NCube/papyrus huggingface dataset:
L’allaitement dans la formation initiale des futurs professionnels de la santé du Québec : parvenir à un consensus sur les objectifs de formation initiale pour améliorer les compétences en allaitement

Bien que l’allaitement exclusif durant les six premiers mois de vie du nouveau-né soit recommandé par les instances nationales et internationales, les mères québécoises n’atteignent pas encore cette cible. Les programmes de formation initiale en santé présentent des lacunes ne permettant pas aux futurs professionnels de santé d’acquérir les compétences en allaitement afin de promouvoir, protéger l’allaitement, et soutenir les mères allaitantes au-delà de la maternité. Un référentiel commun de compétences transversales en allaitement, qui pourrait être utilisé par divers programmes de formation initiale, est souvent recommandé. Cette étude visait l’atteinte d’un consensus d’experts québécois en allaitement et en enseignement de diverses disciplines de santé sur les objectifs transversaux minimaux en allaitement à maitriser dans la formation initiale des futurs professionnels de la santé. Une méthode Delphi a été utilisée pour guider et assembler les opinions du groupe d’experts, à travers trois rondes, vers un consensus final. Une liste préliminaire d’objectifs transversaux minimaux en allaitement à maitriser lors de la formation initiale des professionnels de la santé a été examinée par 33 participants. Suite à la ronde 1, 15 des 29 objectifs ont été validés et estimés pertinents pour les compétences précliniques et de gestion clinique de l’allaitement. Lors de la ronde 2, le consensus a été obtenu pour un objectif supplémentaire. Aucun consensus n’a été obtenu pour les 13 objectifs restants. Cette étude est une étape préliminaire à la création d’un référentiel multidisciplinaire de compétences en allaitement pour tous les professionnels de la santé appelés à soutenir la mère allaitante. Elle contribuera à rehausser la formation en allaitement et ultimement, à améliorer les pratiques et de changer les attitudes des professionnels de la santé au Québec afin de pouvoir soutenir adéquatement et durablement les mères allaitantes, pour le bien-être des nouveau-nés, des mères et de la société.

Keyphrases: Allaitement, Objectifs transversaux, Formation initiale, Delphi
Bien manger en 2015 : perception du concept par des adultes clés agissant auprès d’enfants d’âge préscolaire au Québec

Contexte Le concept de saine alimentation est, en 2015, empreint de confusion. La complexité de ce construit est un frein à l’adoption de saines habitudes alimentaires. Les perceptions associées à ce concept qu’ont les parents et le personnel des services de garde influencent le comportement alimentaire des enfants avec qui ils sont en relation. Les comportements alimentaires des enfants de moins de 5 ans sont d’intérêt car ils ont de fortes chances d’être maintenus tout au long de la vie. Des actions ont été mises en place au cours des dernières années auprès de ces cibles afin d’améliorer leurs pratiques alimentaires. Objectifs Explorer ce que signifie bien manger pour des parents d’enfants d’âge préscolaire, des éducatrices et des responsables de l’alimentation (RA) en milieu de garde au Québec en 2015. Méthode Dans le cadre d’un sondage électronique mené auprès de la population cible, une question ouverte est posée en lien avec les perceptions du « bien manger ». Les réponses qualitatives générées par ce sondage sont analysées selon une approche déductive et inductive avec une grille de codification ainsi que des tests statistiques. Résultats La variété est le sous-thème le plus fréquent parmi les 1753 parents alors que la santé prend la première place parmi les 1055 éducatrices et les 267 RA. Les qualités organoleptiques sont surtout abordées par les RA, alors que les références aux signaux de faim et de satiété se démarquent chez les éducatrices. En général, tous les intervenants font mention de concepts reliés au « bien manger » incluant la variété, la saine alimentation, l’équilibre, la modération ou le plaisir. Conclusion Ce portrait représente les perceptions du « bien manger » qu’ont des acteurs clés auprès d’enfants de 2 à 5 ans en 2015. Ces informations sont utiles pour développer des stratégies de communication rejoignant ces cibles afin de favoriser l’adoption de saines habitudes alimentaires. Les cadres de référence et guides gouvernementaux ont un rôle important dans les recommandations qu’ils intègrent, lesquelles sont reprises par les professionnels actifs en développement de saines habitudes de vie à la petite enfance.

