NCube/papyrus huggingface dataset:
Modèle du pseudo-atome neutre pour l'étude de métaux simples dans le régime de la matière dense et chaude à deux températures

L'étude de la matière dense et chaude (MDC), ce régime  particulier à la frontière entre la phase solide et la phase plasma,  est en pleine effervescence due à ses nombreuses applications en astrophysique et dans le domaine de la fusion nucléaire. Son étude théorique pose plusieurs défis majeurs et le développement d'outils mathématiques appropriés pour ce régime constitue le c\oe ur de cette thèse. En particulier, on s'intéresse à deux états distincts de MDC obtenue par différentes méthodes expérimentales appliquées sur les métaux simples. Le premier cas est la matière ultra-rapide (MUR), cet état où la température du système électronique est très élevée tandis que celle des ions reste à la température ambiante. La MUR ne subit aucune compression et reste à la densité initiale du matériel étudié. La stabilité de ce système est étudiée par le biais du spectre de phonons ainsi que par le calcul de la pression interne qui subit une énorme augmentation. Le deuxième cas est la matière compressée par choc (MCC), où la densité du système peut atteindre deux à trois fois la densité initiale. La température des deux sous-systèmes est considérablement augmentée, mais s'avère ne pas toujours être en équilibre malgré tout. Dans cette thèse, l'étude de la MUR et de la MCC est réalisée à l'aide du modèle du pseudo-atome neutre (PAN) dont la simplicité et l'efficacité s'avèrent idéales pour la MDC. La diffusion Thomson des rayons X, la technique expérimentale la plus utilisée pour obtenir les propriétés de la MDC, nécessite un lissage à un spectre théorique qui est aisément calculable avec le modèle PAN. La conductivité électrique, une propriété fondamentale pour les applications technologiques de  la MDC, est aussi étudiée en détail en comparant les diverses méthodes pour ce type de calculs. Finalement, puisque la création de MDC résulte généralement en des systèmes où la température électronique diffère de la température ionique, l'obtention des propriétés de la MDC dans cet état de quasi-équilibre à deux températures est constamment mis de l'avant tout au long de ce travail et constitue l'un des éléments innovateurs de cette thèse.

Keyphrases: Matière dense et chaude, Métaux simples, Potentiel de paires, Matière ultra-rapide, Matière compressée par choc, Équation d'état, Phonon, Phonon, Quasi-équilibre
Le narcissisme du selfie : esthétique et pratique de la subjectivité contemporaine

Le selfie, par son caractère d’autoportrait et sa pratique répandue de manière épidémique, est souvent considéré comme un symptôme du narcissisme contemporain avec sa culture du moi favorisée par les réseaux sociaux.  Cette vue négative du selfie se base sur la psychanalyse, la figure mythique de Narcisse, et sur toute une critique culturelle. Une évaluation plus nuancée du selfie met plutôt en avant la capacité du selfie à participer à la formation identitaire du sujet.  Chaque chapitre de ce travail répond à une conception particulière du narcissisme. Dans le premier chapitre, nous montrerons que l’erreur fondamentale de Narcisse ne permet pas de bien rendre compte des stratégies visuelles en jeu dans le selfie. Il traitera essentiellement de l’esthétique de l’image selfique. Nous définirons le selfie selon ses caractéristiques visuelles et les effets produits sur son spectateur. Grâce à la définition de ces caractéristiques visuelles, nous pourrons, au deuxième chapitre, établir une archéologie du selfie et proposer une analyse comparative entre le selfie et d’autres pratiques médiatiques qui provoquent des effets visuels similaires. Nous montrerons que ces effets visuels découlent de deux caractéristiques technologiques de l’appareil : sa réflexivité (l’appareil fonctionne comme un miroir) et sa portabilité. Le troisième chapitre sera alors l’occasion de voir la relationnalité du selfie à travers son geste de captation. C’est dans ce troisième chapitre que l’aspect performatif du selfie sera évoqué, et c’est le seul chapitre qui montrera que le concept de narcissisme s’applique de façon très précise à l’analyse du selfie. Enfin, le dernier chapitre considèrera l’environnement numérique de partage du selfie et comment le selfie participe à l’édification d’un nouveau sujet observateur. Cette partie montrera en quoi le selfie est emblématique d’une nouvelle subjectivité contemporaine. Nous verrons comment la subjectivité est affectée, créée, performée, par ce geste selfique qui sert avant tout à une insertion du sujet au sein d’une économie de l’attention.

