NCube/papyrus huggingface dataset:
The implication of cell-derived microvesicles in retinal pigment epithelium degeneration

La dégénérescence maculaire liée à l'âge (DMLA), est la cause la plus fréquente de perte de vision irréversible dans les pays industrialisés, chez les personnes de plus de 65 ans.  La DMLA est une maladie multifactorielle qui existe sous deux formes: la forme sèche et la forme humide. La forme humide qui représente 30% des cas, se caractérise par une néovascularisation choroïdienne pathologique. Des traitements efficaces existent et consiste à bloquer l’action du VEGF. La forme sèche affecte la grande majorité (70%) des patients, demeure actuellement sans traitement. Elle se caractérise par une altération de l'épithélium pigmentaire rétinien (EPR) qui joue un rôle majeur dans l’homéostasie de la rétine. Ces altérations fonctionnelles et structurales se manifestent par des accumulations dans la membrane de Bruch de déchets métaboliques et cellulaires, les drusens. Il a été démontré que le stress oxydatif est le principal facteur qui conduit à la formation de blebs et à la sénescence des cellules de l’EPR.  Notre laboratoire s'intéresse aux effets des microparticules provenant de différents types cellulaires telles que les microparticules dérivées de l’EPR (RMPs). Les microparticules (MPs) sont des fragments membranaires libérés dans l'environnement lors de l'activation cellulaire ou de l'apoptose. Ils sont responsables de diverses fonctions biologiques. Fondé sur notre profil de séquençage de l’ARN, nous avons constaté que les microparticules sont enrichies en microARNs (miARNs). Le let-7f est l'un des miARNs les plus abondants dans les RMPs, et est impliqué dans le dysfonctionnement des cellules rétiniennes induit par le stress oxydatif. L’objectif principal de ce travail est d’étudier les mécanismes d’action des RMPs responsables du dysfonctionnement des cellules de l’EPR. Nos résultats indiquent clairement que dans des conditions de stress oxydatif les RMPs peuvent accélérer la dégénérescence de l’EPR et provoquer des dépôts sous-rétiniens. Selon nos résultats, le let-7f semble jouer un rôle majeur dans l’effet néfaste des RMPs sur les cellules de l’EPR. En conclusion, l’étude du rôle des RMPs dans la dégénérescence rétinienne met en évidence l’intérêt de stratégie visant les miRNA tel que le Let-7f comme cibles thérapeutiques pour traiter la DMLA.

Keyphrases: Microparticules dérivées de l’EPR (RMPs), Stress oxydatif, Dysfonctionnement des cellules EPR, Sénescence, DMLA sèche
Modelling and Reasoning with Software Product Lines with Design Choices

Les gammes de produits logiciels (Software Product Lines)(SPLs) permettent de gérer la variabilité qui apparaît dans les familles de modèles logiciels connexes en raison des variations des besoins des clients. Durant la conception de leurs modifications, les ingénieurs doivent considérer plusieurs conceptions de SPLs alternatives. Cependant, sans informations complètes sur les exigences de qualité souhaitées pour le SPL final, les ingénieurs sont confrontés à une incertitude quant au choix de la conception appropriée. Les formalismes et techniques existants ne conviennent pas à la modélisation et au raisonnement sur l'espace à deux dimensions défini par la variabilité et les choix conceptuels. Nous proposons une approche pour modéliser l'incertitude de conception dans les SPLs et, pour analyser et comprendre l'impact des choix conceptuels sur la qualité des SPLs, exprimé comme des propriétés. Nous définissons formellement les Gammes de produits logiciels avec des choix conceptuels (SPLDCs)(Software Product Lines with Design Choices) et nous décrivons une procédure pour les analyser et fournir une rétroaction appropriée aux ingénieurs basée sur l'ordre partiel des catégories de propriétés de SPLDC. Nous illustrons l'applicabilité de notre approche en utilisant un exemple entirément élaboré qui montre le type de rétroactions nuancées nécessaire pour des analyses significatives des SPLs en présence de choix conceptuels. Pour évaluer l’évolutivité de notre approche, nous utilisons notre approche sur de nombreux SPLDC et enregistrer des temps d'exécution.

