation et de l’historique de l’utilisation du paysage sur l’assemblage des communautés végétales dans les milieux humides non-riverains. L’inventaire floristique de 67 marais et marécages a été réalisé sur le territoire de Laval. La richesse taxonomique, la diversité fonctionnelle ainsi que la diversité bêta taxonomique et fonctionnelle ont été comparées selon le type de milieu humide (marais ou marécage), l’origine des espèces (indigène ou exotique), le niveau d’urbanisation (urbain ou rural) et l’historique d’utilisation du site (agricole ou naturelle). Aucun effet de l’urbanisation et de l’historique d’utilisation agricole du site n’a été détecté sur la richesse taxonomique et la diversité fonctionnelle, dont les principales différences étaient plutôt attribuables à l’origine des espèces et au type de milieu humide. L’urbanisation et l’historique d’utilisation agricole du site n’ont induit aucune différence au niveau de la diversité bêta, mais étaient associées à d’importants changements dans la composition en espèces et en traits des communautés. Alors que la composition floristique des marais était davantage influencée par le niveau actuel d’urbanisation au pourtour des sites, celle des marécages reflètait plutôt les effets des perturbations agricoles in situ passées. De façon générale, les espèces exotiques avaient un rôle homogénéisateur sur la flore. Globalement, mes résultats indiquent que la compréhension des impacts de l’urbanisation sur les communautés floristiques des milieux humides non-riverains nécessite l’intégration de plusieurs facteurs agissant à différentes échelles temporelles.

Keyphrases: Homogénéisation biotique, Marais, Marécage, Espèces exotiques, Diversité alpha et bêta, Traits fonctionnels, Historique du paysage, Assemblage des communautés
Évaluation des facteurs influençant l’avortement des oeufs de la punaise marbrée Halyomorpha halys Stål (Hemiptera: Pentatomidae) par la guêpe parasitoïde Telenomus podisi Ashmead (Hymenoptera: Scelionidae)

Les parasitoïdes se développent sur, ou, à l'intérieur d'un hôte qu’ils tuent au cours de leur développement. Ils sont souvent utilisés en lutte biologique car ils ont la capacité de réduire et de contrôler les populations d’organismes considérés comme nuisibles. Nous avons investigué la capacité de la guêpe parasitoïde Telenomus podisi à induire l’avortement des oeufs de son hôte : la punaise exotique Halyomorpha halys. Cette nouvelle association d’espèce ne permet pas à la guêpe de se reproduire, mais elle induit un taux d’avortement des oeufs de l’hôte, néanmoins variable d’une guêpe à l’autre. Nos trois expériences ont permis de déterminer que 1) le taux d’avortement suit la grosseur de l’oeuf, qu’il soit parasité ou non. Que ce taux d’avortement est encore plus important lorsque parasité par des guêpes de plus petite taille. 2) Le taux d'avortement est expliqué à 18.2% par la génétique des guêpes (h2 = 0,182). 3) Il est difficile de générer une population de T. podisi capable d’induire un taux d’avortement élevé après 5 générations de reproduction sélective. Nous ouvrons, par ces résultats, une piste en matière de lutte biologique contre l’insecte ravageur qu’est H. halys. L’utilisation de petites guêpes permettrait de réduire la reproduction de la punaise. Mais aussi, qu’à la lumière du contenu de ce mémoire, un programme de reproduction sélective pourrait être optimisé pour produire des guêpes performantes en matière d’avortement des oeufs de H. halys.

