Spatial and spatiotemporal clustering of the COVID-19 pandemic in Ecuador

Introduccion En Ecuador el primer caso de COVID-19, la enfermedad causada por el virus SARS-CoV-2, fue reportado oficialmente el 29 de febrero del 2020, y para el 2 de abril, las cifras oficiales de casos confirmados y de muertes ascendian a 3 163 y 120, respectivamente, con una tasa de mortalidad del 3 8%Objetivo Identificar aglomerados espaciales y espaciotemporales de los casos de COVID-19 confirmados oficialmente en Ecuador Materiales y metodos Estudio de series de casos Se analizaron todos los casos de COVID-19 confirmados oficialmente en Ecuador entre el 13 de marzo y el 2 de abril de 2020 El riesgo relativo (RR) de contagio se determino en el programa SaTScan de acuerdo al modelo de probabilidad discreta de Poisson, las aglomeraciones espaciales y espaciotemporales se detectaron con la estadistica de rastreo espacial y la significancia estadistica de cada aglomerado se determino mediante 999 iteraciones usando la simulacion Monte Carlo, obteniendose el modelo aleatorio mas probable Resultados Al 2 de abril, mediante la aglomeracion espaciotemporal, fue posible identificar dos aglomerados en Ecuador, uno principal centrado en la provincia de Guayas (superficie: 15 430 km2, poblacion: 3,6 millones de habitantes, RR: 7 08;p0 000001 e incidencia anual calculada: 1 700 casos/100 000 habitantes) y uno secundario centrado en la provincia de Pichincha (superficie: 88 904 km2, poblacion: 7 1 millones de habitantes, RR: 0 38, p0 000001 e incidencia anual calculada: 737 casos/100 000 habitantes) Conclusiones La implementacion de las estrategias de mitigacion del COVID-19 se debe enfocar en areas de alto riesgo de transmision;por tanto, los datos sobre aglomerados espaciales y espaciotemporales obtenidos con el programa SatScan pueden ser de gran utilidad en la deteccion temprana y vigilancia sanitaria de focos de COVID-19 Alternate abstract:Introduction: In Ecuador, the first COVID-19 case, the disease caused by the SARS-CoV-2 virus, was officially reported on February 29, 2020 As of April 2, the officially confirmed numbers of COVID-19 cases and deaths caused by it were 3 163 and 120, that is, a mortality rate of 3 8% Objective: To identify spatial and spatio-temporal clusters of COVID-19 cases officially confirmed in Ecuador Materials and Methods: Case series study An analysis of all COVID-19 cases officially confirmed in Ecuador from March 13, 2020 to April 2, 2020 was performed Relative Risk (RR) of COVID-19 contagium was determined using the discrete Poisson probability model in the SaTScan software Clusters were generated using purely spatial, and spatial-time scan statistics Significance of each cluster was obtained through 999 iterations using the Monte Carlo simulation, obtaining the most probable random model Results: As of April 2, spatiotemporal clustering allowed identifying two clusters in Ecuador, a main cluster (centered in Guayas province: 15 430 km2;population: 3 6 million inhabitants;RR: 7 08;p0 000001;calculated annual incidence 1700 cases / 100 000 people) and one secondary cluster (centered in the Pichincha province: 88 904 km2;population: 7 1 million;RR: 0 38;p0 000001;calculated annual incidence 737 cases / 100 000 people) Conclusions: The implementation of COVID-19 mitigation strategies should be focused on areas of high transmission risk;therefore, spatial and spatial-temporal clustering with SaTScan software can be extremely useful for the early detection and surveillance of COVID-19 outbreaks