Keyphrases: Ingénierie de ligne de produit, Modélisation, Choix de Conception, Incertitude, Variabilité, Design Choices
Real-time rendering of cities at night

En  synthèse  d’images,  déterminer  la  couleur  d’une  surface  au  pixel  d’une  image doit considérer toutes les sources de lumière de la scène pour évaluer leur contribution lumineuse sur la surface en question. Cette évaluation de la visibilité et en l’occurrence de la radiance incidente des sources de lumière est très coûteuse. Elle n’est généralement pas traitée pour chaque source de lumière en rendu temps-réel. Une ville en pleine nuit est un exemple de telle scène comportant une grande quantité de sources de lumière pour lesquelles les rendus temps-réel modernes ne peuvent pas évaluer la visibilité de toutes les sources de lumière individuelles.  Nous présentons une technique exploitant la cohérence spatiale des villes et la co-hérence temporelle des rendus temps-réel pour accélérer le calcul de la visibilité des sources de lumière. Notre technique de visibilité profite des bloqueurs naturels et pré-dominants de la ville pour rapidement réduire la liste de sources de lumière à évaluer etainsi, accélérer le calcul de la visibilité en assumant des bloqueurs sous forme de boîtes alignées majoritairement selon certains axes dominants. Pour garantir la propagation des occultations, nous fusionnons les bloqueurs adjacents dans un seul et même bloqueur conservateur en termes d’occultations.  Notre technique relie la visibilité de la caméra avec la visibilité des surfaces pour réduire le nombre d’évaluations à effectuer à chaque rendu, et ne calcule la visibilité que pour les surfaces visibles du point de vue de la caméra. Finalement, nous intégrons la technique de visibilité avec une technique de rendu réaliste, Lightcuts, qui a été mise à jour sur GPU dans un scénario de rendu temps-réel.   Même si notre technique ne permettra pas d’atteindre le temps-réel en général dans une scène complexe, elle réduit suffisamment les contraintes pour espérer y arriver un jour.

Keyphrases: Lightcuts, GPU, Visibilité, Rendu temps-réel, Villes
Détermination de la concentration de manganèse dans l’eau potable associée à des déficits cognitifs chez l’enfant

Le manganèse (Mn) est un nutriment essentiel, mais peut induire des effets neurotoxiques lorsque l’exposition est trop élevée. En particulier, certaines études récentes ont rapporté que l’exposition au Mn dans l’eau potable était associée à une diminution des habiletés cognitives chez les enfants. Par contre, la concentration à partir de laquelle ces effets apparaissent n’a pas été estimée dans les études existantes. Par conséquent, l’objectif de mon mémoire de maîtrise était d’estimer la concentration de Mn dans l'eau potable associée à différents niveaux prédéfinis de déficit cognitif chez des enfants d’âge scolaire. Pour ce faire, les données de deux études transversales du Canada ont été poolées, résultant en un échantillon de 630 enfants âgés de 5 à 14 ans. Le quotient intellectuel (QI) de chaque enfant a été évalué et la concentration de Mn a été mesurée dans l’eau de la résidence. Au moyen du logiciel Bayesian Benchmark Dose Analysis, nous avons conduit une analyse concentration repère (benchmark concentration) pour estimer les concentrations de Mn dans l’eau associées à une diminution de 1%, 2% et de 5% de QI, ainsi que les limites inférieures des intervalles crédibles à 95% (LIIC95%). Nos résultats indiquent que la concentration de Mn dans l’eau associée à une diminution de 1% de QI était de 121 µg/L (LIIC95%, 70 µg/L), tandis que celles à une diminution de 2% et de 5% de QI étaient de 241 µg/L (LIIC95%, 141 µg/L) et 611 µg/L (LIIC95%, 367 µg/L), respectivement. Puisque les résultats suggèrent que l’association entre le Mn dans l’eau et le QI diffère entre les sexes, des analyses stratifiées ont aussi été menées. La concentration de Mn dans l’eau associée à une diminution de 1% de QI était de 169 µg/L (LIIC95%, 68 µg/L) chez les garçons et de 73 µg/L (LIIC95%, 8 µg/L) chez les filles. Il n’existe pas de recommandation actuellement au Canada sur la concentration de Mn qui devrait être permise dans l’eau potable, et ces résultats pourraient guider les décideurs dans l’élaboration d’une telle recommandation pour protéger les enfants des effets neurotoxiques de ce métal.