Keyphrases: Narcissisme, Selfie, Archéologie, Geste, Subjectivité contemporaine, Narcissism
Sur un cinéma élégiaque : de la preuve à la plainte : le deuil, l'archive, la photographie

Cette thèse porte sur un cinéma contemporain dit « élégiaque ». L’élégie, du grec ancien elegos, « chant de deuil », est aujourd’hui définie, par extension, comme une œuvre poétique dont le thème est la plainte – « élégiaque » est donc l’expression poétique du deuil et de la perte, l’emploi du terme en ce cas devant également faire droit au motif de la plainte, qu’il continue d’évoquer autant que son fond endeuillé. Deux principales hypothèses fondent les axes de cette recherche : la première est que cette teneur élégiaque se découvre tout particulièrement dans le suspens du mouvement filmique causé par l’irruption de photographies et d’archives ; la seconde, que l’expansion de ce suspens photographique dans le cinéma contemporain est lui-même largement tributaire de l’extension d’une tendance indiciaire correspondant historiquement à l’après Seconde Guerre mondiale. Le cinéma élégiaque constitue donc en réalité le terme d’un parcours qui débute par les mises en scène des gestuelles de lamentation, revient sur le paradigme indiciaire et examine les écrits portant sur la photographie et les archives. La première partie est consacrée à l’élégie, elle revient sur l’histoire du genre, les thèmes de la plainte élégiaque, du deuil et de la mélancolie étant déclinés historiquement. La seconde partie interroge les figures du deuil monumental à travers l’usage allégorique des corps dans les mises en scène des gestuelles de lamentation au cinéma. La troisième partie revient sur la rupture de la Seconde Guerre mondiale, la découverte des camps de concentration et d’extermination ayant accusé le pouvoir de la mise en scène. La destination indiciaire du medium prend alors les devants dans l’événement que constitue la vision des camps nazis, la nature indicielle de ses images photographiques et filmiques autorisant leur double allégeance au cadre juridique comme au domaine mémoriel. On avance que c’est précisément de cette double allégeance que joue le cinéma élégiaque, en portant l’archive de la preuve à la plainte. On examine cette tendance indiciaire, à travers les écrits de Benjamin, Kracauer et Bazin, et le néoréalisme et l’œuvre de Rossellini en particulier. Les rapports du cinéma à la réalité tels qu’ils ont pu être conçus dans ce cadre sont réexaminés. C’est en ces divers sens que l’on tâche finalement de distinguer dans la dernière partie les formes et les contours d’un cinéma élégiaque, au travers de certaines œuvres d’Artavazd Pelechian, Abbas Kiarostami, Chris Marker et Jean-Luc Godard en particulier – où l’on se demande alors ce qui dans ces œuvres se plaint, ce qui en elles est perdu, et comment cela se montre – comment, donc, le cinéma peut-il se faire l’expression de la plainte élégiaque.

Keyphrases: Élégie, Deuil, Mélancolie, Plainte, Preuve, Cinéma, Photographie, Archives, Histoire, Archives
Palimpsestes de la femme nouvelle dans le récit moderniste au féminin : 1900-1940

