NCube/papyrus huggingface dataset:
The self and its complicated relationship with writing in The Diary

Ma mémoire présente ma nouvelle «The Diary». J’explore les conflits psychologiques qui surgissent chez une personne lorsqu'il n'est pas à l'aise avec sa façon de penser et d'agir. Mon histoire représente le complexe d'infériorité de Shadi, sa culpabilité et sa conscience. Sa soeur jumelle, Shadia, est le soi de l'écrivain, Shadi. Il se cherche en elle depuis son enfance. Shadi devient un escroc pour explorer des thèmes pour sa nouvelle pièce de théâtre. L'ego de Shadi est une résultante du patriarcat. Dans l'analyse de «The Diary», mon approche est principalement psychanalytique. J'utilise The Mad Woman in the Attic par Sandra Gilbert et Susan Gubar pour soutenir le thème principal de mon histoire. Shadi emprisonne sa soeur Shadia dans ses écrits car il veut se battre contre son complexe d'infériorité provenant de l'intelligence de sa soeur jumelle. Shadia sort du texte de l'écrivain pour parler à l'auteur. Les travaux de Sigmund Freud contribuent à expliquer la démence de Shadi. La soeur est la partie inconsciente de l'esprit de Shadi. Elle est son super-ego alors qu'elle est sa conscience. J'utilise aussi Madness and Modernism de Louis A. Sass pour la étudier la démence de mon protagoniste, Shadi. Simone de Beauvoir déclare que la femme est considérée comme l'autre. J'utilise l'autre en psychose comme un concept positif bien qu'il invoque des sentiments de terreur. The Anxiety of Influence de Harold Bloom m'aide à décrire la rébellion de mon protagoniste masculin contre ses précurseurs. «The Laugh of Medusa» d’Hélène Cixous explique l'importance de l'écriture féminine dans les poèmes de Shadi qui les écrits dans un état de démence.

Keyphrases: La démence, L'art, Féminisme, Le soi, L'écrit, Madness, Art
Consommateurs de pornographie juvénile et agresseurs sexuels, du pareil au même? Comparaisons sur le plan développemental et comportemental

Objectif. L’objectif principal de ce mémoire consiste à comparer trois groupes de délinquants sexuels sur différents facteurs au plan développemental, psychologique et comportemental (consommateurs de pornographie juvénile, consommateurs de pornographie juvénile avec victime et agresseurs sexuels). Cette comparaison permettra aussi d’observer avec quel groupe les consommateurs de pornographie juvénile avec victime  manifestent le plus de similarités. De plus, il sera question d’examiner le poids des différents facteurs retenus en lien avec l’appartenance à l’un des trois groupes de délinquants sexuels.  Méthodologie. L’échantillon est composé de 50 consommateurs de pornographie juvénile (PJ), 52 consommateurs de pornographie juvénile avec victime (PJV) et de 40 agresseurs sexuels (n= 146). Tous ces hommes ont fait l’objet d’une expertise sexuelle au Centre d’intervention en délinquance sexuelle de Laval (CIDS). Afin de cibler les facteurs les plus intéressants et pertinents, des analyses de Chi-carré et des tests de moyennes ont été menés. Des analyses de régressions logistiques multinomiales ont ensuite été utilisées afin de vérifier le poids des différents facteurs sur l’appartenance à l’un des trois groupes de délinquants sexuels.    Résultats. Les analyses suggèrent que les consommateurs de pornographie juvénile, ainsi que les consommateurs de pornographie juvénile avec victime se différencient significativement des agresseurs sexuels au plan de leur relation avec leur père, de leur consommation de drogues et de pornographie légale, ainsi que par rapport à leur  pratique d’activités à des fins sexuelles. De plus, le groupe de consommateurs de pornographie avec victime se différencie sur seulement un élément lorsqu’on le compare au groupe de consommateurs de pornographie juvénile; les individus du  premier groupe auraient tendance à présenter plus d’antécédents criminels non sexuels à leur actif. De plus, il est possible d’affirmer que, selon les résultats obtenus, les consommateurs de pornographie juvénile avec victime s’apparentent davantage aux consommateurs de pornographie juvénile plutôt qu’aux agresseurs sexuels.

