Devenir des bacteries enteriques en milieu littoral : effet du stress sur leur survie

Bacterial (lora studied in a Brittany estuary (Elorn, rade de Brest, France), The purpose of this study is to evaluate the behaviour of the bacterial flora of a macrotidal estuary, originating from different sources: the Elom freshwater river, a sewage treatment plant (STP), and the sediment. Viable counts were done using several culture media in order to determine where bacteria originated. Principal component analysis showed that the estuary was subjec­ ted to two well-defined conditions. On the one hand, during periods of low turbulence (neap tide), resuspension of bottom sediments did not occur. Bacterial flora decreased from the upper reaches of the estuary to its lower part, coming maini y from two sources (river and STP). As a function of sali nit y variations, bacterial fIora showed a progressive increase of the endogeneous fIora percentage versus contaminating fIora (Enterobacteria). On the other hand, during periods of high turbulence (spring tide, high river flow), a third source of contamination as sediment resuspension was combined with the previous processes. This third source was far from negligible, and might moreover constitute an important component of the exogeneous contaminating fIora of Enterobacteria. Oceanol. Acta, 1987, 10,2, 187-196. INTRODUCTION loisirs et conchyliculture. De nombreux auteurs ont étudié le comportement des bactéries des estuaires, sous l'angle écologique ou sanitaire. De tout temps, les estuaires ont été le lieu de rencontre de diverses activités, parfois antagonistes sur le plan Ainsi, Ferguson et al. (1977), Palumbo et Ferguson de la qualité des eaux: urbanisation, industrialisation, (1978) ont montré que les estuaires se comportent vis­ 0399-1784/87/02187 lOIS 3.00/<CI Gauthier-Villars 187 à-vis du milieu marin comme une source de bactéries. Les concentrations trouvées sont fonction des condi­ tions hydrodynamiques (Churchland el al. 1982; Goul­ der, 1976; 1977 ; Goulder el al., 1980), de la salinité (Prieur el al., 1984). de la présence d'un bouchon vaseux (Frenel, 1978; Ottmann, Quere, 1979). Des espèces marines telles que les vibrions, dont certains pathogènes (V. parahaemolYlicus, V. cholerea), se trou­ vent de façon permanente dans certains estuaires dont ils constituent une partie de la flore autochtone (Colwell el al., 1981; Kaper et al., 1979; 1981; Moites el al., 1983). La qualité des eaux rejetées peut conditionner la conta­ mination fécale de l'estuaire (Read et al., 1982) mais, outre les apports anthropiques, le sédiment est pour de nombreux auteurs, une source importante de bactéries. Ainsi Gerba et McLeods (1976), Irving (1977), Labelle el al. (1980), Erkenbrecher (1981) observent 100 à 1000 fois plus de bactéries dans le sédiment que dans l'eau et ceci quel que soit le type de bactéries étudié. Les teneurs en matière organique du sédiment pourraient expliquer en partie ce phénomène; en effet d'excellentes corrélations sont trouvées entre les numérations bacté­ riennes et les teneurs en carbone organique (Dale, 1974; Rublée, 1982). Ce travail a pour but d'étudier l'influence de différentes sources de bactéries: l'eau douce issue de la rivière Élorn ou de la station d'épuration et le sédiment, sur la flore bactérienne d'un estuaire soumis à un fort marnage. La technique utili sée ici fait appel à l'obten­ tion de numérations sur plusieurs milieux de culture. permettant de caractériser les différents types de flores. MATÉRIEL ET MÉTHODES Cadre de l'étude (fig. 1) L'estuaire de l'Élorn est situé au nord-est de la rade de Brest. Son bassin versant (400 km 2 ) draine une reglOn où les activités agricoles et industrielles (agro­ alimentaires) sont importantes. Le débit de la rivière est en moyenne de 4 m 3 j s (évalué au point ED, fig. 1). L'Élorn dans son cours maritime, reçoit le rejet de la station d'épuration de Landerneau (point SE, 40000 éqjh; traitement secondaire par boues activées) . L'estuaire est soumis aux fluctuations de la marée; le marnage en aval varie de 3 m en morte eau à 7 m en vive eau, tandis qu'en amont , il n'est plus que de 1 à 4m. A marée haute, la largeur du lit de l'estuaire varie d'une centaine à quelques centaines de mètres. La marée basse découvre de larges vasières, ne laissant plus qu'un chenal large de quelques dizaines de métres, dont la profondeur est parfois inférieure à 1 m dans la partie amont (points 4 à 7). Les courants dus à la marée et au débit de la rivière peuvent être élevés (1 à 2 mis en vive eau à mi-jusant), tandis qu'en morte eau, ils n'excèdent pas 40 cmls (L'Yavanc et al., 1985). SE r) STATION d'EPURATION