Keyphrases: Épidémiologie environnementale, Eau potable, Manganèse, Enfants, Neurotoxicité, QI, Concentration repère, IQ, Benchmark concentration
Les maladies fébriles non paludiques à Ouagadougou : prévalence, facteurs associés et évolution du 1er janvier 2015 au 31 décembre 2016

En Afrique subsaharienne, une préoccupation majeure de santé publique est la prise en charge de la fièvre. L’application en 2010 des recommandations de l’OMS d’une prise en charge du paludisme, basée sur une preuve biologique, a permis de déceler une proportion importante de maladies fébriles non paludiques (MFNP) mal diagnostiquées. Les objectifs de cette recherche visent à décrire la prévalence, identifier les facteurs associés et décrire l’évolution des MFNP de 2015 à 2016.  Le devis de l’étude est une étude observationnelle à visée descriptive et analytique dans trois CSPS de la capitale (Pazani, Zongo et Juvénat fille). Nous avons effectué des analyses descriptives puis analysé la relation entre le nombre mensuel de cas de MFNP et les facteurs associés a été étudiée en utilisant la régression binomiale négative. L’analyse de la tendance a été faite à l’aide des séries temporelles interrompues. La prévalence générale des MFNP dans l’échantillon était de 35,16%. Les moins de cinq ans représentaient 56% et les moins de sept ans 69,71% de l’échantillon.   Les analyses descriptives montrent que toutes les variables sauf le sexe semblent être associées à la survenue des MFNP. Les résultats révèlent une prévalence des MFNP variant en fonction de la méthode diagnostique utilisée, elle est plus élevée lorsque la goutte épaisse a été utilisée (53,05%) contre 47% quand la clinique a été utilisée et 22,22% en cas d’utilisation des tests de diagnostic rapide du paludisme. Un lien a été trouvé entre le nombre de cas de MFNP et le jeune âge, le sexe, la saison sèche, les températures chaudes et la politique de gratuité des soins. Plus de cas de MFNP ont été observés parmi les moins d’un an d’âge et les moins de sept ans; les ratios de taux incidence (IRR) respectifs sont (IRR=1,36 et IC à 95%= [1,01; 1,71]); (IRR=1,36 et IC à 95%= [1,07; 1,56]). La saison sèche et les périodes de hausse thermique sont également associées à une augmentation du nombre de cas de MFNP. L’analyse de la tendance en tenant compte de la politique de gratuité des soins à partir d’avril 2016 montre une hausse de la tendance des MFNP. Nos résultats révèlent la nécessité de renforcer les capacités du système de soins afin d’améliorer la prise en charge des maladies fébriles non paludiques pour le bien-être des populations.

Keyphrases: Maladie fébrile non paludique, Prévalence, Tendance, Pays tropicaux
Engagement, complexité et transmédia : une approche de recherche-création de la réflexion spectatorielle

Ce mémoire de recherche-création part de principes théoriques pour concevoir et établir une pratique de création. L’idée principale est de comprendre la réflexion dans un cadre audiovisuel et de suggérer une méthode de création. Le transmédia est proposé comme une pratique adéquate pour répondre à cette exigence. La première partie est consacrée à la partie théorique. Le concept de réflexion y est défini et délimité grâce à la philosophie. Il est par la suite question de créer des liens entre des notions de réflexion et celles de transmédia. L’engagement et la complexité narrative seront alors les principes mis de l’avant afin de discuter de la relation entre la réflexion et le transmédia. Le jeu en réalité alternée sera alors proposé comme étant un type de transmédia complexe encourageant la réflexion. Finalement, afin de bien cerner le concept de réflexion dans le cadre audiovisuel, il sera proposé d’établir un modèle heuristique basé sur la sémio-pragmatique de Roger Odin.  En seconde partie, il sera question de présenter la création, une bible transmédiatique d’un univers de science-fiction appelé INTE.R.E.ST. Cette création vise à favoriser la réflexion du spectateur en incorporant les principes théoriques d’engagement et de complexité narrative tels que définis dans la première partie. Le transmédia, notamment le jeu en réalité alternée, est utilisé afin de les exploiter.