Keyphrases: Pornographie juévnile, Agression sexuelle, Délinquance sexuelle, Facteurs de risque
Détection de matériaux énergétiques dans les eaux naturelles souterraines par spectroscopie de résonance des plasmons de surface portable

Au cours des dernières années, les matériaux énergétiques, tels que le 2,4,6-trinitrotoluène (TNT) et le 1,3,5-trinitro perhydro-1,3,5-triazine (RDX), ont été utilisés lors des activités d’entrainement militaire, ayant un impact potentiel sur l’environnement, les bases militaires, la population environnante, la faune et la flore. Sur les champs de tir, les sols à proximité des cibles et autour des positions de tir nécessitent une surveillance particulière, puisqu’il est possible de trouver une importante quantité de résidus d’explosif qui peuvent être transportés vers les eaux de surface et des eaux souterraines avec les précipitations. Toutefois, la procédure actuelle pour détecter des matériaux énergétiques dans l'eau naturelle est complexe, longue, nécessite un personnel hautement spécialisé et augmente le risque de contamination croisée. Par conséquent, il est difficile d'assurer un contrôle rapide et continu des contaminants. En fait, l'objectif des travaux présentés dans ce mémoire est de développer une technique pour identifier et quantifier les explosifs et leurs produits de dégradation dans les eaux naturelles. En outre, ce test doit être in situ, en continu, peu coûteux et rapide. La résonance des plasmons de surface (SPR) a été donc utilisée pour quantifier les matériaux énergétiques. Une matrice de bis-aniline réticulée avec des nanoparticules d’or (AuNPs) est utilisée en tant que polymère à empreinte moléculaire (MIP) sur le film d'or pour capturer sélectivement le composé d’intérêt. L'association de la molécule d’intérêt, tel que le TNT ou RDX, au MIP par interactions π-donneur-accepteur permet la détection d'explosifs suite aux changements d’indice de réfraction sur la sonde. Le couplage entre les plasmons des AuNPs et de la couche d'or peut également augmenter les signaux SPR. Le test optimisé a ensuite été utilisé sur une base militaire canadienne. L'utilisation de cet essai à base de MIP fournit un outil pour l'extraction et la pré-concentration de TNT ou RDX à la surface d’une sonde SPR et permet leur détection en continu de faibles concentrations dans les eaux naturelles.

Keyphrases: Matériaux énergétiques, SPR, plasmon de surface, TNT, RDX, polymère à empreinte moléculaire, MIP, eau naturelle
Investigation of the effects of ceramide-C16 and n-decane on the polymorphism of phosphatidylethanolamine : a 2H and 31P solid-state NMR and differential scanning calorimetry study

