NCube/papyrus huggingface dataset:
Les relations ville-port selon une approche d’écologie territoriale : le cas de Montréal

Les villes et les ports entretiennent un lien historique très étroit, qui s’est profondément modifié depuis la seconde moitié du XXème siècle, et particulièrement depuis les années 1990. Leurs relations se sont alors complexifiées, connaissant une hausse des conflits.  Les profondes mutations qu’ont connues les relations ville-port ont eu des répercussions sur les enjeux empiriques et théoriques de ce champ de recherche, rendant nécessaire une nouvelle approche et un nouveau modèle.  Notre objectif de recherche a donc été de développer un nouveau modèle des relations ville-port basé sur une approche d’écologie territoriale. Il s’agit d’un outil d’aide à la décision pour les décideurs urbains et portuaires. Les études successives des vulnérabilités de la ville, du port et de l’interface issues des différents processus ont ainsi été intégrées dans un système socio-écologique.  Notre analyse considère la ville portuaire de Montréal, dont les processus à l’œuvre à l’interface ville-port – processus de gouvernance, processus économiques, socio-spatiaux et environnementaux – apparaissent pertinents pour valider un modèle de conciliation des enjeux théoriques et empiriques tant urbains que portuaires.  Les résultats suggèrent d’importantes vulnérabilités dans tous les processus, mais tout particulièrement la gouvernance. Par ailleurs, les enjeux sociaux et environnementaux peinent à trouver leur place face aux considérations économiques, ce qui est renforcé par la difficulté des territoires à s’imposer face aux enjeux globaux jugés supérieurs. Nous pensons qu’une démarche d’écologie territoriale est un moyen pour les villes et les ports de cohabiter et de tirer avantage des processus globaux. L’originalité de notre recherche est de renouveler l’approche du champ des relations ville –port, introduisant pour la première fois une démarche d’écologie politique et territoriale dans la géographie des transports. L’utilisation de la théorie des systèmes socio-écologiques est nouvelle dans ce champ de recherche. C’est l’occasion de documenter les enjeux empiriques depuis les années 1990 et de concevoir un nouveau modèle, qualitatif, apte à analyser les enjeux théoriques renouvelés.

Keyphrases: Géographie des transports, Relations ville-port, Système socio-écologique, Écologie politique, Écologie territoriale, Montréal, Vulnérabilité
L’elocutio en 1 Corinthiens : inventaire, stratégie et herméneutique

Cette thèse analyse 1 Co comme une œuvre de la littérature grecque du 1er siècle. L’hypothèse heuristique est la suivante : il y a un style épistoral mis en œuvre par Paul pour porter au mieux son message. Destinée à être lue, l’épître est aussi discours, et la lettre joue avec les modalités de l’écrit et de l’oral, ce qui lui confère un style original. Cette recherche se focalise donc sur l’elocutio, élément qui définit en rhétorique le style, et regroupe tous les procédés, qu’ils soient lexicaux, syntaxiques ou poétiques, propres à caractériser le mode d’expression. Notre étude propose une lecture minutieuse, in extenso, de 1 Co, en laissant le texte révéler sa dimension sonore. La méthodologie comprend une phase de repérage des procédés les plus fréquents qui soutiennent l’oralité de l’écriture de Paul. À partir de cet inventaire, les grands traits stylistiques sont identifiés. Le processus poétique éclaire le développement thématique de la missive, riche d’une dynamique propre au dialogue et d’une cartographie sonore destinée à la mise en voix de la lettre. La conclusion à laquelle aboutit une telle lecture est que l’oralité constitue une composante essentielle de la stratégie de Paul en 1 Co. Il y a un lien entre le style déployé par l’auteur et les enjeux de la lettre. On peut dès lors parler d’une herméneutique de l’oralité. À partir des critères du style oral proposés par Walter Ong, cette thèse propose pour finir une définition de l’elocutio de 1 Co qui montre à quel point Paul met en œuvre une poétique au service de sa politique. Celle-ci est double : rectifier et édifier. Entre un style combattif et un style réconciliant, la lettre déploie un discours tout orienté vers la figure du Christ ressuscité. L’inouï du kérygme paulinien donne lieu à une créativité stylistique qui convertit la rhétorique, au sens large du terme, en une rhétorique de la conversion.