Keyphrases: Réflexion spectatorielle, Transmédia, Engagement, Complexité narrative, Sémio-pragmatique, Science-fiction, Jeu en réalité alternée, Bible transmédiatique, Sémio-pragmatique
La force du cœur : les changements de l'archétype du héros durant la Renaissance de Disney (1989-1999)

Les héros et héroïnes de la Renaissance de Disney (1989-1999) se distinguent de leurs homologues de la période qui précède 1989. Un renforcement de l’héroïcité est clairement présent, mais n’est abordé nulle part dans la littérature théorique. Cette analyse narratologique et comparative présente ces changements en expliquant tout d’abord l’évolution de la définition du héros dans la littérature théorique, puis présente tous les héros et héroïnes de Disney, qu’ils soient fortement représentés ou délaissés par les écrits sur Disney. Les héros et héroïnes sont comparés à des protagonistes similaires de l’autre période pour soulever le niveau d’activité et la place de l’amour et de la sexualité dans la représentation des personnages, mais aussi plusieurs changements qui ne sont pas abordés dans la littérature de Disney : le passage d’opposant à héros, et le changement au niveau du schéma narratif des héros et héroïnes. Un nouvel archétype se dégage ainsi par l’amalgame des structures du périple du héros de Joseph Campbell et de la promesse de la vierge de Kim Hudson.

Keyphrases: Disney, Héroïsme, Narratologie
Entre souvenir et identité, subconscience et rêve : voyage au sein d’un processus d’auto-affirmation en tant qu’artiste par la déconstruction du concept de l’artiste-génie

Cet essai propose une incursion dans le cheminement psychologique entrepris par une jeune créatrice pour mieux comprendre et définir son statut en tant qu’artiste par l’entremise d’une réflexion théorique sur l’art et les processus de création. En abordant tout d’abord la question d’un angle sociologique, et aboutissant éventuellement dans la sphère de la littérature psychanalytique pour aborder ce qui relève plutôt de l’ordre de l’inspiration et de l’apport du subconscient, ce mémoire de recherche-création suit ainsi le périple de cette longue méditation amorcée dans le but d’aboutir à une auto-affirmation à titre d’artiste par la déconstruction du concept de l’artiste-génie.

Keyphrases: Art, Artiste, Processus de création, Identité, Inspiration, Onirique, Subconscient, Artist
Étude de l’impact des collectionneurs sur la préservation et la conservation du jeu vidéo

Ce mémoire propose une incursion dans le monde du jeu vidéo et de la lutte contre sa détérioration inévitable. Elle vise à en déterminer l’ampleur pour ensuite examiner ainsi que proposer de possibles avenues afin d’en assurer la pérennité. L’objectif final repose sur la proposition que les communautés de collectionneurs influencent la préservation du médium vidéoludique, et tente de déterminer si cette influence est positive ou négative. Cette étude aborde d’abord le monde de la collection classique au sens large dans le but de mieux comprendre ce qui définit le collectionneur et ce qui motive ses comportements. Ensuite, nous explorons les problématiques de la préservation du jeu vidéo en observant à la fois les difficultés à venir en plus d’envisager de possibles solutions afin de pallier la détérioration de l’héritage vidéoludique. Finalement, le mémoire vient lier ces deux sujets en distinguant le collectionneur de jeux vidéo du collectionneur classique et en contestant son approche vis-à-vis de la préservation du médium. Par le biais de questionnaires distribués à même cette communauté, nous pouvons tenter de répondre à la question qui guide cette recherche à savoir quels impacts ces collectionneurs ont sur la préservation du jeu vidéo.

