NCube/papyrus huggingface dataset:
Solitudes enseignantes ou la volonté de changer la société par l’éducation

Bien que toujours « maîtresses » de leurs classes, riches en activités et en possibilités, les enseignantes pourtant actrices principales du système d’éducation se trouvent privées dans leur école d’un pouvoir d’action. Isolées les unes des autres, privées des ressources et des moyens qu’une mise en commun de leur travail leur procurerait, elles doivent assumer seules la tâche de scolariser leurs élèves.  À partir d’un terrain d’observation participante d’une durée de sept mois portant sur la pratique de huit enseignantes, la présente thèse cherche à comprendre les dynamiques culturelles qui traversent et définissent cette expérience ordinaire propre au fait d’enseigner dans une école primaire au Québec. La thèse est divisée en deux parties. Les données et analyses présentées dans la première donnent à voir l’isolement des enseignantes en tant qu’effet de l’intégration de l’école au sein d’un système technocratique fonctionnant selon ses propres finalités autoréférentielles. Dans la seconde partie, c’est l’intérieur de la salle de classe qui est sous examen et qui se révèle être, au sein même de ce système, une enclave où l’on poursuit toujours un idéal pédagogique de transformation de la société par l’école.  En documentant ce contraste entre la vie à l’intérieur des classes et celle à l’extérieur, dans le « système d’éducation », il s’agit de saisir sous quelles formes cette vocation pédagogique perdure d’une manière qui jette un éclairage à la fois sur l’école comme forme sociale moderne, les logiques sous-jacentes à son encadrement bureaucratique et leurs inscriptions dans une problématisation spécifique de la vie collective.  Alors que la scolarisation est souvent appréhendée dans la littérature comme un instrument soit de l’économie ou de l’État, en analysant « l’école comme lieu désenchanté » (partie 1) à partir de « l’enchantement d’enseigner » (partie 2), la présente thèse se veut aussi une réflexion sur l’influence qu’exerce l’école, ses éthiques et ses enseignantes sur la culture.

Keyphrases: Scolarisation, Enseignement, Modernité, Postmodernité, Société, Système social, Culture, Québec, Sujet, Autonomie, Vocation, Catholicisme
Regulation of thecal endothelial cell function by growth factors in ruminants

Cette étude a été réalisée afin d'étudier les effets de BMP4 et de TGFβ1 sur l'expression de gènes et de protéine des cellules endothéliales de la thèque chez l'ovin. Les ovaires ovins ont été obtenus à partir de brebis adultes, quel que soit le stade du cycle oestral, et les cellules endothéliales de la thèque ont été isolées à l'aide de la technologie pluriSelect et cultivées. Après exposition à BMP4 et à TGFβ1 pendant 24 heures, les acides ribonucléiques totaux (ARN) ont été isolés pour une analyse quantitative de la réaction en chaîne de la polymérase en temps réel (qRT-PCR) de gènes de rôles bien connus dans la prolifération des cellules endothéliales, la formation et/ou la perméabilité vasculaire. Une analyse protéomique a également été réalisée à l'aide de la spectrométrie de masse après exposition de cellules endothéliales de la thèque à BMP4 pendant 48h. Les résultats montrent que BMP4 et TGFβ1 régulent les gènes liés à la fonction endothéliale, incluant le facteur de croissance des fibroblastes 18 et l’endothéline-1. L'analyse par spectrométrie de masse a identifié 1488 protéines totales dont 28 protéines sont significativement régulées positivement (> 2 fois) et 29 protéines régulées négativement (<0,5 fois). L’analyse de l’interactome, réalisée à partir de deux bases de données biochimiques et biologiques distinctes, a mis en évidence un degré élevé d’interactions génétiques et physiques entre les voies de signalisation TIMP1, JUN, STAT3 et CD63. Ces observations ont été validées par une analyse par STRING. En conclusion, ces résultats montrent que l'administration exogène de BMP4 ou de TGFβ1 induit des modifications du protéome de la cellule endothéliale de la thèque chez l'ovin. Cependant, la présente étude ne portait que sur des changements d'expression des gènes liés à la fonction endothéliale. Des travaux additionnels seront nécessaires afin d’évaluer le transcriptome, grâce au séquençage d’ARN des cellules endothéliales primaires de la thèque ovine pour identifier d'autres gènes susceptibles d'être régulés par la signalisation du TGF.

