NCube/papyrus huggingface dataset:
From Word Embeddings to Large Vocabulary Neural Machine Translation

Dans ce mémoire, nous examinons certaines propriétés des représentations distribuées de mots et nous proposons une technique pour élargir le vocabulaire des systèmes de traduction automatique neurale. En premier lieu, nous considérons un problème de résolution d'analogies bien connu et examinons l'effet de poids adaptés à la position, le choix de la fonction de combinaison et l'impact de l'apprentissage supervisé. Nous enchaînons en montrant que des représentations distribuées simples basées sur la traduction peuvent atteindre ou dépasser l'état de l'art sur le test de détection de synonymes TOEFL et sur le récent étalon-or SimLex-999. Finalament, motivé par d'impressionnants résultats obtenus avec des représentations distribuées issues de systèmes de traduction neurale à petit vocabulaire (30 000 mots), nous présentons une approche compatible à l'utilisation de cartes graphiques pour augmenter la taille du vocabulaire par plus d'un ordre de magnitude. Bien qu'originalement développée seulement pour obtenir les représentations distribuées, nous montrons que cette technique fonctionne plutôt bien sur des tâches de traduction, en particulier de l'anglais vers le français (WMT'14).

Keyphrases: Analogies, TOEFL, SimLex-999, Accélération, Apprentissage profond, WMT
Risque cardiométabolique et habitudes de vie des adultes atteints de diabète de type 1

Les patients atteints de diabète de type 1 (DbT1) présentent un risque accru de maladies cardiovasculaires. De plus, sous l’influence sociétale et iatrogénique, leur profil de risque cardiométabolique a défavorablement évolué au cours des dernières décennies. Cette population aurait aussi davantage de barrières à l’adoption d’un mode de vie sain. L’objectif de ce mémoire visait à explorer le mode de vie des adultes DbT1 et sa relation avec les facteurs de risque cardiométabolique. Une étude transversale observationnelle menée auprès de 124 adultes DbT1 a permis d’obtenir une caractérisation de leur profil cardiométabolique et de leurs habitudes de vie. Les résultats démontrent que la majorité des adultes atteints de DbT1 n'adoptent pas les saines habitudes de vie recommandées (bonne qualité alimentaire, pratique régulière d’activité physique, non fumeur) et que ceux-ci présentent un profil cardiométabolique altéré comparativement aux adultes DbT1 qui les adoptent. De plus, il y aurait une relation proportionnelle entre l’adoption d’un plus grand nombre de saines habitudes de vie et l’amélioration du profil cardiométabolique. Des études d’interventions ciblant les patients DbT1 et visant à améliorer ces trois grandes composantes des habitudes de vie sont nécessaires.

Keyphrases: Diabète de type 1, Risque cardiométabolique, Double diabète, Habitudes de vie, Qualité alimentaire, Activité physique, Étude observationnelle
Les pratiques sociales à domicile auprès des aînés gais : entre divulgation et dissimulation de l’identité homosexuelle

La recherche portant sur les expériences reliées aux services sociaux et de santé chez les aînés gais reçoit une attention croissante; cependant, les expériences dans le contexte des services à domicile demeurent peu documentées. Les deux principaux objectifs de cette étude sont d’explorer le vécu des aînés gais recevant des services à domicile relativement à leurs stratégies identitaires et de décrire leurs besoins spécifiques en vue de l’adaptation des pratiques sociales à domicile. Les propos de six aînés gais ont été recueillis dans la région de Montréal par entrevues semi-dirigées. Les résultats montrent que les expériences des aînés recevant des services à domicile sont généralement satisfaisantes; parmi eux, certains se sont sentis stigmatisés, mais seulement dans de rares moments et nous ont rapporté avoir plutôt vécu des situations les rendant mal à l’aise. Les résultats présentent aussi une utilisation variée des quatre stratégies identitaires (divulgation active, divulgation passive, dissimulation passive, dissimulation active) d’après une adaptation du modèle d’Eliason et Schope (2001). Si des facteurs individuels et interactionnels ont influencé les stratégies des aînés, ce sont cependant des facteurs contextuels (le type de service d’aide à domicile, le temps, le contexte social immédiat) qui ont pris une importance significative. Enfin, diverses pistes d’action sont à explorer pour l’adaptation des pratiques sociales auprès de cette population, notamment à l’égard de la formation des intervenants sociaux et de la santé, de l’amélioration de l’organisation des services à domicile, du développement de ressources spécifiques et de la contribution du travailleur social auprès des minorités sexuelles âgées.