Keyphrases: préservation, jeux vidéo, collection, collectionneur, ludovidéophile, émulation, émulateur, jouabilité, sérialisation
Stefano della Bella et Le Vase de Médicis : dessin et éducation artistique au XVIIe siècle

L’étude aborde la pratique du graveur-dessinateur florentin Stefano della Bella (1610-1664), plus spécifiquement son activité liée à l'enseignement du dessin et la mise en valeur de cette activité dans son œuvre. Nous nous pencherons principalement sur la gravure intitulée Le Vase de Médicis, datée de 1656, dans laquelle la figure de l’artiste en train de dessiner un vase antique devient le sujet principal. Par le dessin, l'artiste représente le monde qui l'entoure et intègre la figure même de l'observateur au sein de ses travaux. Ainsi, l’artiste démontre une nouvelle tendance. Par cette intégration de la figure du dessinateur, il y a, en quelque sorte, une manifestation d’une conscience de l'image même de l'artiste. Nous étudierons aussi les relations que Stefano della Bella entretenaient avec ses commanditaires. En effet, cette relation permet de mieux comprendre les fondements de sa pratique. D’autre part, le mémoire se concentre aussi sur la question de l’enseignement artistique. Della Bella s’intègre dans l’éducation des princes. Il s’implique dans un programme éducatif auprès de deux grands princes, Louis XIV en France, par le biais de jeux de cartes pédagogiques et Cosimo III de Médicis en Italie, par l’apprentissage du dessin. L’intérêt de se concentrer sur cet aspect présent dans la carrière de Della Bella est d’étudier la façon dont l’artiste met à profit sa pratique artistique auprès de personnages influents. En revanche, cette responsabilité implique de répondre à une demande qui impose des limites et qui démontre selon quelles valeurs et principes cet enseignement se doit de contribuer. Ce mémoire permettra de mieux saisir le nouveau statut de l'artiste qui se développe au XVIIe siècle et donne un exemple concret d’une carrière artistique prolifique s’illustrant à travers des relations stratégiques.

Keyphrases: dessin, Stefano della Bella, Vase de Médicis, XVIIe siècle, enseignement artistique
Pour une astronomie du cinéma : le perfectionnisme moral de Tom Cruise, trajectoire d'une star

Notre recherche s’articule autour de cette question : comment Tom Cruise, par la manière singulière qu’il a de se présenter à nous, réfléchit-il le cinéma ? En s’inspirant de la démarche du philosophe Stanley Cavell, pour qui penser la star nous amène nécessairement à penser le cinéma, et inversement, ce mémoire explore la filmographie de Tom Cruise pour se demander ce qu’est une star hollywoodienne, et plus spécialement quel est son lien à l’ontologie de l’image cinématographique.  Ainsi, dans un premier temps, nous examinons la question de l’ontologie du cinéma pour Cavell, et comment la star se crée à même les puissances révélatrices du cinéma, ce qui nous permet, du coup, de distinguer notre approche de celle, sémiologique, favorisée par les star studies. Dans un deuxième temps, nous explorons le problème du scepticisme tel qu’il se présente à Tom Cruise. Pour Cavell, la star est un modèle auquel confronter notre expérience ordinaire : c’est en affrontant son scepticisme que Tom Cruise peut nous servir de guide, entre autres parce que le drame de Tom Cruise s’appuie sur et révèle notre expérience du cinéma, que Cavell décrit comme une « image mouvante du scepticisme ». Et comme il s’agit d’un drame récurrent dans la filmographie de Tom Cruise, nous y voyons un exemple de perfectionnisme moral.  Enfin, Minority Report (Steven Spielberg, 2002) introduit un questionnement nouveau dans la carrière de Tom Cruise, lié au dispositif projetant son image. Or, comme Cavell a publié son ouvrage The World Viewed en 1971, à un moment où l’expérience du cinéma était encore profondément liée à un contexte de visionnement précis (la salle obscure, l’écran géant, la foule, la pellicule, etc.), Tom Cruise semble se demander cette fois : la star étant liée essentiellement à l’image photographique, qu’advient-il de la star dans le contexte d’un cinéma numérique ? Ce qui implique une seconde question : la star peut-elle encore nous servir de modèle à l’ère de l’expérience informatisée et pour penser l’image numérique ?