L’objet de cette recherche s’articule autour de la construction d’un imaginaire « moderniste » du féminin chez huit femmes auteurs nées durant le dernier tiers du XIXe siècle et appartenant, selon l’histoire littéraire, à divers courants ou mouvements : Rachilde (1860-1953), Marcelle Tinayre (1870-1948), Colette (1873-1954), Lucie Delarue-Mardrus (1874-1945), Valentine de Saint-Point (1875-1953), Natalie Barney (1876-1972), Renée Vivien (1877-1909) et Claude Cahun (1894-1954). Les textes du corpus ont été publiés en France durant une période qui voit l’essor d’un nombre croissant d’écrivaines, soit les années 1900 à 1940. Chacune d’elles ayant une trajectoire singulière, nous avons souhaité inclure au corpus des auteures très connues aujourd’hui, d’autres qui, depuis quelques années, connaissent un regain d’intérêt et d’autres encore qui demeurent très largement inconnues aujourd’hui. Véritables « peintres de la vie moderne » des premières décennies du XXe siècle, observatrices d’un milieu littéraire et artistique en pleine effervescence, ces auteures ont développé l’image kaléidoscopique d’une féminité reconfigurée selon le paramètre du « nouveau », dont nous explorons ici les manifestations textuelles. Les œuvres retenues réinvestissent les grands mythes de la féminité pour proposer une nouvelle mythique du féminin. Face à la mise en œuvre de figures de femme en rupture avec les modèles séculaires, un certain nombre de questions se posent : quelles sont les principales caractéristiques des représentations de ce féminin nouveau genre proposées dans les œuvres ? Où se situent concrètement leurs points de convergence et de divergence ? À travers quelles pratiques scripturaires les auteures transforment-elles l’ancien imaginaire en faveur d’un imaginaire féminin moderniste ? En somme, cette thèse de doctorat, basée sur un corpus d’œuvres publiées durant la première moitié du XXe siècle en France, s’applique à mettre en lumière l’apport des auteures à l’étude au champ littéraire et culturel d’une époque propice aux expérimentations en tous genres, d’une part, et à faire mieux connaître un pan de l’écriture des femmes que l’on avait jusqu’à présent tendance à classer en tant qu’anomalie culturelle, d’autre part.

Keyphrases: Écriture des femmes, Femme nouvelle, Mythes féminins, Modernisme littéraire, Nouvelles études modernistes, Histoires littéraire et culturelle, Écrits de la Première Guerre mondiale, Réécriture
Étude de complexes métalliques d6 à base de ligands tridentés N^N^N et de leurs processus photo-induits inusités

Les trente dernières années ont vue l’apparition et l’évolution de la chimie supramoléculaire, une branche de la chimie permettant de faire le lien entre la chimie moléculaire traditionnelle et la chimie des composés macroscopiques. Le couronnement récent de pionniers de la chimie des supramolécules par le comité Nobel, Jean-Pierre Sauvage et James Fraser Stoddart, mais en évidence l’importance de ce domaine d’actualité.  Ce projet s’inscrit dans une démarche de recherche fondamentale visant à élaborer une antenne de chromophore capable d’absorber l’énergie solaire de façon optimale, et ce dans le but de la transférer à un centre réactionnel capable de convertir l’énergie lumineuse en énergie chimique. La méthodologie employée vise à exploiter divers processus photochimiques afin d’élaborer des architectures supramoléculaires discrètes et d’en étudier les propriétés optiques et électroniques.

Keyphrases: Auto-assemblage, Chimie de coordination, Chimie inorganique
Processus de création et problématiques dans la composition d’un opéra contemporain : El Príncipe Tulicio, opéra de chambre avec dispositif électronique