Keyphrases: Avortement des oeufs, Hôtes, Reproduction sélective, Héritabilité, Lutte biologique, Mortalité non-reproductive
Le microbiome fongique de la rhizosphère du canola : structure et variations

Les champignons de la rhizosphère ont une grande influence sur le développement et la croissance des plantes. Certains de ces micro-organismes protègent les plantes contre les pathogènes, atténuent l'impact des stress abiotiques ou facilitent la nutrition des plantes. Ces organismes s'influencent mutuellement et forment des réseaux complexes d'interactions. Déterminer le fonctionnement du microbiome fongique de la rhizosphère des plantes cultivées est une étape nécessaire pour optimiser l'efficacité de la production végétale. Nous avons testé les hypothèses suivantes : (1) la diversification des systèmes de culture influe sur le microbiome fongique de la rhizosphère du canola; (2) le canola a un core microbiome, soit un ensemble de champignons toujours associés au canola quelles que soit les conditions du milieu; et (3) que certains de ces taxons ont une influence déterminante sur la structure des communautés (taxons nodaux) dans le core microbiome. Pour ce faire, en 2013 et 2016, nous avons échantillonné à la floraison, la phase de canola (Brassica napus) du système de culture, qui est l'un des deux types de canola (Roundup Ready® et Liberty Link®), utilisés dans le cadre d'une expérience de terrain à long terme (6 ans). Lacombe (Alberta), Lethbridge (Alberta) et Scott (Saskatchewan). En utilisant le séquençage d’amplicon par illumina, nous avons obtenus des résultats qui montrent que la diversification des cultures a un impact significatif sur la structure des communautés fongiques de la rhizosphère. Nous avons également découvert et décrit un core microbiome constitué de 47 OTU (Unité Taxonomique Opérationnelle) en 2013 et identifié Preussia funiculata, Schizothecium sp., Mortierella sp., Nectria sp. ainsi que deux taxons inconnus (OTU12 et OTU298) comme taxons nodaux parmi ce core microbiome. Cependant ce core microbiome s’est montré variable, et nous n’avons pu identifier qu’un OTU y appartenant en 2016 : Olpidium Brassicae. Nos résultats permettent de confirmer l’impact de la diversité culturale sur le microbiome fongique du canola et sont présentés comme une base pour le développement de stratégies d'ingénierie écologique pour l'amélioration de la production de canola.

Keyphrases: Microbiome, Brassica napus, Communautés fongiques, Écologie microbienne, Agrosystèmes, Rotations de cultures
Impact du boisement des tourbières ombrotrophes sur leur diversité floristique

L'objectif de ce mémoire est de comprendre les effets du phénomène récent de boisement sur la richesse et la diversité de la végétation des tourbières ombrotrophes isolées dans une matrice agricole. Un dispositif d'échantillonnage niché a été utilisé pour comparer la richesse spécifique et la diversité bêta des milieux ouverts et boisés de 14 tourbières ombrotrophes des basses terres du Saint-Laurent, et ce, aux échelles régionale et locale (respectivement inter- et intra-tourbières). La surface terrière des arbres, l'ouverture de la canopée et l'âge des peuplements forestiers ont également été mesurés dans les milieux boisés. Des tests de t par permutations pour données appariées ont été utilisés pour comparer la richesse spécifique entre les sites ouverts et boisés. La diversité bêta a été calculée comme la similarité de la composition entre les sites, puis comparée en utilisant des tests d'homogénéité des dispersions multivariées. Les milieux boisés avaient une plus grande richesse spécifique que ceux ouverts, en raison d'un enrichissement en espèces facultatives des tourbières et non tourbicoles, ainsi qu'en plantes vasculaires semi-tolérantes et tolérantes à l'ombre. Aux deux échelles étudiées, l'enrichissement en espèces était associé à une différenciation floristique (hausse de diversité bêta), mais uniquement chez les bryophytes dans le cas de l'échelle régionale. La surface terrière des arbres était corrélée positivement à la richesse spécifique des milieux boisés. Ces changements de composition associés au boisement suggèrent une hausse de la similarité entre la flore des tourbières et celle des forêts avoisinantes, et donc une baisse de la diversité régionale.

