NCube/papyrus huggingface dataset:
Influence of the transcription factor Ikaros on neutrophil response during acute inflammation

Les neutrophiles sont essentiels pour les réponses inflammatoires aiguës initiées par une infection ou une lésion tissulaire. De multiples gènes inflammatoires et des signaux sont activés rapidement pour réguler les fonctions des neutrophiles. Ikaros est un facteur de transcription critique impliqué dans la régulation de la différenciation des cellules myéloïdes. L'analyse de transcription des cellules hématopoïétiques en l'absence d'Ikaros indique des différences dans l'expression des gènes des facteurs de signalisation. Cependant, l'impact d'Ikaros sur les mécanismes de signalisation dans les cellules myéloïdes pendant l'inflammation reste à définir. Le but de cette étude était de définir si le manque d'expression d'Ikaros pouvait perturber la signalisation et ainsi la fonction / réponse des neutrophiles pendant l'inflammation. Nous avons utilisé les neutrophiles purifiés de la moelle osseuse des souris WT et Ikaros +/-. Nous avons trouvé que le niveau d'expression d'Ikaros est un facteur important pour contrôler l'apoptose des neutrophiles, la NETosis, l'activité de la myéloperoxydase et la production d’espèces d'oxygène réactives en réponse à l'ADN bactérien. Nous avons également fait des expériences in vivo en utilisant un modèle murin de pneumonie. Nous avons trouvé que la suppression partielle d'Ikaros (souris Ikaros +/-) est associée à l'élimination réduite des bactéries. Pour expliquer comment l'expression plus faible d'Ikaros pourrait affecter la signalisation dans les neutrophiles, nous avons fait une analyse ‘’ high-throughput microarray ‘’ pour identifier les variations de l'activité de la protéine kinase. Les données de microarray suggèrent que plusieurs signaux, comme le P38 MAPK, sont affectées par Ikaros. En conséquence, nous avons utilisé des inhibiteurs sélectifs des kinases pour mieux définir l'importance de ces kinases dans la fonction des neutrophiles. De plus les résultats présentés indiquent l’importance du facteur Ikaros pour la régulation de l’expression des ‘Toll Like Receptor’ 4 et 9, ainsi que du senseur d’ADN cytoplasmique IFI204 dans les neutrophiles. Cette étude présente de nouvelles informations sur le rôle d'Ikaros dans la régulation des fonctions des neutrophiles et une base rationnelle pour le développement de nouvelles approches thérapeutiques ciblant Ikaros pour le traitement des patients avec d'infections et de septicémie en particulier.

Keyphrases: Ikaros, Neutrophil, Inflammatoires aiguës, Immunité innée, Signalisation
La dominance mycorhizienne en tant que facteur local déterminant des processus écologiques forestiers

L'association mycorhizienne implique nombre de plantes et de champignons, étant sans doute la symbiose mutualiste la plus importante et la plus répandue au sein des écosystèmes terrestres. Étant donné que la plupart des arbres forment des mycorhizes arbusculaires ou des ectomycorhizes qui se distinguent par leur écophysiologie, il est judicieux de caractériser les forêts en fonction de leur dominance mycorhizienne afin d'en mesurer les impacts sur les processus écologiques. Ainsi, l'objectif de cette thèse est de quantifier les influences de la dominance mycorhizienne en forêt sur les propriétés abiotiques et biotiques du sol ayant un impact à l'échelle locale sur deux processus associés : la décomposition de la matière organique et la régulation de la diversité végétale. Les forêts étudiées, de dominance mycorhizienne très contrastée, présentent des propriétés physico-chimiques et des communautés microbiennes distinctes au niveau du sol, mais des patrons de distribution verticale des microorganismes du sol d'une similarité inattendue. Dans ces forêts nordiques décidues, la décomposition de la matière organique est favorisée dans les couches supérieures du sol, notamment grâce à la présence du réseau fongique et d'autant plus lorsque les ectomycorhizes prédominent, ce qui prouve l'aspect déterminant du contexte local. L'établissement d'arbres mycorhiziens arbusculaires peut être limité par la combinaison des conditions abiotiques et biotiques édaphiques de la forêt boréale, qui est dominée par les ectomycorhizes, contrairement aux forêts à dominance partagée entre mycorhize arbusculaire et ectomycorhize, où la diversité est favorisée à l'échelle de la communauté. Cette thèse démontre le rôle déterminant, au niveau local, exercé par la dominance mycorhizienne sur les processus écologiques, et soulève l'importance de l'hétérogénéité biotique et abiotique du sol pour mieux saisir le fonctionnement des écosystèmes terrestres.