Keyphrases: Tom Cruise, Stanley Cavell, star, cinéma, éthique, acteur, scepticisme, numérique, philosophie
Une lecture phénoménologique des nus féminins de Francis Bacon et Lucian Freud : vers une éthique identitaire

Lucian Freud et Francis Bacon sont des peintres qui ont, chacun à leur manière, repoussé les limites de la tradition du nu féminin. Leur facture se fait le relais d’une corporéité nouvelle où la chair joue un rôle essentiel. Pour cette raison, ce mémoire propose d’appréhender les corps nus féminins peints par les deux artistes sous un nouvel angle plus humain et plus éthique. Dans ce sens il sera démontré que la phénoménologie de Maurice Merleau-Ponty se révèle être une approche pertinente. Le vocabulaire ontologique déployé par le philosophe dans ses derniers écrits tentera de rendre compte de l’existence des chairs picturales de Freud et Bacon. Néanmoins, l’analyse des nus féminins de ces deux artistes invite à actualiser la théorie merleau-pontienne. Ainsi, ces relectures féministes et queers apportent au corps vécu la dimension sexuée dont il manquait. L’identité sexuelle est de plus en plus remise en cause aujourd’hui dans les sociétés occidentales. Si le corps nu, d’autant plus lorsqu’il est féminin et peint, a longtemps porté les stigmates d’un patriarcat et hétérocentrisme latent, il apparaît, dans les œuvres de Freud et Bacon, vouloir s’en libérer. C’est alors que ce mémoire esquisse, à travers l’analyse des nus féminins de ces deux artistes, une éthique identitaire qui considère l’être humain pour ce qu’il a de plus originel et donc au-delà des préconçus sociétaux et culturels alimentées par nos sociétés occidentales. Ce mémoire se termine avec une analyse de l’œuvre de Jenny Saville. Celle-ci synthétise les idées développées aux sujets de la corporéité chez Bacon et Freud et en incarne plus pleinement la dimension queer ainsi que le potentiel charnel.

Keyphrases: Merleau-Ponty, chair, pensée féministe, pensée queer, Jenny Saville
Théorisation et contextualisation des microchromies dans le cheminement artistique et spirituel de Fernand Leduc

Notre travail propose une lecture à la fois théorique et contextuelle des œuvres de Fernand Leduc produites à partir des années 1970 : les microchromies. Cherchant d’abord à comprendre le fonctionnement intrinsèque de ces œuvres, nous analysons de manière formelle quatre microchromies en portant une attention particulière sur les problématiques que chacune tente d’élucider.  Le regard que nous portons sur les microchromies s’appuie sur les relations qu’entretient l’œuvre d’art avec la littérature de l’artiste, permettant ainsi de cerner l’évolution de sa pensée et de son art. Par cette double lecture, nous sommes en mesure d’inscrire les microchromies dans un cheminement long de plus de soixante-dix ans d’expérimentations artistiques et d’explorations spirituelles. À cet effet, nous analysons les courants artistiques et les philosophies qui ont, de près ou de loin, participé à la métamorphose de la démarche picturale de l’artiste. Les microchromies étant les œuvres les plus tardives de la carrière de Leduc, nous en proposons une analyse comparative avec les œuvres du début de sa carrière dans le but d’élucider ce cheminement continuel. Ainsi, il nous est possible de déterminer en quoi les microchromies peuvent être, ou non, inscrites dans la « rythmique du dépassement » en tant qu’aboutissement de sa carrière.

Keyphrases: Fernand Leduc, microchromie, automatisme, plasticisme, Jean Bazaine, personnalisme, art québécois