Keyphrases: Saine alimentation, perceptions, parents, éducatrices, responsables de l'alimentation, enfants, Québec
Les perceptions des parents d’élèves du primaire et du secondaire à l’égard des produits et services offerts par les services alimentaires de la Commission Scolaire de Montréal

Contexte : L’obésité est un problème de santé publique important au Canada ainsi que dans une majorité de pays occidentaux. Les environnements dans lesquels les jeunes se développent influencent grandement les comportements et habitudes de vie qu’ils adoptent et conserveront une fois adulte. Suite à la publication, en 2008, de la politique-cadre du gouvernement du Québec pour une saine alimentation et un mode de vie physiquement actif, la Commission scolaire de Montréal (CSDM) l’intègre dans ses établissements en 2011. Depuis son implantation, peu de données ont été recueillies par rapport à son application et à sa portée. Objectif : Mesurer les perceptions et la satisfaction des parents d’élèves du primaire et du secondaire à l’égard des produits et services offerts dans les services alimentaires de la CSDM. Méthodologie : En 2014, les parents ayant au moins un enfant fréquentant une école primaire ou secondaire de la CSDM ont été sollicités par voie électronique afin de participer à un sondage au sujet des services alimentaires. Les participants ont rempli un questionnaire comportant plusieurs questions fermées et se terminant par une question ouverte; «Avez-vous des commentaires additionnels à partager sur les services alimentaires?». Combinant une approche d’analyse inductive et déductive, les données qualitatives ont été analysées séparément via l’utilisation de deux grilles de codification inspirées du marketing des produits et des services.  Résultats : L’analyse a porté sur 1114 éléments de réponses rapportés par 696 parents d’élèves du primaire et 430 éléments de réponses rapportés par 285 parents d’élèves du secondaire. L’analyse fait ressortir une insatisfaction importante des parents tant du primaire que du secondaire par rapport aux produits offerts par les services alimentaires de la CSDM incluant la qualité nutritionnelle des aliments, leur goût, leur qualité et leur variété. Les thématiques associées à l’environnement physique des services alimentaires sont aussi très présentes dans les commentaires des parents. Conclusion : Les résultats démontrent une insatisfaction généralisée des parents par rapport aux produits et services offerts par les services alimentaires des écoles primaires et secondaires de la CSDM. Toutefois, un désir d’utilisation de ces services ressort parmi les réponses des parents si l’offre venait à être plus adaptée à leurs besoins et préoccupations.

Keyphrases: Services alimentaires, École, Parents, Élèves, Primaire, Secondaire, Perceptions, Satisfaction, Dîner, Québec
Étude des signatures géniques dans un contexte d’expériences de RNA- Seq

Le principal intérêt des expériences de séquençage d’ARN (RNA-Seq) est qu’elles consti- tuent une vue d’ensemble sur les procédés géniques intrinsèques de la cellule. L’état malade différe de l’état sain de par son usage génique et de nombreux efforts ont été canalisés dans les dernières années en bioinformatique, pour affiner ces signatures gé- niques, notamment dans la classification de leucémies et le typage de cancers du sein. Tous ces modèles voient, cependant, leur performance détériorée par un grand nombre de dimensions d’entrée et la plupart des auteurs choisissent d’imposer un seuil d’exclusion de gènes. J’ai voulu déterminer la nature d’une signature génique et sa taille optimale, en nombre de gènes. Pour déterminer la taille d’une signature génique j’ai appliqué des algorithmes de co-partitionnements à un sous-ensemble de données transcriptomiques afin d’en extraire la signature génique. Mes résultats indiquent que la signature génique ne peut être extraite en entier et l’utilisation de seuils d’exclusions de gènes est le prin- cipal problème. J’ai exploré une méthode d’extraction de la signature génique avec un réseau de neurones artificiels (ANN) en calculant le plus petit ajustement en expression génique nécessaire pour passer d’un phénotype à un autre. La signature génique extraite indique que presque la totalité des gènes sont affectés pour un phénotype donné. Consé- quemment, il est inapproprié de considérer des méthodes avec seuil d’exclusion de gènes et je propose que les signatures géniques sont des phénomènes omnigéniques. Afin de pallier à l’inconvénient dû à la nécessité d’inclure tous les gènes dans l’analyse, j’ai élaboré une méthode d’apprentissage machine par ANN qui gère simultanément deux espaces : l’espace des gènes et l’espace des échantillons. Les coordonnées des gènes et des échantillons dans leur espaces respectifs sont arrangés de manière à ce qu’ils pré- disent l’expression génique. Ma contribution est donc un modèle qui apprend de manière simultanée les interactions entre les gènes et les interactions entre les échantillons. Ma méthode permet également d’inclure dans l’analyse de jeux de données partiellement manquantes, faisant le lien vers l’intégration de données et l’analyses d’échantillons de séquençage de cellule unique (scRNA-Seq).