Keyphrases: Biodiversité microbienne, Champignons saprotrophes, Forêt tempérée nordique de feuillus, Écotone tempéré-boréal, Érable à sucre, Hêtre à grandes feuilles, Forêt boréale, Cycle du carbone, Changement climatique
Sexual desire, sexual behaviour and sexual distress in committed couples

Malgré le rôle central qu’ils jouent dans la sexualité, le désir sexuel et le comportement sexuel restent mal compris – particulièrement chez les couples. La rareté des résultats empiriques dans ce domaine contribue à l’écart qui existe actuellement entre la recherche en sexualité et la pratique clinique, et peut impacter négativement la qualité des soins disponibles aux nombreux couples qui consultent pour des problèmes de désir sexuel - la plainte la plus courante en thérapie sexuelle.  L'objectif des trois articles de cette recherche doctorale était d'aider à combler cette lacune en étudiant le désir sexuel dans le cadre d’une perspective relationnelle. L’hypothèse de départ de ce travail était que le bien-être de chaque partenaire est influencé en interaction avec l’autre partenaire, et que cette influence est médiée en partie par le comportement sexuel du couple. Les résultats obtenus appuient cette hypothèse : Ils suggèrent que les interactions positives pendant les rapports sexuels, telles que les motivations d'approche « pour soi » et « pour l’autre » des deux partenaires et les comportements génitaux et affectifs du couple sont associées à une plus grande satisfaction sexuelle et à un plus fort sentiment d’intimité (étude 1). À l'inverse, les difficultés sexuelles telles que le faible désir sexuel sont associées à des restrictions de comportement sexuel et à l'insatisfaction sexuelle (étude 2). De même, les asynchronies entre partenaires telles que les décalages de désir sexuel sont associées à une plus grande détresse sexuelle (étude 3). Enfin, la troisième étude commence à établir une direction et une portée à ces associations, en suggérant que les problèmes de décalage de désir sexuel prédisent la détresse sexuelle d'un jour à l'autre, et que ces associations quotidiennes sont reflétées par des associations plus distales sur des périodes d’un an ou plus. Ces résultats sont cohérents avec les recherches récentes sur la régulation émotionnelle en sexualité, et plus spécifiquement, avec des modèles où le désir sexuel joue un rôle régulateur, médié par des variations de comportement sexuel.  Il est espéré qu'au-delà de ces contributions conceptuelles, la présente recherche sera utile aux cliniciens. En particulier, ces résultats soutiennent les thérapies qui se concentrent sur les interactions quotidiennes entre les partenaires pour aider les couples aux prises avec des problèmes de désir sexuel.

Keyphrases: Désir sexuel, Comportement sexuel, Décalage de désir, Satisfaction sexuelle, Détresse sexuelle
Étude fondamentale des interactions plasma-graphène dans les plasmas Argon/B2H6

Les travaux de recherche menés dans cette thèse de doctorat se sont focalisés sur la compréhension des interactions graphène-plasma dans le cas de l’exposition de graphène polycristallin à un plasma d’argon pouvant contenant du diborane (B2H6). Une attention particulière est portée sur la cinétique de génération de dommage dans un plasma d’argon pur. Ainsi dans le cas d’un plasma continu, l’absence de seuil en énergie pour la génération de dommage due à un bombardement ionique est mis en évidence. Ceci ne peut s’expliquer que par une gravure à deux étapes, facilitée par la densité ionique élevée caractéristique des plasmas inductifs opérés en mode H. La caractérisation Raman des échantillons exposés au plasma montre une large distribution sur la petite zone sondée. Afin de relier ces fluctuations à l’état initial du graphène, l’imagerie Raman (RIMA) est adaptée dans le but d’extraire des données quantitatives sur l’état du graphène et utilisée pour le reste des travaux. Par la suite, l’étude temporelle des plasmas pulsés en puissance permet de trouver des conditions opératoires avec une fluence ionique drastiquement diminuée. Les traitements subséquents combinés aux analyses RIMA ont permis de suivre l’évolution de l’état du graphène et de distinguer l’état des joints du graphène des domaines de croissance. Ainsi, pour la première fois, l’autoréparation des joints de grains dans un matériau 2D est mis en évidence expérimentalement. Cet effet, théorisé dans les matériaux 3D mais difficilement observé expérimentalement, était effectivement prédis dans le cas du graphène. De plus, un contrôle fin des conditions opératoires du plasma pulsé d’argon a permis d’extraire des paramètres plasmas dans lesquels les métastables d’argons puis les photons VUV émis par les états résonants de l’argon sont les principaux vecteurs d’énergie. Suivant la même méthodologie que précédemment, ces traitements ont mis en lumière les rôles respectifs des ions, des métastables et des photons VUV dans la transmission d’énergie du graphène. Enfin, l’introduction de 5% de diborane a pour conséquence une modification radicale des paramètres physique du plasma. L’exposition de graphène à ce graphène à ce plasma démontre l’intérêt de cette technique pour l’incorporation élevé de bore tout en minimisant la génération de dommages