Historiquement parlant, l’opéra est considéré par plusieurs comme étant la plus complexe et la plus coûteuse des tendances du genre lyrique. L’opéra peut imposer une énorme machinerie, non seulement à la production des œuvres, mais aussi aux créateurs. Dans mon projet d’opéra, cette mécanique est considérée sous deux angles : institutionnel et compositionnel. Ils ont pour objectif, dans le premier cas, de garantir une représentation viable et simple sur scène et, dans le second cas, de concrétiser les caractéristiques musicales qui identifieront l’œuvre selon une esthétique contemporaine. Pour cette thèse, je me suis servi de ma première expérience en composition d’opéra avec la création de El Príncipe Tulicio, un opéra de chambre avec dispositif électronique. Conçu selon le modèle Gesamtkunstwerk, il a été réalisé durant les années 2015-2016 et dure environ 59 minutes.   La thèse comporte deux grandes parties. D’abord, une mise en contexte de l’opéra dans la période dite « contemporaine » de la deuxième moitié du XXe siècle, et sur laquelle je me suis basé pour profiler ma recherche. Puis une deuxième partie, subdivisée en deux sections, qui présente différentes observations et analyses. La première section porte sur trois pièces composées pendant la première moitié du doctorat. Elles ont servi d’incubateurs et de laboratoires pour développer l’idéation de l’opéra. La deuxième section est consacrée à la présentation et à l’analyse exclusive de l’opéra. On y trouve les différentes problématiques inhérentes au processus de création, puis l’analyse de la structure formelle (prologue, quatre interludes, cinq actes et coda) et l’aspect général de l’opéra, où il importe davantage d’expliquer mes procédés. Je démontrerai quelles sont les relations dramaturgiques intrinsèques entre la musique (instrumentale et électroacoustique), la littérature (légende et onomatopées) et le théâtre (mise en scène). L’analyse porte ensuite sur des exemples détaillés afin d’illustrer ma démarche compositionnelle. Elle expose notamment les contraintes que je me suis imposées lors de la recherche. Par exemple, traiter la voix de manière non traditionnelle et l’adapter, au caractère de la pièce, par une notation graphique sur une partition hybride.   Finalement, cette thèse présente quelques conclusions issues des résultats obtenus et des difficultés rencontrées lors du processus de création de l’opéra.

Keyphrases: opéra contemporain, opéra électronique, musique mixte, musique contemporaine, voix contemporaine
Comparaison des perceptions de progrès et d’utilité d’un programme correctionnel entre les participants et l’intervenant

Il existe peu d’études mesurant les perceptions des délinquants face au traitement correctionnel qu’ils reçoivent. Pour cette raison, la place qu’occupent ces perceptions dans le modèle du risque-besoins-réceptivité (Bonta et Andrews, 2017) reste à clarifier, bien qu’il semblerait que celles-ci sont liées à la motivation, à l’engagement, et de façon plus générale à la réceptivité et à la disposition au traitement. Le but de la présente étude de cas était de comparer les perceptions d’utilité du programme correctionnel et de progrès en traitement des participants à un programme correctionnel avec les évaluations de progrès faites par l’agent de programme, afin de faire ressortir les aspects liés aux facteurs de réceptivité expliquant la concordance ou la divergence des perceptions entre les deux parties. Il a été observé que seulement les perceptions de progrès et d’utilité du programme des deux participants ayant bien performé correspondaient aux évaluations faites par l’intervenant. L’analyse des perceptions des participants a permis de faire ressortir des problèmes liés à la réceptivité au plan cognitif des deux participants dont les perceptions divergeaient de celles de l’intervenant. De plus, il semblait y avoir un manque de concordance entre les compétences et objectifs que ceux-ci considéraient avoir travaillé en traitement et les objectifs du traitement correctionnel. Finalement, pour un des participants, la honte ressentie face à ses délits a semblé affecter sa capacité à s’engager dans le traitement. D’un point de vue clinique, les obstacles à la réceptivité relevés par l’étude de cas soulignent l’importance d’une meilleure évaluation et considération des facteurs de réceptivité avant et durant le programme correctionnel.

Keyphrases: Perceptions, Traitement correctionnel, Réceptivité, Engagement
Effets de l'arme à feu sur la carrière criminelle: Sondage auprès de détenus fédéraux au Québec