Keyphrases: Homosexualité, Stratégies identitaires, Vieillissement, Services à domicile, Travail social
The berth allocation problem at port terminals : a column generation framework

Le problème d'allocation de postes d'amarrage (PAPA) est l'un des principaux problèmes de décision aux terminaux portuaires qui a été largement étudié. Dans des recherches antérieures, le PAPA a été reformulé comme étant un problème de partitionnement généralisé (PPG) et résolu en utilisant un solveur standard. Les affectations (colonnes) ont été générées a priori de manière statique et fournies comme entrée au modèle %d'optimisation.  Cette méthode est capable de fournir une solution optimale au problème pour des instances de tailles moyennes. Cependant, son inconvénient principal est l'explosion du nombre d'affectations avec l'augmentation de la taille du problème, qui fait en sorte que le solveur d'optimisation se trouve à court de mémoire.  Dans ce mémoire, nous nous intéressons aux limites de la reformulation PPG. Nous présentons un cadre de génération de colonnes où les affectations sont générées de manière dynamique pour résoudre les grandes instances du PAPA. Nous proposons un algorithme de génération de colonnes qui peut être facilement adapté pour résoudre toutes les variantes du PAPA en se basant sur différents attributs spatiaux et temporels. Nous avons testé notre méthode sur un modèle d'allocation dans lequel les postes d'amarrage sont considérés discrets, l'arrivée des navires est  dynamique et finalement les temps de manutention dépendent des postes d'amarrage où les bateaux vont être amarrés. Les résultats expérimentaux des tests sur un ensemble d'instances artificielles indiquent que la méthode proposée permet de  fournir une solution optimale ou proche de l'optimalité même pour des problème de très grandes tailles en seulement quelques minutes.

Keyphrases: Allocation de postes d'amarrage, Terminaux portuaires, Programmation en nombres entiers mixtes, Partitionnement, Génération de colonnes
Le rôle de sirtuine 3 dans la rétinopathie du prématuré

Dans les pays industrialisés, les rétinopathies ischémiques proliférantes telles que la rétinopathie diabétique et la rétinopathie du prématuré sont les principales causes de cécité chez les individus en âge de travailler et la population pédiatrique. Ces pathologies sont caractérisées par une dégénérescence microvasculaire initiale suivie d’une hyper-vascularisaton compensatoire disproportionnée et pathologique. Les sirtuines constituent une importante famille de protéines impliquées dans le métabolisme et la réponse au stress. Plus particulièrement, sirtuine 3 (SIRT3) est une déacétylase mitochondriale primordiale qui agit au cœur du métabolisme énergétique et de l’activation de nombreuses voies métaboliques oxydatives. Nos résultats démontrent pour la première fois qu’une déficience en SIRT3 diminue la sévérité des lésions vasculaires dans le modèle murin de rétinopathie induite par l’oxygène (OIR). En plus de stimuler l’angiogénèse, l’absence de SIRT3 est aussi associée à une augmentation de la glycolyse, possiblement en activant la famille de gènes 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase (PFKFB). Nous suggérons que le manque de SIRT3 est impliqué dans l’effet Warburg et procure ainsi un avantage prolifératif et protecteur dans l’OIR. La présente étude propose SIRT3 comme nouvelle cible thérapeutique potentielle dans la rétinopathie du prématuré, une maladie dont les complications désastreuses persistent tout au long de la vie.