Keyphrases: graphène polycristallin, bilan d’énergie, auto-réparation des joins de grains
Modification de films de graphène dans la post-décharge en flux de plasmas micro-ondes d’azote à pression réduite

Ce projet de thèse porte sur le traitement de films de graphène dans la post-décharge en flux de plasmas micro-ondes d’azote à pression réduite. Différentes considérations de contamination de surface des échantillons se sont avérées cruciales pour ce travail. Par exemple, en présence d’hydrocarbures, les traitements dans les différentes régions de la post-décharge montrent des profils de production de dommages, d’incorporation d’azote et de fonctionnalisation de contaminants distincts. Le traitement agressif qu’offre la post-décharge proche résulte en la formation de complexes amorphes graphène-hydrocarbures responsables d’une forte hausse de la teneur en azote (jusqu’à 49%) pour des désordres modérés (D:G = 1.3). Pour les traitements dans la post-décharge lointaine, les hydrocarbures jouent un rôle de couche protectrice permettant une incorporation monotone (jusqu’à 18%) à très faible dommage (D:G < 0.3). Les espèces azotées sont néanmoins faiblement liées de sorte que le transfert vers un substrat de SiO2 engendre une perte importante (> 80%) de la teneur en azote. Des considérations d’inhomogénéité de surface des films de graphène ont motivé le développement d’une nouvelle méthode d’analyse des cartographies Raman obtenues par un imageur hyperspectral. L’étude des spectres Raman au niveau des domaines versus aux joints de grains ont permis de mettre en évidence un mécanisme d’auto-réparation des joints de grains relié à l’anisotropie de la migration des adatomes de carbone en surface. L’accumulation de ceux-ci aux joints de grains mène à une émission d’adatomes responsable de l’annihilation de paires de Frenkel. Dans les plasmas azotés, il s’avère que ce mécanisme est également responsable d’une incorporation sélective d’azote aux domaines de croissance du graphène. Lorsque amorphisé, le dopage sélectif s’estompe puisque le transport des adatomes de carbone aux joints de grains, ainsi que l’accumulation essentielle au processus d’auto-réparation, deviennent entravés. Finalement, la recombinaison en surface d’atomes d’azote et la désexcitation de métastables N2(A) sont identifiés comme principaux agents pour la production de dommages dans la post-décharge en flux d’azote. Un modèle d’incorporation impliquant la formation de dommages et l’adsorption d’atomes d’azote est proposé. En présence d’espèces oxydantes dans la post-décharge d’azote, la formation de dommages demeure limitée par les populations de N et de N2(A).

Keyphrases: plasmas pression réduite, post-décharge en flux d'azote, diagnostics spectroscopiques des plasmas, graphène, caractérisation des matériaux
Révéler par l’art les enjeux politiques et matériels de l’économie : la monnaie, la dette, le profit et la valeur vus à travers les matières premières dans trois performances de Marta Minujín (1985, 1996, 2017)

Cette thèse revisite certains grands thèmes associés à l’économie à travers des analyses d’œuvres d’art. Nous proposons de mettre en question l’image, très souvent relayée en histoire de l’art, d’une économie actuelle essentiellement abstraite et détachée des conditions politiques. Dans un premier temps, nous revenons sur la définition même de l’économie. Nous identifions certains principes théoriques servant de légitimation aux discours qui entretiennent l’idée d’une neutralité des objectifs économiques. Puis nous construisons un cadre théorique à la croisée de plusieurs courants de pensée en sciences humaines et sociales, afin d’inscrire la vision de l’économie dans des dimensions politiques et matérielles. Nous réalisons ensuite une analyse de trois performances de l’artiste argentine Marta Minujín. Nous suivons l’artiste quant à l’importance qu’elle accorde aux matières premières, qui deviennent ainsi notre principal moyen d’enquête et de réflexion. Afin de renouveler la vision de l’économie à travers l’analyse d’œuvres d’art, nous conjuguons des comparaisons iconographiques inédites avec une mise à jour de la compréhension des contextes historiques, reposant notamment sur la récente littérature en analyse des systèmes-monde et en économie écologique, et nous présentons des réflexions abouties sur plusieurs concepts majeurs du fonctionnement économique, tels que la monnaie, la dette, le profit et la valeur. Nous montrons ainsi la polysémie du dispositif mis en place par l’artiste, et sa capacité à révéler des dynamiques politiques, territoriales et matérielles récurrentes qui soutiennent le fonctionnement de l’économie. Nous explorons comment les œuvres renversent la hiérarchie habituelle des subordinations économiques, et comment elles en débusquent les origines et les prolongements jusqu’à ce jour. Nous voyons également comment les performances de Marta Minujín pointent et confrontent les arrangements consensuels qui garantissent l’enrichissement économique.