La carrière criminelle se définit en termes de nombre, d’intensité et de durée, et de sévérité, intégrant ainsi les dimensions telles que la diversité des crimes, la spécialisation dans un type de crime en particulier et la fréquence des crimes par mois d’activité. L’arme à feu joue un rôle dans cette carrière criminelle et représente l’outil qui va faciliter la tâche. L’objectif général de cette étude est d’observer les effets de l’arme à feu sur des paramètres de la carrière criminelle et d’en comprendre l’évolution en fonction de l’acquisition d’une arme à feu et des prédispositions criminelles de l’individu. Les données sont auto-révélées et proviennent d’un sondage auprès de 253 détenus dans différents établissements pénitenciers du Québec. Les résultats des analyses de régressions multiples et de régressions logistiques multinomiales révèlent des effets significatifs de la fréquence de port d’armes à feu et de son utilisation sur la diversité des crimes. Le port fréquent d’une arme à feu influence également la fréquence des crimes contre les biens, alors que le port occasionnel influence la fréquence des crimes violents par mois d’activité. Cette fréquence est aussi influencée par la possession d’armes à feu. Enfin, c’est l’utilisation d’une arme à feu dans l’intention de commettre un crime qui joue sur les trois paramètres de la carrière criminelle définis au préalable. L’arme à feu facilite le crime et rend les délinquants plus actifs et prolifiques.

Keyphrases: Armes à feu, Carrière criminelle, Port d'arme à feu, Possession d'arme à feu, Utilisation d'une arme à feu
Développement d’un outil bio-informatique pour l’annotation des associations entre gènes et métabolites basée sur les voies métaboliques

La métabolomique permet l’étude de l’ensemble des métabolites (ex : lipides, sucres, acides aminés) par le biais d’une variété d’outils analytiques et de protocoles expérimentaux qui engendre des coûts importants. Actuellement aucun laboratoire ne peut analyser l’ensemble des métabolites. C'est pourquoi, il est crucial de pouvoir prédire des classes de métabolites pertinentes à analyser en lien avec le phénotype étudié. Toutefois, il n’existe actuellement pas d’outil bio-informatique idéale pour accomplir cette tâche. Dans le cadre de ce projet, l’objectif était de développer un outil bio-informatique afin de prédire les métabolites pertinents à analyser en se basant sur la connaissance seule de l’architecture génétique du phénotype étudié. Afin d'atteindre notre objectif, nous avons posé l’hypothèse que les gènes encodant des enzymes catalysant des réactions métaboliques, modulent la concentration des métabolites à leur proximité dans les voies métaboliques. Cette hypothèse a été testée en calculant le court chemin réactionnel (srd - sorthest reactional path) entre les gènes (SNPs annotés à leur gène putatif) et les métabolites faisant partie des associations statistiques provenant du jeu de données mGWAS de Shin et al. en les cartographiant sur le réseau métabolique de la base de données KEGG. Des 79 associations impliquant un gène encodant une enzyme, 49 ont été annotées par une valeur srd, dont la valeur médiane est de 1. C’est-à-dire, qu'il existe une réaction entre le gène et son métabolite associé, ce qui indique que l'expression du gène peut avoir une influence importante sur la concentration du métabolite. L’annotation majoritaire de courte valeur srd pour les associations statistiques de Shin et al. démontre la pertinence de cette métrique pour définir un profil métabolique à analyser en fonction de l’architecture génétique. En revanche, le manque au niveau de la couverture de l'annotation de l’ensemble des associations pourrait être amélioré en appliquant la méthode avec d'autres bases de données, notamment, Recon2. En somme, PathQuant avec ses futurs développements représente un outil intéressant pour la prédiction d’un profil métabolique à analyser en fonction de l’architecture génétique d’un phénotype donné, en plus de préciser notre compréhension du contrôle des gènes sur le métabolisme.

