Analysis of Polymorphisms at the Adiponectin Gene Locus in Association with Type 2 Diabetes, Body Mass Index and Cardiovascular Traits in Latvian Population

Analysis of Polymorphisms at the Adiponectin Gene Locus in Association with Type 2 Diabetes, Body Mass Index and Cardiovascular Traits in Latvian Population Despite the number of recently conducted studies seeking to determine the association between genetic variants of adiponectin gene and susceptibility to type 2 diabetes (T2D) and increased body mass index (BMI), the results obtained are often inconsistent. To determine the impact of common polymorphisms in promoter and coding regions of adiponectin gene on these conditions in Latvian population, we selected ten SNPs (rs2241767, rs1501299, rs3777261, rs16861210, rs2241766, rs822396, rs182052, rs17300539, rs16861194, rs266729) based on haploblock structure and previously reported association studies. The selected SNPs were screened in a study group of 835 participants from the Genome Data Base of Latvian Population and mainly consisted of patients with T2D and coronary heart disease. None of the individual polymorphisms were significantly associated with T2D status or BMI when analysed using logistic or linear regression and adjusted for gender, age and other significant covariates. Frequency of rs2241766 T allele homozygotes however was significantly increased in T2D patients compared to controls (uncorrected P = 0.007). When analysed with other traits, the rs182052 G allele was found to be less frequent in patients suffering from myocardial infarction (P = 0.02; OR = 0.76, CI95% [0.61-0.92]) compared to others. Haplotype analysis revealed significant association of one haplotype with atrial fibrillation (uncorrected P = 0.01). In summary, we conclude that SNPs in adiponectin gene are unlikely to represent the risk for T2D, but may be involved in pathogenesis of CHD in the Latvian population. Adiponektīna Gēna Lokusa Asociācijas Analīze Saistībā Ar Otrā Tipa Diabētu, Ķermeņa Masas Indeksu Un Kardiovaskulārām Pazīmēm Latvijas Populācijā Neraugoties uz daudzajiem adiponektīna gēna variantu asociācijas pētījumiem saistībā ar otrā tipa diabētu (T2D) un paaugstinātu ķermeņa masas indeksu (ĶMI), līdz šim iegūtie rezultāti bieži ir pretrunīgi. Lai noskaidrotu adiponektīna gēna promotera un kodējošā rajona bieži sastopamo polimorfismu ietekmi uz šīm pazīmēm Latvijas populācijā, balstoties uz haplobloku struktūru un iepriekš zināmiem asociācijas pētījumiem, tika izvēlēti desmit SNP (rs2241767, rs1501299, rs3777261, rs16861210, rs2241766, rs822396, rs182052, rs17300539, rs16861194, rs266729). Izvēlētie SNP tika genotipēti pētījuma grupā, kas sastāvēja no 835 Valsts iedzīvotāju genoma datu bāzes gēnu donoriem. Šajā grupā bija pārsvarā no T2D un koronārās sirds slimības (KSS) pacienti. Neviens no individuāliem polimorfismiem nebija būtiski asociēts ar T2D vai ĶMI, lietojot daudzfaktoru logistiskās vai lineārās regresijas analīzes un korigējot rezultātus pēc dzimuma, vecuma un citiem būtiskiem līdzfaktoriem. Tomēr tika atrasts, ka rs2241766 T alēles homozigotu frekvence T2D pacientu vidū bija būtiski lielāka nekā kontroles grupā (nekorigēta P = 0.007). Analizējot saistībā ar citām pazīmēm, rs182052 G alēle tika biežāk atrasta pacientiem ar miokarda infarktu (P = 0.02; OR = 0.76; CI95%[0.61-0.92]), salīdzinot ar pārējo pētījuma grupu. Haplotipu analīze atklāja viena haplotipa būtisku asociāciju ar mirdzaritmiju (nekorigēta P = 0.01). Kopumā var secināt, ka adiponektīna gēna polimorfismi nav uzskatāmi par būtiskiem T2D riska faktoriem, bet varētu būt iesaistīti koronārās sirds slimības patogenēzē Latvijas populācijā.