Keyphrases: art, économie, Marta Minujín, capitalisme, performance, matières premières, Marta Minujín, performance
La dévotion au Saint Frère André à l’Oratoire Saint-Joseph du Mont-Royal : ethnographie d’une religiosité populaire contemporaine

Dans un paysage religieux québécois qui s'est profondément transformé, même si l’on constate une désaffection des églises catholiques, certaines formes de dévotion restent importantes, en particulier la dévotion au Saint Frère André. Canonisé par le Pape Benoît XVI en octobre 2010, Saint Frère André est le premier Saint homme natif du Canada. Il est à l’origine de la construction de l’Oratoire Saint-Joseph du Mont-Royal, le plus grand Sanctuaire dédié à Saint Joseph au monde. Il est un personnage important au Québec. Selon les données du Sanctuaire, chaque année, deux millions de visiteurs se rendent à l'Oratoire. Ces visiteurs ont plusieurs profils. Ce sont soit des personnes dévotes venant de Montréal ou des environs, des touristes religieux ou des pèlerins. Cette thèse traite de la dévotion au Saint Frère André à l’Oratoire. L’objectif principal est de comprendre les expressions et pratiques de cette dévotion populaire ainsi que l'expérience vécue par les dévots dans ce lieu de pèlerinage, à l’aide d’une approche ethnographique combinée à une étude d’archives des billets d’intentions recueillis à l’Oratoire au cours de l’année 2010 et 2018. Les dix observations réalisées dans les cinq lieux de recueillement dédiés au Saint Frère André, les cinquante entrevues menées auprès de personnes dévotes et l’étude de mille billets d’intentions mettent en évidence la relation de confiance et d’amitié que les personnes entretiennent avec le Saint. Cette relation est entretenue par la perception de manifestations attribuées au divin, telles que des miracles de guérison, des apparitions et des visions qui, pour les dévots, attestent de l’existence d’un échange de biens de charité entre ciel et terre. Il ressort de cette thèse l’importance du rôle d’intercesseur de Saint Frère André dans les pratiques de dévotion ainsi que son rôle dans la mémoire collective québécoise comme en témoignent les relations historiques que bon nombre de familles ont développées avec le Saint. La prière est le lieu premier de la rencontre, le véhicule par lequel les dévots rencontrés communiquent avec Saint Frère André. Quant aux pratiques de dévotion, elles s’expriment sous de multiples formes : reliques, espaces de dévotions, statues, objets de piété, huile de Saint Joseph, images, culte, pèlerinages, etc. La dévotion populaire n’étant pas contrôlée par l’institution religieuse, elle donne libre cours aux expressions religieuses spontanées tant dans les rituels que dans l’écriture votive.

Keyphrases: Dévotion, Pèlerinage, Sanctuaire, Saint, Prière, Miracle, Reliques, Guérison, Expérience spirituelle, Saint, Miracle
Inventaire pendant liquidation : expériences du temps dans les écritures au féminin au Québec 1970-1990

L’hypothèse qui soutient cette thèse est que les écritures au féminin, au Québec, des années soixante-dix à quatre-vingt-dix, livrent une expérience singulière du temps. Les œuvres étudiées présentent une réflexion sur les possibilités de la littérature à mettre en œuvre une transformation, voire une liquidation du temps patriarcal. Cette thèse montre comment les écritures au féminin, tout en voulant instaurer un changement de paradigme dans le temps, héritent tout de même de paramètres, de formes, d’histoires dont elles désirent se détacher. C’est à cette mise en tension entre rupture et récupération que je m’intéresse en étudiant différentes thématiques et pratiques formelles dans un corpus composé de textes publiés en revues, de livres et de films.   Le premier chapitre analyse des textes philosophiques et littéraires qui questionnent le genre sexuel et ses relations au politique, et montre comment les écritures au féminin sont indissociables d’un discours sur la littérature elle-même. Dans le deuxième chapitre, à partir des œuvres de Nicole Brossard et de Louky Bersianik, je vois comment la mémoire est posée comme le lieu de renouvellement des connaissances. Le troisième chapitre se consacre au motif de la cassure face au temps patriarcal dans Cyprine (1978) de Denise Boucher et dans Dieu, de Carole Massé (1979). La construction d’une histoire littéraire au féminin dans la revue littéraire La Barre du jour/La Nouvelle Barre du jour (1965 1990) est le sujet du quatrième chapitre. Le cinquième et dernier chapitre s’intéresse aux manières de construire une temporalité au féminin dans des textes rédigés à plusieurs mains : Retailles, (1977) de Madeleine Gagnon et Denise Boucher et La théorie, un dimanche (1988), de Louky Bersianik, Nicole Brossard, Louise Cotnoir, Louise Dupré, Gail Scott et France Théoret. Insufflant du féminin dans le récit androcentré de l’histoire, les œuvres du corpus travaillent une pratique littéraire consciente d’elle-même et de ses procédés, valorisant l’exploration formelle comme pratique politique.

