Recherche d’agents infectieux circulant dans une communauté d’hôtes, intérêt pour la conservation des PNHs et risque d’émergence de maladies zoonotiquesau Centre De Primatologie du CIRMF et dans les sanctuaires de PNHs (au Gabon)rimatologie du CIRMF (Gabon)

La survie des Primates Non Humains (PNHs) est menacee par les activites humaines et les maladies infectieuses. Pour contribuer a leur conservation au Gabon, plusieurs structures dont les sanctuaires et centres de primatologie ont ete mises en place. Cependant, si la gestion des risques sanitaires n’est pas prise en compte et les conditions d’accompagnement reglementees, ces structures qui visent la sauvegarde des PNHs pourraient constituer de veritables carrefours d’echanges de parasites entre especes de PNH, Homme et/ou microfaune. Ainsi, pour mieux comprendre la nature et l’ampleur du probleme, notre travail de these avait pour but d’evaluer les risques sanitaires et zoonotiques chez des groupes d’hotes de deux (2) sanctuaires et d’un (1) centre de primatologie au Sud-est du Gabon. En combinant les etudes epidemiologiques sur le terrain a la fois chez l’Homme et l’animal, le sequencage, les analyses phylogenetiques ainsi que la modelisation statistique, nos travaux se sont atteles a comprendre (i) la circulation d’agents infectieux entre especes et (ii) les strategies parasitaires dans ces nouveaux contextes de communautes crees par les activites humaines. Nous nous sommes interesses a trois (3) modeles parasitaires, a savoir ; un (1) procaryote (Staphylococcus aureus) et deux (2) eucaryotes dont un agent pathogene a transmission vectorielle (Plasmodium spp) et un groupe viral a transmission directe ou indirecte (paramyxovirus). Nos resultats revelent une grande diversite plasmodiale circulant chez les PNHs (9 especes) et montrent que la specificite d’hotes observee jusqu’a present en milieu naturel est rompue. Si aucun plasmodium simien n’a ete trouve chez l’Homme, le spectre d’hotes de P. falciparum s’agrandit avec sa mise en evidence pour la premiere fois chez le Mandrill (Mandrillus sphinx). Nos resultats revelent egalement une large diversite genetique de Stahylococcus aureus composee de souches generalistes et specialistes, la circulation de souches SARM (S. aureus resistant a la meticilline) principalement via les souches generalistes, entre groupes d’hotes traites et non traites aux antibiotiques et decrivent quinze (15) nouvelles souches. Pour les paramyxovirus, aucune infection n’a ete identifiee mais la question du patron de circulation epidemique ou endemique est posee. En conclusion, cette etude montre que dans ces structures (i) les conditions ecologiques de franchissement inter-especes des parasites sont reunies et (ii) que ces dernieres permettent le developpement d’infections encore jamais observees en milieu naturel. Ces conditions de promiscuite entre especes favorisent la selection d’especes parasitaires a large spectre d’hotes (i.e., generalistes) mais aussi l’occurrence de souches bacteriennes resistantes a la meticilline qui se propagent via la communautarisation des parasites, notamment dans la microfaune interagissant avec les PNHs traites aux antibiotiques ou a partir de l’Homme