NCube/papyrus huggingface dataset:
Amputations : Un cycle de l’éthique médicale

L’amputation est un acte chirurgical qui souligne souvent un échec dans une gestion de l’infection ou dans l’accompagnement d’une pathologie comme le diabète. Elle soulève une question d’ identité pour le patient. La chirurgie reconstructive diminue les enjeux identitaires, sans que cet avantage perçu par le seul patient conduise à une priorité accordée à cette thérapeutique. L’histoire de l’amputation est relativement bien connue (Kirkup, 2007). Pourquoi les premières amputations – si anciennes ? Pourquoi une pratique si abondante aujourd’hui – en particulier, plus de 1200 amputations réalisées en janvier 2010 à Port au Prince? Les techniques alternatives de chirurgie de sauvegarde se sont développées parallèlement à celles de l’amputation. Les grandes césures dans l’histoire médicale ont amené une chute du taux de mortalité, mais pas une réduction de la variété des approches thérapeutiques. Deux grandes grilles d’interprétations sont possibles de cette histoire de l’amputation : soit un cycle avec des récurrences, soit une succession de phases. L’ouvrage « L’usage des plaisirs » de Michel Foucault introduit à la médecine hippocratique qui a fixé la première éthique. L’histoire de la sexualité présente une succession de phases. Cependant, la grille d’analyse sous forme d’un cycle semble pourtant être la mieux confirmée par l’analyse, dans le cas de l’histoire de l’amputation. Ce cycle éthique est composé de recommandations générales en phase de forte incidence de l’amputation et d’une éthique de la décision opportuniste en phase de faible incidence de l’amputation.

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L’agriculture biologique contribue-t-elle au bien-être ?

A travers l’étude de cas d’une association de producteurs de fruits et légumes biologiques en Pays de la Loire (Bio Loire Océan), cet article propose quelques pistes pour appréhender les liens potentiels entre agriculture biologique et bien-être. Dans les cas rencontrés par les auteurs, l’approche utilitariste des économistes du bien-être se révèle peu utile pour analyser ces liens. Les mesures multidimensionnelles des déterminants du bien-être, telles que celle proposée par le rapport Stiglitz (Stiglitz, Sen et Fitoussi, 2009), s’ avèrent plus opérationnelles en la matière. S’appuyant sur cette grille de lecture, l’article met en évidence le fait que ce lien est dual. S’il est possible de dire que, sur certains points, l’agriculture bio favorise la production de capabilités et la qualité de vie sur le territoire considéré, il apparaît également que la recherche de bien-être est au cœur du projet politique des producteurs rencontrés.

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Return and Volatility performance comparison of Ethical and Non-ethical publicly-listed financial services companies

Cette étude compare le rendement et la volatilité des performances des sociétés financières éthiques et non-éthiques cotées, par leur mémoire longue et la volatilité des propriétés d'asymétrie. Ce papier constate que la volatilité des rendements quotidiens du cours des actions des deux groupes de sociétés financières peut être utilisée pour prédire les valeurs futures. Elles suivent également les fondamentaux du marché en présentant des propriétés de réponse à la volatilité asymétriques, ne sont pas à l'abri des chocs négatifs et des pertes d’expérience dans les ralentissements économiques. Toutefois, une constatation montre que les entreprises financières éthiques ont généralement des rendements plus élevés et une volatilité plus faible que leurs homologues non-éthiques. Cela peut être attribué à la perception positive du public investisseur sur les entreprises éthiques, qui invite plus d'investisseurs potentiels en leur fournissant les flux d'investissement stables. Cette étude encourage les gestionnaires de fonds et des investisseurs dans l'addition en continu des instruments de placement éthiques et à créer des portefeuilles liés aux initiatives de responsabilité sociale des entreprises. Les résultats peuvent également offrir plus de compréhension des caractéristiques des sociétés financières éthiques, et ouvrir des voies futures de recherche pour les universitaires et les chercheurs.