Keyphrases: Facteur de croissance transformant β, Ovaire ovin, Cellules endothéliales, Facteur de croissance fibroblastique de type 18, Protéine osseuse morphogénétique, Ovine ovary
Effets de l'exercice sur le développement  foetal chez la souris lors de douleur neuropathique chez la femelle gestante

La douleur peut avoir un impact négatif pendant la grossesse des femmes en affectant les plans physiologiques et psychologiques. Les femmes enceintes craignent utiliser de la médication analgésique, qui peut mener à des effets néfastes ou tératogènes sur le fœtus en développement. Pour ce mémoire, nous avons évalué le développement des souriceaux de mères ayant une douleur neuropathique ; et nous avons évalué si l’exercice pouvait diminuer les effets négatifs attendus sur les souriceaux ainsi que de diminuer la sensibilité à la douleur des mères. Trente-deux femelles ont été assignées aléatoirement à quatre groupes (8 femelles/groupe) : Chirurgie Sham ou Spared Nerve Injury (SNI) avec environnements standard (ES) ou enrichi (EE). La sensibilité mécanique des mères a été évaluée avec les filaments de Von Frey et la performance de l’activité physique avec des roues d’exercice informatisées. Les souriceaux ont été pesés et mesurés à la naissance. Au troisième jour postpartum, ils ont été évalués pour la géotaxie négative, le redressement, la préhension des membres supérieurs, le réflexe des points cardinaux (rooting) et le rampement, et le rampement a été également évalué au sixième jour postpartum. Suite à l’euthanasie, les cerveaux (cortex frontal) des mères ont été analysés pour des neuropeptides sélectionnés. Suite à l’exposition à l’activité, seulement les mères SNI-ES demeuraient neuropathiques et les niveaux d’exercice ont été similaires dans les groupes exposés. Certains neuropeptides cérébraux (enképhalines, endorphines et ocytocine) dans le tissu cérébral des femelles SNI ont montré une différence significative avec exercice. Le nombre de souriceaux était significativement plus petit dans le groupe SNI ES. Le nombre de décès à la naissance était plus important dans le groupe SNI ES, cependant les tests comportementaux étaient similaires dans tous les groupes (excepté pour le test de redressement). Sommairement, l’exercice peut réduire la douleur neuropathique chez les femelles CD-1. La douleur neuropathique n’a pas d’effet sur le neurodéveloppement des souriceaux, mais semble avoir un effet sur le nombre de la portée et sur la mortalité.

Keyphrases: Douleur neuropathique, Enrichissement de l'environnement, Peptides de la douleur, Exercice, Souris, Spared nerve injury
Impact de la litière à base de fumier recyclé sur la propagation des parasites gastro-intestinaux, dans l'environnement des bovins laitiers ainsi que dans le lait