Les céramides, dont la structure comporte une chaîne hexadecanoyle (CerC16), une chaîne considérée comme de longueur moyenne, sont des sphingolipides impliqués dans de nombreuses pathologies telles que l’obésité, le diabète, la maladie de Parkinson ainsi que certains types de cancer. La première partie de mon projet de M.Sc. a consisté à utiliser la calorimétrie différentielle à balayage (DSC de l'anglais differential scanning calorimetry) et la spectroscopie RMN séquentielle à l'état solide du deutérium (2H) et du 31P afin d’étudier l'impact du CerC16 (<20 mol%) sur le polymorphisme de la 1-palmitoyl-2-oléoyl-sn-glycéro-3-phosphoéthanolamine (POPE). Les résultats montrent que le CerC16 a un impact majeur.  Il élargit la transition de phase lamellaire gel-fluide (Lβ‒Lα) et la décale vers les hautes températures, ce qui entraîne la création de larges régions de coexistence Lβ/Lα dans le diagramme de phase du système. La présence du céramide entraîne également un élargissement de la transition de phase Lα‒hexagonale inverse (HII) ainsi qu’une diminution de la température qui lui est associée. Lorsque la proportion de CerC16 dans la membrane de POPE est supérieure à 12-13 mol%, les deux transitions se chevauchent, ce qui entraîne la coexistence des trois phases. Ce chevauchement conduit à une transition de phase directe Lβ‒HII. De manière générale, le céramide entraîne donc une multitude d’effets sur les propriétés de la membrane lipidique, de la variation de sa fluidité à la modulation de son rayon spontané de courbure. Certains alcanes de longueurs variables ont le potentiel de favoriser la transition Lα-HII de différentes phosphatidyléthanolamines (PE). Dans la seconde partie de mon M.Sc., j'ai caractérisé les impacts du n-décane-d22 (10 mol%), un alcane à courte chaîne, sur le polymorphisme de la POPE, en exploitant les mêmes techniques de spectroscopie RMN que précédemment. J’ai montré que, malgré une diminution significative de la température associée au début de transition Lα‒HII, la température de la fin de transition restait quant à elle sensiblement inchangée. Globalement, la transition est donc élargie. Nous proposons que les molécules de n-décane se localisent au niveau des bouts de chaînes acyles de la POPE en phase Lα, ce qui engendre des compressions et des contraintes. Il en résulte un décalage du début de transition Lα‒HII vers les basses températures. Lorsque la température augmente, de plus en plus de molécules de n-décane sont transférées vers la phase HII, ce qui réduit les contraintes sur les chaînes acyles de la phase Lα. Le décane comble les espaces entre les cylindres HII et favorise aussi de cette manière la phase non-lamellaire.

Keyphrases: Polymorphisme, Polymorphism, Gel, Liquide Crystalline, Hexagonale Inversée, Diagramme de Phase
Nano-encapsulation : distribution d'un médicament dans une population de micelles polymères et mécanisme de perméabilisation de liposomes photosensibles

L’encapsulation de médicaments est un domaine en plein essor, car les améliorations thérapeutiques envisageables sont significatives. Dans ce cadre, nous avons étudié, par spectroscopie infrarouge à l’échelle nanométrique, la distribution d’un médicament, le SN-38, dans une population de micelles polymères qui en ont été chargées. La proportion médicament/polymère a été mesurée en comparant les intensités de longueurs d’onde propres au médicament et au polymère. Nous n’avons pas pu obtenir un signal satisfaisant pour une micelle isolée. En étudiant un film laissé par l’évaporation d’une suspension de micelles chargées, nous n’avons pas décelé de différence de teneur en médicament dans la population, dans un intervalle de 5 % autour de la composition théorique (10 (p/p) % de médicament), à part quelques rares amas, possiblement des artefacts dus à la préparation de l’échantillon. Dans un second temps, nous avons investigué les paramètres influençant la libération d’une sonde fluorescente (la sulforhodamine B, SRB) encapsulée dans des liposomes photosensibles. Cette libération est provoquée par l’isomérisation photoactivée d’un dérivé monoalkylé d’azobenzène (azo) dans la bicouche. L’azobenzène, lorsqu’il est illuminé avec des UV, passe d’une conformation trans, plane, à une conformation cis plus volumineuse, qui perturbe la bicouche et la rend plus perméable. Les liposomes sont composés de cet azo et de sulfate de cholestérol (SC) en proportion SC/azo 3/1 (mol/mol). Ces lipides sont en phase lo. Nous avons observé une libération très rapide pendant l’isomérisation même, puis une fuite passive en présence d’azo-cis plus importante qu’en présence d’azo-trans. Il a été démontré que la présence d’azo-trans diminue l’ordre d’une bicouche formée de SC et d’un monoalkyle, diminution accentuée lorsque l’azo est en conformation cis. En remplaçant le SC par d’autres lipides, nous avons testé le comportement de l’azo dans d’autres phases. L’isomérisation est plus lente en phase gel, et plus rapide en phase fluide lamellaire désordonnée (ld), par comparaison avec la phase liquide ordonnée (lo). En phase ld, il semble que la mobilité des lipides permette d’accommoder l’isomère cis sans changement de la perméabilité de la bicouche. Notre système en phase gel ne nous a pas permis de faire des mesures reproductibles de libération de SRB.

