Variabilidad genética del loci RsaI de la prolactina bovina en Ganado Holstein de Antioquia, Colombia

Summary The Holstein breed, widely used in Antioquia´s dairy industry, has undergone genetic changes due to selection that have affected the frequencies of some polimorphisms within important genes. Objective : to identify polymorphism changes in the prolactin RsaI (PRL-Rsal) locus and to characterize the structure and allelic distribution within the Holstein population in Antioquia. Methods : a total of 1.462 Holstein cows from 11 subpopulations (municipalities) of Antioquia were used. The ADN was extracted from leucocytes using the salting-out method and genotyping was performed by PCR-RFLP. Genetic diversity was determined by heterozygosity. The Hardy-Weinberg equilibrium (HW) and the genetic differentiation among populations were performed using the Arlequin 2.0 software. Allelic and genotypic frequencies were assessed with the SAS 9.2 statistical software. Results : the genotypic frequencies found were 0.695 (AA), 0.276 (AB), and 0.029 (BB), while the frequencies of the A and B alleles were 0.833 and 0.167, respectively. There were no deviations from HW equilibrium in any population. Genetic diversity among populations, expressed in terms of heterozygosity, showed a medium value (Ho=0.276). The F ST value of the entire population was significant, indicating genetic differentiation. In addition, some matched FST showed high differentiation. The F IT and F IS parameters were not significant, suggesting that population endogamy or exogamy is not occurring. Conclusions : the bovine PRL-RsaI polymorphism is a suitable marker to evaluate characteristics of economic importance and apparently it has not been influenced by selection pressure. In fact, a significantly high variability (p Key words : genetic differentiation, Hardy-Weinberg equilibrium, PCR-RFLP, single nucleotide polymorphism. Resumen La raza Holstein en Antioquia ha sido utilizada ampliamente por la industria de lecheria especializada, lo cual ha generado cambios geneticos en las diferentes poblaciones debido a algunas fuerzas de seleccion que han afectado las frecuencias de algunos alelos en genes de importancia economica. Objetivo : determinar las frecuencias alelicas y genotipicas de un polimorfismo del exon 4 del gen de prolactina bovino (PRL) en el cual se genera un sitio polimorfico para la endonucleasa de restriccion RsaI y a partir de estas frecuencias estimar algunos parametros de estructura poblacional en ganado Holstein. Metodos : el estudio se llevo a cabo en 1.462 vacas Holstein de 11 subpoblaciones (municipios) del departamento de Antioquia. Se extrajo ADN de leucocitos de sangre periferica por el metodo de Salting out y se realizo la genotipificacion mediante la tecnica de PCR-RFLPs. La diversidad genetica se expreso mediante las heterocigosidades. Se determino adicionalmente el equilibrio de Hardy-Weinberg y la estructuracion genetica poblacional mediante el software Arlequin 2.0. Las frecuencias alelicas y genotipicas se evaluaron mediante el paquete estadistico SAS 9.2. Resultados : las frecuencias genotipicas encontradas fueron 0.695 (AA), 0.276 (AB) y 0.029 (BB) y las frecuencias alelicas 0.833 (A) y 0.167 (B). No se encontraron desviaciones del Equilibrio de Hardy-weinberg en ninguna poblacion. La heterocigosidad fue media entre poblaciones (Ho=0.276). El valor de F ST de toda la poblacion fue significativo, indicando estructuracion genetica. Los estadisticos F IT y F IS no fueron significativos, por tanto no es posible asumir endogamia o exogamia en las poblaciones teniendo como referencia este polimorfismo. Conclusiones : el polimorfismo en el exon 4 del gen de la prolactina bovina es un marcador interesante para evaluar caracteristicas de importancia economica, ya que este no parece haber sido sometido a seleccion directa, presenta frecuencias alelicas muy variables entre poblaciones, con diferenciacion significativa e incluso muy alta entre algunas subpoblaciones (p Palabras clave : diferenciacion genetica, equilibrio de Hardy-Weinberg, PCR-RFLP, polimorfismo de nucleotido simple. Resumo A raca Holandesa em Antioquia tem sido muito utilizada pela industria leiteira especializada, isto tem gerado mudancas geneticas nas diferentes populacoes devido a algumas forcas de selecao que tem afetado as frequencias de alguns alelos em genes de importância economica. Objetivo : determinar as frequencias alelicas e genotipicas de um polimorfismo no exon 4 do gene da prolactina bovina (PRL) no qual se gera um sitio polimorfico para a endonuclease de restricao RsaI e com essas frequencias estimar alguns parâmetros da estrutura populacional no gado Holandes. Metodos : o estudo foi realizado em 1.462 vacas da raca Holandesa de 11 subpopulacoes (municipios) de Antioquia. A extracao do ADN se fez pelo metodo de Salting Out e a genotipagem foi realizada pela tecnica PCR-RFLP. A diversidade genetica foi determinada mediante as heterozigosidades, e o equilibrio de Hardy-Weinberg (HW) e a diferenciacao genetica entre as populacoes foram realizadas usando o software Arlequin v. 2.0. As frequencias alelicas e genotipicas foram analisadas com o programa estatistico SAS v. 9.2. Resultados : as frequencias genotipicas encontradas foram 0.695 (AA), 0.276 (AB) e 0.029 (BB) e as frequencias alelicas 0.833 (A) e 0.167 (B). Nao se encontraram desvios no equilibrio de Hardy-Weinberg nas subpopulacoes. A diversidade genetica expressada como a heterozigosidade observada foi media entre toda a populacao (Ho=0.276). O valor de F ST de toda a populacao foi significativo indicando estruturacao genetica. Os estatisticos F IT e F IS nao foram significativos, por tal razao nao foi possivel assumir endogamia ou exogamia nas subpopulacoes. Conclusoes : o SNP no exon 4 do gene da prolactina bovina e um marcador interessante para avaliar caracteristicas de importância economica, ja que este nao parece ter tido um processo de selecao direta, alem, tem frequencias alelicas muito variaveis entre as diferentes subpopulacoes, com diferenciacao significativa e ainda muito elevada entre as subpopulacoes avaliadas (p Palavras chave : diferenciacao genetica, Hardy-Weinberg, PCR-RFLP, polimorfismo de nucleotideo simples.