L’objectif de ce travail était d'étudier la présence des parasites les plus courants associés au tube digestif des bovins dans la litière de fumier recyclé (LFR), ainsi que la capacité des procédures de préparation actuelles de la LFR à éliminer ces agents pathogènes. Nous avons également évalué si ces parasites pouvaient être récupérés dans le lait provenant du réservoir de lait des fermes utilisant ce système de litière. Enfin, nous avons étudié si la distribution de ces parasites diffèrerait dans le fumier de vaches logées sur une LFR par rapport à celle des vaches logées sur un système de litière plus conventionnel, c’est-à-dire la litière à base de paille.    Vingt-sept fermes LFR et 61 fermes témoins ont été recrutées pour l'étude. Des échantillons de fumier de la fosse de fumier et du lait de la citerne ont été récupérés dans des fermes qui utilisaient la litière à base de paille et dans des fermes qui utilisaient la litière LFR. De plus, dans les troupeaux LFR, nous avons récupéré des échantillons de la fraction solide du fumier après extraction du liquide, de la litière LFR avant utilisation, ainsi que de la LFR utilisée. Les parasites ont d'abord été détectés par flottation en double centrifugation en présence de sulfate de zinc afin de mettre en évidence la présence de protozoaires, puis par flottation en présence de sucre, selon la technique de Wisconsin modifiée, pour l'évaluation des nématodes. Les parasites du genre Cryptosporidium ont été identifiés, d’une part par détection et séquençage de leur ADN, et d’autre part par PCR nichée et séquençage d'une partie du gène codant pour la petite sous-unité de leur ARNr.    Nos résultats ont révélé une présence élevée de parasites des genres Cryptosporidium spp. (C. parvum, C. andersoni et C. meleagridis, identifiés par PCR) et Eimeria spp. (principalement E. bovis et E. zuernii) dans les deux types d’exploitations. Une proportion significativement plus grande d'échantillons de fumier provenant d'exploitations à base de litière LFR était positive à Cryptosporidium spp. par rapport au fumier de fermes utilisant la litière de paille.    Les oocystes des deux genres de protozoaires (Cryptosporidium spp. et Eimeria spp.) ont été trouvés à chaque étape de la préparation / transformation de la LFR, ce qui montre que les stratégies « non standardisées » actuelles de préparation de la LFR ne garantissent pas la destruction des parasites protozoaires.    En termes de risque zoonotique, nous avons décrit une présence importante de Cryptosporidium parvum dans des exploitations traditionnelles (32/61) et dans des explorations de LFR (24/27). De façon positive, aucun parasite n'a été détecté dans les échantillons de lait du réservoir, ni par analyse microscopique ni par méthode moléculaire, ce qui garantit la sécurité des consommateurs.

Keyphrases: bovins laitiers, litière de fumier recyclé, parasites protozoaires, Cryptosporidium spp., Eimeria spp.
Le transfert de l’écosystème microbien fécal des oiseaux contribue à l’établissement du microbiote de surface des œufs pondus : application aux oiseaux reproducteurs de poulet de chair

Dans la filière avicole de type chair, les bactéries présentes sur la coquille de l’œuf après la ponte sont encore très peu caractérisées, mais elles peuvent avoir des impacts sur la santé du poussin et, ultimement, sur la santé publique. L’objectif de cette étude était de décrire le microbiote fécal des oiseaux reproducteurs de poulet de chair et celui retrouvé à la surface de leurs œufs pondus afin d’évaluer une possible transmission de l’écosystème microbien fécal parental vers la surface de l’œuf. Douze troupeaux d’oiseaux reproducteurs de poulet de chair (Québec, Canada) ont été échantillonnés en deux temps. En utilisant une technologie de séquençage ciblant l’ARN ribosomal 16S des bactéries (la métagénomique 16S), nos analyses ont révélé que la composition et la structure des deux communautés bactériennes étaient significativement différentes (p<0.001). Aussi, le facteur temps (2 périodes d’échantillonnage à intervalle de 4 semaines) et le facteur troupeau (identité du lot d’oiseaux) influençaient significativement (p<0.05) les diversités alpha et beta des microbiotes. Ce sont 1790 unités taxonomiques opérationnelles (OTUs) qui étaient communes aux fèces et aux coquilles d’œufs et ce, indépendamment du moment d’échantillonnage. Des séquences associées à des genres bactériens potentiellement pathogènes et à celles retrouvées dans les flores d’altération, i.e Acinetobacter, Campylobacter, Escherichia/Shigella, Helicobacter, Listeria, Proteus, Pseudomonas, Salmonella et Staphylococcus, étaient également partagées entre les deux types d’échantillons. Aussi, certaines OTUs, très représentées dans le microbiote fécal, n’étaient pas présentes à la surface des œufs, suggérant une sélection lors du transfert et/ou une contamination environnementale. À notre connaissance, il s’agit de la première étude s’appuyant sur la métagénomique 16S à décrire la contribution du transfert de l’écosystème microbien fécal des poules reproductrices à l’établissement du microbiote retrouvé à la surface des œufs pondus, ainsi qu’à caractériser les communautés bactériennes présentes dans les fèces d’oiseaux reproducteurs de poulet de chair et à la surface des œufs pondus.