Keyphrases: perméabilité, sulfate de cholestérol, azobenzène, stérosomes, isomérisation, photolibération, micelles polymères
Développement d’une plateforme de criblage par SPR pour la caractérisation d’inhibiteurs de la DHFR R67

L'objectif du projet de recherche est de développer une méthode de criblage d’inhibiteurs basée sur une technologie émergente, soit un dispositif portatif utilisant la résonance des plasmons de surface (SPR).  La cible du criblage est la dihydrofolate réductase R67 (DHFR R67), une enzyme qui confère une résistance bactérienne à l'antibiotique triméthoprime. Ici, l'enzyme cible est immobilisée sur une surface d'or mince avec des propriétés plasmoniques (optiques) spécifiques qui varient en fonction de la masse des molécules se liant à cette surface. Cette technique permet de suivre les événements de liaison de molécules à la DHFR R67 immobilisée, et ainsi peut permettre l'identification d'inhibiteurs potentiels. Cependant, la masse molaire des inhibiteurs typiquement utilisés lors de criblages préliminaires (i.e. 500-1000 g/mol) est trop faible pour générer un signal SPR détectable. Afin de contrer cette lacune, ce mémoire a pour objet de développer un essai compétitif indirect qui mettra en jeu des molécules de masse supérieure. D’abord, une nanoparticule d'or portant un analogue de substrat se liera à la DHFR R67 immobilisée à la surface d’or, générant ainsi un signal SPR important en raison de la masse molaire élevée de la nanoparticule. Ensuite, lors du criblage d'inhibiteurs potentiels, les nanoparticules liées seront déplacées de l'enzyme cible si la molécule criblée fournit une affinité suffisante. Ainsi, il sera possible de suivre indirectement la liaison d'un inhibiteur à la cible.  Ce projet vise donc à tester et à valider l'approche de criblage SPR appliquée à la DHFR R67.

Keyphrases: Chimie médicinale, Enzymologie, Développement de plateforme de criblage, Résonance des plasmons de surface, Dihydrofolate réductase R67, Biophysique
Altérations des cellules de Schwann périsynaptiques à la jonction neuromusculaire : implications pour la sclérose latérale amyotrophique

La sclérose latérale amyotrophique (SLA) est une maladie neurodégénérative foudroyante provoquant la mort des personnes atteintes à l’intérieur de deux à cinq ans suivant leur diagnostic. La SLA est une maladie caractérisée notamment par la dégénérescence des motoneurones et la destruction de la jonction neuromusculaire (JNM). Bien que la contribution des cellules gliales du SNC au développement et à la progression de la maladie soit bien établie, peu d’études se sont intéressées aux propriétés des cellules gliales à la JNM, les cellules de Schwann périsynaptique (CSPs) dans le contexte de la SLA. Les CSPs sont impliquées dans une multitude de fonctions essentielles à la JNM, dont son établissement lors du développement, son efficacité synaptique, son maintien et sa réparation en cas de blessure. Il a été proposé que la régulation de ces diverses fonctions s’opère via l’activation des récepteurs muscariniques (mAChRs) des CSPs. Puisqu’aucune caractérisation de ces cellules n’a été faite, l’objectif de cette thèse était donc de procéder à une évaluation détaillée de la JNM dans un modèle de souris SOD1 (G37R). Plus particulièrement, je me suis concentrée sur la capacité de détection de la transmission synaptique et de réparation des CSPs. Nos résultats suggèrent qu’un niveau d’activation élevé des mAChRs est un élément déterminant pour la synchronisation des CSPs avec leur synapse et pour leur permettre de procéder à la réparation de la JNM dans des conditions pathologiques de SLA. Dans l’ensemble, ces résultats ont permis d’actualiser la vision de la JNM dans la SLA et sont les premiers à mettre en lumière non seulement les altérations fonctionnelles des CSPs, mais également l’impact physiologique de telles altérations. De plus, les résultats de cette thèse pourraient avoir des implications majeures pour l’avancement des connaissances dans le domaine de recherche sur la SLA, plaçant les CSPs directement sur la liste des cibles thérapeutiques potentielles. Par conséquent, la qualité de vie des patients atteints de cette maladie pourrait être améliorée par la poursuite des travaux issus de cette thèse.

