Potentiel évolutif et adaptation des populations de l'agent du mildiou de la laitue, Bremia lactucae, face aux pressions de sélection de la plante hôte, Lactuca sativa

Des nouvelles resistances aux agents pathogenes introgressees dans les plantes cultivees sont frequemment contournees dans differents pathosystemes, engendrant des epidemies et des pertes economiques. En consequence, la comprehension des strategies evolutives impliquees dans l’adaptation des populations pathogenes est necessaire pour ameliorer la gestion durable des resistances. Bremia lactucae, agent pathogene de la laitue est un organisme diploide, heterothallique avec des cycles de reproduction sexuee et asexuee. Cet oomycete est soumis aux fortes pressions de selection exercees par des genes de resistance de la plante hote. Sous cette pression de selection, les populations de B. lactucae ont montre une rapide adaptation aux resistances hotes qui se sont donc averees peu durables. L’etude de la structure genetique d’un agent pathogene peut permettre de comprendre les mecanismes evolutifs impliques dans le contournement des resistances varietales. Ainsi, une etude de la structure genetique (neutre et potentiellement soumise a selection) des populations de B. lactucae en France a ete conduite afin d’identifier les forces evolutives impliquees dans le contournement des resistances de l’hote et de determiner l’influence des pressions de selection des genes de resistance de la plante hote sur cette structure. J’ai valide 12 microsatellites, marqueurs moleculaires neutres, pour analyser la structure genetique de B. lactucae en France. Plus de 800 isolats ont ete preleves dans les plus importants bassins de production de la plante hote, Lactuca sativa. Ces isolats ont ete preleves sur differentes varietes regroupees selon leur combinaison de genes de resistance. Par ailleurs, une prospection dans le compartiment sauvage a permis d’echantillonner des isolats de B. lactucae sur la plante hote adventice L. serriola. Le polymorphisme de plusieurs effecteurs candidats a motif RxLR, a ete etudie dans differentes populations de Bremia. La faible diversite genetique et l’exces d’heterozygotie observes sont en faveur d’une reproduction clonale mais de rares evenements de reproduction sexuee sont egalement suggeres par les resultats. Par ailleurs, la faible differenciation genetique entre populations suggere des flux de genes importants a l’echelle des regions. Des flux de genes ont egalement ete mis en evidence entre le pathosysteme du compartiment sauvage et le pathosysteme du compartiment cultive evoquant un possible role de reservoir genetique des plantes hotes adventices. Une structuration des populations en plusieurs lignees clonales resultant de la pression de selection des genes de resistance des cultivars est egalement indiquee par l’analyse des resultats des marqueurs neutres et selectionnes. La caracterisation de la structure des populations de B. lactucae nous permet de mettre en evidence le fort potentiel evolutif (flux de genes importants, systeme de reproduction mixe, selection de mutants et de migrants par les genes de resistance) de B. lactucae expliquant la rapide adaptation aux resistances hotes. Ainsi, nous pouvons suggerer des pistes de gestion des genes de resistance comme favoriser l’utilisation de resistances quantitatives et l’utilisation de cultures d’association afin d’ameliorer la durabilite des resistances.