Keyphrases: Transmission bactérienne, Microbiote fécal, Microbiote à la surface de la coquille de l’œuf, Oiseaux reproducteurs de poulet de chair, Santé animale, Santé publique
Étude de l’expression et de la fonction du gène Ankyrin-repeat and SOCS-Box protein 9 (ASB9) dans le follicule ovulatoire bovin

La baisse de fertilité chez les vaches laitières est une préoccupation majeure pour l'industrie laitière au Canada car elle entraîne chaque année d'importantes pertes économiques. Cependant, les mécanismes moléculaires associés à une baisse de la fertilité ne sont pas encore complètement élucidés. Dans ce contexte, la régulation du gène Ankyrin-repeat and SOCS Box protein 9 (ASB9) dans le follicule ovarien a été rapportée pour la première fois par notre laboratoire. Nous avons identifié ASB9 comme un gène différentiellement exprimé dans les cellules de granulosa (CG) de follicules ovulatoires bovins. Toutefois, le rôle biologique d’ASB9 dans les CG était inconnu. Nous avons émis l’hypothèse que l’expression d’ASB9 serait induite par l’hormone lutéinisante (LH) dans les CG et que, par sa fonction biologique, ASB9 contribuerait au contrôle de la fonction des CG. Des CG ont été obtenues à partir de petits follicules (SF : 2-4 mm), de follicules dominants au jour 5 du cycle œstral (DF) et de follicules ovulatoires (OF) 24 heures (h) suivant une injection d’hCG. Des analyses par RT-qPCR et western blot ont démontré une induction de l’expression de l’ARNm et de la protéine ASB9 dans les CG des OF par l’hCG. L’expression d'ASB9 dans les parois folliculaires était significativement induite à partir de 12 h post-hCG, avec une induction maximale 24 h post-hCG ou 24 h suivant la libération endogène de la LH comparée à 0 h. Le criblage d’une banque d'ADNc provenant de follicules ovulatoires à l’aide du système double hybride chez la levure a permis d'identifier 10 protéines partenaires d'ASB9 dont tumor necrosis factor alpha-induced protein 6 (TNFAIP6), hypoxia inducible factor 1, alpha subunit (HIF1A) et cytochrome B (CYTB). L'inhibition d’ASB9 par l'approche CRISPR-Cas9 a entraîné une prolifération des CG et une modulation de l'expression de certains gènes dont celui de l’enzyme stéroïdogénique CYP11A1. Ces résultats confirment un rôle d'ASB9 dans le follicule ovulatoire en contrôlant la prolifération et la fonction des CG, en ciblant des protéines spécifiques susceptibles d’être dégradées et, possiblement, en contribuant à la différenciation finale des CG en cellules lutéales. Les résultats de cette étude pourraient mener à une meilleure compréhension et contrôle de la fonction ovarienne par l’identification de gènes associés à la fertilité chez les vaches laitières.