Keyphrases: sclérose latérale amyotrophique, motoneurone, jonction neuromusculaire, cellule de Schwann périsynaptique, récepteur muscarinique, électrophysiologie, immunohistochimie, motoneuron
Magnetic resonance imaging of resting cerebral oxygen metabolism : applications in Alzheimer’s disease

Le contraste BOLD employé dans les études d’imagerie par résonance magnétique fonctionnelle (IRMf) provient d’une combinaison ambigüe de changements du flux sanguin cérébral, du volume sanguin ainsi que du métabolisme oxydatif. Dans un contexte où les fonctions vasculaires ou métaboliques du cerveau ont pu être affectées, tel qu’avec l’âge ou certaines maladies, il est crucial d’effectuer une décomposition du signal BOLD en composantes physiologiquement plus spécifiques. La dernière génération de méthodes d’IRMf calibrée permet d’estimer à la fois le flux sanguin cérébral et le métabolisme oxydatif au repos. Le présent travail est basé sur une telle technique, appelée QUantitative O2 (QUO2), qui, via un model généralisé, prend en considération les changements du flux sanguin ainsi que ceux en concentrations sanguine d’O2 durant des périodes d’hypercapnie et d’hyperoxie, afin d’estimer, à chaque voxel, la fraction d’extraction d’oxygène et le métabolisme oxydatif au repos. Dans la première partie de cette thèse, le protocole d’acquisition ainsi que la stratégie d’analyse de l’approche QUO2 ont été revus afin d’améliorer la stabilité temporelle des réponses BOLD et du flux sanguin, conséquemment, afin d’accroître la fiabilité des paramètres estimés. Par la suite, une évaluation de la variabilité intra- et inter-sujet des différentes mesures QUO2 a été effectuée auprès d’un groupe de participants sains. En parallèle, une analyse de la sensibilité du model à différentes sources d’erreurs aléatoires (issues des mesures acquises) et systématiques (dues aux assomptions du model) a été réalisée. De plus, les impacts du niveau d’oxygène administré durant les périodes d’hyperoxie ont été évalués via une simulation puis expérimentalement, indiquant qu’une hyperoxie moyenne était bénéfique. Finalement, l’influence de la maladie d’Alzheimer sur les changements vasculaires et métaboliques a été explorée pour la première fois en appliquant le protocole QUO2 à une cohorte de patients Alzheimer et à un groupe témoin du même âge. Des différences en terme de flux sanguin, fraction d’oxygène extraite, métabolisme oxydatif, et taux de relaxation transverse R2* au repos comme en réponse à l’hypercapnie, ont été identifiées au niveau du voxel, ainsi qu’au niveau de régions cérébrales vulnérables à la maladie d’Alzheimer. Une liste de limitations accompagnées de recommandations a été dressée en ce qui a trait au temps de transit différé, aux artéfacts de susceptibilité magnétique, de même qu’au défi que représente l’hypercapnie chez les personnes âgées ou atteintes de la maladie d’Alzheimer.

Keyphrases: IRMf calibré, Hyperoxie, Hypercapnie, Exactitude et précision, Métabolisme oxydatif au repos, Fraction d’extraction d’oxygène, Flux sanguin cérébral, Santé vasculaire et métabolique, Maladie d’Alzheimer
Interactions multisensorielles chez les musiciens

