Épidémiologie de la chalarose du frêne, une maladie causée par l’agent pathogène Hymenoscyphus fraxineus

L’introduction de champignons pathogenes envahissants est une cause tres importante d’emergence de maladies forestieres. Depuis ces 30 dernieres annees, la chalarose affecte severement les frenes en particulier Fraxinus excelsior. L’agent pathogene causant cette maladie est un ascomycete originaire d’Asie de l’Est, Hymenoscyphus fraxineus. Il fut observe pour la premiere fois dans les annees 1990 en Pologne, puis s’est rapidement dissemine en Europe pour atteindre la France en 2008. La maladie se dissemine principalement par dispersion aerienne des ascospores. Cette these vise a etudier l’epidemiologie de la chalarose du frene en determinant les facteurs environnementaux influencant le developpement d’H. fraxineus et en proposant un modele de dispersion de la maladie. Le premier objectif de cette these visait a optimiser une methode de piegeage de l’inoculum aerien pour ensuite l’utiliser dans le but d’etudier le patron de dispersion d’H. fraxineus. Nous avons ainsi mis en place une experimentation pour confirmer la fiabilite des resultats obtenus par biologie moleculaire a partir de faibles quantites de cibles, comme ceux observes sur le front de la maladie. Cette methode de piegeage de spores aeriennes a alors ete comparee a des cartes de presence de la chalarose realisees grâce a des signalements de symptomes. L’etude a ete realisee a differentes echelles, locale (commune) et regionale, avec des zones d’echantillonnage de l’ordre de la 100aine de km sur le front de la chalarose. Grâce a ce travail, nous avons pu determiner un rayon d’action autour de la source d’inoculum a l’interieur duquel des strategies de gestion seraient les plus efficaces pour limiter le developpement de la maladie. Le deuxieme objectif de cette these consistait a determiner quels facteurs environnementaux influencent le developpement de la maladie, ce qui s’avere etre un enjeu important pour la gestion forestiere et l’avenir du frene en tant qu’essence forestiere dans les prochaines decennies. Nous avons montre qu’une importante densite d’hote et une grande humidite du milieu influencent positivement le developpement de la maladie. Ce travail a egalement permis de confirmer sur le terrain la sensibilite de l’agent pathogene aux fortes temperatures estivales, suggerant que la zone etudiee du Sud-Est de la France pourrait presenter des ete trop chauds pour le developpement de la maladie. A plus large echelle, le changement climatique pourrait jouer en faveur des frenes. De plus, la presence d’un effet Allee dans la dynamique de population de l’agent pathogene a ete suggeree par nos resultats experimentaux. Le dernier objectif de cette these etait de modeliser la dispersion de la maladie en France. Nos travaux ont permis de mettre en evidence une vitesse de dispersion d’environ 60 km / an. Un modele de reaction-diffusion a ete developpe pour mettre en relation la dispersion, la dynamique de population d’H. fraxineus et les facteurs environnementaux influencant son developpement. Ce modele de dispersion qui utilise des donnees standards issues du systeme d’epidemio-surveillance forestier du Departement de la Sante des Forets apportera des connaissances utiles a la mise en place de strategies de gestion. Cette these ouvre des perspectives sur le devenir du frene dans un contexte de changement climatique et plus largement sur la gestion des invasions biologiques