Keyphrases: ASB9, Ovaire, Cellules de granulosa, Follicule ovulatoire, LH, hCG, Vache laitière, Fertilité, Double hybride, CRISPR-Cas9
Évaluation de l’utilité clinique d’une méthode de dépistage de l’hématurie féline

L’hématurie correspond à un nombre augmenté d’érythrocytes dans l’urine et peut indiquer un désordre urinaire. L’importante occurrence de l’hématurie lors d’affection du bas appareil urinaire peut laisser à supposer que l’hématurie serait potentiellement un bon biomarqueur des affections du bas appareil urinaire chez le chat. Un test non-invasif de dépistage de l’hématurie féline vient de terminer son développement. Il s’agit de granules blancs, à saupoudrer sur la litière du chat, destinés à devenir bleus rapidement au contact de l’hémoglobine.  Le but de ce mémoire est de rapporter les résultats de l’étude de ce test de dépistage et de contextualiser ces derniers en traitant du suivi de l’hématurie féline dans le cadre des affections du bas appareil urinaire. Des études antérieures des prototypes du test de dépistage (Gara-Boivin, del Castillo et al. 2018, Khenifar, del Castillo et al. 2018, Khenifar, del Castillo et al. 2018) ont démontré un bon seuil de détection, d’environ 12[8-16] globules rouges par champ au fort grossissement microscopique x400. L’étude ici présentée a évalué le test avec 80 chats, à la fois en clinique vétérinaire et chez les propriétaires. Les performances du test ont été jugées très bonnes, avec une sensibilité de 91.5%, une spécificité de 90.9%, une valeur prédictive positive de 93.5% et une valeur prédictive négative de 88,2%.  Le produit chromogénique de dépistage a les caractéristiques requises pour une utilisation fiable dans un suivi clinique de l’hématurie féline. Des études sur une plus large population de chats ainsi que sur la gestion des affections du bas appareil urinaire sont actuellement en cours.

Keyphrases: hématurie, chat, maladies du tractus urinaire inférieur, test de dépistage, cystite idiopathique féline, infection du tractus urinaire, sensibilité, spécificité, valeurs prédictives
Caractérisation des déchirures méniscales équines et de leur relation avec l’ostéoarthrose fémorotibiale

La littérature contient peu d’informations concernant la morphologie méniscale équine normale, sa dégénérescence et son rôle dans l’ostéoarthrose (OA). Les objectifs de cette étude étaient de caractériser la morphologie méniscale normale et avec lésions et d’explorer la relation entre la dégénérescence méniscale et l’OA fémorotibiale équine. Cette étude ex vivo inclue 7 articulations normales (n=14 ménisques) et 15 avec OA (n=30 ménisques). Un score macroscopique fémorotibial d’OA (dégénérescence cartilagineuse et ostéophyte) a été utilisé pour quantifier la sévérité (modifié de Olive at al 2010). Les fibrillations et déchirures méniscales macroscopiques (régions crâniale, centrale et caudale) ont été évaluées (1-4). Les fibrillations microscopiques, déchirures et la dégénérescence de la bordure interne ont aussi été gradées (0-3). Des déchirures partielles étaient localisées en surfaces fémorale et tibiale dans les trois régions, majoritairement en surface fémorale de la corne crâniale médiale. Une corrélation positive entre les scores macroscopiques globaux des ménisques médiaux et d’ostéophytes (r=0.7, p=0.002) ou de dégénérescence du cartilage (r=0.5, p=0.03) était présente dans l’articulation fémorotibiale médiale. Le score macroscopique global des ménisques médiaux était supérieur (p=0.004) dans les articulations avec OA avancée, comparativement aux contrôles. La limite principale est que plusieurs ménisques proviennent de l’abattoir et sont sans histoire clinique. Cette étude est la première décrivant la morphologie méniscale équine normale et identifiant des déchirures dans toutes les régions, sur les deux surfaces méniscales. Malgré que la dégénérescence méniscale équine soit corrélée à la sévérité d’OA dans le compartiment fémorotibial médial, la relation entre l’OA et les pathologies méniscales reste à déterminer.