Keyphrases: Rétinopathie du prématuré, Sirtuine 3, Métabolisme énergétique, Angiogénèse, Stress oxydatif, Glycolyse, Effet Warburg, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase
Les stratégies de soutien des infirmières novices travaillant le soir et la nuit en centre hospitalier

Problématique : De nombreux facteurs individuels, organisationnels et systémiques contribuent au taux de démission élevé des infirmières  en début de carrière. Les infirmières vivent difficilement cette période de transition d’étudiante à professionnelle de la santé.  En plus, cette transition est aggravée par des facteurs tels que des horaires le soir et la nuit auxquels plusieurs infirmières sont contraintes de se plier. La précarité des nouvelles infirmières exige alors un soutien particulier dans leur intégration au sein de la profession. Le but de ce travail dirigé est de mieux comprendre le travail de soir et de nuit et d’émettre des stratégies pour soutenir efficacement les infirmières novices travaillant sur ces quarts en centre hospitalier. Méthode : Une recherche intégrative des écrits est effectuée par la méthode de Galvan (2006) à partir des bases de données CINAHL, Pubmed, Web of Science et MEDLINE. Ce travail s’appuie sur le cadre théorique de la perception du soutien du superviseur immédiat d’Eisenberger (2002).  Résultats : L’analyse des écrits recensés permet d’identifier plusieurs recommandations au niveau de la pratique clinique, l’éducation, la gestion et la recherche.  Conclusion : Ce travail contribue à l’avancement des connaissances infirmières. Il présente des recommandations pour les infirmières-chefs et autres gestionnaires en centre hospitalier. De plus, ce travail sensibilise les infirmières d’expérience et les infirmières travaillant le jour au contexte de travail de soir et de nuit des nouvelles infirmières. Il permet également de constater des lacunes dans la littérature sur le sujet et des pistes pour des recherches ultérieures.

Keyphrases: Infirmière novice, Transition, Assistante infirmière-chef, Infirmière-chef, Soutien du superviseur, Travail de soir, Travail de nuit
Activités pédagogiques en laboratoire favorisant l'intégration de connaissances conditionnelles

Lors de la formation infirmière dans le cadre du programme en soins infirmiers en approche par compétences (APC) au collégial, des étudiantes manifestent de la difficulté à préparer le matériel nécessaire avant d’effectuer une méthode de soins, à respecter les étapes de la méthode et à évaluer la situation pour adapter les soins à la situation clinique. Elles éprouvent de la difficulté à gérer leur stress et leur confiance en elles lors des stages en milieu clinique. L’intégration de connaissances conditionnelles s’avère essentielle pour l’application de méthodes de soins qui tiennent compte de la situation de santé du patient. Il est donc primordial de favoriser l’intégration des connaissances conditionnelles lors de l’apprentissage des méthodes de soins en laboratoire, et de ce fait, soutenir le développement du jugement clinique infirmier. Ce projet de stage a pour but de planifier et mettre en œuvre des stratégies pédagogiques en laboratoire, lors d’application de méthodes de soins, qui favorisent l’intégration de connaissances conditionnelles. Le cadre conceptuel du savoir agir avec compétence de LeBoterf (2006), ainsi que la Démarche d'acquisition et d'intégration des méthodes de soins (DAIMS) de Marcheterre (2004), constituent le cadre conceptuel de ce projet de stage. Dans une formation en soins infirmiers, il permet d'orienter le choix de stratégies pédagogiques qui vont aider l’étudiante à intégrer des connaissances conditionnelles afin d’exercer son jugement clinique dans des situations cliniques diversifiées.   L’activité planifiée et mise en œuvre dans ce projet de stage aide les étudiantes à intégrer des connaissances conditionnelles en leur permettant d’effectuer une préparation par elles-mêmes et d’intervenir adéquatement lors des mises en situation, développant ainsi leur jugement clinique. Le développement de leur jugement clinique devrait contribuer à la sécurité et à la qualité des soins prodigués aux patients.

Keyphrases: Approche par compétences, Connaissances conditionnelles, Laboratoire, Méthodes de soins, Stratégie pédagogique
Les réactions de directions d’écoles de milieux défavorisés aux caractéristiques des écoles performantes de milieux défavorisés

La littérature scientifique sur la direction d'écoles de milieux défavorisés est peu abondante. Cependant, elle identifie des caractéristiques observées de façon récurrente dans les écoles performantes de milieux défavorisés. Dans le cadre d'un programme de recherche plus vaste visant à comprendre le travail de direction d'école de milieu défavorisé, nous avons utilisé ces caractéristiques afin de connaître les réactions de 45 directions d'écoles primaires de l'île de Montréal à leur égard. Bien que connaissant ces caractéristiques, plusieurs directions ont manifesté leurs réticences à l'effet que, dans les écoles performantes, l'apprentissage constitue la priorité. Nous présentons ici cette recherche effectuée en collaboration avec le Programme de soutien à l'école montréalaise (MELS) et nous discutons les résultats, qui nous surprennent.