Keyphrases: littérature des femmes, féminismes, histoire, mémoire, temps, littérature québécoise, revue littéraire
Figures de la résistance : les Amazones modernes, de la Belle Époque à aujourd’hui

Depuis la fin du XIXe siècle, on assiste en France à un retour en force du mythe des Amazones dans les textes littéraires et les arts visuels. À chaque époque qui la voit ressurgir, la communauté de guerrières affranchies des lois des hommes suscite autant la fascination que l’effroi. Figures dissidentes qui apparaissent, entre 1870 et aujourd’hui, sous les traits de sportives, d’écuyères, de femmes de carrière (auteures, enseignantes, médecins, avocates…), de militantes féministes, de lesbiennes révolutionnaires et de guerrières futuristes, les Amazones se distinguent par la manière dont elles échappent à une vision hétéronormative du « féminin » et du « masculin ».   Le réinvestissement du mythe des Amazones depuis la Belle Époque traduit un désir d’affranchissement par rapport à un système de société basé sur une pensée antagoniste entre force et faiblesse, corps et esprit, individu et communauté, masculin et féminin. Les guerrières myth(olog)iques semblent cristalliser diverses tentatives d’opposer aux lieux communs d’un féminin conventionnel des figures d’identification en rupture avec les normes et les attentes sociales. Toutefois, en perpétuelle posture de résistance aux catégories genrées, les Amazones et leurs avatars choisissent de n’endosser ni le féminin ni le masculin, optant pour une identité équivoque, se présentant comme un sujet queer dont la mission est d’exposer la pseudo-nature de la conception binaire des genres. À travers leur combat pour le décloisonnement des espaces identitaires, ces figures modernes de la résistance tentent, tant bien que mal, de constituer une communauté ouverte aux différences et de tirer un sentiment de puissance de cette union sororale. L’opposition et les difficultés rencontrées sur le chemin de la conquête, marqué par des actes sacrificiels, les obligent à réinventer leurs armes de lutte et les conduisent parfois à remettre en question l’héritage des troublantes et fascinantes guerrières de l’Antiquité.

Keyphrases: Amazones, identité, communauté, pouvoir, résistance, mythe, féminité, études de genre, littérature française moderne, littérature française contemporaine, arts visuels, myth
The anatomy of silence : decolonizing the female body in rape narratives

La langue est en partie responsable de la perpétuation de la violence sexuelle. Alors que la théorie féministe semble l'alliée naturelle de cette étude, la relation binaire mise au premier plan dans la théorie féministe du traumatisme - en renommant la victime de viol en survivante de viol, par exemple - a gardé son oppression plus ou moins intacte. Mon approche est de m'éloigner du cadre strict de la théorie féministe pour comprendre pleinement la violence sexuelle et sa place dans l'histoire ainsi que son impact sur une femme qui a vécu le crime. En m'appuyant sur les théories de la (dé)colonisation pour analyser les récits de viol, je trouve des parallèles dans les deux actes d'oppression ainsi que dans les modes d'émancipation. Le potentiel ici est d'établir une nouvelle méthodologie qui permettra de recadrer l'analyse littéraire et de décoloniser la politique, la langue et la pédagogie du «monde réel» du viol, c'est-à-dire de montrer l'impact de la suppression, de l'ignorance ou de la négligence du viol comme problème sociopolitique central et structurel. Le corpus de cette thèse se compose de quatre récits littéraires, dont deux sont (semi)-autobiographiques: Cereus Blooms at Night, par Shani Mootoo; Memories of the Future, par Siri Hustvedt; The Apology, par Eve Ensler; et, In My Own Moccasins: A Memoir of Resilience, par Helen Knott.

Keyphrases: Memoir, Violence sexuelle, Décolonisation, colonialité du pouvoir, Études de genre, Théorie féministe