Keyphrases: Boisement, Dispersion multivariée, Diversité bêta, Homogénéisation biotique, Remplacement des espèces, Richesse spécifique, Tourbières ombrotrophes
Contribution of the subthalamic nucleus to visually guided locomotion

Les ganglions de la base (GB) jouent un rôle important dans le contrôle locomoteur. Ceci est illustré par les troubles locomoteurs dont souffrent les patients atteints de maladies dégénératives qui affectent les GB, telles que la maladie de Parkinson, caractérisées par de petits pas lents et traînants, ainsi qu’un gel de la marche (freezing of gait). Une structure centrale dans les GB est le noyau sous-thalamique (NST), de par son rôle de structure d’entrée et ses projections vers le globus pallidus. Cependant, la nature de la contribution du NST au contrôle de la locomotion, ainsi que les caractéristiques de son activité cellulaire durant la marche, sont peu connues. Afin de mieux comprendre cette contribution, nous avons examiné les propriétés de l’activité neuronale du NST lors de la locomotion non-obstruée et celle sous guidage visuel. Ainsi, nous avons effectué des enregistrements neuronaux chez un chat intact, entraîné à marcher régulièrement sur un tapis roulant et à franchir des obstacles se déplaçant à la même vitesse. Nous avons enregistré 40 cellules montrant une activité reliée au movement du membre antérieur, dont 30 ont montré une activité phasique au cours de la locomotion non obstruée liée aux différentes phases du cycle de la marche, principalement la phase de balancement. Au cours de la modification volontaire de la marche, un groupe de 37/40 cellules, incluant certaines qui étaient modulées pendant la locomotion non-obstruée, ont changé leur fréquence de décharge par rapport à l’obstacle. Ces changement étaient principalement des augmentations de fréquence, mais parfois des diminutions ou une diminution suivie d’une augmentation. Ces modifications se produisaient soit avant l’enjambement de l’obstacle (step-advanced), soit lors de l’enjambement de l’obstacle (step-related). L’activité des cellules step-advanced était indépendante des membres (limb-independent), tandis que celle des cellules step-related était spécifique aux membres (limb-dependent). Cette étude est la première à examiner les caractéristiques de décharge du NST lors de la marche et montre que cette structure contribue au contrôle de la locomotion non obstruée ainsi que la modification volontaire de la marche, en jouant un rôle dans la planification et l’exécution de cette dernière.

Keyphrases: Ganglions de la base, noyaux sous thalamiques, modification volontaire de la marche, locomotion sous guidage visuel, locomotion
Changes in Frame of Reference After Exposure to Emotional Stimuli

L'hypothèse de la présente étude était que le développement émotionnel culmine chez les personnes âgées. Ceci s'expliquerait par un changement perceptif de l'importance des stimuli négatifs au cours des décennies de la vie. L'effet de positivité ou le biais de positivité (EP) serait alors le résultat de la désensibilisation aux stimuli négatifs chroniques liés à l'expérience de la vie. Cette recherche présente une preuve de concept en induisant l'EP chez les jeunes adultes par l'exposition à des types spécifiques de stimuli émotionnels. Plus précisément, 39 participants ont été assignés au hasard à deux groupes: le premier groupe fût exposé à des visages tristes seulement et le second à des visages neutres seulement. Les participants ont complété une évaluation de référence et trois évaluations de comparaison où ils ont dû qualifier les expressions faciales sur une échelle dimensionnelle. Entre ces évaluations, ils ont été exposés aux stimuli spécifiques à leur groupe tout en accomplissant une tâche de mémoire de travail pour maintenir leur attention. Le temps requis pour désensibiliser les jeunes adultes normaux a été estimé à l'aide d'un plan d'expérience en blocs puisqu'il s'agissait d'une étude exploratoire. Les symptômes dépressifs et l'anxiété ont été mesurés avant la procédure expérimentale. L'humeur et l'excitation ont été mesurées avant et après la procédure expérimentale. Tout comme les personnes âgées qui expriment l'EP, les participants jeunes adultes ont qualifié les stimuli négatifs de moins négatifs, et les stimuli neutres comme plus positifs au fil du temps. Mots-clés : Effet de positivité; biais de positivité; développement humain; développement émotionnel; priming; jeunes adultes; vieillissement; émotion; personnes âgées; cadre de référence.