Keyphrases: philosophie, éthique, économie, philosophie, éthique, économie, entreprises éthiques et non-éthiques, rendements financiers, volatilité, modèles à mémoire longue, asymétrie de la volatilité
Population Ethics, Social Choice Theory, and Two problems in the Measurement of Economic Poverty

Les ratios par tête et total sont des mesures monétaires alternatives de la pauvreté, dont le premier est de loin l'indice le plus largement utilisé dans la littérature sur la mesure de la pauvreté. Les deux indices, impliquant des variables de populations, peuvent présenter des jugements contradictoires sur la pauvreté à la fois en coupe transversale et en comparaisons chronologiques. Le taux de pauvreté peut également constituer une violation d'une exigence intuitivement attrayante de « vecteur dominance » dans les comparaisons de la pauvreté. Le présent essai retrace certaines de ces difficultés relatives aux questions d'éthique liées à la population et aux principes de choix social. Le point essentiel de l'essai est que les conventions apparemment inoffensives et largement observées dans la mesure de la pauvreté sont en fait compatibles avec des problèmes de cohérence à la fois logique et normative.

Keyphrases: philosophie, éthique, économie, philosophie, éthique, économie, Éthique des populations, Principe de circonscription, Théorie du choix social, principe de Pareto, axiome d’unanimité de sous-groupe
Addition of exogenous polypeptides on the mammalian reovirus outer capsid using reverse genetics

L'addition aux capsides virales de séquences peptidiques exogènes est une approche puissante pour l'étude des processus d'infection virale ou pour cibler des virus vers des types cellulaires bien définis. Jusqu'à récemment, il n'était pas possible de manipuler le génome du réovirus de mammifères et ceci était un obstacle à l'addition de telles étiquettes exogènes sur la capside d'un virus pouvant se répliquer. Cet obstacle a maintenant été surmonté par la mise au point d'un système de génétique inverse à base de plasmides. Dans la présente étude, la génétique inverse a été utilisée pour introduire différents peptides exogènes, jusqu'à 40 acides aminés de longueur, à l'extrémité carboxyle de la protéine de capside externe σ1. Les virus obtenus étaient infectieux, produisent des plages de taille similaire, et peuvent être propagés facilement. Cependant, les efforts pour introduire une séquence de 750 nucléotides de longueur ont été infructueux, même lorsqu'un codon de terminaison était introduit avant celle-ci, suggérant une limite de taille au niveau des acides nucléiques.

Keyphrases: Virus, Virus oncolytiques, Génétique inverse, Epitope, Épitope
Amino acids substitutions in σ1 and μ1 outer capsid proteins of a Vero cell-adapted
mammalian orthoreovirus are required for optimal virus binding and disassembly

Dans une étude récente, le réovirus de sérotype 3 (souche Dearing) a été adapté aux cellules Vero, cellules qui possèdent une capacité limitée à supporter les étapes précoces de décapsidation de réovirus et qui sont incapables de produire de l'interféron comme réponse antivirale lorsqu'elles sont infectées. Le virus adapté (VeroAV) possède des substitutions d'acides aminés au niveau des protéines de capside externe σ1 et μ1, mais ne présente pas de changement au niveau de la protéine σ3. Comme attendu, le virus ne se comporte donc pas comme un mutant de décapsidation classique. Dans la présente étude, une augmentation de la capacité du virus à se fixer à la surface des cellules Vero a été observée et est probablement associée à une augmentation de la fixation aux acides sialiques de la surface cellulaire. De plus, la cinétique de relâche de μ1 à partir des virions semble altérée. L'approche de génétique inverse a permis de confirmer l'importance des substitutions d'acides aminés de la protéine σ1 dans la capacité de VeroAV à infecter les cellules Vero de manière efficace, bien que la coadaptation de μ1 apparaisse nécessaire pour optimiser l'infection virale. Cette approche combinant la sélection in vitro de réovirus à la génétique inverse pour découvrir des substitutions importantes d'acides aminés apparaît prometteuse dans le contexte de la modification de réovirus afin d'accroître son potentiel en tant que virus oncolytique.

Keyphrases: Virus, Réovirus, Génétique inverse, Virus oncolytiques
Amino acid substitutions in σ1 and μ1 outer capsid proteins are selected
during mammalian reovirus adaptation to Vero cells