Keyphrases: Direction d’école, École primaire, Milieu défavorisé
Multisite Research Ethics Review: Problems and Potential Solutions

Les essais cliniques multicentriques à grande échelle ont augmenté en fréquence. À l’heure actuelle, un projet de recherche réalisé dans plusieurs institutions nécessite une évaluation éthique pour chaque établissement. Bien que l’évaluation (institutionnelle) locale peut être nécessaire dans certains cas, les évaluations répétitives peuvent nécessiter des changements inutiles et ne servent pas à protéger davantage les participants. Il a été démontré que le fait d’avoir plusieurs évaluations éthiques d’une seule étude retarde la recherche et exige, dans certains cas, des ressources importantes afin de satisfaire aux demandes des différents comités d’éthique. Cette revue de la littérature aborde les questions conceptuelles et présente les recherches empiriques entourant l’évaluation éthique multicentrique de différentes juridictions. Elle aborde également les méthodes alternatives pour rationaliser le processus d’évaluation éthique, y compris l’évaluation réciproque et l’évaluation centralisée, ainsi qu’une proposition de modification du processus d’évaluation centralisé.

Keyphrases: recherche multicentrique, recherche sur des sujets humains, comité d’éthique de la recherche, comité d’évaluation institutionnel, évaluation réciproque, évaluation centralisée, avis éthique multicentrique
Activité antimicrobienne de peptides provenant d’hydrolysats de protéines de babeurre, de lactoferrine et de pois

Les antibiotiques sont fréquemment utilisés dans l’alimentation de la volaille afin de prévenir certaines maladies, dont l’entérite nécrotique, ce qui occasionne l’émergence de souches bactériennes résistantes aux antibiotiques. Une alternative prometteuse est l’utilisation de peptides antimicrobiens (AMPs) comme suppléments alimentaires, tels les AMPs provenant des produits laitiers. L’objectif du projet était de développer une méthode de production d’extraits peptidiques à partir de coproduits de la transformation alimentaire (babeurre, lactoferrine, isolat de protéines de pois), afin de tester si ces extraits peptidiques possédaient une activité antimicrobienne sur les pathogènes spécifiques aviaires suivants : Salmonella Enteritidis, Salmonella Typhimurium, Escherichia coli et Staphylococcus aureus. Les protéines ont été mises en suspension dans l’eau (5% p/p) et hydrolysées par la pepsine, 6 heures, pH de 2.5. Les peptides furent récupérés par ultrafiltration (< 10 kDa), puis fractionnés selon leur charge nette : totaux, cationiques, anioniques et non liés. L’effet antimicrobien a été évalué surmicroplaques, par la survie bactérienne en présence de concentrations croissantes d’extraits peptidiques. Les extraits cationiques de babeurre ont démontré une efficacité à une concentration inférieure ou égale à 5 mg/mL; perte de 3 log pour Escherichia coli O78 :H80. En comparaison, la lactoferrine cationique a été efficace à une concentration inférieure ou égale à 0.6 mg/mL; perte de 6 log pour E. coli O78 :H80. Les extraits peptidiques du pois ont démontré une efficacité faible. Cette méthode s’avère prometteuse pour le développement d’une alternative ou d’un complément pour la réduction de l’utilisation des antibiotiques dans l’alimentation de la volaille.

Keyphrases: Peptide antimicrobien, Babeurre, Lactoferrine, Pois, Pathogènes aviaires, Chromatographie par adsorption sur membrane, Charge ionique, Lactoferrin
Les effets du vieillissement sur la pharmacodynamie et la pharmacocinétique de la kétamine et de la xylazine chez le rat Sprague-Dawley