Keyphrases: 1er siècle, Nouveau Testament, Paul de Tarse, 1 Corinthien, épistolaire, style, elocutio, rhétorique, oralité, Walter Ong
Religious Peacebuilding in the Great Lakes Region of Africa : The Role of Three Christian Churches in Goma, DRC (1992-2012)

Depuis les années 90, les pays de la région des Grands Lacs Africains sont en proie à une recrudescence de conflits violents se propageant dans toute la région. Les conséquences de ces conflits en République Démocratique du Congo (RDC) se concentrent plus dans les provinces orientales et particulièrement le Nord Kivu. Plusieurs travaux consacrés à ces conflits ont axé leur recherche sur l’édification étatique au détriment des acteurs non-étatiques locaux. Ils portent peu d’attention au rôle de ces derniers et contestent même leur légitimité. La contribution de cette recherche repose sur la compréhension du rôle des acteurs religieux dans la construction de la paix à Goma. A ma connaissance, aucune recherche ethnographique relative à la contribution des acteurs religieux à Goma à la construction de la paix, n’existe. Il faut préciser que cette ville était récemment (Novembre 2012) sous le contrôle des rebelles du mouvement du 23 Mars (M23). Cette recherche marque son originalité par le choix de son échantillon, qui inclut non seulement les leaders religieux, mais aussi les membres à la base de trois différentes Églises : Catholique, 3ème Communauté Baptiste au Centre de l’Afrique (3ème CBCA) et Arche de l’Alliance. Le choix méthodologique de la présente recherche est principalement guidé par cette question : « Comment les membres des Églises Catholique, de la 3ème CBCA et de l’Arche de l’Alliance perçoivent-ils et décrivent-ils leur rôle dans la construction de la paix à Goma? » La méthode qualitative d’étude des cas utilisée inclut trois sources de collecte de données: (1) 40 interviews semi-dirigées, (2) des observations directes non participatives à Goma, (3) un questionnaire de 39 questions (à choix multiples et à développement). Les résultats de cette recherche révèlent l’importance des acteurs religieux qui s’illustrent à plusieurs égards dans leur rôle de médiateurs, en plus de leur rôle particulier plus « traditionnel » en tant que substitution de tâches de l’état post-colonial Congolais en pourvoyant des biens et services aux populations. De plus, nos résultats font aussi état de la nature des relations au sein (et entre) les Églises Catholique, 3ème CBCA et Arche de l’Alliance.

Keyphrases: Goma, Églises, communautés ecclésiales de base, conflit, paix, théologie de la paix, résolution des conflits, transformation des conflits, construction de la paix, Goma, République démocratique du Congo
Perturbation de la membrane cellulaire par des composés cationiques : transport transmembranaire contrôlé et applications biologiques

Les sels contenant des cations organiques sont une classe importante de composés cliniquement utilisés. Ils possèdent de nombreuses propriétés qui sont utilisées pour des applications biologiques, dont, entre autres, la possibilité de perturber les membranes cellulaires. Dans cette thèse, nous nous intéressons particulièrement au débalancement de l’homéostasie induit par l’insertion de certains sels d’imidazolium dans la membrane phospholipidique. La perturbation membranaire qui en résulte ouvre la porte au développement de certaines applications potentielles, telles que le traitement de maladies provenant des dysfonctions du transport ionique transmembranaire, ou bien comme stratégie émergente pour attaquer efficacement des microorganismes indésirables, comme les bactéries multirésistantes, fléau des temps modernes. Pour ce faire, nous avons démontré le transport transmembranaire d’anions effectué par une nouvelle classe de transporteurs mobiles organiques : des sels d’imidazolium fonctionnalisés par des groupements adamantyles. Le contrôle du processus de transport peut être réalisé par l’ajout de cyclodextrines, qui conduit à la formation d’une entité supramoléculaire incapable de perturber la membrane phospholipidique. L’ajout d’un composé invité compétitif permet de disloquer le transporteur du complexe supramoléculaire et de restaurer l’activité de transport transmembranaire. Ce système a ensuite été étudié pour une application potentielle comme stratégie d’administration de médicament contrôlable. La toxicité des sels d’imidazolium contre des bactéries Bacillus thuringiensis a été démontrée comme étant réversible, selon le même modèle que le transport transmembranaire. Nous présentons également un essai spectroscopique simple qui nous permet de quantifier la perméabilisation des membranes des bactéries Escherichia coli. Cette nouvelle approche permet le suivi de la perméabilisation de la membrane bactérienne, induite par le chlorure de benzalkonium ou par d’autres composés cationiques.