Keyphrases: Apprentissage machine, Réduction de dimensionnalité, RNA-Seq, Dimensionnality reduction
Caractérisation du rôle de SCL dans la mégacaryopoïèse et la thrombopoïèse chez les souris transgéniques

SCL est un facteur de transcription qui appartient à la famille bHLH. Dans le système hématopoïétique, SCL est exprimé dans les globules rouges, les mégacaryocytes, les plaquettes et les mastocytes. Chez la souris, la déplétion de SCL cause une absence totale d’érythropoïèse primitive qui mène à une mortalité au jour embryonnaire 9.5. SCL existe principalement sous une forme courte et une forme longue. La forme longue de SCL est très étudiée tandis que la forme courte est très peu caractérisée. Dans le but de comprendre la fonction des 2 isoformes de SCL dans la mégacaryopoïèse et la thrombopoïèse, le laboratoire a produit des lignées de souris transgéniques sur-exprimant chacune des formes de SCL sous le contrôle des éléments régulateurs du facteur de transcription GATA-1. On observe une augmentation de ~40% des mégacaryocytes dans les souris sur-exprimant la forme longue de SCL et un doublement du nombre de plaquettes en comparaison aux souris non transgéniques. Au contraire, une surexpression de la forme courte de SCL cause une diminution de ~50% du nombre de mégacaryocytes. Cependant, la suite de la différenciation des mégacaryocytes en plaquettes est inchangée. De plus, les 2 formes de SCL semblent moduler 2 voies de signalisations (c- Mpl/TPO et c-Kit/SCF) impliquées dans la mégacaryopoïèse. Ces données suggèrent une modulation du programme de différenciation des mégacaryocytes par SCL. La caractérisation des fonctions moléculaires et cellulaires des 2 formes de SCL in vivo permettra d’élucider leurs différentes fonctions. De plus, ces études pourraient mener à l’identification de cibles thérapeutiques pour les désordres de la coagulation.

Keyphrases: Voies de signalisation, SCL, GATA-1, Facteur de transcription, Cellules hématopoïétiques, Mégacaryocytes, Plaquettes
La variabilité technologique et morphométrique des pointes de projectile aurignaciennes en matière osseuse. Implications cognitives, sociales et environnementales

Au cours de la deuxième moitié du SIM3 (entre 41 et 29 ka cal AP), et pour la première fois dans l’histoire de l’humanité, les artisans préhistoriques dispersés sur l’ensemble du continent européen intègrent les matières osseuses – ivoire, os et bois de cervidé – à leurs stratégies technologiques pour la manufacture de pointes de projectile aurignaciennes. Ces technologies comprennent deux catégories, les pointes à base fendue et celles à base massive. Malgré leur standardisation apparente, la variabilité des formes et des dimensions des armatures mérite d’être explorée afin de comprendre en quoi ces données peuvent préciser nos connaissances sur l’organisation technologique de ces sociétés et sur l’histoire de la dispersion des populations d’Homo sapiens en Europe. Dans le cadre de cette thèse, la morphométrie géométrique est adaptée à l’étude de la culture matérielle dédiée aux activités cynégétiques; l’échantillon directement concerné par cette analyse regroupe 547 armatures mises au jour dans 49 sites répartis entre la façade atlantique et les Carpates. Cette approche permet l’identification de huit conceptions volumétriques reproduites par les artisans aurignaciens pour la manufacture des pointes à base fendue, et de deux pour les pointes à base massive, une d’entre elles se déclinant en six variantes. La répartition spatiotemporelle de ces conceptions indique que les pointes de projectile aurignaciennes en matière osseuse ne constituent pas un proxy de la dispersion des Homo sapiens nouvellement arrivés en Europe, mais signalent plutôt la fédération de populations déjà présentes sur le continent et liées les unes aux autres par le développement de stratégies socioéconomiques particulières. Ainsi, l’apparition de ces technologies dans le registre archéologique est interprétée comme une solution aux contraintes imposées par une mobilité accrue des groupes; l’adoption subséquente de l’innovation sur l’ensemble de l’Europe est mise en relation avec l’éruption des champs Phlégréens. Enfin, la mutation typologique observée par le remplacement des pointes à base fendue par celles à base massive suggère des transformations profondes dans la mise en œuvre des stratégies technologiques. Les pointes à base fendue témoignent de l’adoption d’une stratégie planifiée sur le long terme tandis que les pointes à base massive se conforment aux critères attendus dans le cadre d’une stratégie expéditive et ce, indépendamment de la conservation de patrons de mobilité similaires.