Keyphrases: équin, ménisque, déchirure, fémorotibial, ostéoarthrose, Meniscus
Etude épidémiologique de la résistance de Salmonella Dublin, Campylobacter spp et Escherichia coli et l’usage des antimicrobiens chez les veaux de lait du Québec

La résistance aux antimicrobiens est de nos jours une préoccupation mondiale, affectant également le Québec et le Canada. Les productions animales en général, incluant les bovins, participent à ce problème complexe à travers l’usage des antimicrobiens. L’hypothèse de cette étude était que les élevages de veaux de lait constituent une source de Salmonella Dublin, Campylobacter spp et Escherichia coli résistants aux antimicrobiens au Québec. L’étude a été réalisée d’août 2016 à octobre 2017 à partir des échantillons de contenu de caecum prélevés sur les animaux abattus dans deux abattoirs sous inspection fédérale au Québec. Dans un premier temps, la prévalence et les profils de résistance aux antimicrobiens des trois bactéries ont été évalués. Les résultats ont montré chez les trois bactéries des multirésistances dont certains antimicrobiens, comme l’amoxicilline-acide clavulanique, la ceftriaxone et la ciprofloxacine, sont de haute importance pour la santé humaine.  Par la suite, l’association entre l’usage des antimicrobiens dans les élevages et la résistance chez E. coli a également été étudiée. L’usage des polypeptides (bacitracine) était significativement associé à la diminution de la résistance à l’ampicilline et la tétracycline.    Enfin, d’autres facteurs de risque associés à la présence dans les lots de veaux d’isolats d’E. coli multirésistants ont été étudiés. Les résultats ont montré que la taille des lots (les lots de petite taille) était un facteur de risque de multirésistance pour E. coli. Les résultats obtenus à partir de cette étude devraient contribuer à orienter les mesures de prévention et de contrôle de la résistance aux antimicrobiens chez les veaux de lait par les décideurs gouvernementaux et de l’industrie du veau de lait.

Keyphrases: Résistance aux antimicrobiens, Salmonella Dublin, Campylobacter spp, Escherichia coli, Usage des antimicrobiens, Facteurs de risque, Multirésistance, Antibiotiques, Antibiorésistance, Veaux de lait, Québec, Salmonella Dublin, Campylobacter spp, Escherichia coli
Concentration sérique de la lipase DGGR chez le chat lors d’insuffisance rénale

La lipase de l'acide 1,2-o-dilauryl-rac-glycero-3-glutarique ester (6'-méthylrésorufine) (DGGR) semble être utile pour le diagnostic ante-mortem de pancréatite et s’avère également une méthode rentable par rapport au dosage de la lipase féline spécifique du pancréas (Spec fPL). Toutefois, l’influence des comorbidités, notamment celle de l'insuffisance rénale sur la lipase DGGR, est encore méconnue chez le chat. Le but de notre étude est d'établir si la lipase DGGR est augmentée chez des chats présentant une insuffisance rénale par une étude clinique prospective et contrôlée. Trente et un chats malades ayant un test semi-quantitatif normal pour l'estimation de l'immunoréactivité pancréatique féline (SNAP fPL) et avec insuffisance rénale (groupe RI +) ou sans insuffisance rénale (groupe RI-) et 18 chats sains sans insuffisance rénale (groupe sain) ont été recrutés prospectivement. Des échantillons de sérum ont été prélevés chez ces chats et analysés pour le dosage de la lipase DGGR et de la créatinine sérique.  Nous avons trouvé que le groupe RI+ avait des concentrations sériques de lipase DGGR significativement plus élevées par rapport au groupe sain (P <0,05). La lipase DGGR était également positivement associée à la créatinine sérique (P <0,05), et la créatinine expliquait 19,6% de la variation de la lipase.  En conclusion, nos données montrent que les concentrations sériques de lipase DCGR étaient significativement plus élevées que celles des chats sains, avec 37% (6/16) des chats ayant des valeurs plus élevées que les valeurs de référence. Ainsi, même si cette différence était légère, la valeur de la lipase DGGR devrait être interprétée avec précaution en cas d’insuffisance rénale.

Keyphrases: lipase DGGR, SNAP fPL, insuffisance rénale, pancréatite