Chez les animaux de laboratoire, même si les anesthésiques par inhalation sont généralement plus sécuritaires que les injectables, leur utilité est souvent restreinte lorsqu’un protocole expérimental exige une autre approche. Des combinaisons d’anesthésiques contenant de la kétamine sont considérées comme l’option de choix pour les anesthésies injectables chez les rats. Le vieillissement entraîne des changements dégénératifs au niveau de la structure et la fonction des organes, modifiant souvent à la pharmacocinétique des drogues. Ce projet porte sur l’évaluation des changements pharmacodynamiques (physiologiques, biochimiques et histologiques) et pharmacocinétiques, lors d’une combinaison anesthésique de kétamine-­‐xylazine chez le rat Sprague-­‐Dawley vieillissant. Une anesthésie à la kétamine-­‐xylazine fut induite chez des rats Sprague-­‐Dawley de différents âges. Afin d’évaluer l’effet du vieillissement sur le métabolisme des deux drogues, des prélèvements sanguins périodiques pour l’analyse de la pharmacocinétique ainsi que des mesures des paramètres physiologiques, biochimiques et une histopathologie furent effectués. Le vieillissement a causé certaines modifications notamment en produisant une diminution de la saturation d’oxygène, une baisse marquée de la fréquence cardiaque et respiratoire, une hypoalbuminémie ainsi qu’une augmentation  de la durée d’anesthésie. Les paramètres pharmacocinétiques de la kétamine et de la xylazine furent grandement affectés par le vieillissement causant une augmentation progressive significative de l’aire sous la courbe (AUC) et du temps de demi-­‐vie, ainsi qu’une diminution de la clairance. À la lumière de ces résultats, les doses de kétamine et de xylazine doivent être adaptées chez les rats vieillissants pour permettre une anesthésie de durée raisonnable et un réveil sans complications.

Keyphrases: Rat Sprague-Dawley, Anesthésie, Kétamine, Xylazine, Vieillissement, Pharmacocinétique, Xylazine
Perspectives de l'usage de poudre de jaunes d’oeuf comme additif alimentaire contre Campylobacter jejuni chez le poulet : mode d'immunisation et effet de l’encapsulation

La campylobactériose est une zoonose causée par Campylobacter jejuni, une bactérie commensale du poulet, considérée comme la principale source de contamination humaine. C. jejuni est rarement retrouvé dans le tube digestif des poulets avant deux ou trois semaines d'âge. Ce qui pourrait s'expliquer par la transmission d'une immunité maternelle (anticorps IgY) transmise aux poussins via le jaune d'œuf. À la Chaire de recherche en Salubrité des Viandes (CRSV), la caractérisation d'anticorps IgY extraits de jaunes d'œufs frais a montré des niveaux de production d’anticorps différents selon le mode d’immunisation et suggère, in vitro, des effets sur ce pathogène. Ce qui laisse penser qu'en tant qu'additif alimentaire, une poudre de jaunes d'œuf potentialisée permettrait de lutter contre C. jejuni chez le poulet à griller. Dans ce travail, le processus de fabrication de l'additif (déshydratation par « Spray dry » puis encapsulation) a été évalué et les différents modes d'immunisation des poules pondeuses ont également été comparés. Les anticorps ont été extraits des différentes poudres de jaunes d'œuf ou du produit final encapsulé, et caractérisés in vitro (dosage / ELISA, test de mobilité, bactéricidie, western blot). Puis, une évaluation in vivo de la capacité de ces poudres encapsulées, incorporée à 5 % dans la moulée, afin de réduire ou de bloquer la colonisation intestinale des oiseaux par C. jejuni a été testée. In vitro, les résultats ont montré des concentrations d'anticorps et d'efficacité variables selon le type de vaccination. Dans cette étude, on a observé que le « Spray dry » a concentré les anticorps dans les poudres et que ces anticorps sont restés fonctionnels contre C. jejuni. On a également observé que l'encapsulation n’entraîne pas une perte quantitative des anticorps contenus dans les poudres. Malgré les résultats in vitro encourageants, les résultats in vivo ne révèlent aucune inhibition ou réduction de la colonisation des oiseaux par C. jejuni. L’absence d’efficacité la poudre de jaunes d’œuf encapsulée dans notre étude n’est pas due à une perte quantitative et/ou qualitative des anticorps comme soutenu dans les expériences in vitro. Ce qui démontre que les recherches doivent être poursuivies afin de déterminer les conditions optimales de l'utilisation de la poudre de jaune d'œuf in vivo, en tant qu'additif alimentaire chez les poulets

Keyphrases: Campylobacter jejuni, Colonisation, Poulet à griller, Poudre de jaunes d'œuf, Campylobacter jejuni