Keyphrases: Priming, Effet de positivité, Biais de positivité, Développement humain, Développement émotionnel, Priming, Jeunes adultes, Vieillissement, Émotion, Personnes âgées, Cadre de référence
Contribution respective du rejet par les pairs et de l’agressivité des amis aux fonctions réactive et proactive de l’agressivité : une étude associative génétiquement contrôlée

Le premier objectif de la présente étude est de déterminer la contribution respective et possiblement différentielle du rejet par les pairs et de l’agressivité des amis relativement à l’agressivité réactive et à l’agressivité proactive lorsqu'un seul enfant par famille est impliqué; ces analyses correspondent aux études associatives classiques fondées sur des résultats singuliers (i.e. les résultats d'un enfant par famille). Le second objectif est d’examiner à nouveau les liens précédents tout en contrôlant les possibles corrélations gène-environnement par l'entremise de la méthode des différences intra-paires chez des jumeaux monozygotes (MZ); celle-ci permet en effet de contrôler les influences génétiques et les influences environnementales partagées par les jumeaux MZ vivant ensemble. Les données ont été recueillies auprès de 156 paires de jumeaux MZ à 10 ans (80 paires de filles); ceux-ci font partie de l’Étude de Jumeaux Nouveau-Nés du Québec (ÉJNQ). Les résultats montrent que l’agressivité proactive est liée à l’agressivité des amis tant au niveau des résultats singuliers qu'au des différences intra-paires chez les singletons. En revanche, aucun résultat significatif n’a pu être observé quant au lien entre l’agressivité réactive et le rejet par les pairs ou l'agressivité des amis. Différentes pistes d’explications sont proposées pour comprendre les résultats et pour guider les études futures.

Keyphrases: Agressivité réactive, Agressivité proactive, Corrélations gène-environnement, Rejet par les pairs, Agressivité des amis, Facteurs génétiques, Transition enfance et adolescence
Le lien prédictif entre le sentiment d’efficacité des enseignants, l’engagement cognitif et les buts d’accomplissement des élèves de la 4e à la 6e année du primaire

L’engagement scolaire est un prédicteur important de la réussite scolaire et un facteur de protection contre le décrochage. L’engagement cognitif combiné aux buts de maîtrise plutôt qu’aux buts de performance des élèves rendent compte d’un apprentissage autorégulé qui permet à l’élève une meilleure compréhension de la matière et des aspirations scolaires plus grandes. Plusieurs facteurs peuvent favoriser l’apprentissage autorégulé de l’élève dont le sentiment d’efficacité de l’enseignant. Cette influence potentielle pourrait être expliquée par la mise en place par l’enseignant du climat motivationnel de la classe axé sur la maîtrise de la matière plutôt que la performance. Dans cette étude, les données de 373 élèves et 38 enseignants d’écoles primaires en milieux défavorisés à Montréal ont été étudiées à l’aide d’un devis longitudinal et des analyses de cheminement multiniveaux. Les résultats montrent qu’un haut sentiment d’efficacité de la part de l’enseignant prédit l’adhésion des élèves aux buts de maîtrise. Il prédit aussi la mise en place d’un climat motivationnel axé sur la maîtrise de la matière ce qui influence à la baisse les buts de performance des élèves. Ces résultats sont cependant marginalement significatifs et aucun lien n’a été observé entre le sentiment d’efficacité de l’enseignant et l’engagement cognitif des élèves dans cette étude.

