Genetic diversity of Bardhoka breed in Albania and Kosova analyzed by microsatellite markers.

Sheep are considered as an important livestock species in Albania and Kosova. Bardhoka is an autochthonous breed and is the most milk productive sheep among the long tail breeds that lives in both countries. Our study aimed at comparative analysis of microsatellite polymorphism in 6 loci in Bardhoka sheep breed in Albania and Kosova. It is the first time that these local populations of Bardhoka breed from two countries are compared based on DNA markers. It is analyzed genetic diversity of these populations. Allele diversity, observed heterozigosities, expected heterozigosities, F-statistics, GST estimates is calculated, using different software package. A total of 72 alleles were found. The average number of alleles per locus was 8.15. Within breeds, the mean number of alleles ranged from 5.8 in population from Kosova to 7.66 in population from Albania. The Albanian population has higher values of expected and observed heterozigosity, higher allele number and higher FIS value. Mean expected heterozygosity (He) ranged from 0.68 in Bardhoka from Kosova (Kobar) to 0.76 in Bardhoka from Albania (Albar). Both populations showed a significant heterozigote deficit. Several factors that could cause this deficit are discussed. Gene flow (0.81) is rather low. The mean FST (0.238) demonstrated that 76.2% of total genetic variation is due to genetic differentiation within each population. Genetic differentiation between populations was much higher than reported by other authors. Genetic differentiation might be caused by long term isolation of these populations and application of different breeding strategies in each country. The research will go further in the future, increasing the number of the markers. Përmbledhje: Delet konsiderohen si një specie e rëndësishme e kafshëve bujqësore në Shqipëri dhe Kosovë. Bardhoka është një racë autoktone dhe është një nga racat kryesore bishtgjata, prodhuese të qumshtit që mbarështohet në dy vendet. Studimi ynë ka për qëllim analizën krahasuese të polimorfizmit të 6 lokuseve mikrosatelitë në delen Bardhoka në Shqipëri dhe Kosovë. Është hera e parë që këto popullata lokale të racës Bardhoka të dy vendeve krahasohen mbi bazën e markerëve të ADN-së. Është analizuar diversiteti gjenetik i këtyre popullatave. Diversiteti alelik, heterozigotia e vëzhguar, e pritur, statistika F dhe GST janë llogaritur duke përdorur programe të ndryshme kompjuterike. Në total u hasën 72 alele. Numri mesatar i aleleve për lokus është 8.15. Brenda racës, numri mesatar i aleleve varionte nga 5.8 për popullatën nga Kosova deri në 7.66 për popullatën nga Shqipëria. Popullata shqiptare ka vlera më të larta të heterozigotisë së vëzhguar dhe të pritur. Heterozigotia mesatare e pritur (He) varion nga 0.68 në Bardhokën nga Kosova deri në 0.76 në Bardhokën nga Shqipëria. Të dy popullatat shfaqën një deficit sinjifikant të heterozigotëve. Janë analizuar faktorë të ndryshëm që mund të kenë shkaktuar këtë deficit. Fluksi i gjeneve (0.81) është relativisht i ulët. FST mesatare (0.238) tregon se 76.2% e variacionit gjenetik total është për shkak të ndryshimeve gjenetike brenda çdo popullate. Ndryshimet gjenetike midis popullatave janë më të larta se ato të treguara nga autorë të tjerë. Diferencimi gjenetik mund të jetë shkaktuar nga izolimi afatgjatë i këtyre popullatave dhe nga aplikimi i strategjive të ndryshme në secilin vend. Ky studim do të vijojë më tej në të ardhmen, duke rritur numrin e markerëve.