Gene Detection, Virus Isolation, and Sequence Analysis of Avian Leukosis Viruses in Taiwan Country Chickens

SUMMARY Avian leukosis virus (ALV) infection in Taiwan Country chickens (TCCs) was investigated by using gene detection, virus isolation, and sequence analysis. The blood samples of 61 TCC flocks at market ages from a slaughter house were screened for exogenous ALVs using polymerase chain reaction to investigate the ALV infection status. The buffy coats from three breeder and four commercial chicken flocks were cocultured with DF-1 cells to isolate the virus. The full proviral DNA genomes of two ALV isolates were sequenced, analyzed, and compared with reference ALV strains. The gene detection results showed that 60 and 43 of the 61 flocks were infected with subgroup A of ALV (ALV-A) and subgroup J of ALV (ALV-J), respectively. Virus isolation results showed that five ALV-As and two ALV-Js were isolated from those seven TCC flocks. The full sequences of the isolates showed that isolate TW-3577 possessed a myeloblastosis-associated virus 1 gp85 coding region and an ALV-J 3′-untranslated region (3′UTR) and was similar to ordinary ALV-A. However, TW-3593 was unique. The 3′UTR of this isolate displayed high identity to endogenous counterpart sequence and its gp85 was different from all subgroups. This unique ALV is common in Taiwan. RESUMEN Detección de genes, aislamiento viral, y análisis de las secuencias de los virus de la leucosis aviar en pollos de traspatio en Taiwán. Se investigaron las infecciones con el virus de la leucosis aviar (ALV), en pollos de traspatio en Taiwán (TCC) mediante la detección de genes, el aislamiento del virus, y el análisis de secuencias. En la planta de procesamiento, se seleccionaron muestras de sangre de 61 parvadas de traspatio de Taiwán que estaban en edad para mercado para detectar virus de leucosis aviar exógenos mediante la reacción en cadena de la polimerasa, con el fin de investigar el estado de infección por el virus de leucosis aviar. Las capas flogísticas de las muestras de tres y cuatro parvadas de reproductores y de pollos comerciales se co-cultivaron en células DF-1 para aislar el virus. Los genomas completos de ADN proviral de dos aislados fueron secuenciados, analizados, y comparados con cepas de referencia del virus de leucosis aviar. Los resultados de la detección de genes mostró que 60 y 43 de las parvadas avícolas estaban infectadas con los subgrupos A (ALV-A) y J (ALV-J) del virus de la leucosis aviar, respectivamente. Los resultados del aislamiento viral mostraron que cinco de los aislamientos del subgrupo A y dos del subgrupo J fueron aislados de siete parvadas de traspatio. Las secuencias completas de los aislamientos mostraron que el aislamiento TW-3577 poseía una región codificante del gene gp85 asociada al virus de la mieloblastosis 1 y una región no traducida en el extremo 3′ (3'UTR) del subgrupo J y que era similar a un virus ordinario del subgrupo A. Sin embargo, el aislamiento TW-3593 es único. La región no traducida en el extremo 3′ de este aislamiento mostró una alta identidad con la secuencia de su contraparte endógena y su gene gp85 fue diferente de todos los subgrupos. Esta singular virus de la leucosis aviar es común en Taiwán.