Keyphrases: sentiment d’efficacité, engagement cognitif, climat motivationnel, buts de maîtrise, buts de performance
La relation entre les interactions positives avec l’enseignant et les pairs sur l'engagement affectif des élèves du primaire immigrants et non-immigrants en milieux défavorisés

La relation chaleureuse maître-élève et le sentiment d’acceptation par les pairs ont une influence positive sur l’engagement des élèves et notamment, des élèves issus de l’immigration de milieux défavorisés. Pourtant, à notre connaissance, aucune étude n’a exploré l’influence conjointe de ces facteurs sur l’engagement affectif des élèves du primaire. De plus, malgré un intérêt marqué dans les écrits scientifiques pour l’engagement scolaire et ses trajectoires, ainsi qu’une hausse de la population immigrante dans plusieurs pays industrialisés, dont le Canada, les recherches sur l’engagement scolaire des élèves issus de l’immigration au primaire sont limitées. Cette étude a pour objectif d’étudier l’influence différentielle et possiblement additive ou multiplicative des relations chaleureuses avec l’enseignant ainsi que du sentiment d’acceptation par les pairs sur l’engagement affectif en français et en mathématiques des élèves du primaire de milieux défavorisés, issus ou non de l’immigration. Les données ont été recueillies auprès de 130 élèves du troisième cycle du primaire au cours de deux années scolaires consécutives. Les résultats des analyses corrélationnelles montrent que la relation chaleureuse maître-élève est liée positivement à l’engagement affectif de tous les élèves en français et en mathématiques, comparativement à l’acceptation par les pairs qui n’est pas associée à celui-ci. De plus, ces facteurs relationnels interagissent ensemble uniquement chez les élèves issus de l’immigration. En effet, chez ces derniers, la qualité de la relation avec l’enseignant s’avère associée positivement à l’augmentation en cours d’année de l’engagement affectif en français, mais seulement lorsque les élèves présentent un plus faible sentiment d’acceptation sociale. Les implications pour la recherche et la pratique sont discutées.

Keyphrases: engagement scolaire, milieux défavorisés, relation maître-élève, relations avec les pairs
Étude de semiconducteurs par des techniques de spectroscopie quantique

Ce mémoire de maîtrise est consacré à la mise en place d'une technique de spectroscopie quantique comme nouvel outil de caractérisation. La spectroscopie quantique, tout comme la spectroscopie classique, consiste en l'étude des matériaux avec la lumière. La différence est le type de lumière utilisé. Dans le cas présent, on utilise comme sonde des paires de photons qui partagent une propriété très intéressante, soit l'intrication. Les propriétés quantiques que nous promet l'intrication peuvent être utilisées pour donner un net avantage à la lumière quantique sur la lumière dite classique, d'un point de vue spectroscopique. Dans un premier temps, les nombreux avantages qu'offre la spectroscopie quantique seront revus, en explorant les différentes techniques que propose la communauté.  En second lieu, les outils théoriques nécessaires à la bonne compréhension du phénomène de génération de photons intriqués, soit la conversion paramétrique spontanée, seront exposés. Ensuite, l'importance de la fonction de corrélation de second ordre dans le formalisme qui décrit la détection de photons intriqués sera discutée. De plus, les propriétés spectrales non classiques du biphoton, soit une paire de photons intriqués, seront exposées. On décrira ensuite les détails expérimentaux portant sur la mise en place d'un interféromètre de type Hong-Ou-Mandel, où l'un des bras contient un matériau à caractériser. L'interaction avec le matériau modifiera les propriétés du biphoton, ce qui sera visible dans le creux d'anti-corrélation causé par l'interférence quantique à deux photons.  Malgré l'impossibilité d'observer ce creux d'anti-corrélation à cause du trop faible couplage de la source dans l'interféromètre, la génération de paires de photons intriqués a tout de même été observée. De plus, la possibilité d'observer de l'interférence à deux photons a été montrée en mesurant des oscillations quantiques issues d'interférences à un photon. Cela valide la possibilité d'utiliser cette technique spectroscopique comme nouvel outil de caractérisation.

Keyphrases: Biphoton, Spectroscopie quantique, Conversion paramétrique spontanée, Intrication, Interférence quantique