Keyphrases: Sels d’imidazolium, Cyclodextrines, Chimie supramoléculaire, Auto-assemblage, Transport ionique transmembranaire, Membranes cellulaires, Cell membranes
Synthèse et fonctionnalisation de borocyclopropanes et développement d’un procédé de synthèse de diazoalcanes non-stabilisés en utilisant la technologie en débit continu

Ce manuscrit résume les travaux qui ont été réalisés dans le cadre de deux thématiques phares du laboratoire du Pr. Charette qui sont la synthèse et la fonctionnalisation de dérivés cyclopropaniques ainsi que la synthèse de composés diazoïques et leur utilisation dans des réactions subséquentes. Il est à noter que l’utilisation de motifs cyclopropaniques est de plus en plus accrue tant dans les composés d’intérêt pharmaceutique que dans les composés destinés à l’agrochimie. De ce fait, le développement de nouvelles méthodologies de synthèse de cyclopropanes diversement substitués et de leur fonctionnalisation sont pertinents. Afin d’accéder efficacement à des cyclopropanes diversement substitués, il a été choisi de s’orienter vers le développement d’une réaction de borocyclopropantion de type Simmons-Smith via l’utilisation d’un carbénoïde de zinc portant une fonction ester boronique de pinacol. Les borocyclopropanes ainsi synthétisés peuvent être engagés dans des réactions subséquentes permettant de créer de nouvelles liaisons C-C et C-O. Par cette approche divergente, il est possible d’obtenir de nouveaux composés cyclopropaniques substitués à partir d’un intermédiaire commun créant ainsi de la diversité structurale. Différentes séries de borocyclopropanes dérivés d’éther allyliques et de styrènes ont pu être synthétisées. Néanmoins, les borocyclopropanes dérivés de styrènes ont été obtenus avec des rendements moyens et des diastéréosélectivités faibles. Ces derniers résultats ont conduit à l’élaboration d’une seconde génération de borocyclopropanation employant cette fois-ci un procédé photochimique induit par un rayonnement UVA en utilisant la technologie de synthèse en débit continu. La mise au point de ce procédé a permis une amélioration significative des rendements pour ce type de transformation. Pour finir, la dernière partie de ce manuscrit est consacrée au développement d’un procédé sécuritaire et efficace de synthèse de diazoalcanes non-stabilisés utilisant également la technologie de synthèse en débit continu. Ce procédé est basé sur l’oxydation d’hydrazones non-protégées par un oxydant métallique immobilisé dans une colonne de verre. Les diazoalcanes ainsi générés sont directement consommés à la sortie du réacteur dans des réactions subséquentes. L’utilisation de la technologie en débit continu prend tout son sens en limitant l’exposition de l’opérateur à des substances très réactives et toxiques que sont les composés diazoïques.

Keyphrases: Simmons-Smith, Borocyclopropane, Carbénoïde de zinc, Photochimie, Débit continu, Composé diazoïque, Simmons-Smith, Borocyclopropane
Caractérisation du microbiote tumoral influençant la réponse immunitaire et de son importance pronostique dans le cancer du sein

Une multitude de processus biologiques, dont l’établissement d’un système immunitaire compétant, sont dépendants des bactéries associées au corps humain qui constituent notre microbiote. L’équilibre des espèces bactériennes qui le composent est primordial puisqu’un débalancement est observé dans plusieurs maladies inflammatoires, dont le cancer. De telles perturbations dans l’intestin peuvent même moduler l’efficacité de certaines immunothérapies ou chimiothérapies. Des études récentes indiquent également que des bactéries peuvent être retrouvées à l’intérieur des tumeurs solides chez l’humain, notamment dans le cancer du sein.  Nous avons émis l’hypothèse que la présence bactérienne dans les tumeurs pouvait jouer un rôle dans la progression du cancer du sein, et ce, en présence ou non de traitements. Nos objectifs étaient d’optimiser une méthode de quantification bactérienne par qPCR, de vérifier la présence de bactéries dans les tumeurs d’une cohorte de patients atteints du cancer du sein et de déterminer si nos résultats pouvaient avoir une signification clinique.   Suite à la validation de la technique de quantification, nous avons montré que des équivalents bactériens sont détectables dans plusieurs fragments des tumeurs de notre cohorte et que ceux-ci sont retrouvés en quantité plus élevée dans le tissu normal adjacent à ces tumeurs. Nous avons aussi montré que la détection de bactéries dans les tumeurs est associée à une meilleure survie des patients. De plus, cette amélioration de la survie en présence de bactéries concerne préférentiellement les tumeurs de grade III ou Luminal HER2+.  Nous croyons que l’étude approfondie du microbiote des tumeurs et de la réponse immunitaire anti-tumorale qui y est associée permettra de définir de nouvelles cibles thérapeutiques et pourra mener à l’amélioration des traitements actuels du cancer du sein.

