Mate selection strategies to exploit across- and within-breed dominance variation.

Summary In multi-breed livestock populations, dominance variance is found both between and within breeds for many economically important traits. Mate selection strategies were developed to exploit both types of dominance variation simultaneously, with the aim of maximizing genetic merit of progeny. The extended super-breed model, in which breeds are viewed as groups of related and inbred animals within a ‘super-breed’, was used to predict individual additive and dominance effects for use in mate selection. Performance of mate selection was assessed under a range of relative values of additive and dominance variances for one generation of breeding. Mate selection on total progeny merit, including additive effects, individual dominance effects, and value of heterosis, was the optimal breeding strategy at all values of (co)variance components, with improvements in total progeny performance of up to 12.5 % over truncation selection followed by random mating when dominance variance was large relative to total genetic variance. Improvement in progeny merit from mate selection, relative to truncation selection, followed by random mating or truncation selection, followed by mate allocation, was particularly great (up to 53 %) when there was considerable heterosis. Improvements were small if dominance variance was small relative to total genetic variance, and heterosis was low. If the target population is large, full mate selection on total progeny merit is computationally demanding, and unlikely to be practical. Alternative, less computationally demanding strategies made nearly optimal selection and mating decisions at some parameter estimates. Integrating multi-breed genetic evaluation, using a superbreed model, with mate selection provides a powerful framework for the design of breeding programmes which exploit available sources of genetic merit. Zusammenfassung In Tierpopulationenen mit multipler Rassenstruktur besteht fur okonomisch bedeutsame Merkmale Dominanzvarianz, sowohl zwischen als auch innerhalb Rassen.Strategien zur Auswahl von Paarungspartnern wurden entwickelt, um beide Arten der Dominanzvarianz simultan auszunutzen mit dem Ziel, das genetische Mittel der Nachzucht zu maximieren. Das erweiterte ‘Super-Breed-Modell’, in dem Rassen als verwandte und ingezuchtete Gruppen innerhalb einer ubergreifenden Rasse angesehen werden, wurde verwendet um individuelle additiv genetische und dominanzbedingte Effekte fur die Wahl der Paarung zu schatzen. Die Wirksamkeit einer Paarungsselektion wurde unter einer Reihe von verschiedenen additiven und Dominanzvarianz Verhaltnissen fur jeweils eine Generation der Selektion ermittelt. Die Auswahl von Paarungen in Hinblick auf den Gesamtdurchschnitt mit additiven Effekten, individuellen Dominanzeffeken und Heterosis in der Nachzucht war unter allen Werten der (Co)Varianzen die optimale Zuchtstrategie. Es zeigten sich Verbesserungen von bis zu 12,5 % gegenuber Grenzwert-Selektion gefolgt von Zufallspaarung bei groser Dominanzvarianz relativ zur gesamten genetischen Varianz. Die Verbesserung des Nachkommendurchschnittes durch die Paarungswahl relativ zur Grenzwert-Selektion mit folgender Zufallspaarung und Grenzwert-Selektion mit nachfolgender Paarungszuweisung war teilweise gros, bis zu 53 %, wenn deutlich Heterosis vorliegt. Bei geringem Anteil von Dominanzvarianz an der gesamten genetischen Varianz und bei wenig Heterosis war die Verbesserung gering. Wenn die Zielpopulation gros ist, wird die vollstandige Paarungsselektion rechentechnisch aufwendig und kaum praktikabel. Alternative, weniger rechenaufwendige Strategien erreichten nahezu optimale Selektion und Paarungsentscheidungen unter manchen Parameterwertern. Die Integration einer rasseubergreifenden Zuchtwertschatzung, unter Anwendung des Super-Breed-Modells zusammen mit Paarungsselektion, ergibt ein machtiges Rahmenwerk fur die Gestaltung.