Jouer un instrument de musique demande l’interaction des informations provenant de multiples sens. Cette expérience sensorielle a des effets sur les réseaux corticaux et sur les habiletés comportementales chez les musiciens professionnels qui pratiquent pour plusieurs années. L’entrainement musical semble avoir un effet sur les sens, incluant le toucher, mais peu de recherches se sont penchées sur les habiletés tactiles chez les musiciens. L’objectif de cette thèse est d’évaluer les capacités tactiles unisensorielles et multisensorielles non musicales chez les musiciens à l’aide de méthodologies comportementales. La première étude avait pour objectif d’évaluer les temps de réaction auditifs, tactiles, et audiotactiles chez les musiciens. Les temps de réaction de 16 musiciens et 19 membres d’un groupe témoin ont été évalués. Les résultats de cette recherche suggèrent que les musiciens ont des temps de réaction significativement plus rapide pour des stimulations auditives, tactiles, et audiotactiles. La seconde étude avait comme objectif d’évaluer l’interaction d’informations audiotactiles temporelle et spectrale chez les musiciens. Les interactions audiotactiles de 13 musiciens et de 17 membres d’un groupe témoin ont été évaluées à l’aide d’illusions multisensorielles. Les résultats de cette recherche suggèrent que seulement l’interaction audiotactile temporelle est significative différente entre les groupes. La troisième étude avait pour objectif d’évaluer la localisation spatiale tactile chez les musiciens. La localisation spatiale tactile chez 17 musiciens et 20 membres d’un groupe témoin a été évaluée à l’aide de tâche de jugement d’ordre temporel tactile. Les résultats de cette recherche suggèrent que les musiciens ont un taux d’erreur plus élevé pour localiser des stimulations tactiles quand leurs bras sont croisés, mais qu’ils ont des temps de réaction plus rapides pour cette tâche. Généralement, les résultats de ces recherches suggèrent qu’un entrainement musical à long terme améliore les capacités tactiles unisensorielles et multisensorielles, mais seulement pour certaines tâches. D’autres études sont requises afin de mieux comprendre les facteurs de l’entrainement musical menant à ces changements.

Keyphrases: entrainement sensoriel, audiotactile, tactile, musiciens, temps de réaction, illusions multisensorielles, cadres de référence
Structural and Biochemical Characterization of VirB8 Protein in Type IV Secretion Systems

La sécrétion est le passage de macromolécules à travers les membranes cellulaires. Chez les bactéries, la sécrétion est essentielle pour la virulence et la survie. Les bactéries à Gramnégatif utilisent le système de sécrétion de type IV (SST4) pour la sécrétion de toxines et de nucléoprotéines. Les SST4 contribuent notamment à la propagation des gènes de résistance aux antibiotiques. Pour cette raison, les composants du SST4 sont des cibles potentielles pour le développement de médicaments antivirulence. Le SST4 est un complexe protéique qui s’étend entre la double membrane de la bactérie à Gram-négatif. Les protéines qui le composent sont insérées dans les membranes cellulaires ou solubles. Bien que la structure du pore central du SST4 ait été résolue récemment, les détails de l'assemblage et la structure de ce complexe ne sont pas connus. VirB8 est une protéine de la membrane interne qui interagit avec de nombreuses autres sous-unités du SST4. Il s’agit d’un acteur central de l'assemblage du SST4. Des études biophysiques, et notamment des expériences de RMN ont ainsi été réalisées pour caractériser les aspects structuraux des interactions avec VirB8. Des regions dynamiques dans la structure de VirB8 ont été identifiées par spectroscopie RMN lors de la transition entre la forme monomérique et dimérique. Les analyses de cristallographie et de RMN ont révélé des différences structurales dans les régions hélicoïdales (α1 et α4) de VirB8 wild-type et du variant monomérique VirB8M102R. Le criblage de fragments a permis d’identifier de petites molécules capables de se lier à VirB8 ainsi qu’au variant monomérique. Les analyses d’arrimage moléculaire in silico suggèrent que la rainure de surface dans la structure VirB8 est importante pour laliaison de ces petites molécules. Les expériences de RMN et les essais biochimiques révèlent que le feuillet β (β1 en particulier) constitue l'interface d’interaction entre VirB8 et VirB10. Cette interface d’interaction est d’ailleurs importante pour la conjugaison du SST4. De plus, j'ai identifié des changements dans la structure de VirB8 lors de l'interaction avec VirB5. Les études sur la protéine VirB8 nous ont permis de caractériser la séquence d'événements entre VirB8 et d'autres protéines VirB, régulant l'assemblage et la fonction du SST4.

Keyphrases: VirB8, Système de sécrétion de type IV, Résistance aux antibiotiques, RMN, Cristallographie