Keyphrases: Cancer du sein, Infiltration bactérienne, Réaction quantitative de polymérase en chaîne (qPCR), Quantification bactérienne, Gène de l’ARN 16S, Caractéristiques cliniques, Analyse de survie
Mesure de l’activité de la lécithine : cholestérol acyltransférase (LCAT), une enzyme impliquée dans la biogenèse des HDL, par chromatographie liquide - spectrométrie de masse (LC-MS)

La lécithine : cholestérol acyltransférase, ou LCAT, est la seule enzyme plasmatique capable d’estérifier le cholestérol des lipoprotéines circulantes, une fonction importante dans la biogenèse des lipoprotéines de haute densité HDL et le transport inverse du cholestérol. Son activité est définie comme le taux d’estérification fractionnel du cholestérol libre (CL) des HDL (FERHDL). Le FERHDL est un biomarqueur candidat du risque cardiovasculaire. La réaction d’estérification implique l’hydrolyse d’un acide gras estérifié à la phosphatidylcholine (PC) et son transfert au CL, résultant en la formation d’un ester de cholestérol (CE) et d’une lysophosphatidylcholine (LPC). L’objectif de ce travail était de faire la preuve de concept d’une nouvelle méthode de mesure de l’activité LCAT par chromatographie liquide couplée à un spectromètre de masse (LC-MS), qui permet d’identifier et quantifier simultanément tous les substrats et produits de la LCAT. Avec la méthode LC-MS, il a été possible de mesurer le FERHDL comme avec la méthode enzymatique (méthode de référence pour le cholestérol libre), mais aussi des changements au niveau de lipides spécifiques. Les LPC étaient de bons marqueurs candidat de l’activité LCAT, leur abondance étant augmentée de plus de 40% suite à l’incubation. L’activité LCAT a aussi été mesurée dans des plasmas humains enrichis de plusieurs doses de LCAT humaine recombinante et les doses de 4 et 8 μg/mL suffisaient à produire des différences significatives, comparées au plasma natif, pour 5 espèces lipidiques outre le CL: les LPC(16:0) et LPC(18:0) et les PC(14:0|18:2), PC(16:0|16:1) et PC(16:0|18:0). Enfin, l’analyse de l’activité LCAT sur des échantillons de plasma humain de la Biobanque de l’Institut de Cardiologie de Montréal (50 témoins et 50 cas ayant une maladie coronarienne athérosclérotique) a permis d’étudier la modulation des espèces lipidiques dans des échantillons plus complexes qu’un groupe de plasma. De ces lipides, la PC(34 :3) était particulièrement intéressante. Son abondance était plus diminuée par l’incubation du plasma à 37°C chez les cas que chez les témoins, ce qui en fait un candidat comme biomarqueur de l’activité de la LCAT. L’application de la LC-MS à l’étude de la LCAT permet donc une meilleure compréhension des changements lipidiques lors de l’incubation du plasma, ce qui ouvre la voie à la découverte de biomarqueurs.

Keyphrases: HDL, Lécithine : cholestérol acyltransférase, Spectrométrie de masse, LC-MS, Cholestérol, Lipidomique
Étude descriptive sur les crises de colère chez les enfants autistes d’âge préscolaire