Keyphrases: Métabolomique, Génomique, mGWAS, Réseaux, KEGG, mGWAS
The small subunit of the mitoribosome from Andalucia godoyi : isolation and study of its protein composition

Les mitochondries proviennent d’une alphaprotéobactérie ingérée qui a développé une relation endosymbiote permanente avec son hôte. Par la suite, la plupart des gènes de l'endosymbionte ont été perdus ou migrés vers l'hôte, et le mitoribosome a été remodelé en raccourcissant les ARNr mitochondriaux (ARNr-mt) et en recrutant de nouvelles protéines ribosomiques mitochondriales (protéines-r-mt). Pourtant, comment exactement ce remodelage évolutionnaire a eu lieu reste spéculatif en raison du petit nombre d'études chez les eucaryotes primitifs. Ici, nous montrons que la petite sous-unité du mitoribosome d’Andalucia godoyi, un jakobid hétérotrophe flagellé avec le génome mitochondrial le plus primitif, a une proportion élevée de composants de type bactérien par rapport à son homologue dans les eucaryotes hautement divergents. Nous avons trouvé dans l'analyse par spectrométrie de masse que la petite sous-unité du mitoribosome d’A. godoyi contient plus de protéines ribosomiques bactériennes (21 protéines) que son homologue dans tout autre eucaryote (9 à 20 protéines). Bien que la petite sous-unité du mitoribosome d’A. godoyi représente un stade plus primitif du remodelage des mitoribosomes, certaines des protéines spécifiques à la mitochondrie sont déjà présentes (S25, S29, S33, S35, Rsm22 et Mrp10), or dans une moindre mesure que dans la petite sous-unité du mitoribosome de S. cerevisiae (16 protéines) et H. sapiens (13 protéines). En outre, la petite sous-unité du mitoribosome d’A. godoyi ne contient pas les protéines-r-mt S22, S26, S27, S31, S34, S36, S37, S38, S39, S41, S42, S43, S44, S45, S46, S48, et S49 - dont la plupart sont spécifiques aux eucaryotes. Nos résultats, en combinaison avec les caractéristiques de type bactérien dans les ARNr-mt d’A. godoyi, démontrent que cet organisme possède la petite sous-unité du mitoribosome la plus primitive connue à cette date. La caractérisation des mitoribosomes primitifs peut constituer un point de départ pour l'étude des étapes précoces et intermédiaires de l'évolution du mitoribosome.

Keyphrases: Andalucia godoyi, mitoribosome, petite sous-unité, évolution
Analyse du rôle de la paire de gènes A830082K12Rik/Nr2f1 dans la gliogenèse du système nerveux entérique

Les souris Spot qui sont un modèle pour le syndrome de Waardenburg couplé à la maladie de Hirschprung souffrent d’un manque de cellules dérivées de la crête neurale (CCN) incluant les neurones myentériques ainsi que les mélanocytes de la peau et du vestibule. La paire de gènes Nr2f1 et A830082k12Rik (K12) est significativement surexprimée dans les CCN entériques (CCNe) des embryons Spot. De plus, les CCNe des embryons Spot se différencient prématurément en cellules gliales au détriment des progéniteurs non différenciés. Plusieurs études récentes suggèrent que de nombreux cas de maladie de Hirschsprung pourraient être expliqués par une différentiation gliale précoce des CCNe induite par Sonic Hedgehog (SHH). Notre premier objectif est donc de déterminer si et comment le facteur de transcription Nr2f1 et son paralogue Nr2f2 sont impliqués dans la gliogenèse induite par SHH. Notre second objectif est de déterminer si le lncRNA K12 est capable de réguler un gène voisin en cis. Nous avons observé que le traitement de cellules P19 (modèle de cellules souches embryonnaires de souris) avec SHH induit effectivement l’expression de Nr2f1 et Nr2f2 (mesurée par RT-PCR) ainsi que celle de plusieurs marqueurs gliaux. De plus, le knock-down de Nr2f1/2 dans les CCN entériques semble effectivement bloquer la gliogenèse entérique. D’autre part, nos premières analyses du lncRNA A830082k12Rik montre qu’il est capable de réguler la transcription d’un gène voisin en cis. Le facteur de transcription NR2F1 semble être un facteur clé dans la gliogenèse entérique. Une meilleure compréhension de ses mécanismes d’action ainsi que des voies de signalisation impliqués dans sa régulation semble donc indispensable pour mieux comprendre cette étape clé du développement du système nerveux entérique.

Keyphrases: Système nerveux entérique, Cellules de la crête neurale, Gliogenèse, lncRNA