Systématique, biogéographie et diversification du genre Crudia (Leguminosae, Detarioideae)

Le genre Crudia Schreb. présente une distribution pantropicale et une richesse spécifique élevée, inhabituelles pour un genre appartenant à la sous famille des Detarioideae (Leguminosae). Les espèces de Crudia, réparties en Amérique du Sud, en Afrique de l’Ouest et en Asie du Sud Est, ont fait l’objet de plusieurs études de taxonomie indépendantes, réalisées par plusieurs auteurs successifs. En revanche, l’évolution et l’histoire biogéographique du genre sont inconnues à ce jour. Afin de mieux comprendre l’histoire évolutive de Crudia, nous proposons une approche pluridisciplinaire visant à mettre à jour les connaissances à propos de ce genre méconnu. La première partie de cette étude a pour objectif de réaliser une révision taxonomique des espèces asiatiques du genre Crudia, les espèces africaines et américaines ayant déjà été traitées par d’autres auteurs. Nous avons pour cela utilisé des méthodes de taxonomie traditionnelle en compilant des données morphologiques sur un grand nombre de spécimens d’herbier. Sur les trente-cinq espèces initiales décrites en Asie, nous en avons retenu quatorze et avons ajouté une nouvelle espèce. Les autres espèces ont été mises en synonymie pour la plupart, exceptée l’une d’entre elle qui est à présent considérée comme douteuse. Suite à ces réassignations taxonomiques, les distributions géographiques respectives des espèces ont été réévaluées et des nouveaux statuts de conservation ont été proposés. La seconde partie de cette étude a pour objectif de poser un cadre conceptuel afin d’étudier dans le détail l’évolution de ce genre, son histoire biogéographique et les relations entre espèces. Nous avons pour cela séquencé cinq régions nucléaires (ITS, ETS, AGT1, CALTL, AIGP) pour de nombreux spécimens, principalement prélevés sur des échantillons d’herbiers (K, US, P, L, WAG, U). Les phylogénies réalisées montrent que Crudia est monophylétique et possède une structure interne bien définie, avec un clade regroupant toutes les espèces asiatiques et un autre regroupant les espèces africaines et américaines, ces dernières formant elles-mêmes un clade clairement identifiable. La reconstruction de l’histoire biogéographique, associée à la datation à l’aide d’un macrofossile, montre que Crudia trouve son origine en Afrique au cours de l’Éocène, puis subit deux évènements indépendants de dispersion vers l’Amérique du Sud et vers l’Asie au cours de l’Éocène moyen. La troisième partie de cette étude a pour objectif d’identifier si la richesse spécifique du genre Crudia pouvait être associée à un évènement de changement des taux de diversification au cours du temps, mais également savoir si les niches écologiques des différentes espèces étaient semblables à travers l’aire de distribution du genre au complet. Nous avons utilisé pour cela des données d’occurrences des espèces, ainsi que des données reliées au régime de précipitations et à la température. Parallèlement, les taux de diversification ont été étudiés à l’échelle du genre et à l’échelle des Detarioideae. Au final, il s’est avéré que les niches écologiques différaient d’un continent à l’autre, et qu’il n’existait pas de changement des taux de diversification dans le genre Crudia pouvant être relié précisément à la richesse spécifique. Le nombre élevé d’espèces au sein du genre Crudia pourrait en revanche être lié à un âge relativement plus vieux de ce genre, comparé aux autres genres évolutivement proches.

Keyphrases: Crudia, Detarioideae, Révision taxonomique, Phylogénie, Biogéographie, Datation, Systématique, Niche écologique, Diversification, Phylogeny