L'établissement de la persistance virale en culture cellulaire a précédemment mené à la sélection de mutants de réovirus, bien que peu d'entre eux aient été caractérisés en détail. Dans la présence étude, le réovirus a été adapté aux cellules Vero qui, contrairement aux cellules L929 classiquement utilisées, sont peu efficaces pour les étapes précoces de décapsidation de réovirus et sont également incapables de produire de l'interféron comme réponse antivirale, lorsqu'infectées. Le réovirus adapté aux cellules Vero porte des substitutions d'acides aminés à la fois dans les protéines σ1 et μ1. Ceci contraste avec les mutants de décapsidation des cellules L929 infectées de manière persistante, aussi bien que chez divers autres types de cellules, qui présentent généralement des substitutions d'acides aminés au niveau de la protéine de capside externe σ3. Le virus adapté aux cellules Vero demeure sensible à un inhibiteur de protéases lysosomales; de plus, en absence de pression de sélection, le virus a perdu en partie sa capacité à résister à l'interféron. La position des différentes substitutions d'acides aminés sur la structure connue de la protéine suggère un effet sur la fixation de la protéine virale σ1 à la surface cellulaire et sur l'élimination de la protéine μ1 de la capside externe du virus.

Keyphrases: Virus, Réovirus, Mutant, Persistance virale, Décapsidation
La génétique inverse dans l'étude des réovirus: Progrès, obstacles et développements futurs

En génétique dite « classique », l’examen d’un phénotype conduit à l’étude des gènes impliqués dans son obtention. La génétique inverse est une méthode expérimentale très puissante dans laquelle, au contraire, le matériel génétique est modifié et utilisé pour reconstruire un organisme complet, afin de déterminer le résultat de ces modifications. Cette approche est spécialement bien adaptée à l'étude des virus, compte tenu de la relative simplicité et de la petite taille de leurs génomes; l’obstacle principal demeure de récupérer des virus infectieux à partir de génomes viraux clonés. Au cours des années, cet exploit a été accompli pour des représentants de presque toutes les familles de virus de mammifères. Jusqu’à récemment, les Reoviridae, virus à génome d'ARN bicaténaire segmenté, faisaient toutefois exception. Dans cette revue, les progrès réalisés vers la mise au point de la génétique inverse pour l'étude du réovirus seront discutés. La génétique inverse pourrait avoir un impact majeur dans l'optimisation de nouvelles souches de réovirus pour leur utilisation en thérapie comme agents oncolytiques et pour le développement de vaccins dans le cas des rotavirus et des orbivirus. Les travaux actuels font toutefois ressortir les limites de l'approche, la nécessité d’une analyse prudente des résultats obtenus, ainsi que le besoin de développer des systèmes plus efficaces et polyvalents.

Keyphrases: Virus, Réovirus, Virus oncolytiques, Mutagenèse, Génétique inverse
Une approche fréquentielle pratique pour l'échantillonnage adaptatif en espace image

En synthèse d'images réalistes, l'intensité finale d'un pixel est calculée en estimant une intégrale de rendu multi-dimensionnelle. Une large portion de la recherche menée dans ce domaine cherche à trouver de nouvelles techniques afin de réduire le coût de calcul du rendu tout en préservant la fidelité et l'exactitude des images résultantes. En tentant de réduire les coûts de calcul afin d'approcher le rendu en temps réel, certains effets réalistes complexes sont souvent laissés de côté ou remplacés par des astuces ingénieuses mais mathématiquement incorrectes.  Afin d'accélerer le rendu, plusieurs avenues de travail ont soit adressé directement le calcul de pixels individuels en améliorant les routines d'intégration numérique sous-jacentes; ou ont cherché à amortir le coût par région d'image en utilisant des méthodes adaptatives basées sur des modèles prédictifs du transport de la lumière.  L'objectif de ce mémoire, et de l'article résultant, est de se baser sur une méthode de ce dernier type[Durand2005], et de faire progresser la recherche dans le domaine du rendu réaliste adaptatif rapide utilisant une analyse du transport de la lumière basée sur la théorie de Fourier afin de guider et prioriser le lancer de rayons. Nous proposons une approche d'échantillonnage et de reconstruction adaptative pour le rendu de scènes animées illuminées par cartes d'environnement, permettant la reconstruction d'effets tels que les ombres et les réflexions de tous les niveaux fréquentiels, tout en préservant la cohérence temporelle.

