Étude de l'impact de deux traitements, dont un sans antibiotiques, sur la santé digestive et les populations de Clostridium perfringens dans des élevages de poulets de chair

Le problème grandissant de l’antibiorésistance remet en question plusieurs pratiques reliées à l’utilisation des antibiotiques, dont l’usage à grande échelle pour des fins de promotion de la croissance chez les animaux de consommation. Depuis 2006, le retrait des antibiotiques dans les élevages de poulets de chair en Europe a été associé à la résurgence d’entérite nécrotique, une maladie intestinale causée par la bactérie Clostridium perfringens. Alors que la pathogénie de la maladie semblait bien comprise, le retrait des antibiotiques a montré que peu de solutions de remplacement sont disponibles afin de prévenir cette maladie. Très peu d’études se sont intéressées à mieux caractériser la dynamique des populations de  C. perfringens dans les élevages avicoles et l’effet que pouvait avoir le retrait des antibiotiques sur l’évolution de ces populations.   La présente étude a évalué l’impact du remplacement des antibiotiques promoteurs de croissance et des anticoccidiens pendant une période de 14 mois, dans huit élevages commerciaux de poulets de chair au Québec. Un protocole d’élevage alternatif, combinant des stratégies telles que des produits à base d’huiles essentielles, des acides organiques et inorganique, une vaccination contre la coccidiose ainsi qu’une amélioration des conditions de démarrage des poussins, a été utilisé en remplacement des antimicrobiens. Les performances zootechniques, la santé digestive ainsi que l’occurrence d’entérite nécrotique pour les lots de poulets soumis au protocole d’élevage alternatif ont été comparées avec celles de lots de poulets de chair recevant une ration conventionnelle. Des analyses moléculaires basées sur la PCR et le PFGE ont été utilisées afin de documenter l’impact de la mise en place du protocole d’élevage alternatif sur les populations de C. perfringens.  Les résultats obtenus montrent qu’aucune différence entre les groupes soumis aux deux types de protocoles n'est observée en ce qui a trait à la viabilité en élevage, à l'âge d'abattage et aux taux de condamnations à l'abattoir. Toutefois, les lots soumis au traitement alternatif ont eu des performances moindres pour le poids moyen à l'abattage, le gain moyen quotidien et la conversion alimentaire. Un peu plus de 27% des lots soumis au protocole alternatif ont connu un épisode d’entérite nécrotique clinique. Les analyses ont aussi montré que l’un ou l’autre des protocoles ne semble pas exercer d’influence particulière sur la dynamique temporelle des populations de C. perfringens. Pour les lots soumis au protocole d’élevage alternatif, une forte diversité génétique pour C. perfringens a été liée à un risque augmenté de vivre un épisode d’entérite nécrotique. À l’opposé, les lots alternatifs ayant vécu des épisodes récurrents de la maladie ont montré une diminution significative de la diversité génétique, ainsi qu’une augmentation marquée du nombre de souches de C. perfringens transportant plusieurs gènes de virulence.   La présente étude a permis de mieux documenter, d’un point de vue économique et scientifique, la production de poulets de chair élevés sans antibiotiques ni anticoccidiens au Québec. Cette étude est la seule du genre s’étant intéressée à la caractérisation et à la comparaison dans le temps des flores de C. perfringens retrouvées dans les deux types d’élevages. Elle a révélé que la production à grande échelle de poulets de chair élevés sans antibiotiques ni anticoccidiens est possible au Québec, mais que celle-ci présente des impacts sur les performances zootechniques des oiseaux, sur leur santé digestive et sur la dynamique des populations de C. perfringens.       Mots-clés : poulets de chair, antibiotiques, huiles essentielles, acides organiques, vaccination coccidiose, performances zootechniques, santé digestive, entérite nécrotique, Clostridium perfringens, dynamique populationnelle In view of the increasing problem of antibiotic resistance, the large-scale use of growth promoting antibiotics in food-producing animals is being questioned. The voluntary ban of these compounds since 2006 in Europe, has been associated with a resurgence of necrotic enteritis, an intestinal disease of broiler chickens caused by Clostridium perfringens. Unfortunately, few alternatives are available and the pathogenesis of necrotic enteritis is yet to be fully understood. Surprisingly, there is a paucity of scientific papers on C. perfringens population diversity in broiler chicken flocks as well as on the effects of antimicrobial withdrawal on this bacterial population dynamics.   The current study evaluated the impact of replacing antibiotic growth promoters and anticoccidials, over a 14-month period, on eight commercial broiler chicken farms in Québec. A drug-free rearing protocol, combining essential oil-based products, organic and inorganic acids, anticoccidial vaccination and chick brooding conditions improvement, was used in place of antimicrobials. Zootechnical performances, digestive health parameters and necrotic enteritis occurrence were compared between conventional and drug-free flocks involved in this study. Molecular approaches such as PCR and PFGE were used to monitor the impact of both rearing protocols on C. perfringens populations.  Results show that livability, age at time of slaughter and total condemnations were not affected by the drug-free program. However, the drug-free flocks showed a decrease in mean live weight and in the daily weight gain, while feed conversion ratio was increased for drug-free flocks. Nearly 27% of the drug-free flocks experienced a clinical necrotic enteritis outbreak. Molecular analysis showed that C. perfringens temporal dynamics seems to be little affected by both rearing protocols. For the drug-free flocks, an initially greater genotypic diversity was linked with an increased risk of experiencing necrotic enteritis. On the other hand, recurring outbreaks of the disease in affected flocks caused a significant decrease of this genotypic diversity, as well as an increase in the number of C. perfringens strains carrying multiple virulence genes.   The current study allowed us to better document the economical and scientific aspects of a drug-free broiler chicken production in Québec. A limited number of scientific papers relative to the comparison of the influence of different rearing protocols on C. perfringens populations have been published so far. Results showed that drug-free broiler chicken production in Québec is economically feasible, though impacting the zootechnical and health performances, as well as C. perfringens population temporal dynamics.       Key words : broiler chickens, antibiotics, essential oils, organic acids, anticoccidial vaccination, zootechnical performances, digestive health, necrotic enteritis, Clostridium perfringens, population dynamics

Keyphrases: Poulets de chair, Antibiotiques, Huiles essentielles, Acides organiques, Vaccination coccidiose, Performances zootechniques, Santé digestive, Entérite nécrotique, Clostridium perfringens, Dynamique populationnelle, Clostridium perfringens, Clostridium perfringens, Broiler chickens, Antibiotics, Essential oils, Organic acids, Anticoccidial vaccination, Zootechnical performances, Digestive health, Necrotic enteritis, Clostridium perfringens, Population dynamics