Keyphrases: Aurignacien, Paléolithique supérieur, Pointes de projectile, Morphométrie géométrique, Organisation technologique
Exploration des mécanismes responsables de la dichotomie entre la chimiotaxie et la division cellulaire

La division cellulaire (mitose) et la migration cellulaire dirigée vers un gradient de chimioattractants (chimiotaxie) sont deux processus fondamentaux en biologie cellulaire qui impliquent tous les deux la polarisation de la cellule. Dans la mitose, la polarisation de la cellule est bipolaire, définissant des pôles opposés de la cellule vers lesquels les chromosomes et le contenu cellulaire des futures cellules filles en division sont attirés. En revanche, la chimiotaxie nécessite une polarisation unipolaire, définissant un pôle dirigeant (avant) et une queue traînante (arrière). Ces modes de polarisation différents sont fondamentalement incompatibles. Il est donc intuitivement évident qu’une cellule en division aiguë ne peut pas simultanément déclencher un mécanisme de polarisation contradictoire, mais qu’elle doit rester insensible aux signaux chimiotactiques. Étonnamment, la démonstration d’une dichotomie entre mitose et chimiotaxie n’avait pas été faite. De plus, on ignore quand et comment une cellule en division devient insensible aux signaux chimiotactiques.   Dans cette étude, nous démontrons l’existence de la dichotomie entre la chimiotaxie et les phases du cycle cellulaire dont le mode de polarisation est bipolaire, soit la fin de la phase G2 et M dans un modèle humain, les cellules souches pré-B. Nous démontrons que ceci n’est pas dû à une réduction d’expression du récepteur chimioattractant en surface des cellules en phases G2 et M; de plus, la signalisation proximale du récepteur semble intacte. D’autres mécanismes qu’une régulation négative du récepteur chimioattractant lors des phases G2 et M doivent alors être envisagés.

Keyphrases: Phase de G2, Phase de mitose, Chimiotaxie, Dichotomie, Synchronisation cellulaire, Gαi, β-arrestine, ERK 1/2, Cell synchonisation
Les pêcheurs basques au Canada, 1530-1760 : de la culture matérielle à l'identité culturelle

Cette étude propose une synthèse des vestiges architecturaux et de la culture matérielle des sites baleiniers et morutiers basques sur la côte nord du golfe du Saint-Laurent du XVIe au XVIIIe siècle. Elle s’intéresse aux facteurs de continuité et de changement dans les pêches basques sur près de trois siècles, afin de mieux comprendre l’identité de ces pêcheurs. L’origine principalement en Espagne des équipages, l’évolution des techniques de pêche et de chasse à la baleine, les rapports hiérarchiques et de genre au sein des équipages exclusivement masculins, et leurs relations avec les populations autochtones ont été les lignes directrices dans l’étude d’une vingtaine de sites basques. L’analyse des collections conservées à Québec, Ottawa, Saint-Jean et Red Bay (Labrador) et la participation à des fouilles terrestres et subaquatiques d’un site basque à l’île de Petit-Mécatina (Basse-Côte-Nord, Québec) ont été le pivot de nombreuses réflexions. L’analyse contextuelle et comparative de l’ensemble du mobilier retrouvé sur les différents sites a permis de dégager plusieurs traits remarquables de l’identité des pêcheurs basques. Tout d’abord, ils ont laissé une empreinte architecturale durable et délibérément visible dans le paysage côtier. Ensuite, l’analyse des provenances montre que les pêcheurs basques ont tissé des liens commerciaux sur toute la façade atlantique européenne, de l’Andalousie à la Normandie, mais ont également apporté plusieurs productions basques jusque-là non identifiées. Cette thèse démontre que ces pêcheurs formaient une société de gens de mer ouverte à la transmission des savoir-faire dans laquelle l’importance des liens familiaux, l’adaptation au milieu maritime et aux réalités géopolitiques, ainsi que des rapports de réciprocité avec les Autochtones, leur permettaient une relative aisance dans un milieu environnemental parfois hostile.

Keyphrases: archéologie historique, archéologie maritime, Autochtones, Basques, culture matérielle, Espagne, identité culturelle, Labrador, Nouvelle-France, Pays Basque, Québec, Terre-Neuve
Identification de dérèglements épigénétiques embryonnaires associés à une exposition prénatale à l’alcool pendant la période préimplantatoire