Keyphrases: Fourier, Transport de la lumière, Echantillonnage adaptatif, Reconstruction, Filtrage, Synthèse d'images, Reconstruction
Développement et implémentation du jeu des vingt questions

Ce document est un rapport de stage de maitrise qui portait sur la réalisation d'un jeu de 20 questions (20Q) consistant à faire deviner par l’ordinateur un objet d'une maison ou un environnement choisi par le joueur. L’ordinateur pose des questions en langue naturelle et analyse les réponses des joueurs. Ce jeu de 20Q a pour but de faire la publicité gratuite de l'entreprise d'accueil, North Side Inc. 20Q est lié au projet Bot Colony, un jeu vidéo développé par l'entreprise basé sur la capacité de conversation et de compréhension des personnages du jeu. Cette technologie est utilisée dans 20Q sous forme de digressions et aussi indirectement au sein de l'algorithme, des définitions et des liens avec les besoins humains. 20Q est présenté sur une plateforme web qui permet au joueur un accès libre et gratuit à travers le portail de Bot Colony. Pour susciter l'intérêt des joueurs et attirer plus d'internautes, nous avons ajouté un aspect de compétition avec un système de classement et de points. Nous présentons également le déroulement du stage au sein de l’entreprise.

Keyphrases: digressions, 20 questions, sémantique, interactivité, compétition
Environnement virtuel générateur d’émotions

Les émotions jouent un rôle important dans la prise de décision quotidienne. En effet, elles influencent grandement la manière dont les individus interagissent avec leur environnement. Dans cette étude nous avons premièrement conçu un environnement virtuel de conduite automobile, puis créé des scénarios générateurs d’émotions à l’aide de la méthode Belief-Desire-Intention. Nous avons évalué l’efficacité de ces scénarios   à l’aide d’un groupe de 30 personnes et d’un casque électroencéphalogramme pour mesurer leurs émotions. On observe que plus de 70% des scénarios conçus avec cette méthode ont généré l’émotion que l’on avait anticipée chez 52% à 76% des participants. La deuxième phase de cette expérience porte sur la réduction d’émotions avec un agent correcteur. Nous avons noté une efficacité de la réduction des émotions allant de 36.4% jusqu’à 70.0% des participants à travers les différents scénarios.

Keyphrases: Modèle bdi, Environnement virtuel, Génération d’émotions, Création de scénarios générateurs d’émotions, Conduite avec eeg
Evaluating perceptual maps of asymmetries for gait symmetry quantification and pathology detection

Le mouvement de la marche est un processus essentiel de l'activité humaine et aussi le résultat de nombreuses interactions collaboratives entre les systèmes neurologiques, articulaires et musculo-squelettiques fonctionnant ensemble efficacement.  Ceci explique pourquoi une analyse de la marche est aujourd'hui de plus en plus utilisée pour le diagnostic (et aussi la prévention) de différents types de maladies (neurologiques, musculaires, orthopédique, etc.).  Ce rapport présente une nouvelle méthode pour visualiser rapidement les différentes parties du corps humain liées à une possible asymétrie (temporellement invariante par translation) existant dans la démarche d'un patient pour une possible utilisation clinique quotidienne.  L'objectif est de fournir une méthode à la fois facile et peu dispendieuse permettant la mesure et l'affichage visuel, d'une manière intuitive et perceptive, des différentes parties asymétriques d'une démarche.  La méthode proposée repose sur l'utilisation d'un capteur de profondeur peu dispendieux (la Kinect) qui est très bien adaptée pour un diagnostique rapide effectué dans de petites salles médicales car ce capteur est d'une part facile à installer et ne nécessitant aucun marqueur.  L'algorithme que nous allons présenter est basé sur le fait que la marche saine possède des propriétés de symétrie (relativement à une invariance temporelle) dans le plan coronal.

Keyphrases: Analyse de la symétrie de la marche, Kinect, trouble locomoteur, positionnement multidimensionnel (MDS), réduction de dimensionnalité non linéaire, carte de couleur perceptuelle, invariance par décalage temporel, Kinect
Rôles sociaux et consommation d’alcool des femmes et des hommes au Canada : une analyse située du rôle parental