Les crises de colère sont un comportement problématique fréquent chez les enfants autistes qui induit du stress chez les parents, cause de l’exclusion dans les milieux de garde et est souvent ciblé par les interventions comportementales intensives. Toutefois, peu d’études ont comparé d’un point de vue qualitatif et quantitatif les crises d’enfants autistes à celles d’enfants ayant d’autres conditions pédopsychiatriques. La fréquence, la durée, l’âge du début, les déclencheurs, les facilitateurs, les composantes comportementales, les réponses parentales et la perception des parents sur l’impact des crises à la maison ont été récoltés. Des corrélations entre diverses caractéristiques cliniques et sociodémographiques, et la fréquence des crises ont également été analysées. 48 enfants autistes et 47 enfants ayant diverses conditions pédopsychiatriques (la plupart un retard de langage), âgés de 2 à 5 ans, ont été recrutés. Les résultats montrent que le groupe autiste avait une fréquence plus élevée de crises sans déclencheur apparent et une plus grande proportion d’enfants ayant des crises semblant être déclenchées par des difficultés d’expression, faisant des demandes pendant les crises, recevant ce qu’ils demandent de leurs parents durant les crises. Aucune autre différence significative n’a été trouvée. La fréquence des crises était corrélée de manière significative et similaire dans les deux groupes à l’impact des crises à la maison. Ces résultats suggèrent que l’autisme ne favorise pas nécessairement les crises davantage que d’autres conditions pédopsychiatriques, que les crises ne sont pas un bon indicateur pour différencier les troubles pédopsychiatriques à l’âge préscolaire, mais que des difficultés de communication pourraient jouer un rôle dans les crises d’enfants autistes. Cette étude est également la première à inclure une description détaillée des crises dans un groupe d’enfants autistes.

Keyphrases: Autisme, trouble du spectre de l’autisme, crises, crises de colère, problèmes comportementaux et émotionnels, enfants préscolaires
Impact de la mutation du gène LRPPRC sur la vulnérabilité induite par un stress inflammatoire et nutritionnel in vitro et sur la morphologie cérébrale ex vivo

Le syndrome de Leigh version canadienne-française (LSFC) est une maladie mitochondriale rare causée par la mutation du gène LRPPRC (leucine-rich pentatricopeptide repeat motif containing). Le LSFC est caractérisé principalement par une déficience tissu-spécifique (cerveau et foie) en cytochrome c oxydase (COX), ainsi que par des crises potentiellement fatales d'acidose lactique. Ces crises, qui entraînent la mort de 80% des enfants atteints avant l’âge de 4 ans, peuvent être déclenchées, entre autres, par une infection/inflammation et une surcharge nutritionnelle. À ce jour, aucun traitement existe pour prévenir ces crises. Cette étude vise à caractériser l’impact d'un stress de type inflammatoire et nutritionnel (SIN) sur la mort cellulaire et la fonction mitochondriale dans des fibroblastes de peau de patients atteints de LSFC, de même que l’aspect cérébral chez la souris déficiente en LRPPRC hépatique (HKO). Nous supposons que la mutation de LRPPRC : 1) Entraîne une susceptibilité accrue à un SIN, laquelle est associée à une dysfonction mitochondriale et une mort cellulaire augmentée; 2) Exerce un impact cérébral chez la souris HKO. In vitro, la fonction mitochondriale et la mort cellulaire ont été évaluées 24h après l’exposition à un SIN induit par le facteur de nécrose tumorale alpha (« tumor necrosis factor alpha »; TNF-α) et le palmitate. Le potentiel membranaire (∆Ψm), la production des espèces réactives oxygénées (ERO), la capacité de rétention calcique (CRC) et la respiration cellulaire ont été mesurées afin de caractériser la fonction mitochondriale. L’impact des acides gras oméga-3 (O3), un composé anti-inflammatoire, sur la mort cellulaire et la fonction mitochondriale a également été étudié.  Ex vivo, les populations globale, neuronale et astrocytaire ont été évaluées dans les cerveaux des souris HKO et sauvages (« wild type » ; HWT). Nos résultats démontrent que la dysfonction mitochondriale associée à la mutation du gène LRPPRC rend les fibroblastes moins capables de répondre au SIN. En conséquence, des taux plus élevés de mort cellulaire ont été observés chez les fibroblastes LSFC par rapport aux témoins. Aussi, les acides gras O3 exercent un effet bénéfique par rapport à la modulation de la mort cellulaire et au ∆Ψm. Finalement, l’ablation du gène LRPPRC hépatique cause une perte neuronale dans le tronc cérébral des souris HKO. Notre étude a permis d’identifier certains mécanismes cellulaires impliqués dans la physiopathologie du LSFC. Le rôle thérapeutique potentiel des acides gras O3 devra être considéré dans les recherches futures entourant la maladie.

Keyphrases: Acidose lactique, LRPPRC, cytochrome c oxydase, fibroblastes, palmitate, TNF-α, inflammation, nutrition, oméga-3, mitochondria