Il est connu qu’une exposition prénatale à l’alcool (EPA) peut entrainer des dérégulations épigénétiques dans les cellules du cerveau en développement et être responsable de certains phénotypes du Trouble du Spectre de l’Alcoolémie Fœtale (TSAF) comme les troubles neurodéveloppementaux (TND). Les conséquences d’une EPA très tôt dans le développement sur le paysage épigénétique embryonnaire et extra-embryonnaire sont toutefois peu connues. Notre hypothèse est qu’une EPA durant la période préimplantatoire va initier des dérèglements des profils de méthylation d’ADN qui seront amplifiés et perpétués au cours du développement. Ces dérèglements seront visibles dans le cerveau et le placenta des embryons plus tard dans la gestation. Nous avons développé un modèle murin d’EPA en injectant avec de l’éthanol (EtOH) ou de la saline (Ctrl) des femelles souris gestantes au jour embryonnaire 2.5 (E2.5) soit au stade 8-cellules. Des embryons et placentas furent récoltés aux jours E10.5 et E18.5. Un système d’évaluation morphologique a permis de montrer une augmentation significative des anomalies visibles des embryons EtOH. Les profils de méthylation d’ADN ont par la suite été établis par Reduced Representation Bisulfite Sequencing sur 8 échantillons contrôles et 12 échantillons EtOH de cerveaux antérieurs et de placentas au stade E10.5. Des analyses bio-informatiques ont démontré 686 et 2942 régions différentiellement méthylées (DMTs) respectivement dans le cerveau antérieur et le placenta. Nous avons aussi trouvé 21 DMTs communément affectés dans chacun des tissus. Étonnamment, nous avons aussi observé des différences spécifiques aux sexes dans la dérégulation de profils de méthylation en réponse à l’EPA. Notre étude montre, pour la première fois, qu’une EPA très tôt dans le développement embryonnaire entraine des dérégulations de la méthylation d’ADN perceptibles plus tard dans le développement. Ces résultats nous en apprennent davantage sur comment les perturbations épigénétiques peuvent altérer le fonctionnement normal du cerveau et mener à des TNDs chez les enfants atteints du TSAF.

Keyphrases: Épigénétique, Méthylation d'ADN, Trouble du Spectre de l'Alcoolémie Foetale, Exposition prénatale à l'alcool, Troubles neurodéveloppementaux, Développement embryonnaire, Cerveau, Placenta, Reprogrammation épigénétique, Environnement maternel
« S’il faut rapatrier tout ce qui est sacré, c’est la terre qui va venir à nous ». Le processus de rapatriement des objets culturels et sacrés des Ilnuatsh de Mashteuiatsh, au Québec

Le rapatriement des objets culturels et sacrés autochtones anime les scènes internationales depuis plus de trente ans. Pourtant, peu d’études se concentrent sur les enjeux socioculturels et identitaires sous-jacents à la diversité des requêtes autochtones. Pour apporter une meilleure compréhension de ces enjeux, cette thèse étudie les particularités d’un processus de rapatriement d’objets culturels et sacrés : celui mené par la communauté ilnue de Mashteuiatsh, au Québec, auprès du National Museum of the American Indian (NMAI), de Washington DC. Par quels mécanismes et selon quels enjeux le processus de rapatriement redonne aux mains des Ilnuatsh le pouvoir de définir, d’actualiser et de reprendre un contrôle sur les contenus culturels constitutifs de leur identité culturelle ? Comment ce processus peut-il engager un processus réflexif de définition et d’affirmation de leur héritage culturel et de leur être-au-monde ? En croisant l’étude ethno-historique à l’approche ethnographique, notre méthodologie trouve son origine dans une démarche éthiquement impliquée au sein d’un projet de recherche collaboratif. Poursuivant les avenues théoriques et méthodologiques développées par les approches biographiques et agentives des objets, l’étude retrace la trajectoire de vie de trois types d’objets ilnus conservés au NMAI : deux nimapan (courroies de portage), un mushianiakup (manteau en peau d’orignal) et deux teuehikan (tambours). Nous analysons d’abord comment les savoirs sur ces objets se sont constitués au sein d’un processus collaboratif partagé avec des Ilnuatsh de plusieurs générations. Nous analysons ensuite comment les Ilnuatsh s’approprient le cadre de rapatriement imposé par le NMAI : comment se servent-ils des objets et connaissances associées pour nourrir des formes de justification qui renforcent la reconnaissance de leurs distinctions culturelles ? Pour répondre à cette question, nous nous focalisons sur les enjeux relatifs à l’affiliation identitaire et à la conceptualisation des objets « sacrés ». La notion ilnue « d’objet sacré » développée dans cette thèse contraste avec les catégories conceptuelles imposées par le NMAI. Elle met notamment en lumière toute la complexité du réseau relationnel dans lequel les objets se trouvent investis ; réseau qui évolue aujourd’hui dans des contextes d’affirmation et de légitimation identitaires et culturels.

Keyphrases: Rapatriement des objets culturels et sacrés, Mashteuiatsh, Affirmation identitaire, Muséologie, National Museum of the American Indian