Cette thèse de doctorat a pour objectif d’examiner de quelles manières le rôle parental influence la consommation d’alcool des femmes et des hommes et plus précisément, si les relations dynamiques entre le rôle parental, les circonstances au sein desquelles il est mis en acte et les contextes immédiats de consommation permettent d’expliquer les différentes façons individuelles de consommer de l’alcool. Cette étude repose sur le constat qu’en alcoologie, il existe une tendance à considérer l’acteur et l’action comme étant détachés de leur cadre social immédiat. Conséquemment, il existe des limites importantes aux modèles permettant d’expliquer les mécanismes par lesquels les rôles sociaux influencent la consommation d’alcool.   Afin d’avoir une meilleure compréhension sociologique de la consommation d’alcool, cette thèse propose un cadre théorique qui insiste fortement sur la nécessité de tenir compte de la situation. L’acteur agit en fonction de certaines circonstances (perception de conflit de rôles) au sein desquelles son rôle est mis en acte. L’action de boire est dépendante du contexte (caractéristiques spatiales, temporelles, symboliques et relationnelles) au sein duquel l’action se déroule. L’hypothèse générale de recherche stipule que pour comprendre la relation entre les rôles et la consommation d’alcool, il faut situer à la fois l’acteur et l’action.   La validité empirique du cadre théorique a été testée à partir d’une analyse quantitative des données de l’enquête GENACIS Canada (GENder Alcohol and Culture: an International Study) ainsi que des données de l’Enquête sur les Toxicomanies au Canada. La présentation des résultats des analyses prend la forme de trois articles soumis pour publication.  Les données analysées révèlent le bien-fondé du cadre de théorique proposé. Situer l’action a permis de constater que les contextes de consommation sont un médiateur de la relation entre le rôle parental et la consommation d’alcool et plus spécifiquement, que les parents boivent moins fréquemment de façon excessive que les non-parents parce qu’ils boivent dans des lieux différents. Situer l’action a aussi révélé que les femmes et les hommes ont tendance à adopter des comportements de boire qui s’accordent au contexte immédiat, plutôt qu’à la position qu’ils occupent. Par contre, observer les circonstances individuelles au sein desquelles le rôle parental est mis en acte n’a pas permis d’améliorer notre compréhension de la relation à l’étude.   Les évidences scientifiques apportées par cette thèse de doctorat ouvrent la porte au développement de mesures préventives environnementales qui visent le contexte de l’action plutôt que l’acteur, pour limiter la consommation excessive d’alcool des femmes et des hommes.

Keyphrases: consommation d'alcool, rôles sociaux, rôle parental, genre, circonstances, contextes de consommation, modèles de médiation et de modération, sociologie, Canada, gender, Canada
L’expression de l’identité d’aidant dont le proche est atteint de la maladie d’Alzheimer

Nous ne pouvons, désormais, ignorer l’implication des aidants familiaux au sein du dispositif des soins de santé. Lors de l’apparition d’une maladie chronique, telle une démence de type Alzheimer, certains aidants prennent considérablement part dans les soins, au risque de sacrifier leur propre santé physique et mentale. Cette population est maintenant considérée vulnérable sur les plans physiques, psychologiques et sociaux, et requiert un soutien adapté à ses besoins. Par ailleurs, la gestion de la prise en charge, ainsi que les stratégies employées par les aidants, sont loin d’être homogènes et varient d’un aidant à un autre. Objectif : Afin d’améliorer le soutien destiné aux aidants, ce mémoire vise à illustrer l’importance de considérer les types de soutien adoptés et à analyser le sens donné par l’aidant dans le soutien envers un proche atteint de démence de type Alzheimer. Sujets : Six aidants familiaux soutenant un proche (conjoint(e) ou parent) atteint de démence de type Alzheimer ont été rencontrés à plusieurs reprises, à un intervalle d’une année et demi, et ce jusqu’au décès du proche. Méthode : L’approche qualitative longitudinale a permis l’analyse des 16 entretiens afin de mieux cerner les types de soutien employés par les aidants à partir des typologies d’aidants élaborées par Clément, Gagnon, & Rolland (2005) et Pennec (2002) et l’identité d’amour de compassion détaillée par Underwood (2009). Les identités décrites par ces auteurs s’avèrent être des idéaltypes inexistants tels quels dans la réalité. Résultats : À l’exception d’un sujet, tous les aidants ont adopté des traits et des stratégies de gestion de prise en charge se rapportant à plus d’une identité d’aidant. Dans le cas de l’aidante à qui nous n’avons pas pu apposer une identité, peu d’information au niveau de ses stratégies dans la gestion de la prise en charge a été partagée. Ceci serait probablement dû au fait que l’aidante est très peu organisée dans le soutien et qu’elle prend peu d’initiatives, étant elle-même atteinte de démence de type Alzheimer. Conclusion : Afin de mieux adapter les services et le soutien destinés aux aidants familiaux, il importe de mieux comprendre les stratégies de soutien des aidants et leur évolution.

Keyphrases: Aidants familiaux, Démence de type Alzheimer, Identité d'aidant, Stratégie de prise en charge, Fardeau