Diversité et différenciation génétiques des populations de tortues vertes (Chelonia mydas) dans les sites de ponte et d‟alimentation du sud-ouest de l‟océan Indien : Application aux stratégies de conservation de l‟espèce

La tortue verte (Chelonia mydas) constitue l‘un des especes emblematiques de la vie marine, pourtant de nombreuses menaces pesent de nos jours encore sur sa survie (braconnage, captures accidentelles). Ainsi, malgre l‘essor de mesures de protection menees a travers pour sa sauvegarde, la tortue verte constitue une espece ‗en danger d‘extinction‘ et figure dans l‘Annexe I de la Convention de Washington (CITES). Afin d‘elaborer des plans de gestion et de conservation qui soient efficaces, il est important d‘avoir une parfaite connaissance de la biologie de la tortue verte, mais aussi de la structure de ses populations et de leurs caracteristiques. C‘est dans ce cadre que s‘inscrit la presente etude. L‘objectif de cette etude etait d‘acquerir des connaissances sur la structure des populations de tortues vertes dans le sud-ouest de l‘ocean Indien grâce a l‘utilisation de l‘outil genetique. Au total, 1551 echantillons de tissu ont ete collectes dans la zone d‘etude et dans notre site temoin la Polynesie francaise (37 echantillons). Toutes les categories d‘individus ont ete echantillonnees (excepte les mâles en phase de reproduction) et les 15 sites d‘echantillonnage comprennent a la fois des sites de ponte, d‘alimentation et de developpement pour les immatures. Deux types de marqueurs ont ete utilises : la region controle de l‘ADN mitochondrial et 6 loci microsatellites, afin d‘apprehender au mieux l‘apport des lignees maternelles et paternelles. Nous avons pu mettre en evidence la presence dans le sud-ouest de l‘ocean Indien de 29 haplotypes distincts, appartenant a trois clades fortement divergents dont l‘un constitue d‘haplotypes originaires de l‘ocean Atlantique. Parmi ces haplotypes, 7 ont ete detectes pour la premiere fois dans la zone d‘etude, et 15 autres n‘ont jamais ete precedemment decrits chez cette espece. Ils sont presents dans chacun des 3 clades d‘haplotypes. Ces nouveaux haplotypes semblent specifiques a la region, et en font une zone originale. On observe par ailleurs une grande richesse allelique dans les effectifs analyses. Ces resultats montrent que le sud-ouest de l‘ocean Indien est une zone riche et tres diversifiee. Cette region joue un role important dans la diversite genetique globale de l‘espece. Le sud-ouest de l‘ocean Indien constitue l‘une des deux seules zones connues a l‘heure actuelle de contact entre les deux metapopulations de tortues vertes (Atlantique-Mediterranee et Indo-Pacifique). Ce contact a entraine la formation d‘un cline genetique portant principalement sur les frequences relatives des haplotypes CM8 (Atlantique) et C3 (Indo-Pacifique). Les resultats obtenus lors de l‘analyse microsatellite de la differenciation entre les individus originaires des deux metapopulations montrent que le sud-ouest de l‘ocean Indien constitue une zone d‘echanges genetiques entre les deux metapopulations, participant au brasage genetique de l‘espece. L‘etude de facteurs, intrinseques et extrinseques, pouvant influencer la structuration des populations apportent de nombreuses informations qui pourraient s‘averer utiles lors de l‘elaboration de plans de gestion. La structure des femelles et des mâles en alimentation ne differe pas, contrairement a celle des immatures qui semble s‘organiser en ‗pools regionaux‘ qui seraient le fruit de l‘interaction d‘un comportement de philopatrie et d‘une influence des courants oceaniques. La forte differenciation mitochondriale des femelles en ponte et la tres faible differenciation microsatellite observee a l‘echelle de la region, indiquent l‘existence de flux de genes via les mâles. La composition genetique d‘un site ne varie pas de maniere significative au cours de l‘annee. Par contre, elle peut varier d‘une annee a l‘autre, signifiant l‘alternance dans certains sites de ponte de plusieurs populations distinctes. L‘evolution de la composition genetique d‘un groupe, au cours de 10 ou 20 ans, differe selon le site considere. La distance ne semble pas influencer de maniere significative la structuration des populations au niveau microsatellite. Les femelles en ponte sur la plage de Saziley (Mayotte) different genetiquement de celles pondant sur les deux autres plages de l‘ile. La structure observee des populations est en accord avec l‘organisation des courants oceanique dans la region.